آزمون ها و خدمات تشخيصي قابل ارايه

 در

 

 مديريت خدمات تخصصي زيست فناوري

 

 

 

 فهرست

توالی یابی کامل ژنوم (Whole Genome Sequencing). 4

توالی یابی کامل  اگزوم (Whole Exome Sequencing). 5

توالی یابی ژن های هدف (Targeted Sequencing). 5

توالی یابی ترانسکریپتوم (RNA-Seq). 6

توالی یابی RNA های کوچک (Small RNA-Seq). 7

اپی ژنومیکس (Epigenomics). 7

متاژنومیکس(Metagenomics). 8

تعیین ژنوتیپ با استفاده از توالی یابی (Genotyping-By-Sequencing). 8

آناليز روغن دانه آفتابگردان. 10

آناليز روغن دانه فندق.. 11

آناليز روغن زيتون. 12

آناليز روغن زيتون. 13

آناليز روغن زيتون. 14

آناليز بيان ژن. 15

آناليز پروتئينهای موجودات زنده با استفاده از الکتروفورز تک بعدي.. 16

آناليز پروفایل پروتئينی موجودات زنده 17

بررسی سميت سلولي زيست مواد. 18

تشخيص مواد غذايي (GMO). 19

 

 

 

آزمايشگاه مرکزی خدمات ژنوم

ارائه خدمات توالی یابی ژنی و ژنومی و آنالیزهای بیوانفورماتیک مربوطه در در حوزه های انسانی، گیاهی، جانوری و میکروارگانیسم ها در آزمايشگاه خدمات ژنوم پژوهشگاه بشرح ذيل مي باشد:

مشاوره علمي در طراحی و اجرای پروژه ها ژنومی: جهت کاهش هزینه ها و انجام صحیح پروژه های ژنومی خدمات مشاوره ای در سطوح مختلف به  متقاضان عرضه می شود.

توالی یابی کامل ژنوم (Whole Genome Sequencing)

شرح آزمون: توالي يابي کامل ژنوم بصورت de novo و Re-Sequencing   درگونه هاي جانوري ، گياهي و ميکروارگانيسم ها

محدوده کاربرد: از تک سلول ها (Single Cell Sequencing)، بافت تا ارگانيسم هاي پيچيده جانوري وگياهي

روش اصلي مورد استفاده: براساس خرد کردن ژنوم با استفاده از روشهاي آنزيمي و اولتراسونيک و توالي يابي بر روي پلاتفرم هاي نسل جديد توالي يابي (Next Generation Sequencing)

دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: Agilent Bioanalizer جهت تعيين کيفيت DNA ، Illumina HiSeq 2000/2500 به منظور توالي يابي قطعات DNA

 

 

توالی یابی کامل  اگزوم (Whole Exome Sequencing)

- شرح آزمون: توالي يابي نواحي ژني ژنوم به عنوان محدوده عملکردي ژنوم که بخش کوچکتري از ژنوم را در بر مي گيرد.   

- محدوده کاربرد: تک سلول (Single Cell Sequencing)، بافت ، خون براي انسان و موش

- روش اصلي مورد استفاده: براساس خرد کردن ژنوم با استفاده از روشهاي آنزيمي و اولتراسونيک و تکثير نواحي اگزوني  بر روي آرايه ها و Beads مختص گونه و توالي يابي بر روي پلاتفرم هاي نسل جديد توالي يابي (Next Generation Sequencing)

- دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: Agilent Bioanalizer جهت تعيين کيفيت DNA ،            Illumina MiSeq  به منظور توالي يابي قطعات DNA

 

 

توالی یابی ژن های هدف (Targeted Sequencing)

- شرح آزمون: توالي يابي همزمان قطعات تکثير شده (از يک تا صدها ژن) در چندين نمونه

- محدوده کاربرد: از تک سلول ها (Single Cell Sequencing)، بافت تا ارگانيسم هاي پيچيده جانوري وگياهي

- روش اصلي مورد استفاده: براساس تکثير ژنها بصورت جداگانه و توالي يابي بر روي پلاتفرم هاي نسل جديد توالي يابي (Next Generation Sequencing)

- دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: Agilent Bioanalizer جهت تعيين کيفيت DNA ،                           Illumina MiSeq   به منظور توالي يابي قطعات DNA

 

 

توالی یابی ترانسکریپتوم (RNA-Seq)

شرح آزمون:  توالي يابي رونوشت هاي ژنومي (RNA) جهت بررسي ميزان بيان و تعيين پروفايل بياني  

محدوده کاربرد: mRNA  از تک سلول و بافت

روش اصلي مورد استفاده: براساس تهيه کتابخانه رونوشت هاي ژني، تکثير ژنها بصورت همزمان و توالي يابي بر روي پلاتفرم هاي نسل جديد توالي يابي (Next Generation Sequencing)

دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: Agilent Bioanalizer جهت تعيين کيفيت DNA ،           Illumina HiSeq 2000/2500  به منظور توالي يابي قطعات DNA

 

 

توالی یابی RNA های کوچک (Small RNA-Seq)

- شرح آزمون:  توالي يابي رونوشت هاي غير کد کننده ژنومي (Small RNA) جهت بررسي ميزان بيان و تعيين پروفايل

- محدوده کاربرد: Small RNA  از تک سلول و بافت

- روش اصلي مورد استفاده: براساس تهيه کتابخانه رونوشت هاي غير کد کننده ژنومي ، تکثير آنها بصورت همزمان و توالي يابي بر روي پلاتفرم هاي نسل جديد توالي يابي (Next Generation Sequencing)

- دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: Agilent Bioanalizer جهت تعيين کيفيت DNA ،             Illumina MiSeq  به منظور توالي يابي

 

اپی ژنومیکس (Epigenomics)

- شرح آزمون:  توالي يابي به منظور شناسايي مناطق هيستوني، آناليز متيلاسيون و  مطالعه برهمکنش پروتئين و  DNA ژنوم 

- محدوده کاربرد:  DNA از تک سلول و بافت

- روش اصلي مورد استفاده:  براساس ايزوله نمودن قطعات DNA متيله شده با استفاده از آنتي بادي ها و توالي يابي بر روي پلاتفرم هاي نسل جديد توالي يابي (Next Generation Sequencing)

- دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: Agilent Bioanalizer جهت تعيين کيفيت DNA ،            Illumina MiSeq  به منظور توالي يابي

متاژنومیکس(Metagenomics)

- شرح آزمون:  توالي يابي جمعيت هاي مخلوط باکتريايي به منظور شناسايي ترکيب جمعيتي و فراواني گونه ها در نمونه

- محدوده کاربرد:  DNA از نمونه آب، خاک ،محيط زنده و غير زنده  

- روش اصلي مورد استفاده: براساس تهيه کتابخانه ژنومي ، تکثير آنها بصورت همزمان و توالي يابي بر روي پلاتفرم هاي نسل جديد توالي يابي (Next Generation Sequencing)

- دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: Agilent Bioanalizer جهت تعيين کيفيت DNA ،            Illumina HiSeq 2000/2500 به منظور توالي يابي

 

 

تعیین ژنوتیپ با استفاده از توالی یابی (Genotyping-By-Sequencing)

- شرح آزمون:  تعيين ژنوتيپ يک جمعيت براساس توالي يابي قطعات ژنوم به منظور مطالعات جمعيت جانوري و گياهي

- محدوده کاربرد:  DNA از نمونه

- روش اصلي مورد استفاده: براساس برش آنزيمي ژنوم و تکثير آنها بصورت همزمان و توالي يابي بر روي پلاتفرم هاي نسل جديد توالي يابي (Next Generation Sequencing)، شناسايي پلي مورفيسم ها بين افراد جمعيت مورد مطالعه  

- دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: Agilent Bioanalizer جهت تعيين کيفيت DNA ،            Illumina HiSeq 2000/2500 به منظور توالي يابي

 

تعرفه کلیه ازمون های فوق از طریق تماس تلفنی و توافق بر مبنای پروژه یا آزمون میباشد. ( لينک درخواست)

تلفن تماس :09136002347

 

آزمايشگاه  آناليزهاي کمي

آناليز روغن دانه آفتابگردان

- شرح آزمون: استخراج روغن و آماده سازي متيل استرهاي اسيدهاي چرب تري گليسيريد براي تجزيه با کروماتوگرافي گازي

- محدوده کاربرد: تعيين درصد اسیدهاي چرب ازکربن 16 تا 20

- روش اصلي مورد استفاده: متيل استرهاي اسيدهاي چرب در در بافت‌هاي مختلف دانه هاي روغني

- مبناي استاندارد : شماره استاندارد INSO 14880

- دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: دستگاه كروماتوگرافي گازي GC (Gas Chromatography)، داراي دتکتور High Voltage و سري کامل ستون‌ها مویئن و نيز  دستگاه كروماتوگرافي مايع   HPLC (High Performance Liquid Chromatography) با استفاده از دتکتور UV-VIS و ستون‌هاي C8, C4, C18  با قابليت آناليز نمونه‌هاي شيميايي، بيولوژيکي، غذايي، دارويي و سموم

- عدم قطعيت: عدم قطعيت نتايج آزمون درسطح اطمينان بزرگتر يا مساوي 95% است

 

تعرفه آزمون :850000 ریال( لينک درخواست)

 

آناليز روغن دانه فندق

- شرح آزمون: استخراج روغن و آماده سازي متيل استرهاي اسيدهاي چرب تري گليسيريد براي تجزيه با کروماتوگرافي گازي

- محدوده کاربرد: تعيين درصد اسیدهاي چرب ازکربن 16 تا 20

- روش اصلي مورد استفاده: متيل استرهاي اسيدهاي چرب در در بافت‌هاي مختلف دانه هاي روغني

- مبناي استاندارد : شماره استاندارد INSO 14880

- دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: دستگاه كروماتوگرافي گازي GC (Gas Chromatography)، داراي دتکتور High Voltage و سري کامل ستون‌ها مویئن و نيز   دستگاه كروماتوگرافي مايع   HPLC (High Performance Liquid Chromatography) با استفاده از دتکتور UV-VIS و ستون‌هاي C8, C4, C18  با قابليت آناليز نمونه‌هاي شيميايي، بيولوژيکي، غذايي، دارويي و سموم

- عدم قطعيت: عدم قطعيت نتايج آزمون درسطح اطمينان بزرگتر يا مساوي 95% است

 

تعرفه آزمون :800000 ریال( لينک درخواست)

 

آناليز روغن زيتون

- شرح آزمون: استخراج روغن و آماده سازي متيل استرهاي اسيدهاي چرب تري گليسيريد براي تجزيه با کروماتوگرافي گازي

- محدوده کاربرد: تعيين درصد اسیدهاي چرب ازکربن 16 تا 20

- روش اصلي مورد استفاده: متيل استرهاي اسيدهاي چرب در در بافت‌هاي مختلف دانه هاي روغني

- مبناي استاندارد : شماره استاندارد INSO 14880

- دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: دستگاه كروماتوگرافي گازي GC (Gas Chromatography)، داراي دتکتور High Voltage و سري کامل ستون‌ها مویئن و نيز   دستگاه كروماتوگرافي مايع   HPLC (High Performance Liquid Chromatography) با استفاده از دتکتور UV-VIS و ستون‌هاي C8, C4, C18  با قابليت آناليز نمونه‌هاي شيميايي، بيولوژيکي، غذايي، دارويي و سموم

- عدم قطعيت: عدم قطعيت نتايج آزمون درسطح اطمينان بزرگتر يا مساوي 95% است

 

تعرفه آزمون :800000 ریال( لينک درخواست)

آناليز روغن زيتون

- شرح آزمون: شناسائي و تعيين  تركيبات  بيوفنلي در روغن زيتون بوسيله کروماتوگرافي مايع با فشار بالا

- محدوده کاربرد: تعيين درصد اسیدهاي چرب ازکربن 16 تا 20

- روش اصلي مورد استفاده: استفاده از روش HPLC جهت تعيين بيوفنول هاي موجود در روغن درارتباط با کيفيت اين محصول 

- مبناي استاندارد : شماره استاندارد INSO 14880

- دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: دستگاه كروماتوگرافي مايع تهيه‌اي (با خاصيت جداسازي و خالص‌سازي) سيستمHPLC-Prep (High Performance Liquid Chromatography) Preparative با ستون C18 با قابليت آناليز و خالص‌سازي نمونه‌هاي شيميايي، بيولوژيکي، غذايي، دارويي و سموم.

- عدم قطعيت: عدم قطعيت نتايج آزمون درسطح اطمينان بزرگتر يا مساوي 95% است .

 

تعرفه آزمون :1200000 ریال( لينک درخواست)

 

آناليز روغن زيتون

- شرح آزمون: اندازه گيري ضريب خاموشي در ناحيه ماوراء بنفش به روش جذب

- محدوده کاربرد: nm360-220

- روش اصلي مورد استفاده: تشخيص خلوص و پايداري روغن با قابلیت اندازه گیری

- مبناي استاندارد : شماره استاندارد ISIRI 10503

- دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: دستگاهSpectrophotometer(UV/VIS) با قابلیت اندازه گیری در طول موجهای بین 200 تا 700 نانومتر

- عدم قطعيت: عدم قطعيت نتايج آزمون درسطح اطمينان بزرگتر يا مساوي 95% است

تعرفه آزمون :250000 ریال( لينک درخواست)

 

 

آزمايشگاه  ترانسکریپتومیکس

آناليز بيان ژن

- شرح آزمون: اندازه گيري و سنجش بيان ژن (Gene expression) ، Genotyping داراي SNPs تغييرات جهشي با دقت و قدرت تفکيک بالا و همچنين بررسي جهش ها و پلي مورفيسم هاي ژني در گونه هاي جانوري، گياهي و انساني  )بر اساس پروتکل پيشنهادي ازطرف متقاضي(

- محدوده کاربرد:

- روش اصلي مورد استفاده: مقايسه تغييرات ژن ها با استفاده از پرايمرهاي اختصاصي و مواد فلورسنت

- دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: دستگاه Real time PCR با قابليت High Resolution Melting (HRM)داراي توانايي Fluorophores  شش رنگي

 

تعرفه آزمون :500000 ریال( لينک درخواست)

 

آزمايشگاه  پروتئومیکس (یک بعدي و دو بعدي )

 آناليز پروتئينهای موجودات زنده با استفاده از الکتروفورز تک بعدي   

- شرح آزمون: اندازه گيري و جداسازي پروتئين ها در بافت هاي مختلف موجودات زنده با استفاده الکتروفورز تک بعدي،  براساس وزن مولکولي پروتئينها ( SDS-PAGE)

- محدوده کاربرد: براساس وزن مولکولي پروتئينها

- روش اصلي مورد استفاده: استخراج و سنجش ميزان غلظت پروتئينها، جداسازي پروتئينها براساس وزن مولکولي ،  رنگ آميزي پروتئينها با استفاده از کوماسي يا نيترات نقره

مقادير يکسان از آنها براي الکتروفورز استفاده مي شود . پس از اتمام الکتروفورز، پروتئينها با استفاده از رنگ آميزي کوماسي يا نيترات نقره مشاهده مي شوند .

- دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: دستگاه Spectrophotometer(UV/VIS) براي سنجش ميزان پروتئينها ، سيستم الکتروفورز تک بعدي Bio-Rad، سيستم الکتروفورز تک بعدي پايا پژوهش

 

تعرفه آزمون یک بعدی با مقیاس بالاتر:850000 ریال

تعرفه آزمون با دستگاهBiorad : ریال500000    

( لينک درخواست)

 

 

آناليز پروفایل پروتئينی موجودات زنده

- شرح آزمون: اندازه گيري و جداسازي پروتئين ها در بافت هاي مختلف موجودات زنده با استفاده الکتروفورز دو بعدي، براساس PH ايزوالکتريک پروتئينها (ايزوالکتريک فوکوسينگ يا IEF) و وزن مولکولي پروتئينها          ( SDS-PAGE )

- محدوده کاربرد: PH 3 تا 10 براي بعد اول و وزن مولکولي 5 تا 120 کيلو دالتون براي بعد دوم

- روش اصلي مورد استفاده: استخراج و سنجش ميزان غلظت پروتئينها، جداسازي پروتئينها با استفاده از الکتروفورز دو بعدي ( SDS-PAGE + IEF) براساس pH ايزوالکتريک  (PI) در بعد اول، جداسازي پروتئينها براساس وزن مولکولي در بعد دوم ،  رنگ آميزي پروتئينها با استفاده از کوماسي يا نيترات نقره

- دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: دستگاهSpectrophotometer(UV/VIS) براي سنجش ميزان پروتئينها ، سيستم الکتروفورزي IEF براي بعد اول، سيستم الکتروفورزی Bio-Rad و پايا پژوهش براي بعد دوم.

تعرفه آزمون دوبعدی :3500000 ریال( لينک درخواست)

آزمايشگاه سمیت و زیست سازگاری سلولی

بررسی سميت سلولي زيست مواد

- شرح آزمون: بکار گيري کشت سلول براي آزمايش سميت سلولي کليه کليه زيست مواد مصارف پزشکي، دندانپزشکي، بررسی سميت سلولی  بيو مواد و ملزومات آرايشي (لنزهای رنگی) و زيبائی .

- محدوده کاربرد: کيفی (سميت و عدم سميت)

- روش اصلي مورد استفاده: آزمون برون تني (In vitro)کشت سلولي با استفاده از رده سلولي استاندارد L929  فيبروبلاست موشي مي باشد . زيست مواد در مجاورت مستقيم يا غير مستقيم (نسبت به نوع زيست مواد )با کشت سلول قرار مي گيرد .ارزيابي اين هم کشتي برحسب مورفولوژي سلول بررسي خواهد گرديد .

- مبناي استاندارد : شماره استاندارد ISO 10993-5: 2009 British standard

- دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: هود بيولوژيک، نکوباتور Co2، ميکروسکوپ اينورت و بند ماري.

- عدم قطعيت: عدم قطعيت نتايج آزمون درسطح اطمينان بزرگتر يا مساوي 95% است

 

تعرفه آزمون :1000000 ریال( لينک درخواست)

آزمايشگاه تشخيص  GMO

تشخيص مواد غذايي (GMO)

- شرح آزمون: شناسایی دقیق محصولات تغییرشکل یافته ژنتیکی در بسیاری از بذور و گیاهان نظیر برنج، جو، گندم، ذرت، چغندر قند، کلزا، سویا، سیب زمینی، آفتاب گردان و محصولات غذایی نظیر غذای کودک، محصولات گوشتی (سوسیس و کالباس)، مشتقات سویا و انواع روغن های خوراکی با استانداردهای بین المللی مبناي سفارشات در آزمون مورد نظر مي باشد . 

- محدوده کاربرد: شناسايي و رديابي موجودات زنده تغيير ژنتيکي يافته و محصولات مشتق شده آنها

- روش اصلي مورد استفاده:  شناسايي دقيق محصولات مختلف تراريخت با استفاده از پرايمرهاي اختصاصي در PCR و الکتروفورز

- مبناي استاندارد : شماره استاندارد ISO 21569

- دستگاهها و تجهيزات مورد استفاده: ژل داک با تابش نور مرئی و نور UV جهت عکسبرداری از نمونه های ژل آگارز، ترموسایکر با ایجاد چرخه های مختلف دمایی امکان تکثیر قطعات خاص اسید نوکلئیک، بیوفتومتر براي اندازه گیری جذب نور در طول موجهاي مختلف، الکتروفورز افقی Horizontal Electrophoresis جهت ژل گذاری و جدا کردن نمونه های زیست مولکولی

- عدم قطعيت: عدم قطعيت نتايج آزمون درسطح اطمينان بزرگتر يا مساوي 95% است .

تعرفه آزمون :980000 ریال( لينک درخواست)