National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   1,818                                        
?                                            
A   87                                        
C   48                                        
D   87           1                            
E   63                                        
F   138                                        
G   120                                        
H   24                                        
I   84               1                        
K   90                                        
L   141                                        
M   6                                        
N   147                                        
P   93                                        
Q   69                                        
R   72                                        
S   138                                        
T   150                                        
V   150                                        
W   21                                        
Y   90                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 21683 A 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 21684 A 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 21685 A 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 21686 G 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 21687 T 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 21688 T 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 21689 T 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 21690 T 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 21691 C 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 21692 A 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 21693 G 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 21694 A 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 21695 T 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 21696 C 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 21697 C 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 21698 T 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 21699 C 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 21700 A 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 21701 G 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 21702 T 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 21703 T 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 21704 T 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 21705 T 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 21706 A 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 21707 C 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 21708 A 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 21709 T 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 21710 T 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 21711 C 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 21712 A 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 21713 A 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 21714 C 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 21715 T 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 21716 C 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 21717 A 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 21718 G 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 21719 G 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 21720 A 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 21721 C 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 21722 T 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 21723 T 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 21724 G 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 21725 T 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 21726 T 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 21727 C 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 21728 T 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 21729 T 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 21730 A 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 21731 C 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 21732 C 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 21733 T 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 21734 T 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 21735 T 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 21736 C 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 21737 T 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 21738 T 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 21739 T 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 21740 T 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 21741 C 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 21742 C 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 21743 A 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 21744 A 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 21745 T 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 21746 G 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 21747 T 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 21748 T 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 21749 A 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 21750 C 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 21751 T 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 21752 T 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 21753 G 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 21754 G 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 21755 T 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 21756 T 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 21757 C 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 21758 C 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 21759 A 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 21760 T 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 21761 G 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 21762 C 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 21763 T 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 21764 A 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 21765 T 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 21766 A 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 21767 C 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 21768 A 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 21769 T 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 21770 G 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 21771 T 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 21772 C 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 21773 T 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 21774 C 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 21775 T 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 21776 G 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 21777 G 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 21778 G 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 21779 A 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 21780 C 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 21781 C 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 21782 A 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 21783 A 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 21784 T 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 21785 G 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 21786 G 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 21787 T 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 21788 A 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 21789 C 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 21790 T 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 21791 A 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 21792 A 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 21793 G 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 21794 A 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 21795 G 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 21796 G 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 21797 T 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 21798 T 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 21799 T 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 21800 G 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 21801 A 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 21802 T 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 21803 A 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 21804 A 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 21805 C 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 21806 C 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 21807 C 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 21808 T 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 21809 G 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 21810 T 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 21811 C 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 21812 C 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 21813 T 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 21814 A 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 21815 C 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 21816 C 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 21817 A 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 21818 T 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 21819 T 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 21820 T 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 21821 A 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 21822 A 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 21823 T 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 21824 G 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 21825 A 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 21826 T 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 21827 G 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 21828 G 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 21829 T 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 21830 G 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 21831 T 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 21832 T 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 21833 T 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 21834 A 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 21835 T 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 21836 T 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 21837 T 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 21838 T 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 21839 G 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 21840 C 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 21841 T 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 21842 T 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 21843 C 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 21844 C 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 21845 A 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 21846 C 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 21847 T 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 21848 G 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 21849 A 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 21850 G 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 21851 A 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 21852 A 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 21853 G 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 21854 T 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 21855 C 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 21856 T 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 21857 A 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 21858 A 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 21859 C 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 21860 A 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 21861 T 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 21862 A 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 21863 A 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 21864 T 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 21865 A 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 21866 A 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 21867 G 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 21868 A 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 21869 G 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 21870 G 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 21871 C 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 21872 T 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 21873 G 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 21874 G 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 21875 A 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 21876 T 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 21877 T 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 21878 T 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 21879 T 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 21880 T 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 21881 G 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 21882 G 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 21883 T 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 21884 A 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 21885 C 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 21886 T 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 21887 A 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 21888 C 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 21889 T 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 21890 T 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 21891 T 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 21892 A 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 21893 G 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 21894 A 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 21895 T 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 21896 T 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 21897 C 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 21898 G 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 21899 A 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 21900 A 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 21901 G 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 21902 A 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 21903 C 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 21904 C 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 21905 C 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 21906 A 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 21907 G 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 21908 T 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 21909 C 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 21910 C 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 21911 C 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 21912 T 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 21913 A 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 21914 C 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 21915 T 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 21916 T 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 21917 A 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 21918 T 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 21919 T 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 21920 G 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 21921 T 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 21922 T 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 21923 A 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 21924 A 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 21925 T 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 21926 A 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 21927 A 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 21928 C 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 21929 G 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 21930 C 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 21931 T 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 21932 A 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 21933 C 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 21934 T 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 21935 A 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 21936 A 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 21937 T 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 21938 G 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 21939 T 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 21940 T 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 21941 G 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 21942 T 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 21943 T 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 21944 A 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 21945 T 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 21946 T 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 21947 A 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 21948 A 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 21949 A 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 21950 G 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 21951 T 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 21952 C 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 21953 T 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 21954 G 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 21955 T 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 21956 G 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 21957 A 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 21958 A 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 21959 T 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 21960 T 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 21961 T 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 21962 C 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 21963 A 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 21964 A 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 21965 T 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 21966 T 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 21967 T 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 21968 T 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 21969 G 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 21970 T 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 21971 A 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 21972 A 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 21973 T 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 21974 G 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 21975 A 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 21976 T 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 21977 C 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 21978 C 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 21979 A 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 21980 T 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 21981 T 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 21982 T 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 21983 T 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 21984 T 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 21985 G 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 21986 G 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 21987 G 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 21988 T 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 21989 G 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 21990 T 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 21991 T 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 21992 T 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 21993 A 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 21994 T 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 21995 T 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 21996 A 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 21997 C 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 21998 C 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 21999 A 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 22000 C 1 1
318 Antigua_and_Barbuda 22001 A 1 1
319 Antigua_and_Barbuda 22002 A 1 1
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1029 Antigua_and_Barbuda 22712 C 1 1
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1703 Antigua_and_Barbuda 23386 T 1 1
1704 Antigua_and_Barbuda 23387 G 1 1
1705 Antigua_and_Barbuda 23388 C 1 1
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1709 Antigua_and_Barbuda 23392 T 1 1
1710 Antigua_and_Barbuda 23393 C 1 1
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1808 Antigua_and_Barbuda 23491 T 1 1
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1810 Antigua_and_Barbuda 23493 A 1 1
1811 Antigua_and_Barbuda 23494 A 1 1
1812 Antigua_and_Barbuda 23495 A 1 1
1813 Antigua_and_Barbuda 23496 C 1 1
1814 Antigua_and_Barbuda 23497 A 1 1
1815 Antigua_and_Barbuda 23498 C 1 1
1816 Antigua_and_Barbuda 23499 G 1 1
1817 Antigua_and_Barbuda 23500 T 1 1