National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.

Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     2                                        
-     366                                        
?                                              
A     15                                        
C     21                                        
D     22                                        
E     18                                        
F     24                                        
G     15                                        
H     12                                        
I     30                                        
K     15                                        
L     30                                        
M     3                                        
N     6                                        
P     21                                        
Q     18                                        
R     12                                        
S     27                                        
T     15                                        
V     36                                        
W     3                                        
Y     21                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide

Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Liechtenstein 27894 A 3 3
1 Liechtenstein 27895 T 3 3
2 Liechtenstein 27896 G 3 3
3 Liechtenstein 27897 A 3 3
4 Liechtenstein 27898 A 3 3
5 Liechtenstein 27899 A 3 3
6 Liechtenstein 27900 T 3 3
7 Liechtenstein 27901 T 3 3
8 Liechtenstein 27902 T 3 3
9 Liechtenstein 27903 C 3 3
10 Liechtenstein 27904 T 3 3
11 Liechtenstein 27905 T 3 3
12 Liechtenstein 27906 G 3 3
13 Liechtenstein 27907 T 3 3
14 Liechtenstein 27908 T 3 3
15 Liechtenstein 27909 T 3 3
16 Liechtenstein 27910 T 3 3
17 Liechtenstein 27911 C 3 3
18 Liechtenstein 27912 T 3 3
19 Liechtenstein 27913 T 3 3
20 Liechtenstein 27914 A 3 3
21 Liechtenstein 27915 G 3 3
22 Liechtenstein 27916 G 3 3
23 Liechtenstein 27917 A 3 3
24 Liechtenstein 27918 A 3 3
25 Liechtenstein 27919 T 3 3
26 Liechtenstein 27920 C 3 3
27 Liechtenstein 27921 A 3 3
28 Liechtenstein 27922 T 3 3
29 Liechtenstein 27923 C 3 3
30 Liechtenstein 27924 A 3 3
31 Liechtenstein 27925 C 3 3
32 Liechtenstein 27926 A 3 3
33 Liechtenstein 27927 A 3 3
34 Liechtenstein 27928 C 3 3
35 Liechtenstein 27929 T 3 3
36 Liechtenstein 27930 G 3 3
37 Liechtenstein 27931 T 3 3
38 Liechtenstein 27932 A 3 3
39 Liechtenstein 27933 G 3 3
40 Liechtenstein 27934 C 3 3
41 Liechtenstein 27935 T 3 3
42 Liechtenstein 27936 G 3 3
43 Liechtenstein 27937 C 3 3
44 Liechtenstein 27938 A 3 3
45 Liechtenstein 27939 T 3 3
46 Liechtenstein 27940 T 3 3
47 Liechtenstein 27941 T 3 3
48 Liechtenstein 27942 C 3 3
49 Liechtenstein 27943 A 3 3
50 Liechtenstein 27944 C 3 3
51 Liechtenstein 27945 C 3 3
52 Liechtenstein 27946 A 3 3
53 Liechtenstein 27947 A 3 3
54 Liechtenstein 27948 G 3 3
55 Liechtenstein 27949 A 3 3
56 Liechtenstein 27950 A 3 3
57 Liechtenstein 27951 T 3 3
58 Liechtenstein 27952 G 3 3
59 Liechtenstein 27953 T 3 3
60 Liechtenstein 27954 A 3 3
61 Liechtenstein 27955 G 3 3
62 Liechtenstein 27956 T 3 3
63 Liechtenstein 27957 T 3 3
64 Liechtenstein 27958 T 3 3
65 Liechtenstein 27959 A 3 3
66 Liechtenstein 27960 C 3 3
67 Liechtenstein 27961 A 3 3
68 Liechtenstein 27962 G 3 3
69 Liechtenstein 27963 T 3 3
70 Liechtenstein 27964 C 3 3
71 Liechtenstein 27965 A 3 3
72 Liechtenstein 27966 T 3 3
73 Liechtenstein 27967 G 3 3
74 Liechtenstein 27968 T 3 3
75 Liechtenstein 27969 A 3 3
76 Liechtenstein 27970 C 3 3
77 Liechtenstein 27971 T 3 3
78 Liechtenstein 27972 C 3 3
79 Liechtenstein 27973 A 3 3
80 Liechtenstein 27974 A 3 3
81 Liechtenstein 27975 C 3 3
82 Liechtenstein 27976 A 3 3
83 Liechtenstein 27977 T 3 3
84 Liechtenstein 27978 C 3 3
85 Liechtenstein 27979 A 3 3
86 Liechtenstein 27980 A 3 3
87 Liechtenstein 27981 C 3 3
88 Liechtenstein 27982 C 3 3
89 Liechtenstein 27983 A 3 3
90 Liechtenstein 27984 T 3 3
91 Liechtenstein 27985 A 3 3
92 Liechtenstein 27986 T 3 3
93 Liechtenstein 27987 G 3 3
94 Liechtenstein 27988 T 3 3
95 Liechtenstein 27989 A 3 3
96 Liechtenstein 27990 G 3 3
97 Liechtenstein 27991 T 3 3
98 Liechtenstein 27992 T 3 3
99 Liechtenstein 27993 G 3 3
100 Liechtenstein 27994 A 3 3
101 Liechtenstein 27995 T 3 3
102 Liechtenstein 27996 G 3 3
103 Liechtenstein 27997 A 3 3
104 Liechtenstein 27998 C 3 3
105 Liechtenstein 27999 C 3 3
106 Liechtenstein 28000 C 3 3
107 Liechtenstein 28001 G 3 3
108 Liechtenstein 28002 T 3 3
109 Liechtenstein 28003 G 3 3
110 Liechtenstein 28004 T 3 3
111 Liechtenstein 28005 C 3 3
112 Liechtenstein 28006 C 3 3
113 Liechtenstein 28007 T 3 3
114 Liechtenstein 28008 A 3 3
115 Liechtenstein 28009 T 3 3
116 Liechtenstein 28010 T 3 3
117 Liechtenstein 28011 C 3 3
118 Liechtenstein 28012 A 3 3
119 Liechtenstein 28013 C 3 3
120 Liechtenstein 28014 T 3 3
121 Liechtenstein 28015 T 3 3
122 Liechtenstein 28016 C 3 3
123 Liechtenstein 28017 T 3 3
124 Liechtenstein 28018 A 3 3
125 Liechtenstein 28019 T 3 3
126 Liechtenstein 28020 T 3 3
127 Liechtenstein 28021 C 3 3
128 Liechtenstein 28022 T 3 3
129 Liechtenstein 28023 A 3 3
130 Liechtenstein 28024 A 3 3
131 Liechtenstein 28025 A 3 3
132 Liechtenstein 28026 T 3 3
133 Liechtenstein 28027 G 3 3
134 Liechtenstein 28028 G 3 3
135 Liechtenstein 28029 T 3 3
136 Liechtenstein 28030 A 3 3
137 Liechtenstein 28031 T 3 3
138 Liechtenstein 28032 A 3 3
139 Liechtenstein 28033 T 3 3
140 Liechtenstein 28034 T 3 3
141 Liechtenstein 28035 A 3 3
142 Liechtenstein 28036 G 3 3
143 Liechtenstein 28037 A 3 3
144 Liechtenstein 28038 G 3 3
145 Liechtenstein 28039 T 3 3
146 Liechtenstein 28040 A 3 3
147 Liechtenstein 28041 G 3 3
148 Liechtenstein 28042 G 3 3
149 Liechtenstein 28043 A 3 3
150 Liechtenstein 28044 G 3 3
151 Liechtenstein 28045 C 3 3
152 Liechtenstein 28046 T 3 3
153 Liechtenstein 28047 A 3 3
154 Liechtenstein 28048 G 3 3
155 Liechtenstein 28049 A 3 3
156 Liechtenstein 28050 A 3 3
157 Liechtenstein 28051 A 3 3
158 Liechtenstein 28052 A 3 3
159 Liechtenstein 28053 T 3 3
160 Liechtenstein 28054 C 3 3
161 Liechtenstein 28055 A 3 3
162 Liechtenstein 28056 G 3 3
163 Liechtenstein 28057 C 3 3
164 Liechtenstein 28058 A 3 3
165 Liechtenstein 28059 C 3 3
166 Liechtenstein 28060 C 3 3
167 Liechtenstein 28061 T 3 3
168 Liechtenstein 28062 T 3 3
169 Liechtenstein 28063 T 3 3
170 Liechtenstein 28064 A 3 3
171 Liechtenstein 28065 A 3 3
172 Liechtenstein 28066 T 3 3
173 Liechtenstein 28067 T 3 3
174 Liechtenstein 28068 G 3 3
175 Liechtenstein 28069 A 3 3
176 Liechtenstein 28070 A 3 3
177 Liechtenstein 28071 T 3 3
178 Liechtenstein 28072 T 3 3
179 Liechtenstein 28073 G 3 3
180 Liechtenstein 28074 T 3 3
181 Liechtenstein 28075 G 3 3
182 Liechtenstein 28076 C 3 3
183 Liechtenstein 28077 G 3 3
184 Liechtenstein 28078 T 3 3
185 Liechtenstein 28079 G 3 3
186 Liechtenstein 28080 G 3 3
187 Liechtenstein 28081 A 3 3
188 Liechtenstein 28082 T 3 3
189 Liechtenstein 28083 G 3 3
190 Liechtenstein 28084 A 3 3
191 Liechtenstein 28085 G 3 3
192 Liechtenstein 28086 G 3 3
193 Liechtenstein 28087 C 3 3
194 Liechtenstein 28088 T 3 3
195 Liechtenstein 28089 G 3 3
196 Liechtenstein 28090 G 3 3
197 Liechtenstein 28091 T 3 3
198 Liechtenstein 28092 T 3 3
199 Liechtenstein 28093 C 3 3
200 Liechtenstein 28094 T 3 3
201 Liechtenstein 28095 A 3 3
202 Liechtenstein 28096 A 3 3
203 Liechtenstein 28097 A 3 3
204 Liechtenstein 28098 T 3 3
205 Liechtenstein 28099 C 3 3
206 Liechtenstein 28100 A 3 3
207 Liechtenstein 28101 C 3 3
208 Liechtenstein 28102 C 3 3
209 Liechtenstein 28103 C 3 3
210 Liechtenstein 28104 A 3 3
211 Liechtenstein 28105 T 3 3
212 Liechtenstein 28106 T 3 3
213 Liechtenstein 28107 C 3 3
214 Liechtenstein 28108 A 3 3
215 Liechtenstein 28109 G 3 3
216 Liechtenstein 28110 T 3 3
217 Liechtenstein 28111 A 3 3
218 Liechtenstein 28112 C 3 3
219 Liechtenstein 28113 A 3 3
220 Liechtenstein 28114 T 3 3
221 Liechtenstein 28115 C 3 3
222 Liechtenstein 28116 G 3 3
223 Liechtenstein 28117 A 3 3
224 Liechtenstein 28118 T 3 3
225 Liechtenstein 28119 A 3 3
226 Liechtenstein 28120 T 3 3
227 Liechtenstein 28121 C 3 3
228 Liechtenstein 28122 G 3 3
229 Liechtenstein 28123 G 3 3
230 Liechtenstein 28124 T 3 3
231 Liechtenstein 28125 A 3 3
232 Liechtenstein 28126 A 3 3
233 Liechtenstein 28127 T 3 3
234 Liechtenstein 28128 T 3 3
235 Liechtenstein 28129 A 3 3
236 Liechtenstein 28130 T 3 3
237 Liechtenstein 28131 A 3 3
238 Liechtenstein 28132 C 3 3
239 Liechtenstein 28133 A 3 3
240 Liechtenstein 28134 G 3 3
241 Liechtenstein 28135 T 3 3
242 Liechtenstein 28136 T 3 3
243 Liechtenstein 28137 T 3 3
244 Liechtenstein 28138 C 3 3
245 Liechtenstein 28139 C 3 3
246 Liechtenstein 28140 T 3 3
247 Liechtenstein 28141 G 3 3
248 Liechtenstein 28142 T 3 3
249 Liechtenstein 28143 T 3 3
250 Liechtenstein 28144 T 3 3
251 Liechtenstein 28145 A 3 3
252 Liechtenstein 28146 C 3 3
253 Liechtenstein 28147 C 3 3
254 Liechtenstein 28148 T 3 3
255 Liechtenstein 28149 T 3 3
256 Liechtenstein 28150 T 3 3
257 Liechtenstein 28151 T 3 3
258 Liechtenstein 28152 A 3 3
259 Liechtenstein 28153 C 3 3
260 Liechtenstein 28154 A 3 3
261 Liechtenstein 28155 A 3 3
262 Liechtenstein 28156 T 3 3
263 Liechtenstein 28157 T 3 3
264 Liechtenstein 28158 A 3 3
265 Liechtenstein 28159 A 3 3
266 Liechtenstein 28160 T 3 3
267 Liechtenstein 28161 T 3 3
268 Liechtenstein 28162 G 3 3
269 Liechtenstein 28163 C 3 3
270 Liechtenstein 28164 C 3 3
271 Liechtenstein 28165 A 3 3
272 Liechtenstein 28166 G 3 3
273 Liechtenstein 28167 G 3 3
274 Liechtenstein 28168 A 3 3
275 Liechtenstein 28169 A 3 3
276 Liechtenstein 28170 C 3 3
277 Liechtenstein 28171 C 3 3
278 Liechtenstein 28172 T 3 3
279 Liechtenstein 28173 A 3 3
280 Liechtenstein 28174 A 3 3
281 Liechtenstein 28175 A 3 3
282 Liechtenstein 28176 T 3 3
283 Liechtenstein 28177 T 3 3
284 Liechtenstein 28178 G 3 3
285 Liechtenstein 28179 G 3 3
286 Liechtenstein 28180 G 3 3
287 Liechtenstein 28181 T 3 3
288 Liechtenstein 28182 A 3 3
289 Liechtenstein 28183 G 3 3
290 Liechtenstein 28184 T 3 3
291 Liechtenstein 28185 C 3 3
292 Liechtenstein 28186 T 3 3
293 Liechtenstein 28187 T 3 3
294 Liechtenstein 28188 G 3 3
295 Liechtenstein 28189 T 3 3
296 Liechtenstein 28190 A 3 3
297 Liechtenstein 28191 G 3 3
298 Liechtenstein 28192 T 3 3
299 Liechtenstein 28193 G 3 3
300 Liechtenstein 28194 C 3 3
301 Liechtenstein 28195 G 3 3
302 Liechtenstein 28196 T 3 3
303 Liechtenstein 28197 T 3 3
304 Liechtenstein 28198 G 3 3
305 Liechtenstein 28199 T 3 3
306 Liechtenstein 28200 T 3 3
307 Liechtenstein 28201 C 3 3
308 Liechtenstein 28202 G 3 3
309 Liechtenstein 28203 T 3 3
310 Liechtenstein 28204 T 3 3
311 Liechtenstein 28205 C 3 3
312 Liechtenstein 28206 T 3 3
313 Liechtenstein 28207 A 3 3
314 Liechtenstein 28208 T 3 3
315 Liechtenstein 28209 G 3 3
316 Liechtenstein 28210 A 3 3
317 Liechtenstein 28211 A 3 3
318 Liechtenstein 28212 G 3 3
319 Liechtenstein 28213 A 3 3
320 Liechtenstein 28214 C 3 3
321 Liechtenstein 28215 T 3 3
322 Liechtenstein 28216 T 3 3
323 Liechtenstein 28217 T 3 3
324 Liechtenstein 28218 T 3 3
325 Liechtenstein 28219 T 3 3
326 Liechtenstein 28220 A 3 3
327 Liechtenstein 28221 G 3 3
328 Liechtenstein 28222 A 3 3
329 Liechtenstein 28223 G 3 3
330 Liechtenstein 28224 T 3 3
331 Liechtenstein 28225 A 3 3
332 Liechtenstein 28226 T 3 3
333 Liechtenstein 28227 C 3 3
334 Liechtenstein 28228 A 3 3
335 Liechtenstein 28229 T 3 3
336 Liechtenstein 28230 G 3 3
337 Liechtenstein 28231 A 3 3
338 Liechtenstein 28232 C 3 3
339 Liechtenstein 28233 G 3 3
340 Liechtenstein 28234 T 3 3
341 Liechtenstein 28235 T 3 3
342 Liechtenstein 28236 C 3 3
343 Liechtenstein 28237 G 3 3
344 Liechtenstein 28238 T 3 3
345 Liechtenstein 28239 G 3 3
346 Liechtenstein 28240 T 3 3
347 Liechtenstein 28241 T 3 3
348 Liechtenstein 28242 G 3 3
349 Liechtenstein 28243 T 3 3
350 Liechtenstein 28244 T 3 3
351 Liechtenstein 28245 T 3 3
352 Liechtenstein 28246 T 3 3
353 Liechtenstein 28247 A 3 3
354 Liechtenstein 28248 G 3 3
355 Liechtenstein 28249 A 3 3
356 Liechtenstein 28250 T 3 3
357 Liechtenstein 28251 T 3 3
358 Liechtenstein 28252 T 3 3
359 Liechtenstein 28253 C 3 3
360 Liechtenstein 28254 A 3 3
361 Liechtenstein 28255 T 3 3
362 Liechtenstein 28256 C 3 3
363 Liechtenstein 28257 T 3 3
364 Liechtenstein 28258 A 3 3
365 Liechtenstein 28259 A 3 3