National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     2                                        
-     366                                        
?                                              
A     15                                        
C     21                                        
D     22                                        
E     18                                        
F     24                                        
G     15                                        
H     12                                        
I     30                                        
K     15                                        
L     30                                        
M     3                                        
N     6                                        
P     21                                        
Q     18                                        
R     12                                        
S     27                                        
T     15                                        
V     36                                        
W     3                                        
Y     21                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 27894 A 5 5
1 Brunei 27895 T 5 5
2 Brunei 27896 G 5 5
3 Brunei 27897 A 5 5
4 Brunei 27898 A 5 5
5 Brunei 27899 A 5 5
6 Brunei 27900 T 5 5
7 Brunei 27901 T 5 5
8 Brunei 27902 T 5 5
9 Brunei 27903 C 5 5
10 Brunei 27904 T 5 5
11 Brunei 27905 T 5 5
12 Brunei 27906 G 5 5
13 Brunei 27907 T 5 5
14 Brunei 27908 T 5 5
15 Brunei 27909 T 5 5
16 Brunei 27910 T 5 5
17 Brunei 27911 C 5 5
18 Brunei 27912 T 5 5
19 Brunei 27913 T 5 5
20 Brunei 27914 A 5 5
21 Brunei 27915 G 5 5
22 Brunei 27916 G 5 5
23 Brunei 27917 A 5 5
24 Brunei 27918 A 5 5
25 Brunei 27919 T 5 5
26 Brunei 27920 C 5 5
27 Brunei 27921 A 5 5
28 Brunei 27922 T 5 5
29 Brunei 27923 C 5 5
30 Brunei 27924 A 5 5
31 Brunei 27925 C 5 5
32 Brunei 27926 A 5 5
33 Brunei 27927 A 5 5
34 Brunei 27928 C 5 5
35 Brunei 27929 T 5 5
36 Brunei 27930 G 5 5
37 Brunei 27931 T 5 5
38 Brunei 27932 A 5 5
39 Brunei 27933 G 5 5
40 Brunei 27934 C 5 5
41 Brunei 27935 T 5 5
42 Brunei 27936 G 5 5
43 Brunei 27937 C 5 5
44 Brunei 27938 A 5 5
45 Brunei 27939 T 5 5
46 Brunei 27940 T 5 5
47 Brunei 27941 T 5 5
48 Brunei 27942 C 5 5
49 Brunei 27943 A 5 5
50 Brunei 27944 C 5 5
51 Brunei 27945 C 5 5
52 Brunei 27946 A 5 5
53 Brunei 27947 A 5 5
54 Brunei 27948 G 5 5
55 Brunei 27949 A 5 5
56 Brunei 27950 A 5 5
57 Brunei 27951 T 5 5
58 Brunei 27952 G 5 5
59 Brunei 27953 T 5 5
60 Brunei 27954 A 5 5
61 Brunei 27955 G 5 5
62 Brunei 27956 T 5 5
63 Brunei 27957 T 5 5
64 Brunei 27958 T 5 5
65 Brunei 27959 A 5 5
66 Brunei 27960 C 5 5
67 Brunei 27961 A 5 5
68 Brunei 27962 G 5 5
69 Brunei 27963 T 5 5
70 Brunei 27964 C 5 5
71 Brunei 27965 A 5 5
72 Brunei 27966 T 5 5
73 Brunei 27967 G 5 5
74 Brunei 27968 T 5 5
75 Brunei 27969 A 5 5
76 Brunei 27970 C 5 5
77 Brunei 27971 T 5 5
78 Brunei 27972 C 5 5
79 Brunei 27973 A 5 5
80 Brunei 27974 A 5 5
81 Brunei 27975 C 5 5
82 Brunei 27976 A 5 5
83 Brunei 27977 T 5 5
84 Brunei 27978 C 5 5
85 Brunei 27979 A 5 5
86 Brunei 27980 A 5 5
87 Brunei 27981 C 5 5
88 Brunei 27982 C 5 5
89 Brunei 27983 A 5 5
90 Brunei 27984 T 5 5
91 Brunei 27985 A 5 5
92 Brunei 27986 T 5 5
93 Brunei 27987 G 5 5
94 Brunei 27988 T 5 5
95 Brunei 27989 A 5 5
96 Brunei 27990 G 5 5
97 Brunei 27991 T 5 5
98 Brunei 27992 T 5 5
99 Brunei 27993 G 5 5
100 Brunei 27994 A 5 5
101 Brunei 27995 T 5 5
102 Brunei 27996 G 5 5
103 Brunei 27997 A 5 5
104 Brunei 27998 C 5 5
105 Brunei 27999 C 5 5
106 Brunei 28000 C 5 5
107 Brunei 28001 G 5 5
108 Brunei 28002 T 5 5
109 Brunei 28003 G 5 5
110 Brunei 28004 T 5 5
111 Brunei 28005 C 5 5
112 Brunei 28006 C 5 5
113 Brunei 28007 T 5 5
114 Brunei 28008 A 5 5
115 Brunei 28009 T 5 5
116 Brunei 28010 T 5 5
117 Brunei 28011 C 5 5
118 Brunei 28012 A 5 5
119 Brunei 28013 C 5 5
120 Brunei 28014 T 5 5
121 Brunei 28015 T 5 5
122 Brunei 28016 C 5 5
123 Brunei 28017 T 5 5
124 Brunei 28018 A 5 5
125 Brunei 28019 T 5 5
126 Brunei 28020 T 5 5
127 Brunei 28021 C 5 5
128 Brunei 28022 T 5 5
129 Brunei 28023 A 5 5
130 Brunei 28024 A 5 5
131 Brunei 28025 A 5 5
132 Brunei 28026 T 5 5
133 Brunei 28027 G 5 5
134 Brunei 28028 G 5 5
135 Brunei 28029 T 5 5
136 Brunei 28030 A 5 5
137 Brunei 28031 T 5 5
138 Brunei 28032 A 5 5
139 Brunei 28033 T 5 5
140 Brunei 28034 T 5 5
141 Brunei 28035 A 5 5
142 Brunei 28036 G 5 5
143 Brunei 28037 A 5 5
144 Brunei 28038 G 5 5
145 Brunei 28039 T 5 5
146 Brunei 28040 A 5 5
147 Brunei 28041 G 5 5
148 Brunei 28042 G 5 5
149 Brunei 28043 A 5 5
150 Brunei 28044 G 5 5
151 Brunei 28045 C 5 5
152 Brunei 28046 T 5 5
153 Brunei 28047 A 5 5
154 Brunei 28048 G 5 5
155 Brunei 28049 A 5 5
156 Brunei 28050 A 5 5
157 Brunei 28051 A 5 5
158 Brunei 28052 A 5 5
159 Brunei 28053 T 5 5
160 Brunei 28054 C 5 5
161 Brunei 28055 A 5 5
162 Brunei 28056 G 5 5
163 Brunei 28057 C 5 5
164 Brunei 28058 A 5 5
165 Brunei 28059 C 5 5
166 Brunei 28060 C 5 5
167 Brunei 28061 T 5 5
168 Brunei 28062 T 5 5
169 Brunei 28063 T 5 5
170 Brunei 28064 A 5 5
171 Brunei 28065 A 5 5
172 Brunei 28066 T 5 5
173 Brunei 28067 T 5 5
174 Brunei 28068 G 5 5
175 Brunei 28069 A 5 5
176 Brunei 28070 A 5 5
177 Brunei 28071 T 5 5
178 Brunei 28072 T 5 5
179 Brunei 28073 G 5 5
180 Brunei 28074 T 5 5
181 Brunei 28075 G 5 5
182 Brunei 28076 C 5 5
183 Brunei 28077 G 5 5
184 Brunei 28078 T 5 5
185 Brunei 28079 G 5 5
186 Brunei 28080 G 5 5
187 Brunei 28081 A 5 5
188 Brunei 28082 T 5 5
189 Brunei 28083 G 5 5
190 Brunei 28084 A 5 5
191 Brunei 28085 G 5 5
192 Brunei 28086 G 5 5
193 Brunei 28087 C 5 5
194 Brunei 28088 T 5 5
195 Brunei 28089 G 5 5
196 Brunei 28090 G 5 5
197 Brunei 28091 T 5 5
198 Brunei 28092 T 5 5
199 Brunei 28093 C 5 5
200 Brunei 28094 T 5 5
201 Brunei 28095 A 5 5
202 Brunei 28096 A 5 5
203 Brunei 28097 A 5 5
204 Brunei 28098 T 5 5
205 Brunei 28099 C 5 5
206 Brunei 28100 A 5 5
207 Brunei 28101 C 5 5
208 Brunei 28102 C 5 5
209 Brunei 28103 C 5 5
210 Brunei 28104 A 5 5
211 Brunei 28105 T 5 5
212 Brunei 28106 T 5 5
213 Brunei 28107 C 5 5
214 Brunei 28108 A 5 5
215 Brunei 28109 G 5 5
216 Brunei 28110 T 5 5
217 Brunei 28111 A 5 5
218 Brunei 28112 C 5 5
219 Brunei 28113 A 5 5
220 Brunei 28114 T 5 5
221 Brunei 28115 C 5 5
222 Brunei 28116 G 5 5
223 Brunei 28117 A 5 5
224 Brunei 28118 T 5 5
225 Brunei 28119 A 5 5
226 Brunei 28120 T 5 5
227 Brunei 28121 C 5 5
228 Brunei 28122 G 5 5
229 Brunei 28123 G 5 5
230 Brunei 28124 T 5 5
231 Brunei 28125 A 5 5
232 Brunei 28126 A 5 5
233 Brunei 28127 T 5 5
234 Brunei 28128 T 5 5
235 Brunei 28129 A 5 5
236 Brunei 28130 T 5 5
237 Brunei 28131 A 5 5
238 Brunei 28132 C 5 5
239 Brunei 28133 A 5 5
240 Brunei 28134 G 5 5
241 Brunei 28135 T 5 5
242 Brunei 28136 T 5 5
243 Brunei 28137 T 5 5
244 Brunei 28138 C 5 5
245 Brunei 28139 C 5 5
246 Brunei 28140 T 5 5
247 Brunei 28141 G 5 5
248 Brunei 28142 T 5 5
249 Brunei 28143 T 5 5
250 Brunei 28144 T 5 5
251 Brunei 28145 A 5 5
252 Brunei 28146 C 5 5
253 Brunei 28147 C 5 5
254 Brunei 28148 T 5 5
255 Brunei 28149 T 5 5
256 Brunei 28150 T 5 5
257 Brunei 28151 T 5 5
258 Brunei 28152 A 5 5
259 Brunei 28153 C 5 5
260 Brunei 28154 A 5 5
261 Brunei 28155 A 5 5
262 Brunei 28156 T 5 5
263 Brunei 28157 T 5 5
264 Brunei 28158 A 5 5
265 Brunei 28159 A 5 5
266 Brunei 28160 T 5 5
267 Brunei 28161 T 5 5
268 Brunei 28162 G 5 5
269 Brunei 28163 C 5 5
270 Brunei 28164 C 5 5
271 Brunei 28165 A 5 5
272 Brunei 28166 G 5 5
273 Brunei 28167 G 5 5
274 Brunei 28168 A 5 5
275 Brunei 28169 A 5 5
276 Brunei 28170 C 5 5
277 Brunei 28171 C 5 5
278 Brunei 28172 T 5 5
279 Brunei 28173 A 5 5
280 Brunei 28174 A 5 5
281 Brunei 28175 A 5 5
282 Brunei 28176 T 5 5
283 Brunei 28177 T 5 5
284 Brunei 28178 G 5 5
285 Brunei 28179 G 5 5
286 Brunei 28180 G 5 5
287 Brunei 28181 T 5 5
288 Brunei 28182 A 5 5
289 Brunei 28183 G 5 5
290 Brunei 28184 T 5 5
291 Brunei 28185 C 5 5
292 Brunei 28186 T 5 5
293 Brunei 28187 T 5 5
294 Brunei 28188 G 5 5
295 Brunei 28189 T 5 5
296 Brunei 28190 A 5 5
297 Brunei 28191 G 5 5
298 Brunei 28192 T 5 5
299 Brunei 28193 G 5 5
300 Brunei 28194 C 5 5
301 Brunei 28195 G 5 5
302 Brunei 28196 T 5 5
303 Brunei 28197 T 5 5
304 Brunei 28198 G 5 5
305 Brunei 28199 T 5 5
306 Brunei 28200 T 5 5
307 Brunei 28201 C 5 5
308 Brunei 28202 G 5 5
309 Brunei 28203 T 5 5
310 Brunei 28204 T 5 5
311 Brunei 28205 C 5 5
312 Brunei 28206 T 5 5
313 Brunei 28207 A 5 5
314 Brunei 28208 T 5 5
315 Brunei 28209 G 5 5
316 Brunei 28210 A 5 5
317 Brunei 28211 A 5 5
318 Brunei 28212 G 5 5
319 Brunei 28213 A 5 5
320 Brunei 28214 C 5 5
321 Brunei 28215 T 5 5
322 Brunei 28216 T 5 5
323 Brunei 28217 T 5 5
324 Brunei 28218 T 5 5
325 Brunei 28219 T 5 5
326 Brunei 28220 A 5 5
327 Brunei 28221 G 5 5
328 Brunei 28222 A 5 5
329 Brunei 28223 G 5 5
330 Brunei 28224 T 5 5
331 Brunei 28225 A 5 5
332 Brunei 28226 T 5 5
333 Brunei 28227 C 5 5
334 Brunei 28228 A 5 5
335 Brunei 28229 T 5 5
336 Brunei 28230 G 5 5
337 Brunei 28231 A 5 5
338 Brunei 28232 C 5 5
339 Brunei 28233 G 5 5
340 Brunei 28234 T 5 5
341 Brunei 28235 T 5 5
342 Brunei 28236 C 5 5
343 Brunei 28237 G 5 5
344 Brunei 28238 T 5 5
345 Brunei 28239 G 5 5
346 Brunei 28240 T 5 5
347 Brunei 28241 T 5 5
348 Brunei 28242 G 5 5
349 Brunei 28243 T 5 5
350 Brunei 28244 T 5 5
351 Brunei 28245 T 5 5
352 Brunei 28246 T 5 5
353 Brunei 28247 A 5 5
354 Brunei 28248 G 5 5
355 Brunei 28249 A 5 5
356 Brunei 28250 T 5 5
357 Brunei 28251 T 5 5
358 Brunei 28252 T 5 5
359 Brunei 28253 C 5 5
360 Brunei 28254 A 5 5
361 Brunei 28255 T 5 5
362 Brunei 28256 C 5 5
363 Brunei 28257 T 5 5
364 Brunei 28258 A 5 5
365 Brunei 28259 A 5 5