National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V Y
*     3                                      
-     370                                      
?                                            
A     27                                      
C     18                                      
D     6                                      
E     24                                      
F     30                                      
G     12                                      
H     9                                      
I     25                                      
K     21                                      
L     45                                      
M     6                                      
N     6                                      
P     18                                      
Q     15                                      
R     15                                      
S     21                                      
T     30                                      
V     24                                      
Y     15                                      

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 27394 A 5 5
1 Brunei 27395 T 5 5
2 Brunei 27396 G 5 5
3 Brunei 27397 A 5 5
4 Brunei 27398 A 5 5
5 Brunei 27399 A 5 5
6 Brunei 27400 A 5 5
7 Brunei 27401 T 5 5
8 Brunei 27402 T 5 5
9 Brunei 27403 A 5 5
10 Brunei 27404 T 5 5
11 Brunei 27405 T 5 5
12 Brunei 27406 C 5 5
13 Brunei 27407 T 5 5
14 Brunei 27408 T 5 5
15 Brunei 27409 T 5 5
16 Brunei 27410 T 5 5
17 Brunei 27411 C 5 5
18 Brunei 27412 T 5 5
19 Brunei 27413 T 5 5
20 Brunei 27414 G 5 5
21 Brunei 27415 G 5 5
22 Brunei 27416 C 5 5
23 Brunei 27417 A 5 5
24 Brunei 27418 C 5 5
25 Brunei 27419 T 5 5
26 Brunei 27420 G 5 5
27 Brunei 27421 A 5 5
28 Brunei 27422 T 5 5
29 Brunei 27423 A 5 5
30 Brunei 27424 A 5 5
31 Brunei 27425 C 5 5
32 Brunei 27426 A 5 5
33 Brunei 27427 C 5 5
34 Brunei 27428 T 5 5
35 Brunei 27429 C 5 5
36 Brunei 27430 G 5 5
37 Brunei 27431 C 5 5
38 Brunei 27432 T 5 5
39 Brunei 27433 A 5 5
40 Brunei 27434 C 5 5
41 Brunei 27435 T 5 5
42 Brunei 27436 T 5 5
43 Brunei 27437 G 5 5
44 Brunei 27438 T 5 5
45 Brunei 27439 G 5 5
46 Brunei 27440 A 5 5
47 Brunei 27441 G 5 5
48 Brunei 27442 C 5 5
49 Brunei 27443 T 5 5
50 Brunei 27444 T 5 5
51 Brunei 27445 T 5 5
52 Brunei 27446 A 5 5
53 Brunei 27447 T 5 5
54 Brunei 27448 C 5 5
55 Brunei 27449 A 5 5
56 Brunei 27450 C 5 5
57 Brunei 27451 T 5 5
58 Brunei 27452 A 5 5
59 Brunei 27453 C 5 5
60 Brunei 27454 C 5 5
61 Brunei 27455 A 5 5
62 Brunei 27456 A 5 5
63 Brunei 27457 G 5 5
64 Brunei 27458 A 5 5
65 Brunei 27459 G 5 5
66 Brunei 27460 T 5 5
67 Brunei 27461 G 5 5
68 Brunei 27462 T 5 5
69 Brunei 27463 G 5 5
70 Brunei 27464 T 5 5
71 Brunei 27465 T 5 5
72 Brunei 27466 A 5 5
73 Brunei 27467 G 5 5
74 Brunei 27468 A 5 5
75 Brunei 27469 G 5 5
76 Brunei 27470 G 5 5
77 Brunei 27471 T 5 5
78 Brunei 27472 A 5 5
79 Brunei 27473 C 5 5
80 Brunei 27474 A 5 5
81 Brunei 27475 A 5 5
82 Brunei 27476 C 5 5
83 Brunei 27477 A 5 5
84 Brunei 27478 G 5 5
85 Brunei 27479 T 5 5
86 Brunei 27480 A 5 5
87 Brunei 27481 C 5 5
88 Brunei 27482 T 5 5
89 Brunei 27483 T 5 5
90 Brunei 27484 T 5 5
91 Brunei 27485 T 5 5
92 Brunei 27486 A 5 5
93 Brunei 27487 A 5 5
94 Brunei 27488 A 5 5
95 Brunei 27489 A 5 5
96 Brunei 27490 G 5 5
97 Brunei 27491 A 5 5
98 Brunei 27492 A 5 5
99 Brunei 27493 C 5 5
100 Brunei 27494 C 5 5
101 Brunei 27495 T 5 5
102 Brunei 27496 T 5 5
103 Brunei 27497 G 5 5
104 Brunei 27498 C 5 5
105 Brunei 27499 T 5 5
106 Brunei 27500 C 5 5
107 Brunei 27501 T 5 5
108 Brunei 27502 T 5 5
109 Brunei 27503 C 5 5
110 Brunei 27504 T 5 5
111 Brunei 27505 G 5 5
112 Brunei 27506 G 5 5
113 Brunei 27507 A 5 5
114 Brunei 27508 A 5 5
115 Brunei 27509 C 5 5
116 Brunei 27510 A 5 5
117 Brunei 27511 T 5 5
118 Brunei 27512 A 5 5
119 Brunei 27513 C 5 5
120 Brunei 27514 G 5 5
121 Brunei 27515 A 5 5
122 Brunei 27516 G 5 5
123 Brunei 27517 G 5 5
124 Brunei 27518 G 5 5
125 Brunei 27519 C 5 5
126 Brunei 27520 A 5 5
127 Brunei 27521 A 5 5
128 Brunei 27522 T 5 5
129 Brunei 27523 T 5 5
130 Brunei 27524 C 5 5
131 Brunei 27525 A 5 5
132 Brunei 27526 C 5 5
133 Brunei 27527 C 5 5
134 Brunei 27528 A 5 5
135 Brunei 27529 T 5 5
136 Brunei 27530 T 5 5
137 Brunei 27531 T 5 5
138 Brunei 27532 C 5 5
139 Brunei 27533 A 5 5
140 Brunei 27534 T 5 5
141 Brunei 27535 C 5 5
142 Brunei 27536 C 5 5
143 Brunei 27537 T 5 5
144 Brunei 27538 C 5 5
145 Brunei 27539 T 5 5
146 Brunei 27540 A 5 5
147 Brunei 27541 G 5 5
148 Brunei 27542 C 5 5
149 Brunei 27543 T 5 5
150 Brunei 27544 G 5 5
151 Brunei 27545 A 5 5
152 Brunei 27546 T 5 5
153 Brunei 27547 A 5 5
154 Brunei 27548 A 5 5
155 Brunei 27549 C 5 5
156 Brunei 27550 A 5 5
157 Brunei 27551 A 5 5
158 Brunei 27552 A 5 5
159 Brunei 27553 T 5 5
160 Brunei 27554 T 5 5
161 Brunei 27555 T 5 5
162 Brunei 27556 G 5 5
163 Brunei 27557 C 5 5
164 Brunei 27558 A 5 5
165 Brunei 27559 C 5 5
166 Brunei 27560 T 5 5
167 Brunei 27561 G 5 5
168 Brunei 27562 A 5 5
169 Brunei 27563 C 5 5
170 Brunei 27564 T 5 5
171 Brunei 27565 T 5 5
172 Brunei 27566 G 5 5
173 Brunei 27567 C 5 5
174 Brunei 27568 T 5 5
175 Brunei 27569 T 5 5
176 Brunei 27570 T 5 5
177 Brunei 27571 A 5 5
178 Brunei 27572 G 5 5
179 Brunei 27573 C 5 5
180 Brunei 27574 A 5 5
181 Brunei 27575 C 5 5
182 Brunei 27576 T 5 5
183 Brunei 27577 C 5 5
184 Brunei 27578 A 5 5
185 Brunei 27579 A 5 5
186 Brunei 27580 T 5 5
187 Brunei 27581 T 5 5
188 Brunei 27582 T 5 5
189 Brunei 27583 G 5 5
190 Brunei 27584 C 5 5
191 Brunei 27585 T 5 5
192 Brunei 27586 T 5 5
193 Brunei 27587 T 5 5
194 Brunei 27588 T 5 5
195 Brunei 27589 G 5 5
196 Brunei 27590 C 5 5
197 Brunei 27591 T 5 5
198 Brunei 27592 T 5 5
199 Brunei 27593 G 5 5
200 Brunei 27594 T 5 5
201 Brunei 27595 C 5 5
202 Brunei 27596 C 5 5
203 Brunei 27597 T 5 5
204 Brunei 27598 G 5 5
205 Brunei 27599 A 5 5
206 Brunei 27600 C 5 5
207 Brunei 27601 G 5 5
208 Brunei 27602 G 5 5
209 Brunei 27603 C 5 5
210 Brunei 27604 G 5 5
211 Brunei 27605 T 5 5
212 Brunei 27606 A 5 5
213 Brunei 27607 A 5 5
214 Brunei 27608 A 5 5
215 Brunei 27609 A 5 5
216 Brunei 27610 C 5 5
217 Brunei 27611 A 5 5
218 Brunei 27612 C 5 5
219 Brunei 27613 G 5 5
220 Brunei 27614 T 5 5
221 Brunei 27615 C 5 5
222 Brunei 27616 T 5 5
223 Brunei 27617 A 5 5
224 Brunei 27618 T 5 5
225 Brunei 27619 C 5 5
226 Brunei 27620 A 5 5
227 Brunei 27621 G 5 5
228 Brunei 27622 T 5 5
229 Brunei 27623 T 5 5
230 Brunei 27624 A 5 5
231 Brunei 27625 C 5 5
232 Brunei 27626 G 5 5
233 Brunei 27627 T 5 5
234 Brunei 27628 G 5 5
235 Brunei 27629 C 5 5
236 Brunei 27630 C 5 5
237 Brunei 27631 A 5 5
238 Brunei 27632 G 5 5
239 Brunei 27633 A 5 5
240 Brunei 27634 T 5 5
241 Brunei 27635 C 5 5
242 Brunei 27636 A 5 5
243 Brunei 27637 G 5 5
244 Brunei 27638 T 5 5
245 Brunei 27639 T 5 5
246 Brunei 27640 T 5 5
247 Brunei 27641 C 5 5
248 Brunei 27642 A 5 5
249 Brunei 27643 C 5 5
250 Brunei 27644 C 5 5
251 Brunei 27645 T 5 5
252 Brunei 27646 A 5 5
253 Brunei 27647 A 5 5
254 Brunei 27648 A 5 5
255 Brunei 27649 C 5 5
256 Brunei 27650 T 5 5
257 Brunei 27651 G 5 5
258 Brunei 27652 T 5 5
259 Brunei 27653 T 5 5
260 Brunei 27654 C 5 5
261 Brunei 27655 A 5 5
262 Brunei 27656 T 5 5
263 Brunei 27657 C 5 5
264 Brunei 27658 A 5 5
265 Brunei 27659 G 5 5
266 Brunei 27660 A 5 5
267 Brunei 27661 C 5 5
268 Brunei 27662 A 5 5
269 Brunei 27663 A 5 5
270 Brunei 27664 G 5 5
271 Brunei 27665 A 5 5
272 Brunei 27666 G 5 5
273 Brunei 27667 G 5 5
274 Brunei 27668 A 5 5
275 Brunei 27669 A 5 5
276 Brunei 27670 G 5 5
277 Brunei 27671 T 5 5
278 Brunei 27672 T 5 5
279 Brunei 27673 C 5 5
280 Brunei 27674 A 5 5
281 Brunei 27675 A 5 5
282 Brunei 27676 G 5 5
283 Brunei 27677 A 5 5
284 Brunei 27678 A 5 5
285 Brunei 27679 C 5 5
286 Brunei 27680 T 5 5
287 Brunei 27681 T 5 5
288 Brunei 27682 T 5 5
289 Brunei 27683 A 5 5
290 Brunei 27684 C 5 5
291 Brunei 27685 T 5 5
292 Brunei 27686 C 5 5
293 Brunei 27687 T 5 5
294 Brunei 27688 C 5 5
295 Brunei 27689 C 5 5
296 Brunei 27690 A 5 5
297 Brunei 27691 A 5 5
298 Brunei 27692 T 5 5
299 Brunei 27693 T 5 5
300 Brunei 27694 T 5 5
301 Brunei 27695 T 5 5
302 Brunei 27696 T 5 5
303 Brunei 27697 C 5 5
304 Brunei 27698 T 5 5
305 Brunei 27699 T 5 5
306 Brunei 27700 A 5 5
307 Brunei 27701 T 5 5
308 Brunei 27702 T 5 5
309 Brunei 27703 G 5 5
310 Brunei 27704 T 5 5
311 Brunei 27705 T 5 5
312 Brunei 27706 G 5 5
313 Brunei 27707 C 5 5
314 Brunei 27708 G 5 5
315 Brunei 27709 G 5 5
316 Brunei 27710 C 5 5
317 Brunei 27711 A 5 5
318 Brunei 27712 A 5 5
319 Brunei 27713 T 5 5
320 Brunei 27714 A 5 5
321 Brunei 27715 G 5 5
322 Brunei 27716 T 5 5
323 Brunei 27717 G 5 5
324 Brunei 27718 T 5 5
325 Brunei 27719 T 5 5
326 Brunei 27720 T 5 5
327 Brunei 27721 A 5 5
328 Brunei 27722 T 5 5
329 Brunei 27723 A 5 5
330 Brunei 27724 A 5 5
331 Brunei 27725 C 5 5
332 Brunei 27726 A 5 5
333 Brunei 27727 C 5 5
334 Brunei 27728 T 5 5
335 Brunei 27729 T 5 5
336 Brunei 27730 T 5 5
337 Brunei 27731 G 5 5
338 Brunei 27732 C 5 5
339 Brunei 27733 T 5 5
340 Brunei 27734 T 5 5
341 Brunei 27735 C 5 5
342 Brunei 27736 A 5 5
343 Brunei 27737 C 5 5
344 Brunei 27738 A 5 5
345 Brunei 27739 C 5 5
346 Brunei 27740 T 5 5
347 Brunei 27741 C 5 5
348 Brunei 27742 A 5 5
349 Brunei 27743 A 5 5
350 Brunei 27744 A 5 5
351 Brunei 27745 A 5 5
352 Brunei 27746 G 5 5
353 Brunei 27747 A 5 5
354 Brunei 27748 A 5 5
355 Brunei 27749 A 5 5
356 Brunei 27750 G 5 5
357 Brunei 27751 A 5 5
358 Brunei 27752 C 5 5
359 Brunei 27753 A 5 5
360 Brunei 27754 G 5 5
361 Brunei 27755 A 5 5
362 Brunei 27756 A 5 5
363 Brunei 27757 T 5 5
364 Brunei 27758 G 5 5
365 Brunei 27759 A 5 5