National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V Y
*     3                                      
-     370                                      
?                                            
A     27                                      
C     18                                      
D     6                                      
E     24                                      
F     30                                      
G     12                                      
H     9                                      
I     25                                      
K     21                                      
L     45                                      
M     6                                      
N     6                                      
P     18                                      
Q     15                                      
R     15                                      
S     21                                      
T     30                                      
V     24                                      
Y     15                                      

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Bosnia_and_Herzegovina 27394 A 33 33
1 Bosnia_and_Herzegovina 27395 T 33 33
2 Bosnia_and_Herzegovina 27396 G 33 33
3 Bosnia_and_Herzegovina 27397 A 33 33
4 Bosnia_and_Herzegovina 27398 A 33 33
5 Bosnia_and_Herzegovina 27399 A 33 33
6 Bosnia_and_Herzegovina 27400 A 33 33
7 Bosnia_and_Herzegovina 27401 T 33 33
8 Bosnia_and_Herzegovina 27402 T 33 33
9 Bosnia_and_Herzegovina 27403 A 33 33
10 Bosnia_and_Herzegovina 27404 T 33 33
11 Bosnia_and_Herzegovina 27405 T 33 33
12 Bosnia_and_Herzegovina 27406 C 33 33
13 Bosnia_and_Herzegovina 27407 T 33 33
14 Bosnia_and_Herzegovina 27408 T 33 33
15 Bosnia_and_Herzegovina 27409 T 33 33
16 Bosnia_and_Herzegovina 27410 T 33 33
17 Bosnia_and_Herzegovina 27411 C 33 33
18 Bosnia_and_Herzegovina 27412 T 33 33
19 Bosnia_and_Herzegovina 27413 T 33 33
20 Bosnia_and_Herzegovina 27414 G 33 33
21 Bosnia_and_Herzegovina 27415 G 33 33
22 Bosnia_and_Herzegovina 27416 C 33 33
23 Bosnia_and_Herzegovina 27417 A 33 33
24 Bosnia_and_Herzegovina 27418 C 33 33
25 Bosnia_and_Herzegovina 27419 T 33 33
26 Bosnia_and_Herzegovina 27420 G 33 33
27 Bosnia_and_Herzegovina 27421 A 33 33
28 Bosnia_and_Herzegovina 27422 T 33 33
29 Bosnia_and_Herzegovina 27423 A 33 33
30 Bosnia_and_Herzegovina 27424 A 33 33
31 Bosnia_and_Herzegovina 27425 C 33 33
32 Bosnia_and_Herzegovina 27426 A 33 33
33 Bosnia_and_Herzegovina 27427 C 33 33
34 Bosnia_and_Herzegovina 27428 T 33 33
35 Bosnia_and_Herzegovina 27429 C 33 33
36 Bosnia_and_Herzegovina 27430 G 33 33
37 Bosnia_and_Herzegovina 27431 C 33 33
38 Bosnia_and_Herzegovina 27432 T 33 33
39 Bosnia_and_Herzegovina 27433 A 33 33
40 Bosnia_and_Herzegovina 27434 C 33 33
41 Bosnia_and_Herzegovina 27435 T 33 33
42 Bosnia_and_Herzegovina 27436 T 33 33
43 Bosnia_and_Herzegovina 27437 G 33 33
44 Bosnia_and_Herzegovina 27438 T 33 33
45 Bosnia_and_Herzegovina 27439 G 33 33
46 Bosnia_and_Herzegovina 27440 A 33 33
47 Bosnia_and_Herzegovina 27441 G 33 33
48 Bosnia_and_Herzegovina 27442 C 33 33
49 Bosnia_and_Herzegovina 27443 T 33 33
50 Bosnia_and_Herzegovina 27444 T 33 33
51 Bosnia_and_Herzegovina 27445 T 33 33
52 Bosnia_and_Herzegovina 27446 A 33 33
53 Bosnia_and_Herzegovina 27447 T 33 33
54 Bosnia_and_Herzegovina 27448 C 33 33
55 Bosnia_and_Herzegovina 27449 A 33 33
56 Bosnia_and_Herzegovina 27450 C 33 33
57 Bosnia_and_Herzegovina 27451 T 33 33
58 Bosnia_and_Herzegovina 27452 A 33 33
59 Bosnia_and_Herzegovina 27453 C 33 33
60 Bosnia_and_Herzegovina 27454 C 33 33
61 Bosnia_and_Herzegovina 27455 A 33 33
62 Bosnia_and_Herzegovina 27456 A 33 33
63 Bosnia_and_Herzegovina 27457 G 33 33
64 Bosnia_and_Herzegovina 27458 A 33 33
65 Bosnia_and_Herzegovina 27459 G 33 33
66 Bosnia_and_Herzegovina 27460 T 33 33
67 Bosnia_and_Herzegovina 27461 G 33 33
68 Bosnia_and_Herzegovina 27462 T 33 33
69 Bosnia_and_Herzegovina 27463 G 33 33
70 Bosnia_and_Herzegovina 27464 T 33 33
71 Bosnia_and_Herzegovina 27465 T 33 33
72 Bosnia_and_Herzegovina 27466 A 33 33
73 Bosnia_and_Herzegovina 27467 G 33 33
74 Bosnia_and_Herzegovina 27468 A 33 33
75 Bosnia_and_Herzegovina 27469 G 33 33
76 Bosnia_and_Herzegovina 27470 G 33 33
77 Bosnia_and_Herzegovina 27471 T 33 33
78 Bosnia_and_Herzegovina 27472 A 33 33
79 Bosnia_and_Herzegovina 27473 C 33 33
80 Bosnia_and_Herzegovina 27474 A 33 33
81 Bosnia_and_Herzegovina 27475 A 33 33
82 Bosnia_and_Herzegovina 27476 C 33 33
83 Bosnia_and_Herzegovina 27477 A 33 33
84 Bosnia_and_Herzegovina 27478 G 33 33
85 Bosnia_and_Herzegovina 27479 T 33 33
86 Bosnia_and_Herzegovina 27480 A 33 33
87 Bosnia_and_Herzegovina 27481 C 33 33
88 Bosnia_and_Herzegovina 27482 T 33 33
89 Bosnia_and_Herzegovina 27483 T 33 33
90 Bosnia_and_Herzegovina 27484 T 33 33
91 Bosnia_and_Herzegovina 27485 T 33 33
92 Bosnia_and_Herzegovina 27486 A 33 33
93 Bosnia_and_Herzegovina 27487 A 33 33
94 Bosnia_and_Herzegovina 27488 A 33 33
95 Bosnia_and_Herzegovina 27489 A 33 33
96 Bosnia_and_Herzegovina 27490 G 33 33
97 Bosnia_and_Herzegovina 27491 A 33 33
98 Bosnia_and_Herzegovina 27492 A 33 33
99 Bosnia_and_Herzegovina 27493 C 33 33
100 Bosnia_and_Herzegovina 27494 C 33 33
101 Bosnia_and_Herzegovina 27495 T 33 33
102 Bosnia_and_Herzegovina 27496 T 33 33
103 Bosnia_and_Herzegovina 27497 G 33 33
104 Bosnia_and_Herzegovina 27498 C 33 33
105 Bosnia_and_Herzegovina 27499 T 33 33
106 Bosnia_and_Herzegovina 27500 C 33 33
107 Bosnia_and_Herzegovina 27501 T 33 33
108 Bosnia_and_Herzegovina 27502 T 33 33
109 Bosnia_and_Herzegovina 27503 C 33 33
110 Bosnia_and_Herzegovina 27504 T 33 33
111 Bosnia_and_Herzegovina 27505 G 33 33
112 Bosnia_and_Herzegovina 27506 G 33 33
113 Bosnia_and_Herzegovina 27507 A 33 33
114 Bosnia_and_Herzegovina 27508 A 33 33
115 Bosnia_and_Herzegovina 27509 C 33 33
116 Bosnia_and_Herzegovina 27510 A 33 33
117 Bosnia_and_Herzegovina 27511 T 33 33
118 Bosnia_and_Herzegovina 27512 A 33 33
119 Bosnia_and_Herzegovina 27513 C 33 33
120 Bosnia_and_Herzegovina 27514 G 33 33
121 Bosnia_and_Herzegovina 27515 A 33 33
122 Bosnia_and_Herzegovina 27516 G 33 33
123 Bosnia_and_Herzegovina 27517 G 33 33
124 Bosnia_and_Herzegovina 27518 G 33 33
125 Bosnia_and_Herzegovina 27519 C 33 33
126 Bosnia_and_Herzegovina 27520 A 33 33
127 Bosnia_and_Herzegovina 27521 A 33 33
128 Bosnia_and_Herzegovina 27522 T 33 33
129 Bosnia_and_Herzegovina 27523 T 33 33
130 Bosnia_and_Herzegovina 27524 C 33 33
131 Bosnia_and_Herzegovina 27525 A 33 33
132 Bosnia_and_Herzegovina 27526 C 33 33
133 Bosnia_and_Herzegovina 27527 C 33 33
134 Bosnia_and_Herzegovina 27528 A 33 33
135 Bosnia_and_Herzegovina 27529 T 33 33
136 Bosnia_and_Herzegovina 27530 T 33 33
137 Bosnia_and_Herzegovina 27531 T 33 33
138 Bosnia_and_Herzegovina 27532 C 33 33
139 Bosnia_and_Herzegovina 27533 A 33 33
140 Bosnia_and_Herzegovina 27534 T 33 33
141 Bosnia_and_Herzegovina 27535 C 33 33
142 Bosnia_and_Herzegovina 27536 C 33 33
143 Bosnia_and_Herzegovina 27537 T 33 33
144 Bosnia_and_Herzegovina 27538 C 33 33
145 Bosnia_and_Herzegovina 27539 T 33 33
146 Bosnia_and_Herzegovina 27540 A 33 33
147 Bosnia_and_Herzegovina 27541 G 33 33
148 Bosnia_and_Herzegovina 27542 C 33 33
149 Bosnia_and_Herzegovina 27543 T 33 33
150 Bosnia_and_Herzegovina 27544 G 33 33
151 Bosnia_and_Herzegovina 27545 A 33 33
152 Bosnia_and_Herzegovina 27546 T 33 33
153 Bosnia_and_Herzegovina 27547 A 33 33
154 Bosnia_and_Herzegovina 27548 A 33 33
155 Bosnia_and_Herzegovina 27549 C 33 33
156 Bosnia_and_Herzegovina 27550 A 33 33
157 Bosnia_and_Herzegovina 27551 A 33 33
158 Bosnia_and_Herzegovina 27552 A 33 33
159 Bosnia_and_Herzegovina 27553 T 33 33
160 Bosnia_and_Herzegovina 27554 T 33 33
161 Bosnia_and_Herzegovina 27555 T 33 33
162 Bosnia_and_Herzegovina 27556 G 33 33
163 Bosnia_and_Herzegovina 27557 C 33 33
164 Bosnia_and_Herzegovina 27558 A 33 33
165 Bosnia_and_Herzegovina 27559 C 33 33
166 Bosnia_and_Herzegovina 27560 T 33 33
167 Bosnia_and_Herzegovina 27561 G 33 33
168 Bosnia_and_Herzegovina 27562 A 33 33
169 Bosnia_and_Herzegovina 27563 C 33 33
170 Bosnia_and_Herzegovina 27564 T 33 33
171 Bosnia_and_Herzegovina 27565 T 33 33
172 Bosnia_and_Herzegovina 27566 G 33 33
173 Bosnia_and_Herzegovina 27567 C 33 33
174 Bosnia_and_Herzegovina 27568 T 33 33
175 Bosnia_and_Herzegovina 27569 T 33 33
176 Bosnia_and_Herzegovina 27570 T 33 33
177 Bosnia_and_Herzegovina 27571 A 33 33
178 Bosnia_and_Herzegovina 27572 G 33 33
179 Bosnia_and_Herzegovina 27573 C 33 33
180 Bosnia_and_Herzegovina 27574 A 33 33
181 Bosnia_and_Herzegovina 27575 C 33 33
182 Bosnia_and_Herzegovina 27576 T 33 33
183 Bosnia_and_Herzegovina 27577 C 33 33
184 Bosnia_and_Herzegovina 27578 A 33 33
185 Bosnia_and_Herzegovina 27579 A 33 33
186 Bosnia_and_Herzegovina 27580 T 33 33
187 Bosnia_and_Herzegovina 27581 T 33 33
188 Bosnia_and_Herzegovina 27582 T 33 33
189 Bosnia_and_Herzegovina 27583 G 33 33
190 Bosnia_and_Herzegovina 27584 C 33 33
191 Bosnia_and_Herzegovina 27585 T 33 33
192 Bosnia_and_Herzegovina 27586 T 33 33
193 Bosnia_and_Herzegovina 27587 T 33 33
194 Bosnia_and_Herzegovina 27588 T 33 33
195 Bosnia_and_Herzegovina 27589 G 33 33
196 Bosnia_and_Herzegovina 27590 C 33 33
197 Bosnia_and_Herzegovina 27591 T 33 33
198 Bosnia_and_Herzegovina 27592 T 33 33
199 Bosnia_and_Herzegovina 27593 G 33 33
200 Bosnia_and_Herzegovina 27594 T 33 33
201 Bosnia_and_Herzegovina 27595 C 33 33
202 Bosnia_and_Herzegovina 27596 C 33 33
203 Bosnia_and_Herzegovina 27597 T 33 33
204 Bosnia_and_Herzegovina 27598 G 33 33
205 Bosnia_and_Herzegovina 27599 A 33 33
206 Bosnia_and_Herzegovina 27600 C 33 33
207 Bosnia_and_Herzegovina 27601 G 33 33
208 Bosnia_and_Herzegovina 27602 G 33 33
209 Bosnia_and_Herzegovina 27603 C 33 33
210 Bosnia_and_Herzegovina 27604 G 33 33
211 Bosnia_and_Herzegovina 27605 T 33 33
212 Bosnia_and_Herzegovina 27606 A 33 33
213 Bosnia_and_Herzegovina 27607 A 33 33
214 Bosnia_and_Herzegovina 27608 A 33 33
215 Bosnia_and_Herzegovina 27609 A 33 33
216 Bosnia_and_Herzegovina 27610 C 33 33
217 Bosnia_and_Herzegovina 27611 A 33 33
218 Bosnia_and_Herzegovina 27612 C 33 33
219 Bosnia_and_Herzegovina 27613 G 33 33
220 Bosnia_and_Herzegovina 27614 T 33 33
221 Bosnia_and_Herzegovina 27615 C 33 33
222 Bosnia_and_Herzegovina 27616 T 33 33
223 Bosnia_and_Herzegovina 27617 A 33 33
224 Bosnia_and_Herzegovina 27618 T 33 33
225 Bosnia_and_Herzegovina 27619 C 33 33
226 Bosnia_and_Herzegovina 27620 A 33 33
227 Bosnia_and_Herzegovina 27621 G 33 33
228 Bosnia_and_Herzegovina 27622 T 33 33
229 Bosnia_and_Herzegovina 27623 T 33 33
230 Bosnia_and_Herzegovina 27624 A 33 33
231 Bosnia_and_Herzegovina 27625 C 33 33
232 Bosnia_and_Herzegovina 27626 G 33 33
233 Bosnia_and_Herzegovina 27627 T 33 33
234 Bosnia_and_Herzegovina 27628 G 33 33
235 Bosnia_and_Herzegovina 27629 C 33 33
236 Bosnia_and_Herzegovina 27630 C 33 33
237 Bosnia_and_Herzegovina 27631 A 33 33
238 Bosnia_and_Herzegovina 27632 G 33 33
239 Bosnia_and_Herzegovina 27633 A 33 33
240 Bosnia_and_Herzegovina 27634 T 33 33
241 Bosnia_and_Herzegovina 27635 C 33 33
242 Bosnia_and_Herzegovina 27636 A 33 33
243 Bosnia_and_Herzegovina 27637 G 33 33
244 Bosnia_and_Herzegovina 27638 T 33 33
245 Bosnia_and_Herzegovina 27639 T 33 33
246 Bosnia_and_Herzegovina 27640 T 33 33
247 Bosnia_and_Herzegovina 27641 C 33 33
248 Bosnia_and_Herzegovina 27642 A 33 33
249 Bosnia_and_Herzegovina 27643 C 33 33
250 Bosnia_and_Herzegovina 27644 C 33 33
251 Bosnia_and_Herzegovina 27645 T 33 33
252 Bosnia_and_Herzegovina 27646 A 33 33
253 Bosnia_and_Herzegovina 27647 A 33 33
254 Bosnia_and_Herzegovina 27648 A 33 33
255 Bosnia_and_Herzegovina 27649 C 33 33
256 Bosnia_and_Herzegovina 27650 T 33 33
257 Bosnia_and_Herzegovina 27651 G 33 33
258 Bosnia_and_Herzegovina 27652 T 33 33
259 Bosnia_and_Herzegovina 27653 T 33 33
260 Bosnia_and_Herzegovina 27654 C 33 33
261 Bosnia_and_Herzegovina 27655 A 33 33
262 Bosnia_and_Herzegovina 27656 T 33 33
263 Bosnia_and_Herzegovina 27657 C 33 33
264 Bosnia_and_Herzegovina 27658 A 33 33
265 Bosnia_and_Herzegovina 27659 G 33 33
266 Bosnia_and_Herzegovina 27660 A 33 33
267 Bosnia_and_Herzegovina 27661 C 33 33
268 Bosnia_and_Herzegovina 27662 A 33 33
269 Bosnia_and_Herzegovina 27663 A 33 33
270 Bosnia_and_Herzegovina 27664 G 33 33
271 Bosnia_and_Herzegovina 27665 A 33 33
272 Bosnia_and_Herzegovina 27666 G 33 33
273 Bosnia_and_Herzegovina 27667 G 33 33
274 Bosnia_and_Herzegovina 27668 A 33 33
275 Bosnia_and_Herzegovina 27669 A 33 33
276 Bosnia_and_Herzegovina 27670 G 33 33
277 Bosnia_and_Herzegovina 27671 T 33 33
278 Bosnia_and_Herzegovina 27672 T 33 33
279 Bosnia_and_Herzegovina 27673 C 33 33
280 Bosnia_and_Herzegovina 27674 A 33 33
281 Bosnia_and_Herzegovina 27675 A 33 33
282 Bosnia_and_Herzegovina 27676 G 33 33
283 Bosnia_and_Herzegovina 27677 A 33 33
284 Bosnia_and_Herzegovina 27678 A 33 33
285 Bosnia_and_Herzegovina 27679 C 33 33
286 Bosnia_and_Herzegovina 27680 T 33 33
287 Bosnia_and_Herzegovina 27681 T 33 33
288 Bosnia_and_Herzegovina 27682 T 33 33
289 Bosnia_and_Herzegovina 27683 A 33 33
290 Bosnia_and_Herzegovina 27684 C 33 33
291 Bosnia_and_Herzegovina 27685 T 33 33
292 Bosnia_and_Herzegovina 27686 C 33 33
293 Bosnia_and_Herzegovina 27687 T 33 33
294 Bosnia_and_Herzegovina 27688 C 33 33
295 Bosnia_and_Herzegovina 27689 C 33 33
296 Bosnia_and_Herzegovina 27690 A 33 33
297 Bosnia_and_Herzegovina 27691 A 33 33
298 Bosnia_and_Herzegovina 27692 T 33 33
299 Bosnia_and_Herzegovina 27693 T 33 33
300 Bosnia_and_Herzegovina 27694 T 33 33
301 Bosnia_and_Herzegovina 27695 T 33 33
302 Bosnia_and_Herzegovina 27696 T 33 33
303 Bosnia_and_Herzegovina 27697 C 33 33
304 Bosnia_and_Herzegovina 27698 T 33 33
305 Bosnia_and_Herzegovina 27699 T 33 33
306 Bosnia_and_Herzegovina 27700 A 33 33
307 Bosnia_and_Herzegovina 27701 T 33 33
308 Bosnia_and_Herzegovina 27702 T 33 33
309 Bosnia_and_Herzegovina 27703 G 33 33
310 Bosnia_and_Herzegovina 27704 T 33 33
311 Bosnia_and_Herzegovina 27705 T 33 33
312 Bosnia_and_Herzegovina 27706 G 33 33
313 Bosnia_and_Herzegovina 27707 C 33 33
314 Bosnia_and_Herzegovina 27708 G 33 33
315 Bosnia_and_Herzegovina 27709 G 33 33
316 Bosnia_and_Herzegovina 27710 C 33 33
317 Bosnia_and_Herzegovina 27711 A 33 33
318 Bosnia_and_Herzegovina 27712 A 33 33
319 Bosnia_and_Herzegovina 27713 T 33 33
320 Bosnia_and_Herzegovina 27714 A 33 33
321 Bosnia_and_Herzegovina 27715 G 33 33
322 Bosnia_and_Herzegovina 27716 T 33 33
323 Bosnia_and_Herzegovina 27717 G 33 33
324 Bosnia_and_Herzegovina 27718 T 33 33
325 Bosnia_and_Herzegovina 27719 T 33 33
326 Bosnia_and_Herzegovina 27720 T 33 33
327 Bosnia_and_Herzegovina 27721 A 33 33
328 Bosnia_and_Herzegovina 27722 T 33 33
329 Bosnia_and_Herzegovina 27723 A 33 33
330 Bosnia_and_Herzegovina 27724 A 33 33
331 Bosnia_and_Herzegovina 27725 C 33 33
332 Bosnia_and_Herzegovina 27726 A 33 33
333 Bosnia_and_Herzegovina 27727 C 33 33
334 Bosnia_and_Herzegovina 27728 T 33 33
335 Bosnia_and_Herzegovina 27729 T 33 33
336 Bosnia_and_Herzegovina 27730 T 33 33
337 Bosnia_and_Herzegovina 27731 G 33 33
338 Bosnia_and_Herzegovina 27732 C 33 33
339 Bosnia_and_Herzegovina 27733 T 33 33
340 Bosnia_and_Herzegovina 27734 T 33 33
341 Bosnia_and_Herzegovina 27735 C 33 33
342 Bosnia_and_Herzegovina 27736 A 33 33
343 Bosnia_and_Herzegovina 27737 C 33 33
344 Bosnia_and_Herzegovina 27738 A 33 33
345 Bosnia_and_Herzegovina 27739 C 33 33
346 Bosnia_and_Herzegovina 27740 T 33 33
347 Bosnia_and_Herzegovina 27741 C 33 33
348 Bosnia_and_Herzegovina 27742 A 33 33
349 Bosnia_and_Herzegovina 27743 A 33 33
350 Bosnia_and_Herzegovina 27744 A 33 33
351 Bosnia_and_Herzegovina 27745 A 33 33
352 Bosnia_and_Herzegovina 27746 G 33 33
353 Bosnia_and_Herzegovina 27747 A 33 33
354 Bosnia_and_Herzegovina 27748 A 33 33
355 Bosnia_and_Herzegovina 27749 A 33 33
356 Bosnia_and_Herzegovina 27750 G 33 33
357 Bosnia_and_Herzegovina 27751 A 33 33
358 Bosnia_and_Herzegovina 27752 C 33 33
359 Bosnia_and_Herzegovina 27753 A 33 33
360 Bosnia_and_Herzegovina 27754 G 33 33
361 Bosnia_and_Herzegovina 27755 A 33 33
362 Bosnia_and_Herzegovina 27756 A 33 33
363 Bosnia_and_Herzegovina 27757 T 33 33
364 Bosnia_and_Herzegovina 27758 G 33 33
365 Bosnia_and_Herzegovina 27759 A 33 33