National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.

Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V Y
*     3                                      
-     370                                      
?                                            
A     27                                      
C     18                                      
D     6                                      
E     24                                      
F     30                                      
G     12                                      
H     9                                      
I     25                                      
K     21                                      
L     45                                      
M     6                                      
N     6                                      
P     18                                      
Q     15                                      
R     15                                      
S     21                                      
T     30                                      
V     24                                      
Y     15                                      

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide

Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Algeria 27394 A 18 18
1 Algeria 27395 T 18 18
2 Algeria 27396 G 18 18
3 Algeria 27397 A 18 18
4 Algeria 27398 A 18 18
5 Algeria 27399 A 18 18
6 Algeria 27400 A 18 18
7 Algeria 27401 T 18 18
8 Algeria 27402 T 18 18
9 Algeria 27403 A 18 18
10 Algeria 27404 T 18 18
11 Algeria 27405 T 18 18
12 Algeria 27406 C 18 18
13 Algeria 27407 T 18 18
14 Algeria 27408 T 18 18
15 Algeria 27409 T 18 18
16 Algeria 27410 T 18 18
17 Algeria 27411 C 18 18
18 Algeria 27412 T 18 18
19 Algeria 27413 T 18 18
20 Algeria 27414 G 18 18
21 Algeria 27415 G 18 18
22 Algeria 27416 C 18 18
23 Algeria 27417 A 18 18
24 Algeria 27418 C 18 18
25 Algeria 27419 T 18 18
26 Algeria 27420 G 18 18
27 Algeria 27421 A 18 18
28 Algeria 27422 T 18 18
29 Algeria 27423 A 18 18
30 Algeria 27424 A 18 18
31 Algeria 27425 C 18 18
32 Algeria 27426 A 18 18
33 Algeria 27427 C 18 18
34 Algeria 27428 T 18 18
35 Algeria 27429 C 18 18
36 Algeria 27430 G 18 18
37 Algeria 27431 C 18 18
38 Algeria 27432 T 18 18
39 Algeria 27433 A 18 18
40 Algeria 27434 C 18 18
41 Algeria 27435 T 18 18
42 Algeria 27436 T 18 18
43 Algeria 27437 G 18 18
44 Algeria 27438 T 18 18
45 Algeria 27439 G 18 18
46 Algeria 27440 A 18 18
47 Algeria 27441 G 18 18
48 Algeria 27442 C 18 18
49 Algeria 27443 T 18 18
50 Algeria 27444 T 18 18
51 Algeria 27445 T 18 18
52 Algeria 27446 A 18 18
53 Algeria 27447 T 18 18
54 Algeria 27448 C 18 18
55 Algeria 27449 A 18 18
56 Algeria 27450 C 18 18
57 Algeria 27451 T 18 18
58 Algeria 27452 A 18 18
59 Algeria 27453 C 18 18
60 Algeria 27454 C 18 18
61 Algeria 27455 A 18 18
62 Algeria 27456 A 18 18
63 Algeria 27457 G 18 18
64 Algeria 27458 A 18 18
65 Algeria 27459 G 18 18
66 Algeria 27460 T 18 18
67 Algeria 27461 G 18 18
68 Algeria 27462 T 18 18
69 Algeria 27463 G 18 18
70 Algeria 27464 T 18 18
71 Algeria 27465 T 18 18
72 Algeria 27466 A 18 18
73 Algeria 27467 G 18 18
74 Algeria 27468 A 18 18
75 Algeria 27469 G 18 18
76 Algeria 27470 G 18 18
77 Algeria 27471 T 18 18
78 Algeria 27472 A 18 18
79 Algeria 27473 C 18 18
80 Algeria 27474 A 18 18
81 Algeria 27475 A 18 18
82 Algeria 27476 C 18 18
83 Algeria 27477 A 18 18
84 Algeria 27478 G 18 18
85 Algeria 27479 T 18 18
86 Algeria 27480 A 18 18
87 Algeria 27481 C 18 18
88 Algeria 27482 T 18 18
89 Algeria 27483 T 18 18
90 Algeria 27484 T 18 18
91 Algeria 27485 T 18 18
92 Algeria 27486 A 18 18
93 Algeria 27487 A 18 18
94 Algeria 27488 A 18 18
95 Algeria 27489 A 18 18
96 Algeria 27490 G 18 18
97 Algeria 27491 A 18 18
98 Algeria 27492 A 18 18
99 Algeria 27493 C 18 18
100 Algeria 27494 C 18 18
101 Algeria 27495 T 18 18
102 Algeria 27496 T 18 18
103 Algeria 27497 G 18 18
104 Algeria 27498 C 18 18
105 Algeria 27499 T 18 18
106 Algeria 27500 C 18 18
107 Algeria 27501 T 18 18
108 Algeria 27502 T 18 18
109 Algeria 27503 C 18 18
110 Algeria 27504 T 18 18
111 Algeria 27505 G 18 18
112 Algeria 27506 G 18 18
113 Algeria 27507 A 18 18
114 Algeria 27508 A 18 18
115 Algeria 27509 C 18 18
116 Algeria 27510 A 18 18
117 Algeria 27511 T 18 18
118 Algeria 27512 A 18 18
119 Algeria 27513 C 18 18
120 Algeria 27514 G 18 18
121 Algeria 27515 A 18 18
122 Algeria 27516 G 18 18
123 Algeria 27517 G 18 18
124 Algeria 27518 G 18 18
125 Algeria 27519 C 18 18
126 Algeria 27520 A 18 18
127 Algeria 27521 A 18 18
128 Algeria 27522 T 18 18
129 Algeria 27523 T 18 18
130 Algeria 27524 C 18 18
131 Algeria 27525 A 18 18
132 Algeria 27526 C 18 18
133 Algeria 27527 C 18 18
134 Algeria 27528 A 18 18
135 Algeria 27529 T 18 18
136 Algeria 27530 T 18 18
137 Algeria 27531 T 18 18
138 Algeria 27532 C 18 18
139 Algeria 27533 A 18 18
140 Algeria 27534 T 18 18
141 Algeria 27535 C 18 18
142 Algeria 27536 C 18 18
143 Algeria 27537 T 18 18
144 Algeria 27538 C 18 18
145 Algeria 27539 T 18 18
146 Algeria 27540 A 18 18
147 Algeria 27541 G 18 18
148 Algeria 27542 C 18 18
149 Algeria 27543 T 18 18
150 Algeria 27544 G 18 18
151 Algeria 27545 A 18 18
152 Algeria 27546 T 18 18
153 Algeria 27547 A 18 18
154 Algeria 27548 A 18 18
155 Algeria 27549 C 18 18
156 Algeria 27550 A 18 18
157 Algeria 27551 A 18 18
158 Algeria 27552 A 18 18
159 Algeria 27553 T 18 18
160 Algeria 27554 T 18 18
161 Algeria 27555 T 18 18
162 Algeria 27556 G 18 18
163 Algeria 27557 C 18 18
164 Algeria 27558 A 18 18
165 Algeria 27559 C 18 18
166 Algeria 27560 T 18 18
167 Algeria 27561 G 18 18
168 Algeria 27562 A 18 18
169 Algeria 27563 C 18 18
170 Algeria 27564 T 18 18
171 Algeria 27565 T 18 18
172 Algeria 27566 G 18 18
173 Algeria 27567 C 18 18
174 Algeria 27568 T 18 18
175 Algeria 27569 T 18 18
176 Algeria 27570 T 18 18
177 Algeria 27571 A 18 18
178 Algeria 27572 G 18 18
179 Algeria 27573 C 18 18
180 Algeria 27574 A 18 18
181 Algeria 27575 C 18 18
182 Algeria 27576 T 18 18
183 Algeria 27577 C 18 18
184 Algeria 27578 A 18 18
185 Algeria 27579 A 18 18
186 Algeria 27580 T 18 18
187 Algeria 27581 T 18 18
188 Algeria 27582 T 18 18
189 Algeria 27583 G 18 18
190 Algeria 27584 C 18 18
191 Algeria 27585 T 18 18
192 Algeria 27586 T 18 18
193 Algeria 27587 T 18 18
194 Algeria 27588 T 18 18
195 Algeria 27589 G 18 18
196 Algeria 27590 C 18 18
197 Algeria 27591 T 18 18
198 Algeria 27592 T 18 18
199 Algeria 27593 G 18 18
200 Algeria 27594 T 18 18
201 Algeria 27595 C 18 18
202 Algeria 27596 C 18 18
203 Algeria 27597 T 18 18
204 Algeria 27598 G 18 18
205 Algeria 27599 A 18 18
206 Algeria 27600 C 18 18
207 Algeria 27601 G 18 18
208 Algeria 27602 G 18 18
209 Algeria 27603 C 18 18
210 Algeria 27604 G 18 18
211 Algeria 27605 T 18 18
212 Algeria 27606 A 18 18
213 Algeria 27607 A 18 18
214 Algeria 27608 A 18 18
215 Algeria 27609 A 18 18
216 Algeria 27610 C 18 18
217 Algeria 27611 A 18 18
218 Algeria 27612 C 18 18
219 Algeria 27613 G 18 18
220 Algeria 27614 T 18 18
221 Algeria 27615 C 18 18
222 Algeria 27616 T 18 18
223 Algeria 27617 A 18 18
224 Algeria 27618 T 18 18
225 Algeria 27619 C 18 18
226 Algeria 27620 A 18 18
227 Algeria 27621 G 18 18
228 Algeria 27622 T 18 18
229 Algeria 27623 T 18 18
230 Algeria 27624 A 18 18
231 Algeria 27625 C 18 18
232 Algeria 27626 G 18 18
233 Algeria 27627 T 18 18
234 Algeria 27628 G 18 18
235 Algeria 27629 C 18 18
236 Algeria 27630 C 18 18
237 Algeria 27631 A 18 18
238 Algeria 27632 G 18 18
239 Algeria 27633 A 18 18
240 Algeria 27634 T 18 18
241 Algeria 27635 C 18 18
242 Algeria 27636 A 18 18
243 Algeria 27637 G 18 18
244 Algeria 27638 T 18 18
245 Algeria 27639 T 18 18
246 Algeria 27640 T 18 18
247 Algeria 27641 C 18 18
248 Algeria 27642 A 18 18
249 Algeria 27643 C 18 18
250 Algeria 27644 C 18 18
251 Algeria 27645 T 18 18
252 Algeria 27646 A 18 18
253 Algeria 27647 A 18 18
254 Algeria 27648 A 18 18
255 Algeria 27649 C 18 18
256 Algeria 27650 T 18 18
257 Algeria 27651 G 18 18
258 Algeria 27652 T 18 18
259 Algeria 27653 T 18 18
260 Algeria 27654 C 18 18
261 Algeria 27655 A 18 18
262 Algeria 27656 T 18 18
263 Algeria 27657 C 18 18
264 Algeria 27658 A 18 18
265 Algeria 27659 G 18 18
266 Algeria 27660 A 18 18
267 Algeria 27661 C 18 18
268 Algeria 27662 A 18 18
269 Algeria 27663 A 18 18
270 Algeria 27664 G 18 18
271 Algeria 27665 A 18 18
272 Algeria 27666 G 18 18
273 Algeria 27667 G 18 18
274 Algeria 27668 A 18 18
275 Algeria 27669 A 18 18
276 Algeria 27670 G 18 18
277 Algeria 27671 T 18 18
278 Algeria 27672 T 18 18
279 Algeria 27673 C 18 18
280 Algeria 27674 A 18 18
281 Algeria 27675 A 18 18
282 Algeria 27676 G 18 18
283 Algeria 27677 A 18 18
284 Algeria 27678 A 18 18
285 Algeria 27679 C 18 18
286 Algeria 27680 T 18 18
287 Algeria 27681 T 18 18
288 Algeria 27682 T 18 18
289 Algeria 27683 A 18 18
290 Algeria 27684 C 18 18
291 Algeria 27685 T 18 18
292 Algeria 27686 C 18 18
293 Algeria 27687 T 18 18
294 Algeria 27688 C 18 18
295 Algeria 27689 C 18 18
296 Algeria 27690 A 18 18
297 Algeria 27691 A 18 18
298 Algeria 27692 T 18 18
299 Algeria 27693 T 18 18
300 Algeria 27694 T 18 18
301 Algeria 27695 T 18 18
302 Algeria 27696 T 18 18
303 Algeria 27697 C 18 18
304 Algeria 27698 T 18 18
305 Algeria 27699 T 18 18
306 Algeria 27700 A 18 18
307 Algeria 27701 T 18 18
308 Algeria 27702 T 18 18
309 Algeria 27703 G 18 18
310 Algeria 27704 T 18 18
311 Algeria 27705 T 18 18
312 Algeria 27706 G 18 18
313 Algeria 27707 C 18 18
314 Algeria 27708 G 18 18
315 Algeria 27709 G 18 18
316 Algeria 27710 C 18 18
317 Algeria 27711 A 18 18
318 Algeria 27712 A 18 18
319 Algeria 27713 T 18 18
320 Algeria 27714 A 18 18
321 Algeria 27715 G 18 18
322 Algeria 27716 T 18 18
323 Algeria 27717 G 18 18
324 Algeria 27718 T 18 18
325 Algeria 27719 T 18 18
326 Algeria 27720 T 18 18
327 Algeria 27721 A 18 18
328 Algeria 27722 T 18 18
329 Algeria 27723 A 18 18
330 Algeria 27724 A 18 18
331 Algeria 27725 C 18 18
332 Algeria 27726 A 18 18
333 Algeria 27727 C 18 18
334 Algeria 27728 T 18 18
335 Algeria 27729 T 18 18
336 Algeria 27730 T 18 18
337 Algeria 27731 G 18 18
338 Algeria 27732 C 18 18
339 Algeria 27733 T 18 18
340 Algeria 27734 T 18 18
341 Algeria 27735 C 18 18
342 Algeria 27736 A 18 18
343 Algeria 27737 C 18 18
344 Algeria 27738 A 18 18
345 Algeria 27739 C 18 18
346 Algeria 27740 T 18 18
347 Algeria 27741 C 18 18
348 Algeria 27742 A 18 18
349 Algeria 27743 A 18 18
350 Algeria 27744 A 18 18
351 Algeria 27745 A 18 18
352 Algeria 27746 G 18 18
353 Algeria 27747 A 18 18
354 Algeria 27748 A 18 18
355 Algeria 27749 A 18 18
356 Algeria 27750 G 18 18
357 Algeria 27751 A 18 18
358 Algeria 27752 C 18 18
359 Algeria 27753 A 18 18
360 Algeria 27754 G 18 18
361 Algeria 27755 A 18 18
362 Algeria 27756 A 18 18
363 Algeria 27757 T 18 18
364 Algeria 27758 G 18 18
365 Algeria 27759 A 18 18