National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.

Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     2                                        
-     828                                        
?                                              
A     39                                        
C     21                                        
D     39           1                            
E     33                                        
F     42                                        
G     42                                        
H     24                                        
I     63                                        
K     33                                        
L     90                                        
M     12                                        
N     24                                        
P     36                               1        
Q     27             1                          
R     18                                        
S     66                                        
T     72                                        
V     76                                        
W     18                                        
Y     51                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide

Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Sierra_Leone 25393 A 11 11
1 Sierra_Leone 25394 T 11 11
2 Sierra_Leone 25395 G 11 11
3 Sierra_Leone 25396 G 11 11
4 Sierra_Leone 25397 A G 11 10 Asp2Gly
5 Sierra_Leone 25398 T 11 11
6 Sierra_Leone 25399 T 11 11
7 Sierra_Leone 25400 T 11 11
8 Sierra_Leone 25401 G 11 11
9 Sierra_Leone 25402 T 11 11
10 Sierra_Leone 25403 T 11 11
11 Sierra_Leone 25404 T 11 11
12 Sierra_Leone 25405 A 11 11
13 Sierra_Leone 25406 T 11 11
14 Sierra_Leone 25407 G 11 11
15 Sierra_Leone 25408 A 11 11
16 Sierra_Leone 25409 G 11 11
17 Sierra_Leone 25410 A 11 11
18 Sierra_Leone 25411 A 11 11
19 Sierra_Leone 25412 T 11 11
20 Sierra_Leone 25413 C 11 11
21 Sierra_Leone 25414 T 11 11
22 Sierra_Leone 25415 T 11 11
23 Sierra_Leone 25416 C 11 11
24 Sierra_Leone 25417 A 11 11
25 Sierra_Leone 25418 C 11 11
26 Sierra_Leone 25419 A 11 11
27 Sierra_Leone 25420 A 11 11
28 Sierra_Leone 25421 T 11 11
29 Sierra_Leone 25422 T 11 11
30 Sierra_Leone 25423 G 11 11
31 Sierra_Leone 25424 G 11 11
32 Sierra_Leone 25425 A 11 11
33 Sierra_Leone 25426 A 11 11
34 Sierra_Leone 25427 C 11 11
35 Sierra_Leone 25428 T 11 11
36 Sierra_Leone 25429 G 11 11
37 Sierra_Leone 25430 T 11 11
38 Sierra_Leone 25431 A 11 11
39 Sierra_Leone 25432 A 11 11
40 Sierra_Leone 25433 C 11 11
41 Sierra_Leone 25434 T 11 11
42 Sierra_Leone 25435 T 11 11
43 Sierra_Leone 25436 T 11 11
44 Sierra_Leone 25437 G 11 11
45 Sierra_Leone 25438 A 11 11
46 Sierra_Leone 25439 A 11 11
47 Sierra_Leone 25440 G 11 11
48 Sierra_Leone 25441 C 11 11
49 Sierra_Leone 25442 A 11 11
50 Sierra_Leone 25443 A 11 11
51 Sierra_Leone 25444 G 11 11
52 Sierra_Leone 25445 G 11 11
53 Sierra_Leone 25446 T 11 11
54 Sierra_Leone 25447 G 11 11
55 Sierra_Leone 25448 A 11 11
56 Sierra_Leone 25449 A 11 11
57 Sierra_Leone 25450 A 11 11
58 Sierra_Leone 25451 T 11 11
59 Sierra_Leone 25452 C 11 11
60 Sierra_Leone 25453 A 11 11
61 Sierra_Leone 25454 A 11 11
62 Sierra_Leone 25455 G 11 11
63 Sierra_Leone 25456 G 11 11
64 Sierra_Leone 25457 A 11 11
65 Sierra_Leone 25458 T 11 11
66 Sierra_Leone 25459 G 11 11
67 Sierra_Leone 25460 C 11 11
68 Sierra_Leone 25461 T 11 11
69 Sierra_Leone 25462 A 11 11
70 Sierra_Leone 25463 C 11 11
71 Sierra_Leone 25464 T 11 11
72 Sierra_Leone 25465 C 11 11
73 Sierra_Leone 25466 C 11 11
74 Sierra_Leone 25467 T 11 11
75 Sierra_Leone 25468 T 11 11
76 Sierra_Leone 25469 C 11 11
77 Sierra_Leone 25470 A 11 11
78 Sierra_Leone 25471 G 11 11
79 Sierra_Leone 25472 A 11 11
80 Sierra_Leone 25473 T 11 11
81 Sierra_Leone 25474 T 11 11
82 Sierra_Leone 25475 T 11 11
83 Sierra_Leone 25476 T 11 11
84 Sierra_Leone 25477 G 11 11
85 Sierra_Leone 25478 T 11 11
86 Sierra_Leone 25479 T 11 10
87 Sierra_Leone 25480 C 11 10
88 Sierra_Leone 25481 G 11 10
89 Sierra_Leone 25482 C 11 10
90 Sierra_Leone 25483 G 11 10
91 Sierra_Leone 25484 C 11 11
92 Sierra_Leone 25485 T 11 11
93 Sierra_Leone 25486 A 11 11
94 Sierra_Leone 25487 C 11 11
95 Sierra_Leone 25488 T 11 11
96 Sierra_Leone 25489 G 11 11
97 Sierra_Leone 25490 C 11 11
98 Sierra_Leone 25491 A 11 11
99 Sierra_Leone 25492 A 11 11
100 Sierra_Leone 25493 C 11 11
101 Sierra_Leone 25494 G 11 11
102 Sierra_Leone 25495 A 11 11
103 Sierra_Leone 25496 T 11 11
104 Sierra_Leone 25497 A 11 11
105 Sierra_Leone 25498 C 11 11
106 Sierra_Leone 25499 C 11 11
107 Sierra_Leone 25500 G 11 11
108 Sierra_Leone 25501 A 11 11
109 Sierra_Leone 25502 T 11 11
110 Sierra_Leone 25503 A 11 11
111 Sierra_Leone 25504 C 11 11
112 Sierra_Leone 25505 A 11 11
113 Sierra_Leone 25506 A 11 11
114 Sierra_Leone 25507 G 11 11
115 Sierra_Leone 25508 C 11 11
116 Sierra_Leone 25509 C 11 11
117 Sierra_Leone 25510 T 11 11
118 Sierra_Leone 25511 C 11 11
119 Sierra_Leone 25512 A 11 11
120 Sierra_Leone 25513 C 11 11
121 Sierra_Leone 25514 T 11 11
122 Sierra_Leone 25515 C 11 11
123 Sierra_Leone 25516 C 11 11
124 Sierra_Leone 25517 C 11 11
125 Sierra_Leone 25518 T 11 11
126 Sierra_Leone 25519 T 11 11
127 Sierra_Leone 25520 T 11 11
128 Sierra_Leone 25521 C 11 11
129 Sierra_Leone 25522 G 11 11
130 Sierra_Leone 25523 G 11 11
131 Sierra_Leone 25524 A 11 11
132 Sierra_Leone 25525 T 11 11
133 Sierra_Leone 25526 G 11 11
134 Sierra_Leone 25527 G 11 11
135 Sierra_Leone 25528 C 11 11
136 Sierra_Leone 25529 T 11 11
137 Sierra_Leone 25530 T 11 11
138 Sierra_Leone 25531 A 11 11
139 Sierra_Leone 25532 T 11 11
140 Sierra_Leone 25533 T 11 11
141 Sierra_Leone 25534 G 11 11
142 Sierra_Leone 25535 T 11 11
143 Sierra_Leone 25536 T 11 11
144 Sierra_Leone 25537 G 11 11
145 Sierra_Leone 25538 G 11 11
146 Sierra_Leone 25539 C 11 11
147 Sierra_Leone 25540 G 11 11
148 Sierra_Leone 25541 T 11 11
149 Sierra_Leone 25542 T 11 11
150 Sierra_Leone 25543 G 11 11
151 Sierra_Leone 25544 C 11 11
152 Sierra_Leone 25545 A 11 11
153 Sierra_Leone 25546 C 11 11
154 Sierra_Leone 25547 T 11 11
155 Sierra_Leone 25548 T 11 11
156 Sierra_Leone 25549 C 11 11
157 Sierra_Leone 25550 T 11 11
158 Sierra_Leone 25551 T 11 11
159 Sierra_Leone 25552 G 11 11
160 Sierra_Leone 25553 C 11 11
161 Sierra_Leone 25554 T 11 11
162 Sierra_Leone 25555 G 11 11
163 Sierra_Leone 25556 T 11 11
164 Sierra_Leone 25557 T 11 11
165 Sierra_Leone 25558 T 11 11
166 Sierra_Leone 25559 T 11 11
167 Sierra_Leone 25560 T 11 11
168 Sierra_Leone 25561 C 11 11
169 Sierra_Leone 25562 A 11 11
170 Sierra_Leone 25563 G T 11 9 Gln57His
171 Sierra_Leone 25564 A 11 11
172 Sierra_Leone 25565 G 11 11
173 Sierra_Leone 25566 C 11 11
174 Sierra_Leone 25567 G 11 11
175 Sierra_Leone 25568 C 11 11
176 Sierra_Leone 25569 T 11 11
177 Sierra_Leone 25570 T 11 11
178 Sierra_Leone 25571 C 11 11
179 Sierra_Leone 25572 C 11 11
180 Sierra_Leone 25573 A 11 11
181 Sierra_Leone 25574 A 11 11
182 Sierra_Leone 25575 A 11 11
183 Sierra_Leone 25576 A 11 11
184 Sierra_Leone 25577 T 11 11
185 Sierra_Leone 25578 C 11 11
186 Sierra_Leone 25579 A 11 11
187 Sierra_Leone 25580 T 11 11
188 Sierra_Leone 25581 A 11 11
189 Sierra_Leone 25582 A 11 11
190 Sierra_Leone 25583 C 11 11
191 Sierra_Leone 25584 C 11 11
192 Sierra_Leone 25585 C 11 11
193 Sierra_Leone 25586 T 11 11
194 Sierra_Leone 25587 C 11 11
195 Sierra_Leone 25588 A 11 11
196 Sierra_Leone 25589 A 11 11
197 Sierra_Leone 25590 A 11 11
198 Sierra_Leone 25591 A 11 11
199 Sierra_Leone 25592 A 11 11
200 Sierra_Leone 25593 G 11 11
201 Sierra_Leone 25594 A 11 11
202 Sierra_Leone 25595 G 11 11
203 Sierra_Leone 25596 A 11 11
204 Sierra_Leone 25597 T 11 11
205 Sierra_Leone 25598 G 11 11
206 Sierra_Leone 25599 G 11 11
207 Sierra_Leone 25600 C 11 11
208 Sierra_Leone 25601 A 11 11
209 Sierra_Leone 25602 A 11 11
210 Sierra_Leone 25603 C 11 11
211 Sierra_Leone 25604 T 11 11
212 Sierra_Leone 25605 A 11 11
213 Sierra_Leone 25606 G 11 11
214 Sierra_Leone 25607 C 11 11
215 Sierra_Leone 25608 A 11 11
216 Sierra_Leone 25609 C 11 11
217 Sierra_Leone 25610 T 11 11
218 Sierra_Leone 25611 C 11 11
219 Sierra_Leone 25612 T 11 11
220 Sierra_Leone 25613 C 11 11
221 Sierra_Leone 25614 C 11 11
222 Sierra_Leone 25615 A 11 11
223 Sierra_Leone 25616 A 11 11
224 Sierra_Leone 25617 G 11 11
225 Sierra_Leone 25618 G 11 11
226 Sierra_Leone 25619 G 11 11
227 Sierra_Leone 25620 T 11 11
228 Sierra_Leone 25621 G 11 11
229 Sierra_Leone 25622 T 11 11
230 Sierra_Leone 25623 T 11 11
231 Sierra_Leone 25624 C 11 11
232 Sierra_Leone 25625 A 11 11
233 Sierra_Leone 25626 C 11 11
234 Sierra_Leone 25627 T 11 11
235 Sierra_Leone 25628 T 11 11
236 Sierra_Leone 25629 T 11 11
237 Sierra_Leone 25630 G 11 11
238 Sierra_Leone 25631 T 11 11
239 Sierra_Leone 25632 T 11 11
240 Sierra_Leone 25633 T 11 11
241 Sierra_Leone 25634 G 11 11
242 Sierra_Leone 25635 C 11 11
243 Sierra_Leone 25636 A 11 11
244 Sierra_Leone 25637 A 11 11
245 Sierra_Leone 25638 C 11 11
246 Sierra_Leone 25639 T 11 11
247 Sierra_Leone 25640 T 11 11
248 Sierra_Leone 25641 G 11 11
249 Sierra_Leone 25642 C 11 11
250 Sierra_Leone 25643 T 11 11
251 Sierra_Leone 25644 G 11 11
252 Sierra_Leone 25645 T 11 11
253 Sierra_Leone 25646 T 11 11
254 Sierra_Leone 25647 G 11 11
255 Sierra_Leone 25648 T 11 11
256 Sierra_Leone 25649 T 11 11
257 Sierra_Leone 25650 G 11 11
258 Sierra_Leone 25651 T 11 11
259 Sierra_Leone 25652 T 11 11
260 Sierra_Leone 25653 T 11 11
261 Sierra_Leone 25654 G 11 11
262 Sierra_Leone 25655 T 11 11
263 Sierra_Leone 25656 A 11 11
264 Sierra_Leone 25657 A 11 11
265 Sierra_Leone 25658 C 11 11
266 Sierra_Leone 25659 A 11 11
267 Sierra_Leone 25660 G 11 11
268 Sierra_Leone 25661 T 11 11
269 Sierra_Leone 25662 T 11 11
270 Sierra_Leone 25663 T 11 11
271 Sierra_Leone 25664 A 11 11
272 Sierra_Leone 25665 C 11 11
273 Sierra_Leone 25666 T 11 11
274 Sierra_Leone 25667 C 11 11
275 Sierra_Leone 25668 A 11 11
276 Sierra_Leone 25669 C 11 11
277 Sierra_Leone 25670 A 11 11
278 Sierra_Leone 25671 C 11 11
279 Sierra_Leone 25672 C 11 11
280 Sierra_Leone 25673 T 11 11
281 Sierra_Leone 25674 T 11 11
282 Sierra_Leone 25675 T 11 11
283 Sierra_Leone 25676 T 11 11
284 Sierra_Leone 25677 G 11 11
285 Sierra_Leone 25678 C 11 11
286 Sierra_Leone 25679 T 11 11
287 Sierra_Leone 25680 C 11 11
288 Sierra_Leone 25681 G 11 11
289 Sierra_Leone 25682 T 11 11
290 Sierra_Leone 25683 T 11 11
291 Sierra_Leone 25684 G 11 11
292 Sierra_Leone 25685 C 11 11
293 Sierra_Leone 25686 T 11 11
294 Sierra_Leone 25687 G 11 11
295 Sierra_Leone 25688 C 11 11
296 Sierra_Leone 25689 T 11 11
297 Sierra_Leone 25690 G 11 11
298 Sierra_Leone 25691 G 11 11
299 Sierra_Leone 25692 C 11 11
300 Sierra_Leone 25693 C 11 11
301 Sierra_Leone 25694 T 11 11
302 Sierra_Leone 25695 T 11 11
303 Sierra_Leone 25696 G 11 11
304 Sierra_Leone 25697 A 11 11
305 Sierra_Leone 25698 A 11 11
306 Sierra_Leone 25699 G 11 11
307 Sierra_Leone 25700 C 11 11
308 Sierra_Leone 25701 C 11 11
309 Sierra_Leone 25702 C T 11 10 Pro104Ser
310 Sierra_Leone 25703 C 11 11
311 Sierra_Leone 25704 T 11 11
312 Sierra_Leone 25705 T 11 11
313 Sierra_Leone 25706 T 11 11
314 Sierra_Leone 25707 T 11 11
315 Sierra_Leone 25708 C 11 11
316 Sierra_Leone 25709 T 11 11
317 Sierra_Leone 25710 C 11 11
318 Sierra_Leone 25711 T 11 10
319 Sierra_Leone 25712 A 11 10
320 Sierra_Leone 25713 T 11 10
321 Sierra_Leone 25714 C 11 10
322 Sierra_Leone 25715 T 11 10
323 Sierra_Leone 25716 T 11 10
324 Sierra_Leone 25717 T 11 10
325 Sierra_Leone 25718 A 11 10
326 Sierra_Leone 25719 T 11 10
327 Sierra_Leone 25720 G 11 10
328 Sierra_Leone 25721 C 11 10
329 Sierra_Leone 25722 T 11 10
330 Sierra_Leone 25723 T 11 10
331 Sierra_Leone 25724 T 11 10
332 Sierra_Leone 25725 A 11 10
333 Sierra_Leone 25726 G 11 10
334 Sierra_Leone 25727 T 11 10
335 Sierra_Leone 25728 C 11 10
336 Sierra_Leone 25729 T 11 10
337 Sierra_Leone 25730 A 11 10
338 Sierra_Leone 25731 C 11 10
339 Sierra_Leone 25732 T 11 10
340 Sierra_Leone 25733 T 11 10
341 Sierra_Leone 25734 C 11 10
342 Sierra_Leone 25735 T 11 10
343 Sierra_Leone 25736 T 11 10
344 Sierra_Leone 25737 G 11 10
345 Sierra_Leone 25738 C 11 10
346 Sierra_Leone 25739 A 11 10
347 Sierra_Leone 25740 G 11 10
348 Sierra_Leone 25741 A 11 10
349 Sierra_Leone 25742 G 11 11
350 Sierra_Leone 25743 T 11 11
351 Sierra_Leone 25744 A 11 11
352 Sierra_Leone 25745 T 11 11
353 Sierra_Leone 25746 A 11 11
354 Sierra_Leone 25747 A 11 11
355 Sierra_Leone 25748 A 11 11
356 Sierra_Leone 25749 C 11 11
357 Sierra_Leone 25750 T 11 11
358 Sierra_Leone 25751 T 11 11
359 Sierra_Leone 25752 T 11 11
360 Sierra_Leone 25753 G 11 11
361 Sierra_Leone 25754 T 11 11
362 Sierra_Leone 25755 A 11 11
363 Sierra_Leone 25756 A 11 11
364 Sierra_Leone 25757 G 11 11
365 Sierra_Leone 25758 A 11 11
366 Sierra_Leone 25759 A 11 11
367 Sierra_Leone 25760 T 11 11
368 Sierra_Leone 25761 A 11 11
369 Sierra_Leone 25762 A 11 11
370 Sierra_Leone 25763 T 11 11
371 Sierra_Leone 25764 A 11 11
372 Sierra_Leone 25765 A 11 11
373 Sierra_Leone 25766 T 11 11
374 Sierra_Leone 25767 G 11 11
375 Sierra_Leone 25768 A 11 11
376 Sierra_Leone 25769 G 11 11
377 Sierra_Leone 25770 G 11 11
378 Sierra_Leone 25771 C 11 11
379 Sierra_Leone 25772 T 11 11
380 Sierra_Leone 25773 T 11 11
381 Sierra_Leone 25774 T 11 11
382 Sierra_Leone 25775 G 11 11
383 Sierra_Leone 25776 G 11 11
384 Sierra_Leone 25777 C 11 11
385 Sierra_Leone 25778 T 11 11
386 Sierra_Leone 25779 T 11 11
387 Sierra_Leone 25780 T 11 11
388 Sierra_Leone 25781 G 11 11
389 Sierra_Leone 25782 C 11 11
390 Sierra_Leone 25783 T 11 11
391 Sierra_Leone 25784 G 11 11
392 Sierra_Leone 25785 G 11 11
393 Sierra_Leone 25786 A 11 11
394 Sierra_Leone 25787 A 11 11
395 Sierra_Leone 25788 A 11 11
396 Sierra_Leone 25789 T 11 11
397 Sierra_Leone 25790 G 11 11
398 Sierra_Leone 25791 C 11 11
399 Sierra_Leone 25792 C 11 11
400 Sierra_Leone 25793 G 11 11
401 Sierra_Leone 25794 T 11 11
402 Sierra_Leone 25795 T 11 11
403 Sierra_Leone 25796 C 11 11
404 Sierra_Leone 25797 C 11 11
405 Sierra_Leone 25798 A 11 11
406 Sierra_Leone 25799 A 11 11
407 Sierra_Leone 25800 A 11 11
408 Sierra_Leone 25801 A 11 11
409 Sierra_Leone 25802 A 11 11
410 Sierra_Leone 25803 C 11 11
411 Sierra_Leone 25804 C 11 11
412 Sierra_Leone 25805 C 11 11
413 Sierra_Leone 25806 A 11 11
414 Sierra_Leone 25807 T 11 11
415 Sierra_Leone 25808 T 11 11
416 Sierra_Leone 25809 A 11 11
417 Sierra_Leone 25810 C 11 11
418 Sierra_Leone 25811 T 11 11
419 Sierra_Leone 25812 T 11 11
420 Sierra_Leone 25813 T 11 11
421 Sierra_Leone 25814 A 11 11
422 Sierra_Leone 25815 T 11 11
423 Sierra_Leone 25816 G 11 11
424 Sierra_Leone 25817 A 11 11
425 Sierra_Leone 25818 T 11 11
426 Sierra_Leone 25819 G 11 11
427 Sierra_Leone 25820 C 11 11
428 Sierra_Leone 25821 C 11 11
429 Sierra_Leone 25822 A 11 11
430 Sierra_Leone 25823 A 11 11
431 Sierra_Leone 25824 C 11 11
432 Sierra_Leone 25825 T 11 11
433 Sierra_Leone 25826 A 11 11
434 Sierra_Leone 25827 T 11 11
435 Sierra_Leone 25828 T 11 11
436 Sierra_Leone 25829 T 11 11
437 Sierra_Leone 25830 T 11 11
438 Sierra_Leone 25831 C 11 11
439 Sierra_Leone 25832 T 11 11
440 Sierra_Leone 25833 T 11 11
441 Sierra_Leone 25834 T 11 11
442 Sierra_Leone 25835 G 11 11
443 Sierra_Leone 25836 C 11 11
444 Sierra_Leone 25837 T 11 11
445 Sierra_Leone 25838 G 11 11
446 Sierra_Leone 25839 G 11 11
447 Sierra_Leone 25840 C 11 11
448 Sierra_Leone 25841 A 11 11
449 Sierra_Leone 25842 T 11 11
450 Sierra_Leone 25843 A 11 11
451 Sierra_Leone 25844 C 11 11
452 Sierra_Leone 25845 T 11 11
453 Sierra_Leone 25846 A 11 11
454 Sierra_Leone 25847 A 11 11
455 Sierra_Leone 25848 T 11 11
456 Sierra_Leone 25849 T 11 11
457 Sierra_Leone 25850 G 11 11
458 Sierra_Leone 25851 T 11 11
459 Sierra_Leone 25852 T 11 11
460 Sierra_Leone 25853 A 11 11
461 Sierra_Leone 25854 C 11 11
462 Sierra_Leone 25855 G 11 11
463 Sierra_Leone 25856 A 11 11
464 Sierra_Leone 25857 C 11 11
465 Sierra_Leone 25858 T 11 11
466 Sierra_Leone 25859 A 11 11
467 Sierra_Leone 25860 T 11 11
468 Sierra_Leone 25861 T 11 11
469 Sierra_Leone 25862 G 11 11
470 Sierra_Leone 25863 T 11 11
471 Sierra_Leone 25864 A 11 11
472 Sierra_Leone 25865 T 11 11
473 Sierra_Leone 25866 A 11 11
474 Sierra_Leone 25867 C 11 11
475 Sierra_Leone 25868 C 11 11
476 Sierra_Leone 25869 T 11 11
477 Sierra_Leone 25870 T 11 11
478 Sierra_Leone 25871 A 11 11
479 Sierra_Leone 25872 C 11 11
480 Sierra_Leone 25873 A 11 11
481 Sierra_Leone 25874 A 11 11
482 Sierra_Leone 25875 T 11 11
483 Sierra_Leone 25876 A 11 11
484 Sierra_Leone 25877 G 11 11
485 Sierra_Leone 25878 T 11 11
486 Sierra_Leone 25879 G 11 11
487 Sierra_Leone 25880 T 11 11
488 Sierra_Leone 25881 A 11 11
489 Sierra_Leone 25882 A 11 11
490 Sierra_Leone 25883 C 11 11
491 Sierra_Leone 25884 T 11 11
492 Sierra_Leone 25885 T 11 11
493 Sierra_Leone 25886 C 11 11
494 Sierra_Leone 25887 T 11 11
495 Sierra_Leone 25888 T 11 11
496 Sierra_Leone 25889 C 11 11
497 Sierra_Leone 25890 A 11 11
498 Sierra_Leone 25891 A 11 11
499 Sierra_Leone 25892 T 11 11
500 Sierra_Leone 25893 T 11 11
501 Sierra_Leone 25894 G 11 11
502 Sierra_Leone 25895 T 11 11
503 Sierra_Leone 25896 C 11 11
504 Sierra_Leone 25897 A 11 11
505 Sierra_Leone 25898 T 11 11
506 Sierra_Leone 25899 T 11 11
507 Sierra_Leone 25900 A 11 11
508 Sierra_Leone 25901 C 11 11
509 Sierra_Leone 25902 T 11 11
510 Sierra_Leone 25903 T 11 11
511 Sierra_Leone 25904 C 11 11
512 Sierra_Leone 25905 A 11 11
513 Sierra_Leone 25906 G 11 11
514 Sierra_Leone 25907 G 11 11
515 Sierra_Leone 25908 T 11 11
516 Sierra_Leone 25909 G 11 11
517 Sierra_Leone 25910 A 11 11
518 Sierra_Leone 25911 T 11 11
519 Sierra_Leone 25912 G 11 11
520 Sierra_Leone 25913 G 11 11
521 Sierra_Leone 25914 C 11 11
522 Sierra_Leone 25915 A 11 11
523 Sierra_Leone 25916 C 11 11
524 Sierra_Leone 25917 A 11 11
525 Sierra_Leone 25918 A 11 11
526 Sierra_Leone 25919 C 11 11
527 Sierra_Leone 25920 A 11 11
528 Sierra_Leone 25921 A 11 11
529 Sierra_Leone 25922 G 11 11
530 Sierra_Leone 25923 T 11 11
531 Sierra_Leone 25924 C 11 11
532 Sierra_Leone 25925 C 11 11
533 Sierra_Leone 25926 T 11 11
534 Sierra_Leone 25927 A 11 11
535 Sierra_Leone 25928 T 11 11
536 Sierra_Leone 25929 T 11 11
537 Sierra_Leone 25930 T 11 11
538 Sierra_Leone 25931 C 11 11
539 Sierra_Leone 25932 T 11 11
540 Sierra_Leone 25933 G 11 11
541 Sierra_Leone 25934 A 11 11
542 Sierra_Leone 25935 A 11 11
543 Sierra_Leone 25936 C 11 11
544 Sierra_Leone 25937 A 11 11
545 Sierra_Leone 25938 T 11 11
546 Sierra_Leone 25939 G 11 11
547 Sierra_Leone 25940 A 11 11
548 Sierra_Leone 25941 C 11 11
549 Sierra_Leone 25942 T 11 11
550 Sierra_Leone 25943 A 11 11
551 Sierra_Leone 25944 C 11 11
552 Sierra_Leone 25945 C 11 11
553 Sierra_Leone 25946 A 11 11
554 Sierra_Leone 25947 G 11 11
555 Sierra_Leone 25948 A 11 11
556 Sierra_Leone 25949 T 11 11
557 Sierra_Leone 25950 T 11 11
558 Sierra_Leone 25951 G 11 11
559 Sierra_Leone 25952 G 11 11
560 Sierra_Leone 25953 T 11 11
561 Sierra_Leone 25954 G 11 11
562 Sierra_Leone 25955 G 11 11
563 Sierra_Leone 25956 T 11 11
564 Sierra_Leone 25957 T 11 11
565 Sierra_Leone 25958 A 11 11
566 Sierra_Leone 25959 T 11 11
567 Sierra_Leone 25960 A 11 11
568 Sierra_Leone 25961 C 11 11
569 Sierra_Leone 25962 T 11 11
570 Sierra_Leone 25963 G 11 11
571 Sierra_Leone 25964 A 11 11
572 Sierra_Leone 25965 A 11 11
573 Sierra_Leone 25966 A 11 11
574 Sierra_Leone 25967 A 11 11
575 Sierra_Leone 25968 A 11 11
576 Sierra_Leone 25969 T 11 11
577 Sierra_Leone 25970 G 11 11
578 Sierra_Leone 25971 G 11 11
579 Sierra_Leone 25972 G 11 11
580 Sierra_Leone 25973 A 11 11
581 Sierra_Leone 25974 A 11 11
582 Sierra_Leone 25975 T 11 11
583 Sierra_Leone 25976 C 11 11
584 Sierra_Leone 25977 T 11 11
585 Sierra_Leone 25978 G 11 11
586 Sierra_Leone 25979 G 11 11
587 Sierra_Leone 25980 A 11 11
588 Sierra_Leone 25981 G 11 11
589 Sierra_Leone 25982 T 11 11
590 Sierra_Leone 25983 A 11 11
591 Sierra_Leone 25984 A 11 11
592 Sierra_Leone 25985 A 11 11
593 Sierra_Leone 25986 A 11 11
594 Sierra_Leone 25987 G 11 11
595 Sierra_Leone 25988 A 11 11
596 Sierra_Leone 25989 C 11 11
597 Sierra_Leone 25990 T 11 11
598 Sierra_Leone 25991 G 11 11
599 Sierra_Leone 25992 T 11 11
600 Sierra_Leone 25993 G 11 11
601 Sierra_Leone 25994 T 11 11
602 Sierra_Leone 25995 T 11 11
603 Sierra_Leone 25996 G 11 11
604 Sierra_Leone 25997 T 11 11
605 Sierra_Leone 25998 A 11 11
606 Sierra_Leone 25999 T 11 11
607 Sierra_Leone 26000 T 11 11
608 Sierra_Leone 26001 A 11 11
609 Sierra_Leone 26002 C 11 11
610 Sierra_Leone 26003 A 11 11
611 Sierra_Leone 26004 C 11 11
612 Sierra_Leone 26005 A 11 11
613 Sierra_Leone 26006 G 11 11
614 Sierra_Leone 26007 T 11 11
615 Sierra_Leone 26008 T 11 11
616 Sierra_Leone 26009 A 11 11
617 Sierra_Leone 26010 C 11 11
618 Sierra_Leone 26011 T 11 11
619 Sierra_Leone 26012 T 11 11
620 Sierra_Leone 26013 C 11 11
621 Sierra_Leone 26014 A 11 11
622 Sierra_Leone 26015 C 11 11
623 Sierra_Leone 26016 T 11 11
624 Sierra_Leone 26017 T 11 11
625 Sierra_Leone 26018 C 11 11
626 Sierra_Leone 26019 A 11 11
627 Sierra_Leone 26020 G 11 11
628 Sierra_Leone 26021 A 11 11
629 Sierra_Leone 26022 C 11 11
630 Sierra_Leone 26023 T 11 11
631 Sierra_Leone 26024 A 11 11
632 Sierra_Leone 26025 T 11 11
633 Sierra_Leone 26026 T 11 11
634 Sierra_Leone 26027 A 11 11
635 Sierra_Leone 26028 C 11 11
636 Sierra_Leone 26029 C 11 11
637 Sierra_Leone 26030 A 11 11
638 Sierra_Leone 26031 G 11 11
639 Sierra_Leone 26032 C 11 11
640 Sierra_Leone 26033 T 11 11
641 Sierra_Leone 26034 G 11 11
642 Sierra_Leone 26035 T 11 11
643 Sierra_Leone 26036 A 11 11
644 Sierra_Leone 26037 C 11 11
645 Sierra_Leone 26038 T 11 11
646 Sierra_Leone 26039 C 11 11
647 Sierra_Leone 26040 A 11 11
648 Sierra_Leone 26041 A 11 11
649 Sierra_Leone 26042 C 11 11
650 Sierra_Leone 26043 T 11 11
651 Sierra_Leone 26044 C 11 11
652 Sierra_Leone 26045 A 11 11
653 Sierra_Leone 26046 A 11 11
654 Sierra_Leone 26047 T 11 11
655 Sierra_Leone 26048 T 11 11
656 Sierra_Leone 26049 G 11 11
657 Sierra_Leone 26050 A 11 11
658 Sierra_Leone 26051 G 11 11
659 Sierra_Leone 26052 T 11 11
660 Sierra_Leone 26053 A 11 11
661 Sierra_Leone 26054 C 11 11
662 Sierra_Leone 26055 A 11 11
663 Sierra_Leone 26056 G 11 11
664 Sierra_Leone 26057 A 11 11
665 Sierra_Leone 26058 C 11 11
666 Sierra_Leone 26059 A 11 11
667 Sierra_Leone 26060 C 11 11
668 Sierra_Leone 26061 T 11 11
669 Sierra_Leone 26062 G 11 11
670 Sierra_Leone 26063 G 11 11
671 Sierra_Leone 26064 T 11 11
672 Sierra_Leone 26065 G 11 11
673 Sierra_Leone 26066 T 11 11
674 Sierra_Leone 26067 T 11 11
675 Sierra_Leone 26068 G 11 11
676 Sierra_Leone 26069 A 11 11
677 Sierra_Leone 26070 A 11 11
678 Sierra_Leone 26071 C 11 11
679 Sierra_Leone 26072 A 11 11
680 Sierra_Leone 26073 T 11 11
681 Sierra_Leone 26074 G 11 11
682 Sierra_Leone 26075 T 11 11
683 Sierra_Leone 26076 T 11 11
684 Sierra_Leone 26077 A 11 11
685 Sierra_Leone 26078 C 11 11
686 Sierra_Leone 26079 C 11 11
687 Sierra_Leone 26080 T 11 11
688 Sierra_Leone 26081 T 11 11
689 Sierra_Leone 26082 C 11 11
690 Sierra_Leone 26083 T 11 11
691 Sierra_Leone 26084 T 11 11
692 Sierra_Leone 26085 C 11 11
693 Sierra_Leone 26086 A 11 11
694 Sierra_Leone 26087 T 11 11
695 Sierra_Leone 26088 C 11 11
696 Sierra_Leone 26089 T 11 11
697 Sierra_Leone 26090 A 11 11
698 Sierra_Leone 26091 C 11 11
699 Sierra_Leone 26092 A 11 11
700 Sierra_Leone 26093 A 11 11
701 Sierra_Leone 26094 T 11 11
702 Sierra_Leone 26095 A 11 11
703 Sierra_Leone 26096 A 11 11
704 Sierra_Leone 26097 A 11 11
705 Sierra_Leone 26098 A 11 11
706 Sierra_Leone 26099 T 11 11
707 Sierra_Leone 26100 T 11 11
708 Sierra_Leone 26101 G 11 11
709 Sierra_Leone 26102 T 11 11
710 Sierra_Leone 26103 T 11 11
711 Sierra_Leone 26104 G 11 11
712 Sierra_Leone 26105 A 11 11
713 Sierra_Leone 26106 T 11 11
714 Sierra_Leone 26107 G 11 11
715 Sierra_Leone 26108 A 11 11
716 Sierra_Leone 26109 G 11 11
717 Sierra_Leone 26110 C 11 11
718 Sierra_Leone 26111 C 11 11
719 Sierra_Leone 26112 T 11 11
720 Sierra_Leone 26113 G 11 11
721 Sierra_Leone 26114 A 11 11
722 Sierra_Leone 26115 A 11 11
723 Sierra_Leone 26116 G 11 11
724 Sierra_Leone 26117 A 11 11
725 Sierra_Leone 26118 A 11 11
726 Sierra_Leone 26119 C 11 11
727 Sierra_Leone 26120 A 11 11
728 Sierra_Leone 26121 T 11 11
729 Sierra_Leone 26122 G 11 11
730 Sierra_Leone 26123 T 11 11
731 Sierra_Leone 26124 C 11 11
732 Sierra_Leone 26125 C 11 11
733 Sierra_Leone 26126 A 11 11
734 Sierra_Leone 26127 A 11 11
735 Sierra_Leone 26128 A 11 11
736 Sierra_Leone 26129 T 11 11
737 Sierra_Leone 26130 T 11 11
738 Sierra_Leone 26131 C 11 11
739 Sierra_Leone 26132 A 11 11
740 Sierra_Leone 26133 C 11 11
741 Sierra_Leone 26134 A 11 11
742 Sierra_Leone 26135 C 11 11
743 Sierra_Leone 26136 A 11 11
744 Sierra_Leone 26137 A 11 11
745 Sierra_Leone 26138 T 11 11
746 Sierra_Leone 26139 C 11 11
747 Sierra_Leone 26140 G 11 11
748 Sierra_Leone 26141 A 11 11
749 Sierra_Leone 26142 C 11 11
750 Sierra_Leone 26143 G 11 11
751 Sierra_Leone 26144 G 11 11
752 Sierra_Leone 26145 T 11 11
753 Sierra_Leone 26146 T 11 11
754 Sierra_Leone 26147 C 11 11
755 Sierra_Leone 26148 A 11 11
756 Sierra_Leone 26149 T 11 11
757 Sierra_Leone 26150 C 11 11
758 Sierra_Leone 26151 C 11 11
759 Sierra_Leone 26152 G 11 11
760 Sierra_Leone 26153 G 11 11
761 Sierra_Leone 26154 A 11 11
762 Sierra_Leone 26155 G 11 11
763 Sierra_Leone 26156 T 11 11
764 Sierra_Leone 26157 T 11 11
765 Sierra_Leone 26158 G 11 11
766 Sierra_Leone 26159 T 11 11
767 Sierra_Leone 26160 T 11 11
768 Sierra_Leone 26161 A 11 11
769 Sierra_Leone 26162 A 11 11
770 Sierra_Leone 26163 T 11 11
771 Sierra_Leone 26164 C 11 11
772 Sierra_Leone 26165 C 11 11
773 Sierra_Leone 26166 A 11 11
774 Sierra_Leone 26167 G 11 11
775 Sierra_Leone 26168 T 11 11
776 Sierra_Leone 26169 A 11 11
777 Sierra_Leone 26170 A 11 11
778 Sierra_Leone 26171 T 11 11
779 Sierra_Leone 26172 G 11 11
780 Sierra_Leone 26173 G 11 11
781 Sierra_Leone 26174 A 11 11
782 Sierra_Leone 26175 A 11 11
783 Sierra_Leone 26176 C 11 11
784 Sierra_Leone 26177 C 11 11
785 Sierra_Leone 26178 A 11 11
786 Sierra_Leone 26179 A 11 11
787 Sierra_Leone 26180 T 11 11
788 Sierra_Leone 26181 T 11 11
789 Sierra_Leone 26182 T 11 11
790 Sierra_Leone 26183 A 11 11
791 Sierra_Leone 26184 T 11 11
792 Sierra_Leone 26185 G 11 11
793 Sierra_Leone 26186 A 11 11
794 Sierra_Leone 26187 T 11 11
795 Sierra_Leone 26188 G 11 11
796 Sierra_Leone 26189 A 11 11
797 Sierra_Leone 26190 A 11 11
798 Sierra_Leone 26191 C 11 11
799 Sierra_Leone 26192 C 11 11
800 Sierra_Leone 26193 G 11 11
801 Sierra_Leone 26194 A 11 11
802 Sierra_Leone 26195 C 11 11
803 Sierra_Leone 26196 G 11 11
804 Sierra_Leone 26197 A 11 11
805 Sierra_Leone 26198 C 11 11
806 Sierra_Leone 26199 G 11 11
807 Sierra_Leone 26200 A 11 11
808 Sierra_Leone 26201 C 11 11
809 Sierra_Leone 26202 T 11 11
810 Sierra_Leone 26203 A 11 11
811 Sierra_Leone 26204 C 11 11
812 Sierra_Leone 26205 T 11 11
813 Sierra_Leone 26206 A 11 11
814 Sierra_Leone 26207 G 11 11
815 Sierra_Leone 26208 C 11 11
816 Sierra_Leone 26209 G 11 11
817 Sierra_Leone 26210 T 11 11
818 Sierra_Leone 26211 G 11 11
819 Sierra_Leone 26212 C 11 11
820 Sierra_Leone 26213 C 11 11
821 Sierra_Leone 26214 T 11 11
822 Sierra_Leone 26215 T 11 11
823 Sierra_Leone 26216 T 11 11
824 Sierra_Leone 26217 G 11 11
825 Sierra_Leone 26218 T 11 11
826 Sierra_Leone 26219 A 11 11
827 Sierra_Leone 26220 A 11 11