National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.

Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     2                                        
-     828                                        
?                                              
A     39                                   3    
C     21                                        
D     39       1                               2
E     33       1                                
F     42                   1                    
G     42   3                           1   2    
H     24                                       1
I     63               1                 1 1    
K     33                       1                
L     90         3         3     1              
M     12                                        
N     24                                       1
P     36                               1 1      
Q     27             1               1          
R     18                                        
S 1   66         1                     4        
T     72               2     1           1      
V     76 1       1         1                    
W     18   1               1                    
Y     51                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide

Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Nigeria 25393 A 236 236
1 Nigeria 25394 T 236 236
2 Nigeria 25395 G 237 237
3 Nigeria 25396 G 237 237
4 Nigeria 25397 A 237 237
5 Nigeria 25398 T 237 237
6 Nigeria 25399 T 237 237
7 Nigeria 25400 T 238 238
8 Nigeria 25401 G 238 238
9 Nigeria 25402 T 238 238
10 Nigeria 25403 T 238 238
11 Nigeria 25404 T 238 238
12 Nigeria 25405 A 238 238
13 Nigeria 25406 T 238 238
14 Nigeria 25407 G 238 238
15 Nigeria 25408 A 238 238
16 Nigeria 25409 G 238 238
17 Nigeria 25410 A 238 238
18 Nigeria 25411 A 238 238
19 Nigeria 25412 T 239 239
20 Nigeria 25413 C 239 239
21 Nigeria 25414 T 239 239
22 Nigeria 25415 T 239 239
23 Nigeria 25416 C 239 239
24 Nigeria 25417 A 239 238
25 Nigeria 25418 C 239 239
26 Nigeria 25419 A 239 239
27 Nigeria 25420 A 239 239
28 Nigeria 25421 T 239 239
29 Nigeria 25422 T 239 239
30 Nigeria 25423 G 239 239
31 Nigeria 25424 G 239 239
32 Nigeria 25425 A 239 239
33 Nigeria 25426 A 239 239
34 Nigeria 25427 C 239 239
35 Nigeria 25428 T 239 239
36 Nigeria 25429 G 239 239
37 Nigeria 25430 T 239 239
38 Nigeria 25431 A 239 239
39 Nigeria 25432 A 239 239
40 Nigeria 25433 C 239 239
41 Nigeria 25434 T 239 239
42 Nigeria 25435 T 239 239
43 Nigeria 25436 T 239 238
44 Nigeria 25437 G 239 238
45 Nigeria 25438 A 239 238
46 Nigeria 25439 A 239 238
47 Nigeria 25440 G C 239 237 Lys16Asn
48 Nigeria 25441 C 239 238
49 Nigeria 25442 A 239 238
50 Nigeria 25443 A 239 238
51 Nigeria 25444 G 239 238
52 Nigeria 25445 G 239 238
53 Nigeria 25446 T 239 238
54 Nigeria 25447 G 239 238
55 Nigeria 25448 A 239 238
56 Nigeria 25449 A 239 238
57 Nigeria 25450 A 239 238
58 Nigeria 25451 T 239 238
59 Nigeria 25452 C 239 238
60 Nigeria 25453 A 239 238
61 Nigeria 25454 A 239 238
62 Nigeria 25455 G 239 238
63 Nigeria 25456 G T 239 238 Asp22Tyr
64 Nigeria 25457 A 239 239
65 Nigeria 25458 T 239 239
66 Nigeria 25459 G 239 239
67 Nigeria 25460 C T 239 238 Ala23Val
68 Nigeria 25461 T 239 239
69 Nigeria 25462 A 239 239
70 Nigeria 25463 C 239 239
71 Nigeria 25464 T 239 239
72 Nigeria 25465 C 239 239
73 Nigeria 25466 C 239 239
74 Nigeria 25467 T 239 239
75 Nigeria 25468 T 239 239
76 Nigeria 25469 C 239 239
77 Nigeria 25470 A 239 239
78 Nigeria 25471 G T 239 232 Asp27Tyr
79 Nigeria 25472 A 239 239
80 Nigeria 25473 T 239 239
81 Nigeria 25474 T 239 239
82 Nigeria 25475 T 239 239
83 Nigeria 25476 T 239 239
84 Nigeria 25477 G 239 239
85 Nigeria 25478 T 239 239
86 Nigeria 25479 T 239 239
87 Nigeria 25480 C 239 239
88 Nigeria 25481 G 239 239
89 Nigeria 25482 C 240 240
90 Nigeria 25483 G 240 240
91 Nigeria 25484 C 240 240
92 Nigeria 25485 T 240 240
93 Nigeria 25486 A 240 240
94 Nigeria 25487 C 240 240
95 Nigeria 25488 T 240 240
96 Nigeria 25489 G 240 240
97 Nigeria 25490 C 240 240
98 Nigeria 25491 A 240 239
99 Nigeria 25492 A 240 239
100 Nigeria 25493 C 240 239
101 Nigeria 25494 G T 240 238 Thr34Thr
102 Nigeria 25495 A 240 239
103 Nigeria 25496 T C 240 238 Ile35Thr
104 Nigeria 25497 A 240 239
105 Nigeria 25498 C 240 239
106 Nigeria 25499 C 240 239
107 Nigeria 25500 G 240 239
108 Nigeria 25501 A 240 239
109 Nigeria 25502 T 240 238
110 Nigeria 25503 A 240 238
111 Nigeria 25504 C 240 238
112 Nigeria 25505 A 240 237
113 Nigeria 25506 A 240 237
114 Nigeria 25507 G 240 237
115 Nigeria 25508 C 240 238
116 Nigeria 25509 C 240 238
117 Nigeria 25510 T 240 237
118 Nigeria 25511 C 240 237
119 Nigeria 25512 A 240 237
120 Nigeria 25513 C 240 238
121 Nigeria 25514 T 240 238
122 Nigeria 25515 C 240 238
123 Nigeria 25516 C 240 238
124 Nigeria 25517 C 240 238
125 Nigeria 25518 T 240 238
126 Nigeria 25519 T 240 238
127 Nigeria 25520 T 240 238
128 Nigeria 25521 C 240 238
129 Nigeria 25522 G 240 238
130 Nigeria 25523 G 240 238
131 Nigeria 25524 A 240 238
132 Nigeria 25525 T 240 238
133 Nigeria 25526 G 240 239
134 Nigeria 25527 G 240 239
135 Nigeria 25528 C 240 239
136 Nigeria 25529 T 240 239
137 Nigeria 25530 T 240 239
138 Nigeria 25531 A 240 239
139 Nigeria 25532 T 240 239
140 Nigeria 25533 T 240 239
141 Nigeria 25534 G 240 239
142 Nigeria 25535 T 240 239
143 Nigeria 25536 T 240 238
144 Nigeria 25537 G 240 238
145 Nigeria 25538 G 240 238
146 Nigeria 25539 C 240 238
147 Nigeria 25540 G 240 238
148 Nigeria 25541 T C 240 236 Val50Ala
149 Nigeria 25542 T 240 237
150 Nigeria 25543 G 240 238
151 Nigeria 25544 C 240 238
152 Nigeria 25545 A 240 238
153 Nigeria 25546 C T 240 234 Leu52Phe
154 Nigeria 25547 T 240 237
155 Nigeria 25548 T 240 237
156 Nigeria 25549 C 240 237
157 Nigeria 25550 T 240 238
158 Nigeria 25551 T 240 238
159 Nigeria 25552 G 240 238
160 Nigeria 25553 C 240 238
161 Nigeria 25554 T 240 238
162 Nigeria 25555 G 240 238
163 Nigeria 25556 T 240 238
164 Nigeria 25557 T 240 238
165 Nigeria 25558 T 240 239
166 Nigeria 25559 T 240 239
167 Nigeria 25560 T 240 239
168 Nigeria 25561 C 240 239
169 Nigeria 25562 A 240 239
170 Nigeria 25563 G T 240 178 Gln57His
171 Nigeria 25564 A 240 237
172 Nigeria 25565 G 240 237
173 Nigeria 25566 C 240 237
174 Nigeria 25567 G 240 238
175 Nigeria 25568 C 240 238
176 Nigeria 25569 T 240 238
177 Nigeria 25570 T 241 239
178 Nigeria 25571 C 241 239
179 Nigeria 25572 C T 241 236 Ser60Ser
180 Nigeria 25573 A 241 239
181 Nigeria 25574 A 241 239
182 Nigeria 25575 A 241 239
183 Nigeria 25576 A 241 239
184 Nigeria 25577 T 241 238
185 Nigeria 25578 C 241 238
186 Nigeria 25579 A 241 238
187 Nigeria 25580 T 241 238
188 Nigeria 25581 A 241 238
189 Nigeria 25582 A 241 238
190 Nigeria 25583 C 241 238
191 Nigeria 25584 C 241 238
192 Nigeria 25585 C 241 238
193 Nigeria 25586 T 241 238
194 Nigeria 25587 C 241 238
195 Nigeria 25588 A 241 238
196 Nigeria 25589 A 241 238
197 Nigeria 25590 A 241 239
198 Nigeria 25591 A 241 239
199 Nigeria 25592 A 241 239
200 Nigeria 25593 G 241 239
201 Nigeria 25594 A 241 238
202 Nigeria 25595 G 241 238
203 Nigeria 25596 A 241 237
204 Nigeria 25597 T 241 237
205 Nigeria 25598 G 241 237
206 Nigeria 25599 G 241 237
207 Nigeria 25600 C 241 237
208 Nigeria 25601 A 241 237
209 Nigeria 25602 A 241 236
210 Nigeria 25603 C T 241 235 Leu71Leu
211 Nigeria 25604 T 241 236
212 Nigeria 25605 A 241 236
213 Nigeria 25606 G 241 236
214 Nigeria 25607 C 241 236
215 Nigeria 25608 A 242 237
216 Nigeria 25609 C 242 238
217 Nigeria 25610 T 242 240
218 Nigeria 25611 C 243 243
219 Nigeria 25612 T 243 243
220 Nigeria 25613 C 243 243
221 Nigeria 25614 C T 243 242 Ser74Ser
222 Nigeria 25615 A 243 243
223 Nigeria 25616 A 243 243
224 Nigeria 25617 G 243 243
225 Nigeria 25618 G 243 243
226 Nigeria 25619 G 243 243
227 Nigeria 25620 T 243 241
228 Nigeria 25621 G T 243 239 Val77Phe
229 Nigeria 25622 T 243 241
230 Nigeria 25623 T 243 241
231 Nigeria 25624 C 243 241
232 Nigeria 25625 A 243 241
233 Nigeria 25626 C 243 241
234 Nigeria 25627 T C 243 240 Phe79Leu
235 Nigeria 25628 T 243 241
236 Nigeria 25629 T 244 242
237 Nigeria 25630 G 244 242
238 Nigeria 25631 T 244 242
239 Nigeria 25632 T 244 242
240 Nigeria 25633 T 244 242
241 Nigeria 25634 G 244 242
242 Nigeria 25635 C 244 242
243 Nigeria 25636 A T 244 241 Asn82Tyr
244 Nigeria 25637 A 244 242
245 Nigeria 25638 C 244 242
246 Nigeria 25639 T 244 242
247 Nigeria 25640 T 244 242
248 Nigeria 25641 G 244 242
249 Nigeria 25642 C 244 242
250 Nigeria 25643 T 244 242
251 Nigeria 25644 G 244 242
252 Nigeria 25645 T 244 242
253 Nigeria 25646 T 244 242
254 Nigeria 25647 G T 244 241 Leu85Phe
255 Nigeria 25648 T 244 242
256 Nigeria 25649 T 244 242
257 Nigeria 25650 G A 244 241 Leu86Leu
258 Nigeria 25651 T 244 243
259 Nigeria 25652 T 244 243
260 Nigeria 25653 T 244 243
261 Nigeria 25654 G 244 243
262 Nigeria 25655 T 244 243
263 Nigeria 25656 A 244 243
264 Nigeria 25657 A 244 243
265 Nigeria 25658 C 244 243
266 Nigeria 25659 A 244 241
267 Nigeria 25660 G 244 242
268 Nigeria 25661 T 244 242
269 Nigeria 25662 T 244 242
270 Nigeria 25663 T 244 243
271 Nigeria 25664 A 244 243
272 Nigeria 25665 C 244 243
273 Nigeria 25666 T 244 244
274 Nigeria 25667 C 244 244
275 Nigeria 25668 A 244 244
276 Nigeria 25669 C T 244 243 His93Tyr
277 Nigeria 25670 A 244 244
278 Nigeria 25671 C 244 244
279 Nigeria 25672 C 244 244
280 Nigeria 25673 T 244 244
281 Nigeria 25674 T 244 244
282 Nigeria 25675 T 244 244
283 Nigeria 25676 T 244 244
284 Nigeria 25677 G 244 244
285 Nigeria 25678 C 244 244
286 Nigeria 25679 T 244 243
287 Nigeria 25680 C 244 243
288 Nigeria 25681 G 244 243
289 Nigeria 25682 T 244 243
290 Nigeria 25683 T 244 243
291 Nigeria 25684 G 244 243
292 Nigeria 25685 C 244 243
293 Nigeria 25686 T 244 242
294 Nigeria 25687 G 244 242
295 Nigeria 25688 C T 244 241 Ala99Val
296 Nigeria 25689 T 244 242
297 Nigeria 25690 G T 244 241 Gly100Cys
298 Nigeria 25691 G 244 243
299 Nigeria 25692 C 244 243
300 Nigeria 25693 C 244 243
301 Nigeria 25694 T C 244 242 Leu101Pro
302 Nigeria 25695 T 244 243
303 Nigeria 25696 G 244 243
304 Nigeria 25697 A 244 243
305 Nigeria 25698 A 244 243
306 Nigeria 25699 G 244 243
307 Nigeria 25700 C 244 243
308 Nigeria 25701 C 244 243
309 Nigeria 25702 C A 244 242 Pro104Thr
310 Nigeria 25703 C 244 243
311 Nigeria 25704 T 244 243
312 Nigeria 25705 T 244 243
313 Nigeria 25706 T 244 243
314 Nigeria 25707 T 244 243
315 Nigeria 25708 C T 244 243 Leu106Phe
316 Nigeria 25709 T 244 243
317 Nigeria 25710 C T 244 242 Leu106Leu
318 Nigeria 25711 T 244 243
319 Nigeria 25712 A 245 243
320 Nigeria 25713 T 245 243
321 Nigeria 25714 C 245 243
322 Nigeria 25715 T 245 242
323 Nigeria 25716 T 245 242
324 Nigeria 25717 T 246 243
325 Nigeria 25718 A 246 243
326 Nigeria 25719 T 246 243
327 Nigeria 25720 G 246 243
328 Nigeria 25721 C T 246 240 Ala110Val
329 Nigeria 25722 T 245 242
330 Nigeria 25723 T 245 242
331 Nigeria 25724 T 245 242
332 Nigeria 25725 A 245 242
333 Nigeria 25726 G 245 242
334 Nigeria 25727 T 245 242
335 Nigeria 25728 C 245 242
336 Nigeria 25729 T 245 243
337 Nigeria 25730 A 245 243
338 Nigeria 25731 C 245 243
339 Nigeria 25732 T 245 243
340 Nigeria 25733 T 245 242
341 Nigeria 25734 C 245 242
342 Nigeria 25735 T 245 240
343 Nigeria 25736 T 245 240
344 Nigeria 25737 G 245 240
345 Nigeria 25738 C 245 240
346 Nigeria 25739 A 245 239
347 Nigeria 25740 G 245 240
348 Nigeria 25741 A 245 236
349 Nigeria 25742 G 245 237
350 Nigeria 25743 T 245 236
351 Nigeria 25744 A 245 236
352 Nigeria 25745 T 245 237
353 Nigeria 25746 A 245 237
354 Nigeria 25747 A 245 237
355 Nigeria 25748 A 245 237
356 Nigeria 25749 C 245 237
357 Nigeria 25750 T 244 234
358 Nigeria 25751 T 243 232
359 Nigeria 25752 T 243 231
360 Nigeria 25753 G 243 232
361 Nigeria 25754 T 243 232
362 Nigeria 25755 A 243 232
363 Nigeria 25756 A 243 232
364 Nigeria 25757 G 243 233
365 Nigeria 25758 A 243 233
366 Nigeria 25759 A 243 234
367 Nigeria 25760 T 243 234
368 Nigeria 25761 A 243 235
369 Nigeria 25762 A 243 237
370 Nigeria 25763 T 243 238
371 Nigeria 25764 A 243 238
372 Nigeria 25765 A 243 239
373 Nigeria 25766 T 241 234
374 Nigeria 25767 G 241 235
375 Nigeria 25768 A 241 236
376 Nigeria 25769 G 241 236
377 Nigeria 25770 G 241 236
378 Nigeria 25771 C 241 236
379 Nigeria 25772 T 241 235
380 Nigeria 25773 T 241 235
381 Nigeria 25774 T 241 235
382 Nigeria 25775 G 241 238
383 Nigeria 25776 G 241 238
384 Nigeria 25777 C 241 238
385 Nigeria 25778 T 241 235
386 Nigeria 25779 T 241 235
387 Nigeria 25780 T 241 235
388 Nigeria 25781 G 241 235
389 Nigeria 25782 C 241 235
390 Nigeria 25783 T 241 236
391 Nigeria 25784 G T 241 236 Trp131Leu
392 Nigeria 25785 G T 241 235 Trp131Cys
393 Nigeria 25786 A 241 236
394 Nigeria 25787 A 241 236
395 Nigeria 25788 A 241 236
396 Nigeria 25789 T 241 236
397 Nigeria 25790 G 241 236
398 Nigeria 25791 C 241 236
399 Nigeria 25792 C 241 235
400 Nigeria 25793 G 241 234
401 Nigeria 25794 T 241 236
402 Nigeria 25795 T 241 236
403 Nigeria 25796 C 241 237
404 Nigeria 25797 C T 241 236 Ser135Ser
405 Nigeria 25798 A 241 238
406 Nigeria 25799 A 241 238
407 Nigeria 25800 A 241 237
408 Nigeria 25801 A 241 237
409 Nigeria 25802 A 242 238
410 Nigeria 25803 C 242 238
411 Nigeria 25804 C 242 238
412 Nigeria 25805 C 242 238
413 Nigeria 25806 A 242 238
414 Nigeria 25807 T 242 238
415 Nigeria 25808 T 242 238
416 Nigeria 25809 A 242 240
417 Nigeria 25810 C 242 240
418 Nigeria 25811 T 242 240
419 Nigeria 25812 T 242 240
420 Nigeria 25813 T 242 240
421 Nigeria 25814 A 242 240
422 Nigeria 25815 T 242 240
423 Nigeria 25816 G 242 240
424 Nigeria 25817 A 243 240
425 Nigeria 25818 T A 243 238 Asp142Glu
426 Nigeria 25819 G 243 239
427 Nigeria 25820 C 243 239
428 Nigeria 25821 C 243 239
429 Nigeria 25822 A 243 239
430 Nigeria 25823 A 244 240
431 Nigeria 25824 C 244 240
432 Nigeria 25825 T 244 240
433 Nigeria 25826 A 244 240
434 Nigeria 25827 T 244 240
435 Nigeria 25828 T 244 240
436 Nigeria 25829 T 244 240
437 Nigeria 25830 T 244 240
438 Nigeria 25831 C 244 240
439 Nigeria 25832 T 244 240
440 Nigeria 25833 T 244 240
441 Nigeria 25834 T 244 240
442 Nigeria 25835 G 244 240
443 Nigeria 25836 C 244 240
444 Nigeria 25837 T 245 241
445 Nigeria 25838 G 245 241
446 Nigeria 25839 G 246 242
447 Nigeria 25840 C 246 242
448 Nigeria 25841 A 246 242
449 Nigeria 25842 T 247 244
450 Nigeria 25843 A 247 241
451 Nigeria 25844 C T 247 242 Thr151Ile
452 Nigeria 25845 T 247 243
453 Nigeria 25846 A 247 243
454 Nigeria 25847 A 247 243
455 Nigeria 25848 T 247 243
456 Nigeria 25849 T 247 243
457 Nigeria 25850 G 247 243
458 Nigeria 25851 T 247 243
459 Nigeria 25852 T 247 243
460 Nigeria 25853 A 247 243
461 Nigeria 25854 C 247 243
462 Nigeria 25855 G 247 244
463 Nigeria 25856 A 247 244
464 Nigeria 25857 C 248 245
465 Nigeria 25858 T 248 245
466 Nigeria 25859 A 248 246
467 Nigeria 25860 T 248 246
468 Nigeria 25861 T 248 246
469 Nigeria 25862 G 248 247
470 Nigeria 25863 T 248 247
471 Nigeria 25864 A G 248 246 Ile158Val
472 Nigeria 25865 T 248 247
473 Nigeria 25866 A 248 247
474 Nigeria 25867 C 249 248
475 Nigeria 25868 C 249 248
476 Nigeria 25869 T 249 249
477 Nigeria 25870 T 249 249
478 Nigeria 25871 A 249 249
479 Nigeria 25872 C 249 249
480 Nigeria 25873 A 249 249
481 Nigeria 25874 A 249 249
482 Nigeria 25875 T 249 249
483 Nigeria 25876 A 249 249
484 Nigeria 25877 G 249 249
485 Nigeria 25878 T 249 249
486 Nigeria 25879 G 249 249
487 Nigeria 25880 T 249 249
488 Nigeria 25881 A 249 249
489 Nigeria 25882 A 249 249
490 Nigeria 25883 C 249 249
491 Nigeria 25884 T 249 249
492 Nigeria 25885 T 249 249
493 Nigeria 25886 C 249 249
494 Nigeria 25887 T 249 249
495 Nigeria 25888 T 249 249
496 Nigeria 25889 C 249 249
497 Nigeria 25890 A 249 249
498 Nigeria 25891 A 249 249
499 Nigeria 25892 T 249 249
500 Nigeria 25893 T 249 249
501 Nigeria 25894 G 249 249
502 Nigeria 25895 T 249 249
503 Nigeria 25896 C 249 249
504 Nigeria 25897 A 249 249
505 Nigeria 25898 T 249 249
506 Nigeria 25899 T 249 249
507 Nigeria 25900 A 249 249
508 Nigeria 25901 C 249 249
509 Nigeria 25902 T 249 249
510 Nigeria 25903 T 249 249
511 Nigeria 25904 C 249 249
512 Nigeria 25905 A 249 249
513 Nigeria 25906 G 249 249
514 Nigeria 25907 G T 249 248 Gly172Val
515 Nigeria 25908 T 249 249
516 Nigeria 25909 G 249 249
517 Nigeria 25910 A 249 249
518 Nigeria 25911 T 249 249
519 Nigeria 25912 G T 249 248 Gly174Cys
520 Nigeria 25913 G 249 249
521 Nigeria 25914 C 249 249
522 Nigeria 25915 A 249 249
523 Nigeria 25916 C 249 249
524 Nigeria 25917 A 249 249
525 Nigeria 25918 A 249 249
526 Nigeria 25919 C 249 249
527 Nigeria 25920 A 249 249
528 Nigeria 25921 A 249 249
529 Nigeria 25922 G 249 249
530 Nigeria 25923 T 249 249
531 Nigeria 25924 C 249 249
532 Nigeria 25925 C 250 250
533 Nigeria 25926 T 250 250
534 Nigeria 25927 A 250 250
535 Nigeria 25928 T 250 250
536 Nigeria 25929 T 250 250
537 Nigeria 25930 T 250 250
538 Nigeria 25931 C 250 250
539 Nigeria 25932 T 250 250
540 Nigeria 25933 G 250 250
541 Nigeria 25934 A 250 250
542 Nigeria 25935 A 250 250
543 Nigeria 25936 C 250 250
544 Nigeria 25937 A 250 250
545 Nigeria 25938 T 250 250
546 Nigeria 25939 G 250 250
547 Nigeria 25940 A 250 250
548 Nigeria 25941 C 250 250
549 Nigeria 25942 T 250 250
550 Nigeria 25943 A 250 250
551 Nigeria 25944 C 250 250
552 Nigeria 25945 C 250 250
553 Nigeria 25946 A G 250 247 Gln185Arg
554 Nigeria 25947 G 250 249
555 Nigeria 25948 A 250 249
556 Nigeria 25949 T 250 249
557 Nigeria 25950 T C 250 248 Ile186Ile
558 Nigeria 25951 G 250 249
559 Nigeria 25952 G 250 249
560 Nigeria 25953 T 250 249
561 Nigeria 25954 G 250 249
562 Nigeria 25955 G 250 249
563 Nigeria 25956 T 250 249
564 Nigeria 25957 T 250 249
565 Nigeria 25958 A 250 249
566 Nigeria 25959 T 250 249
567 Nigeria 25960 A 250 249
568 Nigeria 25961 C 250 249
569 Nigeria 25962 T 250 249
570 Nigeria 25963 G 250 249
571 Nigeria 25964 A 250 249
572 Nigeria 25965 A 250 249
573 Nigeria 25966 A 250 249
574 Nigeria 25967 A 250 249
575 Nigeria 25968 A 250 249
576 Nigeria 25969 T 250 249
577 Nigeria 25970 G 249 248
578 Nigeria 25971 G 249 248
579 Nigeria 25972 G 249 248
580 Nigeria 25973 A 249 248
581 Nigeria 25974 A 249 248
582 Nigeria 25975 T 251 250
583 Nigeria 25976 C T 251 247 Ser195Phe
584 Nigeria 25977 T 251 250
585 Nigeria 25978 G 251 250
586 Nigeria 25979 G 251 250
587 Nigeria 25980 A 251 250
588 Nigeria 25981 G 251 251
589 Nigeria 25982 T 251 251
590 Nigeria 25983 A 251 251
591 Nigeria 25984 A 251 251
592 Nigeria 25985 A 251 251
593 Nigeria 25986 A 251 251
594 Nigeria 25987 G 251 251
595 Nigeria 25988 A 251 251
596 Nigeria 25989 C 251 251
597 Nigeria 25990 T 251 251
598 Nigeria 25991 G 251 251
599 Nigeria 25992 T 251 251
600 Nigeria 25993 G 251 251
601 Nigeria 25994 T 251 251
602 Nigeria 25995 T 251 251
603 Nigeria 25996 G T 251 249 Val202Leu
604 Nigeria 25997 T 251 251
605 Nigeria 25998 A 251 251
606 Nigeria 25999 T 251 251
607 Nigeria 26000 T 251 250
608 Nigeria 26001 A 251 250
609 Nigeria 26002 C 251 250
610 Nigeria 26003 A 251 250
611 Nigeria 26004 C 251 250
612 Nigeria 26005 A 251 250
613 Nigeria 26006 G 251 251
614 Nigeria 26007 T 251 251
615 Nigeria 26008 T 251 251
616 Nigeria 26009 A 251 251
617 Nigeria 26010 C 251 251
618 Nigeria 26011 T 251 251
619 Nigeria 26012 T 251 251
620 Nigeria 26013 C 251 251
621 Nigeria 26014 A 251 251
622 Nigeria 26015 C 251 251
623 Nigeria 26016 T 251 251
624 Nigeria 26017 T 251 251
625 Nigeria 26018 C 251 251
626 Nigeria 26019 A 251 251
627 Nigeria 26020 G 251 251
628 Nigeria 26021 A 251 251
629 Nigeria 26022 C 251 251
630 Nigeria 26023 T 251 251
631 Nigeria 26024 A 251 251
632 Nigeria 26025 T 251 251
633 Nigeria 26026 T 251 251
634 Nigeria 26027 A 251 251
635 Nigeria 26028 C 251 251
636 Nigeria 26029 C 251 250
637 Nigeria 26030 A 251 250
638 Nigeria 26031 G 251 250
639 Nigeria 26032 C 251 250
640 Nigeria 26033 T 251 250
641 Nigeria 26034 G 251 251
642 Nigeria 26035 T 251 251
643 Nigeria 26036 A 251 251
644 Nigeria 26037 C 251 251
645 Nigeria 26038 T 251 251
646 Nigeria 26039 C G 251 250 Ser216*
647 Nigeria 26040 A T 251 250 Ser216Ser
648 Nigeria 26041 A 251 251
649 Nigeria 26042 C 251 251
650 Nigeria 26043 T 251 251
651 Nigeria 26044 C 251 251
652 Nigeria 26045 A 251 251
653 Nigeria 26046 A 251 251
654 Nigeria 26047 T 251 251
655 Nigeria 26048 T 251 251
656 Nigeria 26049 G 251 251
657 Nigeria 26050 A 251 250
658 Nigeria 26051 G 251 250
659 Nigeria 26052 T 251 250
660 Nigeria 26053 A 251 250
661 Nigeria 26054 C 251 250
662 Nigeria 26055 A 251 250
663 Nigeria 26056 G 251 249
664 Nigeria 26057 A 251 249
665 Nigeria 26058 C 251 249
666 Nigeria 26059 A 251 249
667 Nigeria 26060 C T 251 247 Thr223Ile
668 Nigeria 26061 T 251 250
669 Nigeria 26062 G T 251 249 Gly224Cys
670 Nigeria 26063 G 251 251
671 Nigeria 26064 T 251 251
672 Nigeria 26065 G 251 251
673 Nigeria 26066 T 251 251
674 Nigeria 26067 T 251 251
675 Nigeria 26068 G 251 251
676 Nigeria 26069 A 251 251
677 Nigeria 26070 A 251 251
678 Nigeria 26071 C 252 252
679 Nigeria 26072 A 252 252
680 Nigeria 26073 T 252 252
681 Nigeria 26074 G 252 252
682 Nigeria 26075 T 252 252
683 Nigeria 26076 T 252 252
684 Nigeria 26077 A 252 252
685 Nigeria 26078 C 252 252
686 Nigeria 26079 C 252 252
687 Nigeria 26080 T 252 252
688 Nigeria 26081 T 252 251
689 Nigeria 26082 C 251 251
690 Nigeria 26083 T 251 251
691 Nigeria 26084 T 251 251
692 Nigeria 26085 C 251 251
693 Nigeria 26086 A 251 251
694 Nigeria 26087 T 251 251
695 Nigeria 26088 C 251 251
696 Nigeria 26089 T 251 251
697 Nigeria 26090 A 251 251
698 Nigeria 26091 C 251 251
699 Nigeria 26092 A 251 251
700 Nigeria 26093 A 251 251
701 Nigeria 26094 T 251 251
702 Nigeria 26095 A 251 251
703 Nigeria 26096 A 251 251
704 Nigeria 26097 A 251 251
705 Nigeria 26098 A 251 251
706 Nigeria 26099 T 251 251
707 Nigeria 26100 T 251 251
708 Nigeria 26101 G 251 251
709 Nigeria 26102 T 251 251
710 Nigeria 26103 T 251 251
711 Nigeria 26104 G 251 251
712 Nigeria 26105 A 251 251
713 Nigeria 26106 T 251 251
714 Nigeria 26107 G 251 251
715 Nigeria 26108 A 251 251
716 Nigeria 26109 G 251 251
717 Nigeria 26110 C T 251 248 Pro240Ser
718 Nigeria 26111 C 251 251
719 Nigeria 26112 T 251 251
720 Nigeria 26113 G 251 251
721 Nigeria 26114 A 251 251
722 Nigeria 26115 A 251 251
723 Nigeria 26116 G 251 251
724 Nigeria 26117 A 251 251
725 Nigeria 26118 A 251 251
726 Nigeria 26119 C 251 251
727 Nigeria 26120 A 251 251
728 Nigeria 26121 T 251 251
729 Nigeria 26122 G 251 251
730 Nigeria 26123 T 251 251
731 Nigeria 26124 C 251 251
732 Nigeria 26125 C 251 251
733 Nigeria 26126 A 251 250
734 Nigeria 26127 A 251 250
735 Nigeria 26128 A 251 250
736 Nigeria 26129 T 251 250
737 Nigeria 26130 T 251 250
738 Nigeria 26131 C 251 251
739 Nigeria 26132 A 251 251
740 Nigeria 26133 C 251 251
741 Nigeria 26134 A 251 251
742 Nigeria 26135 C 251 251
743 Nigeria 26136 A 251 249
744 Nigeria 26137 A 251 249
745 Nigeria 26138 T 251 250
746 Nigeria 26139 C 251 250
747 Nigeria 26140 G 251 250
748 Nigeria 26141 A 251 250
749 Nigeria 26142 C 251 250
750 Nigeria 26143 G A 251 249 Gly251Ser
751 Nigeria 26144 G T 251 241 Gly251Val
752 Nigeria 26145 T 251 250
753 Nigeria 26146 T 251 250
754 Nigeria 26147 C 251 250
755 Nigeria 26148 A 251 250
756 Nigeria 26149 T 251 250
757 Nigeria 26150 C 251 250
758 Nigeria 26151 C 251 250
759 Nigeria 26152 G 251 249
760 Nigeria 26153 G 251 250
761 Nigeria 26154 A 251 250
762 Nigeria 26155 G 251 250
763 Nigeria 26156 T 251 250
764 Nigeria 26157 T 251 250
765 Nigeria 26158 G 251 250
766 Nigeria 26159 T 251 250
767 Nigeria 26160 T 251 250
768 Nigeria 26161 A 251 250
769 Nigeria 26162 A 251 250
770 Nigeria 26163 T 251 250
771 Nigeria 26164 C 251 250
772 Nigeria 26165 C 251 250
773 Nigeria 26166 A 251 250
774 Nigeria 26167 G 251 250
775 Nigeria 26168 T 251 250
776 Nigeria 26169 A 251 250
777 Nigeria 26170 A 251 250
778 Nigeria 26171 T 251 250
779 Nigeria 26172 G 251 249
780 Nigeria 26173 G 251 249
781 Nigeria 26174 A 251 250
782 Nigeria 26175 A 251 249
783 Nigeria 26176 C 251 249
784 Nigeria 26177 C 251 249
785 Nigeria 26178 A 251 250
786 Nigeria 26179 A 251 250
787 Nigeria 26180 T 251 250
788 Nigeria 26181 T 251 250
789 Nigeria 26182 T 251 250
790 Nigeria 26183 A 251 250
791 Nigeria 26184 T 251 251
792 Nigeria 26185 G 251 251
793 Nigeria 26186 A 251 251
794 Nigeria 26187 T 251 251
795 Nigeria 26188 G 251 251
796 Nigeria 26189 A 251 251
797 Nigeria 26190 A G 251 250 Glu266Glu
798 Nigeria 26191 C 251 251
799 Nigeria 26192 C 251 251
800 Nigeria 26193 G 251 251
801 Nigeria 26194 A 251 251
802 Nigeria 26195 C 251 251
803 Nigeria 26196 G 251 251
804 Nigeria 26197 A 251 251
805 Nigeria 26198 C T 251 250 Thr269Met
806 Nigeria 26199 G 251 251
807 Nigeria 26200 A 251 251
808 Nigeria 26201 C 251 251
809 Nigeria 26202 T 251 251
810 Nigeria 26203 A 251 251
811 Nigeria 26204 C 251 251
812 Nigeria 26205 T 251 251
813 Nigeria 26206 A 251 251
814 Nigeria 26207 G 251 251
815 Nigeria 26208 C 251 251
816 Nigeria 26209 G 251 250
817 Nigeria 26210 T 251 251
818 Nigeria 26211 G 250 250
819 Nigeria 26212 C 250 250
820 Nigeria 26213 C 250 250
821 Nigeria 26214 T 250 250
822 Nigeria 26215 T 250 250
823 Nigeria 26216 T 250 250
824 Nigeria 26217 G 250 250
825 Nigeria 26218 T 249 249
826 Nigeria 26219 A 249 249
827 Nigeria 26220 A 249 249