National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     2                                        
-     828                                        
?                                              
A     39                                        
C     21                                        
D     39                                        
E     33                                        
F     42                                        
G     42                                        
H     24                                        
I     63                                        
K     33                                        
L     90                                        
M     12                                        
N     24                                        
P     36                                        
Q     27                                        
R     18                                        
S     66                                        
T     72                                        
V     76                                        
W     18                                        
Y     51                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 25393 A 5 5
1 Brunei 25394 T 5 5
2 Brunei 25395 G 5 5
3 Brunei 25396 G 5 5
4 Brunei 25397 A 5 5
5 Brunei 25398 T 5 5
6 Brunei 25399 T 5 5
7 Brunei 25400 T 5 5
8 Brunei 25401 G 5 5
9 Brunei 25402 T 5 5
10 Brunei 25403 T 5 5
11 Brunei 25404 T 5 5
12 Brunei 25405 A 5 5
13 Brunei 25406 T 5 5
14 Brunei 25407 G 5 5
15 Brunei 25408 A 5 5
16 Brunei 25409 G 5 5
17 Brunei 25410 A 5 5
18 Brunei 25411 A 5 5
19 Brunei 25412 T 5 5
20 Brunei 25413 C 5 5
21 Brunei 25414 T 5 5
22 Brunei 25415 T 5 5
23 Brunei 25416 C 5 5
24 Brunei 25417 A 5 5
25 Brunei 25418 C 5 5
26 Brunei 25419 A 5 5
27 Brunei 25420 A 5 5
28 Brunei 25421 T 5 5
29 Brunei 25422 T 5 5
30 Brunei 25423 G 5 5
31 Brunei 25424 G 5 5
32 Brunei 25425 A 5 5
33 Brunei 25426 A 5 5
34 Brunei 25427 C 5 5
35 Brunei 25428 T 5 5
36 Brunei 25429 G 5 5
37 Brunei 25430 T 5 5
38 Brunei 25431 A 5 5
39 Brunei 25432 A 5 5
40 Brunei 25433 C 5 5
41 Brunei 25434 T 5 5
42 Brunei 25435 T 5 5
43 Brunei 25436 T 5 5
44 Brunei 25437 G 5 5
45 Brunei 25438 A 5 5
46 Brunei 25439 A 5 5
47 Brunei 25440 G 5 5
48 Brunei 25441 C 5 5
49 Brunei 25442 A 5 5
50 Brunei 25443 A 5 5
51 Brunei 25444 G 5 5
52 Brunei 25445 G 5 5
53 Brunei 25446 T 5 5
54 Brunei 25447 G 5 5
55 Brunei 25448 A 5 5
56 Brunei 25449 A 5 5
57 Brunei 25450 A 5 5
58 Brunei 25451 T 5 5
59 Brunei 25452 C 5 5
60 Brunei 25453 A 5 5
61 Brunei 25454 A 5 5
62 Brunei 25455 G 5 5
63 Brunei 25456 G 5 5
64 Brunei 25457 A 5 5
65 Brunei 25458 T 5 5
66 Brunei 25459 G 5 5
67 Brunei 25460 C 5 5
68 Brunei 25461 T 5 5
69 Brunei 25462 A 5 5
70 Brunei 25463 C 5 5
71 Brunei 25464 T 5 5
72 Brunei 25465 C 5 5
73 Brunei 25466 C 5 5
74 Brunei 25467 T 5 5
75 Brunei 25468 T 5 5
76 Brunei 25469 C 5 5
77 Brunei 25470 A 5 5
78 Brunei 25471 G 5 5
79 Brunei 25472 A 5 5
80 Brunei 25473 T 5 5
81 Brunei 25474 T 5 5
82 Brunei 25475 T 5 5
83 Brunei 25476 T 5 5
84 Brunei 25477 G 5 5
85 Brunei 25478 T 5 5
86 Brunei 25479 T 5 5
87 Brunei 25480 C 5 5
88 Brunei 25481 G 5 5
89 Brunei 25482 C 5 5
90 Brunei 25483 G 5 5
91 Brunei 25484 C 5 5
92 Brunei 25485 T 5 5
93 Brunei 25486 A 5 5
94 Brunei 25487 C 5 5
95 Brunei 25488 T 5 5
96 Brunei 25489 G 5 5
97 Brunei 25490 C 5 5
98 Brunei 25491 A 5 5
99 Brunei 25492 A 5 5
100 Brunei 25493 C 5 5
101 Brunei 25494 G 5 5
102 Brunei 25495 A 5 5
103 Brunei 25496 T 5 5
104 Brunei 25497 A 5 5
105 Brunei 25498 C 5 5
106 Brunei 25499 C 5 5
107 Brunei 25500 G 5 5
108 Brunei 25501 A 5 5
109 Brunei 25502 T 5 5
110 Brunei 25503 A 5 5
111 Brunei 25504 C 5 5
112 Brunei 25505 A 5 5
113 Brunei 25506 A 5 5
114 Brunei 25507 G 5 5
115 Brunei 25508 C 5 5
116 Brunei 25509 C 5 5
117 Brunei 25510 T 5 5
118 Brunei 25511 C 5 5
119 Brunei 25512 A 5 5
120 Brunei 25513 C 5 5
121 Brunei 25514 T 5 5
122 Brunei 25515 C 5 5
123 Brunei 25516 C 5 5
124 Brunei 25517 C 5 5
125 Brunei 25518 T 5 5
126 Brunei 25519 T 5 5
127 Brunei 25520 T 5 5
128 Brunei 25521 C 5 5
129 Brunei 25522 G 5 5
130 Brunei 25523 G 5 5
131 Brunei 25524 A 5 5
132 Brunei 25525 T 5 5
133 Brunei 25526 G 5 5
134 Brunei 25527 G 5 5
135 Brunei 25528 C 5 5
136 Brunei 25529 T 5 5
137 Brunei 25530 T 5 5
138 Brunei 25531 A 5 5
139 Brunei 25532 T 5 5
140 Brunei 25533 T 5 5
141 Brunei 25534 G 5 5
142 Brunei 25535 T 5 5
143 Brunei 25536 T 5 5
144 Brunei 25537 G 5 5
145 Brunei 25538 G 5 5
146 Brunei 25539 C 5 5
147 Brunei 25540 G 5 5
148 Brunei 25541 T 5 5
149 Brunei 25542 T 5 5
150 Brunei 25543 G 5 5
151 Brunei 25544 C 5 5
152 Brunei 25545 A 5 5
153 Brunei 25546 C 5 5
154 Brunei 25547 T 5 5
155 Brunei 25548 T 5 5
156 Brunei 25549 C 5 5
157 Brunei 25550 T 5 5
158 Brunei 25551 T 5 5
159 Brunei 25552 G 5 5
160 Brunei 25553 C 5 5
161 Brunei 25554 T 5 5
162 Brunei 25555 G 5 5
163 Brunei 25556 T 5 5
164 Brunei 25557 T 5 5
165 Brunei 25558 T 5 5
166 Brunei 25559 T 5 5
167 Brunei 25560 T 5 5
168 Brunei 25561 C 5 5
169 Brunei 25562 A 5 5
170 Brunei 25563 G 5 5
171 Brunei 25564 A 5 5
172 Brunei 25565 G 5 5
173 Brunei 25566 C 5 5
174 Brunei 25567 G 5 5
175 Brunei 25568 C 5 5
176 Brunei 25569 T 5 5
177 Brunei 25570 T 5 5
178 Brunei 25571 C 5 5
179 Brunei 25572 C 5 5
180 Brunei 25573 A 5 5
181 Brunei 25574 A 5 5
182 Brunei 25575 A 5 5
183 Brunei 25576 A 5 5
184 Brunei 25577 T 5 5
185 Brunei 25578 C 5 5
186 Brunei 25579 A 5 5
187 Brunei 25580 T 5 5
188 Brunei 25581 A 5 5
189 Brunei 25582 A 5 5
190 Brunei 25583 C 5 5
191 Brunei 25584 C 5 5
192 Brunei 25585 C 5 5
193 Brunei 25586 T 5 5
194 Brunei 25587 C 5 5
195 Brunei 25588 A 5 5
196 Brunei 25589 A 5 5
197 Brunei 25590 A 5 5
198 Brunei 25591 A 5 5
199 Brunei 25592 A 5 5
200 Brunei 25593 G 5 5
201 Brunei 25594 A 5 5
202 Brunei 25595 G 5 5
203 Brunei 25596 A 5 5
204 Brunei 25597 T 5 5
205 Brunei 25598 G 5 5
206 Brunei 25599 G 5 5
207 Brunei 25600 C 5 5
208 Brunei 25601 A 5 5
209 Brunei 25602 A 5 5
210 Brunei 25603 C 5 5
211 Brunei 25604 T 5 5
212 Brunei 25605 A 5 5
213 Brunei 25606 G 5 5
214 Brunei 25607 C 5 5
215 Brunei 25608 A 5 5
216 Brunei 25609 C 5 5
217 Brunei 25610 T 5 5
218 Brunei 25611 C 5 5
219 Brunei 25612 T 5 5
220 Brunei 25613 C 5 5
221 Brunei 25614 C 5 5
222 Brunei 25615 A 5 5
223 Brunei 25616 A 5 5
224 Brunei 25617 G 5 5
225 Brunei 25618 G 5 5
226 Brunei 25619 G 5 5
227 Brunei 25620 T 5 5
228 Brunei 25621 G 5 5
229 Brunei 25622 T 5 5
230 Brunei 25623 T 5 5
231 Brunei 25624 C 5 5
232 Brunei 25625 A 5 5
233 Brunei 25626 C 5 5
234 Brunei 25627 T 5 5
235 Brunei 25628 T 5 5
236 Brunei 25629 T 5 5
237 Brunei 25630 G 5 5
238 Brunei 25631 T 5 5
239 Brunei 25632 T 5 5
240 Brunei 25633 T 5 5
241 Brunei 25634 G 5 5
242 Brunei 25635 C 5 5
243 Brunei 25636 A 5 5
244 Brunei 25637 A 5 5
245 Brunei 25638 C 5 5
246 Brunei 25639 T 5 5
247 Brunei 25640 T 5 5
248 Brunei 25641 G 5 5
249 Brunei 25642 C 5 5
250 Brunei 25643 T 5 5
251 Brunei 25644 G 5 5
252 Brunei 25645 T 5 5
253 Brunei 25646 T 5 5
254 Brunei 25647 G 5 5
255 Brunei 25648 T 5 5
256 Brunei 25649 T 5 5
257 Brunei 25650 G 5 5
258 Brunei 25651 T 5 5
259 Brunei 25652 T 5 5
260 Brunei 25653 T 5 5
261 Brunei 25654 G 5 5
262 Brunei 25655 T 5 5
263 Brunei 25656 A 5 5
264 Brunei 25657 A 5 5
265 Brunei 25658 C 5 5
266 Brunei 25659 A 5 5
267 Brunei 25660 G 5 5
268 Brunei 25661 T 5 5
269 Brunei 25662 T 5 5
270 Brunei 25663 T 5 5
271 Brunei 25664 A 5 5
272 Brunei 25665 C 5 5
273 Brunei 25666 T 5 5
274 Brunei 25667 C 5 5
275 Brunei 25668 A 5 5
276 Brunei 25669 C 5 5
277 Brunei 25670 A 5 5
278 Brunei 25671 C 5 5
279 Brunei 25672 C 5 5
280 Brunei 25673 T 5 5
281 Brunei 25674 T 5 5
282 Brunei 25675 T 5 5
283 Brunei 25676 T 5 5
284 Brunei 25677 G 5 5
285 Brunei 25678 C 5 5
286 Brunei 25679 T 5 5
287 Brunei 25680 C 5 5
288 Brunei 25681 G 5 5
289 Brunei 25682 T 5 5
290 Brunei 25683 T 5 5
291 Brunei 25684 G 5 5
292 Brunei 25685 C 5 5
293 Brunei 25686 T 5 5
294 Brunei 25687 G 5 5
295 Brunei 25688 C 5 5
296 Brunei 25689 T 5 5
297 Brunei 25690 G 5 5
298 Brunei 25691 G 5 5
299 Brunei 25692 C 5 5
300 Brunei 25693 C 5 5
301 Brunei 25694 T 5 5
302 Brunei 25695 T 5 5
303 Brunei 25696 G 5 5
304 Brunei 25697 A 5 5
305 Brunei 25698 A 5 5
306 Brunei 25699 G 5 5
307 Brunei 25700 C 5 5
308 Brunei 25701 C 5 5
309 Brunei 25702 C 5 5
310 Brunei 25703 C 5 5
311 Brunei 25704 T 5 5
312 Brunei 25705 T 5 5
313 Brunei 25706 T 5 5
314 Brunei 25707 T 5 5
315 Brunei 25708 C 5 5
316 Brunei 25709 T 5 5
317 Brunei 25710 C 5 5
318 Brunei 25711 T 5 5
319 Brunei 25712 A 5 5
320 Brunei 25713 T 5 5
321 Brunei 25714 C 5 5
322 Brunei 25715 T 5 5
323 Brunei 25716 T 5 5
324 Brunei 25717 T 5 5
325 Brunei 25718 A 5 5
326 Brunei 25719 T 5 5
327 Brunei 25720 G 5 5
328 Brunei 25721 C 5 5
329 Brunei 25722 T 5 5
330 Brunei 25723 T 5 5
331 Brunei 25724 T 5 5
332 Brunei 25725 A 5 5
333 Brunei 25726 G 5 5
334 Brunei 25727 T 5 5
335 Brunei 25728 C 5 5
336 Brunei 25729 T 5 5
337 Brunei 25730 A 5 5
338 Brunei 25731 C 5 5
339 Brunei 25732 T 5 5
340 Brunei 25733 T 5 5
341 Brunei 25734 C 5 5
342 Brunei 25735 T 5 5
343 Brunei 25736 T 5 5
344 Brunei 25737 G 5 5
345 Brunei 25738 C 5 5
346 Brunei 25739 A 5 5
347 Brunei 25740 G 5 5
348 Brunei 25741 A 5 5
349 Brunei 25742 G 5 5
350 Brunei 25743 T 5 5
351 Brunei 25744 A 5 5
352 Brunei 25745 T 5 5
353 Brunei 25746 A 5 5
354 Brunei 25747 A 5 5
355 Brunei 25748 A 5 5
356 Brunei 25749 C 5 5
357 Brunei 25750 T 5 5
358 Brunei 25751 T 5 5
359 Brunei 25752 T 5 5
360 Brunei 25753 G 5 5
361 Brunei 25754 T 5 5
362 Brunei 25755 A 5 5
363 Brunei 25756 A 5 5
364 Brunei 25757 G 5 5
365 Brunei 25758 A 5 5
366 Brunei 25759 A 5 5
367 Brunei 25760 T 5 5
368 Brunei 25761 A 5 5
369 Brunei 25762 A 5 5
370 Brunei 25763 T 5 5
371 Brunei 25764 A 5 5
372 Brunei 25765 A 5 5
373 Brunei 25766 T 5 5
374 Brunei 25767 G 5 5
375 Brunei 25768 A 5 5
376 Brunei 25769 G 5 5
377 Brunei 25770 G 5 5
378 Brunei 25771 C 5 5
379 Brunei 25772 T 5 5
380 Brunei 25773 T 5 5
381 Brunei 25774 T 5 5
382 Brunei 25775 G 5 5
383 Brunei 25776 G 5 5
384 Brunei 25777 C 5 5
385 Brunei 25778 T 5 5
386 Brunei 25779 T 5 5
387 Brunei 25780 T 5 5
388 Brunei 25781 G 5 5
389 Brunei 25782 C 5 5
390 Brunei 25783 T 5 5
391 Brunei 25784 G 5 5
392 Brunei 25785 G 5 5
393 Brunei 25786 A 5 5
394 Brunei 25787 A 5 5
395 Brunei 25788 A 5 5
396 Brunei 25789 T 5 5
397 Brunei 25790 G 5 5
398 Brunei 25791 C 5 5
399 Brunei 25792 C 5 5
400 Brunei 25793 G 5 5
401 Brunei 25794 T 5 5
402 Brunei 25795 T 5 5
403 Brunei 25796 C 5 5
404 Brunei 25797 C 5 5
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