National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     2                                        
-     828                                        
?                                              
A     39                                        
C     21                                        
D     39                                        
E     33                                        
F     42                                        
G     42                                   1    
H     24                                        
I     63                                        
K     33                                        
L     90                                        
M     12                                        
N     24                                        
P     36                                        
Q     27             1                          
R     18                                        
S     66                                        
T     72                                        
V     76                                        
W     18                                        
Y     51                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 25393 A 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 25394 T 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 25395 G 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 25396 G 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 25397 A 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 25398 T 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 25399 T 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 25400 T 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 25401 G 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 25402 T 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 25403 T 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 25404 T 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 25405 A 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 25406 T 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 25407 G 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 25408 A 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 25409 G 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 25410 A 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 25411 A 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 25412 T 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 25413 C 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 25414 T 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 25415 T 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 25416 C 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 25417 A 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 25418 C 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 25419 A 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 25420 A 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 25421 T 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 25422 T 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 25423 G 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 25424 G 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 25425 A 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 25426 A 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 25427 C 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 25428 T 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 25429 G 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 25430 T 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 25431 A 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 25432 A 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 25433 C 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 25434 T 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 25435 T 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 25436 T 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 25437 G 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 25438 A 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 25439 A 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 25440 G 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 25441 C 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 25442 A 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 25443 A 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 25444 G 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 25445 G 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 25446 T 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 25447 G 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 25448 A 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 25449 A 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 25450 A 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 25451 T 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 25452 C 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 25453 A 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 25454 A 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 25455 G 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 25456 G 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 25457 A 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 25458 T 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 25459 G 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 25460 C 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 25461 T 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 25462 A 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 25463 C 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 25464 T 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 25465 C 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 25466 C 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 25467 T 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 25468 T 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 25469 C 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 25470 A 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 25471 G 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 25472 A 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 25473 T 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 25474 T 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 25475 T 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 25476 T 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 25477 G 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 25478 T 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 25479 T 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 25480 C 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 25481 G 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 25482 C 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 25483 G 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 25484 C 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 25485 T 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 25486 A 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 25487 C 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 25488 T 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 25489 G 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 25490 C 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 25491 A 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 25492 A 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 25493 C 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 25494 G 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 25495 A 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 25496 T 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 25497 A 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 25498 C 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 25499 C 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 25500 G 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 25501 A 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 25502 T 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 25503 A 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 25504 C 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 25505 A 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 25506 A 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 25507 G 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 25508 C 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 25509 C 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 25510 T 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 25511 C 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 25512 A 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 25513 C 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 25514 T 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 25515 C 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 25516 C 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 25517 C 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 25518 T 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 25519 T 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 25520 T 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 25521 C 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 25522 G 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 25523 G 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 25524 A 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 25525 T 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 25526 G 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 25527 G 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 25528 C 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 25529 T 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 25530 T 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 25531 A 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 25532 T 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 25533 T 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 25534 G 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 25535 T 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 25536 T 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 25537 G 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 25538 G 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 25539 C 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 25540 G 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 25541 T 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 25542 T 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 25543 G 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 25544 C 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 25545 A 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 25546 C 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 25547 T 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 25548 T 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 25549 C 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 25550 T 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 25551 T 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 25552 G 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 25553 C 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 25554 T 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 25555 G 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 25556 T 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 25557 T 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 25558 T 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 25559 T 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 25560 T 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 25561 C 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 25562 A 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 25563 G T 1 0 Gln57His
171 Antigua_and_Barbuda 25564 A 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 25565 G 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 25566 C 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 25567 G 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 25568 C 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 25569 T 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 25570 T 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 25571 C 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 25572 C 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 25573 A 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 25574 A 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 25575 A 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 25576 A 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 25577 T 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 25578 C 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 25579 A 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 25580 T 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 25581 A 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 25582 A 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 25583 C 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 25584 C 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 25585 C 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 25586 T 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 25587 C 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 25588 A 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 25589 A 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 25590 A 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 25591 A 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 25592 A 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 25593 G 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 25594 A 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 25595 G 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 25596 A 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 25597 T 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 25598 G 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 25599 G 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 25600 C 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 25601 A 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 25602 A 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 25603 C 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 25604 T 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 25605 A 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 25606 G 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 25607 C 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 25608 A 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 25609 C 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 25610 T 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 25611 C 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 25612 T 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 25613 C 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 25614 C 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 25615 A 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 25616 A 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 25617 G 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 25618 G 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 25619 G 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 25620 T 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 25621 G 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 25622 T 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 25623 T 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 25624 C 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 25625 A 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 25626 C 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 25627 T 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 25628 T 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 25629 T 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 25630 G 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 25631 T 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 25632 T 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 25633 T 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 25634 G 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 25635 C 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 25636 A 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 25637 A 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 25638 C 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 25639 T 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 25640 T 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 25641 G 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 25642 C 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 25643 T 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 25644 G 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 25645 T 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 25646 T 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 25647 G 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 25648 T 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 25649 T 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 25650 G 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 25651 T 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 25652 T 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 25653 T 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 25654 G 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 25655 T 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 25656 A 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 25657 A 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 25658 C 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 25659 A 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 25660 G 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 25661 T 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 25662 T 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 25663 T 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 25664 A 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 25665 C 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 25666 T 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 25667 C 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 25668 A 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 25669 C 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 25670 A 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 25671 C 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 25672 C 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 25673 T 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 25674 T 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 25675 T 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 25676 T 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 25677 G 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 25678 C 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 25679 T 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 25680 C 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 25681 G 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 25682 T 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 25683 T 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 25684 G 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 25685 C 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 25686 T 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 25687 G 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 25688 C 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 25689 T 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 25690 G 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 25691 G 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 25692 C 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 25693 C 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 25694 T 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 25695 T 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 25696 G 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 25697 A 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 25698 A 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 25699 G 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 25700 C 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 25701 C 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 25702 C 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 25703 C 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 25704 T 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 25705 T 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 25706 T 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 25707 T 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 25708 C 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 25709 T 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 25710 C 1 1
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