National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   918                                        
?                                            
A   51                                        
C   36                                        
D   51                                        
E   27                                        
F   51                                        
G   78                                        
H   21                                        
I   33                                        
K   33                                        
L   87                                        
M   30                                        
N   63                                        
P   39                                        
Q   42                                        
R   33                                        
S   48                                        
T   72                                        
V   81                                        
W   9                                        
Y   33                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 10055 A 5 5
1 Brunei 10056 G 5 5
2 Brunei 10057 T 5 5
3 Brunei 10058 G 5 5
4 Brunei 10059 G 5 5
5 Brunei 10060 T 5 5
6 Brunei 10061 T 5 5
7 Brunei 10062 T 5 5
8 Brunei 10063 T 5 5
9 Brunei 10064 A 5 5
10 Brunei 10065 G 5 5
11 Brunei 10066 A 5 5
12 Brunei 10067 A 5 5
13 Brunei 10068 A 5 5
14 Brunei 10069 A 5 5
15 Brunei 10070 A 5 5
16 Brunei 10071 T 5 5
17 Brunei 10072 G 5 5
18 Brunei 10073 G 5 5
19 Brunei 10074 C 5 5
20 Brunei 10075 A 5 5
21 Brunei 10076 T 5 5
22 Brunei 10077 T 5 5
23 Brunei 10078 C 5 5
24 Brunei 10079 C 5 5
25 Brunei 10080 C 5 5
26 Brunei 10081 A 5 5
27 Brunei 10082 T 5 5
28 Brunei 10083 C 5 5
29 Brunei 10084 T 5 5
30 Brunei 10085 G 5 5
31 Brunei 10086 G 5 5
32 Brunei 10087 T 5 5
33 Brunei 10088 A 5 5
34 Brunei 10089 A 5 5
35 Brunei 10090 A 5 5
36 Brunei 10091 G 5 5
37 Brunei 10092 T 5 5
38 Brunei 10093 T 5 5
39 Brunei 10094 G 5 5
40 Brunei 10095 A 5 5
41 Brunei 10096 G 5 5
42 Brunei 10097 G 5 5
43 Brunei 10098 G 5 5
44 Brunei 10099 T 5 5
45 Brunei 10100 T 5 5
46 Brunei 10101 G 5 5
47 Brunei 10102 T 5 5
48 Brunei 10103 A 5 5
49 Brunei 10104 T 5 5
50 Brunei 10105 G 5 5
51 Brunei 10106 G 5 5
52 Brunei 10107 T 5 5
53 Brunei 10108 A 5 5
54 Brunei 10109 C 5 5
55 Brunei 10110 A 5 5
56 Brunei 10111 A 5 5
57 Brunei 10112 G 5 5
58 Brunei 10113 T 5 5
59 Brunei 10114 A 5 5
60 Brunei 10115 A 5 5
61 Brunei 10116 C 5 5
62 Brunei 10117 T 5 5
63 Brunei 10118 T 5 5
64 Brunei 10119 G 5 5
65 Brunei 10120 T 5 5
66 Brunei 10121 G 5 5
67 Brunei 10122 G 5 5
68 Brunei 10123 T 5 5
69 Brunei 10124 A 5 5
70 Brunei 10125 C 5 5
71 Brunei 10126 A 5 5
72 Brunei 10127 A 5 5
73 Brunei 10128 C 5 5
74 Brunei 10129 T 5 5
75 Brunei 10130 A 5 5
76 Brunei 10131 C 5 5
77 Brunei 10132 A 5 5
78 Brunei 10133 C 5 5
79 Brunei 10134 T 5 5
80 Brunei 10135 T 5 5
81 Brunei 10136 A 5 5
82 Brunei 10137 A 5 5
83 Brunei 10138 C 5 5
84 Brunei 10139 G 5 5
85 Brunei 10140 G 5 5
86 Brunei 10141 T 5 5
87 Brunei 10142 C 5 5
88 Brunei 10143 T 5 5
89 Brunei 10144 T 5 5
90 Brunei 10145 T 5 5
91 Brunei 10146 G 5 5
92 Brunei 10147 G 5 5
93 Brunei 10148 C 5 5
94 Brunei 10149 T 5 5
95 Brunei 10150 T 5 5
96 Brunei 10151 G 5 5
97 Brunei 10152 A 5 5
98 Brunei 10153 T 5 5
99 Brunei 10154 G 5 5
100 Brunei 10155 A 5 5
101 Brunei 10156 C 5 5
102 Brunei 10157 G 5 5
103 Brunei 10158 T 5 5
104 Brunei 10159 A 5 5
105 Brunei 10160 G 5 5
106 Brunei 10161 T 5 5
107 Brunei 10162 T 5 5
108 Brunei 10163 T 5 5
109 Brunei 10164 A 5 5
110 Brunei 10165 C 5 5
111 Brunei 10166 T 5 5
112 Brunei 10167 G 5 5
113 Brunei 10168 T 5 5
114 Brunei 10169 C 5 5
115 Brunei 10170 C 5 5
116 Brunei 10171 A 5 5
117 Brunei 10172 A 5 5
118 Brunei 10173 G 5 5
119 Brunei 10174 A 5 5
120 Brunei 10175 C 5 5
121 Brunei 10176 A 5 5
122 Brunei 10177 T 5 5
123 Brunei 10178 G 5 5
124 Brunei 10179 T 5 5
125 Brunei 10180 G 5 5
126 Brunei 10181 A 5 5
127 Brunei 10182 T 5 5
128 Brunei 10183 C 5 5
129 Brunei 10184 T 5 5
130 Brunei 10185 G 5 5
131 Brunei 10186 C 5 5
132 Brunei 10187 A 5 5
133 Brunei 10188 C 5 5
134 Brunei 10189 C 5 5
135 Brunei 10190 T 5 5
136 Brunei 10191 C 5 5
137 Brunei 10192 T 5 5
138 Brunei 10193 G 5 5
139 Brunei 10194 A 5 5
140 Brunei 10195 A 5 5
141 Brunei 10196 G 5 5
142 Brunei 10197 A 5 5
143 Brunei 10198 C 5 5
144 Brunei 10199 A 5 5
145 Brunei 10200 T 5 5
146 Brunei 10201 G 5 5
147 Brunei 10202 C 5 5
148 Brunei 10203 T 5 5
149 Brunei 10204 T 5 5
150 Brunei 10205 A 5 5
151 Brunei 10206 A 5 5
152 Brunei 10207 C 5 5
153 Brunei 10208 C 5 5
154 Brunei 10209 C 5 5
155 Brunei 10210 T 5 5
156 Brunei 10211 A 5 5
157 Brunei 10212 A 5 5
158 Brunei 10213 T 5 5
159 Brunei 10214 T 5 5
160 Brunei 10215 A 5 5
161 Brunei 10216 T 5 5
162 Brunei 10217 G 5 5
163 Brunei 10218 A 5 5
164 Brunei 10219 A 5 5
165 Brunei 10220 G 5 5
166 Brunei 10221 A 5 5
167 Brunei 10222 T 5 5
168 Brunei 10223 T 5 5
169 Brunei 10224 T 5 5
170 Brunei 10225 A 5 5
171 Brunei 10226 C 5 5
172 Brunei 10227 T 5 5
173 Brunei 10228 C 5 5
174 Brunei 10229 A 5 5
175 Brunei 10230 T 5 5
176 Brunei 10231 T 5 5
177 Brunei 10232 C 5 5
178 Brunei 10233 G 5 5
179 Brunei 10234 T 5 5
180 Brunei 10235 A 5 5
181 Brunei 10236 A 5 5
182 Brunei 10237 G 5 5
183 Brunei 10238 T 5 5
184 Brunei 10239 C 5 5
185 Brunei 10240 T 5 5
186 Brunei 10241 A 5 5
187 Brunei 10242 A 5 5
188 Brunei 10243 T 5 5
189 Brunei 10244 C 5 5
190 Brunei 10245 A 5 5
191 Brunei 10246 T 5 5
192 Brunei 10247 A 5 5
193 Brunei 10248 A 5 5
194 Brunei 10249 T 5 5
195 Brunei 10250 T 5 5
196 Brunei 10251 T 5 5
197 Brunei 10252 C 5 5
198 Brunei 10253 T 5 5
199 Brunei 10254 T 5 5
200 Brunei 10255 G 5 5
201 Brunei 10256 G 5 5
202 Brunei 10257 T 5 5
203 Brunei 10258 A 5 5
204 Brunei 10259 C 5 5
205 Brunei 10260 A 5 5
206 Brunei 10261 G 5 5
207 Brunei 10262 G 5 5
208 Brunei 10263 C 5 5
209 Brunei 10264 T 5 5
210 Brunei 10265 G 5 5
211 Brunei 10266 G 5 5
212 Brunei 10267 T 5 5
213 Brunei 10268 A 5 5
214 Brunei 10269 A 5 5
215 Brunei 10270 T 5 5
216 Brunei 10271 G 5 5
217 Brunei 10272 T 5 5
218 Brunei 10273 T 5 5
219 Brunei 10274 C 5 5
220 Brunei 10275 A 5 5
221 Brunei 10276 A 5 5
222 Brunei 10277 C 5 5
223 Brunei 10278 T 5 5
224 Brunei 10279 C 5 5
225 Brunei 10280 A 5 5
226 Brunei 10281 G 5 5
227 Brunei 10282 G 5 5
228 Brunei 10283 G 5 5
229 Brunei 10284 T 5 5
230 Brunei 10285 T 5 5
231 Brunei 10286 A 5 5
232 Brunei 10287 T 5 5
233 Brunei 10288 T 5 5
234 Brunei 10289 G 5 5
235 Brunei 10290 G 5 5
236 Brunei 10291 A 5 5
237 Brunei 10292 C 5 5
238 Brunei 10293 A 5 5
239 Brunei 10294 T 5 5
240 Brunei 10295 T 5 5
241 Brunei 10296 C 5 5
242 Brunei 10297 T 5 5
243 Brunei 10298 A 5 5
244 Brunei 10299 T 5 5
245 Brunei 10300 G 5 5
246 Brunei 10301 C 5 5
247 Brunei 10302 A 5 5
248 Brunei 10303 A 5 5
249 Brunei 10304 A 5 5
250 Brunei 10305 A 5 5
251 Brunei 10306 T 5 5
252 Brunei 10307 T 5 5
253 Brunei 10308 G 5 5
254 Brunei 10309 T 5 5
255 Brunei 10310 G 5 5
256 Brunei 10311 T 5 5
257 Brunei 10312 A 5 5
258 Brunei 10313 C 5 5
259 Brunei 10314 T 5 5
260 Brunei 10315 T 5 5
261 Brunei 10316 A 5 5
262 Brunei 10317 A 5 5
263 Brunei 10318 G 5 5
264 Brunei 10319 C 5 5
265 Brunei 10320 T 5 5
266 Brunei 10321 T 5 5
267 Brunei 10322 A 5 5
268 Brunei 10323 A 5 5
269 Brunei 10324 G 5 5
270 Brunei 10325 G 5 5
271 Brunei 10326 T 5 5
272 Brunei 10327 T 5 5
273 Brunei 10328 G 5 5
274 Brunei 10329 A 5 5
275 Brunei 10330 T 5 5
276 Brunei 10331 A 5 5
277 Brunei 10332 C 5 5
278 Brunei 10333 A 5 5
279 Brunei 10334 G 5 5
280 Brunei 10335 C 5 5
281 Brunei 10336 C 5 5
282 Brunei 10337 A 5 5
283 Brunei 10338 A 5 5
284 Brunei 10339 T 5 5
285 Brunei 10340 C 5 5
286 Brunei 10341 C 5 5
287 Brunei 10342 T 5 5
288 Brunei 10343 A 5 5
289 Brunei 10344 A 5 5
290 Brunei 10345 G 5 5
291 Brunei 10346 A 5 5
292 Brunei 10347 C 5 5
293 Brunei 10348 A 5 5
294 Brunei 10349 C 5 5
295 Brunei 10350 C 5 5
296 Brunei 10351 T 5 5
297 Brunei 10352 A 5 5
298 Brunei 10353 A 5 5
299 Brunei 10354 G 5 5
300 Brunei 10355 T 5 5
301 Brunei 10356 A 5 5
302 Brunei 10357 T 5 5
303 Brunei 10358 A 5 5
304 Brunei 10359 A 5 5
305 Brunei 10360 G 5 5
306 Brunei 10361 T 5 5
307 Brunei 10362 T 5 5
308 Brunei 10363 T 5 5
309 Brunei 10364 G 5 5
310 Brunei 10365 T 5 5
311 Brunei 10366 T 5 5
312 Brunei 10367 C 5 5
313 Brunei 10368 G 5 5
314 Brunei 10369 C 5 5
315 Brunei 10370 A 5 5
316 Brunei 10371 T 5 5
317 Brunei 10372 T 5 5
318 Brunei 10373 C 5 5
319 Brunei 10374 A 5 5
320 Brunei 10375 A 5 5
321 Brunei 10376 C 5 5
322 Brunei 10377 C 5 5
323 Brunei 10378 A 5 5
324 Brunei 10379 G 5 5
325 Brunei 10380 G 5 5
326 Brunei 10381 A 5 5
327 Brunei 10382 C 5 5
328 Brunei 10383 A 5 5
329 Brunei 10384 G 5 5
330 Brunei 10385 A 5 5
331 Brunei 10386 C 5 5
332 Brunei 10387 T 5 5
333 Brunei 10388 T 5 5
334 Brunei 10389 T 5 5
335 Brunei 10390 T 5 5
336 Brunei 10391 T 5 5
337 Brunei 10392 C 5 5
338 Brunei 10393 A 5 5
339 Brunei 10394 G 5 5
340 Brunei 10395 T 5 5
341 Brunei 10396 G 5 5
342 Brunei 10397 T 5 5
343 Brunei 10398 T 5 5
344 Brunei 10399 A 5 5
345 Brunei 10400 G 5 5
346 Brunei 10401 C 5 5
347 Brunei 10402 T 5 5
348 Brunei 10403 T 5 5
349 Brunei 10404 G 5 5
350 Brunei 10405 T 5 5
351 Brunei 10406 T 5 5
352 Brunei 10407 A 5 5
353 Brunei 10408 C 5 5
354 Brunei 10409 A 5 5
355 Brunei 10410 A 5 5
356 Brunei 10411 T 5 5
357 Brunei 10412 G 5 5
358 Brunei 10413 G 5 5
359 Brunei 10414 T 5 5
360 Brunei 10415 T 5 5
361 Brunei 10416 C 5 5
362 Brunei 10417 A 5 5
363 Brunei 10418 C 5 5
364 Brunei 10419 C 5 5
365 Brunei 10420 A 5 5
366 Brunei 10421 T 5 5
367 Brunei 10422 C 5 5
368 Brunei 10423 T 5 5
369 Brunei 10424 G 5 5
370 Brunei 10425 G 5 5
371 Brunei 10426 T 5 5
372 Brunei 10427 G 5 5
373 Brunei 10428 T 5 5
374 Brunei 10429 T 5 5
375 Brunei 10430 T 5 5
376 Brunei 10431 A 5 5
377 Brunei 10432 C 5 5
378 Brunei 10433 C 5 5
379 Brunei 10434 A 5 5
380 Brunei 10435 A 5 5
381 Brunei 10436 T 5 5
382 Brunei 10437 G 5 5
383 Brunei 10438 T 5 5
384 Brunei 10439 G 5 5
385 Brunei 10440 C 5 5
386 Brunei 10441 T 5 5
387 Brunei 10442 A 5 5
388 Brunei 10443 T 5 5
389 Brunei 10444 G 5 5
390 Brunei 10445 A 5 5
391 Brunei 10446 G 5 5
392 Brunei 10447 G 5 5
393 Brunei 10448 C 5 5
394 Brunei 10449 C 5 5
395 Brunei 10450 C 5 5
396 Brunei 10451 A 5 5
397 Brunei 10452 A 5 5
398 Brunei 10453 T 5 5
399 Brunei 10454 T 5 5
400 Brunei 10455 T 5 5
401 Brunei 10456 C 5 5
402 Brunei 10457 A 5 5
403 Brunei 10458 C 5 5
404 Brunei 10459 T 5 5
405 Brunei 10460 A 5 5
406 Brunei 10461 T 5 5
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862 Brunei 10917 A 5 5
863 Brunei 10918 A 5 5
864 Brunei 10919 G 5 5
865 Brunei 10920 A 5 5
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868 Brunei 10923 A 5 5
869 Brunei 10924 A 5 5
870 Brunei 10925 T 5 5
871 Brunei 10926 T 5 5
872 Brunei 10927 T 5 5
873 Brunei 10928 A 5 5
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