National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   383                                        
?                                            
A   12                                        
C   20                                        
D   15                                        
E   9                                        
F   15                                        
G   30                                        
H   9                                        
I   12                                        
K   24                                        
L   33         1                              
M   12                                        
N   27                                        
P   21                                        
Q   21                                        
R   15                                        
S   24                                        
T   24                                        
V   42                                        
W   3                                        
Y   15                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 10055 A 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 10056 G 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 10057 T 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 10058 G 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 10059 G 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 10060 T 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 10061 T 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 10062 T 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 10063 T 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 10064 A 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 10065 G 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 10066 A 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 10067 A 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 10068 A 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 10069 A 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 10070 A 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 10071 T 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 10072 G 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 10073 G 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 10074 C 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 10075 A 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 10076 T 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 10077 T 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 10078 C 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 10079 C 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 10080 C 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 10081 A 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 10082 T 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 10083 C 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 10084 T 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 10085 G 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 10086 G 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 10087 T 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 10088 A 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 10089 A 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 10090 A 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 10091 G 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 10092 T 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 10093 T 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 10094 G 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 10095 A 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 10096 G 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 10097 G 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 10098 G 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 10099 T 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 10100 T 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 10101 G 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 10102 T 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 10103 A 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 10104 T 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 10105 G 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 10106 G 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 10107 T 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 10108 A 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 10109 C 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 10110 A 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 10111 A 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 10112 G 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 10113 T 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 10114 A 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 10115 A 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 10116 C 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 10117 T 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 10118 T 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 10119 G 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 10120 T 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 10121 G 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 10122 G 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 10123 T 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 10124 A 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 10125 C 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 10126 A 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 10127 A 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 10128 C 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 10129 T 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 10130 A 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 10131 C 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 10132 A 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 10133 C 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 10134 T 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 10135 T 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 10136 A 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 10137 A 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 10138 C 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 10139 G 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 10140 G 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 10141 T 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 10142 C 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 10143 T 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 10144 T 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 10145 T 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 10146 G 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 10147 G 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 10148 C 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 10149 T 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 10150 T 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 10151 G 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 10152 A 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 10153 T 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 10154 G 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 10155 A 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 10156 C 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 10157 G 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 10158 T 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 10159 A 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 10160 G 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 10161 T 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 10162 T 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 10163 T 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 10164 A 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 10165 C 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 10166 T 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 10167 G 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 10168 T 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 10169 C 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 10170 C 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 10171 A 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 10172 A 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 10173 G 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 10174 A 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 10175 C 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 10176 A 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 10177 T 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 10178 G 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 10179 T 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 10180 G 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 10181 A 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 10182 T 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 10183 C 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 10184 T 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 10185 G 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 10186 C 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 10187 A 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 10188 C 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 10189 C 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 10190 T 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 10191 C 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 10192 T 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 10193 G 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 10194 A 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 10195 A 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 10196 G 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 10197 A 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 10198 C 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 10199 A 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 10200 T 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 10201 G 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 10202 C 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 10203 T 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 10204 T 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 10205 A 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 10206 A 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 10207 C 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 10208 C 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 10209 C 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 10210 T 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 10211 A 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 10212 A 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 10213 T 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 10214 T 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 10215 A 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 10216 T 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 10217 G 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 10218 A 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 10219 A 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 10220 G 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 10221 A 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 10222 T 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 10223 T 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 10224 T 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 10225 A 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 10226 C 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 10227 T 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 10228 C 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 10229 A 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 10230 T 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 10231 T 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 10232 C 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 10233 G 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 10234 T 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 10235 A 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 10236 A 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 10237 G 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 10238 T 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 10239 C 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 10240 T 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 10241 A 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 10242 A 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 10243 T 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 10244 C 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 10245 A 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 10246 T 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 10247 A 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 10248 A 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 10249 T 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 10250 T 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 10251 T 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 10252 C 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 10253 T 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 10254 T 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 10255 G 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 10256 G 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 10257 T 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 10258 A 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 10259 C 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 10260 A 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 10261 G 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 10262 G 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 10263 C 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 10264 T 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 10265 G 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 10266 G 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 10267 T 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 10268 A 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 10269 A 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 10270 T 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 10271 G 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 10272 T 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 10273 T 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 10274 C 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 10275 A 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 10276 A 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 10277 C 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 10278 T 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 10279 C 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 10280 A 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 10281 G 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 10282 G 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 10283 G 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 10284 T 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 10285 T 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 10286 A 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 10287 T 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 10288 T 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 10289 G 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 10290 G 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 10291 A 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 10292 C 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 10293 A 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 10294 T 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 10295 T 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 10296 C 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 10297 T 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 10298 A 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 10299 T 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 10300 G 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 10301 C 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 10302 A 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 10303 A 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 10304 A 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 10305 A 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 10306 T 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 10307 T 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 10308 G 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 10309 T 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 10310 G 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 10311 T 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 10312 A 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 10313 C 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 10314 T 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 10315 T 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 10316 A 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 10317 A 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 10318 G 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 10319 C T 1 0 Leu3352Phe
265 Antigua_and_Barbuda 10320 T 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 10321 T 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 10322 A 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 10323 A 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 10324 G 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 10325 G 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 10326 T 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 10327 T 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 10328 G 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 10329 A 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 10330 T 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 10331 A 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 10332 C 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 10333 A 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 10334 G 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 10335 C 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 10336 C 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 10337 A 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 10338 A 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 10339 T 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 10340 C 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 10341 C 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 10342 T 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 10343 A 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 10344 A 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 10345 G 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 10346 A 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 10347 C 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 10348 A 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 10349 C 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 10350 C 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 10351 T 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 10352 A 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 10353 A 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 10354 G 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 10355 T 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 10356 A 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 10357 T 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 10358 A 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 10359 A 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 10360 G 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 10361 T 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 10362 T 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 10363 T 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 10364 G 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 10365 T 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 10366 T 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 10367 C 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 10368 G 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 10369 C 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 10370 A 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 10371 T 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 10372 T 1 1
318 Antigua_and_Barbuda 10373 C 1 1
319 Antigua_and_Barbuda 10374 A 1 1
320 Antigua_and_Barbuda 10375 A 1 1
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