National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     2                                      
-     1,260                                      
?                                            
A     111                                      
D     72                                      
E     36                                      
F     39                                      
G     129                                      
H     12                                      
I     42                                      
K     93                                      
L     81                                      
M     21                                      
N     66                                      
P     84                 1                    
Q     105                                      
R     87                                      
S     111                                      
T     97                                      
V     24                                      
W     15                                      
Y     33                                      

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 28274 A 5 5
1 Brunei 28275 T 5 5
2 Brunei 28276 G 5 5
3 Brunei 28277 T 5 5
4 Brunei 28278 C 5 5
5 Brunei 28279 T 5 5
6 Brunei 28280 G 5 5
7 Brunei 28281 A 5 5
8 Brunei 28282 T 5 5
9 Brunei 28283 A 5 5
10 Brunei 28284 A 5 5
11 Brunei 28285 T 5 5
12 Brunei 28286 G 5 5
13 Brunei 28287 G 5 5
14 Brunei 28288 A 5 5
15 Brunei 28289 C 5 5
16 Brunei 28290 C 5 5
17 Brunei 28291 C 5 5
18 Brunei 28292 C 5 5
19 Brunei 28293 A 5 5
20 Brunei 28294 A 5 5
21 Brunei 28295 A 5 5
22 Brunei 28296 A 5 5
23 Brunei 28297 T 5 5
24 Brunei 28298 C 5 5
25 Brunei 28299 A 5 5
26 Brunei 28300 G 5 5
27 Brunei 28301 C 5 5
28 Brunei 28302 G 5 5
29 Brunei 28303 A 5 5
30 Brunei 28304 A 5 5
31 Brunei 28305 A 5 5
32 Brunei 28306 T 5 5
33 Brunei 28307 G 5 5
34 Brunei 28308 C 5 5
35 Brunei 28309 A 5 5
36 Brunei 28310 C 5 5
37 Brunei 28311 C T 5 0 Pro13Leu
38 Brunei 28312 C 5 5
39 Brunei 28313 C 5 5
40 Brunei 28314 G 5 5
41 Brunei 28315 C 5 5
42 Brunei 28316 A 5 5
43 Brunei 28317 T 5 5
44 Brunei 28318 T 5 5
45 Brunei 28319 A 5 5
46 Brunei 28320 C 5 5
47 Brunei 28321 G 5 5
48 Brunei 28322 T 5 5
49 Brunei 28323 T 5 5
50 Brunei 28324 T 5 5
51 Brunei 28325 G 5 5
52 Brunei 28326 G 5 5
53 Brunei 28327 T 5 5
54 Brunei 28328 G 5 5
55 Brunei 28329 G 5 5
56 Brunei 28330 A 5 5
57 Brunei 28331 C 5 5
58 Brunei 28332 C 5 5
59 Brunei 28333 C 5 5
60 Brunei 28334 T 5 5
61 Brunei 28335 C 5 5
62 Brunei 28336 A 5 5
63 Brunei 28337 G 5 5
64 Brunei 28338 A 5 5
65 Brunei 28339 T 5 5
66 Brunei 28340 T 5 5
67 Brunei 28341 C 5 5
68 Brunei 28342 A 5 5
69 Brunei 28343 A 5 5
70 Brunei 28344 C 5 5
71 Brunei 28345 T 5 5
72 Brunei 28346 G 5 5
73 Brunei 28347 G 5 5
74 Brunei 28348 C 5 5
75 Brunei 28349 A 5 5
76 Brunei 28350 G 5 5
77 Brunei 28351 T 5 5
78 Brunei 28352 A 5 5
79 Brunei 28353 A 5 5
80 Brunei 28354 C 5 5
81 Brunei 28355 C 5 5
82 Brunei 28356 A 5 5
83 Brunei 28357 G 5 5
84 Brunei 28358 A 5 5
85 Brunei 28359 A 5 5
86 Brunei 28360 T 5 5
87 Brunei 28361 G 5 5
88 Brunei 28362 G 5 5
89 Brunei 28363 A 5 5
90 Brunei 28364 G 5 5
91 Brunei 28365 A 5 5
92 Brunei 28366 A 5 5
93 Brunei 28367 C 5 5
94 Brunei 28368 G 5 5
95 Brunei 28369 C 5 5
96 Brunei 28370 A 5 5
97 Brunei 28371 G 5 5
98 Brunei 28372 T 5 5
99 Brunei 28373 G 5 5
100 Brunei 28374 G 5 5
101 Brunei 28375 G 5 5
102 Brunei 28376 G 5 5
103 Brunei 28377 C 5 5
104 Brunei 28378 G 5 5
105 Brunei 28379 C 5 5
106 Brunei 28380 G 5 5
107 Brunei 28381 A 5 5
108 Brunei 28382 T 5 5
109 Brunei 28383 C 5 5
110 Brunei 28384 A 5 5
111 Brunei 28385 A 5 5
112 Brunei 28386 A 5 5
113 Brunei 28387 A 5 5
114 Brunei 28388 C 5 5
115 Brunei 28389 A 5 5
116 Brunei 28390 A 5 5
117 Brunei 28391 C 5 5
118 Brunei 28392 G 5 5
119 Brunei 28393 T 5 5
120 Brunei 28394 C 5 5
121 Brunei 28395 G 5 5
122 Brunei 28396 G 5 5
123 Brunei 28397 C 5 5
124 Brunei 28398 C 5 5
125 Brunei 28399 C 5 5
126 Brunei 28400 C 5 5
127 Brunei 28401 A 5 5
128 Brunei 28402 A 5 5
129 Brunei 28403 G 5 5
130 Brunei 28404 G 5 5
131 Brunei 28405 T 5 5
132 Brunei 28406 T 5 5
133 Brunei 28407 T 5 5
134 Brunei 28408 A 5 5
135 Brunei 28409 C 5 5
136 Brunei 28410 C 5 5
137 Brunei 28411 C 5 5
138 Brunei 28412 A 5 5
139 Brunei 28413 A 5 5
140 Brunei 28414 T 5 5
141 Brunei 28415 A 5 5
142 Brunei 28416 A 5 5
143 Brunei 28417 T 5 5
144 Brunei 28418 A 5 5
145 Brunei 28419 C 5 5
146 Brunei 28420 T 5 5
147 Brunei 28421 G 5 5
148 Brunei 28422 C 5 5
149 Brunei 28423 G 5 5
150 Brunei 28424 T 5 5
151 Brunei 28425 C 5 5
152 Brunei 28426 T 5 5
153 Brunei 28427 T 5 5
154 Brunei 28428 G 5 5
155 Brunei 28429 G 5 5
156 Brunei 28430 T 5 5
157 Brunei 28431 T 5 5
158 Brunei 28432 C 5 5
159 Brunei 28433 A 5 5
160 Brunei 28434 C 5 5
161 Brunei 28435 C 5 5
162 Brunei 28436 G 5 5
163 Brunei 28437 C 5 5
164 Brunei 28438 T 5 5
165 Brunei 28439 C 5 5
166 Brunei 28440 T 5 5
167 Brunei 28441 C 5 5
168 Brunei 28442 A 5 5
169 Brunei 28443 C 5 5
170 Brunei 28444 T 5 5
171 Brunei 28445 C 5 5
172 Brunei 28446 A 5 5
173 Brunei 28447 A 5 5
174 Brunei 28448 C 5 5
175 Brunei 28449 A 5 5
176 Brunei 28450 T 5 5
177 Brunei 28451 G 5 5
178 Brunei 28452 G 5 5
179 Brunei 28453 C 5 5
180 Brunei 28454 A 5 5
181 Brunei 28455 A 5 5
182 Brunei 28456 G 5 5
183 Brunei 28457 G 5 5
184 Brunei 28458 A 5 5
185 Brunei 28459 A 5 5
186 Brunei 28460 G 5 5
187 Brunei 28461 A 5 5
188 Brunei 28462 C 5 5
189 Brunei 28463 C 5 5
190 Brunei 28464 T 5 5
191 Brunei 28465 T 5 5
192 Brunei 28466 A 5 5
193 Brunei 28467 A 5 5
194 Brunei 28468 A 5 5
195 Brunei 28469 T 5 5
196 Brunei 28470 T 5 5
197 Brunei 28471 C 5 5
198 Brunei 28472 C 5 5
199 Brunei 28473 C 5 5
200 Brunei 28474 T 5 5
201 Brunei 28475 C 5 5
202 Brunei 28476 G 5 5
203 Brunei 28477 A 5 5
204 Brunei 28478 G 5 5
205 Brunei 28479 G 5 5
206 Brunei 28480 A 5 5
207 Brunei 28481 C 5 5
208 Brunei 28482 A 5 5
209 Brunei 28483 A 5 5
210 Brunei 28484 G 5 5
211 Brunei 28485 G 5 5
212 Brunei 28486 C 5 5
213 Brunei 28487 G 5 5
214 Brunei 28488 T 5 5
215 Brunei 28489 T 5 5
216 Brunei 28490 C 5 5
217 Brunei 28491 C 5 5
218 Brunei 28492 A 5 5
219 Brunei 28493 A 5 5
220 Brunei 28494 T 5 5
221 Brunei 28495 T 5 5
222 Brunei 28496 A 5 5
223 Brunei 28497 A 5 5
224 Brunei 28498 C 5 5
225 Brunei 28499 A 5 5
226 Brunei 28500 C 5 5
227 Brunei 28501 C 5 5
228 Brunei 28502 A 5 5
229 Brunei 28503 A 5 5
230 Brunei 28504 T 5 5
231 Brunei 28505 A 5 5
232 Brunei 28506 G 5 5
233 Brunei 28507 C 5 5
234 Brunei 28508 A 5 5
235 Brunei 28509 G 5 5
236 Brunei 28510 T 5 5
237 Brunei 28511 C 5 5
238 Brunei 28512 C 5 5
239 Brunei 28513 A 5 5
240 Brunei 28514 G 5 5
241 Brunei 28515 A 5 5
242 Brunei 28516 T 5 5
243 Brunei 28517 G 5 5
244 Brunei 28518 A 5 5
245 Brunei 28519 C 5 5
246 Brunei 28520 C 5 5
247 Brunei 28521 A 5 5
248 Brunei 28522 A 5 5
249 Brunei 28523 A 5 5
250 Brunei 28524 T 5 5
251 Brunei 28525 T 5 5
252 Brunei 28526 G 5 5
253 Brunei 28527 G 5 5
254 Brunei 28528 C 5 5
255 Brunei 28529 T 5 5
256 Brunei 28530 A 5 5
257 Brunei 28531 C 5 5
258 Brunei 28532 T 5 5
259 Brunei 28533 A 5 5
260 Brunei 28534 C 5 5
261 Brunei 28535 C 5 5
262 Brunei 28536 G 5 5
263 Brunei 28537 A 5 5
264 Brunei 28538 A 5 5
265 Brunei 28539 G 5 5
266 Brunei 28540 A 5 5
267 Brunei 28541 G 5 5
268 Brunei 28542 C 5 5
269 Brunei 28543 T 5 5
270 Brunei 28544 A 5 5
271 Brunei 28545 C 5 5
272 Brunei 28546 C 5 5
273 Brunei 28547 A 5 5
274 Brunei 28548 G 5 5
275 Brunei 28549 A 5 5
276 Brunei 28550 C 5 5
277 Brunei 28551 G 5 5
278 Brunei 28552 A 5 5
279 Brunei 28553 A 5 5
280 Brunei 28554 T 5 5
281 Brunei 28555 T 5 5
282 Brunei 28556 C 5 5
283 Brunei 28557 G 5 5
284 Brunei 28558 T 5 5
285 Brunei 28559 G 5 5
286 Brunei 28560 G 5 5
287 Brunei 28561 T 5 5
288 Brunei 28562 G 5 5
289 Brunei 28563 G 5 5
290 Brunei 28564 T 5 5
291 Brunei 28565 G 5 5
292 Brunei 28566 A 5 5
293 Brunei 28567 C 5 5
294 Brunei 28568 G 5 5
295 Brunei 28569 G 5 5
296 Brunei 28570 T 5 5
297 Brunei 28571 A 5 5
298 Brunei 28572 A 5 5
299 Brunei 28573 A 5 5
300 Brunei 28574 A 5 5
301 Brunei 28575 T 5 5
302 Brunei 28576 G 5 5
303 Brunei 28577 A 5 5
304 Brunei 28578 A 5 5
305 Brunei 28579 A 5 5
306 Brunei 28580 G 5 5
307 Brunei 28581 A 5 5
308 Brunei 28582 T 5 5
309 Brunei 28583 C 5 5
310 Brunei 28584 T 5 5
311 Brunei 28585 C 5 5
312 Brunei 28586 A 5 5
313 Brunei 28587 G 5 5
314 Brunei 28588 T 5 5
315 Brunei 28589 C 5 5
316 Brunei 28590 C 5 5
317 Brunei 28591 A 5 5
318 Brunei 28592 A 5 5
319 Brunei 28593 G 5 5
320 Brunei 28594 A 5 5
321 Brunei 28595 T 5 5
322 Brunei 28596 G 5 5
323 Brunei 28597 G 5 5
324 Brunei 28598 T 5 5
325 Brunei 28599 A 5 5
326 Brunei 28600 T 5 5
327 Brunei 28601 T 5 5
328 Brunei 28602 T 5 5
329 Brunei 28603 C 5 5
330 Brunei 28604 T 5 5
331 Brunei 28605 A 5 5
332 Brunei 28606 C 5 5
333 Brunei 28607 T 5 5
334 Brunei 28608 A 5 5
335 Brunei 28609 C 5 5
336 Brunei 28610 C 5 5
337 Brunei 28611 T 5 5
338 Brunei 28612 A 5 5
339 Brunei 28613 G 5 5
340 Brunei 28614 G 5 5
341 Brunei 28615 A 5 5
342 Brunei 28616 A 5 5
343 Brunei 28617 C 5 5
344 Brunei 28618 T 5 5
345 Brunei 28619 G 5 5
346 Brunei 28620 G 5 5
347 Brunei 28621 G 5 5
348 Brunei 28622 C 5 5
349 Brunei 28623 C 5 5
350 Brunei 28624 A 5 5
351 Brunei 28625 G 5 5
352 Brunei 28626 A 5 5
353 Brunei 28627 A 5 5
354 Brunei 28628 G 5 5
355 Brunei 28629 C 5 5
356 Brunei 28630 T 5 5
357 Brunei 28631 G 5 5
358 Brunei 28632 G 5 5
359 Brunei 28633 A 5 5
360 Brunei 28634 C 5 5
361 Brunei 28635 T 5 5
362 Brunei 28636 T 5 5
363 Brunei 28637 C 5 5
364 Brunei 28638 C 5 5
365 Brunei 28639 C 5 5
366 Brunei 28640 T 5 5
367 Brunei 28641 A 5 5
368 Brunei 28642 T 5 5
369 Brunei 28643 G 5 5
370 Brunei 28644 G 5 5
371 Brunei 28645 T 5 5
372 Brunei 28646 G 5 5
373 Brunei 28647 C 5 5
374 Brunei 28648 T 5 5
375 Brunei 28649 A 5 5
376 Brunei 28650 A 5 5
377 Brunei 28651 C 5 5
378 Brunei 28652 A 5 5
379 Brunei 28653 A 5 5
380 Brunei 28654 A 5 5
381 Brunei 28655 G 5 5
382 Brunei 28656 A 5 5
383 Brunei 28657 C 5 5
384 Brunei 28658 G 5 5
385 Brunei 28659 G 5 5
386 Brunei 28660 C 5 5
387 Brunei 28661 A 5 5
388 Brunei 28662 T 5 5
389 Brunei 28663 C 5 5
390 Brunei 28664 A 5 5
391 Brunei 28665 T 5 5
392 Brunei 28666 A 5 5
393 Brunei 28667 T 5 5
394 Brunei 28668 G 5 5
395 Brunei 28669 G 5 5
396 Brunei 28670 G 5 5
397 Brunei 28671 T 5 5
398 Brunei 28672 T 5 5
399 Brunei 28673 G 5 5
400 Brunei 28674 C 5 5
401 Brunei 28675 A 5 5
402 Brunei 28676 A 5 5
403 Brunei 28677 C 5 5
404 Brunei 28678 T 5 5
405 Brunei 28679 G 5 5
406 Brunei 28680 A 5 5
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408 Brunei 28682 G 5 5
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