National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   1,083                                      
?                                          
A   93                                      
D   54                                      
E   30                                      
F   33                                      
G   129                                      
H   12                                      
I   42                                      
K   66                                      
L   66                                      
M   18                                      
N   66                                      
P   69                 1           1        
Q   78                                      
R   84                                      
S   96                                      
T   78                                      
V   21                                      
W   15                                      
Y   33                                      

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 28274 A 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 28275 T 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 28276 G 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 28277 T 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 28278 C 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 28279 T 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 28280 G 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 28281 A 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 28282 T 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 28283 A 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 28284 A 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 28285 T 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 28286 G 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 28287 G 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 28288 A 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 28289 C 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 28290 C 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 28291 C 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 28292 C 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 28293 A 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 28294 A 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 28295 A 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 28296 A 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 28297 T 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 28298 C 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 28299 A 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 28300 G 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 28301 C 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 28302 G 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 28303 A 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 28304 A 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 28305 A 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 28306 T 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 28307 G 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 28308 C 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 28309 A 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 28310 C 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 28311 C 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 28312 C 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 28313 C 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 28314 G 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 28315 C 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 28316 A 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 28317 T 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 28318 T 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 28319 A 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 28320 C 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 28321 G 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 28322 T 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 28323 T 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 28324 T 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 28325 G 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 28326 G 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 28327 T 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 28328 G 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 28329 G 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 28330 A 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 28331 C 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 28332 C 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 28333 C 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 28334 T 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 28335 C 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 28336 A 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 28337 G 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 28338 A 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 28339 T 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 28340 T 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 28341 C 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 28342 A 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 28343 A 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 28344 C 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 28345 T 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 28346 G 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 28347 G 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 28348 C 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 28349 A 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 28350 G 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 28351 T 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 28352 A 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 28353 A 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 28354 C 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 28355 C 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 28356 A 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 28357 G 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 28358 A 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 28359 A 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 28360 T 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 28361 G 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 28362 G 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 28363 A 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 28364 G 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 28365 A 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 28366 A 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 28367 C 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 28368 G 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 28369 C 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 28370 A 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 28371 G 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 28372 T 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 28373 G 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 28374 G 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 28375 G 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 28376 G 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 28377 C 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 28378 G 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 28379 C 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 28380 G 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 28381 A 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 28382 T 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 28383 C 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 28384 A 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 28385 A 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 28386 A 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 28387 A 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 28388 C 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 28389 A 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 28390 A 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 28391 C 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 28392 G 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 28393 T 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 28394 C 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 28395 G 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 28396 G 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 28397 C 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 28398 C 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 28399 C 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 28400 C 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 28401 A 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 28402 A 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 28403 G 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 28404 G 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 28405 T 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 28406 T 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 28407 T 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 28408 A 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 28409 C 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 28410 C 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 28411 C 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 28412 A 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 28413 A 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 28414 T 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 28415 A 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 28416 A 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 28417 T 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 28418 A 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 28419 C 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 28420 T 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 28421 G 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 28422 C 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 28423 G 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 28424 T 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 28425 C 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 28426 T 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 28427 T 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 28428 G 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 28429 G 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 28430 T 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 28431 T 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 28432 C 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 28433 A 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 28434 C 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 28435 C 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 28436 G 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 28437 C 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 28438 T 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 28439 C 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 28440 T 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 28441 C 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 28442 A 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 28443 C 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 28444 T 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 28445 C 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 28446 A 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 28447 A 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 28448 C 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 28449 A 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 28450 T 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 28451 G 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 28452 G 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 28453 C 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 28454 A 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 28455 A 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 28456 G 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 28457 G 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 28458 A 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 28459 A 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 28460 G 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 28461 A 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 28462 C 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 28463 C 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 28464 T 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 28465 T 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 28466 A 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 28467 A 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 28468 A 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 28469 T 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 28470 T 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 28471 C 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 28472 C T 1 0 Pro67Ser
199 Antigua_and_Barbuda 28473 C 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 28474 T 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 28475 C 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 28476 G 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 28477 A 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 28478 G 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 28479 G 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 28480 A 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 28481 C 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 28482 A 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 28483 A 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 28484 G 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 28485 G 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 28486 C 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 28487 G 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 28488 T 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 28489 T 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 28490 C 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 28491 C 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 28492 A 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 28493 A 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 28494 T 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 28495 T 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 28496 A 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 28497 A 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 28498 C 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 28499 A 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 28500 C 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 28501 C 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 28502 A 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 28503 A 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 28504 T 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 28505 A 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 28506 G 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 28507 C 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 28508 A 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 28509 G 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 28510 T 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 28511 C 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 28512 C 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 28513 A 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 28514 G 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 28515 A 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 28516 T 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 28517 G 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 28518 A 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 28519 C 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 28520 C 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 28521 A 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 28522 A 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 28523 A 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 28524 T 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 28525 T 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 28526 G 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 28527 G 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 28528 C 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 28529 T 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 28530 A 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 28531 C 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 28532 T 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 28533 A 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 28534 C 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 28535 C 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 28536 G 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 28537 A 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 28538 A 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 28539 G 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 28540 A 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 28541 G 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 28542 C 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 28543 T 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 28544 A 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 28545 C 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 28546 C 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 28547 A 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 28548 G 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 28549 A 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 28550 C 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 28551 G 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 28552 A 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 28553 A 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 28554 T 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 28555 T 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 28556 C 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 28557 G 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 28558 T 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 28559 G 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 28560 G 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 28561 T 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 28562 G 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 28563 G 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 28564 T 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 28565 G 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 28566 A 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 28567 C 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 28568 G 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 28569 G 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 28570 T 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 28571 A 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 28572 A 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 28573 A 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 28574 A 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 28575 T 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 28576 G 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 28577 A 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 28578 A 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 28579 A 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 28580 G 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 28581 A 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 28582 T 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 28583 C 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 28584 T 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 28585 C 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 28586 A 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 28587 G 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 28588 T 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 28589 C 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 28590 C 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 28591 A 1 1
318 Antigua_and_Barbuda 28592 A 1 1
319 Antigua_and_Barbuda 28593 G 1 1
320 Antigua_and_Barbuda 28594 A 1 1
321 Antigua_and_Barbuda 28595 T 1 1
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1025 Antigua_and_Barbuda 29299 A 1 1
1026 Antigua_and_Barbuda 29300 G 1 1
1027 Antigua_and_Barbuda 29301 A 1 1
1028 Antigua_and_Barbuda 29302 T 1 1
1029 Antigua_and_Barbuda 29303 C 1 1
1030 Antigua_and_Barbuda 29304 C 1 1
1031 Antigua_and_Barbuda 29305 A 1 1
1032 Antigua_and_Barbuda 29306 A 1 1
1033 Antigua_and_Barbuda 29307 A 1 1
1034 Antigua_and_Barbuda 29308 T 1 1
1035 Antigua_and_Barbuda 29309 T 1 1
1036 Antigua_and_Barbuda 29310 T 1 1
1037 Antigua_and_Barbuda 29311 C 1 1
1038 Antigua_and_Barbuda 29312 A 1 1
1039 Antigua_and_Barbuda 29313 A 1 1
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1041 Antigua_and_Barbuda 29315 G 1 1
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1081 Antigua_and_Barbuda 29355 A 1 1
1082 Antigua_and_Barbuda 29356 A 1 1