National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G I K L M N P Q R S T V W Y
-   339                                      
?                                          
A   30                                      
C   9                                      
D   18                                      
E   9                                      
F   12                                      
G   27                                      
I   6                                      
K   21                                      
L   45                                      
M   6                                      
N   21                                      
P   18                                      
Q   12                                      
R   18                                      
S   15                                      
T   36                                      
V   18                                      
W   3                                      
Y   15                                      

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 12686 A 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 12687 A 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 12688 T 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 12689 A 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 12690 A 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 12691 T 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 12692 G 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 12693 A 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 12694 G 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 12695 C 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 12696 T 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 12697 T 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 12698 A 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 12699 G 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 12700 T 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 12701 C 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 12702 C 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 12703 T 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 12704 G 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 12705 T 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 12706 T 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 12707 G 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 12708 C 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 12709 A 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 12710 C 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 12711 T 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 12712 A 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 12713 C 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 12714 G 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 12715 A 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 12716 C 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 12717 A 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 12718 G 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 12719 A 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 12720 T 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 12721 G 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 12722 T 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 12723 C 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 12724 T 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 12725 T 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 12726 G 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 12727 T 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 12728 G 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 12729 C 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 12730 T 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 12731 G 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 12732 C 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 12733 C 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 12734 G 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 12735 G 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 12736 T 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 12737 A 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 12738 C 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 12739 T 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 12740 A 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 12741 C 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 12742 A 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 12743 C 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 12744 A 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 12745 A 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 12746 A 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 12747 C 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 12748 T 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 12749 G 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 12750 C 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 12751 T 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 12752 T 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 12753 G 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 12754 C 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 12755 A 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 12756 C 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 12757 T 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 12758 G 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 12759 A 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 12760 T 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 12761 G 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 12762 A 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 12763 C 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 12764 A 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 12765 A 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 12766 T 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 12767 G 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 12768 C 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 12769 G 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 12770 T 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 12771 T 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 12772 A 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 12773 G 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 12774 C 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 12775 T 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 12776 T 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 12777 A 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 12778 C 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 12779 T 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 12780 A 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 12781 C 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 12782 A 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 12783 A 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 12784 C 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 12785 A 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 12786 C 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 12787 A 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 12788 A 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 12789 C 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 12790 A 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 12791 A 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 12792 A 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 12793 G 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 12794 G 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 12795 G 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 12796 A 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 12797 G 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 12798 G 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 12799 T 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 12800 A 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 12801 G 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 12802 G 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 12803 T 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 12804 T 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 12805 T 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 12806 G 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 12807 T 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 12808 A 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 12809 C 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 12810 T 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 12811 T 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 12812 G 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 12813 C 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 12814 A 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 12815 C 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 12816 T 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 12817 G 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 12818 T 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 12819 T 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 12820 A 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 12821 T 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 12822 C 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 12823 C 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 12824 G 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 12825 A 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 12826 T 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 12827 T 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 12828 T 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 12829 A 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 12830 C 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 12831 A 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 12832 G 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 12833 G 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 12834 A 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 12835 T 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 12836 T 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 12837 T 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 12838 G 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 12839 A 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 12840 A 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 12841 A 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 12842 T 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 12843 G 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 12844 G 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 12845 G 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 12846 C 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 12847 T 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 12848 A 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 12849 G 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 12850 A 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 12851 T 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 12852 T 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 12853 C 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 12854 C 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 12855 C 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 12856 T 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 12857 A 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 12858 A 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 12859 G 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 12860 A 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 12861 G 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 12862 T 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 12863 G 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 12864 A 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 12865 T 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 12866 G 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 12867 G 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 12868 A 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 12869 A 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 12870 C 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 12871 T 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 12872 G 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 12873 G 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 12874 T 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 12875 A 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 12876 C 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 12877 T 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 12878 A 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 12879 T 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 12880 C 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 12881 T 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 12882 A 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 12883 T 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 12884 A 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 12885 C 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 12886 A 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 12887 G 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 12888 A 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 12889 A 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 12890 C 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 12891 T 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 12892 G 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 12893 G 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 12894 A 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 12895 A 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 12896 C 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 12897 C 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 12898 A 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 12899 C 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 12900 C 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 12901 T 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 12902 T 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 12903 G 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 12904 T 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 12905 A 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 12906 G 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 12907 G 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 12908 T 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 12909 T 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 12910 T 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 12911 G 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 12912 T 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 12913 T 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 12914 A 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 12915 C 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 12916 A 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 12917 G 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 12918 A 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 12919 C 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 12920 A 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 12921 C 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 12922 A 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 12923 C 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 12924 C 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 12925 T 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 12926 A 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 12927 A 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 12928 A 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 12929 G 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 12930 G 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 12931 T 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 12932 C 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 12933 C 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 12934 T 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 12935 A 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 12936 A 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 12937 A 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 12938 G 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 12939 T 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 12940 G 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 12941 A 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 12942 A 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 12943 G 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 12944 T 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 12945 A 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 12946 T 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 12947 T 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 12948 T 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 12949 A 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 12950 T 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 12951 A 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 12952 C 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 12953 T 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 12954 T 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 12955 T 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 12956 A 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 12957 T 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 12958 T 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 12959 A 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 12960 A 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 12961 A 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 12962 G 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 12963 G 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 12964 A 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 12965 T 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 12966 T 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 12967 A 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 12968 A 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 12969 A 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 12970 C 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 12971 A 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 12972 A 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 12973 C 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 12974 C 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 12975 T 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 12976 A 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 12977 A 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 12978 A 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 12979 T 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 12980 A 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 12981 G 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 12982 A 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 12983 G 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 12984 G 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 12985 T 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 12986 A 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 12987 T 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 12988 G 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 12989 G 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 12990 T 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 12991 A 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 12992 C 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 12993 T 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 12994 T 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 12995 G 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 12996 G 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 12997 T 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 12998 A 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 12999 G 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 13000 T 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 13001 T 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 13002 T 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 13003 A 1 1
318 Antigua_and_Barbuda 13004 G 1 1
319 Antigua_and_Barbuda 13005 C 1 1
320 Antigua_and_Barbuda 13006 T 1 1
321 Antigua_and_Barbuda 13007 G 1 1
322 Antigua_and_Barbuda 13008 C 1 1
323 Antigua_and_Barbuda 13009 C 1 1
324 Antigua_and_Barbuda 13010 A 1 1
325 Antigua_and_Barbuda 13011 C 1 1
326 Antigua_and_Barbuda 13012 A 1 1
327 Antigua_and_Barbuda 13013 G 1 1
328 Antigua_and_Barbuda 13014 T 1 1
329 Antigua_and_Barbuda 13015 A 1 1
330 Antigua_and_Barbuda 13016 C 1 1
331 Antigua_and_Barbuda 13017 G 1 1
332 Antigua_and_Barbuda 13018 T 1 1
333 Antigua_and_Barbuda 13019 C 1 1
334 Antigua_and_Barbuda 13020 T 1 1
335 Antigua_and_Barbuda 13021 A 1 1
336 Antigua_and_Barbuda 13022 C 1 1
337 Antigua_and_Barbuda 13023 A 1 1
338 Antigua_and_Barbuda 13024 A 1 1