National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.

Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G I K L M N P Q R S T V W Y
-   594                                      
?                                          
A   84                               1      
C   6                                      
D   39                                      
E   27                                      
F   15                                      
G   9                                      
I   30                                      
K   45                                      
L   54         1                            
M   27                                      
N   39                     1                
P   18                             1        
Q   33                                      
R   21                                      
S   45                                      
T   39                                      
V   39                                      
W   6                                      
Y   18                                      

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide

Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Thailand 12092 G 491 491
1 Thailand 12093 C 491 491
2 Thailand 12094 T 491 491
3 Thailand 12095 A 491 491
4 Thailand 12096 T 491 491
5 Thailand 12097 A 491 491
6 Thailand 12098 G 491 491
7 Thailand 12099 C 491 491
8 Thailand 12100 C 491 491
9 Thailand 12101 T 491 491
10 Thailand 12102 C 491 491
11 Thailand 12103 A 491 491
12 Thailand 12104 G 491 491
13 Thailand 12105 A 491 491
14 Thailand 12106 G 491 491
15 Thailand 12107 T 491 491
16 Thailand 12108 T 491 491
17 Thailand 12109 T 491 491
18 Thailand 12110 A 491 491
19 Thailand 12111 G 491 491
20 Thailand 12112 T 491 491
21 Thailand 12113 T 491 491
22 Thailand 12114 C 491 491
23 Thailand 12115 C 491 491
24 Thailand 12116 C 491 491
25 Thailand 12117 T 491 491
26 Thailand 12118 T 491 491
27 Thailand 12119 C T 491 490 Pro3952Ser
28 Thailand 12120 C 491 491
29 Thailand 12121 A 491 491
30 Thailand 12122 T 491 491
31 Thailand 12123 C 491 491
32 Thailand 12124 A 491 491
33 Thailand 12125 T 491 491
34 Thailand 12126 A 491 491
35 Thailand 12127 T 491 491
36 Thailand 12128 G 491 491
37 Thailand 12129 C 491 491
38 Thailand 12130 A 491 491
39 Thailand 12131 G 491 491
40 Thailand 12132 C 491 491
41 Thailand 12133 T 491 491
42 Thailand 12134 T 491 491
43 Thailand 12135 T 491 491
44 Thailand 12136 T 491 491
45 Thailand 12137 G 491 491
46 Thailand 12138 C 491 491
47 Thailand 12139 T 491 491
48 Thailand 12140 A 491 491
49 Thailand 12141 C 491 491
50 Thailand 12142 T 491 491
51 Thailand 12143 G 491 491
52 Thailand 12144 C 491 491
53 Thailand 12145 T 491 491
54 Thailand 12146 C 491 491
55 Thailand 12147 A 491 491
56 Thailand 12148 A 491 491
57 Thailand 12149 G 491 491
58 Thailand 12150 A 491 491
59 Thailand 12151 A 491 491
60 Thailand 12152 G 491 491
61 Thailand 12153 C 491 491
62 Thailand 12154 T 491 491
63 Thailand 12155 T 491 491
64 Thailand 12156 A 491 491
65 Thailand 12157 T 491 491
66 Thailand 12158 G 491 491
67 Thailand 12159 A 491 491
68 Thailand 12160 G 491 491
69 Thailand 12161 C 491 491
70 Thailand 12162 A 491 491
71 Thailand 12163 G 491 491
72 Thailand 12164 G 491 491
73 Thailand 12165 C 491 491
74 Thailand 12166 T 491 491
75 Thailand 12167 G 491 491
76 Thailand 12168 T 491 491
77 Thailand 12169 T 491 491
78 Thailand 12170 G 491 491
79 Thailand 12171 C 491 491
80 Thailand 12172 T 491 491
81 Thailand 12173 A 491 491
82 Thailand 12174 A 491 491
83 Thailand 12175 T 491 491
84 Thailand 12176 G 491 491
85 Thailand 12177 G 491 491
86 Thailand 12178 T 491 491
87 Thailand 12179 G 491 491
88 Thailand 12180 A 491 491
89 Thailand 12181 T 491 491
90 Thailand 12182 T 491 491
91 Thailand 12183 C 491 491
92 Thailand 12184 T 491 491
93 Thailand 12185 G 491 491
94 Thailand 12186 A 491 491
95 Thailand 12187 A 491 491
96 Thailand 12188 G 491 491
97 Thailand 12189 T 491 491
98 Thailand 12190 T 491 491
99 Thailand 12191 G 491 490
100 Thailand 12192 T 491 491
101 Thailand 12193 T 491 491
102 Thailand 12194 C T 491 490 Leu3977Phe
103 Thailand 12195 T 491 491
104 Thailand 12196 T 491 491
105 Thailand 12197 A 491 491
106 Thailand 12198 A 491 491
107 Thailand 12199 A 491 491
108 Thailand 12200 A 491 491
109 Thailand 12201 A 491 491
110 Thailand 12202 G 491 491
111 Thailand 12203 T 491 491
112 Thailand 12204 T 491 491
113 Thailand 12205 G 491 491
114 Thailand 12206 A 491 491
115 Thailand 12207 A 491 491
116 Thailand 12208 G 491 491
117 Thailand 12209 A 491 491
118 Thailand 12210 A 491 491
119 Thailand 12211 G 491 491
120 Thailand 12212 T 491 491
121 Thailand 12213 C 491 491
122 Thailand 12214 T 491 491
123 Thailand 12215 T 491 491
124 Thailand 12216 T 491 491
125 Thailand 12217 G 491 491
126 Thailand 12218 A 491 491
127 Thailand 12219 A 491 491
128 Thailand 12220 T 491 491
129 Thailand 12221 G 491 491
130 Thailand 12222 T 491 491
131 Thailand 12223 G 491 491
132 Thailand 12224 G 491 491
133 Thailand 12225 C 491 491
134 Thailand 12226 T 491 491
135 Thailand 12227 A 491 491
136 Thailand 12228 A 491 491
137 Thailand 12229 A 491 491
138 Thailand 12230 T 491 491
139 Thailand 12231 C 491 491
140 Thailand 12232 T 491 491
141 Thailand 12233 G 491 491
142 Thailand 12234 A 491 491
143 Thailand 12235 A 491 491
144 Thailand 12236 T 491 491
145 Thailand 12237 T 491 491
146 Thailand 12238 T 491 491
147 Thailand 12239 G 491 491
148 Thailand 12240 A 491 491
149 Thailand 12241 C 491 491
150 Thailand 12242 C 491 491
151 Thailand 12243 G 491 491
152 Thailand 12244 T 491 491
153 Thailand 12245 G 491 491
154 Thailand 12246 A 491 491
155 Thailand 12247 T 491 491
156 Thailand 12248 G 491 491
157 Thailand 12249 C 491 491
158 Thailand 12250 A 491 491
159 Thailand 12251 G 491 491
160 Thailand 12252 C 491 491
161 Thailand 12253 C 491 491
162 Thailand 12254 A 491 491
163 Thailand 12255 T 491 491
164 Thailand 12256 G 491 491
165 Thailand 12257 C 491 491
166 Thailand 12258 A 491 491
167 Thailand 12259 A 491 491
168 Thailand 12260 C 491 491
169 Thailand 12261 G 491 491
170 Thailand 12262 T 491 491
171 Thailand 12263 A 491 491
172 Thailand 12264 A 491 491
173 Thailand 12265 G 491 491
174 Thailand 12266 T 491 491
175 Thailand 12267 T 491 491
176 Thailand 12268 G 491 491
177 Thailand 12269 G 491 491
178 Thailand 12270 A 491 491
179 Thailand 12271 A 491 491
180 Thailand 12272 A 491 491
181 Thailand 12273 A 491 491
182 Thailand 12274 G 491 491
183 Thailand 12275 A 491 491
184 Thailand 12276 T 491 491
185 Thailand 12277 G 491 491
186 Thailand 12278 G 491 491
187 Thailand 12279 C 491 491
188 Thailand 12280 T 491 491
189 Thailand 12281 G 491 491
190 Thailand 12282 A 491 491
191 Thailand 12283 T 491 491
192 Thailand 12284 C 491 491
193 Thailand 12285 A 491 491
194 Thailand 12286 A 491 491
195 Thailand 12287 G 491 491
196 Thailand 12288 C 491 491
197 Thailand 12289 T 491 491
198 Thailand 12290 A 491 491
199 Thailand 12291 T 491 491
200 Thailand 12292 G 491 491
201 Thailand 12293 A 491 491
202 Thailand 12294 C 491 491
203 Thailand 12295 C 491 491
204 Thailand 12296 C 491 491
205 Thailand 12297 A 491 491
206 Thailand 12298 A 491 491
207 Thailand 12299 A 491 491
208 Thailand 12300 T 491 491
209 Thailand 12301 G 491 491
210 Thailand 12302 T 491 491
211 Thailand 12303 A 491 491
212 Thailand 12304 T 491 491
213 Thailand 12305 A 491 491
214 Thailand 12306 A 491 491
215 Thailand 12307 A 491 491
216 Thailand 12308 C 491 491
217 Thailand 12309 A 491 491
218 Thailand 12310 G 491 491
219 Thailand 12311 G 491 491
220 Thailand 12312 C 491 491
221 Thailand 12313 T 491 491
222 Thailand 12314 A 491 491
223 Thailand 12315 G 491 491
224 Thailand 12316 A 491 491
225 Thailand 12317 T 491 491
226 Thailand 12318 C 491 491
227 Thailand 12319 T 491 491
228 Thailand 12320 G 491 491
229 Thailand 12321 A 491 491
230 Thailand 12322 G 491 491
231 Thailand 12323 G 491 491
232 Thailand 12324 A 491 491
233 Thailand 12325 C 491 491
234 Thailand 12326 A 491 491
235 Thailand 12327 A 491 491
236 Thailand 12328 G 491 491
237 Thailand 12329 A 491 491
238 Thailand 12330 G 491 491
239 Thailand 12331 G 491 491
240 Thailand 12332 G 491 491
241 Thailand 12333 C 491 491
242 Thailand 12334 A 491 491
243 Thailand 12335 A 491 491
244 Thailand 12336 A 491 491
245 Thailand 12337 A 491 491
246 Thailand 12338 G 491 491
247 Thailand 12339 T 491 491
248 Thailand 12340 T 491 491
249 Thailand 12341 A 491 491
250 Thailand 12342 C 491 491
251 Thailand 12343 T 491 491
252 Thailand 12344 A 491 491
253 Thailand 12345 G 491 491
254 Thailand 12346 T 491 491
255 Thailand 12347 G 491 491
256 Thailand 12348 C 491 491
257 Thailand 12349 T 491 491
258 Thailand 12350 A 491 491
259 Thailand 12351 T 491 491
260 Thailand 12352 G 491 491
261 Thailand 12353 C 491 491
262 Thailand 12354 A 491 491
263 Thailand 12355 G 491 491
264 Thailand 12356 A 491 491
265 Thailand 12357 C 491 491
266 Thailand 12358 A 491 491
267 Thailand 12359 A 491 491
268 Thailand 12360 T 491 491
269 Thailand 12361 G 491 491
270 Thailand 12362 C 491 491
271 Thailand 12363 T 491 491
272 Thailand 12364 T 491 491
273 Thailand 12365 T 491 491
274 Thailand 12366 T 491 491
275 Thailand 12367 C 491 491
276 Thailand 12368 A 491 491
277 Thailand 12369 C 491 491
278 Thailand 12370 T 491 491
279 Thailand 12371 A 491 491
280 Thailand 12372 T 491 491
281 Thailand 12373 G 491 491
282 Thailand 12374 C 491 491
283 Thailand 12375 T 491 491
284 Thailand 12376 T 491 491
285 Thailand 12377 A 491 491
286 Thailand 12378 G 491 491
287 Thailand 12379 A 491 491
288 Thailand 12380 A 491 491
289 Thailand 12381 A 491 491
290 Thailand 12382 G 491 491
291 Thailand 12383 T 491 491
292 Thailand 12384 T 491 491
293 Thailand 12385 G 491 491
294 Thailand 12386 G 491 491
295 Thailand 12387 A 491 491
296 Thailand 12388 T 491 491
297 Thailand 12389 A 491 491
298 Thailand 12390 A 491 491
299 Thailand 12391 T 491 491
300 Thailand 12392 G 491 491
301 Thailand 12393 A 491 491
302 Thailand 12394 T 491 491
303 Thailand 12395 G 491 491
304 Thailand 12396 C 491 491
305 Thailand 12397 A 491 491
306 Thailand 12398 C 491 491
307 Thailand 12399 T 491 491
308 Thailand 12400 C 491 491
309 Thailand 12401 A 491 491
310 Thailand 12402 A 491 491
311 Thailand 12403 C 491 491
312 Thailand 12404 A 491 491
313 Thailand 12405 A 491 491
314 Thailand 12406 C 491 491
315 Thailand 12407 A 491 491
316 Thailand 12408 T 491 491
317 Thailand 12409 T 491 491
318 Thailand 12410 A 491 491
319 Thailand 12411 T 491 491
320 Thailand 12412 C 491 491
321 Thailand 12413 A 491 491
322 Thailand 12414 A 491 491
323 Thailand 12415 C 491 491
324 Thailand 12416 A 491 491
325 Thailand 12417 A 491 491
326 Thailand 12418 T 491 491
327 Thailand 12419 G 491 491
328 Thailand 12420 C 491 491
329 Thailand 12421 A 491 491
330 Thailand 12422 A 491 491
331 Thailand 12423 G 491 491
332 Thailand 12424 A 491 491
333 Thailand 12425 G 491 491
334 Thailand 12426 A 491 491
335 Thailand 12427 T 491 491
336 Thailand 12428 G 491 491
337 Thailand 12429 G 491 491
338 Thailand 12430 T 491 491
339 Thailand 12431 T 491 491
340 Thailand 12432 G 491 491
341 Thailand 12433 T 491 491
342 Thailand 12434 G 491 491
343 Thailand 12435 T 491 491
344 Thailand 12436 T 491 491
345 Thailand 12437 C 491 491
346 Thailand 12438 C 491 491
347 Thailand 12439 C 491 491
348 Thailand 12440 T 491 491
349 Thailand 12441 T 491 491
350 Thailand 12442 G 491 491
351 Thailand 12443 A 491 491
352 Thailand 12444 A 491 491
353 Thailand 12445 C 491 491
354 Thailand 12446 A 491 491
355 Thailand 12447 T 491 491
356 Thailand 12448 A 491 491
357 Thailand 12449 A 491 491
358 Thailand 12450 T 491 491
359 Thailand 12451 A 491 491
360 Thailand 12452 C 491 491
361 Thailand 12453 C 491 491
362 Thailand 12454 T 491 491
363 Thailand 12455 C 491 491
364 Thailand 12456 T 491 491
365 Thailand 12457 T 491 491
366 Thailand 12458 A 491 491
367 Thailand 12459 C 491 491
368 Thailand 12460 A 491 491
369 Thailand 12461 A 491 491
370 Thailand 12462 C 491 491
371 Thailand 12463 A 491 491
372 Thailand 12464 G A 491 490 Ala4067Thr
373 Thailand 12465 C 491 491
374 Thailand 12466 A 491 491
375 Thailand 12467 G 491 491
376 Thailand 12468 C 491 491
377 Thailand 12469 C 491 491
378 Thailand 12470 A 491 491
379 Thailand 12471 A 491 491
380 Thailand 12472 A 491 491
381 Thailand 12473 C 491 491
382 Thailand 12474 T 491 491
383 Thailand 12475 A 491 491
384 Thailand 12476 A 491 491
385 Thailand 12477 T 491 491
386 Thailand 12478 G 491 491
387 Thailand 12479 G 491 491
388 Thailand 12480 T 491 491
389 Thailand 12481 T 491 491
390 Thailand 12482 G 491 491
391 Thailand 12483 T 491 491
392 Thailand 12484 C 491 491
393 Thailand 12485 A 491 491
394 Thailand 12486 T 491 491
395 Thailand 12487 A 491 491
396 Thailand 12488 C 491 491
397 Thailand 12489 C 491 491
398 Thailand 12490 A 491 491
399 Thailand 12491 G 491 491
400 Thailand 12492 A 491 491
401 Thailand 12493 C 491 491
402 Thailand 12494 T 491 491
403 Thailand 12495 A 491 491
404 Thailand 12496 T 491 491
405 Thailand 12497 A 491 491
406 Thailand 12498 A 491 491
407 Thailand 12499 C 491 491
408 Thailand 12500 A 491 491
409 Thailand 12501 C 491 491
410 Thailand 12502 A 491 491
411 Thailand 12503 T 491 491
412 Thailand 12504 A 491 491
413 Thailand 12505 T 491 491
414 Thailand 12506 A 491 490
415 Thailand 12507 A 491 491
416 Thailand 12508 A 491 491
417 Thailand 12509 A 491 491
418 Thailand 12510 A 491 491
419 Thailand 12511 T 491 491
420 Thailand 12512 A 491 491
421 Thailand 12513 C 491 491
422 Thailand 12514 G 491 491
423 Thailand 12515 T 491 491
424 Thailand 12516 G 491 491
425 Thailand 12517 T 491 491
426 Thailand 12518 G 491 491
427 Thailand 12519 A 491 491
428 Thailand 12520 T 491 491
429 Thailand 12521 G 491 491
430 Thailand 12522 G 491 491
431 Thailand 12523 T 491 491
432 Thailand 12524 A 491 491
433 Thailand 12525 C 491 491
434 Thailand 12526 A 491 491
435 Thailand 12527 A 491 491
436 Thailand 12528 C 491 491
437 Thailand 12529 A 491 491
438 Thailand 12530 T 491 491
439 Thailand 12531 T 491 491
440 Thailand 12532 T 491 491
441 Thailand 12533 A 491 491
442 Thailand 12534 C 491 491
443 Thailand 12535 T 491 491
444 Thailand 12536 T 491 491
445 Thailand 12537 A 491 491
446 Thailand 12538 T 491 491
447 Thailand 12539 G 491 491
448 Thailand 12540 C 491 491
449 Thailand 12541 A 491 491
450 Thailand 12542 T 491 491
451 Thailand 12543 C 491 491
452 Thailand 12544 A 491 491
453 Thailand 12545 G 491 491
454 Thailand 12546 C 491 491
455 Thailand 12547 A 491 491
456 Thailand 12548 T 491 491
457 Thailand 12549 T 491 491
458 Thailand 12550 G 491 491
459 Thailand 12551 T 491 491
460 Thailand 12552 G 491 491
461 Thailand 12553 G 491 491
462 Thailand 12554 G 491 491
463 Thailand 12555 A 491 491
464 Thailand 12556 A 491 491
465 Thailand 12557 A 491 491
466 Thailand 12558 T 491 491
467 Thailand 12559 C 491 491
468 Thailand 12560 C 491 491
469 Thailand 12561 A 491 491
470 Thailand 12562 A 491 491
471 Thailand 12563 C 491 491
472 Thailand 12564 A 491 491
473 Thailand 12565 G 491 491
474 Thailand 12566 G 491 491
475 Thailand 12567 T 491 491
476 Thailand 12568 T 491 491
477 Thailand 12569 G 491 491
478 Thailand 12570 T 491 491
479 Thailand 12571 A 491 491
480 Thailand 12572 G 491 491
481 Thailand 12573 A 491 491
482 Thailand 12574 T 491 491
483 Thailand 12575 G 491 491
484 Thailand 12576 C 491 491
485 Thailand 12577 A 491 490
486 Thailand 12578 G 491 490
487 Thailand 12579 A 491 491
488 Thailand 12580 T 491 491
489 Thailand 12581 A 491 491
490 Thailand 12582 G 491 491
491 Thailand 12583 T 491 491
492 Thailand 12584 A 491 491
493 Thailand 12585 A 491 491
494 Thailand 12586 A 491 491
495 Thailand 12587 A 491 491
496 Thailand 12588 T 491 491
497 Thailand 12589 T 491 491
498 Thailand 12590 G 491 491
499 Thailand 12591 T 491 491
500 Thailand 12592 T 491 491
501 Thailand 12593 C 491 491
502 Thailand 12594 A 491 491
503 Thailand 12595 A 491 491
504 Thailand 12596 C 491 491
505 Thailand 12597 T 491 491
506 Thailand 12598 T 491 491
507 Thailand 12599 A 491 491
508 Thailand 12600 G 491 491
509 Thailand 12601 T 491 491
510 Thailand 12602 G 491 491
511 Thailand 12603 A 491 491
512 Thailand 12604 A 491 491
513 Thailand 12605 A 491 491
514 Thailand 12606 T 491 491
515 Thailand 12607 T 491 491
516 Thailand 12608 A 491 491
517 Thailand 12609 G 491 491
518 Thailand 12610 T 491 491
519 Thailand 12611 A 491 491
520 Thailand 12612 T 491 491
521 Thailand 12613 G 491 491
522 Thailand 12614 G 491 491
523 Thailand 12615 A 491 491
524 Thailand 12616 C 491 491
525 Thailand 12617 A 491 491
526 Thailand 12618 A 491 491
527 Thailand 12619 T 491 491
528 Thailand 12620 T 491 491
529 Thailand 12621 C 491 491
530 Thailand 12622 A 491 491
531 Thailand 12623 C 491 491
532 Thailand 12624 C 491 491
533 Thailand 12625 T 491 491
534 Thailand 12626 A 491 491
535 Thailand 12627 A 491 491
536 Thailand 12628 T C 491 483 Asn4121Asn
537 Thailand 12629 T 491 491
538 Thailand 12630 T 491 491
539 Thailand 12631 A 491 491
540 Thailand 12632 G 491 491
541 Thailand 12633 C 491 491
542 Thailand 12634 A 491 491
543 Thailand 12635 T 491 491
544 Thailand 12636 G 491 491
545 Thailand 12637 G 491 491
546 Thailand 12638 C 491 491
547 Thailand 12639 C 491 491
548 Thailand 12640 T 491 491
549 Thailand 12641 C 491 491
550 Thailand 12642 T 491 491
551 Thailand 12643 T 491 491
552 Thailand 12644 A 491 491
553 Thailand 12645 T 491 491
554 Thailand 12646 T 491 491
555 Thailand 12647 G 491 491
556 Thailand 12648 T 491 491
557 Thailand 12649 A 491 491
558 Thailand 12650 A 491 491
559 Thailand 12651 C 491 491
560 Thailand 12652 A 491 491
561 Thailand 12653 G 491 491
562 Thailand 12654 C 491 491
563 Thailand 12655 T 491 491
564 Thailand 12656 T 491 491
565 Thailand 12657 T 491 491
566 Thailand 12658 A 491 491
567 Thailand 12659 A 491 491
568 Thailand 12660 G 491 491
569 Thailand 12661 G 491 491
570 Thailand 12662 G 491 491
571 Thailand 12663 C 491 491
572 Thailand 12664 C 491 491
573 Thailand 12665 A 491 491
574 Thailand 12666 A 491 491
575 Thailand 12667 T 491 491
576 Thailand 12668 T 491 491
577 Thailand 12669 C 491 491
578 Thailand 12670 T 491 491
579 Thailand 12671 G 491 491
580 Thailand 12672 C 491 491
581 Thailand 12673 T 491 491
582 Thailand 12674 G 491 491
583 Thailand 12675 T 491 491
584 Thailand 12676 C 491 491
585 Thailand 12677 A 491 491
586 Thailand 12678 A 491 491
587 Thailand 12679 A 491 491
588 Thailand 12680 T 491 491
589 Thailand 12681 T 491 491
590 Thailand 12682 A 491 491
591 Thailand 12683 C 491 491
592 Thailand 12684 A 491 491
593 Thailand 12685 G 490 490