National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.

Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G I K L M N P Q R S T V W Y
-   594                                      
?                                          
A   84                                      
C   6                                      
D   39                                      
E   27                                      
F   15                                      
G   9                                      
I   30             1                        
K   45                                      
L   54                 1                    
M   27                                      
N   39                                      
P   18                                      
Q   33                                      
R   21                                      
S   45                             1        
T   39                                      
V   39                                      
W   6                                      
Y   18                                      

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide

Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Senegal 12092 G 135 135
1 Senegal 12093 C 135 135
2 Senegal 12094 T 135 135
3 Senegal 12095 A 135 135
4 Senegal 12096 T 135 135
5 Senegal 12097 A 135 135
6 Senegal 12098 G 135 135
7 Senegal 12099 C 135 135
8 Senegal 12100 C 135 135
9 Senegal 12101 T 135 135
10 Senegal 12102 C 135 135
11 Senegal 12103 A 135 135
12 Senegal 12104 G 135 135
13 Senegal 12105 A 135 135
14 Senegal 12106 G 135 135
15 Senegal 12107 T 135 135
16 Senegal 12108 T 135 135
17 Senegal 12109 T 135 135
18 Senegal 12110 A 135 135
19 Senegal 12111 G 135 135
20 Senegal 12112 T 135 135
21 Senegal 12113 T 135 135
22 Senegal 12114 C 135 135
23 Senegal 12115 C T 135 133 Ser3950Ser
24 Senegal 12116 C 135 135
25 Senegal 12117 T 135 135
26 Senegal 12118 T 135 135
27 Senegal 12119 C 135 135
28 Senegal 12120 C 135 135
29 Senegal 12121 A 135 135
30 Senegal 12122 T 135 135
31 Senegal 12123 C 135 135
32 Senegal 12124 A 135 135
33 Senegal 12125 T 135 135
34 Senegal 12126 A 135 135
35 Senegal 12127 T 135 135
36 Senegal 12128 G 135 135
37 Senegal 12129 C 135 135
38 Senegal 12130 A 135 135
39 Senegal 12131 G 135 135
40 Senegal 12132 C 135 135
41 Senegal 12133 T 135 135
42 Senegal 12134 T 135 135
43 Senegal 12135 T 135 135
44 Senegal 12136 T 135 135
45 Senegal 12137 G 135 135
46 Senegal 12138 C 135 135
47 Senegal 12139 T 135 135
48 Senegal 12140 A 135 135
49 Senegal 12141 C 135 135
50 Senegal 12142 T 135 135
51 Senegal 12143 G 135 135
52 Senegal 12144 C 135 135
53 Senegal 12145 T 135 135
54 Senegal 12146 C 135 135
55 Senegal 12147 A 135 135
56 Senegal 12148 A 135 135
57 Senegal 12149 G 135 135
58 Senegal 12150 A 135 135
59 Senegal 12151 A 135 135
60 Senegal 12152 G 135 135
61 Senegal 12153 C 135 135
62 Senegal 12154 T 135 135
63 Senegal 12155 T 135 135
64 Senegal 12156 A 135 135
65 Senegal 12157 T 135 135
66 Senegal 12158 G 135 135
67 Senegal 12159 A 135 135
68 Senegal 12160 G 135 135
69 Senegal 12161 C 135 135
70 Senegal 12162 A 135 135
71 Senegal 12163 G 135 135
72 Senegal 12164 G 135 135
73 Senegal 12165 C 135 135
74 Senegal 12166 T 135 135
75 Senegal 12167 G 135 135
76 Senegal 12168 T 135 135
77 Senegal 12169 T 135 135
78 Senegal 12170 G 135 135
79 Senegal 12171 C 135 135
80 Senegal 12172 T 135 135
81 Senegal 12173 A 135 135
82 Senegal 12174 A 135 135
83 Senegal 12175 T 135 135
84 Senegal 12176 G 135 135
85 Senegal 12177 G 135 135
86 Senegal 12178 T 135 135
87 Senegal 12179 G 135 135
88 Senegal 12180 A 135 135
89 Senegal 12181 T 135 135
90 Senegal 12182 T 135 135
91 Senegal 12183 C 135 135
92 Senegal 12184 T 135 135
93 Senegal 12185 G 135 135
94 Senegal 12186 A 135 135
95 Senegal 12187 A 135 135
96 Senegal 12188 G 135 135
97 Senegal 12189 T 135 135
98 Senegal 12190 T 135 135
99 Senegal 12191 G 135 135
100 Senegal 12192 T 135 135
101 Senegal 12193 T 135 135
102 Senegal 12194 C 135 135
103 Senegal 12195 T 135 135
104 Senegal 12196 T 135 135
105 Senegal 12197 A 135 135
106 Senegal 12198 A 135 135
107 Senegal 12199 A 135 135
108 Senegal 12200 A 135 135
109 Senegal 12201 A 135 135
110 Senegal 12202 G 135 135
111 Senegal 12203 T 135 135
112 Senegal 12204 T 135 135
113 Senegal 12205 G 135 135
114 Senegal 12206 A 135 135
115 Senegal 12207 A 135 135
116 Senegal 12208 G 135 135
117 Senegal 12209 A 135 135
118 Senegal 12210 A 135 135
119 Senegal 12211 G 135 135
120 Senegal 12212 T 135 135
121 Senegal 12213 C 135 135
122 Senegal 12214 T 135 135
123 Senegal 12215 T 135 135
124 Senegal 12216 T 135 135
125 Senegal 12217 G 135 135
126 Senegal 12218 A 135 135
127 Senegal 12219 A 135 135
128 Senegal 12220 T 135 135
129 Senegal 12221 G 135 135
130 Senegal 12222 T 135 135
131 Senegal 12223 G 135 135
132 Senegal 12224 G 135 135
133 Senegal 12225 C 135 135
134 Senegal 12226 T 135 135
135 Senegal 12227 A 135 135
136 Senegal 12228 A 135 135
137 Senegal 12229 A 135 135
138 Senegal 12230 T 135 135
139 Senegal 12231 C 135 135
140 Senegal 12232 T 135 135
141 Senegal 12233 G 135 135
142 Senegal 12234 A 135 135
143 Senegal 12235 A 135 135
144 Senegal 12236 T 135 135
145 Senegal 12237 T 135 135
146 Senegal 12238 T 135 135
147 Senegal 12239 G 135 135
148 Senegal 12240 A 135 135
149 Senegal 12241 C 135 135
150 Senegal 12242 C 135 135
151 Senegal 12243 G 135 135
152 Senegal 12244 T 135 135
153 Senegal 12245 G 135 135
154 Senegal 12246 A 135 135
155 Senegal 12247 T 135 135
156 Senegal 12248 G 135 135
157 Senegal 12249 C 135 135
158 Senegal 12250 A 135 135
159 Senegal 12251 G 135 135
160 Senegal 12252 C 135 135
161 Senegal 12253 C 135 135
162 Senegal 12254 A 135 135
163 Senegal 12255 T 135 135
164 Senegal 12256 G 135 135
165 Senegal 12257 C 135 135
166 Senegal 12258 A 135 135
167 Senegal 12259 A 135 135
168 Senegal 12260 C 135 135
169 Senegal 12261 G 135 135
170 Senegal 12262 T 135 135
171 Senegal 12263 A 135 135
172 Senegal 12264 A 135 135
173 Senegal 12265 G 135 135
174 Senegal 12266 T 135 135
175 Senegal 12267 T 135 135
176 Senegal 12268 G 135 135
177 Senegal 12269 G 135 135
178 Senegal 12270 A 135 135
179 Senegal 12271 A 135 135
180 Senegal 12272 A 135 135
181 Senegal 12273 A 135 135
182 Senegal 12274 G 135 135
183 Senegal 12275 A 135 135
184 Senegal 12276 T 135 135
185 Senegal 12277 G 135 135
186 Senegal 12278 G 135 135
187 Senegal 12279 C 135 135
188 Senegal 12280 T 135 135
189 Senegal 12281 G 135 135
190 Senegal 12282 A 135 135
191 Senegal 12283 T 135 135
192 Senegal 12284 C 135 135
193 Senegal 12285 A 135 135
194 Senegal 12286 A 135 135
195 Senegal 12287 G 135 135
196 Senegal 12288 C 135 135
197 Senegal 12289 T 135 135
198 Senegal 12290 A 135 135
199 Senegal 12291 T 135 135
200 Senegal 12292 G 135 135
201 Senegal 12293 A 135 135
202 Senegal 12294 C 135 135
203 Senegal 12295 C 135 135
204 Senegal 12296 C 135 135
205 Senegal 12297 A 135 135
206 Senegal 12298 A 135 135
207 Senegal 12299 A 135 135
208 Senegal 12300 T 135 135
209 Senegal 12301 G 135 135
210 Senegal 12302 T 135 135
211 Senegal 12303 A 135 135
212 Senegal 12304 T 135 135
213 Senegal 12305 A 135 135
214 Senegal 12306 A 135 135
215 Senegal 12307 A 135 135
216 Senegal 12308 C 135 135
217 Senegal 12309 A 135 135
218 Senegal 12310 G 135 135
219 Senegal 12311 G 135 135
220 Senegal 12312 C 135 135
221 Senegal 12313 T 135 135
222 Senegal 12314 A 135 135
223 Senegal 12315 G 135 135
224 Senegal 12316 A 135 135
225 Senegal 12317 T 135 135
226 Senegal 12318 C 135 135
227 Senegal 12319 T 135 135
228 Senegal 12320 G 135 135
229 Senegal 12321 A 135 135
230 Senegal 12322 G 135 135
231 Senegal 12323 G 135 135
232 Senegal 12324 A 135 135
233 Senegal 12325 C 135 135
234 Senegal 12326 A 135 135
235 Senegal 12327 A 135 135
236 Senegal 12328 G 135 135
237 Senegal 12329 A 135 135
238 Senegal 12330 G 135 135
239 Senegal 12331 G 135 135
240 Senegal 12332 G 135 135
241 Senegal 12333 C 135 135
242 Senegal 12334 A 135 135
243 Senegal 12335 A 135 135
244 Senegal 12336 A 135 135
245 Senegal 12337 A 135 135
246 Senegal 12338 G 135 135
247 Senegal 12339 T 136 136
248 Senegal 12340 T 136 136
249 Senegal 12341 A 136 136
250 Senegal 12342 C 136 136
251 Senegal 12343 T 136 136
252 Senegal 12344 A 136 136
253 Senegal 12345 G 136 136
254 Senegal 12346 T 136 136
255 Senegal 12347 G 136 135
256 Senegal 12348 C 136 136
257 Senegal 12349 T 136 136
258 Senegal 12350 A 136 135
259 Senegal 12351 T 136 136
260 Senegal 12352 G 136 136
261 Senegal 12353 C 136 135
262 Senegal 12354 A 136 135
263 Senegal 12355 G 136 135
264 Senegal 12356 A 136 135
265 Senegal 12357 C 136 135
266 Senegal 12358 A 136 135
267 Senegal 12359 A 136 135
268 Senegal 12360 T 136 135
269 Senegal 12361 G 136 136
270 Senegal 12362 C 136 136
271 Senegal 12363 T 136 136
272 Senegal 12364 T 136 136
273 Senegal 12365 T 136 136
274 Senegal 12366 T 136 136
275 Senegal 12367 C 136 136
276 Senegal 12368 A 136 136
277 Senegal 12369 C 136 136
278 Senegal 12370 T 136 136
279 Senegal 12371 A 136 136
280 Senegal 12372 T 136 136
281 Senegal 12373 G 136 136
282 Senegal 12374 C 136 136
283 Senegal 12375 T 136 136
284 Senegal 12376 T 136 136
285 Senegal 12377 A 136 136
286 Senegal 12378 G 136 136
287 Senegal 12379 A 136 136
288 Senegal 12380 A 136 136
289 Senegal 12381 A 136 136
290 Senegal 12382 G 136 136
291 Senegal 12383 T 136 136
292 Senegal 12384 T 136 136
293 Senegal 12385 G 136 136
294 Senegal 12386 G 136 136
295 Senegal 12387 A 136 136
296 Senegal 12388 T 136 136
297 Senegal 12389 A 136 136
298 Senegal 12390 A 136 136
299 Senegal 12391 T 136 136
300 Senegal 12392 G 136 136
301 Senegal 12393 A 136 136
302 Senegal 12394 T 136 136
303 Senegal 12395 G 136 136
304 Senegal 12396 C 136 136
305 Senegal 12397 A 136 136
306 Senegal 12398 C 136 136
307 Senegal 12399 T 136 136
308 Senegal 12400 C 136 136
309 Senegal 12401 A 136 136
310 Senegal 12402 A 136 136
311 Senegal 12403 C 136 136
312 Senegal 12404 A 136 136
313 Senegal 12405 A 136 136
314 Senegal 12406 C 136 135
315 Senegal 12407 A 136 135
316 Senegal 12408 T 136 135
317 Senegal 12409 T 136 135
318 Senegal 12410 A 136 135
319 Senegal 12411 T 136 135
320 Senegal 12412 C 136 135
321 Senegal 12413 A 136 135
322 Senegal 12414 A 136 135
323 Senegal 12415 C 136 135
324 Senegal 12416 A 136 135
325 Senegal 12417 A 136 135
326 Senegal 12418 T 136 136
327 Senegal 12419 G 136 136
328 Senegal 12420 C 136 136
329 Senegal 12421 A 136 136
330 Senegal 12422 A 136 136
331 Senegal 12423 G 136 136
332 Senegal 12424 A 136 136
333 Senegal 12425 G 136 136
334 Senegal 12426 A 136 136
335 Senegal 12427 T 136 136
336 Senegal 12428 G 136 136
337 Senegal 12429 G 136 136
338 Senegal 12430 T 136 136
339 Senegal 12431 T 136 136
340 Senegal 12432 G 136 136
341 Senegal 12433 T 136 136
342 Senegal 12434 G 136 136
343 Senegal 12435 T 136 136
344 Senegal 12436 T 136 136
345 Senegal 12437 C 136 136
346 Senegal 12438 C 136 136
347 Senegal 12439 C 136 136
348 Senegal 12440 T 136 136
349 Senegal 12441 T 136 136
350 Senegal 12442 G 136 136
351 Senegal 12443 A 136 136
352 Senegal 12444 A 136 136
353 Senegal 12445 C 136 136
354 Senegal 12446 A 136 136
355 Senegal 12447 T 136 136
356 Senegal 12448 A 136 136
357 Senegal 12449 A 136 136
358 Senegal 12450 T 136 136
359 Senegal 12451 A 136 136
360 Senegal 12452 C 136 136
361 Senegal 12453 C 136 136
362 Senegal 12454 T 136 136
363 Senegal 12455 C 136 136
364 Senegal 12456 T 136 136
365 Senegal 12457 T 136 136
366 Senegal 12458 A 136 136
367 Senegal 12459 C 136 136
368 Senegal 12460 A 136 136
369 Senegal 12461 A 136 136
370 Senegal 12462 C 136 136
371 Senegal 12463 A 136 136
372 Senegal 12464 G 136 136
373 Senegal 12465 C 136 136
374 Senegal 12466 A 136 136
375 Senegal 12467 G 136 136
376 Senegal 12468 C 136 136
377 Senegal 12469 C 136 136
378 Senegal 12470 A 136 136
379 Senegal 12471 A 136 136
380 Senegal 12472 A 136 136
381 Senegal 12473 C T 136 135 Leu4070Leu
382 Senegal 12474 T 136 136
383 Senegal 12475 A 136 136
384 Senegal 12476 A 136 136
385 Senegal 12477 T 136 136
386 Senegal 12478 G 136 136
387 Senegal 12479 G 136 136
388 Senegal 12480 T 135 135
389 Senegal 12481 T 135 135
390 Senegal 12482 G 135 135
391 Senegal 12483 T 135 135
392 Senegal 12484 C 135 135
393 Senegal 12485 A 135 135
394 Senegal 12486 T 135 135
395 Senegal 12487 A 135 135
396 Senegal 12488 C 135 135
397 Senegal 12489 C 135 135
398 Senegal 12490 A 135 135
399 Senegal 12491 G 135 135
400 Senegal 12492 A 135 135
401 Senegal 12493 C 135 135
402 Senegal 12494 T 135 135
403 Senegal 12495 A 135 135
404 Senegal 12496 T 135 135
405 Senegal 12497 A 135 135
406 Senegal 12498 A 135 135
407 Senegal 12499 C 135 135
408 Senegal 12500 A 135 135
409 Senegal 12501 C 135 135
410 Senegal 12502 A 135 135
411 Senegal 12503 T 135 135
412 Senegal 12504 A 135 135
413 Senegal 12505 T 135 135
414 Senegal 12506 A 135 135
415 Senegal 12507 A 135 135
416 Senegal 12508 A 135 135
417 Senegal 12509 A 135 135
418 Senegal 12510 A 135 135
419 Senegal 12511 T 135 135
420 Senegal 12512 A 135 135
421 Senegal 12513 C 135 135
422 Senegal 12514 G 135 135
423 Senegal 12515 T 135 135
424 Senegal 12516 G 135 135
425 Senegal 12517 T 135 135
426 Senegal 12518 G 135 135
427 Senegal 12519 A 135 135
428 Senegal 12520 T 135 135
429 Senegal 12521 G 135 135
430 Senegal 12522 G 135 135
431 Senegal 12523 T 135 135
432 Senegal 12524 A 135 135
433 Senegal 12525 C 135 135
434 Senegal 12526 A 135 135
435 Senegal 12527 A 135 135
436 Senegal 12528 C 135 135
437 Senegal 12529 A 135 135
438 Senegal 12530 T 135 135
439 Senegal 12531 T 135 135
440 Senegal 12532 T 135 135
441 Senegal 12533 A 135 135
442 Senegal 12534 C 135 135
443 Senegal 12535 T 135 135
444 Senegal 12536 T 135 135
445 Senegal 12537 A 135 135
446 Senegal 12538 T 135 135
447 Senegal 12539 G 135 135
448 Senegal 12540 C 135 135
449 Senegal 12541 A 135 135
450 Senegal 12542 T 135 135
451 Senegal 12543 C 135 135
452 Senegal 12544 A 135 135
453 Senegal 12545 G 135 135
454 Senegal 12546 C 135 135
455 Senegal 12547 A 135 135
456 Senegal 12548 T 135 135
457 Senegal 12549 T 135 135
458 Senegal 12550 G 135 135
459 Senegal 12551 T 135 135
460 Senegal 12552 G 135 135
461 Senegal 12553 G 135 135
462 Senegal 12554 G 135 135
463 Senegal 12555 A 135 135
464 Senegal 12556 A 135 135
465 Senegal 12557 A 135 135
466 Senegal 12558 T 135 135
467 Senegal 12559 C T 135 134 Ile4098Ile
468 Senegal 12560 C 135 135
469 Senegal 12561 A 135 135
470 Senegal 12562 A 135 135
471 Senegal 12563 C 135 135
472 Senegal 12564 A 135 135
473 Senegal 12565 G 135 135
474 Senegal 12566 G 135 135
475 Senegal 12567 T 135 135
476 Senegal 12568 T 135 135
477 Senegal 12569 G 135 135
478 Senegal 12570 T 135 135
479 Senegal 12571 A 135 135
480 Senegal 12572 G 135 135
481 Senegal 12573 A 135 135
482 Senegal 12574 T 135 135
483 Senegal 12575 G 135 135
484 Senegal 12576 C 135 135
485 Senegal 12577 A 135 135
486 Senegal 12578 G 135 135
487 Senegal 12579 A 135 135
488 Senegal 12580 T 135 135
489 Senegal 12581 A 135 135
490 Senegal 12582 G 135 135
491 Senegal 12583 T 135 135
492 Senegal 12584 A 135 135
493 Senegal 12585 A 135 135
494 Senegal 12586 A 135 135
495 Senegal 12587 A 135 135
496 Senegal 12588 T 135 135
497 Senegal 12589 T 135 135
498 Senegal 12590 G 135 135
499 Senegal 12591 T 135 135
500 Senegal 12592 T 135 135
501 Senegal 12593 C 135 135
502 Senegal 12594 A 135 135
503 Senegal 12595 A 135 135
504 Senegal 12596 C 135 135
505 Senegal 12597 T 135 135
506 Senegal 12598 T 135 135
507 Senegal 12599 A 135 135
508 Senegal 12600 G 135 135
509 Senegal 12601 T 135 135
510 Senegal 12602 G 135 135
511 Senegal 12603 A 135 135
512 Senegal 12604 A 135 135
513 Senegal 12605 A 135 135
514 Senegal 12606 T 135 135
515 Senegal 12607 T 135 135
516 Senegal 12608 A 135 135
517 Senegal 12609 G 135 135
518 Senegal 12610 T 135 135
519 Senegal 12611 A 135 135
520 Senegal 12612 T 135 135
521 Senegal 12613 G 135 135
522 Senegal 12614 G 135 135
523 Senegal 12615 A 135 135
524 Senegal 12616 C 135 135
525 Senegal 12617 A 135 135
526 Senegal 12618 A 135 135
527 Senegal 12619 T 135 135
528 Senegal 12620 T 135 135
529 Senegal 12621 C 135 135
530 Senegal 12622 A 135 135
531 Senegal 12623 C 135 135
532 Senegal 12624 C 135 135
533 Senegal 12625 T 135 135
534 Senegal 12626 A 135 135
535 Senegal 12627 A 135 135
536 Senegal 12628 T 135 135
537 Senegal 12629 T 135 135
538 Senegal 12630 T 135 135
539 Senegal 12631 A 135 135
540 Senegal 12632 G 135 135
541 Senegal 12633 C 135 135
542 Senegal 12634 A 135 135
543 Senegal 12635 T 135 135
544 Senegal 12636 G 135 135
545 Senegal 12637 G 135 135
546 Senegal 12638 C 135 135
547 Senegal 12639 C 135 135
548 Senegal 12640 T 135 135
549 Senegal 12641 C 135 135
550 Senegal 12642 T 135 135
551 Senegal 12643 T 135 135
552 Senegal 12644 A 135 135
553 Senegal 12645 T 135 135
554 Senegal 12646 T 135 135
555 Senegal 12647 G 135 135
556 Senegal 12648 T 135 135
557 Senegal 12649 A 135 135
558 Senegal 12650 A 135 135
559 Senegal 12651 C 135 135
560 Senegal 12652 A 135 135
561 Senegal 12653 G 135 135
562 Senegal 12654 C 135 135
563 Senegal 12655 T 135 135
564 Senegal 12656 T 135 135
565 Senegal 12657 T 135 135
566 Senegal 12658 A 135 135
567 Senegal 12659 A 135 135
568 Senegal 12660 G 135 135
569 Senegal 12661 G 135 135
570 Senegal 12662 G 135 135
571 Senegal 12663 C 135 135
572 Senegal 12664 C 135 135
573 Senegal 12665 A 135 135
574 Senegal 12666 A 135 135
575 Senegal 12667 T 135 135
576 Senegal 12668 T 135 135
577 Senegal 12669 C 135 135
578 Senegal 12670 T 135 135
579 Senegal 12671 G 135 135
580 Senegal 12672 C 135 135
581 Senegal 12673 T 135 135
582 Senegal 12674 G 135 135
583 Senegal 12675 T 135 135
584 Senegal 12676 C 135 135
585 Senegal 12677 A 135 135
586 Senegal 12678 A 135 135
587 Senegal 12679 A 135 135
588 Senegal 12680 T 135 135
589 Senegal 12681 T 135 135
590 Senegal 12682 A 135 135
591 Senegal 12683 C 135 135
592 Senegal 12684 A 135 135
593 Senegal 12685 G 135 135