National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G I K L M N P Q R S T V W Y
-   594                                      
?                                          
A   84                                      
C   6                                      
D   39 1                                    
E   27                                      
F   15                                      
G   9                                      
I   30                                 1    
K   45                                      
L   54                                      
M   27                                      
N   39                                      
P   18                             2        
Q   33                                      
R   21                 1                    
S   45                                      
T   39                   1                  
V   39         1                            
W   6                                      
Y   18                                      

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Latvia 12092 G 233 233
1 Latvia 12093 C 233 233
2 Latvia 12094 T 233 233
3 Latvia 12095 A 233 233
4 Latvia 12096 T 233 233
5 Latvia 12097 A 233 233
6 Latvia 12098 G 233 233
7 Latvia 12099 C 233 233
8 Latvia 12100 C 233 233
9 Latvia 12101 T 233 233
10 Latvia 12102 C 233 233
11 Latvia 12103 A 233 233
12 Latvia 12104 G 233 233
13 Latvia 12105 A 233 233
14 Latvia 12106 G 233 233
15 Latvia 12107 T 233 233
16 Latvia 12108 T 233 233
17 Latvia 12109 T 233 233
18 Latvia 12110 A 233 233
19 Latvia 12111 G 233 233
20 Latvia 12112 T 233 233
21 Latvia 12113 T 233 233
22 Latvia 12114 C 233 233
23 Latvia 12115 C 233 233
24 Latvia 12116 C 233 233
25 Latvia 12117 T 233 233
26 Latvia 12118 T 233 233
27 Latvia 12119 C T 233 231 Pro3952Ser
28 Latvia 12120 C 233 233
29 Latvia 12121 A 233 233
30 Latvia 12122 T 233 233
31 Latvia 12123 C 233 233
32 Latvia 12124 A 233 233
33 Latvia 12125 T 233 233
34 Latvia 12126 A 233 233
35 Latvia 12127 T 233 233
36 Latvia 12128 G 233 233
37 Latvia 12129 C 233 233
38 Latvia 12130 A 233 233
39 Latvia 12131 G 233 233
40 Latvia 12132 C 233 233
41 Latvia 12133 T 233 233
42 Latvia 12134 T 233 233
43 Latvia 12135 T 233 233
44 Latvia 12136 T 233 233
45 Latvia 12137 G 233 233
46 Latvia 12138 C 233 233
47 Latvia 12139 T 233 233
48 Latvia 12140 A 233 233
49 Latvia 12141 C 233 233
50 Latvia 12142 T 233 233
51 Latvia 12143 G 233 233
52 Latvia 12144 C 233 233
53 Latvia 12145 T 233 233
54 Latvia 12146 C 233 233
55 Latvia 12147 A 233 233
56 Latvia 12148 A 233 233
57 Latvia 12149 G 233 233
58 Latvia 12150 A 233 233
59 Latvia 12151 A 233 233
60 Latvia 12152 G 233 233
61 Latvia 12153 C 233 233
62 Latvia 12154 T 233 233
63 Latvia 12155 T 233 233
64 Latvia 12156 A 233 233
65 Latvia 12157 T 233 233
66 Latvia 12158 G 233 233
67 Latvia 12159 A 233 233
68 Latvia 12160 G 233 233
69 Latvia 12161 C 233 233
70 Latvia 12162 A 233 233
71 Latvia 12163 G 233 233
72 Latvia 12164 G 233 233
73 Latvia 12165 C 233 233
74 Latvia 12166 T 233 233
75 Latvia 12167 G 233 233
76 Latvia 12168 T 233 233
77 Latvia 12169 T 233 233
78 Latvia 12170 G 233 233
79 Latvia 12171 C 233 233
80 Latvia 12172 T 233 233
81 Latvia 12173 A 233 233
82 Latvia 12174 A 233 233
83 Latvia 12175 T 233 233
84 Latvia 12176 G 233 233
85 Latvia 12177 G 233 233
86 Latvia 12178 T 233 233
87 Latvia 12179 G 233 233
88 Latvia 12180 A 233 233
89 Latvia 12181 T 233 233
90 Latvia 12182 T 233 233
91 Latvia 12183 C 233 233
92 Latvia 12184 T 233 233
93 Latvia 12185 G 233 233
94 Latvia 12186 A 233 233
95 Latvia 12187 A 233 233
96 Latvia 12188 G 233 233
97 Latvia 12189 T 233 233
98 Latvia 12190 T 233 233
99 Latvia 12191 G T 233 231 Val3976Phe
100 Latvia 12192 T 233 233
101 Latvia 12193 T 233 233
102 Latvia 12194 C 233 233
103 Latvia 12195 T 233 233
104 Latvia 12196 T 233 233
105 Latvia 12197 A 233 233
106 Latvia 12198 A 233 233
107 Latvia 12199 A 233 233
108 Latvia 12200 A 233 233
109 Latvia 12201 A 233 233
110 Latvia 12202 G 233 233
111 Latvia 12203 T 233 233
112 Latvia 12204 T 233 233
113 Latvia 12205 G 233 233
114 Latvia 12206 A 233 233
115 Latvia 12207 A 233 233
116 Latvia 12208 G 233 233
117 Latvia 12209 A 233 233
118 Latvia 12210 A 233 233
119 Latvia 12211 G 233 233
120 Latvia 12212 T 233 233
121 Latvia 12213 C 233 233
122 Latvia 12214 T 233 233
123 Latvia 12215 T 233 233
124 Latvia 12216 T 233 233
125 Latvia 12217 G 233 233
126 Latvia 12218 A 233 233
127 Latvia 12219 A 233 233
128 Latvia 12220 T 233 233
129 Latvia 12221 G 233 233
130 Latvia 12222 T 233 233
131 Latvia 12223 G 233 233
132 Latvia 12224 G 233 233
133 Latvia 12225 C 233 233
134 Latvia 12226 T 233 233
135 Latvia 12227 A 233 233
136 Latvia 12228 A 233 233
137 Latvia 12229 A 233 233
138 Latvia 12230 T 233 233
139 Latvia 12231 C 233 233
140 Latvia 12232 T 233 233
141 Latvia 12233 G 233 233
142 Latvia 12234 A 233 233
143 Latvia 12235 A 233 233
144 Latvia 12236 T 233 233
145 Latvia 12237 T 233 233
146 Latvia 12238 T 233 233
147 Latvia 12239 G 233 233
148 Latvia 12240 A 233 233
149 Latvia 12241 C 233 233
150 Latvia 12242 C 233 233
151 Latvia 12243 G T 233 232 Arg3993Leu
152 Latvia 12244 T 233 233
153 Latvia 12245 G 233 233
154 Latvia 12246 A 233 233
155 Latvia 12247 T 233 233
156 Latvia 12248 G 233 233
157 Latvia 12249 C 233 233
158 Latvia 12250 A 233 233
159 Latvia 12251 G 233 233
160 Latvia 12252 C 233 233
161 Latvia 12253 C 233 233
162 Latvia 12254 A 233 233
163 Latvia 12255 T 233 233
164 Latvia 12256 G 233 233
165 Latvia 12257 C 233 233
166 Latvia 12258 A 233 233
167 Latvia 12259 A 233 233
168 Latvia 12260 C 233 233
169 Latvia 12261 G 233 233
170 Latvia 12262 T 233 233
171 Latvia 12263 A 233 233
172 Latvia 12264 A 233 233
173 Latvia 12265 G 233 233
174 Latvia 12266 T 233 233
175 Latvia 12267 T 233 233
176 Latvia 12268 G 233 233
177 Latvia 12269 G 233 233
178 Latvia 12270 A 233 233
179 Latvia 12271 A 233 233
180 Latvia 12272 A 233 233
181 Latvia 12273 A 233 233
182 Latvia 12274 G 233 233
183 Latvia 12275 A 233 233
184 Latvia 12276 T 233 233
185 Latvia 12277 G 233 233
186 Latvia 12278 G 233 233
187 Latvia 12279 C 233 233
188 Latvia 12280 T 233 233
189 Latvia 12281 G 233 233
190 Latvia 12282 A 233 233
191 Latvia 12283 T 233 233
192 Latvia 12284 C 233 233
193 Latvia 12285 A 233 233
194 Latvia 12286 A 233 233
195 Latvia 12287 G 233 233
196 Latvia 12288 C 233 233
197 Latvia 12289 T 233 233
198 Latvia 12290 A 233 233
199 Latvia 12291 T 233 233
200 Latvia 12292 G 233 233
201 Latvia 12293 A 233 233
202 Latvia 12294 C 233 233
203 Latvia 12295 C 233 233
204 Latvia 12296 C 233 233
205 Latvia 12297 A 233 233
206 Latvia 12298 A 233 233
207 Latvia 12299 A 233 233
208 Latvia 12300 T 233 233
209 Latvia 12301 G 233 233
210 Latvia 12302 T 233 233
211 Latvia 12303 A 233 233
212 Latvia 12304 T 233 233
213 Latvia 12305 A 233 233
214 Latvia 12306 A 233 233
215 Latvia 12307 A 233 233
216 Latvia 12308 C 233 233
217 Latvia 12309 A 233 233
218 Latvia 12310 G 233 233
219 Latvia 12311 G 233 233
220 Latvia 12312 C 233 233
221 Latvia 12313 T 233 233
222 Latvia 12314 A 233 233
223 Latvia 12315 G 233 233
224 Latvia 12316 A 233 233
225 Latvia 12317 T 233 233
226 Latvia 12318 C 233 233
227 Latvia 12319 T 233 233
228 Latvia 12320 G 233 233
229 Latvia 12321 A 233 233
230 Latvia 12322 G 233 233
231 Latvia 12323 G 233 233
232 Latvia 12324 A 233 233
233 Latvia 12325 C 233 233
234 Latvia 12326 A 233 233
235 Latvia 12327 A 233 233
236 Latvia 12328 G 233 233
237 Latvia 12329 A 233 233
238 Latvia 12330 G 233 233
239 Latvia 12331 G 233 233
240 Latvia 12332 G 233 233
241 Latvia 12333 C 233 233
242 Latvia 12334 A 233 233
243 Latvia 12335 A 233 233
244 Latvia 12336 A 233 233
245 Latvia 12337 A 233 233
246 Latvia 12338 G 233 233
247 Latvia 12339 T 233 233
248 Latvia 12340 T 233 233
249 Latvia 12341 A 233 233
250 Latvia 12342 C 233 233
251 Latvia 12343 T 233 233
252 Latvia 12344 A 233 233
253 Latvia 12345 G 233 233
254 Latvia 12346 T 233 233
255 Latvia 12347 G 233 233
256 Latvia 12348 C 233 233
257 Latvia 12349 T 233 233
258 Latvia 12350 A 233 233
259 Latvia 12351 T 233 233
260 Latvia 12352 G 233 233
261 Latvia 12353 C 233 233
262 Latvia 12354 A 233 233
263 Latvia 12355 G 233 233
264 Latvia 12356 A 233 233
265 Latvia 12357 C 233 233
266 Latvia 12358 A 233 233
267 Latvia 12359 A 233 233
268 Latvia 12360 T 233 233
269 Latvia 12361 G 233 233
270 Latvia 12362 C 233 233
271 Latvia 12363 T 233 233
272 Latvia 12364 T 233 233
273 Latvia 12365 T 233 233
274 Latvia 12366 T 233 233
275 Latvia 12367 C 233 233
276 Latvia 12368 A 233 233
277 Latvia 12369 C 233 233
278 Latvia 12370 T 233 233
279 Latvia 12371 A 233 233
280 Latvia 12372 T 233 233
281 Latvia 12373 G 233 233
282 Latvia 12374 C 233 233
283 Latvia 12375 T 233 233
284 Latvia 12376 T 233 233
285 Latvia 12377 A 233 233
286 Latvia 12378 G 233 233
287 Latvia 12379 A 233 233
288 Latvia 12380 A 233 233
289 Latvia 12381 A 233 233
290 Latvia 12382 G 233 233
291 Latvia 12383 T 233 233
292 Latvia 12384 T 233 233
293 Latvia 12385 G 233 233
294 Latvia 12386 G 233 233
295 Latvia 12387 A 233 233
296 Latvia 12388 T 233 233
297 Latvia 12389 A 233 233
298 Latvia 12390 A 233 233
299 Latvia 12391 T 233 233
300 Latvia 12392 G 233 233
301 Latvia 12393 A 233 233
302 Latvia 12394 T 233 233
303 Latvia 12395 G 233 233
304 Latvia 12396 C 233 233
305 Latvia 12397 A 233 233
306 Latvia 12398 C 233 233
307 Latvia 12399 T 233 233
308 Latvia 12400 C 233 233
309 Latvia 12401 A 233 233
310 Latvia 12402 A 233 233
311 Latvia 12403 C 233 233
312 Latvia 12404 A 233 233
313 Latvia 12405 A 233 233
314 Latvia 12406 C 233 233
315 Latvia 12407 A 233 233
316 Latvia 12408 T 233 233
317 Latvia 12409 T 233 233
318 Latvia 12410 A 233 233
319 Latvia 12411 T 233 233
320 Latvia 12412 C 233 233
321 Latvia 12413 A 233 233
322 Latvia 12414 A 233 233
323 Latvia 12415 C 233 233
324 Latvia 12416 A 233 233
325 Latvia 12417 A 233 233
326 Latvia 12418 T 233 233
327 Latvia 12419 G 233 233
328 Latvia 12420 C 233 233
329 Latvia 12421 A 233 233
330 Latvia 12422 A 233 233
331 Latvia 12423 G 233 233
332 Latvia 12424 A 233 233
333 Latvia 12425 G 233 233
334 Latvia 12426 A 233 233
335 Latvia 12427 T 233 233
336 Latvia 12428 G 233 233
337 Latvia 12429 G 233 233
338 Latvia 12430 T 233 233
339 Latvia 12431 T 233 233
340 Latvia 12432 G 233 233
341 Latvia 12433 T 233 233
342 Latvia 12434 G 233 233
343 Latvia 12435 T 233 233
344 Latvia 12436 T 233 233
345 Latvia 12437 C 233 233
346 Latvia 12438 C 233 233
347 Latvia 12439 C 233 233
348 Latvia 12440 T 233 233
349 Latvia 12441 T 233 233
350 Latvia 12442 G 233 233
351 Latvia 12443 A 233 233
352 Latvia 12444 A 233 233
353 Latvia 12445 C 233 233
354 Latvia 12446 A 233 233
355 Latvia 12447 T 233 233
356 Latvia 12448 A 233 233
357 Latvia 12449 A 233 233
358 Latvia 12450 T 233 233
359 Latvia 12451 A 233 233
360 Latvia 12452 C 233 233
361 Latvia 12453 C 233 233
362 Latvia 12454 T 233 233
363 Latvia 12455 C 233 233
364 Latvia 12456 T 233 233
365 Latvia 12457 T 233 233
366 Latvia 12458 A 233 233
367 Latvia 12459 C 233 233
368 Latvia 12460 A 233 233
369 Latvia 12461 A 233 233
370 Latvia 12462 C 233 233
371 Latvia 12463 A 233 233
372 Latvia 12464 G 233 233
373 Latvia 12465 C 233 233
374 Latvia 12466 A 233 233
375 Latvia 12467 G 233 233
376 Latvia 12468 C 233 233
377 Latvia 12469 C 233 233
378 Latvia 12470 A 233 233
379 Latvia 12471 A 233 233
380 Latvia 12472 A 233 233
381 Latvia 12473 C 233 233
382 Latvia 12474 T 233 233
383 Latvia 12475 A 233 233
384 Latvia 12476 A 233 233
385 Latvia 12477 T 233 233
386 Latvia 12478 G 233 233
387 Latvia 12479 G 233 233
388 Latvia 12480 T 233 233
389 Latvia 12481 T 233 233
390 Latvia 12482 G 233 233
391 Latvia 12483 T 233 233
392 Latvia 12484 C 233 233
393 Latvia 12485 A 233 233
394 Latvia 12486 T 233 233
395 Latvia 12487 A 233 233
396 Latvia 12488 C T 233 232 Pro4075Ser
397 Latvia 12489 C 233 233
398 Latvia 12490 A 233 233
399 Latvia 12491 G 233 233
400 Latvia 12492 A 233 233
401 Latvia 12493 C 233 233
402 Latvia 12494 T 233 233
403 Latvia 12495 A 233 233
404 Latvia 12496 T 233 233
405 Latvia 12497 A 233 233
406 Latvia 12498 A 233 233
407 Latvia 12499 C 233 233
408 Latvia 12500 A 233 233
409 Latvia 12501 C 233 233
410 Latvia 12502 A 233 233
411 Latvia 12503 T 233 233
412 Latvia 12504 A 233 233
413 Latvia 12505 T 233 233
414 Latvia 12506 A 233 233
415 Latvia 12507 A 233 233
416 Latvia 12508 A 233 233
417 Latvia 12509 A 233 233
418 Latvia 12510 A 233 233
419 Latvia 12511 T 233 233
420 Latvia 12512 A 233 233
421 Latvia 12513 C T 233 199 Thr4083Met
422 Latvia 12514 G 233 233
423 Latvia 12515 T 233 233
424 Latvia 12516 G 233 233
425 Latvia 12517 T 233 233
426 Latvia 12518 G 233 233
427 Latvia 12519 A C 233 231 Asp4085Ala
428 Latvia 12520 T 233 233
429 Latvia 12521 G 233 233
430 Latvia 12522 G 233 233
431 Latvia 12523 T 233 233
432 Latvia 12524 A 233 233
433 Latvia 12525 C 233 233
434 Latvia 12526 A 233 233
435 Latvia 12527 A 233 233
436 Latvia 12528 C 233 233
437 Latvia 12529 A 233 233
438 Latvia 12530 T 233 233
439 Latvia 12531 T 233 233
440 Latvia 12532 T 233 233
441 Latvia 12533 A 233 233
442 Latvia 12534 C 233 233
443 Latvia 12535 T 233 233
444 Latvia 12536 T 233 233
445 Latvia 12537 A 233 233
446 Latvia 12538 T 233 233
447 Latvia 12539 G 233 233
448 Latvia 12540 C 233 233
449 Latvia 12541 A 233 233
450 Latvia 12542 T 233 233
451 Latvia 12543 C 233 233
452 Latvia 12544 A 233 233
453 Latvia 12545 G 233 233
454 Latvia 12546 C 233 233
455 Latvia 12547 A 233 233
456 Latvia 12548 T 233 233
457 Latvia 12549 T 233 233
458 Latvia 12550 G 233 233
459 Latvia 12551 T 233 233
460 Latvia 12552 G 233 233
461 Latvia 12553 G 233 233
462 Latvia 12554 G 233 233
463 Latvia 12555 A 233 233
464 Latvia 12556 A 233 233
465 Latvia 12557 A G 233 232 Ile4098Val
466 Latvia 12558 T 233 233
467 Latvia 12559 C 233 233
468 Latvia 12560 C 233 233
469 Latvia 12561 A 233 233
470 Latvia 12562 A 233 233
471 Latvia 12563 C 233 233
472 Latvia 12564 A 233 233
473 Latvia 12565 G 233 233
474 Latvia 12566 G 233 233
475 Latvia 12567 T 233 233
476 Latvia 12568 T 233 233
477 Latvia 12569 G 233 233
478 Latvia 12570 T 233 233
479 Latvia 12571 A 233 233
480 Latvia 12572 G 233 233
481 Latvia 12573 A 233 233
482 Latvia 12574 T 233 233
483 Latvia 12575 G 233 233
484 Latvia 12576 C 233 233
485 Latvia 12577 A 233 233
486 Latvia 12578 G 233 233
487 Latvia 12579 A 233 233
488 Latvia 12580 T 233 233
489 Latvia 12581 A 233 233
490 Latvia 12582 G 233 233
491 Latvia 12583 T 233 233
492 Latvia 12584 A 233 233
493 Latvia 12585 A 233 233
494 Latvia 12586 A 233 233
495 Latvia 12587 A 233 233
496 Latvia 12588 T 233 233
497 Latvia 12589 T 233 233
498 Latvia 12590 G 233 233
499 Latvia 12591 T 233 233
500 Latvia 12592 T 233 233
501 Latvia 12593 C 233 233
502 Latvia 12594 A 233 233
503 Latvia 12595 A 233 233
504 Latvia 12596 C 233 233
505 Latvia 12597 T 233 233
506 Latvia 12598 T 233 233
507 Latvia 12599 A 233 233
508 Latvia 12600 G 233 233
509 Latvia 12601 T 233 233
510 Latvia 12602 G 233 233
511 Latvia 12603 A 233 233
512 Latvia 12604 A 233 233
513 Latvia 12605 A 233 233
514 Latvia 12606 T 233 233
515 Latvia 12607 T 233 233
516 Latvia 12608 A 233 233
517 Latvia 12609 G 233 233
518 Latvia 12610 T 233 233
519 Latvia 12611 A 233 233
520 Latvia 12612 T 233 233
521 Latvia 12613 G 233 233
522 Latvia 12614 G 233 233
523 Latvia 12615 A 233 233
524 Latvia 12616 C 233 233
525 Latvia 12617 A 233 233
526 Latvia 12618 A 233 233
527 Latvia 12619 T 233 233
528 Latvia 12620 T 233 233
529 Latvia 12621 C 233 233
530 Latvia 12622 A 233 233
531 Latvia 12623 C 233 233
532 Latvia 12624 C 233 233
533 Latvia 12625 T 233 233
534 Latvia 12626 A 233 233
535 Latvia 12627 A 233 233
536 Latvia 12628 T 233 233
537 Latvia 12629 T 233 233
538 Latvia 12630 T 233 233
539 Latvia 12631 A 233 233
540 Latvia 12632 G 233 233
541 Latvia 12633 C 233 233
542 Latvia 12634 A 233 233
543 Latvia 12635 T 233 233
544 Latvia 12636 G 233 233
545 Latvia 12637 G 233 233
546 Latvia 12638 C 233 233
547 Latvia 12639 C 233 233
548 Latvia 12640 T 233 233
549 Latvia 12641 C 233 233
550 Latvia 12642 T 233 233
551 Latvia 12643 T 233 233
552 Latvia 12644 A 233 233
553 Latvia 12645 T 233 233
554 Latvia 12646 T 233 233
555 Latvia 12647 G 233 233
556 Latvia 12648 T 233 233
557 Latvia 12649 A 233 233
558 Latvia 12650 A 233 233
559 Latvia 12651 C 233 233
560 Latvia 12652 A 233 233
561 Latvia 12653 G 233 233
562 Latvia 12654 C 233 233
563 Latvia 12655 T 233 233
564 Latvia 12656 T 233 233
565 Latvia 12657 T 233 233
566 Latvia 12658 A 233 233
567 Latvia 12659 A 233 233
568 Latvia 12660 G 233 233
569 Latvia 12661 G 233 233
570 Latvia 12662 G 233 233
571 Latvia 12663 C 233 233
572 Latvia 12664 C 233 233
573 Latvia 12665 A 233 233
574 Latvia 12666 A 233 233
575 Latvia 12667 T 233 233
576 Latvia 12668 T 233 233
577 Latvia 12669 C 233 233
578 Latvia 12670 T 233 233
579 Latvia 12671 G 233 233
580 Latvia 12672 C 233 233
581 Latvia 12673 T 233 233
582 Latvia 12674 G 233 233
583 Latvia 12675 T 233 233
584 Latvia 12676 C 233 233
585 Latvia 12677 A 233 233
586 Latvia 12678 A 233 233
587 Latvia 12679 A 233 233
588 Latvia 12680 T 233 233
589 Latvia 12681 T 233 233
590 Latvia 12682 A 233 233
591 Latvia 12683 C 233 233
592 Latvia 12684 A 233 233
593 Latvia 12685 G 233 233