National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G I K L M N P Q R S T V W Y
-   594                                      
?                                          
A   84                                      
C   6                                      
D   39                                      
E   27                                      
F   15                                      
G   9                                      
I   30                                      
K   45                                      
L   54                                      
M   27                                      
N   39                                      
P   18                                      
Q   33                                      
R   21                                      
S   45                                      
T   39                                      
V   39                                      
W   6                                      
Y   18                                      

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 12092 G 5 5
1 Brunei 12093 C 5 5
2 Brunei 12094 T 5 5
3 Brunei 12095 A 5 5
4 Brunei 12096 T 5 5
5 Brunei 12097 A 5 5
6 Brunei 12098 G 5 5
7 Brunei 12099 C 5 5
8 Brunei 12100 C 5 5
9 Brunei 12101 T 5 5
10 Brunei 12102 C 5 5
11 Brunei 12103 A 5 5
12 Brunei 12104 G 5 5
13 Brunei 12105 A 5 5
14 Brunei 12106 G 5 5
15 Brunei 12107 T 5 5
16 Brunei 12108 T 5 5
17 Brunei 12109 T 5 5
18 Brunei 12110 A 5 5
19 Brunei 12111 G 5 5
20 Brunei 12112 T 5 5
21 Brunei 12113 T 5 5
22 Brunei 12114 C 5 5
23 Brunei 12115 C 5 5
24 Brunei 12116 C 5 5
25 Brunei 12117 T 5 5
26 Brunei 12118 T 5 5
27 Brunei 12119 C 5 5
28 Brunei 12120 C 5 5
29 Brunei 12121 A 5 5
30 Brunei 12122 T 5 5
31 Brunei 12123 C 5 5
32 Brunei 12124 A 5 5
33 Brunei 12125 T 5 5
34 Brunei 12126 A 5 5
35 Brunei 12127 T 5 5
36 Brunei 12128 G 5 5
37 Brunei 12129 C 5 5
38 Brunei 12130 A 5 5
39 Brunei 12131 G 5 5
40 Brunei 12132 C 5 5
41 Brunei 12133 T 5 5
42 Brunei 12134 T 5 5
43 Brunei 12135 T 5 5
44 Brunei 12136 T 5 5
45 Brunei 12137 G 5 5
46 Brunei 12138 C 5 5
47 Brunei 12139 T 5 5
48 Brunei 12140 A 5 5
49 Brunei 12141 C 5 5
50 Brunei 12142 T 5 5
51 Brunei 12143 G 5 5
52 Brunei 12144 C 5 5
53 Brunei 12145 T 5 5
54 Brunei 12146 C 5 5
55 Brunei 12147 A 5 5
56 Brunei 12148 A 5 5
57 Brunei 12149 G 5 5
58 Brunei 12150 A 5 5
59 Brunei 12151 A 5 5
60 Brunei 12152 G 5 5
61 Brunei 12153 C 5 5
62 Brunei 12154 T 5 5
63 Brunei 12155 T 5 5
64 Brunei 12156 A 5 5
65 Brunei 12157 T 5 5
66 Brunei 12158 G 5 5
67 Brunei 12159 A 5 5
68 Brunei 12160 G 5 5
69 Brunei 12161 C 5 5
70 Brunei 12162 A 5 5
71 Brunei 12163 G 5 5
72 Brunei 12164 G 5 5
73 Brunei 12165 C 5 5
74 Brunei 12166 T 5 5
75 Brunei 12167 G 5 5
76 Brunei 12168 T 5 5
77 Brunei 12169 T 5 5
78 Brunei 12170 G 5 5
79 Brunei 12171 C 5 5
80 Brunei 12172 T 5 5
81 Brunei 12173 A 5 5
82 Brunei 12174 A 5 5
83 Brunei 12175 T 5 5
84 Brunei 12176 G 5 5
85 Brunei 12177 G 5 5
86 Brunei 12178 T 5 5
87 Brunei 12179 G 5 5
88 Brunei 12180 A 5 5
89 Brunei 12181 T 5 5
90 Brunei 12182 T 5 5
91 Brunei 12183 C 5 5
92 Brunei 12184 T 5 5
93 Brunei 12185 G 5 5
94 Brunei 12186 A 5 5
95 Brunei 12187 A 5 5
96 Brunei 12188 G 5 5
97 Brunei 12189 T 5 5
98 Brunei 12190 T 5 5
99 Brunei 12191 G 5 5
100 Brunei 12192 T 5 5
101 Brunei 12193 T 5 5
102 Brunei 12194 C 5 5
103 Brunei 12195 T 5 5
104 Brunei 12196 T 5 5
105 Brunei 12197 A 5 5
106 Brunei 12198 A 5 5
107 Brunei 12199 A 5 5
108 Brunei 12200 A 5 5
109 Brunei 12201 A 5 5
110 Brunei 12202 G 5 5
111 Brunei 12203 T 5 5
112 Brunei 12204 T 5 5
113 Brunei 12205 G 5 5
114 Brunei 12206 A 5 5
115 Brunei 12207 A 5 5
116 Brunei 12208 G 5 5
117 Brunei 12209 A 5 5
118 Brunei 12210 A 5 5
119 Brunei 12211 G 5 5
120 Brunei 12212 T 5 5
121 Brunei 12213 C 5 5
122 Brunei 12214 T 5 5
123 Brunei 12215 T 5 5
124 Brunei 12216 T 5 5
125 Brunei 12217 G 5 5
126 Brunei 12218 A 5 5
127 Brunei 12219 A 5 5
128 Brunei 12220 T 5 5
129 Brunei 12221 G 5 5
130 Brunei 12222 T 5 5
131 Brunei 12223 G 5 5
132 Brunei 12224 G 5 5
133 Brunei 12225 C 5 5
134 Brunei 12226 T 5 5
135 Brunei 12227 A 5 5
136 Brunei 12228 A 5 5
137 Brunei 12229 A 5 5
138 Brunei 12230 T 5 5
139 Brunei 12231 C 5 5
140 Brunei 12232 T 5 5
141 Brunei 12233 G 5 5
142 Brunei 12234 A 5 5
143 Brunei 12235 A 5 5
144 Brunei 12236 T 5 5
145 Brunei 12237 T 5 5
146 Brunei 12238 T 5 5
147 Brunei 12239 G 5 5
148 Brunei 12240 A 5 5
149 Brunei 12241 C 5 5
150 Brunei 12242 C 5 5
151 Brunei 12243 G 5 5
152 Brunei 12244 T 5 5
153 Brunei 12245 G 5 5
154 Brunei 12246 A 5 5
155 Brunei 12247 T 5 5
156 Brunei 12248 G 5 5
157 Brunei 12249 C 5 5
158 Brunei 12250 A 5 5
159 Brunei 12251 G 5 5
160 Brunei 12252 C 5 5
161 Brunei 12253 C 5 5
162 Brunei 12254 A 5 5
163 Brunei 12255 T 5 5
164 Brunei 12256 G 5 5
165 Brunei 12257 C 5 5
166 Brunei 12258 A 5 5
167 Brunei 12259 A 5 5
168 Brunei 12260 C 5 5
169 Brunei 12261 G 5 5
170 Brunei 12262 T 5 5
171 Brunei 12263 A 5 5
172 Brunei 12264 A 5 5
173 Brunei 12265 G 5 5
174 Brunei 12266 T 5 5
175 Brunei 12267 T 5 5
176 Brunei 12268 G 5 5
177 Brunei 12269 G 5 5
178 Brunei 12270 A 5 5
179 Brunei 12271 A 5 5
180 Brunei 12272 A 5 5
181 Brunei 12273 A 5 5
182 Brunei 12274 G 5 5
183 Brunei 12275 A 5 5
184 Brunei 12276 T 5 5
185 Brunei 12277 G 5 5
186 Brunei 12278 G 5 5
187 Brunei 12279 C 5 5
188 Brunei 12280 T 5 5
189 Brunei 12281 G 5 5
190 Brunei 12282 A 5 5
191 Brunei 12283 T 5 5
192 Brunei 12284 C 5 5
193 Brunei 12285 A 5 5
194 Brunei 12286 A 5 5
195 Brunei 12287 G 5 5
196 Brunei 12288 C 5 5
197 Brunei 12289 T 5 5
198 Brunei 12290 A 5 5
199 Brunei 12291 T 5 5
200 Brunei 12292 G 5 5
201 Brunei 12293 A 5 5
202 Brunei 12294 C 5 5
203 Brunei 12295 C 5 5
204 Brunei 12296 C 5 5
205 Brunei 12297 A 5 5
206 Brunei 12298 A 5 5
207 Brunei 12299 A 5 5
208 Brunei 12300 T 5 5
209 Brunei 12301 G 5 5
210 Brunei 12302 T 5 5
211 Brunei 12303 A 5 5
212 Brunei 12304 T 5 5
213 Brunei 12305 A 5 5
214 Brunei 12306 A 5 5
215 Brunei 12307 A 5 5
216 Brunei 12308 C 5 5
217 Brunei 12309 A 5 5
218 Brunei 12310 G 5 5
219 Brunei 12311 G 5 5
220 Brunei 12312 C 5 5
221 Brunei 12313 T 5 5
222 Brunei 12314 A 5 5
223 Brunei 12315 G 5 5
224 Brunei 12316 A 5 5
225 Brunei 12317 T 5 5
226 Brunei 12318 C 5 5
227 Brunei 12319 T 5 5
228 Brunei 12320 G 5 5
229 Brunei 12321 A 5 5
230 Brunei 12322 G 5 5
231 Brunei 12323 G 5 5
232 Brunei 12324 A 5 5
233 Brunei 12325 C 5 5
234 Brunei 12326 A 5 5
235 Brunei 12327 A 5 5
236 Brunei 12328 G 5 5
237 Brunei 12329 A 5 5
238 Brunei 12330 G 5 5
239 Brunei 12331 G 5 5
240 Brunei 12332 G 5 5
241 Brunei 12333 C 5 5
242 Brunei 12334 A 5 5
243 Brunei 12335 A 5 5
244 Brunei 12336 A 5 5
245 Brunei 12337 A 5 5
246 Brunei 12338 G 5 5
247 Brunei 12339 T 5 5
248 Brunei 12340 T 5 5
249 Brunei 12341 A 5 5
250 Brunei 12342 C 5 5
251 Brunei 12343 T 5 5
252 Brunei 12344 A 5 5
253 Brunei 12345 G 5 5
254 Brunei 12346 T 5 5
255 Brunei 12347 G 5 5
256 Brunei 12348 C 5 5
257 Brunei 12349 T 5 5
258 Brunei 12350 A 5 5
259 Brunei 12351 T 5 5
260 Brunei 12352 G 5 5
261 Brunei 12353 C 5 5
262 Brunei 12354 A 5 5
263 Brunei 12355 G 5 5
264 Brunei 12356 A 5 5
265 Brunei 12357 C 5 5
266 Brunei 12358 A 5 5
267 Brunei 12359 A 5 5
268 Brunei 12360 T 5 5
269 Brunei 12361 G 5 5
270 Brunei 12362 C 5 5
271 Brunei 12363 T 5 5
272 Brunei 12364 T 5 5
273 Brunei 12365 T 5 5
274 Brunei 12366 T 5 5
275 Brunei 12367 C 5 5
276 Brunei 12368 A 5 5
277 Brunei 12369 C 5 5
278 Brunei 12370 T 5 5
279 Brunei 12371 A 5 5
280 Brunei 12372 T 5 5
281 Brunei 12373 G 5 5
282 Brunei 12374 C 5 5
283 Brunei 12375 T 5 5
284 Brunei 12376 T 5 5
285 Brunei 12377 A 5 5
286 Brunei 12378 G 5 5
287 Brunei 12379 A 5 5
288 Brunei 12380 A 5 5
289 Brunei 12381 A 5 5
290 Brunei 12382 G 5 5
291 Brunei 12383 T 5 5
292 Brunei 12384 T 5 5
293 Brunei 12385 G 5 5
294 Brunei 12386 G 5 5
295 Brunei 12387 A 5 5
296 Brunei 12388 T 5 5
297 Brunei 12389 A 5 5
298 Brunei 12390 A 5 5
299 Brunei 12391 T 5 5
300 Brunei 12392 G 5 5
301 Brunei 12393 A 5 5
302 Brunei 12394 T 5 5
303 Brunei 12395 G 5 5
304 Brunei 12396 C 5 5
305 Brunei 12397 A 5 5
306 Brunei 12398 C 5 5
307 Brunei 12399 T 5 5
308 Brunei 12400 C 5 5
309 Brunei 12401 A 5 5
310 Brunei 12402 A 5 5
311 Brunei 12403 C 5 5
312 Brunei 12404 A 5 5
313 Brunei 12405 A 5 5
314 Brunei 12406 C 5 5
315 Brunei 12407 A 5 5
316 Brunei 12408 T 5 5
317 Brunei 12409 T 5 5
318 Brunei 12410 A 5 5
319 Brunei 12411 T 5 5
320 Brunei 12412 C 5 5
321 Brunei 12413 A 5 5
322 Brunei 12414 A 5 5
323 Brunei 12415 C 5 5
324 Brunei 12416 A 5 5
325 Brunei 12417 A 5 5
326 Brunei 12418 T 5 5
327 Brunei 12419 G 5 5
328 Brunei 12420 C 5 5
329 Brunei 12421 A 5 5
330 Brunei 12422 A 5 5
331 Brunei 12423 G 5 5
332 Brunei 12424 A 5 5
333 Brunei 12425 G 5 5
334 Brunei 12426 A 5 5
335 Brunei 12427 T 5 5
336 Brunei 12428 G 5 5
337 Brunei 12429 G 5 5
338 Brunei 12430 T 5 5
339 Brunei 12431 T 5 5
340 Brunei 12432 G 5 5
341 Brunei 12433 T 5 5
342 Brunei 12434 G 5 5
343 Brunei 12435 T 5 5
344 Brunei 12436 T 5 5
345 Brunei 12437 C 5 5
346 Brunei 12438 C 5 5
347 Brunei 12439 C 5 5
348 Brunei 12440 T 5 5
349 Brunei 12441 T 5 5
350 Brunei 12442 G 5 5
351 Brunei 12443 A 5 5
352 Brunei 12444 A 5 5
353 Brunei 12445 C 5 5
354 Brunei 12446 A 5 5
355 Brunei 12447 T 5 5
356 Brunei 12448 A 5 5
357 Brunei 12449 A 5 5
358 Brunei 12450 T 5 5
359 Brunei 12451 A 5 5
360 Brunei 12452 C 5 5
361 Brunei 12453 C 5 5
362 Brunei 12454 T 5 5
363 Brunei 12455 C 5 5
364 Brunei 12456 T 5 5
365 Brunei 12457 T 5 5
366 Brunei 12458 A 5 5
367 Brunei 12459 C 5 5
368 Brunei 12460 A 5 5
369 Brunei 12461 A 5 5
370 Brunei 12462 C 5 5
371 Brunei 12463 A 5 5
372 Brunei 12464 G 5 5
373 Brunei 12465 C 5 5
374 Brunei 12466 A 5 5
375 Brunei 12467 G 5 5
376 Brunei 12468 C 5 5
377 Brunei 12469 C 5 5
378 Brunei 12470 A 5 5
379 Brunei 12471 A 5 5
380 Brunei 12472 A 5 5
381 Brunei 12473 C 5 5
382 Brunei 12474 T 5 5
383 Brunei 12475 A 5 5
384 Brunei 12476 A 5 5
385 Brunei 12477 T 5 5
386 Brunei 12478 G 5 5
387 Brunei 12479 G 5 5
388 Brunei 12480 T 5 5
389 Brunei 12481 T 5 5
390 Brunei 12482 G 5 5
391 Brunei 12483 T 5 5
392 Brunei 12484 C 5 5
393 Brunei 12485 A 5 5
394 Brunei 12486 T 5 5
395 Brunei 12487 A 5 5
396 Brunei 12488 C 5 5
397 Brunei 12489 C 5 5
398 Brunei 12490 A 5 5
399 Brunei 12491 G 5 5
400 Brunei 12492 A 5 5
401 Brunei 12493 C 5 5
402 Brunei 12494 T 5 5
403 Brunei 12495 A 5 5
404 Brunei 12496 T 5 5
405 Brunei 12497 A 5 5
406 Brunei 12498 A 5 5
407 Brunei 12499 C 5 5
408 Brunei 12500 A 5 5
409 Brunei 12501 C 5 5
410 Brunei 12502 A 5 5
411 Brunei 12503 T 5 5
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