National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G I K L M N P Q R S T V W Y
-   594                                      
?                                          
A   84                                      
C   6                                      
D   39                                      
E   27                                      
F   15                                      
G   9                                      
I   30                                      
K   45                                      
L   54                                      
M   27                                      
N   39                                      
P   18                                      
Q   33                                      
R   21                                      
S   45                                      
T   39                                      
V   39                                      
W   6                                      
Y   18                                      

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 12092 G 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 12093 C 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 12094 T 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 12095 A 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 12096 T 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 12097 A 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 12098 G 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 12099 C 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 12100 C 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 12101 T 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 12102 C 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 12103 A 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 12104 G 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 12105 A 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 12106 G 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 12107 T 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 12108 T 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 12109 T 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 12110 A 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 12111 G 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 12112 T 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 12113 T 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 12114 C 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 12115 C 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 12116 C 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 12117 T 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 12118 T 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 12119 C 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 12120 C 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 12121 A 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 12122 T 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 12123 C 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 12124 A 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 12125 T 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 12126 A 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 12127 T 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 12128 G 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 12129 C 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 12130 A 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 12131 G 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 12132 C 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 12133 T 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 12134 T 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 12135 T 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 12136 T 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 12137 G 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 12138 C 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 12139 T 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 12140 A 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 12141 C 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 12142 T 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 12143 G 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 12144 C 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 12145 T 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 12146 C 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 12147 A 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 12148 A 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 12149 G 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 12150 A 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 12151 A 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 12152 G 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 12153 C 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 12154 T 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 12155 T 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 12156 A 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 12157 T 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 12158 G 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 12159 A 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 12160 G 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 12161 C 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 12162 A 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 12163 G 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 12164 G 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 12165 C 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 12166 T 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 12167 G 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 12168 T 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 12169 T 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 12170 G 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 12171 C 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 12172 T 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 12173 A 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 12174 A 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 12175 T 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 12176 G 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 12177 G 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 12178 T 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 12179 G 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 12180 A 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 12181 T 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 12182 T 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 12183 C 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 12184 T 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 12185 G 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 12186 A 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 12187 A 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 12188 G 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 12189 T 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 12190 T 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 12191 G 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 12192 T 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 12193 T 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 12194 C 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 12195 T 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 12196 T 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 12197 A 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 12198 A 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 12199 A 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 12200 A 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 12201 A 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 12202 G 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 12203 T 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 12204 T 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 12205 G 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 12206 A 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 12207 A 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 12208 G 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 12209 A 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 12210 A 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 12211 G 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 12212 T 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 12213 C 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 12214 T 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 12215 T 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 12216 T 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 12217 G 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 12218 A 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 12219 A 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 12220 T 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 12221 G 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 12222 T 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 12223 G 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 12224 G 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 12225 C 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 12226 T 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 12227 A 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 12228 A 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 12229 A 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 12230 T 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 12231 C 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 12232 T 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 12233 G 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 12234 A 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 12235 A 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 12236 T 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 12237 T 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 12238 T 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 12239 G 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 12240 A 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 12241 C 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 12242 C 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 12243 G 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 12244 T 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 12245 G 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 12246 A 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 12247 T 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 12248 G 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 12249 C 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 12250 A 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 12251 G 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 12252 C 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 12253 C 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 12254 A 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 12255 T 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 12256 G 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 12257 C 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 12258 A 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 12259 A 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 12260 C 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 12261 G 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 12262 T 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 12263 A 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 12264 A 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 12265 G 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 12266 T 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 12267 T 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 12268 G 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 12269 G 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 12270 A 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 12271 A 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 12272 A 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 12273 A 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 12274 G 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 12275 A 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 12276 T 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 12277 G 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 12278 G 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 12279 C 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 12280 T 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 12281 G 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 12282 A 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 12283 T 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 12284 C 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 12285 A 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 12286 A 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 12287 G 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 12288 C 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 12289 T 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 12290 A 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 12291 T 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 12292 G 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 12293 A 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 12294 C 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 12295 C 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 12296 C 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 12297 A 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 12298 A 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 12299 A 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 12300 T 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 12301 G 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 12302 T 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 12303 A 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 12304 T 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 12305 A 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 12306 A 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 12307 A 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 12308 C 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 12309 A 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 12310 G 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 12311 G 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 12312 C 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 12313 T 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 12314 A 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 12315 G 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 12316 A 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 12317 T 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 12318 C 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 12319 T 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 12320 G 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 12321 A 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 12322 G 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 12323 G 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 12324 A 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 12325 C 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 12326 A 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 12327 A 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 12328 G 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 12329 A 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 12330 G 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 12331 G 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 12332 G 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 12333 C 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 12334 A 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 12335 A 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 12336 A 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 12337 A 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 12338 G 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 12339 T 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 12340 T 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 12341 A 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 12342 C 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 12343 T 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 12344 A 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 12345 G 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 12346 T 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 12347 G 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 12348 C 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 12349 T 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 12350 A 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 12351 T 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 12352 G 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 12353 C 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 12354 A 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 12355 G 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 12356 A 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 12357 C 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 12358 A 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 12359 A 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 12360 T 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 12361 G 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 12362 C 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 12363 T 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 12364 T 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 12365 T 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 12366 T 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 12367 C 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 12368 A 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 12369 C 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 12370 T 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 12371 A 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 12372 T 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 12373 G 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 12374 C 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 12375 T 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 12376 T 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 12377 A 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 12378 G 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 12379 A 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 12380 A 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 12381 A 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 12382 G 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 12383 T 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 12384 T 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 12385 G 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 12386 G 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 12387 A 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 12388 T 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 12389 A 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 12390 A 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 12391 T 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 12392 G 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 12393 A 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 12394 T 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 12395 G 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 12396 C 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 12397 A 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 12398 C 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 12399 T 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 12400 C 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 12401 A 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 12402 A 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 12403 C 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 12404 A 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 12405 A 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 12406 C 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 12407 A 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 12408 T 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 12409 T 1 1
318 Antigua_and_Barbuda 12410 A 1 1
319 Antigua_and_Barbuda 12411 T 1 1
320 Antigua_and_Barbuda 12412 C 1 1
321 Antigua_and_Barbuda 12413 A 1 1
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