National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   870                                        
?                                            
A   60                                        
C   30                                        
D   24                                        
E   9                                        
F   66                                        
G   45                                        
H   12                                        
I   48                                        
K   36                                        
L   123         1                              
M   51                                        
N   30                                        
P   21                                        
Q   21                                        
R   27                                        
S   51                                        
T   63                                        
V   84                                        
W   18                                        
Y   51                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 10973 A 5 5
1 Brunei 10974 G 5 5
2 Brunei 10975 T 5 5
3 Brunei 10976 G 5 5
4 Brunei 10977 C 5 5
5 Brunei 10978 A 5 5
6 Brunei 10979 G 5 5
7 Brunei 10980 T 5 5
8 Brunei 10981 G 5 5
9 Brunei 10982 A 5 5
10 Brunei 10983 A 5 5
11 Brunei 10984 A 5 5
12 Brunei 10985 A 5 5
13 Brunei 10986 G 5 5
14 Brunei 10987 A 5 5
15 Brunei 10988 A 5 5
16 Brunei 10989 C 5 5
17 Brunei 10990 A 5 5
18 Brunei 10991 A 5 5
19 Brunei 10992 T 5 5
20 Brunei 10993 C 5 5
21 Brunei 10994 A 5 5
22 Brunei 10995 A 5 5
23 Brunei 10996 G 5 5
24 Brunei 10997 G 5 5
25 Brunei 10998 G 5 5
26 Brunei 10999 T 5 5
27 Brunei 11000 A 5 5
28 Brunei 11001 C 5 5
29 Brunei 11002 A 5 5
30 Brunei 11003 C 5 5
31 Brunei 11004 A 5 5
32 Brunei 11005 C 5 5
33 Brunei 11006 C 5 5
34 Brunei 11007 A 5 5
35 Brunei 11008 C 5 5
36 Brunei 11009 T 5 5
37 Brunei 11010 G 5 5
38 Brunei 11011 G 5 5
39 Brunei 11012 T 5 5
40 Brunei 11013 T 5 5
41 Brunei 11014 G 5 5
42 Brunei 11015 T 5 5
43 Brunei 11016 T 5 5
44 Brunei 11017 A 5 5
45 Brunei 11018 C 5 5
46 Brunei 11019 T 5 5
47 Brunei 11020 C 5 5
48 Brunei 11021 A 5 5
49 Brunei 11022 C 5 5
50 Brunei 11023 A 5 5
51 Brunei 11024 A 5 5
52 Brunei 11025 T 5 5
53 Brunei 11026 T 5 5
54 Brunei 11027 T 5 5
55 Brunei 11028 T 5 5
56 Brunei 11029 G 5 5
57 Brunei 11030 A 5 5
58 Brunei 11031 C 5 5
59 Brunei 11032 T 5 5
60 Brunei 11033 T 5 5
61 Brunei 11034 C 5 5
62 Brunei 11035 A 5 5
63 Brunei 11036 C 5 5
64 Brunei 11037 T 5 5
65 Brunei 11038 T 5 5
66 Brunei 11039 T 5 5
67 Brunei 11040 T 5 5
68 Brunei 11041 A 5 5
69 Brunei 11042 G 5 5
70 Brunei 11043 T 5 5
71 Brunei 11044 T 5 5
72 Brunei 11045 T 5 5
73 Brunei 11046 T 5 5
74 Brunei 11047 A 5 5
75 Brunei 11048 G 5 5
76 Brunei 11049 T 5 5
77 Brunei 11050 C 5 5
78 Brunei 11051 C 5 5
79 Brunei 11052 A 5 5
80 Brunei 11053 G 5 5
81 Brunei 11054 A 5 5
82 Brunei 11055 G 5 5
83 Brunei 11056 T 5 5
84 Brunei 11057 A 5 5
85 Brunei 11058 C 5 5
86 Brunei 11059 T 5 5
87 Brunei 11060 C 5 5
88 Brunei 11061 A 5 5
89 Brunei 11062 A 5 5
90 Brunei 11063 T 5 5
91 Brunei 11064 G 5 5
92 Brunei 11065 G 5 5
93 Brunei 11066 T 5 5
94 Brunei 11067 C 5 5
95 Brunei 11068 T 5 5
96 Brunei 11069 T 5 5
97 Brunei 11070 T 5 5
98 Brunei 11071 G 5 5
99 Brunei 11072 T 5 5
100 Brunei 11073 T 5 5
101 Brunei 11074 C 5 5
102 Brunei 11075 T 5 5
103 Brunei 11076 T 5 5
104 Brunei 11077 T 5 5
105 Brunei 11078 T 5 5
106 Brunei 11079 T 5 5
107 Brunei 11080 T 5 5
108 Brunei 11081 T 5 5
109 Brunei 11082 T 5 5
110 Brunei 11083 G T 5 0 Leu3606Phe
111 Brunei 11084 T 5 5
112 Brunei 11085 A 5 5
113 Brunei 11086 T 5 5
114 Brunei 11087 G 5 5
115 Brunei 11088 A 5 5
116 Brunei 11089 A 5 5
117 Brunei 11090 A 5 5
118 Brunei 11091 A 5 5
119 Brunei 11092 T 5 5
120 Brunei 11093 G 5 5
121 Brunei 11094 C 5 5
122 Brunei 11095 C 5 5
123 Brunei 11096 T 5 5
124 Brunei 11097 T 5 5
125 Brunei 11098 T 5 5
126 Brunei 11099 T 5 5
127 Brunei 11100 T 5 5
128 Brunei 11101 A 5 5
129 Brunei 11102 C 5 5
130 Brunei 11103 C 5 5
131 Brunei 11104 T 5 5
132 Brunei 11105 T 5 5
133 Brunei 11106 T 5 5
134 Brunei 11107 T 5 5
135 Brunei 11108 G 5 5
136 Brunei 11109 C 5 5
137 Brunei 11110 T 5 5
138 Brunei 11111 A 5 5
139 Brunei 11112 T 5 5
140 Brunei 11113 G 5 5
141 Brunei 11114 G 5 5
142 Brunei 11115 G 5 5
143 Brunei 11116 T 5 5
144 Brunei 11117 A 5 5
145 Brunei 11118 T 5 5
146 Brunei 11119 T 5 5
147 Brunei 11120 A 5 5
148 Brunei 11121 T 5 5
149 Brunei 11122 T 5 5
150 Brunei 11123 G 5 5
151 Brunei 11124 C 5 5
152 Brunei 11125 T 5 5
153 Brunei 11126 A 5 5
154 Brunei 11127 T 5 5
155 Brunei 11128 G 5 5
156 Brunei 11129 T 5 5
157 Brunei 11130 C 5 5
158 Brunei 11131 T 5 5
159 Brunei 11132 G 5 5
160 Brunei 11133 C 5 5
161 Brunei 11134 T 5 5
162 Brunei 11135 T 5 5
163 Brunei 11136 T 5 5
164 Brunei 11137 T 5 5
165 Brunei 11138 G 5 5
166 Brunei 11139 C 5 5
167 Brunei 11140 A 5 5
168 Brunei 11141 A 5 5
169 Brunei 11142 T 5 5
170 Brunei 11143 G 5 5
171 Brunei 11144 A 5 5
172 Brunei 11145 T 5 5
173 Brunei 11146 G 5 5
174 Brunei 11147 T 5 5
175 Brunei 11148 T 5 5
176 Brunei 11149 T 5 5
177 Brunei 11150 G 5 5
178 Brunei 11151 T 5 5
179 Brunei 11152 C 5 5
180 Brunei 11153 A 5 5
181 Brunei 11154 A 5 5
182 Brunei 11155 A 5 5
183 Brunei 11156 C 5 5
184 Brunei 11157 A 5 5
185 Brunei 11158 T 5 5
186 Brunei 11159 A 5 5
187 Brunei 11160 A 5 5
188 Brunei 11161 G 5 5
189 Brunei 11162 C 5 5
190 Brunei 11163 A 5 5
191 Brunei 11164 T 5 5
192 Brunei 11165 G 5 5
193 Brunei 11166 C 5 5
194 Brunei 11167 A 5 5
195 Brunei 11168 T 5 5
196 Brunei 11169 T 5 5
197 Brunei 11170 T 5 5
198 Brunei 11171 C 5 5
199 Brunei 11172 T 5 5
200 Brunei 11173 C 5 5
201 Brunei 11174 T 5 5
202 Brunei 11175 G 5 5
203 Brunei 11176 T 5 5
204 Brunei 11177 T 5 5
205 Brunei 11178 T 5 5
206 Brunei 11179 G 5 5
207 Brunei 11180 T 5 5
208 Brunei 11181 T 5 5
209 Brunei 11182 T 5 5
210 Brunei 11183 T 5 5
211 Brunei 11184 T 5 5
212 Brunei 11185 G 5 5
213 Brunei 11186 T 5 5
214 Brunei 11187 T 5 5
215 Brunei 11188 A 5 5
216 Brunei 11189 C 5 5
217 Brunei 11190 C 5 5
218 Brunei 11191 T 5 5
219 Brunei 11192 T 5 5
220 Brunei 11193 C 5 5
221 Brunei 11194 T 5 5
222 Brunei 11195 C 5 5
223 Brunei 11196 T 5 5
224 Brunei 11197 T 5 5
225 Brunei 11198 G 5 5
226 Brunei 11199 C 5 5
227 Brunei 11200 C 5 5
228 Brunei 11201 A 5 5
229 Brunei 11202 C 5 5
230 Brunei 11203 T 5 5
231 Brunei 11204 G 5 5
232 Brunei 11205 T 5 5
233 Brunei 11206 A 5 5
234 Brunei 11207 G 5 5
235 Brunei 11208 C 5 5
236 Brunei 11209 T 5 5
237 Brunei 11210 T 5 5
238 Brunei 11211 A 5 5
239 Brunei 11212 T 5 5
240 Brunei 11213 T 5 5
241 Brunei 11214 T 5 5
242 Brunei 11215 T 5 5
243 Brunei 11216 A 5 5
244 Brunei 11217 A 5 5
245 Brunei 11218 T 5 5
246 Brunei 11219 A 5 5
247 Brunei 11220 T 5 5
248 Brunei 11221 G 5 5
249 Brunei 11222 G 5 5
250 Brunei 11223 T 5 5
251 Brunei 11224 C 5 5
252 Brunei 11225 T 5 5
253 Brunei 11226 A 5 5
254 Brunei 11227 T 5 5
255 Brunei 11228 A 5 5
256 Brunei 11229 T 5 5
257 Brunei 11230 G 5 5
258 Brunei 11231 C 5 5
259 Brunei 11232 C 5 5
260 Brunei 11233 T 5 5
261 Brunei 11234 G 5 5
262 Brunei 11235 C 5 5
263 Brunei 11236 T 5 5
264 Brunei 11237 A 5 5
265 Brunei 11238 G 5 5
266 Brunei 11239 T 5 5
267 Brunei 11240 T 5 5
268 Brunei 11241 G 5 5
269 Brunei 11242 G 5 5
270 Brunei 11243 G 5 5
271 Brunei 11244 T 5 5
272 Brunei 11245 G 5 5
273 Brunei 11246 A 5 5
274 Brunei 11247 T 5 5
275 Brunei 11248 G 5 5
276 Brunei 11249 C 5 5
277 Brunei 11250 G 5 5
278 Brunei 11251 T 5 5
279 Brunei 11252 A 5 5
280 Brunei 11253 T 5 5
281 Brunei 11254 T 5 5
282 Brunei 11255 A 5 5
283 Brunei 11256 T 5 5
284 Brunei 11257 G 5 5
285 Brunei 11258 A 5 5
286 Brunei 11259 C 5 5
287 Brunei 11260 A 5 5
288 Brunei 11261 T 5 5
289 Brunei 11262 G 5 5
290 Brunei 11263 G 5 5
291 Brunei 11264 T 5 5
292 Brunei 11265 T 5 5
293 Brunei 11266 G 5 5
294 Brunei 11267 G 5 5
295 Brunei 11268 A 5 5
296 Brunei 11269 T 5 5
297 Brunei 11270 A 5 5
298 Brunei 11271 T 5 5
299 Brunei 11272 G 5 5
300 Brunei 11273 G 5 5
301 Brunei 11274 T 5 5
302 Brunei 11275 T 5 5
303 Brunei 11276 G 5 5
304 Brunei 11277 A 5 5
305 Brunei 11278 T 5 5
306 Brunei 11279 A 5 5
307 Brunei 11280 C 5 5
308 Brunei 11281 T 5 5
309 Brunei 11282 A 5 5
310 Brunei 11283 G 5 5
311 Brunei 11284 T 5 5
312 Brunei 11285 T 5 5
313 Brunei 11286 T 5 5
314 Brunei 11287 G 5 5
315 Brunei 11288 T 5 5
316 Brunei 11289 C 5 5
317 Brunei 11290 T 5 5
318 Brunei 11291 G 5 5
319 Brunei 11292 G 5 5
320 Brunei 11293 T 5 5
321 Brunei 11294 T 5 5
322 Brunei 11295 T 5 5
323 Brunei 11296 T 5 5
324 Brunei 11297 A 5 5
325 Brunei 11298 A 5 5
326 Brunei 11299 G 5 5
327 Brunei 11300 C 5 5
328 Brunei 11301 T 5 5
329 Brunei 11302 A 5 5
330 Brunei 11303 A 5 5
331 Brunei 11304 A 5 5
332 Brunei 11305 A 5 5
333 Brunei 11306 G 5 5
334 Brunei 11307 A 5 5
335 Brunei 11308 C 5 5
336 Brunei 11309 T 5 5
337 Brunei 11310 G 5 5
338 Brunei 11311 T 5 5
339 Brunei 11312 G 5 5
340 Brunei 11313 T 5 5
341 Brunei 11314 T 5 5
342 Brunei 11315 A 5 5
343 Brunei 11316 T 5 5
344 Brunei 11317 G 5 5
345 Brunei 11318 T 5 5
346 Brunei 11319 A 5 5
347 Brunei 11320 T 5 5
348 Brunei 11321 G 5 5
349 Brunei 11322 C 5 5
350 Brunei 11323 A 5 5
351 Brunei 11324 T 5 5
352 Brunei 11325 C 5 5
353 Brunei 11326 A 5 5
354 Brunei 11327 G 5 5
355 Brunei 11328 C 5 5
356 Brunei 11329 T 5 5
357 Brunei 11330 G 5 5
358 Brunei 11331 T 5 5
359 Brunei 11332 A 5 5
360 Brunei 11333 G 5 5
361 Brunei 11334 T 5 5
362 Brunei 11335 G 5 5
363 Brunei 11336 T 5 5
364 Brunei 11337 T 5 5
365 Brunei 11338 A 5 5
366 Brunei 11339 C 5 5
367 Brunei 11340 T 5 5
368 Brunei 11341 A 5 5
369 Brunei 11342 A 5 5
370 Brunei 11343 T 5 5
371 Brunei 11344 C 5 5
372 Brunei 11345 C 5 5
373 Brunei 11346 T 5 5
374 Brunei 11347 T 5 5
375 Brunei 11348 A 5 5
376 Brunei 11349 T 5 5
377 Brunei 11350 G 5 5
378 Brunei 11351 A 5 5
379 Brunei 11352 C 5 5
380 Brunei 11353 A 5 5
381 Brunei 11354 G 5 5
382 Brunei 11355 C 5 5
383 Brunei 11356 A 5 5
384 Brunei 11357 A 5 5
385 Brunei 11358 G 5 5
386 Brunei 11359 A 5 5
387 Brunei 11360 A 5 5
388 Brunei 11361 C 5 5
389 Brunei 11362 T 5 5
390 Brunei 11363 G 5 5
391 Brunei 11364 T 5 5
392 Brunei 11365 G 5 5
393 Brunei 11366 T 5 5
394 Brunei 11367 A 5 5
395 Brunei 11368 T 5 5
396 Brunei 11369 G 5 5
397 Brunei 11370 A 5 5
398 Brunei 11371 T 5 5
399 Brunei 11372 G 5 5
400 Brunei 11373 A 5 5
401 Brunei 11374 T 5 5
402 Brunei 11375 G 5 5
403 Brunei 11376 G 5 5
404 Brunei 11377 T 5 5
405 Brunei 11378 G 5 5
406 Brunei 11379 C 5 5
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860 Brunei 11833 C 5 5
861 Brunei 11834 A 5 5
862 Brunei 11835 C 5 5
863 Brunei 11836 T 5 5
864 Brunei 11837 G 5 5
865 Brunei 11838 T 5 5
866 Brunei 11839 A 5 5
867 Brunei 11840 C 5 5
868 Brunei 11841 A 5 5
869 Brunei 11842 G 5 5