National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   696                                        
?                                            
A   54                                        
C   27                                        
D   18                                        
E   6                                        
F   57                                        
G   30                                        
H   12                                        
I   39                                        
K   21                                        
L   99                                        
M   48                                        
N   21                                        
P   12                                        
Q   12                                        
R   18                                        
S   42                                        
T   54                                        
V   69                                        
W   18                                        
Y   39                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 10973 A 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 10974 G 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 10975 T 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 10976 G 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 10977 C 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 10978 A 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 10979 G 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 10980 T 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 10981 G 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 10982 A 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 10983 A 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 10984 A 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 10985 A 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 10986 G 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 10987 A 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 10988 A 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 10989 C 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 10990 A 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 10991 A 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 10992 T 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 10993 C 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 10994 A 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 10995 A 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 10996 G 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 10997 G 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 10998 G 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 10999 T 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 11000 A 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 11001 C 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 11002 A 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 11003 C 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 11004 A 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 11005 C 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 11006 C 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 11007 A 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 11008 C 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 11009 T 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 11010 G 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 11011 G 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 11012 T 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 11013 T 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 11014 G 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 11015 T 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 11016 T 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 11017 A 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 11018 C 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 11019 T 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 11020 C 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 11021 A 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 11022 C 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 11023 A 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 11024 A 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 11025 T 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 11026 T 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 11027 T 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 11028 T 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 11029 G 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 11030 A 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 11031 C 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 11032 T 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 11033 T 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 11034 C 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 11035 A 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 11036 C 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 11037 T 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 11038 T 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 11039 T 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 11040 T 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 11041 A 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 11042 G 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 11043 T 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 11044 T 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 11045 T 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 11046 T 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 11047 A 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 11048 G 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 11049 T 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 11050 C 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 11051 C 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 11052 A 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 11053 G 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 11054 A 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 11055 G 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 11056 T 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 11057 A 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 11058 C 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 11059 T 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 11060 C 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 11061 A 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 11062 A 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 11063 T 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 11064 G 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 11065 G 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 11066 T 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 11067 C 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 11068 T 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 11069 T 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 11070 T 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 11071 G 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 11072 T 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 11073 T 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 11074 C 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 11075 T 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 11076 T 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 11077 T 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 11078 T 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 11079 T 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 11080 T 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 11081 T 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 11082 T 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 11083 G 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 11084 T 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 11085 A 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 11086 T 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 11087 G 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 11088 A 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 11089 A 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 11090 A 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 11091 A 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 11092 T 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 11093 G 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 11094 C 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 11095 C 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 11096 T 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 11097 T 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 11098 T 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 11099 T 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 11100 T 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 11101 A 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 11102 C 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 11103 C 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 11104 T 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 11105 T 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 11106 T 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 11107 T 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 11108 G 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 11109 C 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 11110 T 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 11111 A 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 11112 T 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 11113 G 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 11114 G 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 11115 G 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 11116 T 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 11117 A 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 11118 T 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 11119 T 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 11120 A 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 11121 T 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 11122 T 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 11123 G 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 11124 C 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 11125 T 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 11126 A 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 11127 T 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 11128 G 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 11129 T 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 11130 C 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 11131 T 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 11132 G 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 11133 C 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 11134 T 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 11135 T 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 11136 T 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 11137 T 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 11138 G 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 11139 C 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 11140 A 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 11141 A 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 11142 T 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 11143 G 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 11144 A 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 11145 T 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 11146 G 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 11147 T 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 11148 T 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 11149 T 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 11150 G 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 11151 T 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 11152 C 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 11153 A 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 11154 A 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 11155 A 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 11156 C 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 11157 A 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 11158 T 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 11159 A 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 11160 A 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 11161 G 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 11162 C 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 11163 A 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 11164 T 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 11165 G 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 11166 C 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 11167 A 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 11168 T 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 11169 T 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 11170 T 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 11171 C 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 11172 T 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 11173 C 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 11174 T 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 11175 G 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 11176 T 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 11177 T 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 11178 T 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 11179 G 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 11180 T 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 11181 T 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 11182 T 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 11183 T 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 11184 T 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 11185 G 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 11186 T 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 11187 T 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 11188 A 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 11189 C 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 11190 C 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 11191 T 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 11192 T 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 11193 C 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 11194 T 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 11195 C 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 11196 T 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 11197 T 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 11198 G 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 11199 C 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 11200 C 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 11201 A 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 11202 C 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 11203 T 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 11204 G 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 11205 T 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 11206 A 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 11207 G 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 11208 C 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 11209 T 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 11210 T 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 11211 A 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 11212 T 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 11213 T 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 11214 T 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 11215 T 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 11216 A 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 11217 A 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 11218 T 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 11219 A 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 11220 T 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 11221 G 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 11222 G 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 11223 T 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 11224 C 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 11225 T 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 11226 A 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 11227 T 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 11228 A 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 11229 T 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 11230 G 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 11231 C 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 11232 C 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 11233 T 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 11234 G 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 11235 C 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 11236 T 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 11237 A 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 11238 G 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 11239 T 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 11240 T 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 11241 G 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 11242 G 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 11243 G 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 11244 T 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 11245 G 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 11246 A 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 11247 T 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 11248 G 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 11249 C 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 11250 G 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 11251 T 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 11252 A 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 11253 T 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 11254 T 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 11255 A 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 11256 T 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 11257 G 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 11258 A 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 11259 C 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 11260 A 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 11261 T 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 11262 G 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 11263 G 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 11264 T 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 11265 T 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 11266 G 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 11267 G 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 11268 A 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 11269 T 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 11270 A 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 11271 T 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 11272 G 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 11273 G 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 11274 T 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 11275 T 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 11276 G 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 11277 A 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 11278 T 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 11279 A 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 11280 C 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 11281 T 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 11282 A 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 11283 G 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 11284 T 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 11285 T 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 11286 T 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 11287 G 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 11288 T 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 11289 C 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 11290 T 1 1
318 Antigua_and_Barbuda 11291 G 1 1
319 Antigua_and_Barbuda 11292 G 1 1
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321 Antigua_and_Barbuda 11294 T 1 1
322 Antigua_and_Barbuda 11295 T 1 1
323 Antigua_and_Barbuda 11296 T 1 1
324 Antigua_and_Barbuda 11297 A 1 1
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328 Antigua_and_Barbuda 11301 T 1 1
329 Antigua_and_Barbuda 11302 A 1 1
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674 Antigua_and_Barbuda 11647 T 1 1
675 Antigua_and_Barbuda 11648 G 1 1
676 Antigua_and_Barbuda 11649 G 1 1
677 Antigua_and_Barbuda 11650 C 1 1
678 Antigua_and_Barbuda 11651 C 1 1
679 Antigua_and_Barbuda 11652 T 1 1
680 Antigua_and_Barbuda 11653 C 1 1
681 Antigua_and_Barbuda 11654 T 1 1
682 Antigua_and_Barbuda 11655 T 1 1
683 Antigua_and_Barbuda 11656 T 1 1
684 Antigua_and_Barbuda 11657 T 1 1
685 Antigua_and_Barbuda 11658 G 1 1
686 Antigua_and_Barbuda 11659 T 1 1
687 Antigua_and_Barbuda 11660 T 1 1
688 Antigua_and_Barbuda 11661 T 1 1
689 Antigua_and_Barbuda 11662 A 1 1
690 Antigua_and_Barbuda 11663 C 1 1
691 Antigua_and_Barbuda 11664 T 1 1
692 Antigua_and_Barbuda 11665 C 1 1
693 Antigua_and_Barbuda 11666 A 1 1
694 Antigua_and_Barbuda 11667 A 1 1
695 Antigua_and_Barbuda 11668 C 1 1