National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   1,500                                        
?                                            
A   108                                        
C   48                                        
D   66                                        
E   45                                        
F   111                                        
G   81                                        
H   27                                        
I   90                                        
K   51                                        
L   147                                        
M   27                                        
N   63                                        
P   60                                        
Q   27                                        
R   60                                        
S   114                                        
T   123                                        
V   138                                        
W   18                                        
Y   96                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 8555 A 5 5
1 Brunei 8556 A 5 5
2 Brunei 8557 A 5 5
3 Brunei 8558 A 5 5
4 Brunei 8559 T 5 5
5 Brunei 8560 T 5 5
6 Brunei 8561 G 5 5
7 Brunei 8562 T 5 5
8 Brunei 8563 T 5 5
9 Brunei 8564 A 5 5
10 Brunei 8565 A 5 5
11 Brunei 8566 T 5 5
12 Brunei 8567 A 5 5
13 Brunei 8568 A 5 5
14 Brunei 8569 T 5 5
15 Brunei 8570 T 5 5
16 Brunei 8571 G 5 5
17 Brunei 8572 G 5 5
18 Brunei 8573 T 5 5
19 Brunei 8574 T 5 5
20 Brunei 8575 G 5 5
21 Brunei 8576 A 5 5
22 Brunei 8577 A 5 5
23 Brunei 8578 G 5 5
24 Brunei 8579 C 5 5
25 Brunei 8580 A 5 5
26 Brunei 8581 G 5 5
27 Brunei 8582 T 5 5
28 Brunei 8583 T 5 5
29 Brunei 8584 A 5 5
30 Brunei 8585 A 5 5
31 Brunei 8586 T 5 5
32 Brunei 8587 T 5 5
33 Brunei 8588 A 5 5
34 Brunei 8589 A 5 5
35 Brunei 8590 A 5 5
36 Brunei 8591 G 5 5
37 Brunei 8592 T 5 5
38 Brunei 8593 T 5 5
39 Brunei 8594 A 5 5
40 Brunei 8595 C 5 5
41 Brunei 8596 A 5 5
42 Brunei 8597 C 5 5
43 Brunei 8598 T 5 5
44 Brunei 8599 T 5 5
45 Brunei 8600 G 5 5
46 Brunei 8601 T 5 5
47 Brunei 8602 G 5 5
48 Brunei 8603 T 5 5
49 Brunei 8604 T 5 5
50 Brunei 8605 C 5 5
51 Brunei 8606 C 5 5
52 Brunei 8607 T 5 5
53 Brunei 8608 T 5 5
54 Brunei 8609 T 5 5
55 Brunei 8610 T 5 5
56 Brunei 8611 T 5 5
57 Brunei 8612 G 5 5
58 Brunei 8613 T 5 5
59 Brunei 8614 T 5 5
60 Brunei 8615 G 5 5
61 Brunei 8616 C 5 5
62 Brunei 8617 T 5 5
63 Brunei 8618 G 5 5
64 Brunei 8619 C 5 5
65 Brunei 8620 T 5 5
66 Brunei 8621 A 5 5
67 Brunei 8622 T 5 5
68 Brunei 8623 T 5 5
69 Brunei 8624 T 5 5
70 Brunei 8625 T 5 5
71 Brunei 8626 C 5 5
72 Brunei 8627 T 5 5
73 Brunei 8628 A 5 5
74 Brunei 8629 T 5 5
75 Brunei 8630 T 5 5
76 Brunei 8631 T 5 5
77 Brunei 8632 A 5 5
78 Brunei 8633 A 5 5
79 Brunei 8634 T 5 5
80 Brunei 8635 A 5 5
81 Brunei 8636 A 5 5
82 Brunei 8637 C 5 5
83 Brunei 8638 A 5 5
84 Brunei 8639 C 5 5
85 Brunei 8640 C 5 5
86 Brunei 8641 T 5 5
87 Brunei 8642 G 5 5
88 Brunei 8643 T 5 5
89 Brunei 8644 T 5 5
90 Brunei 8645 C 5 5
91 Brunei 8646 A 5 5
92 Brunei 8647 T 5 5
93 Brunei 8648 G 5 5
94 Brunei 8649 T 5 5
95 Brunei 8650 C 5 5
96 Brunei 8651 A 5 5
97 Brunei 8652 T 5 5
98 Brunei 8653 G 5 5
99 Brunei 8654 T 5 5
100 Brunei 8655 C 5 5
101 Brunei 8656 T 5 5
102 Brunei 8657 A 5 5
103 Brunei 8658 A 5 5
104 Brunei 8659 A 5 5
105 Brunei 8660 C 5 5
106 Brunei 8661 A 5 5
107 Brunei 8662 T 5 5
108 Brunei 8663 A 5 5
109 Brunei 8664 C 5 5
110 Brunei 8665 T 5 5
111 Brunei 8666 G 5 5
112 Brunei 8667 A 5 5
113 Brunei 8668 C 5 5
114 Brunei 8669 T 5 5
115 Brunei 8670 T 5 5
116 Brunei 8671 T 5 5
117 Brunei 8672 T 5 5
118 Brunei 8673 C 5 5
119 Brunei 8674 A 5 5
120 Brunei 8675 A 5 5
121 Brunei 8676 G 5 5
122 Brunei 8677 T 5 5
123 Brunei 8678 G 5 5
124 Brunei 8679 A 5 5
125 Brunei 8680 A 5 5
126 Brunei 8681 A 5 5
127 Brunei 8682 T 5 5
128 Brunei 8683 C 5 5
129 Brunei 8684 A 5 5
130 Brunei 8685 T 5 5
131 Brunei 8686 A 5 5
132 Brunei 8687 G 5 5
133 Brunei 8688 G 5 5
134 Brunei 8689 A 5 5
135 Brunei 8690 T 5 5
136 Brunei 8691 A 5 5
137 Brunei 8692 C 5 5
138 Brunei 8693 A 5 5
139 Brunei 8694 A 5 5
140 Brunei 8695 G 5 5
141 Brunei 8696 G 5 5
142 Brunei 8697 C 5 5
143 Brunei 8698 T 5 5
144 Brunei 8699 A 5 5
145 Brunei 8700 T 5 5
146 Brunei 8701 T 5 5
147 Brunei 8702 G 5 5
148 Brunei 8703 A 5 5
149 Brunei 8704 T 5 5
150 Brunei 8705 G 5 5
151 Brunei 8706 G 5 5
152 Brunei 8707 T 5 5
153 Brunei 8708 G 5 5
154 Brunei 8709 G 5 5
155 Brunei 8710 T 5 5
156 Brunei 8711 G 5 5
157 Brunei 8712 T 5 5
158 Brunei 8713 C 5 5
159 Brunei 8714 A 5 5
160 Brunei 8715 C 5 5
161 Brunei 8716 T 5 5
162 Brunei 8717 C 5 5
163 Brunei 8718 G 5 5
164 Brunei 8719 T 5 5
165 Brunei 8720 G 5 5
166 Brunei 8721 A 5 5
167 Brunei 8722 C 5 5
168 Brunei 8723 A 5 5
169 Brunei 8724 T 5 5
170 Brunei 8725 A 5 5
171 Brunei 8726 G 5 5
172 Brunei 8727 C 5 5
173 Brunei 8728 A 5 5
174 Brunei 8729 T 5 5
175 Brunei 8730 C 5 5
176 Brunei 8731 T 5 5
177 Brunei 8732 A 5 5
178 Brunei 8733 C 5 5
179 Brunei 8734 A 5 5
180 Brunei 8735 G 5 5
181 Brunei 8736 A 5 5
182 Brunei 8737 T 5 5
183 Brunei 8738 A 5 5
184 Brunei 8739 C 5 5
185 Brunei 8740 T 5 5
186 Brunei 8741 T 5 5
187 Brunei 8742 G 5 5
188 Brunei 8743 T 5 5
189 Brunei 8744 T 5 5
190 Brunei 8745 T 5 5
191 Brunei 8746 T 5 5
192 Brunei 8747 G 5 5
193 Brunei 8748 C 5 5
194 Brunei 8749 T 5 5
195 Brunei 8750 A 5 5
196 Brunei 8751 A 5 5
197 Brunei 8752 C 5 5
198 Brunei 8753 A 5 5
199 Brunei 8754 A 5 5
200 Brunei 8755 A 5 5
201 Brunei 8756 C 5 5
202 Brunei 8757 A 5 5
203 Brunei 8758 T 5 5
204 Brunei 8759 G 5 5
205 Brunei 8760 C 5 5
206 Brunei 8761 T 5 5
207 Brunei 8762 G 5 5
208 Brunei 8763 A 5 5
209 Brunei 8764 T 5 5
210 Brunei 8765 T 5 5
211 Brunei 8766 T 5 5
212 Brunei 8767 T 5 5
213 Brunei 8768 G 5 5
214 Brunei 8769 A 5 5
215 Brunei 8770 C 5 5
216 Brunei 8771 A 5 5
217 Brunei 8772 C 5 5
218 Brunei 8773 A 5 5
219 Brunei 8774 T 5 5
220 Brunei 8775 G 5 5
221 Brunei 8776 G 5 5
222 Brunei 8777 T 5 5
223 Brunei 8778 T 5 5
224 Brunei 8779 T 5 5
225 Brunei 8780 A 5 5
226 Brunei 8781 G 5 5
227 Brunei 8782 C 5 5
228 Brunei 8783 C 5 5
229 Brunei 8784 A 5 5
230 Brunei 8785 G 5 5
231 Brunei 8786 C 5 5
232 Brunei 8787 G 5 5
233 Brunei 8788 T 5 5
234 Brunei 8789 G 5 5
235 Brunei 8790 G 5 5
236 Brunei 8791 T 5 5
237 Brunei 8792 G 5 5
238 Brunei 8793 G 5 5
239 Brunei 8794 T 5 5
240 Brunei 8795 A 5 5
241 Brunei 8796 G 5 5
242 Brunei 8797 T 5 5
243 Brunei 8798 T 5 5
244 Brunei 8799 A 5 5
245 Brunei 8800 T 5 5
246 Brunei 8801 A 5 5
247 Brunei 8802 C 5 5
248 Brunei 8803 T 5 5
249 Brunei 8804 A 5 5
250 Brunei 8805 A 5 5
251 Brunei 8806 T 5 5
252 Brunei 8807 G 5 5
253 Brunei 8808 A 5 5
254 Brunei 8809 C 5 5
255 Brunei 8810 A 5 5
256 Brunei 8811 A 5 5
257 Brunei 8812 A 5 5
258 Brunei 8813 G 5 5
259 Brunei 8814 C 5 5
260 Brunei 8815 T 5 5
261 Brunei 8816 T 5 5
262 Brunei 8817 G 5 5
263 Brunei 8818 C 5 5
264 Brunei 8819 C 5 5
265 Brunei 8820 C 5 5
266 Brunei 8821 A 5 5
267 Brunei 8822 T 5 5
268 Brunei 8823 T 5 5
269 Brunei 8824 G 5 5
270 Brunei 8825 A 5 5
271 Brunei 8826 T 5 5
272 Brunei 8827 T 5 5
273 Brunei 8828 G 5 5
274 Brunei 8829 C 5 5
275 Brunei 8830 T 5 5
276 Brunei 8831 G 5 5
277 Brunei 8832 C 5 5
278 Brunei 8833 A 5 5
279 Brunei 8834 G 5 5
280 Brunei 8835 T 5 5
281 Brunei 8836 C 5 5
282 Brunei 8837 A 5 5
283 Brunei 8838 T 5 5
284 Brunei 8839 A 5 5
285 Brunei 8840 A 5 5
286 Brunei 8841 C 5 5
287 Brunei 8842 A 5 5
288 Brunei 8843 A 5 5
289 Brunei 8844 G 5 5
290 Brunei 8845 A 5 5
291 Brunei 8846 G 5 5
292 Brunei 8847 A 5 5
293 Brunei 8848 A 5 5
294 Brunei 8849 G 5 5
295 Brunei 8850 T 5 5
296 Brunei 8851 G 5 5
297 Brunei 8852 G 5 5
298 Brunei 8853 G 5 5
299 Brunei 8854 T 5 5
300 Brunei 8855 T 5 5
301 Brunei 8856 T 5 5
302 Brunei 8857 T 5 5
303 Brunei 8858 G 5 5
304 Brunei 8859 T 5 5
305 Brunei 8860 C 5 5
306 Brunei 8861 G 5 5
307 Brunei 8862 T 5 5
308 Brunei 8863 G 5 5
309 Brunei 8864 C 5 5
310 Brunei 8865 C 5 5
311 Brunei 8866 T 5 5
312 Brunei 8867 G 5 5
313 Brunei 8868 G 5 5
314 Brunei 8869 T 5 5
315 Brunei 8870 T 5 5
316 Brunei 8871 T 5 5
317 Brunei 8872 G 5 5
318 Brunei 8873 C 5 5
319 Brunei 8874 C 5 5
320 Brunei 8875 T 5 5
321 Brunei 8876 G 5 5
322 Brunei 8877 G 5 5
323 Brunei 8878 C 5 5
324 Brunei 8879 A 5 5
325 Brunei 8880 C 5 5
326 Brunei 8881 G 5 5
327 Brunei 8882 A 5 5
328 Brunei 8883 T 5 5
329 Brunei 8884 A 5 5
330 Brunei 8885 T 5 5
331 Brunei 8886 T 5 5
332 Brunei 8887 A 5 5
333 Brunei 8888 C 5 5
334 Brunei 8889 G 5 5
335 Brunei 8890 C 5 5
336 Brunei 8891 A 5 5
337 Brunei 8892 C 5 5
338 Brunei 8893 A 5 5
339 Brunei 8894 A 5 5
340 Brunei 8895 C 5 5
341 Brunei 8896 T 5 5
342 Brunei 8897 A 5 5
343 Brunei 8898 A 5 5
344 Brunei 8899 T 5 5
345 Brunei 8900 G 5 5
346 Brunei 8901 G 5 5
347 Brunei 8902 T 5 5
348 Brunei 8903 G 5 5
349 Brunei 8904 A 5 5
350 Brunei 8905 C 5 5
351 Brunei 8906 T 5 5
352 Brunei 8907 T 5 5
353 Brunei 8908 T 5 5
354 Brunei 8909 T 5 5
355 Brunei 8910 T 5 5
356 Brunei 8911 G 5 5
357 Brunei 8912 C 5 5
358 Brunei 8913 A 5 5
359 Brunei 8914 T 5 5
360 Brunei 8915 T 5 5
361 Brunei 8916 T 5 5
362 Brunei 8917 C 5 5
363 Brunei 8918 T 5 5
364 Brunei 8919 T 5 5
365 Brunei 8920 A 5 5
366 Brunei 8921 C 5 5
367 Brunei 8922 C 5 5
368 Brunei 8923 T 5 5
369 Brunei 8924 A 5 5
370 Brunei 8925 G 5 5
371 Brunei 8926 A 5 5
372 Brunei 8927 G 5 5
373 Brunei 8928 T 5 5
374 Brunei 8929 T 5 5
375 Brunei 8930 T 5 5
376 Brunei 8931 T 5 5
377 Brunei 8932 T 5 5
378 Brunei 8933 A 5 5
379 Brunei 8934 G 5 5
380 Brunei 8935 T 5 5
381 Brunei 8936 G 5 5
382 Brunei 8937 C 5 5
383 Brunei 8938 A 5 5
384 Brunei 8939 G 5 5
385 Brunei 8940 T 5 5
386 Brunei 8941 T 5 5
387 Brunei 8942 G 5 5
388 Brunei 8943 G 5 5
389 Brunei 8944 T 5 5
390 Brunei 8945 A 5 5
391 Brunei 8946 A 5 5
392 Brunei 8947 C 5 5
393 Brunei 8948 A 5 5
394 Brunei 8949 T 5 5
395 Brunei 8950 C 5 5
396 Brunei 8951 T 5 5
397 Brunei 8952 G 5 5
398 Brunei 8953 T 5 5
399 Brunei 8954 T 5 5
400 Brunei 8955 A 5 5
401 Brunei 8956 C 5 5
402 Brunei 8957 A 5 5
403 Brunei 8958 C 5 5
404 Brunei 8959 A 5 5
405 Brunei 8960 C 5 5
406 Brunei 8961 C 5 5
407 Brunei 8962 A 5 5
408 Brunei 8963 T 5 5
409 Brunei 8964 C 5 5
410 Brunei 8965 A 5 5
411 Brunei 8966 A 5 5
412 Brunei 8967 A 5 5
413 Brunei 8968 A 5 5
414 Brunei 8969 C 5 5
415 Brunei 8970 T 5 5
416 Brunei 8971 T 5 5
417 Brunei 8972 A 5 5
418 Brunei 8973 T 5 5
419 Brunei 8974 A 5 5
420 Brunei 8975 G 5 5
421 Brunei 8976 A 5 5
422 Brunei 8977 G 5 5
423 Brunei 8978 T 5 5
424 Brunei 8979 A 5 5
425 Brunei 8980 C 5 5
426 Brunei 8981 A 5 5
427 Brunei 8982 C 5 5
428 Brunei 8983 T 5 5
429 Brunei 8984 G 5 5
430 Brunei 8985 A 5 5
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1370 Brunei 9925 A 5 5
1371 Brunei 9926 A 5 5
1372 Brunei 9927 T 5 5
1373 Brunei 9928 G 5 5
1374 Brunei 9929 G 5 5
1375 Brunei 9930 A 5 4
1376 Brunei 9931 T 5 5
1377 Brunei 9932 A 5 5
1378 Brunei 9933 C 5 5
1379 Brunei 9934 A 5 5
1380 Brunei 9935 A 5 5
1381 Brunei 9936 C 5 5
1382 Brunei 9937 T 5 5
1383 Brunei 9938 A 5 5
1384 Brunei 9939 G 5 5
1385 Brunei 9940 C 5 5
1386 Brunei 9941 T 5 5
1387 Brunei 9942 A 5 5
1388 Brunei 9943 C 5 5
1389 Brunei 9944 A 5 5
1390 Brunei 9945 G 5 5
1391 Brunei 9946 A 5 5
1392 Brunei 9947 G 5 5
1393 Brunei 9948 A 5 5
1394 Brunei 9949 A 5 5
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1400 Brunei 9955 T 5 5
1401 Brunei 9956 T 5 5
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1403 Brunei 9958 T 5 5
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1445 Brunei 10000 T 5 5
1446 Brunei 10001 T 5 5
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1451 Brunei 10006 T 5 5
1452 Brunei 10007 G 5 5
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1454 Brunei 10009 T 5 5
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1457 Brunei 10012 T 5 5
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1461 Brunei 10016 C 5 5
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1464 Brunei 10019 C 5 5
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1466 Brunei 10021 A 5 5
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1469 Brunei 10024 A 5 5
1470 Brunei 10025 C 5 5
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1472 Brunei 10027 A 5 5
1473 Brunei 10028 A 5 5
1474 Brunei 10029 C 5 5
1475 Brunei 10030 C 5 5
1476 Brunei 10031 T 5 5
1477 Brunei 10032 C 5 5
1478 Brunei 10033 T 5 5
1479 Brunei 10034 A 5 5
1480 Brunei 10035 T 5 5
1481 Brunei 10036 C 5 5
1482 Brunei 10037 A 5 5
1483 Brunei 10038 C 5 5
1484 Brunei 10039 C 5 5
1485 Brunei 10040 T 5 5
1486 Brunei 10041 C 5 5
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1488 Brunei 10043 G 5 5
1489 Brunei 10044 C 5 5
1490 Brunei 10045 T 5 5
1491 Brunei 10046 G 5 5
1492 Brunei 10047 T 5 5
1493 Brunei 10048 T 5 5
1494 Brunei 10049 T 5 5
1495 Brunei 10050 T 5 5
1496 Brunei 10051 G 5 5
1497 Brunei 10052 C 5 5
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1499 Brunei 10054 G 5 5