National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   691                                        
?                                            
A   49                                        
C   24                                        
D   42                                        
E   30                                        
F   45                                        
G   45                                        
H   15                                        
I   48                                        
K   30                                        
L   48                                        
M   6                                        
N   24                                        
P   30                                        
Q   9                                        
R   30                                        
S   48                                        
T   66                                        
V   63                                        
W   6                                        
Y   33                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 8555 A 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 8556 A 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 8557 A 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 8558 A 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 8559 T 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 8560 T 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 8561 G 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 8562 T 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 8563 T 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 8564 A 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 8565 A 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 8566 T 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 8567 A 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 8568 A 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 8569 T 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 8570 T 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 8571 G 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 8572 G 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 8573 T 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 8574 T 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 8575 G 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 8576 A 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 8577 A 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 8578 G 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 8579 C 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 8580 A 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 8581 G 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 8582 T 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 8583 T 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 8584 A 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 8585 A 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 8586 T 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 8587 T 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 8588 A 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 8589 A 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 8590 A 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 8591 G 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 8592 T 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 8593 T 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 8594 A 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 8595 C 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 8596 A 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 8597 C 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 8598 T 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 8599 T 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 8600 G 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 8601 T 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 8602 G 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 8603 T 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 8604 T 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 8605 C 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 8606 C 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 8607 T 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 8608 T 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 8609 T 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 8610 T 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 8611 T 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 8612 G 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 8613 T 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 8614 T 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 8615 G 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 8616 C 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 8617 T 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 8618 G 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 8619 C 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 8620 T 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 8621 A 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 8622 T 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 8623 T 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 8624 T 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 8625 T 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 8626 C 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 8627 T 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 8628 A 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 8629 T 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 8630 T 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 8631 T 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 8632 A 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 8633 A 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 8634 T 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 8635 A 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 8636 A 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 8637 C 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 8638 A 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 8639 C 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 8640 C 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 8641 T 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 8642 G 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 8643 T 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 8644 T 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 8645 C 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 8646 A 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 8647 T 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 8648 G 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 8649 T 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 8650 C 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 8651 A 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 8652 T 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 8653 G 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 8654 T 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 8655 C 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 8656 T 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 8657 A 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 8658 A 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 8659 A 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 8660 C 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 8661 A 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 8662 T 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 8663 A 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 8664 C 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 8665 T 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 8666 G 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 8667 A 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 8668 C 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 8669 T 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 8670 T 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 8671 T 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 8672 T 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 8673 C 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 8674 A 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 8675 A 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 8676 G 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 8677 T 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 8678 G 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 8679 A 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 8680 A 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 8681 A 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 8682 T 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 8683 C 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 8684 A 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 8685 T 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 8686 A 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 8687 G 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 8688 G 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 8689 A 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 8690 T 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 8691 A 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 8692 C 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 8693 A 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 8694 A 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 8695 G 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 8696 G 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 8697 C 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 8698 T 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 8699 A 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 8700 T 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 8701 T 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 8702 G 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 8703 A 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 8704 T 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 8705 G 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 8706 G 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 8707 T 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 8708 G 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 8709 G 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 8710 T 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 8711 G 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 8712 T 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 8713 C 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 8714 A 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 8715 C 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 8716 T 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 8717 C 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 8718 G 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 8719 T 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 8720 G 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 8721 A 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 8722 C 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 8723 A 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 8724 T 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 8725 A 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 8726 G 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 8727 C 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 8728 A 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 8729 T 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 8730 C 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 8731 T 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 8732 A 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 8733 C 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 8734 A 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 8735 G 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 8736 A 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 8737 T 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 8738 A 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 8739 C 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 8740 T 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 8741 T 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 8742 G 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 8743 T 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 8744 T 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 8745 T 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 8746 T 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 8747 G 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 8748 C 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 8749 T 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 8750 A 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 8751 A 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 8752 C 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 8753 A 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 8754 A 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 8755 A 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 8756 C 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 8757 A 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 8758 T 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 8759 G 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 8760 C 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 8761 T 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 8762 G 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 8763 A 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 8764 T 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 8765 T 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 8766 T 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 8767 T 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 8768 G 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 8769 A 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 8770 C 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 8771 A 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 8772 C 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 8773 A 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 8774 T 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 8775 G 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 8776 G 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 8777 T 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 8778 T 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 8779 T 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 8780 A 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 8781 G 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 8782 C 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 8783 C 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 8784 A 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 8785 G 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 8786 C 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 8787 G 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 8788 T 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 8789 G 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 8790 G 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 8791 T 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 8792 G 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 8793 G 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 8794 T 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 8795 A 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 8796 G 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 8797 T 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 8798 T 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 8799 A 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 8800 T 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 8801 A 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 8802 C 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 8803 T 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 8804 A 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 8805 A 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 8806 T 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 8807 G 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 8808 A 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 8809 C 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 8810 A 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 8811 A 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 8812 A 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 8813 G 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 8814 C 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 8815 T 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 8816 T 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 8817 G 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 8818 C 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 8819 C 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 8820 C 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 8821 A 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 8822 T 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 8823 T 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 8824 G 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 8825 A 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 8826 T 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 8827 T 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 8828 G 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 8829 C 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 8830 T 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 8831 G 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 8832 C 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 8833 A 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 8834 G 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 8835 T 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 8836 C 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 8837 A 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 8838 T 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 8839 A 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 8840 A 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 8841 C 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 8842 A 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 8843 A 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 8844 G 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 8845 A 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 8846 G 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 8847 A 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 8848 A 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 8849 G 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 8850 T 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 8851 G 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 8852 G 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 8853 G 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 8854 T 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 8855 T 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 8856 T 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 8857 T 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 8858 G 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 8859 T 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 8860 C 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 8861 G 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 8862 T 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 8863 G 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 8864 C 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 8865 C 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 8866 T 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 8867 G 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 8868 G 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 8869 T 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 8870 T 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 8871 T 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 8872 G 1 1
318 Antigua_and_Barbuda 8873 C 1 1
319 Antigua_and_Barbuda 8874 C 1 1
320 Antigua_and_Barbuda 8875 T 1 1
321 Antigua_and_Barbuda 8876 G 1 1
322 Antigua_and_Barbuda 8877 G 1 1
323 Antigua_and_Barbuda 8878 C 1 1
324 Antigua_and_Barbuda 8879 A 1 1
325 Antigua_and_Barbuda 8880 C 1 1
326 Antigua_and_Barbuda 8881 G 1 1
327 Antigua_and_Barbuda 8882 A 1 1
328 Antigua_and_Barbuda 8883 T 1 1
329 Antigua_and_Barbuda 8884 A 1 1
330 Antigua_and_Barbuda 8885 T 1 1
331 Antigua_and_Barbuda 8886 T 1 1
332 Antigua_and_Barbuda 8887 A 1 1
333 Antigua_and_Barbuda 8888 C 1 1
334 Antigua_and_Barbuda 8889 G 1 1
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