National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   1,500                                        
?                                            
A   108                                        
C   48                                        
D   66                                        
E   45                                        
F   111                                        
G   81                                        
H   27                                        
I   90                                        
K   51                                        
L   147                                        
M   27                                        
N   63                                        
P   60                                        
Q   27                                        
R   60                                        
S   114                                        
T   123                                        
V   138                                        
W   18                                        
Y   96                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Andorra 8555 A 1 1
1 Andorra 8556 A 1 1
2 Andorra 8557 A 1 1
3 Andorra 8558 A 1 1
4 Andorra 8559 T 1 1
5 Andorra 8560 T 1 1
6 Andorra 8561 G 1 1
7 Andorra 8562 T 1 1
8 Andorra 8563 T 1 1
9 Andorra 8564 A 1 1
10 Andorra 8565 A 1 1
11 Andorra 8566 T 1 1
12 Andorra 8567 A 1 1
13 Andorra 8568 A 1 1
14 Andorra 8569 T 1 1
15 Andorra 8570 T 1 1
16 Andorra 8571 G 1 1
17 Andorra 8572 G 1 1
18 Andorra 8573 T 1 1
19 Andorra 8574 T 1 1
20 Andorra 8575 G 1 1
21 Andorra 8576 A 1 1
22 Andorra 8577 A 1 1
23 Andorra 8578 G 1 1
24 Andorra 8579 C 1 1
25 Andorra 8580 A 1 1
26 Andorra 8581 G 1 1
27 Andorra 8582 T 1 1
28 Andorra 8583 T 1 1
29 Andorra 8584 A 1 1
30 Andorra 8585 A 1 1
31 Andorra 8586 T 1 1
32 Andorra 8587 T 1 1
33 Andorra 8588 A 1 1
34 Andorra 8589 A 1 1
35 Andorra 8590 A 1 1
36 Andorra 8591 G 1 1
37 Andorra 8592 T 1 1
38 Andorra 8593 T 1 1
39 Andorra 8594 A 1 1
40 Andorra 8595 C 1 1
41 Andorra 8596 A 1 1
42 Andorra 8597 C 1 1
43 Andorra 8598 T 1 1
44 Andorra 8599 T 1 1
45 Andorra 8600 G 1 1
46 Andorra 8601 T 1 1
47 Andorra 8602 G 1 1
48 Andorra 8603 T 1 1
49 Andorra 8604 T 1 1
50 Andorra 8605 C 1 1
51 Andorra 8606 C 1 1
52 Andorra 8607 T 1 1
53 Andorra 8608 T 1 1
54 Andorra 8609 T 1 1
55 Andorra 8610 T 1 1
56 Andorra 8611 T 1 1
57 Andorra 8612 G 1 1
58 Andorra 8613 T 1 1
59 Andorra 8614 T 1 1
60 Andorra 8615 G 1 1
61 Andorra 8616 C 1 1
62 Andorra 8617 T 1 1
63 Andorra 8618 G 1 1
64 Andorra 8619 C 1 1
65 Andorra 8620 T 1 1
66 Andorra 8621 A 1 1
67 Andorra 8622 T 1 1
68 Andorra 8623 T 1 1
69 Andorra 8624 T 1 1
70 Andorra 8625 T 1 1
71 Andorra 8626 C 1 1
72 Andorra 8627 T 1 1
73 Andorra 8628 A 1 1
74 Andorra 8629 T 1 1
75 Andorra 8630 T 1 1
76 Andorra 8631 T 1 1
77 Andorra 8632 A 1 1
78 Andorra 8633 A 1 1
79 Andorra 8634 T 1 1
80 Andorra 8635 A 1 1
81 Andorra 8636 A 1 1
82 Andorra 8637 C 1 1
83 Andorra 8638 A 1 1
84 Andorra 8639 C 1 1
85 Andorra 8640 C 1 1
86 Andorra 8641 T 1 1
87 Andorra 8642 G 1 1
88 Andorra 8643 T 1 1
89 Andorra 8644 T 1 1
90 Andorra 8645 C 1 1
91 Andorra 8646 A 1 1
92 Andorra 8647 T 1 1
93 Andorra 8648 G 1 1
94 Andorra 8649 T 1 1
95 Andorra 8650 C 1 1
96 Andorra 8651 A 1 1
97 Andorra 8652 T 1 1
98 Andorra 8653 G 1 1
99 Andorra 8654 T 1 1
100 Andorra 8655 C 1 1
101 Andorra 8656 T 1 1
102 Andorra 8657 A 1 1
103 Andorra 8658 A 1 1
104 Andorra 8659 A 1 1
105 Andorra 8660 C 1 1
106 Andorra 8661 A 1 1
107 Andorra 8662 T 1 1
108 Andorra 8663 A 1 1
109 Andorra 8664 C 1 1
110 Andorra 8665 T 1 1
111 Andorra 8666 G 1 1
112 Andorra 8667 A 1 1
113 Andorra 8668 C 1 1
114 Andorra 8669 T 1 1
115 Andorra 8670 T 1 1
116 Andorra 8671 T 1 1
117 Andorra 8672 T 1 1
118 Andorra 8673 C 1 1
119 Andorra 8674 A 1 1
120 Andorra 8675 A 1 1
121 Andorra 8676 G 1 1
122 Andorra 8677 T 1 1
123 Andorra 8678 G 1 1
124 Andorra 8679 A 1 1
125 Andorra 8680 A 1 1
126 Andorra 8681 A 1 1
127 Andorra 8682 T 1 1
128 Andorra 8683 C 1 1
129 Andorra 8684 A 1 1
130 Andorra 8685 T 1 1
131 Andorra 8686 A 1 1
132 Andorra 8687 G 1 1
133 Andorra 8688 G 1 1
134 Andorra 8689 A 1 1
135 Andorra 8690 T 1 1
136 Andorra 8691 A 1 1
137 Andorra 8692 C 1 1
138 Andorra 8693 A 1 1
139 Andorra 8694 A 1 1
140 Andorra 8695 G 1 1
141 Andorra 8696 G 1 1
142 Andorra 8697 C 1 1
143 Andorra 8698 T 1 1
144 Andorra 8699 A 1 1
145 Andorra 8700 T 1 1
146 Andorra 8701 T 1 1
147 Andorra 8702 G 1 1
148 Andorra 8703 A 1 1
149 Andorra 8704 T 1 1
150 Andorra 8705 G 1 1
151 Andorra 8706 G 1 1
152 Andorra 8707 T 1 1
153 Andorra 8708 G 1 1
154 Andorra 8709 G 1 1
155 Andorra 8710 T 1 1
156 Andorra 8711 G 1 1
157 Andorra 8712 T 1 1
158 Andorra 8713 C 1 1
159 Andorra 8714 A 1 1
160 Andorra 8715 C 1 1
161 Andorra 8716 T 1 1
162 Andorra 8717 C 1 1
163 Andorra 8718 G 1 1
164 Andorra 8719 T 1 1
165 Andorra 8720 G 1 1
166 Andorra 8721 A 1 1
167 Andorra 8722 C 1 1
168 Andorra 8723 A 1 1
169 Andorra 8724 T 1 1
170 Andorra 8725 A 1 1
171 Andorra 8726 G 1 1
172 Andorra 8727 C 1 1
173 Andorra 8728 A 1 1
174 Andorra 8729 T 1 1
175 Andorra 8730 C 1 1
176 Andorra 8731 T 1 1
177 Andorra 8732 A 1 1
178 Andorra 8733 C 1 1
179 Andorra 8734 A 1 1
180 Andorra 8735 G 1 1
181 Andorra 8736 A 1 1
182 Andorra 8737 T 1 1
183 Andorra 8738 A 1 1
184 Andorra 8739 C 1 1
185 Andorra 8740 T 1 1
186 Andorra 8741 T 1 1
187 Andorra 8742 G 1 1
188 Andorra 8743 T 1 1
189 Andorra 8744 T 1 1
190 Andorra 8745 T 1 1
191 Andorra 8746 T 1 1
192 Andorra 8747 G 1 1
193 Andorra 8748 C 1 1
194 Andorra 8749 T 1 1
195 Andorra 8750 A 1 1
196 Andorra 8751 A 1 1
197 Andorra 8752 C 1 1
198 Andorra 8753 A 1 1
199 Andorra 8754 A 1 1
200 Andorra 8755 A 1 1
201 Andorra 8756 C 1 1
202 Andorra 8757 A 1 1
203 Andorra 8758 T 1 1
204 Andorra 8759 G 1 1
205 Andorra 8760 C 1 1
206 Andorra 8761 T 1 1
207 Andorra 8762 G 1 1
208 Andorra 8763 A 1 1
209 Andorra 8764 T 1 1
210 Andorra 8765 T 1 1
211 Andorra 8766 T 1 1
212 Andorra 8767 T 1 1
213 Andorra 8768 G 1 1
214 Andorra 8769 A 1 1
215 Andorra 8770 C 1 1
216 Andorra 8771 A 1 1
217 Andorra 8772 C 1 1
218 Andorra 8773 A 1 1
219 Andorra 8774 T 1 1
220 Andorra 8775 G 1 1
221 Andorra 8776 G 1 1
222 Andorra 8777 T 1 1
223 Andorra 8778 T 1 1
224 Andorra 8779 T 1 1
225 Andorra 8780 A 1 1
226 Andorra 8781 G 1 1
227 Andorra 8782 C 1 1
228 Andorra 8783 C 1 1
229 Andorra 8784 A 1 1
230 Andorra 8785 G 1 1
231 Andorra 8786 C 1 1
232 Andorra 8787 G 1 1
233 Andorra 8788 T 1 1
234 Andorra 8789 G 1 1
235 Andorra 8790 G 1 1
236 Andorra 8791 T 1 1
237 Andorra 8792 G 1 1
238 Andorra 8793 G 1 1
239 Andorra 8794 T 1 1
240 Andorra 8795 A 1 1
241 Andorra 8796 G 1 1
242 Andorra 8797 T 1 1
243 Andorra 8798 T 1 1
244 Andorra 8799 A 1 1
245 Andorra 8800 T 1 1
246 Andorra 8801 A 1 1
247 Andorra 8802 C 1 1
248 Andorra 8803 T 1 1
249 Andorra 8804 A 1 1
250 Andorra 8805 A 1 1
251 Andorra 8806 T 1 1
252 Andorra 8807 G 1 1
253 Andorra 8808 A 1 1
254 Andorra 8809 C 1 1
255 Andorra 8810 A 1 1
256 Andorra 8811 A 1 1
257 Andorra 8812 A 1 1
258 Andorra 8813 G 1 1
259 Andorra 8814 C 1 1
260 Andorra 8815 T 1 1
261 Andorra 8816 T 1 1
262 Andorra 8817 G 1 1
263 Andorra 8818 C 1 1
264 Andorra 8819 C 1 1
265 Andorra 8820 C 1 1
266 Andorra 8821 A 1 1
267 Andorra 8822 T 1 1
268 Andorra 8823 T 1 1
269 Andorra 8824 G 1 1
270 Andorra 8825 A 1 1
271 Andorra 8826 T 1 1
272 Andorra 8827 T 1 1
273 Andorra 8828 G 1 1
274 Andorra 8829 C 1 1
275 Andorra 8830 T 1 1
276 Andorra 8831 G 1 1
277 Andorra 8832 C 1 1
278 Andorra 8833 A 1 1
279 Andorra 8834 G 1 1
280 Andorra 8835 T 1 1
281 Andorra 8836 C 1 1
282 Andorra 8837 A 1 1
283 Andorra 8838 T 1 1
284 Andorra 8839 A 1 1
285 Andorra 8840 A 1 1
286 Andorra 8841 C 1 1
287 Andorra 8842 A 1 1
288 Andorra 8843 A 1 1
289 Andorra 8844 G 1 1
290 Andorra 8845 A 1 1
291 Andorra 8846 G 1 1
292 Andorra 8847 A 1 1
293 Andorra 8848 A 1 1
294 Andorra 8849 G 1 1
295 Andorra 8850 T 1 1
296 Andorra 8851 G 1 1
297 Andorra 8852 G 1 1
298 Andorra 8853 G 1 1
299 Andorra 8854 T 1 1
300 Andorra 8855 T 1 1
301 Andorra 8856 T 1 1
302 Andorra 8857 T 1 1
303 Andorra 8858 G 1 1
304 Andorra 8859 T 1 1
305 Andorra 8860 C 1 1
306 Andorra 8861 G 1 1
307 Andorra 8862 T 1 1
308 Andorra 8863 G 1 1
309 Andorra 8864 C 1 1
310 Andorra 8865 C 1 1
311 Andorra 8866 T 1 1
312 Andorra 8867 G 1 1
313 Andorra 8868 G 1 1
314 Andorra 8869 T 1 1
315 Andorra 8870 T 1 1
316 Andorra 8871 T 1 1
317 Andorra 8872 G 1 1
318 Andorra 8873 C 1 1
319 Andorra 8874 C 1 1
320 Andorra 8875 T 1 1
321 Andorra 8876 G 1 1
322 Andorra 8877 G 1 1
323 Andorra 8878 C 1 1
324 Andorra 8879 A 1 1
325 Andorra 8880 C 1 1
326 Andorra 8881 G 1 1
327 Andorra 8882 A 1 1
328 Andorra 8883 T 1 1
329 Andorra 8884 A 1 1
330 Andorra 8885 T 1 1
331 Andorra 8886 T 1 1
332 Andorra 8887 A 1 1
333 Andorra 8888 C 1 1
334 Andorra 8889 G 1 1
335 Andorra 8890 C 1 1
336 Andorra 8891 A 1 1
337 Andorra 8892 C 1 1
338 Andorra 8893 A 1 1
339 Andorra 8894 A 1 1
340 Andorra 8895 C 1 1
341 Andorra 8896 T 1 1
342 Andorra 8897 A 1 1
343 Andorra 8898 A 1 1
344 Andorra 8899 T 1 1
345 Andorra 8900 G 1 1
346 Andorra 8901 G 1 1
347 Andorra 8902 T 1 1
348 Andorra 8903 G 1 1
349 Andorra 8904 A 1 1
350 Andorra 8905 C 1 1
351 Andorra 8906 T 1 1
352 Andorra 8907 T 1 1
353 Andorra 8908 T 1 1
354 Andorra 8909 T 1 1
355 Andorra 8910 T 1 1
356 Andorra 8911 G 1 1
357 Andorra 8912 C 1 1
358 Andorra 8913 A 1 1
359 Andorra 8914 T 1 1
360 Andorra 8915 T 1 1
361 Andorra 8916 T 1 1
362 Andorra 8917 C 1 1
363 Andorra 8918 T 1 1
364 Andorra 8919 T 1 1
365 Andorra 8920 A 1 1
366 Andorra 8921 C 1 1
367 Andorra 8922 C 1 1
368 Andorra 8923 T 1 1
369 Andorra 8924 A 1 1
370 Andorra 8925 G 1 1
371 Andorra 8926 A 1 1
372 Andorra 8927 G 1 1
373 Andorra 8928 T 1 1
374 Andorra 8929 T 1 1
375 Andorra 8930 T 1 1
376 Andorra 8931 T 1 1
377 Andorra 8932 T 1 1
378 Andorra 8933 A 1 1
379 Andorra 8934 G 1 1
380 Andorra 8935 T 1 1
381 Andorra 8936 G 1 1
382 Andorra 8937 C 1 1
383 Andorra 8938 A 1 1
384 Andorra 8939 G 1 1
385 Andorra 8940 T 1 1
386 Andorra 8941 T 1 1
387 Andorra 8942 G 1 1
388 Andorra 8943 G 1 1
389 Andorra 8944 T 1 1
390 Andorra 8945 A 1 1
391 Andorra 8946 A 1 1
392 Andorra 8947 C 1 1
393 Andorra 8948 A 1 1
394 Andorra 8949 T 1 1
395 Andorra 8950 C 1 1
396 Andorra 8951 T 1 1
397 Andorra 8952 G 1 1
398 Andorra 8953 T 1 1
399 Andorra 8954 T 1 1
400 Andorra 8955 A 1 1
401 Andorra 8956 C 1 1
402 Andorra 8957 A 1 1
403 Andorra 8958 C 1 1
404 Andorra 8959 A 1 1
405 Andorra 8960 C 1 1
406 Andorra 8961 C 1 1
407 Andorra 8962 A 1 1
408 Andorra 8963 T 1 1
409 Andorra 8964 C 1 1
410 Andorra 8965 A 1 1
411 Andorra 8966 A 1 1
412 Andorra 8967 A 1 1
413 Andorra 8968 A 1 1
414 Andorra 8969 C 1 1
415 Andorra 8970 T 1 1
416 Andorra 8971 T 1 1
417 Andorra 8972 A 1 1
418 Andorra 8973 T 1 1
419 Andorra 8974 A 1 1
420 Andorra 8975 G 1 1
421 Andorra 8976 A 1 1
422 Andorra 8977 G 1 1
423 Andorra 8978 T 1 1
424 Andorra 8979 A 1 1
425 Andorra 8980 C 1 1
426 Andorra 8981 A 1 1
427 Andorra 8982 C 1 1
428 Andorra 8983 T 1 1
429 Andorra 8984 G 1 1
430 Andorra 8985 A 1 1
431 Andorra 8986 C 1 1
432 Andorra 8987 T 1 1
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1380 Andorra 9935 A 1 1
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1386 Andorra 9941 T 1 1
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