National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   5,835                                        
?                                            
A   378                                 1      
C   153   1                                    
D   309                                        
E   357                                        
F   240                                        
G   294                                        
H   105                                        
I   291                                        
K   420                                        
L   534                                        
M   111                                        
N   339                                        
P   222                                        
Q   204                                        
R   135                                        
S   417                                        
T   492                 1                      
V   495                                        
W   54                                        
Y   285                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 2720 G 5 5
1 Brunei 2721 C 5 5
2 Brunei 2722 A 5 5
3 Brunei 2723 C 5 5
4 Brunei 2724 C 5 5
5 Brunei 2725 A 5 5
6 Brunei 2726 A 5 5
7 Brunei 2727 C 5 5
8 Brunei 2728 A 5 5
9 Brunei 2729 A 5 5
10 Brunei 2730 A 5 5
11 Brunei 2731 G 5 5
12 Brunei 2732 G 5 5
13 Brunei 2733 T 5 5
14 Brunei 2734 T 5 5
15 Brunei 2735 A 5 5
16 Brunei 2736 C 5 5
17 Brunei 2737 T 5 5
18 Brunei 2738 T 5 5
19 Brunei 2739 T 5 5
20 Brunei 2740 T 5 5
21 Brunei 2741 G 5 5
22 Brunei 2742 G 5 5
23 Brunei 2743 T 5 5
24 Brunei 2744 G 5 5
25 Brunei 2745 A 5 5
26 Brunei 2746 T 5 5
27 Brunei 2747 G 5 5
28 Brunei 2748 A 5 5
29 Brunei 2749 C 5 5
30 Brunei 2750 A 5 5
31 Brunei 2751 C 5 5
32 Brunei 2752 T 5 5
33 Brunei 2753 G 5 5
34 Brunei 2754 T 5 5
35 Brunei 2755 G 5 5
36 Brunei 2756 A 5 5
37 Brunei 2757 T 5 5
38 Brunei 2758 A 5 5
39 Brunei 2759 G 5 5
40 Brunei 2760 A 5 5
41 Brunei 2761 A 5 5
42 Brunei 2762 G 5 5
43 Brunei 2763 T 5 5
44 Brunei 2764 G 5 5
45 Brunei 2765 C 5 5
46 Brunei 2766 A 5 5
47 Brunei 2767 A 5 5
48 Brunei 2768 G 5 5
49 Brunei 2769 G 5 5
50 Brunei 2770 T 5 5
51 Brunei 2771 T 5 5
52 Brunei 2772 A 5 5
53 Brunei 2773 C 5 5
54 Brunei 2774 A 5 5
55 Brunei 2775 A 5 5
56 Brunei 2776 G 5 5
57 Brunei 2777 A 5 5
58 Brunei 2778 G 5 5
59 Brunei 2779 T 5 5
60 Brunei 2780 G 5 5
61 Brunei 2781 T 5 5
62 Brunei 2782 G 5 5
63 Brunei 2783 A 5 5
64 Brunei 2784 A 5 5
65 Brunei 2785 T 5 5
66 Brunei 2786 A 5 5
67 Brunei 2787 T 5 5
68 Brunei 2788 C 5 5
69 Brunei 2789 A 5 5
70 Brunei 2790 C 5 5
71 Brunei 2791 T 5 5
72 Brunei 2792 T 5 5
73 Brunei 2793 T 5 5
74 Brunei 2794 T 5 5
75 Brunei 2795 G 5 5
76 Brunei 2796 A 5 5
77 Brunei 2797 A 5 5
78 Brunei 2798 C 5 5
79 Brunei 2799 T 5 5
80 Brunei 2800 T 5 5
81 Brunei 2801 G 5 5
82 Brunei 2802 A 5 5
83 Brunei 2803 T 5 5
84 Brunei 2804 G 5 5
85 Brunei 2805 A 5 5
86 Brunei 2806 A 5 5
87 Brunei 2807 A 5 5
88 Brunei 2808 G 5 5
89 Brunei 2809 G 5 5
90 Brunei 2810 A 5 5
91 Brunei 2811 T 5 5
92 Brunei 2812 T 5 5
93 Brunei 2813 G 5 5
94 Brunei 2814 A 5 5
95 Brunei 2815 T 5 5
96 Brunei 2816 A 5 5
97 Brunei 2817 A 5 5
98 Brunei 2818 A 5 5
99 Brunei 2819 G 5 5
100 Brunei 2820 T 5 5
101 Brunei 2821 A 5 5
102 Brunei 2822 C 5 5
103 Brunei 2823 T 5 5
104 Brunei 2824 T 5 5
105 Brunei 2825 A 5 5
106 Brunei 2826 A 5 5
107 Brunei 2827 T 5 5
108 Brunei 2828 G 5 5
109 Brunei 2829 A 5 5
110 Brunei 2830 G 5 5
111 Brunei 2831 A 5 5
112 Brunei 2832 A 5 5
113 Brunei 2833 G 5 5
114 Brunei 2834 T 5 5
115 Brunei 2835 G 5 5
116 Brunei 2836 C 5 5
117 Brunei 2837 T 5 5
118 Brunei 2838 C 5 5
119 Brunei 2839 T 5 5
120 Brunei 2840 G 5 5
121 Brunei 2841 C 5 5
122 Brunei 2842 C 5 5
123 Brunei 2843 T 5 5
124 Brunei 2844 A 5 5
125 Brunei 2845 T 5 5
126 Brunei 2846 A 5 5
127 Brunei 2847 C 5 5
128 Brunei 2848 A 5 5
129 Brunei 2849 G 5 5
130 Brunei 2850 T 5 5
131 Brunei 2851 T 5 5
132 Brunei 2852 G 5 5
133 Brunei 2853 A 5 5
134 Brunei 2854 A 5 5
135 Brunei 2855 C 5 5
136 Brunei 2856 T 5 5
137 Brunei 2857 C 5 5
138 Brunei 2858 G 5 5
139 Brunei 2859 G 5 5
140 Brunei 2860 T 5 5
141 Brunei 2861 A 5 5
142 Brunei 2862 C 5 5
143 Brunei 2863 A 5 5
144 Brunei 2864 G 5 5
145 Brunei 2865 A 5 5
146 Brunei 2866 A 5 5
147 Brunei 2867 G 5 5
148 Brunei 2868 T 5 5
149 Brunei 2869 A 5 5
150 Brunei 2870 A 5 5
151 Brunei 2871 A 5 5
152 Brunei 2872 T 5 5
153 Brunei 2873 G 5 5
154 Brunei 2874 A 5 5
155 Brunei 2875 G 5 5
156 Brunei 2876 T 5 5
157 Brunei 2877 T 5 5
158 Brunei 2878 C 5 5
159 Brunei 2879 G 5 5
160 Brunei 2880 C 5 5
161 Brunei 2881 C 5 5
162 Brunei 2882 T 5 5
163 Brunei 2883 G 5 5
164 Brunei 2884 T 5 5
165 Brunei 2885 G 5 5
166 Brunei 2886 T 5 5
167 Brunei 2887 T 5 5
168 Brunei 2888 G 5 5
169 Brunei 2889 T 5 5
170 Brunei 2890 G 5 5
171 Brunei 2891 G 5 5
172 Brunei 2892 C 5 5
173 Brunei 2893 A 5 5
174 Brunei 2894 G 5 5
175 Brunei 2895 A 5 5
176 Brunei 2896 T 5 5
177 Brunei 2897 G A 5 2 Ala878Thr
178 Brunei 2898 C 5 5
179 Brunei 2899 T 5 5
180 Brunei 2900 G 5 5
181 Brunei 2901 T 5 5
182 Brunei 2902 C 5 5
183 Brunei 2903 A 5 5
184 Brunei 2904 T 5 5
185 Brunei 2905 A 5 5
186 Brunei 2906 A 5 5
187 Brunei 2907 A 5 5
188 Brunei 2908 A 5 5
189 Brunei 2909 A 5 5
190 Brunei 2910 C 5 5
191 Brunei 2911 T 5 5
192 Brunei 2912 T 5 5
193 Brunei 2913 T 5 5
194 Brunei 2914 G 5 5
195 Brunei 2915 C 5 5
196 Brunei 2916 A 5 5
197 Brunei 2917 A 5 5
198 Brunei 2918 C 5 5
199 Brunei 2919 C 5 5
200 Brunei 2920 A 5 5
201 Brunei 2921 G 5 5
202 Brunei 2922 T 5 5
203 Brunei 2923 A 5 5
204 Brunei 2924 T 5 5
205 Brunei 2925 C 5 5
206 Brunei 2926 T 5 5
207 Brunei 2927 G 5 5
208 Brunei 2928 A 5 5
209 Brunei 2929 A 5 5
210 Brunei 2930 T 5 5
211 Brunei 2931 T 5 5
212 Brunei 2932 A 5 5
213 Brunei 2933 C 5 5
214 Brunei 2934 T 5 5
215 Brunei 2935 T 5 5
216 Brunei 2936 A 5 5
217 Brunei 2937 C 5 5
218 Brunei 2938 A 5 5
219 Brunei 2939 C 5 5
220 Brunei 2940 C 5 5
221 Brunei 2941 A 5 5
222 Brunei 2942 C 5 5
223 Brunei 2943 T 5 5
224 Brunei 2944 G 5 5
225 Brunei 2945 G 5 5
226 Brunei 2946 G 5 5
227 Brunei 2947 C 5 5
228 Brunei 2948 A 5 5
229 Brunei 2949 T 5 5
230 Brunei 2950 T 5 5
231 Brunei 2951 G 5 5
232 Brunei 2952 A 5 5
233 Brunei 2953 T 5 5
234 Brunei 2954 T 5 5
235 Brunei 2955 T 5 5
236 Brunei 2956 A 5 5
237 Brunei 2957 G 5 5
238 Brunei 2958 A 5 5
239 Brunei 2959 T 5 5
240 Brunei 2960 G 5 5
241 Brunei 2961 A 5 5
242 Brunei 2962 G 5 5
243 Brunei 2963 T 5 5
244 Brunei 2964 G 5 5
245 Brunei 2965 G 5 5
246 Brunei 2966 A 5 5
247 Brunei 2967 G 5 5
248 Brunei 2968 T 5 5
249 Brunei 2969 A 5 5
250 Brunei 2970 T 5 5
251 Brunei 2971 G 5 5
252 Brunei 2972 G 5 5
253 Brunei 2973 C 5 5
254 Brunei 2974 T 5 5
255 Brunei 2975 A 5 5
256 Brunei 2976 C 5 5
257 Brunei 2977 A 5 5
258 Brunei 2978 T 5 5
259 Brunei 2979 A 5 5
260 Brunei 2980 C 5 5
261 Brunei 2981 T 5 5
262 Brunei 2982 A 5 5
263 Brunei 2983 C 5 5
264 Brunei 2984 T 5 5
265 Brunei 2985 T 5 5
266 Brunei 2986 A 5 5
267 Brunei 2987 T 5 5
268 Brunei 2988 T 5 5
269 Brunei 2989 T 5 5
270 Brunei 2990 G 5 5
271 Brunei 2991 A 5 5
272 Brunei 2992 T 5 5
273 Brunei 2993 G 5 5
274 Brunei 2994 A 5 5
275 Brunei 2995 G 5 5
276 Brunei 2996 T 5 5
277 Brunei 2997 C 5 5
278 Brunei 2998 T 5 5
279 Brunei 2999 G 5 5
280 Brunei 3000 G 5 5
281 Brunei 3001 T 5 5
282 Brunei 3002 G 5 5
283 Brunei 3003 A 5 5
284 Brunei 3004 G 5 5
285 Brunei 3005 T 5 5
286 Brunei 3006 T 5 5
287 Brunei 3007 T 5 5
288 Brunei 3008 A 5 5
289 Brunei 3009 A 5 5
290 Brunei 3010 A 5 5
291 Brunei 3011 T 5 5
292 Brunei 3012 T 5 5
293 Brunei 3013 G 5 5
294 Brunei 3014 G 5 5
295 Brunei 3015 C 5 5
296 Brunei 3016 T 5 5
297 Brunei 3017 T 5 5
298 Brunei 3018 C 5 5
299 Brunei 3019 A 5 5
300 Brunei 3020 C 5 5
301 Brunei 3021 A 5 5
302 Brunei 3022 T 5 5
303 Brunei 3023 A 5 5
304 Brunei 3024 T 5 5
305 Brunei 3025 G 5 5
306 Brunei 3026 T 5 5
307 Brunei 3027 A 5 5
308 Brunei 3028 T 5 5
309 Brunei 3029 T 5 5
310 Brunei 3030 G 5 5
311 Brunei 3031 T 5 5
312 Brunei 3032 T 5 5
313 Brunei 3033 C 5 5
314 Brunei 3034 T 5 5
315 Brunei 3035 T 5 5
316 Brunei 3036 T 5 5
317 Brunei 3037 C 5 5
318 Brunei 3038 T 5 5
319 Brunei 3039 A 5 5
320 Brunei 3040 C 5 5
321 Brunei 3041 C 5 5
322 Brunei 3042 C 5 5
323 Brunei 3043 T 5 5
324 Brunei 3044 C 5 5
325 Brunei 3045 C 5 5
326 Brunei 3046 A 5 5
327 Brunei 3047 G 5 5
328 Brunei 3048 A 5 5
329 Brunei 3049 T 5 5
330 Brunei 3050 G 5 5
331 Brunei 3051 A 5 5
332 Brunei 3052 G 5 5
333 Brunei 3053 G 5 5
334 Brunei 3054 A 5 5
335 Brunei 3055 T 5 5
336 Brunei 3056 G 5 5
337 Brunei 3057 A 5 5
338 Brunei 3058 A 5 5
339 Brunei 3059 G 5 5
340 Brunei 3060 A 5 5
341 Brunei 3061 A 5 5
342 Brunei 3062 G 5 5
343 Brunei 3063 A 5 5
344 Brunei 3064 A 5 5
345 Brunei 3065 G 5 5
346 Brunei 3066 G 5 5
347 Brunei 3067 T 5 5
348 Brunei 3068 G 5 5
349 Brunei 3069 A 5 5
350 Brunei 3070 T 5 5
351 Brunei 3071 T 5 5
352 Brunei 3072 G 5 5
353 Brunei 3073 T 5 5
354 Brunei 3074 G 5 5
355 Brunei 3075 A 5 5
356 Brunei 3076 A 5 5
357 Brunei 3077 G 5 5
358 Brunei 3078 A 5 5
359 Brunei 3079 A 5 5
360 Brunei 3080 G 5 5
361 Brunei 3081 A 5 5
362 Brunei 3082 A 5 5
363 Brunei 3083 G 5 5
364 Brunei 3084 A 5 5
365 Brunei 3085 G 5 5
366 Brunei 3086 T 5 5
367 Brunei 3087 T 5 5
368 Brunei 3088 T 5 5
369 Brunei 3089 G 5 5
370 Brunei 3090 A 5 5
371 Brunei 3091 G 5 5
372 Brunei 3092 C 5 5
373 Brunei 3093 C 5 5
374 Brunei 3094 A 5 5
375 Brunei 3095 T 5 5
376 Brunei 3096 C 5 5
377 Brunei 3097 A 5 5
378 Brunei 3098 A 5 5
379 Brunei 3099 C 5 5
380 Brunei 3100 T 5 5
381 Brunei 3101 C 5 5
382 Brunei 3102 A 5 5
383 Brunei 3103 A 5 5
384 Brunei 3104 T 5 5
385 Brunei 3105 A 5 5
386 Brunei 3106 T 5 5
387 Brunei 3107 G 5 5
388 Brunei 3108 A 5 5
389 Brunei 3109 G 5 5
390 Brunei 3110 T 5 5
391 Brunei 3111 A 5 5
392 Brunei 3112 T 5 5
393 Brunei 3113 G 5 5
394 Brunei 3114 G 5 5
395 Brunei 3115 T 5 5
396 Brunei 3116 A 5 5
397 Brunei 3117 C 5 5
398 Brunei 3118 T 5 5
399 Brunei 3119 G 5 5
400 Brunei 3120 A 5 5
401 Brunei 3121 A 5 5
402 Brunei 3122 G 5 5
403 Brunei 3123 A 5 5
404 Brunei 3124 T 5 5
405 Brunei 3125 G 5 5
406 Brunei 3126 A 5 5
407 Brunei 3127 T 5 5
408 Brunei 3128 T 5 5
409 Brunei 3129 A 5 5
410 Brunei 3130 C 5 5
411 Brunei 3131 C 5 5
412 Brunei 3132 A 5 5
413 Brunei 3133 A 5 5
414 Brunei 3134 G 5 5
415 Brunei 3135 G 5 5
416 Brunei 3136 T 5 5
417 Brunei 3137 A 5 5
418 Brunei 3138 A 5 5
419 Brunei 3139 A 5 5
420 Brunei 3140 C 5 5
421 Brunei 3141 C 5 5
422 Brunei 3142 T 5 5
423 Brunei 3143 T 5 5
424 Brunei 3144 T 5 5
425 Brunei 3145 G 5 5
426 Brunei 3146 G 5 5
427 Brunei 3147 A 5 5
428 Brunei 3148 A 5 5
429 Brunei 3149 T 5 5
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