National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   2,276                                        
?                                            
A   138                                        
C   30                                        
D   135                                        
E   216                                        
F   72         1                              
G   132                                        
H   36                                        
I   119                                        
K   165                                        
L   207                                        
M   30                                        
N   105                                        
P   90                                        
Q   87                                        
R   42                                        
S   144                                        
T   201                                        
V   213                                        
W   12                                        
Y   102                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 2720 G 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 2721 C 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 2722 A 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 2723 C 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 2724 C 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 2725 A 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 2726 A 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 2727 C 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 2728 A 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 2729 A 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 2730 A 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 2731 G 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 2732 G 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 2733 T 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 2734 T 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 2735 A 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 2736 C 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 2737 T 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 2738 T 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 2739 T 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 2740 T 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 2741 G 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 2742 G 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 2743 T 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 2744 G 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 2745 A 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 2746 T 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 2747 G 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 2748 A 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 2749 C 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 2750 A 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 2751 C 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 2752 T 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 2753 G 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 2754 T 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 2755 G 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 2756 A 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 2757 T 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 2758 A 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 2759 G 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 2760 A 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 2761 A 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 2762 G 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 2763 T 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 2764 G 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 2765 C 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 2766 A 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 2767 A 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 2768 G 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 2769 G 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 2770 T 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 2771 T 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 2772 A 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 2773 C 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 2774 A 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 2775 A 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 2776 G 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 2777 A 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 2778 G 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 2779 T 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 2780 G 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 2781 T 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 2782 G 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 2783 A 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 2784 A 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 2785 T 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 2786 A 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 2787 T 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 2788 C 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 2789 A 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 2790 C 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 2791 T 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 2792 T 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 2793 T 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 2794 T 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 2795 G 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 2796 A 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 2797 A 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 2798 C 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 2799 T 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 2800 T 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 2801 G 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 2802 A 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 2803 T 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 2804 G 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 2805 A 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 2806 A 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 2807 A 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 2808 G 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 2809 G 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 2810 A 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 2811 T 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 2812 T 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 2813 G 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 2814 A 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 2815 T 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 2816 A 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 2817 A 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 2818 A 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 2819 G 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 2820 T 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 2821 A 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 2822 C 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 2823 T 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 2824 T 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 2825 A 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 2826 A 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 2827 T 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 2828 G 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 2829 A 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 2830 G 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 2831 A 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 2832 A 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 2833 G 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 2834 T 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 2835 G 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 2836 C 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 2837 T 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 2838 C 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 2839 T 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 2840 G 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 2841 C 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 2842 C 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 2843 T 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 2844 A 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 2845 T 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 2846 A 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 2847 C 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 2848 A 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 2849 G 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 2850 T 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 2851 T 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 2852 G 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 2853 A 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 2854 A 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 2855 C 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 2856 T 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 2857 C 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 2858 G 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 2859 G 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 2860 T 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 2861 A 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 2862 C 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 2863 A 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 2864 G 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 2865 A 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 2866 A 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 2867 G 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 2868 T 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 2869 A 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 2870 A 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 2871 A 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 2872 T 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 2873 G 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 2874 A 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 2875 G 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 2876 T 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 2877 T 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 2878 C 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 2879 G 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 2880 C 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 2881 C 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 2882 T 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 2883 G 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 2884 T 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 2885 G 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 2886 T 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 2887 T 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 2888 G 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 2889 T 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 2890 G 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 2891 G 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 2892 C 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 2893 A 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 2894 G 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 2895 A 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 2896 T 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 2897 G 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 2898 C 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 2899 T 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 2900 G 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 2901 T 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 2902 C 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 2903 A 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 2904 T 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 2905 A 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 2906 A 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 2907 A 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 2908 A 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 2909 A 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 2910 C 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 2911 T 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 2912 T 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 2913 T 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 2914 G 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 2915 C 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 2916 A 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 2917 A 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 2918 C 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 2919 C 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 2920 A 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 2921 G 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 2922 T 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 2923 A 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 2924 T 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 2925 C 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 2926 T 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 2927 G 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 2928 A 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 2929 A 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 2930 T 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 2931 T 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 2932 A 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 2933 C 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 2934 T 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 2935 T 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 2936 A 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 2937 C 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 2938 A 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 2939 C 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 2940 C 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 2941 A 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 2942 C 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 2943 T 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 2944 G 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 2945 G 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 2946 G 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 2947 C 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 2948 A 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 2949 T 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 2950 T 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 2951 G 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 2952 A 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 2953 T 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 2954 T 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 2955 T 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 2956 A 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 2957 G 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 2958 A 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 2959 T 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 2960 G 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 2961 A 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 2962 G 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 2963 T 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 2964 G 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 2965 G 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 2966 A 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 2967 G 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 2968 T 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 2969 A 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 2970 T 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 2971 G 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 2972 G 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 2973 C 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 2974 T 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 2975 A 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 2976 C 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 2977 A 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 2978 T 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 2979 A 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 2980 C 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 2981 T 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 2982 A 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 2983 C 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 2984 T 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 2985 T 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 2986 A 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 2987 T 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 2988 T 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 2989 T 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 2990 G 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 2991 A 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 2992 T 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 2993 G 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 2994 A 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 2995 G 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 2996 T 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 2997 C 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 2998 T 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 2999 G 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 3000 G 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 3001 T 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 3002 G 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 3003 A 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 3004 G 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 3005 T 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 3006 T 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 3007 T 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 3008 A 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 3009 A 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 3010 A 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 3011 T 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 3012 T 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 3013 G 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 3014 G 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 3015 C 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 3016 T 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 3017 T 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 3018 C 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 3019 A 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 3020 C 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 3021 A 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 3022 T 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 3023 A 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 3024 T 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 3025 G 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 3026 T 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 3027 A 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 3028 T 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 3029 T 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 3030 G 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 3031 T 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 3032 T 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 3033 C 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 3034 T 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 3035 T 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 3036 T 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 3037 C T 1 0 Phe924Phe
318 Antigua_and_Barbuda 3038 T 1 1
319 Antigua_and_Barbuda 3039 A 1 1
320 Antigua_and_Barbuda 3040 C 1 1
321 Antigua_and_Barbuda 3041 C 1 1
322 Antigua_and_Barbuda 3042 C 1 1
323 Antigua_and_Barbuda 3043 T 1 1
324 Antigua_and_Barbuda 3044 C 1 1
325 Antigua_and_Barbuda 3045 C 1 1
326 Antigua_and_Barbuda 3046 A 1 1
327 Antigua_and_Barbuda 3047 G 1 1
328 Antigua_and_Barbuda 3048 A 1 1
329 Antigua_and_Barbuda 3049 T 1 1
330 Antigua_and_Barbuda 3050 G 1 1
331 Antigua_and_Barbuda 3051 A 1 1
332 Antigua_and_Barbuda 3052 G 1 1
333 Antigua_and_Barbuda 3053 G 1 1
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335 Antigua_and_Barbuda 3055 T 1 1
336 Antigua_and_Barbuda 3056 G 1 1
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