National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   5,835                                        
?                                            
A   378                                        
C   153                                        
D   309                                        
E   357                                        
F   240         1                              
G   294                                        
H   105                                        
I   291                                        
K   420                                        
L   534                                        
M   111                                        
N   339                                        
P   222                                        
Q   204                                        
R   135                                        
S   417                                        
T   492                                        
V   495                                        
W   54                                        
Y   285                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Andorra 2720 G 1 1
1 Andorra 2721 C 1 1
2 Andorra 2722 A 1 1
3 Andorra 2723 C 1 1
4 Andorra 2724 C 1 1
5 Andorra 2725 A 1 1
6 Andorra 2726 A 1 1
7 Andorra 2727 C 1 1
8 Andorra 2728 A 1 1
9 Andorra 2729 A 1 1
10 Andorra 2730 A 1 1
11 Andorra 2731 G 1 1
12 Andorra 2732 G 1 1
13 Andorra 2733 T 1 1
14 Andorra 2734 T 1 1
15 Andorra 2735 A 1 1
16 Andorra 2736 C 1 1
17 Andorra 2737 T 1 1
18 Andorra 2738 T 1 1
19 Andorra 2739 T 1 1
20 Andorra 2740 T 1 1
21 Andorra 2741 G 1 1
22 Andorra 2742 G 1 1
23 Andorra 2743 T 1 1
24 Andorra 2744 G 1 1
25 Andorra 2745 A 1 1
26 Andorra 2746 T 1 1
27 Andorra 2747 G 1 1
28 Andorra 2748 A 1 1
29 Andorra 2749 C 1 1
30 Andorra 2750 A 1 1
31 Andorra 2751 C 1 1
32 Andorra 2752 T 1 1
33 Andorra 2753 G 1 1
34 Andorra 2754 T 1 1
35 Andorra 2755 G 1 1
36 Andorra 2756 A 1 1
37 Andorra 2757 T 1 1
38 Andorra 2758 A 1 1
39 Andorra 2759 G 1 1
40 Andorra 2760 A 1 1
41 Andorra 2761 A 1 1
42 Andorra 2762 G 1 1
43 Andorra 2763 T 1 1
44 Andorra 2764 G 1 1
45 Andorra 2765 C 1 1
46 Andorra 2766 A 1 1
47 Andorra 2767 A 1 1
48 Andorra 2768 G 1 1
49 Andorra 2769 G 1 1
50 Andorra 2770 T 1 1
51 Andorra 2771 T 1 1
52 Andorra 2772 A 1 1
53 Andorra 2773 C 1 1
54 Andorra 2774 A 1 1
55 Andorra 2775 A 1 1
56 Andorra 2776 G 1 1
57 Andorra 2777 A 1 1
58 Andorra 2778 G 1 1
59 Andorra 2779 T 1 1
60 Andorra 2780 G 1 1
61 Andorra 2781 T 1 1
62 Andorra 2782 G 1 1
63 Andorra 2783 A 1 1
64 Andorra 2784 A 1 1
65 Andorra 2785 T 1 1
66 Andorra 2786 A 1 1
67 Andorra 2787 T 1 1
68 Andorra 2788 C 1 1
69 Andorra 2789 A 1 1
70 Andorra 2790 C 1 1
71 Andorra 2791 T 1 1
72 Andorra 2792 T 1 1
73 Andorra 2793 T 1 1
74 Andorra 2794 T 1 1
75 Andorra 2795 G 1 1
76 Andorra 2796 A 1 1
77 Andorra 2797 A 1 1
78 Andorra 2798 C 1 1
79 Andorra 2799 T 1 1
80 Andorra 2800 T 1 1
81 Andorra 2801 G 1 1
82 Andorra 2802 A 1 1
83 Andorra 2803 T 1 1
84 Andorra 2804 G 1 1
85 Andorra 2805 A 1 1
86 Andorra 2806 A 1 1
87 Andorra 2807 A 1 1
88 Andorra 2808 G 1 1
89 Andorra 2809 G 1 1
90 Andorra 2810 A 1 1
91 Andorra 2811 T 1 1
92 Andorra 2812 T 1 1
93 Andorra 2813 G 1 1
94 Andorra 2814 A 1 1
95 Andorra 2815 T 1 1
96 Andorra 2816 A 1 1
97 Andorra 2817 A 1 1
98 Andorra 2818 A 1 1
99 Andorra 2819 G 1 1
100 Andorra 2820 T 1 1
101 Andorra 2821 A 1 1
102 Andorra 2822 C 1 1
103 Andorra 2823 T 1 1
104 Andorra 2824 T 1 1
105 Andorra 2825 A 1 1
106 Andorra 2826 A 1 1
107 Andorra 2827 T 1 1
108 Andorra 2828 G 1 1
109 Andorra 2829 A 1 1
110 Andorra 2830 G 1 1
111 Andorra 2831 A 1 1
112 Andorra 2832 A 1 1
113 Andorra 2833 G 1 1
114 Andorra 2834 T 1 1
115 Andorra 2835 G 1 1
116 Andorra 2836 C 1 1
117 Andorra 2837 T 1 1
118 Andorra 2838 C 1 1
119 Andorra 2839 T 1 1
120 Andorra 2840 G 1 1
121 Andorra 2841 C 1 1
122 Andorra 2842 C 1 1
123 Andorra 2843 T 1 1
124 Andorra 2844 A 1 1
125 Andorra 2845 T 1 1
126 Andorra 2846 A 1 1
127 Andorra 2847 C 1 1
128 Andorra 2848 A 1 1
129 Andorra 2849 G 1 1
130 Andorra 2850 T 1 1
131 Andorra 2851 T 1 1
132 Andorra 2852 G 1 1
133 Andorra 2853 A 1 1
134 Andorra 2854 A 1 1
135 Andorra 2855 C 1 1
136 Andorra 2856 T 1 1
137 Andorra 2857 C 1 1
138 Andorra 2858 G 1 1
139 Andorra 2859 G 1 1
140 Andorra 2860 T 1 1
141 Andorra 2861 A 1 1
142 Andorra 2862 C 1 1
143 Andorra 2863 A 1 1
144 Andorra 2864 G 1 1
145 Andorra 2865 A 1 1
146 Andorra 2866 A 1 1
147 Andorra 2867 G 1 1
148 Andorra 2868 T 1 1
149 Andorra 2869 A 1 1
150 Andorra 2870 A 1 1
151 Andorra 2871 A 1 1
152 Andorra 2872 T 1 1
153 Andorra 2873 G 1 1
154 Andorra 2874 A 1 1
155 Andorra 2875 G 1 1
156 Andorra 2876 T 1 1
157 Andorra 2877 T 1 1
158 Andorra 2878 C 1 1
159 Andorra 2879 G 1 1
160 Andorra 2880 C 1 1
161 Andorra 2881 C 1 1
162 Andorra 2882 T 1 1
163 Andorra 2883 G 1 1
164 Andorra 2884 T 1 1
165 Andorra 2885 G 1 1
166 Andorra 2886 T 1 1
167 Andorra 2887 T 1 1
168 Andorra 2888 G 1 1
169 Andorra 2889 T 1 1
170 Andorra 2890 G 1 1
171 Andorra 2891 G 1 1
172 Andorra 2892 C 1 1
173 Andorra 2893 A 1 1
174 Andorra 2894 G 1 1
175 Andorra 2895 A 1 1
176 Andorra 2896 T 1 1
177 Andorra 2897 G 1 1
178 Andorra 2898 C 1 1
179 Andorra 2899 T 1 1
180 Andorra 2900 G 1 1
181 Andorra 2901 T 1 1
182 Andorra 2902 C 1 1
183 Andorra 2903 A 1 1
184 Andorra 2904 T 1 1
185 Andorra 2905 A 1 1
186 Andorra 2906 A 1 1
187 Andorra 2907 A 1 1
188 Andorra 2908 A 1 1
189 Andorra 2909 A 1 1
190 Andorra 2910 C 1 1
191 Andorra 2911 T 1 1
192 Andorra 2912 T 1 1
193 Andorra 2913 T 1 1
194 Andorra 2914 G 1 1
195 Andorra 2915 C 1 1
196 Andorra 2916 A 1 1
197 Andorra 2917 A 1 1
198 Andorra 2918 C 1 1
199 Andorra 2919 C 1 1
200 Andorra 2920 A 1 1
201 Andorra 2921 G 1 1
202 Andorra 2922 T 1 1
203 Andorra 2923 A 1 1
204 Andorra 2924 T 1 1
205 Andorra 2925 C 1 1
206 Andorra 2926 T 1 1
207 Andorra 2927 G 1 1
208 Andorra 2928 A 1 1
209 Andorra 2929 A 1 1
210 Andorra 2930 T 1 1
211 Andorra 2931 T 1 1
212 Andorra 2932 A 1 1
213 Andorra 2933 C 1 1
214 Andorra 2934 T 1 1
215 Andorra 2935 T 1 1
216 Andorra 2936 A 1 1
217 Andorra 2937 C 1 1
218 Andorra 2938 A 1 1
219 Andorra 2939 C 1 1
220 Andorra 2940 C 1 1
221 Andorra 2941 A 1 1
222 Andorra 2942 C 1 1
223 Andorra 2943 T 1 1
224 Andorra 2944 G 1 1
225 Andorra 2945 G 1 1
226 Andorra 2946 G 1 1
227 Andorra 2947 C 1 1
228 Andorra 2948 A 1 1
229 Andorra 2949 T 1 1
230 Andorra 2950 T 1 1
231 Andorra 2951 G 1 1
232 Andorra 2952 A 1 1
233 Andorra 2953 T 1 1
234 Andorra 2954 T 1 1
235 Andorra 2955 T 1 1
236 Andorra 2956 A 1 1
237 Andorra 2957 G 1 1
238 Andorra 2958 A 1 1
239 Andorra 2959 T 1 1
240 Andorra 2960 G 1 1
241 Andorra 2961 A 1 1
242 Andorra 2962 G 1 1
243 Andorra 2963 T 1 1
244 Andorra 2964 G 1 1
245 Andorra 2965 G 1 1
246 Andorra 2966 A 1 1
247 Andorra 2967 G 1 1
248 Andorra 2968 T 1 1
249 Andorra 2969 A 1 1
250 Andorra 2970 T 1 1
251 Andorra 2971 G 1 1
252 Andorra 2972 G 1 1
253 Andorra 2973 C 1 1
254 Andorra 2974 T 1 1
255 Andorra 2975 A 1 1
256 Andorra 2976 C 1 1
257 Andorra 2977 A 1 1
258 Andorra 2978 T 1 1
259 Andorra 2979 A 1 1
260 Andorra 2980 C 1 1
261 Andorra 2981 T 1 1
262 Andorra 2982 A 1 1
263 Andorra 2983 C 1 1
264 Andorra 2984 T 1 1
265 Andorra 2985 T 1 1
266 Andorra 2986 A 1 1
267 Andorra 2987 T 1 1
268 Andorra 2988 T 1 1
269 Andorra 2989 T 1 1
270 Andorra 2990 G 1 1
271 Andorra 2991 A 1 1
272 Andorra 2992 T 1 1
273 Andorra 2993 G 1 1
274 Andorra 2994 A 1 1
275 Andorra 2995 G 1 1
276 Andorra 2996 T 1 1
277 Andorra 2997 C 1 1
278 Andorra 2998 T 1 1
279 Andorra 2999 G 1 1
280 Andorra 3000 G 1 1
281 Andorra 3001 T 1 1
282 Andorra 3002 G 1 1
283 Andorra 3003 A 1 1
284 Andorra 3004 G 1 1
285 Andorra 3005 T 1 1
286 Andorra 3006 T 1 1
287 Andorra 3007 T 1 1
288 Andorra 3008 A 1 1
289 Andorra 3009 A 1 1
290 Andorra 3010 A 1 1
291 Andorra 3011 T 1 1
292 Andorra 3012 T 1 1
293 Andorra 3013 G 1 1
294 Andorra 3014 G 1 1
295 Andorra 3015 C 1 1
296 Andorra 3016 T 1 1
297 Andorra 3017 T 1 1
298 Andorra 3018 C 1 1
299 Andorra 3019 A 1 1
300 Andorra 3020 C 1 1
301 Andorra 3021 A 1 1
302 Andorra 3022 T 1 1
303 Andorra 3023 A 1 1
304 Andorra 3024 T 1 1
305 Andorra 3025 G 1 1
306 Andorra 3026 T 1 1
307 Andorra 3027 A 1 1
308 Andorra 3028 T 1 1
309 Andorra 3029 T 1 1
310 Andorra 3030 G 1 1
311 Andorra 3031 T 1 1
312 Andorra 3032 T 1 1
313 Andorra 3033 C 1 1
314 Andorra 3034 T 1 1
315 Andorra 3035 T 1 1
316 Andorra 3036 T 1 1
317 Andorra 3037 C T 1 0 Phe924Phe
318 Andorra 3038 T 1 1
319 Andorra 3039 A 1 1
320 Andorra 3040 C 1 1
321 Andorra 3041 C 1 1
322 Andorra 3042 C 1 1
323 Andorra 3043 T 1 1
324 Andorra 3044 C 1 1
325 Andorra 3045 C 1 1
326 Andorra 3046 A 1 1
327 Andorra 3047 G 1 1
328 Andorra 3048 A 1 1
329 Andorra 3049 T 1 1
330 Andorra 3050 G 1 1
331 Andorra 3051 A 1 1
332 Andorra 3052 G 1 1
333 Andorra 3053 G 1 1
334 Andorra 3054 A 1 1
335 Andorra 3055 T 1 1
336 Andorra 3056 G 1 1
337 Andorra 3057 A 1 1
338 Andorra 3058 A 1 1
339 Andorra 3059 G 1 1
340 Andorra 3060 A 1 1
341 Andorra 3061 A 1 1
342 Andorra 3062 G 1 1
343 Andorra 3063 A 1 1
344 Andorra 3064 A 1 1
345 Andorra 3065 G 1 1
346 Andorra 3066 G 1 1
347 Andorra 3067 T 1 1
348 Andorra 3068 G 1 1
349 Andorra 3069 A 1 1
350 Andorra 3070 T 1 1
351 Andorra 3071 T 1 1
352 Andorra 3072 G 1 1
353 Andorra 3073 T 1 1
354 Andorra 3074 G 1 1
355 Andorra 3075 A 1 1
356 Andorra 3076 A 1 1
357 Andorra 3077 G 1 1
358 Andorra 3078 A 1 1
359 Andorra 3079 A 1 1
360 Andorra 3080 G 1 1
361 Andorra 3081 A 1 1
362 Andorra 3082 A 1 1
363 Andorra 3083 G 1 1
364 Andorra 3084 A 1 1
365 Andorra 3085 G 1 1
366 Andorra 3086 T 1 1
367 Andorra 3087 T 1 1
368 Andorra 3088 T 1 1
369 Andorra 3089 G 1 1
370 Andorra 3090 A 1 1
371 Andorra 3091 G 1 1
372 Andorra 3092 C 1 1
373 Andorra 3093 C 1 1
374 Andorra 3094 A 1 1
375 Andorra 3095 T 1 1
376 Andorra 3096 C 1 1
377 Andorra 3097 A 1 1
378 Andorra 3098 A 1 1
379 Andorra 3099 C 1 1
380 Andorra 3100 T 1 1
381 Andorra 3101 C 1 1
382 Andorra 3102 A 1 1
383 Andorra 3103 A 1 1
384 Andorra 3104 T 1 1
385 Andorra 3105 A 1 1
386 Andorra 3106 T 1 1
387 Andorra 3107 G 1 1
388 Andorra 3108 A 1 1
389 Andorra 3109 G 1 1
390 Andorra 3110 T 1 1
391 Andorra 3111 A 1 1
392 Andorra 3112 T 1 1
393 Andorra 3113 G 1 1
394 Andorra 3114 G 1 1
395 Andorra 3115 T 1 1
396 Andorra 3116 A 1 1
397 Andorra 3117 C 1 1
398 Andorra 3118 T 1 1
399 Andorra 3119 G 1 1
400 Andorra 3120 A 1 1
401 Andorra 3121 A 1 1
402 Andorra 3122 G 1 1
403 Andorra 3123 A 1 1
404 Andorra 3124 T 1 1
405 Andorra 3125 G 1 1
406 Andorra 3126 A 1 1
407 Andorra 3127 T 1 1
408 Andorra 3128 T 1 1
409 Andorra 3129 A 1 1
410 Andorra 3130 C 1 1
411 Andorra 3131 C 1 1
412 Andorra 3132 A 1 1
413 Andorra 3133 A 1 1
414 Andorra 3134 G 1 1
415 Andorra 3135 G 1 1
416 Andorra 3136 T 1 1
417 Andorra 3137 A 1 1
418 Andorra 3138 A 1 1
419 Andorra 3139 A 1 1
420 Andorra 3140 C 1 1
421 Andorra 3141 C 1 1
422 Andorra 3142 T 1 1
423 Andorra 3143 T 1 1
424 Andorra 3144 T 1 1
425 Andorra 3145 G 1 1
426 Andorra 3146 G 1 1
427 Andorra 3147 A 1 1
428 Andorra 3148 A 1 1
429 Andorra 3149 T 1 1
430 Andorra 3150 T 1 1
431 Andorra 3151 T 1 1
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