National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   1,914                                        
?                                            
A   132                                        
C   81                                        
D   60                                        
E   162                                        
F   90                                        
G   147                                        
H   27                                        
I   120                                        
K   153                                        
L   180                                        
M   30                                        
N   93                                        
P   66                                        
Q   54                                        
R   57                                        
S   108                                        
T   138               1                        
V   138                                        
W   21                                        
Y   57                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Uzbekistan 806 G <*> 2 2
1 Uzbekistan 807 C <*> 2 2
2 Uzbekistan 808 A <*> 2 2
3 Uzbekistan 809 T <*> 2 2
4 Uzbekistan 810 A <*> 2 2
5 Uzbekistan 811 C <*> 2 2
6 Uzbekistan 812 A <*> 2 2
7 Uzbekistan 813 C <*> 2 2
8 Uzbekistan 814 T <*> 2 2
9 Uzbekistan 815 C <*> 2 2
10 Uzbekistan 816 G <*> 2 2
11 Uzbekistan 817 C <*> 2 2
12 Uzbekistan 818 T <*> 2 2
13 Uzbekistan 819 A <*> 2 2
14 Uzbekistan 820 T <*> 2 2
15 Uzbekistan 821 G <*> 2 2
16 Uzbekistan 822 T <*> 2 2
17 Uzbekistan 823 C <*> 2 2
18 Uzbekistan 824 G <*> 2 2
19 Uzbekistan 825 A <*> 2 2
20 Uzbekistan 826 T <*> 2 2
21 Uzbekistan 827 A <*> 2 2
22 Uzbekistan 828 A <*> 2 2
23 Uzbekistan 829 C <*> 2 2
24 Uzbekistan 830 A <*> 2 2
25 Uzbekistan 831 A <*> 2 2
26 Uzbekistan 832 C <*> 2 2
27 Uzbekistan 833 T <*> 2 2
28 Uzbekistan 834 T <*> 2 2
29 Uzbekistan 835 C <*> 2 2
30 Uzbekistan 836 T <*> 2 2
31 Uzbekistan 837 G <*> 2 2
32 Uzbekistan 838 T <*> 2 2
33 Uzbekistan 839 G <*> 2 2
34 Uzbekistan 840 G <*> 2 2
35 Uzbekistan 841 C <*> 2 2
36 Uzbekistan 842 C <*> 2 2
37 Uzbekistan 843 C <*> 2 2
38 Uzbekistan 844 T <*> 2 2
39 Uzbekistan 845 G <*> 2 2
40 Uzbekistan 846 A <*> 2 2
41 Uzbekistan 847 T <*> 2 2
42 Uzbekistan 848 G <*> 2 2
43 Uzbekistan 849 G <*> 2 2
44 Uzbekistan 850 C <*> 2 2
45 Uzbekistan 851 T <*> 2 2
46 Uzbekistan 852 A <*> 2 2
47 Uzbekistan 853 C <*> 2 2
48 Uzbekistan 854 C <*> 2 2
49 Uzbekistan 855 C <*> 2 2
50 Uzbekistan 856 T <*> 2 2
51 Uzbekistan 857 C <*> 2 2
52 Uzbekistan 858 T <*> 2 2
53 Uzbekistan 859 T <*> 2 2
54 Uzbekistan 860 G <*> 2 2
55 Uzbekistan 861 A <*> 2 2
56 Uzbekistan 862 G <*> 2 2
57 Uzbekistan 863 T <*> 2 2
58 Uzbekistan 864 G <*> 2 2
59 Uzbekistan 865 C <*> 2 2
60 Uzbekistan 866 A <*> 2 2
61 Uzbekistan 867 T <*> 2 2
62 Uzbekistan 868 T <*> 2 2
63 Uzbekistan 869 A <*> 2 2
64 Uzbekistan 870 A <*> 2 2
65 Uzbekistan 871 A <*> 2 2
66 Uzbekistan 872 G <*> 2 2
67 Uzbekistan 873 A <*> 2 2
68 Uzbekistan 874 C <*> 2 2
69 Uzbekistan 875 C <*> 2 2
70 Uzbekistan 876 T <*> 2 2
71 Uzbekistan 877 T <*> 2 2
72 Uzbekistan 878 C <*> 2 2
73 Uzbekistan 879 T <*> 2 2
74 Uzbekistan 880 A <*> 2 2
75 Uzbekistan 881 G <*> 2 2
76 Uzbekistan 882 C <*> 2 2
77 Uzbekistan 883 A <*> 2 2
78 Uzbekistan 884 C <*> 2 2
79 Uzbekistan 885 G <*> 2 2
80 Uzbekistan 886 T <*> 2 2
81 Uzbekistan 887 G <*> 2 2
82 Uzbekistan 888 C <*> 2 2
83 Uzbekistan 889 T <*> 2 2
84 Uzbekistan 890 G <*> 2 2
85 Uzbekistan 891 G <*> 2 2
86 Uzbekistan 892 T <*> 2 2
87 Uzbekistan 893 A <*> 2 2
88 Uzbekistan 894 A <*> 2 2
89 Uzbekistan 895 A <*> 2 2
90 Uzbekistan 896 G <*> 2 2
91 Uzbekistan 897 C <*> 2 2
92 Uzbekistan 898 T <*> 2 2
93 Uzbekistan 899 T <*> 2 2
94 Uzbekistan 900 C <*> 2 2
95 Uzbekistan 901 A <*> 2 2
96 Uzbekistan 902 T <*> 2 2
97 Uzbekistan 903 G <*> 2 2
98 Uzbekistan 904 C <*> 2 2
99 Uzbekistan 905 A <*> 2 2
100 Uzbekistan 906 C <*> 2 2
101 Uzbekistan 907 T <*> 2 2
102 Uzbekistan 908 T <*> 2 2
103 Uzbekistan 909 T <*> 2 2
104 Uzbekistan 910 G <*> 2 2
105 Uzbekistan 911 T <*> 2 2
106 Uzbekistan 912 C <*> 2 2
107 Uzbekistan 913 C <*> 2 2
108 Uzbekistan 914 G <*> 2 2
109 Uzbekistan 915 A <*> 2 2
110 Uzbekistan 916 A <*> 2 2
111 Uzbekistan 917 C <*> 2 2
112 Uzbekistan 918 A <*> 2 2
113 Uzbekistan 919 A <*> 2 2
114 Uzbekistan 920 C <*> 2 2
115 Uzbekistan 921 T <*> 2 2
116 Uzbekistan 922 G <*> 2 2
117 Uzbekistan 923 G <*> 2 2
118 Uzbekistan 924 A <*> 2 2
119 Uzbekistan 925 C <*> 2 2
120 Uzbekistan 926 T <*> 2 2
121 Uzbekistan 927 T <*> 2 2
122 Uzbekistan 928 T <*> 2 2
123 Uzbekistan 929 A <*> 2 2
124 Uzbekistan 930 T <*> 2 2
125 Uzbekistan 931 T <*> 2 2
126 Uzbekistan 932 G <*> 2 2
127 Uzbekistan 933 A <*> 2 2
128 Uzbekistan 934 C <*> 2 2
129 Uzbekistan 935 A <*> 2 2
130 Uzbekistan 936 C <*> 2 2
131 Uzbekistan 937 T <*> 2 2
132 Uzbekistan 938 A <*> 2 2
133 Uzbekistan 939 A <*> 2 2
134 Uzbekistan 940 G <*> 2 2
135 Uzbekistan 941 A <*> 2 2
136 Uzbekistan 942 G <*> 2 2
137 Uzbekistan 943 G <*> 2 2
138 Uzbekistan 944 G <*> 2 2
139 Uzbekistan 945 G <*> 2 2
140 Uzbekistan 946 T <*> 2 2
141 Uzbekistan 947 G <*> 2 2
142 Uzbekistan 948 T <*> 2 2
143 Uzbekistan 949 A <*> 2 2
144 Uzbekistan 950 T <*> 2 2
145 Uzbekistan 951 A <*> 2 2
146 Uzbekistan 952 C <*> 2 2
147 Uzbekistan 953 T <*> 2 2
148 Uzbekistan 954 G <*> 2 2
149 Uzbekistan 955 C <*> 2 2
150 Uzbekistan 956 T <*> 2 2
151 Uzbekistan 957 G <*> 2 2
152 Uzbekistan 958 C <*> 2 2
153 Uzbekistan 959 C <*> 2 2
154 Uzbekistan 960 G <*> 2 2
155 Uzbekistan 961 T <*> 2 2
156 Uzbekistan 962 G <*> 2 2
157 Uzbekistan 963 A <*> 2 2
158 Uzbekistan 964 A <*> 2 2
159 Uzbekistan 965 C <*> 2 2
160 Uzbekistan 966 A <*> 2 2
161 Uzbekistan 967 T <*> 2 2
162 Uzbekistan 968 G <*> 2 2
163 Uzbekistan 969 A <*> 2 2
164 Uzbekistan 970 G <*> 2 2
165 Uzbekistan 971 C <*> 2 2
166 Uzbekistan 972 A <*> 2 2
167 Uzbekistan 973 T <*> 2 2
168 Uzbekistan 974 G <*> 2 2
169 Uzbekistan 975 A <*> 2 2
170 Uzbekistan 976 A <*> 2 2
171 Uzbekistan 977 A <*> 2 2
172 Uzbekistan 978 T <*> 2 2
173 Uzbekistan 979 T <*> 2 2
174 Uzbekistan 980 G <*> 2 2
175 Uzbekistan 981 C <*> 2 2
176 Uzbekistan 982 T <*> 2 2
177 Uzbekistan 983 T <*> 2 2
178 Uzbekistan 984 G <*> 2 2
179 Uzbekistan 985 G <*> 2 2
180 Uzbekistan 986 T <*> 2 2
181 Uzbekistan 987 A <*> 2 2
182 Uzbekistan 988 C <*> 2 2
183 Uzbekistan 989 A <*> 2 2
184 Uzbekistan 990 C <*> 2 2
185 Uzbekistan 991 G <*> 2 2
186 Uzbekistan 992 G <*> 2 2
187 Uzbekistan 993 A <*> 2 2
188 Uzbekistan 994 A <*> 2 2
189 Uzbekistan 995 C <*> 2 2
190 Uzbekistan 996 G <*> 2 2
191 Uzbekistan 997 T <*> 2 2
192 Uzbekistan 998 T <*> 2 2
193 Uzbekistan 999 C <*> 2 2
194 Uzbekistan 1000 T <*> 2 2
195 Uzbekistan 1001 G <*> 2 2
196 Uzbekistan 1002 A <*> 2 2
197 Uzbekistan 1003 A <*> 2 2
198 Uzbekistan 1004 A <*> 2 2
199 Uzbekistan 1005 A <*> 2 2
200 Uzbekistan 1006 G <*> 2 2
201 Uzbekistan 1007 A <*> 2 2
202 Uzbekistan 1008 G <*> 2 2
203 Uzbekistan 1009 C <*> 2 2
204 Uzbekistan 1010 T <*> 2 2
205 Uzbekistan 1011 A <*> 2 2
206 Uzbekistan 1012 T <*> 2 2
207 Uzbekistan 1013 G <*> 2 2
208 Uzbekistan 1014 A <*> 2 2
209 Uzbekistan 1015 A <*> 2 2
210 Uzbekistan 1016 T <*> 2 2
211 Uzbekistan 1017 T <*> 2 2
212 Uzbekistan 1018 G <*> 2 2
213 Uzbekistan 1019 C <*> 2 2
214 Uzbekistan 1020 A <*> 2 2
215 Uzbekistan 1021 G <*> 2 2
216 Uzbekistan 1022 A <*> 2 2
217 Uzbekistan 1023 C <*> 2 2
218 Uzbekistan 1024 A <*> 2 2
219 Uzbekistan 1025 C <*> 2 2
220 Uzbekistan 1026 C <*> 2 2
221 Uzbekistan 1027 T <*> 2 2
222 Uzbekistan 1028 T <*> 2 2
223 Uzbekistan 1029 T <*> 2 2
224 Uzbekistan 1030 T <*> 2 2
225 Uzbekistan 1031 G <*> 2 2
226 Uzbekistan 1032 A <*> 2 2
227 Uzbekistan 1033 A <*> 2 2
228 Uzbekistan 1034 A <*> 2 2
229 Uzbekistan 1035 T <*> 2 2
230 Uzbekistan 1036 T <*> 2 2
231 Uzbekistan 1037 A <*> 2 2
232 Uzbekistan 1038 A <*> 2 2
233 Uzbekistan 1039 A <*> 2 2
234 Uzbekistan 1040 T <*> 2 2
235 Uzbekistan 1041 T <*> 2 2
236 Uzbekistan 1042 G <*> 2 2
237 Uzbekistan 1043 G <*> 2 2
238 Uzbekistan 1044 C <*> 2 2
239 Uzbekistan 1045 A <*> 2 2
240 Uzbekistan 1046 A <*> 2 2
241 Uzbekistan 1047 A <*> 2 2
242 Uzbekistan 1048 G <*> 2 2
243 Uzbekistan 1049 A <*> 2 2
244 Uzbekistan 1050 A <*> 2 2
245 Uzbekistan 1051 A <*> 2 2
246 Uzbekistan 1052 T <*> 2 2
247 Uzbekistan 1053 T <*> 2 2
248 Uzbekistan 1054 T <*> 2 2
249 Uzbekistan 1055 G <*> 2 2
250 Uzbekistan 1056 A <*> 2 2
251 Uzbekistan 1057 C <*> 2 2
252 Uzbekistan 1058 A <*> 2 2
253 Uzbekistan 1059 C T,<*> 2 1 p.Thr265Ile
254 Uzbekistan 1060 C <*> 2 2
255 Uzbekistan 1061 T <*> 2 2
256 Uzbekistan 1062 T <*> 2 2
257 Uzbekistan 1063 C <*> 2 2
258 Uzbekistan 1064 A <*> 2 2
259 Uzbekistan 1065 A <*> 2 2
260 Uzbekistan 1066 T <*> 2 2
261 Uzbekistan 1067 G <*> 2 2
262 Uzbekistan 1068 G <*> 2 2
263 Uzbekistan 1069 G <*> 2 2
264 Uzbekistan 1070 G <*> 2 2
265 Uzbekistan 1071 A <*> 2 2
266 Uzbekistan 1072 A <*> 2 2
267 Uzbekistan 1073 T <*> 2 2
268 Uzbekistan 1074 G <*> 2 2
269 Uzbekistan 1075 T <*> 2 2
270 Uzbekistan 1076 C <*> 2 2
271 Uzbekistan 1077 C <*> 2 2
272 Uzbekistan 1078 A <*> 2 2
273 Uzbekistan 1079 A <*> 2 2
274 Uzbekistan 1080 A <*> 2 2
275 Uzbekistan 1081 T <*> 2 2
276 Uzbekistan 1082 T <*> 2 2
277 Uzbekistan 1083 T <*> 2 2
278 Uzbekistan 1084 T <*> 2 2
279 Uzbekistan 1085 G <*> 2 2
280 Uzbekistan 1086 T <*> 2 2
281 Uzbekistan 1087 A <*> 2 2
282 Uzbekistan 1088 T <*> 2 2
283 Uzbekistan 1089 T <*> 2 2
284 Uzbekistan 1090 T <*> 2 2
285 Uzbekistan 1091 C <*> 2 2
286 Uzbekistan 1092 C <*> 2 2
287 Uzbekistan 1093 C <*> 2 2
288 Uzbekistan 1094 T <*> 2 2
289 Uzbekistan 1095 T <*> 2 2
290 Uzbekistan 1096 A <*> 2 2
291 Uzbekistan 1097 A <*> 2 2
292 Uzbekistan 1098 A <*> 2 2
293 Uzbekistan 1099 T <*> 2 2
294 Uzbekistan 1100 T <*> 2 2
295 Uzbekistan 1101 C <*> 2 2
296 Uzbekistan 1102 C <*> 2 2
297 Uzbekistan 1103 A <*> 2 2
298 Uzbekistan 1104 T <*> 2 2
299 Uzbekistan 1105 A <*> 2 2
300 Uzbekistan 1106 A <*> 2 2
301 Uzbekistan 1107 T <*> 2 2
302 Uzbekistan 1108 C <*> 2 2
303 Uzbekistan 1109 A <*> 2 2
304 Uzbekistan 1110 A <*> 2 2
305 Uzbekistan 1111 G <*> 2 2
306 Uzbekistan 1112 A <*> 2 2
307 Uzbekistan 1113 C <*> 2 2
308 Uzbekistan 1114 T <*> 2 2
309 Uzbekistan 1115 A <*> 2 2
310 Uzbekistan 1116 T <*> 2 2
311 Uzbekistan 1117 T <*> 2 2
312 Uzbekistan 1118 C <*> 2 2
313 Uzbekistan 1119 A <*> 2 2
314 Uzbekistan 1120 A <*> 2 2
315 Uzbekistan 1121 C <*> 2 2
316 Uzbekistan 1122 C <*> 2 2
317 Uzbekistan 1123 A <*> 2 2
318 Uzbekistan 1124 A <*> 2 2
319 Uzbekistan 1125 G <*> 2 2
320 Uzbekistan 1126 G <*> 2 2
321 Uzbekistan 1127 G <*> 2 2
322 Uzbekistan 1128 T <*> 2 2
323 Uzbekistan 1129 T <*> 2 2
324 Uzbekistan 1130 G <*> 2 2
325 Uzbekistan 1131 A <*> 2 2
326 Uzbekistan 1132 A <*> 2 2
327 Uzbekistan 1133 A <*> 2 2
328 Uzbekistan 1134 A <*> 2 2
329 Uzbekistan 1135 G <*> 2 2
330 Uzbekistan 1136 A <*> 2 2
331 Uzbekistan 1137 A <*> 2 2
332 Uzbekistan 1138 A <*> 2 2
333 Uzbekistan 1139 A <*> 2 2
334 Uzbekistan 1140 A <*> 2 2
335 Uzbekistan 1141 G <*> 2 2
336 Uzbekistan 1142 C <*> 2 2
337 Uzbekistan 1143 T <*> 2 2
338 Uzbekistan 1144 T <*> 2 2
339 Uzbekistan 1145 G <*> 2 2
340 Uzbekistan 1146 A <*> 2 2
341 Uzbekistan 1147 T <*> 2 2
342 Uzbekistan 1148 G <*> 2 2
343 Uzbekistan 1149 G <*> 2 2
344 Uzbekistan 1150 C <*> 2 2
345 Uzbekistan 1151 T <*> 2 2
346 Uzbekistan 1152 T <*> 2 2
347 Uzbekistan 1153 T <*> 2 2
348 Uzbekistan 1154 A <*> 2 2
349 Uzbekistan 1155 T <*> 2 2
350 Uzbekistan 1156 G <*> 2 2
351 Uzbekistan 1157 G <*> 2 2
352 Uzbekistan 1158 G <*> 2 2
353 Uzbekistan 1159 T <*> 2 2
354 Uzbekistan 1160 A <*> 2 2
355 Uzbekistan 1161 G <*> 2 2
356 Uzbekistan 1162 A <*> 2 2
357 Uzbekistan 1163 A <*> 2 2
358 Uzbekistan 1164 T <*> 2 2
359 Uzbekistan 1165 T <*> 2 2
360 Uzbekistan 1166 C <*> 2 2
361 Uzbekistan 1167 G <*> 2 2
362 Uzbekistan 1168 A <*> 2 2
363 Uzbekistan 1169 T <*> 2 2
364 Uzbekistan 1170 C <*> 2 2
365 Uzbekistan 1171 T <*> 2 2
366 Uzbekistan 1172 G <*> 2 2
367 Uzbekistan 1173 T <*> 2 2
368 Uzbekistan 1174 C <*> 2 2
369 Uzbekistan 1175 T <*> 2 2
370 Uzbekistan 1176 A <*> 2 2
371 Uzbekistan 1177 T <*> 2 2
372 Uzbekistan 1178 C <*> 2 2
373 Uzbekistan 1179 C <*> 2 2
374 Uzbekistan 1180 A <*> 2 2
375 Uzbekistan 1181 G <*> 2 2
376 Uzbekistan 1182 T <*> 2 2
377 Uzbekistan 1183 T <*> 2 2
378 Uzbekistan 1184 G <*> 2 2
379 Uzbekistan 1185 C <*> 2 2
380 Uzbekistan 1186 G <*> 2 2
381 Uzbekistan 1187 T <*> 2 2
382 Uzbekistan 1188 C <*> 2 2
383 Uzbekistan 1189 A <*> 2 2
384 Uzbekistan 1190 C <*> 2 2
385 Uzbekistan 1191 C <*> 2 2
386 Uzbekistan 1192 A <*> 2 2
387 Uzbekistan 1193 A <*> 2 2
388 Uzbekistan 1194 A <*> 2 2
389 Uzbekistan 1195 T <*> 2 2
390 Uzbekistan 1196 G <*> 2 2
391 Uzbekistan 1197 A <*> 2 2
392 Uzbekistan 1198 A <*> 2 2
393 Uzbekistan 1199 T <*> 2 2
394 Uzbekistan 1200 G <*> 2 2
395 Uzbekistan 1201 C <*> 2 2
396 Uzbekistan 1202 A <*> 2 2
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