National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   1,914                                        
?                                            
A   132 1                                 3    
C   81   2     2                             1
D   60       1   2           1                
E   162           1               1            
F   90         1                             1
G   147   1 1 1   1                   1   2    
H   27                                       2
I   120               1                        
K   153       1         1     2                
L   180                   5                    
M   30                                   1    
N   93                       2                
P   66                         1       1      
Q   54             1                          
R   57   3             1                      
S   108         2         1           3        
T   138               2                        
V   138         2                         1    
W   21                                        
Y   57                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Romania 806 G 360 360
1 Romania 807 C 360 360
2 Romania 808 A 360 360
3 Romania 809 T 360 360
4 Romania 810 A 360 360
5 Romania 811 C 360 360
6 Romania 812 A 360 360
7 Romania 813 C 360 360
8 Romania 814 T 362 362
9 Romania 815 C 362 362
10 Romania 816 G 362 362
11 Romania 817 C 362 362
12 Romania 818 T 362 362
13 Romania 819 A 362 362
14 Romania 820 T 362 362
15 Romania 821 G 362 362
16 Romania 822 T 362 362
17 Romania 823 C 362 362
18 Romania 824 G 362 362
19 Romania 825 A 362 362
20 Romania 826 T 362 362
21 Romania 827 A 362 362
22 Romania 828 A 362 362
23 Romania 829 C 362 362
24 Romania 830 A 362 362
25 Romania 831 A 362 362
26 Romania 832 C T 362 360 Asn189Asn
27 Romania 833 T 362 362
28 Romania 834 T 362 362
29 Romania 835 C T 362 360 Phe190Phe
30 Romania 836 T 362 362
31 Romania 837 G 362 362
32 Romania 838 T 362 362
33 Romania 839 G 362 362
34 Romania 840 G 362 362
35 Romania 841 C 362 362
36 Romania 842 C 362 362
37 Romania 843 C 362 362
38 Romania 844 T 362 362
39 Romania 845 G 362 362
40 Romania 846 A 362 362
41 Romania 847 T 362 362
42 Romania 848 G 362 362
43 Romania 849 G 362 362
44 Romania 850 C 362 362
45 Romania 851 T 362 362
46 Romania 852 A 362 362
47 Romania 853 C 362 362
48 Romania 854 C 362 362
49 Romania 855 C 362 362
50 Romania 856 T 362 362
51 Romania 857 C 362 362
52 Romania 858 T 362 362
53 Romania 859 T 362 362
54 Romania 860 G 362 362
55 Romania 861 A 362 362
56 Romania 862 G 362 362
57 Romania 863 T 362 362
58 Romania 864 G 362 362
59 Romania 865 C 362 362
60 Romania 866 A 362 362
61 Romania 867 T 362 362
62 Romania 868 T 362 362
63 Romania 869 A 362 362
64 Romania 870 A 362 362
65 Romania 871 A 362 362
66 Romania 872 G 362 362
67 Romania 873 A 362 362
68 Romania 874 C 362 362
69 Romania 875 C 362 362
70 Romania 876 T 362 362
71 Romania 877 T 362 362
72 Romania 878 C 362 362
73 Romania 879 T 362 362
74 Romania 880 A 362 362
75 Romania 881 G 362 362
76 Romania 882 C 362 362
77 Romania 883 A 362 362
78 Romania 884 C T 362 360 Arg207Cys
79 Romania 885 G 362 362
80 Romania 886 T 362 362
81 Romania 887 G 362 362
82 Romania 888 C 362 362
83 Romania 889 T 362 362
84 Romania 890 G 362 362
85 Romania 891 G 362 362
86 Romania 892 T 362 362
87 Romania 893 A 362 362
88 Romania 894 A 362 362
89 Romania 895 A 362 362
90 Romania 896 G 362 362
91 Romania 897 C 362 362
92 Romania 898 T 362 362
93 Romania 899 T 362 362
94 Romania 900 C 362 362
95 Romania 901 A 362 362
96 Romania 902 T 362 362
97 Romania 903 G 362 362
98 Romania 904 C 362 362
99 Romania 905 A 362 362
100 Romania 906 C 362 362
101 Romania 907 T 362 362
102 Romania 908 T 362 362
103 Romania 909 T 362 362
104 Romania 910 G 362 362
105 Romania 911 T 362 362
106 Romania 912 C 362 362
107 Romania 913 C T 362 344 Ser216Ser
108 Romania 914 G 362 362
109 Romania 915 A 362 362
110 Romania 916 A 362 362
111 Romania 917 C 362 362
112 Romania 918 A 362 362
113 Romania 919 A 362 362
114 Romania 920 C 362 362
115 Romania 921 T 362 362
116 Romania 922 G 362 362
117 Romania 923 G 362 362
118 Romania 924 A 362 362
119 Romania 925 C 362 362
120 Romania 926 T 362 362
121 Romania 927 T 362 362
122 Romania 928 T 362 362
123 Romania 929 A 362 362
124 Romania 930 T 362 362
125 Romania 931 T 362 362
126 Romania 932 G 362 362
127 Romania 933 A 362 362
128 Romania 934 C 362 362
129 Romania 935 A 362 362
130 Romania 936 C 362 362
131 Romania 937 T 362 362
132 Romania 938 A 362 362
133 Romania 939 A 362 362
134 Romania 940 G 362 362
135 Romania 941 A 362 362
136 Romania 942 G 362 362
137 Romania 943 G 362 362
138 Romania 944 G 362 362
139 Romania 945 G 362 362
140 Romania 946 T 362 362
141 Romania 947 G 362 362
142 Romania 948 T 362 362
143 Romania 949 A 362 362
144 Romania 950 T 362 362
145 Romania 951 A 362 362
146 Romania 952 C 362 362
147 Romania 953 T 362 362
148 Romania 954 G 362 362
149 Romania 955 C T 362 360 Cys230Cys
150 Romania 956 T 362 362
151 Romania 957 G 362 362
152 Romania 958 C 362 362
153 Romania 959 C 362 362
154 Romania 960 G 362 362
155 Romania 961 T 362 362
156 Romania 962 G 362 362
157 Romania 963 A 362 360
158 Romania 964 A 362 362
159 Romania 965 C T 362 360 His234Tyr
160 Romania 966 A 362 362
161 Romania 967 T 362 362
162 Romania 968 G 362 362
163 Romania 969 A 362 362
164 Romania 970 G 362 362
165 Romania 971 C 362 362
166 Romania 972 A 362 362
167 Romania 973 T 362 362
168 Romania 974 G 362 362
169 Romania 975 A 362 362
170 Romania 976 A 362 362
171 Romania 977 A 362 362
172 Romania 978 T 362 362
173 Romania 979 T 362 362
174 Romania 980 G 362 362
175 Romania 981 C 362 362
176 Romania 982 T 362 362
177 Romania 983 T 362 362
178 Romania 984 G 362 362
179 Romania 985 G 362 362
180 Romania 986 T 362 362
181 Romania 987 A 362 362
182 Romania 988 C 362 362
183 Romania 989 A 362 362
184 Romania 990 C 362 362
185 Romania 991 G 362 362
186 Romania 992 G 362 362
187 Romania 993 A 362 362
188 Romania 994 A 362 362
189 Romania 995 C 362 362
190 Romania 996 G 362 362
191 Romania 997 T 362 362
192 Romania 998 T 362 362
193 Romania 999 C 362 362
194 Romania 1000 T 362 362
195 Romania 1001 G 362 362
196 Romania 1002 A 362 362
197 Romania 1003 A 362 362
198 Romania 1004 A 362 362
199 Romania 1005 A 362 362
200 Romania 1006 G 362 362
201 Romania 1007 A 362 362
202 Romania 1008 G 362 362
203 Romania 1009 C 362 362
204 Romania 1010 T 362 362
205 Romania 1011 A 362 362
206 Romania 1012 T 362 362
207 Romania 1013 G 362 362
208 Romania 1014 A 362 362
209 Romania 1015 A 362 362
210 Romania 1016 T 362 362
211 Romania 1017 T 362 362
212 Romania 1018 G 362 362
213 Romania 1019 C 362 362
214 Romania 1020 A 362 362
215 Romania 1021 G 362 362
216 Romania 1022 A 362 362
217 Romania 1023 C 362 362
218 Romania 1024 A 362 362
219 Romania 1025 C 362 362
220 Romania 1026 C 362 362
221 Romania 1027 T 362 362
222 Romania 1028 T 362 362
223 Romania 1029 T 362 362
224 Romania 1030 T 362 362
225 Romania 1031 G 362 362
226 Romania 1032 A 362 362
227 Romania 1033 A 362 362
228 Romania 1034 A 362 362
229 Romania 1035 T 362 362
230 Romania 1036 T 362 362
231 Romania 1037 A 362 362
232 Romania 1038 A 362 362
233 Romania 1039 A 362 362
234 Romania 1040 T 362 362
235 Romania 1041 T 362 362
236 Romania 1042 G 362 362
237 Romania 1043 G 362 362
238 Romania 1044 C 362 362
239 Romania 1045 A 362 362
240 Romania 1046 A 362 362
241 Romania 1047 A 362 362
242 Romania 1048 G 362 362
243 Romania 1049 A 362 362
244 Romania 1050 A 362 362
245 Romania 1051 A 362 362
246 Romania 1052 T 362 362
247 Romania 1053 T 362 362
248 Romania 1054 T 362 362
249 Romania 1055 G 362 362
250 Romania 1056 A 362 362
251 Romania 1057 C 362 362
252 Romania 1058 A 362 362
253 Romania 1059 C T 362 322 Thr265Ile
254 Romania 1060 C 362 362
255 Romania 1061 T 362 362
256 Romania 1062 T 362 362
257 Romania 1063 C 362 362
258 Romania 1064 A 362 362
259 Romania 1065 A 362 362
260 Romania 1066 T 362 362
261 Romania 1067 G 362 362
262 Romania 1068 G A 362 360 Gly268Glu
263 Romania 1069 G 362 362
264 Romania 1070 G 362 362
265 Romania 1071 A 362 362
266 Romania 1072 A 362 362
267 Romania 1073 T 362 362
268 Romania 1074 G T 362 360 Cys270Phe
269 Romania 1075 T 362 362
270 Romania 1076 C 362 362
271 Romania 1077 C 362 362
272 Romania 1078 A 362 362
273 Romania 1079 A 362 362
274 Romania 1080 A 362 362
275 Romania 1081 T 362 362
276 Romania 1082 T 362 362
277 Romania 1083 T 362 362
278 Romania 1084 T 362 362
279 Romania 1085 G 362 362
280 Romania 1086 T 362 362
281 Romania 1087 A 362 362
282 Romania 1088 T 362 362
283 Romania 1089 T 362 362
284 Romania 1090 T 362 362
285 Romania 1091 C 362 362
286 Romania 1092 C 362 362
287 Romania 1093 C 362 362
288 Romania 1094 T 362 362
289 Romania 1095 T 362 362
290 Romania 1096 A 362 362
291 Romania 1097 A 362 362
292 Romania 1098 A 362 362
293 Romania 1099 T 362 362
294 Romania 1100 T 362 362
295 Romania 1101 C 362 362
296 Romania 1102 C 362 362
297 Romania 1103 A 362 362
298 Romania 1104 T 362 362
299 Romania 1105 A 362 362
300 Romania 1106 A 362 362
301 Romania 1107 T 362 362
302 Romania 1108 C 362 362
303 Romania 1109 A 362 362
304 Romania 1110 A 362 362
305 Romania 1111 G 362 362
306 Romania 1112 A 362 362
307 Romania 1113 C 362 362
308 Romania 1114 T 362 362
309 Romania 1115 A 362 362
310 Romania 1116 T 362 362
311 Romania 1117 T 362 362
312 Romania 1118 C 362 362
313 Romania 1119 A 362 362
314 Romania 1120 A 362 362
315 Romania 1121 C 362 362
316 Romania 1122 C 362 362
317 Romania 1123 A 362 362
318 Romania 1124 A 362 362
319 Romania 1125 G A 362 360 Arg287Lys
320 Romania 1126 G 362 362
321 Romania 1127 G 362 362
322 Romania 1128 T 362 362
323 Romania 1129 T 362 362
324 Romania 1130 G 362 362
325 Romania 1131 A 362 362
326 Romania 1132 A 362 362
327 Romania 1133 A 362 362
328 Romania 1134 A 362 362
329 Romania 1135 G 362 362
330 Romania 1136 A 362 362
331 Romania 1137 A 362 362
332 Romania 1138 A 362 362
333 Romania 1139 A 362 362
334 Romania 1140 A 362 362
335 Romania 1141 G T 362 360 Lys292Asn
336 Romania 1142 C 362 362
337 Romania 1143 T 362 362
338 Romania 1144 T 362 362
339 Romania 1145 G 362 362
340 Romania 1146 A 362 362
341 Romania 1147 T 362 362
342 Romania 1148 G 362 362
343 Romania 1149 G 362 362
344 Romania 1150 C 362 362
345 Romania 1151 T 362 362
346 Romania 1152 T 362 362
347 Romania 1153 T 362 362
348 Romania 1154 A 362 362
349 Romania 1155 T 362 362
350 Romania 1156 G 362 362
351 Romania 1157 G 362 362
352 Romania 1158 G 362 362
353 Romania 1159 T 362 362
354 Romania 1160 A 362 362
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357 Romania 1163 A 362 362
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365 Romania 1171 T 362 362
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1117 Romania 1923 A 364 364
1118 Romania 1924 A 364 364
1119 Romania 1925 A 364 364
1120 Romania 1926 C 364 364
1121 Romania 1927 T 364 364
1122 Romania 1928 G 364 364
1123 Romania 1929 C 364 364
1124 Romania 1930 T 364 364
1125 Romania 1931 C 364 364
1126 Romania 1932 A 364 364
1127 Romania 1933 A 364 364
1128 Romania 1934 A 364 364
1129 Romania 1935 A 364 364
1130 Romania 1936 T 364 364
1131 Romania 1937 T 364 364
1132 Romania 1938 C T 364 362 Ser558Phe
1133 Romania 1939 T 364 364
1134 Romania 1940 G 364 364
1135 Romania 1941 T 364 364
1136 Romania 1942 G 364 364
1137 Romania 1943 C 364 364
1138 Romania 1944 G 364 364
1139 Romania 1945 T 364 364
1140 Romania 1946 G 364 364
1141 Romania 1947 T 364 364
1142 Romania 1948 T 364 364
1143 Romania 1949 T 364 364
1144 Romania 1950 T 364 364
1145 Romania 1951 A 364 364
1146 Romania 1952 C 364 364
1147 Romania 1953 A 364 364
1148 Romania 1954 G 364 364
1149 Romania 1955 A 364 364
1150 Romania 1956 A 364 364
1151 Romania 1957 G 364 364
1152 Romania 1958 G 364 364
1153 Romania 1959 C 364 364
1154 Romania 1960 C 364 364
1155 Romania 1961 G 364 364
1156 Romania 1962 C 364 364
1157 Romania 1963 T 364 364
1158 Romania 1964 A 364 364
1159 Romania 1965 T 364 364
1160 Romania 1966 A 364 364
1161 Romania 1967 A 364 364
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1163 Romania 1969 A 364 364
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1165 Romania 1971 T 364 364
1166 Romania 1972 A 364 364
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1169 Romania 1975 A 364 364
1170 Romania 1976 G 364 364
1171 Romania 1977 A 364 364
1172 Romania 1978 T 364 364
1173 Romania 1979 G 364 364
1174 Romania 1980 G 364 364
1175 Romania 1981 A 364 364
1176 Romania 1982 A 364 364
1177 Romania 1983 T 364 364
1178 Romania 1984 T 364 364
1179 Romania 1985 T 364 364
1180 Romania 1986 C 364 364
1181 Romania 1987 A 364 364
1182 Romania 1988 C 364 364
1183 Romania 1989 A 364 364
1184 Romania 1990 G 364 364
1185 Romania 1991 T 364 364
1186 Romania 1992 A 364 364
1187 Romania 1993 T 364 364
1188 Romania 1994 T 364 364
1189 Romania 1995 C 364 364
1190 Romania 1996 A 364 364
1191 Romania 1997 C 364 364
1192 Romania 1998 T 364 364
1193 Romania 1999 G 364 364
1194 Romania 2000 A 364 364
1195 Romania 2001 G 364 364
1196 Romania 2002 A 364 364
1197 Romania 2003 C 364 364
1198 Romania 2004 T 364 364
1199 Romania 2005 C 364 364
1200 Romania 2006 A 364 364
1201 Romania 2007 T 364 364
1202 Romania 2008 T 364 364
1203 Romania 2009 G 364 364
1204 Romania 2010 A 364 364
1205 Romania 2011 T 364 364
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1211 Romania 2017 G 364 364
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1213 Romania 2019 T 364 364
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1215 Romania 2021 T 364 364
1216 Romania 2022 T 364 364
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1219 Romania 2025 C 364 364
1220 Romania 2026 A 364 364
1221 Romania 2027 T 364 364
1222 Romania 2028 C 364 364
1223 Romania 2029 T 364 364
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1225 Romania 2031 A G 364 362 Asp589Gly
1226 Romania 2032 T 364 364
1227 Romania 2033 T 364 364
1228 Romania 2034 T 364 364
1229 Romania 2035 G 364 364
1230 Romania 2036 G 364 364
1231 Romania 2037 C 364 364
1232 Romania 2038 T 364 364
1233 Romania 2039 A 364 364
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1235 Romania 2041 T 364 364
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1238 Romania 2044 C 364 364
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1241 Romania 2047 T 364 364
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1243 Romania 2049 T 364 364
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1251 Romania 2057 A 364 364
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1259 Romania 2065 C 364 364
1260 Romania 2066 A 364 364
1261 Romania 2067 T 364 364
1262 Romania 2068 T 364 364
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1267 Romania 2073 G 364 364
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1270 Romania 2076 G 364 364
1271 Romania 2077 T 364 364
1272 Romania 2078 G 364 364
1273 Romania 2079 T 364 364
1274 Romania 2080 T 364 364
1275 Romania 2081 G 364 364
1276 Romania 2082 T 364 364
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1281 Romania 2087 T 364 364
1282 Romania 2088 T 364 364
1283 Romania 2089 G 364 364
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1285 Romania 2091 C 364 364
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1287 Romania 2093 T 364 364
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1300 Romania 2106 C 364 364
1301 Romania 2107 T 364 364
1302 Romania 2108 A 364 364
1303 Romania 2109 A 364 364
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1305 Romania 2111 A 364 364
1306 Romania 2112 T 364 364
1307 Romania 2113 C 364 364
1308 Romania 2114 T 364 364
1309 Romania 2115 T 364 364
1310 Romania 2116 T 364 364
1311 Romania 2117 G 364 364
1312 Romania 2118 G 364 364
1313 Romania 2119 C 364 364
1314 Romania 2120 A 364 364
1315 Romania 2121 C 364 364
1316 Romania 2122 T 364 364
1317 Romania 2123 G 364 364
1318 Romania 2124 T 364 364
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1320 Romania 2126 T 364 364
1321 Romania 2127 A 364 364
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1325 Romania 2131 A 364 364
1326 Romania 2132 A 364 364
1327 Romania 2133 A 364 364
1328 Romania 2134 A 364 364
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1330 Romania 2136 T 364 364
1331 Romania 2137 C 364 364
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1333 Romania 2139 A 364 364
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1335 Romania 2141 C 364 364
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1337 Romania 2143 C T 364 362 Pro626Pro
1338 Romania 2144 G 364 364
1339 Romania 2145 T 364 364
1340 Romania 2146 C 364 364
1341 Romania 2147 C 364 364
1342 Romania 2148 T 364 364
1343 Romania 2149 T 364 364
1344 Romania 2150 G 364 364
1345 Romania 2151 A 364 364
1346 Romania 2152 T 364 364
1347 Romania 2153 T 364 364
1348 Romania 2154 G 364 364
1349 Romania 2155 G 364 364
1350 Romania 2156 C 364 364
1351 Romania 2157 T 364 364
1352 Romania 2158 T 364 364
1353 Romania 2159 G 364 364
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1355 Romania 2161 A 364 364
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1361 Romania 2167 G 382 382
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1363 Romania 2169 T 382 382
1364 Romania 2170 T 382 382
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1366 Romania 2172 A 382 382
1367 Romania 2173 G 382 382
1368 Romania 2174 G 382 382
1369 Romania 2175 A 382 382
1370 Romania 2176 A 382 382
1371 Romania 2177 G 382 382
1372 Romania 2178 G 382 382
1373 Romania 2179 T 382 382
1374 Romania 2180 G 382 382
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1379 Romania 2185 G 382 382
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1381 Romania 2187 T 382 382
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1384 Romania 2190 T 382 382
1385 Romania 2191 T 382 382
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1400 Romania 2206 A 382 382
1401 Romania 2207 A 382 382
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1403 Romania 2209 T 382 382
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1480 Romania 2286 G 382 382
1481 Romania 2287 T 382 382
1482 Romania 2288 G 382 382
1483 Romania 2289 T 382 382
1484 Romania 2290 T 382 382
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1851 Romania 2657 A 382 382
1852 Romania 2658 A 382 382
1853 Romania 2659 G T 382 378 Lys798Asn
1854 Romania 2660 T 382 382
1855 Romania 2661 A 382 382
1856 Romania 2662 C 382 382
1857 Romania 2663 T 382 382
1858 Romania 2664 G 382 382
1859 Romania 2665 T 382 382
1860 Romania 2666 G 382 382
1861 Romania 2667 C 382 382
1862 Romania 2668 C 382 382
1863 Romania 2669 C 382 382
1864 Romania 2670 T 382 382
1865 Romania 2671 T 382 382
1866 Romania 2672 G 382 382
1867 Romania 2673 C 382 382
1868 Romania 2674 A 382 382
1869 Romania 2675 C 382 382
1870 Romania 2676 C 382 382
1871 Romania 2677 T 382 382
1872 Romania 2678 A 382 382
1873 Romania 2679 A 382 382
1874 Romania 2680 T 382 382
1875 Romania 2681 A 382 382
1876 Romania 2682 T 382 382
1877 Romania 2683 G 382 382
1878 Romania 2684 A 382 382
1879 Romania 2685 T 382 382
1880 Romania 2686 G 382 382
1881 Romania 2687 G 382 382
1882 Romania 2688 T 382 382
1883 Romania 2689 A 382 382
1884 Romania 2690 A 382 382
1885 Romania 2691 C 382 382
1886 Romania 2692 A 382 382
1887 Romania 2693 A 382 382
1888 Romania 2694 A 382 382
1889 Romania 2695 C 382 382
1890 Romania 2696 A 382 382
1891 Romania 2697 A 382 382
1892 Romania 2698 T 382 382
1893 Romania 2699 A 382 382
1894 Romania 2700 C 382 382
1895 Romania 2701 C 382 382
1896 Romania 2702 T 382 382
1897 Romania 2703 T 382 382
1898 Romania 2704 C 382 382
1899 Romania 2705 A 382 382
1900 Romania 2706 C 382 382
1901 Romania 2707 A 382 382
1902 Romania 2708 C 382 382
1903 Romania 2709 T 382 382
1904 Romania 2710 C T 382 380 Leu815Leu
1905 Romania 2711 A 382 382
1906 Romania 2712 A 382 382
1907 Romania 2713 A 382 382
1908 Romania 2714 G 382 382
1909 Romania 2715 G 382 382
1910 Romania 2716 C 382 382
1911 Romania 2717 G 382 382
1912 Romania 2718 G 382 382
1913 Romania 2719 T 382 382