National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   1,914                                        
?                                            
A   132                                        
C   81                                        
D   60     1                 1                
E   162                                        
F   90                                        
G   147                                        
H   27                                        
I   120                                        
K   153                                        
L   180                                        
M   30                                        
N   93                                        
P   66                                        
Q   54                                        
R   57                                        
S   108                                        
T   138                                        
V   138                                        
W   21                                        
Y   57                                       1

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Madagascar 806 G 6 6
1 Madagascar 807 C 6 6
2 Madagascar 808 A 6 6
3 Madagascar 809 T 6 6
4 Madagascar 810 A 6 6
5 Madagascar 811 C 6 6
6 Madagascar 812 A 6 6
7 Madagascar 813 C 6 6
8 Madagascar 814 T 6 6
9 Madagascar 815 C 6 6
10 Madagascar 816 G 6 6
11 Madagascar 817 C 6 6
12 Madagascar 818 T 6 6
13 Madagascar 819 A 6 6
14 Madagascar 820 T 6 6
15 Madagascar 821 G 6 6
16 Madagascar 822 T 6 6
17 Madagascar 823 C 6 6
18 Madagascar 824 G 6 6
19 Madagascar 825 A 6 6
20 Madagascar 826 T 6 6
21 Madagascar 827 A 6 6
22 Madagascar 828 A 6 6
23 Madagascar 829 C 6 6
24 Madagascar 830 A 6 6
25 Madagascar 831 A 6 6
26 Madagascar 832 C 6 6
27 Madagascar 833 T 6 6
28 Madagascar 834 T 6 6
29 Madagascar 835 C 6 6
30 Madagascar 836 T 6 6
31 Madagascar 837 G 6 6
32 Madagascar 838 T 6 6
33 Madagascar 839 G 6 6
34 Madagascar 840 G 6 6
35 Madagascar 841 C 6 6
36 Madagascar 842 C 6 6
37 Madagascar 843 C 6 6
38 Madagascar 844 T 6 6
39 Madagascar 845 G 6 6
40 Madagascar 846 A 6 6
41 Madagascar 847 T 6 6
42 Madagascar 848 G 6 6
43 Madagascar 849 G 6 6
44 Madagascar 850 C 6 6
45 Madagascar 851 T 6 6
46 Madagascar 852 A 6 6
47 Madagascar 853 C 6 6
48 Madagascar 854 C 6 6
49 Madagascar 855 C 6 6
50 Madagascar 856 T 6 6
51 Madagascar 857 C 6 6
52 Madagascar 858 T 6 6
53 Madagascar 859 T 6 6
54 Madagascar 860 G 6 6
55 Madagascar 861 A 6 6
56 Madagascar 862 G 6 6
57 Madagascar 863 T 6 6
58 Madagascar 864 G 6 6
59 Madagascar 865 C 6 6
60 Madagascar 866 A 6 6
61 Madagascar 867 T 6 6
62 Madagascar 868 T 6 6
63 Madagascar 869 A 6 6
64 Madagascar 870 A 6 6
65 Madagascar 871 A 6 6
66 Madagascar 872 G 6 6
67 Madagascar 873 A 6 6
68 Madagascar 874 C 6 6
69 Madagascar 875 C 6 6
70 Madagascar 876 T 6 6
71 Madagascar 877 T 6 6
72 Madagascar 878 C 6 6
73 Madagascar 879 T 6 6
74 Madagascar 880 A 6 6
75 Madagascar 881 G 6 6
76 Madagascar 882 C 6 6
77 Madagascar 883 A 6 6
78 Madagascar 884 C 6 6
79 Madagascar 885 G 6 6
80 Madagascar 886 T 6 6
81 Madagascar 887 G 6 6
82 Madagascar 888 C 6 6
83 Madagascar 889 T 6 6
84 Madagascar 890 G 6 6
85 Madagascar 891 G 6 6
86 Madagascar 892 T 6 6
87 Madagascar 893 A 6 6
88 Madagascar 894 A 6 6
89 Madagascar 895 A 6 6
90 Madagascar 896 G 6 6
91 Madagascar 897 C 6 6
92 Madagascar 898 T 6 6
93 Madagascar 899 T 6 6
94 Madagascar 900 C 6 6
95 Madagascar 901 A 6 6
96 Madagascar 902 T 6 6
97 Madagascar 903 G 6 6
98 Madagascar 904 C 6 6
99 Madagascar 905 A 6 6
100 Madagascar 906 C 6 6
101 Madagascar 907 T 6 6
102 Madagascar 908 T 6 6
103 Madagascar 909 T 6 6
104 Madagascar 910 G 6 6
105 Madagascar 911 T 6 6
106 Madagascar 912 C 6 6
107 Madagascar 913 C 6 6
108 Madagascar 914 G 6 6
109 Madagascar 915 A 6 6
110 Madagascar 916 A 6 6
111 Madagascar 917 C 6 6
112 Madagascar 918 A 6 6
113 Madagascar 919 A 6 6
114 Madagascar 920 C 6 6
115 Madagascar 921 T 6 6
116 Madagascar 922 G 6 6
117 Madagascar 923 G 6 6
118 Madagascar 924 A 6 6
119 Madagascar 925 C 6 6
120 Madagascar 926 T 6 6
121 Madagascar 927 T 6 6
122 Madagascar 928 T 6 6
123 Madagascar 929 A 6 6
124 Madagascar 930 T 6 6
125 Madagascar 931 T 6 6
126 Madagascar 932 G 6 6
127 Madagascar 933 A 6 6
128 Madagascar 934 C 6 6
129 Madagascar 935 A 6 6
130 Madagascar 936 C 6 6
131 Madagascar 937 T 6 6
132 Madagascar 938 A 6 6
133 Madagascar 939 A 6 6
134 Madagascar 940 G 6 6
135 Madagascar 941 A 6 6
136 Madagascar 942 G 6 6
137 Madagascar 943 G 6 6
138 Madagascar 944 G 6 6
139 Madagascar 945 G 6 6
140 Madagascar 946 T 6 6
141 Madagascar 947 G 6 6
142 Madagascar 948 T 6 6
143 Madagascar 949 A 6 6
144 Madagascar 950 T 6 6
145 Madagascar 951 A 6 6
146 Madagascar 952 C 6 6
147 Madagascar 953 T 6 6
148 Madagascar 954 G 6 6
149 Madagascar 955 C 6 6
150 Madagascar 956 T 6 6
151 Madagascar 957 G 6 6
152 Madagascar 958 C 6 6
153 Madagascar 959 C 6 6
154 Madagascar 960 G 6 6
155 Madagascar 961 T 6 6
156 Madagascar 962 G 6 6
157 Madagascar 963 A 6 6
158 Madagascar 964 A 6 6
159 Madagascar 965 C 6 6
160 Madagascar 966 A 6 6
161 Madagascar 967 T 6 6
162 Madagascar 968 G 6 6
163 Madagascar 969 A 6 6
164 Madagascar 970 G 6 6
165 Madagascar 971 C 6 6
166 Madagascar 972 A 6 6
167 Madagascar 973 T 6 6
168 Madagascar 974 G 6 6
169 Madagascar 975 A 6 6
170 Madagascar 976 A 6 6
171 Madagascar 977 A 6 6
172 Madagascar 978 T 6 6
173 Madagascar 979 T 6 6
174 Madagascar 980 G 6 6
175 Madagascar 981 C 6 6
176 Madagascar 982 T 6 6
177 Madagascar 983 T 6 6
178 Madagascar 984 G 6 6
179 Madagascar 985 G 6 6
180 Madagascar 986 T 6 6
181 Madagascar 987 A 6 6
182 Madagascar 988 C 6 6
183 Madagascar 989 A 6 6
184 Madagascar 990 C 6 6
185 Madagascar 991 G 6 6
186 Madagascar 992 G 6 6
187 Madagascar 993 A 6 6
188 Madagascar 994 A 6 6
189 Madagascar 995 C 6 6
190 Madagascar 996 G 6 6
191 Madagascar 997 T 6 6
192 Madagascar 998 T 6 6
193 Madagascar 999 C 6 6
194 Madagascar 1000 T 6 6
195 Madagascar 1001 G 6 6
196 Madagascar 1002 A 6 6
197 Madagascar 1003 A 6 6
198 Madagascar 1004 A 6 6
199 Madagascar 1005 A 6 6
200 Madagascar 1006 G 6 6
201 Madagascar 1007 A 6 6
202 Madagascar 1008 G 6 6
203 Madagascar 1009 C 6 6
204 Madagascar 1010 T 6 6
205 Madagascar 1011 A 6 6
206 Madagascar 1012 T 6 6
207 Madagascar 1013 G 6 6
208 Madagascar 1014 A 6 6
209 Madagascar 1015 A 6 6
210 Madagascar 1016 T 6 6
211 Madagascar 1017 T 6 6
212 Madagascar 1018 G 6 6
213 Madagascar 1019 C 6 6
214 Madagascar 1020 A 6 6
215 Madagascar 1021 G 6 6
216 Madagascar 1022 A 6 6
217 Madagascar 1023 C 6 6
218 Madagascar 1024 A 6 6
219 Madagascar 1025 C 6 6
220 Madagascar 1026 C 6 6
221 Madagascar 1027 T 6 6
222 Madagascar 1028 T 6 6
223 Madagascar 1029 T 6 6
224 Madagascar 1030 T 6 6
225 Madagascar 1031 G 6 6
226 Madagascar 1032 A 6 6
227 Madagascar 1033 A 6 6
228 Madagascar 1034 A 6 6
229 Madagascar 1035 T 6 6
230 Madagascar 1036 T 6 6
231 Madagascar 1037 A 6 6
232 Madagascar 1038 A 6 6
233 Madagascar 1039 A 6 6
234 Madagascar 1040 T 6 6
235 Madagascar 1041 T 6 6
236 Madagascar 1042 G 6 6
237 Madagascar 1043 G 6 6
238 Madagascar 1044 C 6 6
239 Madagascar 1045 A 6 6
240 Madagascar 1046 A 6 6
241 Madagascar 1047 A 6 6
242 Madagascar 1048 G 6 6
243 Madagascar 1049 A 6 6
244 Madagascar 1050 A 6 6
245 Madagascar 1051 A 6 6
246 Madagascar 1052 T 6 6
247 Madagascar 1053 T 6 6
248 Madagascar 1054 T 6 6
249 Madagascar 1055 G 6 6
250 Madagascar 1056 A 6 6
251 Madagascar 1057 C 6 6
252 Madagascar 1058 A 6 6
253 Madagascar 1059 C 6 6
254 Madagascar 1060 C 6 6
255 Madagascar 1061 T 6 6
256 Madagascar 1062 T 6 6
257 Madagascar 1063 C 6 6
258 Madagascar 1064 A 6 6
259 Madagascar 1065 A 6 6
260 Madagascar 1066 T 6 6
261 Madagascar 1067 G 6 6
262 Madagascar 1068 G 6 6
263 Madagascar 1069 G 6 6
264 Madagascar 1070 G 6 6
265 Madagascar 1071 A 6 6
266 Madagascar 1072 A 6 6
267 Madagascar 1073 T 6 6
268 Madagascar 1074 G 6 6
269 Madagascar 1075 T 6 6
270 Madagascar 1076 C 6 6
271 Madagascar 1077 C 6 6
272 Madagascar 1078 A 6 6
273 Madagascar 1079 A 6 6
274 Madagascar 1080 A 6 6
275 Madagascar 1081 T 6 6
276 Madagascar 1082 T 6 6
277 Madagascar 1083 T 6 6
278 Madagascar 1084 T 6 6
279 Madagascar 1085 G 6 6
280 Madagascar 1086 T 6 6
281 Madagascar 1087 A 6 6
282 Madagascar 1088 T 6 6
283 Madagascar 1089 T 6 6
284 Madagascar 1090 T 6 6
285 Madagascar 1091 C 6 6
286 Madagascar 1092 C 6 6
287 Madagascar 1093 C 6 6
288 Madagascar 1094 T 6 6
289 Madagascar 1095 T 6 6
290 Madagascar 1096 A 6 6
291 Madagascar 1097 A 6 6
292 Madagascar 1098 A 6 6
293 Madagascar 1099 T 6 6
294 Madagascar 1100 T 6 6
295 Madagascar 1101 C 6 6
296 Madagascar 1102 C 6 6
297 Madagascar 1103 A 6 6
298 Madagascar 1104 T 6 6
299 Madagascar 1105 A 6 6
300 Madagascar 1106 A 6 6
301 Madagascar 1107 T 6 6
302 Madagascar 1108 C 6 6
303 Madagascar 1109 A 6 6
304 Madagascar 1110 A 6 6
305 Madagascar 1111 G 6 6
306 Madagascar 1112 A 6 6
307 Madagascar 1113 C 6 6
308 Madagascar 1114 T 6 6
309 Madagascar 1115 A 6 6
310 Madagascar 1116 T 6 6
311 Madagascar 1117 T 6 6
312 Madagascar 1118 C 6 6
313 Madagascar 1119 A 6 6
314 Madagascar 1120 A 6 6
315 Madagascar 1121 C 6 6
316 Madagascar 1122 C 6 6
317 Madagascar 1123 A 6 6
318 Madagascar 1124 A 6 6
319 Madagascar 1125 G 6 6
320 Madagascar 1126 G 6 6
321 Madagascar 1127 G 6 6
322 Madagascar 1128 T 6 6
323 Madagascar 1129 T 6 6
324 Madagascar 1130 G 6 6
325 Madagascar 1131 A 6 6
326 Madagascar 1132 A 6 6
327 Madagascar 1133 A 6 6
328 Madagascar 1134 A 6 6
329 Madagascar 1135 G 6 6
330 Madagascar 1136 A 6 6
331 Madagascar 1137 A 6 6
332 Madagascar 1138 A 6 6
333 Madagascar 1139 A 6 6
334 Madagascar 1140 A 6 6
335 Madagascar 1141 G 6 6
336 Madagascar 1142 C 6 6
337 Madagascar 1143 T 6 6
338 Madagascar 1144 T 6 6
339 Madagascar 1145 G 6 6
340 Madagascar 1146 A 6 6
341 Madagascar 1147 T 6 6
342 Madagascar 1148 G 6 6
343 Madagascar 1149 G 6 6
344 Madagascar 1150 C 6 6
345 Madagascar 1151 T 6 6
346 Madagascar 1152 T 6 6
347 Madagascar 1153 T 6 6
348 Madagascar 1154 A 6 6
349 Madagascar 1155 T 6 6
350 Madagascar 1156 G 6 6
351 Madagascar 1157 G 6 6
352 Madagascar 1158 G 6 6
353 Madagascar 1159 T 6 6
354 Madagascar 1160 A 6 6
355 Madagascar 1161 G 6 6
356 Madagascar 1162 A 6 6
357 Madagascar 1163 A 6 6
358 Madagascar 1164 T 6 6
359 Madagascar 1165 T 6 6
360 Madagascar 1166 C 6 6
361 Madagascar 1167 G 6 6
362 Madagascar 1168 A 6 6
363 Madagascar 1169 T 6 6
364 Madagascar 1170 C 6 6
365 Madagascar 1171 T 6 6
366 Madagascar 1172 G 6 6
367 Madagascar 1173 T 6 6
368 Madagascar 1174 C 6 6
369 Madagascar 1175 T 6 6
370 Madagascar 1176 A 6 6
371 Madagascar 1177 T 6 6
372 Madagascar 1178 C 6 6
373 Madagascar 1179 C 6 6
374 Madagascar 1180 A 6 6
375 Madagascar 1181 G 6 6
376 Madagascar 1182 T 6 6
377 Madagascar 1183 T 6 6
378 Madagascar 1184 G 6 6
379 Madagascar 1185 C 6 6
380 Madagascar 1186 G 6 6
381 Madagascar 1187 T 6 6
382 Madagascar 1188 C 6 6
383 Madagascar 1189 A 6 6
384 Madagascar 1190 C 6 6
385 Madagascar 1191 C 6 6
386 Madagascar 1192 A 6 6
387 Madagascar 1193 A 6 6
388 Madagascar 1194 A 6 6
389 Madagascar 1195 T 6 6
390 Madagascar 1196 G 6 6
391 Madagascar 1197 A 6 6
392 Madagascar 1198 A 6 6
393 Madagascar 1199 T 6 6
394 Madagascar 1200 G 6 6
395 Madagascar 1201 C 6 6
396 Madagascar 1202 A 6 6
397 Madagascar 1203 A 6 6
398 Madagascar 1204 C 6 6
399 Madagascar 1205 C 6 6
400 Madagascar 1206 A 6 6
401 Madagascar 1207 A 6 6
402 Madagascar 1208 A 6 6
403 Madagascar 1209 T 6 6
404 Madagascar 1210 G 6 6
405 Madagascar 1211 T 6 6
406 Madagascar 1212 G 6 6
407 Madagascar 1213 C 6 6
408 Madagascar 1214 C 6 6
409 Madagascar 1215 T 6 6
410 Madagascar 1216 T 6 6
411 Madagascar 1217 T 6 6
412 Madagascar 1218 C 6 6
413 Madagascar 1219 A 6 6
414 Madagascar 1220 A 6 6
415 Madagascar 1221 C 6 6
416 Madagascar 1222 T 6 6
417 Madagascar 1223 C 6 6
418 Madagascar 1224 T 6 6
419 Madagascar 1225 C 6 6
420 Madagascar 1226 A 6 6
421 Madagascar 1227 T 6 6
422 Madagascar 1228 G 6 6
423 Madagascar 1229 A 6 6
424 Madagascar 1230 A 6 6
425 Madagascar 1231 G 6 6
426 Madagascar 1232 T 6 6
427 Madagascar 1233 G 6 6
428 Madagascar 1234 T 6 6
429 Madagascar 1235 G 6 6
430 Madagascar 1236 A 6 6
431 Madagascar 1237 T 6 6
432 Madagascar 1238 C 6 6
433 Madagascar 1239 A 6 6
434 Madagascar 1240 T 6 6
435 Madagascar 1241 T 6 6
436 Madagascar 1242 G 6 6
437 Madagascar 1243 T 6 6
438 Madagascar 1244 G 6 6
439 Madagascar 1245 G 6 6
440 Madagascar 1246 T 6 6
441 Madagascar 1247 G 6 6
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1831 Madagascar 2637 T 6 6
1832 Madagascar 2638 C 6 6
1833 Madagascar 2639 G 6 6
1834 Madagascar 2640 A 6 6
1835 Madagascar 2641 A 6 6
1836 Madagascar 2642 A 6 6
1837 Madagascar 2643 T 6 6
1838 Madagascar 2644 C 6 6
1839 Madagascar 2645 A 6 6
1840 Madagascar 2646 A 6 6
1841 Madagascar 2647 A 6 6
1842 Madagascar 2648 G 6 6
1843 Madagascar 2649 A 6 6
1844 Madagascar 2650 C 6 6
1845 Madagascar 2651 A 6 6
1846 Madagascar 2652 C 6 6
1847 Madagascar 2653 A 6 6
1848 Madagascar 2654 G 6 6
1849 Madagascar 2655 A 6 6
1850 Madagascar 2656 A 6 6
1851 Madagascar 2657 A 6 6
1852 Madagascar 2658 A 6 6
1853 Madagascar 2659 G 6 6
1854 Madagascar 2660 T 6 6
1855 Madagascar 2661 A 6 6
1856 Madagascar 2662 C 6 6
1857 Madagascar 2663 T 6 6
1858 Madagascar 2664 G 6 6
1859 Madagascar 2665 T 6 6
1860 Madagascar 2666 G 6 6
1861 Madagascar 2667 C 6 6
1862 Madagascar 2668 C 6 6
1863 Madagascar 2669 C 6 6
1864 Madagascar 2670 T 6 6
1865 Madagascar 2671 T 6 6
1866 Madagascar 2672 G 6 6
1867 Madagascar 2673 C 6 6
1868 Madagascar 2674 A 6 6
1869 Madagascar 2675 C 6 6
1870 Madagascar 2676 C 6 6
1871 Madagascar 2677 T 6 6
1872 Madagascar 2678 A 6 6
1873 Madagascar 2679 A 6 6
1874 Madagascar 2680 T 6 6
1875 Madagascar 2681 A 6 6
1876 Madagascar 2682 T 6 6
1877 Madagascar 2683 G 6 6
1878 Madagascar 2684 A 6 6
1879 Madagascar 2685 T 6 6
1880 Madagascar 2686 G 6 6
1881 Madagascar 2687 G 6 6
1882 Madagascar 2688 T 6 6
1883 Madagascar 2689 A 6 6
1884 Madagascar 2690 A 6 6
1885 Madagascar 2691 C 6 6
1886 Madagascar 2692 A 6 6
1887 Madagascar 2693 A 6 6
1888 Madagascar 2694 A 6 6
1889 Madagascar 2695 C 6 6
1890 Madagascar 2696 A 6 6
1891 Madagascar 2697 A 6 6
1892 Madagascar 2698 T 6 6
1893 Madagascar 2699 A 6 6
1894 Madagascar 2700 C 6 6
1895 Madagascar 2701 C 6 6
1896 Madagascar 2702 T 6 6
1897 Madagascar 2703 T 6 6
1898 Madagascar 2704 C 6 6
1899 Madagascar 2705 A 6 6
1900 Madagascar 2706 C 6 6
1901 Madagascar 2707 A 6 6
1902 Madagascar 2708 C 6 6
1903 Madagascar 2709 T 6 6
1904 Madagascar 2710 C 6 6
1905 Madagascar 2711 A 6 6
1906 Madagascar 2712 A 6 6
1907 Madagascar 2713 A 6 6
1908 Madagascar 2714 G 6 6
1909 Madagascar 2715 G 6 6
1910 Madagascar 2716 C 6 6
1911 Madagascar 2717 G 6 6
1912 Madagascar 2718 G 6 6
1913 Madagascar 2719 T 6 6