National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   1,914                                        
?                                            
A   132                                        
C   81                                        
D   60                                        
E   162                                        
F   90                                        
G   147                                        
H   27                                        
I   120                                        
K   153                                        
L   180                                        
M   30                                        
N   93                                        
P   66                                        
Q   54                                        
R   57                                        
S   108                                        
T   138                                        
V   138                                        
W   21                                        
Y   57                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 806 G 5 5
1 Brunei 807 C 5 5
2 Brunei 808 A 5 5
3 Brunei 809 T 5 5
4 Brunei 810 A 5 5
5 Brunei 811 C 5 5
6 Brunei 812 A 5 5
7 Brunei 813 C 5 5
8 Brunei 814 T 5 5
9 Brunei 815 C 5 5
10 Brunei 816 G 5 5
11 Brunei 817 C 5 5
12 Brunei 818 T 5 5
13 Brunei 819 A 5 5
14 Brunei 820 T 5 5
15 Brunei 821 G 5 5
16 Brunei 822 T 5 5
17 Brunei 823 C 5 5
18 Brunei 824 G 5 5
19 Brunei 825 A 5 5
20 Brunei 826 T 5 5
21 Brunei 827 A 5 5
22 Brunei 828 A 5 5
23 Brunei 829 C 5 5
24 Brunei 830 A 5 5
25 Brunei 831 A 5 5
26 Brunei 832 C 5 5
27 Brunei 833 T 5 5
28 Brunei 834 T 5 5
29 Brunei 835 C 5 5
30 Brunei 836 T 5 5
31 Brunei 837 G 5 5
32 Brunei 838 T 5 5
33 Brunei 839 G 5 5
34 Brunei 840 G 5 5
35 Brunei 841 C 5 5
36 Brunei 842 C 5 5
37 Brunei 843 C 5 5
38 Brunei 844 T 5 5
39 Brunei 845 G 5 5
40 Brunei 846 A 5 5
41 Brunei 847 T 5 5
42 Brunei 848 G 5 5
43 Brunei 849 G 5 5
44 Brunei 850 C 5 5
45 Brunei 851 T 5 5
46 Brunei 852 A 5 5
47 Brunei 853 C 5 5
48 Brunei 854 C 5 5
49 Brunei 855 C 5 5
50 Brunei 856 T 5 5
51 Brunei 857 C 5 5
52 Brunei 858 T 5 5
53 Brunei 859 T 5 5
54 Brunei 860 G 5 5
55 Brunei 861 A 5 5
56 Brunei 862 G 5 5
57 Brunei 863 T 5 5
58 Brunei 864 G 5 5
59 Brunei 865 C 5 5
60 Brunei 866 A 5 5
61 Brunei 867 T 5 5
62 Brunei 868 T 5 5
63 Brunei 869 A 5 5
64 Brunei 870 A 5 5
65 Brunei 871 A 5 5
66 Brunei 872 G 5 5
67 Brunei 873 A 5 5
68 Brunei 874 C 5 5
69 Brunei 875 C 5 5
70 Brunei 876 T 5 5
71 Brunei 877 T 5 5
72 Brunei 878 C 5 5
73 Brunei 879 T 5 5
74 Brunei 880 A 5 5
75 Brunei 881 G 5 5
76 Brunei 882 C 5 5
77 Brunei 883 A 5 5
78 Brunei 884 C 5 5
79 Brunei 885 G 5 5
80 Brunei 886 T 5 5
81 Brunei 887 G 5 5
82 Brunei 888 C 5 5
83 Brunei 889 T 5 5
84 Brunei 890 G 5 5
85 Brunei 891 G 5 5
86 Brunei 892 T 5 5
87 Brunei 893 A 5 5
88 Brunei 894 A 5 5
89 Brunei 895 A 5 5
90 Brunei 896 G 5 5
91 Brunei 897 C 5 5
92 Brunei 898 T 5 5
93 Brunei 899 T 5 5
94 Brunei 900 C 5 5
95 Brunei 901 A 5 5
96 Brunei 902 T 5 5
97 Brunei 903 G 5 5
98 Brunei 904 C 5 5
99 Brunei 905 A 5 5
100 Brunei 906 C 5 5
101 Brunei 907 T 5 5
102 Brunei 908 T 5 5
103 Brunei 909 T 5 5
104 Brunei 910 G 5 5
105 Brunei 911 T 5 5
106 Brunei 912 C 5 5
107 Brunei 913 C 5 5
108 Brunei 914 G 5 5
109 Brunei 915 A 5 5
110 Brunei 916 A 5 5
111 Brunei 917 C 5 5
112 Brunei 918 A 5 5
113 Brunei 919 A 5 5
114 Brunei 920 C 5 5
115 Brunei 921 T 5 5
116 Brunei 922 G 5 5
117 Brunei 923 G 5 5
118 Brunei 924 A 5 5
119 Brunei 925 C 5 5
120 Brunei 926 T 5 5
121 Brunei 927 T 5 5
122 Brunei 928 T 5 5
123 Brunei 929 A 5 5
124 Brunei 930 T 5 5
125 Brunei 931 T 5 5
126 Brunei 932 G 5 5
127 Brunei 933 A 5 5
128 Brunei 934 C 5 5
129 Brunei 935 A 5 5
130 Brunei 936 C 5 5
131 Brunei 937 T 5 5
132 Brunei 938 A 5 5
133 Brunei 939 A 5 5
134 Brunei 940 G 5 5
135 Brunei 941 A 5 5
136 Brunei 942 G 5 5
137 Brunei 943 G 5 5
138 Brunei 944 G 5 5
139 Brunei 945 G 5 5
140 Brunei 946 T 5 5
141 Brunei 947 G 5 5
142 Brunei 948 T 5 5
143 Brunei 949 A 5 5
144 Brunei 950 T 5 5
145 Brunei 951 A 5 5
146 Brunei 952 C 5 5
147 Brunei 953 T 5 5
148 Brunei 954 G 5 5
149 Brunei 955 C 5 5
150 Brunei 956 T 5 5
151 Brunei 957 G 5 5
152 Brunei 958 C 5 5
153 Brunei 959 C 5 5
154 Brunei 960 G 5 5
155 Brunei 961 T 5 5
156 Brunei 962 G 5 5
157 Brunei 963 A 5 5
158 Brunei 964 A 5 5
159 Brunei 965 C 5 5
160 Brunei 966 A 5 5
161 Brunei 967 T 5 5
162 Brunei 968 G 5 5
163 Brunei 969 A 5 5
164 Brunei 970 G 5 5
165 Brunei 971 C 5 5
166 Brunei 972 A 5 5
167 Brunei 973 T 5 5
168 Brunei 974 G 5 5
169 Brunei 975 A 5 5
170 Brunei 976 A 5 5
171 Brunei 977 A 5 5
172 Brunei 978 T 5 5
173 Brunei 979 T 5 5
174 Brunei 980 G 5 5
175 Brunei 981 C 5 5
176 Brunei 982 T 5 5
177 Brunei 983 T 5 5
178 Brunei 984 G 5 5
179 Brunei 985 G 5 5
180 Brunei 986 T 5 5
181 Brunei 987 A 5 5
182 Brunei 988 C 5 5
183 Brunei 989 A 5 5
184 Brunei 990 C 5 5
185 Brunei 991 G 5 5
186 Brunei 992 G 5 5
187 Brunei 993 A 5 5
188 Brunei 994 A 5 5
189 Brunei 995 C 5 5
190 Brunei 996 G 5 5
191 Brunei 997 T 5 5
192 Brunei 998 T 5 5
193 Brunei 999 C 5 5
194 Brunei 1000 T 5 5
195 Brunei 1001 G 5 5
196 Brunei 1002 A 5 5
197 Brunei 1003 A 5 5
198 Brunei 1004 A 5 5
199 Brunei 1005 A 5 5
200 Brunei 1006 G 5 5
201 Brunei 1007 A 5 5
202 Brunei 1008 G 5 5
203 Brunei 1009 C 5 5
204 Brunei 1010 T 5 5
205 Brunei 1011 A 5 5
206 Brunei 1012 T 5 5
207 Brunei 1013 G 5 5
208 Brunei 1014 A 5 5
209 Brunei 1015 A 5 5
210 Brunei 1016 T 5 5
211 Brunei 1017 T 5 5
212 Brunei 1018 G 5 5
213 Brunei 1019 C 5 5
214 Brunei 1020 A 5 5
215 Brunei 1021 G 5 5
216 Brunei 1022 A 5 5
217 Brunei 1023 C 5 5
218 Brunei 1024 A 5 5
219 Brunei 1025 C 5 5
220 Brunei 1026 C 5 5
221 Brunei 1027 T 5 5
222 Brunei 1028 T 5 5
223 Brunei 1029 T 5 5
224 Brunei 1030 T 5 5
225 Brunei 1031 G 5 5
226 Brunei 1032 A 5 5
227 Brunei 1033 A 5 5
228 Brunei 1034 A 5 5
229 Brunei 1035 T 5 5
230 Brunei 1036 T 5 5
231 Brunei 1037 A 5 5
232 Brunei 1038 A 5 5
233 Brunei 1039 A 5 5
234 Brunei 1040 T 5 5
235 Brunei 1041 T 5 5
236 Brunei 1042 G 5 5
237 Brunei 1043 G 5 5
238 Brunei 1044 C 5 5
239 Brunei 1045 A 5 5
240 Brunei 1046 A 5 5
241 Brunei 1047 A 5 5
242 Brunei 1048 G 5 5
243 Brunei 1049 A 5 5
244 Brunei 1050 A 5 5
245 Brunei 1051 A 5 5
246 Brunei 1052 T 5 5
247 Brunei 1053 T 5 5
248 Brunei 1054 T 5 5
249 Brunei 1055 G 5 5
250 Brunei 1056 A 5 5
251 Brunei 1057 C 5 5
252 Brunei 1058 A 5 5
253 Brunei 1059 C 5 5
254 Brunei 1060 C 5 5
255 Brunei 1061 T 5 5
256 Brunei 1062 T 5 5
257 Brunei 1063 C 5 5
258 Brunei 1064 A 5 5
259 Brunei 1065 A 5 5
260 Brunei 1066 T 5 5
261 Brunei 1067 G 5 5
262 Brunei 1068 G 5 5
263 Brunei 1069 G 5 5
264 Brunei 1070 G 5 5
265 Brunei 1071 A 5 5
266 Brunei 1072 A 5 5
267 Brunei 1073 T 5 5
268 Brunei 1074 G 5 5
269 Brunei 1075 T 5 5
270 Brunei 1076 C 5 5
271 Brunei 1077 C 5 5
272 Brunei 1078 A 5 5
273 Brunei 1079 A 5 5
274 Brunei 1080 A 5 5
275 Brunei 1081 T 5 5
276 Brunei 1082 T 5 5
277 Brunei 1083 T 5 5
278 Brunei 1084 T 5 5
279 Brunei 1085 G 5 5
280 Brunei 1086 T 5 5
281 Brunei 1087 A 5 5
282 Brunei 1088 T 5 5
283 Brunei 1089 T 5 5
284 Brunei 1090 T 5 5
285 Brunei 1091 C 5 5
286 Brunei 1092 C 5 5
287 Brunei 1093 C 5 5
288 Brunei 1094 T 5 5
289 Brunei 1095 T 5 5
290 Brunei 1096 A 5 5
291 Brunei 1097 A 5 5
292 Brunei 1098 A 5 5
293 Brunei 1099 T 5 5
294 Brunei 1100 T 5 5
295 Brunei 1101 C 5 5
296 Brunei 1102 C 5 5
297 Brunei 1103 A 5 5
298 Brunei 1104 T 5 5
299 Brunei 1105 A 5 5
300 Brunei 1106 A 5 5
301 Brunei 1107 T 5 5
302 Brunei 1108 C 5 5
303 Brunei 1109 A 5 5
304 Brunei 1110 A 5 5
305 Brunei 1111 G 5 5
306 Brunei 1112 A 5 5
307 Brunei 1113 C 5 5
308 Brunei 1114 T 5 5
309 Brunei 1115 A 5 5
310 Brunei 1116 T 5 5
311 Brunei 1117 T 5 5
312 Brunei 1118 C 5 5
313 Brunei 1119 A 5 5
314 Brunei 1120 A 5 5
315 Brunei 1121 C 5 5
316 Brunei 1122 C 5 5
317 Brunei 1123 A 5 5
318 Brunei 1124 A 5 5
319 Brunei 1125 G 5 5
320 Brunei 1126 G 5 5
321 Brunei 1127 G 5 5
322 Brunei 1128 T 5 5
323 Brunei 1129 T 5 5
324 Brunei 1130 G 5 5
325 Brunei 1131 A 5 5
326 Brunei 1132 A 5 5
327 Brunei 1133 A 5 5
328 Brunei 1134 A 5 5
329 Brunei 1135 G 5 5
330 Brunei 1136 A 5 5
331 Brunei 1137 A 5 5
332 Brunei 1138 A 5 5
333 Brunei 1139 A 5 5
334 Brunei 1140 A 5 5
335 Brunei 1141 G 5 5
336 Brunei 1142 C 5 5
337 Brunei 1143 T 5 5
338 Brunei 1144 T 5 5
339 Brunei 1145 G 5 5
340 Brunei 1146 A 5 5
341 Brunei 1147 T 5 5
342 Brunei 1148 G 5 5
343 Brunei 1149 G 5 5
344 Brunei 1150 C 5 5
345 Brunei 1151 T 5 5
346 Brunei 1152 T 5 5
347 Brunei 1153 T 5 5
348 Brunei 1154 A 5 5
349 Brunei 1155 T 5 5
350 Brunei 1156 G 5 5
351 Brunei 1157 G 5 5
352 Brunei 1158 G 5 5
353 Brunei 1159 T 5 5
354 Brunei 1160 A 5 5
355 Brunei 1161 G 5 5
356 Brunei 1162 A 5 5
357 Brunei 1163 A 5 5
358 Brunei 1164 T 5 5
359 Brunei 1165 T 5 5
360 Brunei 1166 C 5 5
361 Brunei 1167 G 5 5
362 Brunei 1168 A 5 5
363 Brunei 1169 T 5 5
364 Brunei 1170 C 5 5
365 Brunei 1171 T 5 5
366 Brunei 1172 G 5 5
367 Brunei 1173 T 5 5
368 Brunei 1174 C 5 5
369 Brunei 1175 T 5 5
370 Brunei 1176 A 5 5
371 Brunei 1177 T 5 5
372 Brunei 1178 C 5 5
373 Brunei 1179 C 5 5
374 Brunei 1180 A 5 5
375 Brunei 1181 G 5 5
376 Brunei 1182 T 5 5
377 Brunei 1183 T 5 5
378 Brunei 1184 G 5 5
379 Brunei 1185 C 5 5
380 Brunei 1186 G 5 5
381 Brunei 1187 T 5 5
382 Brunei 1188 C 5 5
383 Brunei 1189 A 5 5
384 Brunei 1190 C 5 5
385 Brunei 1191 C 5 5
386 Brunei 1192 A 5 5
387 Brunei 1193 A 5 5
388 Brunei 1194 A 5 5
389 Brunei 1195 T 5 5
390 Brunei 1196 G 5 5
391 Brunei 1197 A 5 5
392 Brunei 1198 A 5 5
393 Brunei 1199 T 5 5
394 Brunei 1200 G 5 5
395 Brunei 1201 C 5 5
396 Brunei 1202 A 5 5
397 Brunei 1203 A 5 5
398 Brunei 1204 C 5 5
399 Brunei 1205 C 5 5
400 Brunei 1206 A 5 5
401 Brunei 1207 A 5 5
402 Brunei 1208 A 5 5
403 Brunei 1209 T 5 5
404 Brunei 1210 G 5 5
405 Brunei 1211 T 5 5
406 Brunei 1212 G 5 5
407 Brunei 1213 C 5 5
408 Brunei 1214 C 5 5
409 Brunei 1215 T 5 5
410 Brunei 1216 T 5 5
411 Brunei 1217 T 5 5
412 Brunei 1218 C 5 5
413 Brunei 1219 A 5 5
414 Brunei 1220 A 5 5
415 Brunei 1221 C 5 5
416 Brunei 1222 T 5 5
417 Brunei 1223 C 5 5
418 Brunei 1224 T 5 5
419 Brunei 1225 C 5 5
420 Brunei 1226 A 5 5
421 Brunei 1227 T 5 5
422 Brunei 1228 G 5 5
423 Brunei 1229 A 5 5
424 Brunei 1230 A 5 5
425 Brunei 1231 G 5 5
426 Brunei 1232 T 5 5
427 Brunei 1233 G 5 5
428 Brunei 1234 T 5 5
429 Brunei 1235 G 5 5
430 Brunei 1236 A 5 5
431 Brunei 1237 T 5 5
432 Brunei 1238 C 5 5
433 Brunei 1239 A 5 5
434 Brunei 1240 T 5 5
435 Brunei 1241 T 5 5
436 Brunei 1242 G 5 5
437 Brunei 1243 T 5 5
438 Brunei 1244 G 5 5
439 Brunei 1245 G 5 5
440 Brunei 1246 T 5 5
441 Brunei 1247 G 5 5
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443 Brunei 1249 A 5 5
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923 Brunei 1729 G 5 5
924 Brunei 1730 G 5 5
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1833 Brunei 2639 G 5 5
1834 Brunei 2640 A 5 5
1835 Brunei 2641 A 5 5
1836 Brunei 2642 A 5 5
1837 Brunei 2643 T 5 5
1838 Brunei 2644 C 5 5
1839 Brunei 2645 A 5 5
1840 Brunei 2646 A 5 5
1841 Brunei 2647 A 5 5
1842 Brunei 2648 G 5 5
1843 Brunei 2649 A 5 5
1844 Brunei 2650 C 5 5
1845 Brunei 2651 A 5 5
1846 Brunei 2652 C 5 5
1847 Brunei 2653 A 5 5
1848 Brunei 2654 G 5 5
1849 Brunei 2655 A 5 5
1850 Brunei 2656 A 5 5
1851 Brunei 2657 A 5 5
1852 Brunei 2658 A 5 5
1853 Brunei 2659 G 5 5
1854 Brunei 2660 T 5 5
1855 Brunei 2661 A 5 5
1856 Brunei 2662 C 5 5
1857 Brunei 2663 T 5 5
1858 Brunei 2664 G 5 5
1859 Brunei 2665 T 5 5
1860 Brunei 2666 G 5 5
1861 Brunei 2667 C 5 5
1862 Brunei 2668 C 5 5
1863 Brunei 2669 C 5 5
1864 Brunei 2670 T 5 5
1865 Brunei 2671 T 5 5
1866 Brunei 2672 G 5 5
1867 Brunei 2673 C 5 5
1868 Brunei 2674 A 5 5
1869 Brunei 2675 C 5 5
1870 Brunei 2676 C 5 5
1871 Brunei 2677 T 5 5
1872 Brunei 2678 A 5 5
1873 Brunei 2679 A 5 5
1874 Brunei 2680 T 5 5
1875 Brunei 2681 A 5 5
1876 Brunei 2682 T 5 5
1877 Brunei 2683 G 5 5
1878 Brunei 2684 A 5 5
1879 Brunei 2685 T 5 5
1880 Brunei 2686 G 5 5
1881 Brunei 2687 G 5 5
1882 Brunei 2688 T 5 5
1883 Brunei 2689 A 5 5
1884 Brunei 2690 A 5 5
1885 Brunei 2691 C 5 5
1886 Brunei 2692 A 5 5
1887 Brunei 2693 A 5 5
1888 Brunei 2694 A 5 5
1889 Brunei 2695 C 5 5
1890 Brunei 2696 A 5 5
1891 Brunei 2697 A 5 5
1892 Brunei 2698 T 5 5
1893 Brunei 2699 A 5 5
1894 Brunei 2700 C 5 5
1895 Brunei 2701 C 5 5
1896 Brunei 2702 T 5 5
1897 Brunei 2703 T 5 5
1898 Brunei 2704 C 5 5
1899 Brunei 2705 A 5 5
1900 Brunei 2706 C 5 5
1901 Brunei 2707 A 5 5
1902 Brunei 2708 C 5 5
1903 Brunei 2709 T 5 5
1904 Brunei 2710 C 5 5
1905 Brunei 2711 A 5 5
1906 Brunei 2712 A 5 5
1907 Brunei 2713 A 5 5
1908 Brunei 2714 G 5 5
1909 Brunei 2715 G 5 5
1910 Brunei 2716 C 5 5
1911 Brunei 2717 G 5 5
1912 Brunei 2718 G 5 5
1913 Brunei 2719 T 5 5