National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   1,124                                        
?                                            
A   84                                        
C   24                                        
D   33                                        
E   98                                        
F   54                                        
G   78                                        
H   3                                        
I   84                                        
K   99                                        
L   132                                        
M   21                                        
N   51                                        
P   30                                        
Q   36                                        
R   24                                        
S   63                                        
T   84                                 1      
V   93                                        
W   12                                        
Y   21                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 1596 A 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 1597 A 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 1598 G 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 1599 G 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 1600 T 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 1601 C 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 1602 T 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 1603 T 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 1604 A 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 1605 A 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 1606 T 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 1607 G 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 1608 A 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 1609 C 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 1610 A 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 1611 A 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 1612 C 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 1613 C 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 1614 T 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 1615 T 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 1616 C 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 1617 T 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 1618 T 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 1619 G 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 1620 A 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 1621 A 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 1622 A 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 1623 T 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 1624 A 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 1625 C 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 1626 T 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 1627 C 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 1628 C 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 1629 A 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 1630 A 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 1631 A 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 1632 A 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 1633 A 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 1634 G 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 1635 A 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 1636 G 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 1637 A 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 1638 A 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 1639 A 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 1640 G 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 1641 T 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 1642 C 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 1643 A 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 1644 A 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 1645 C 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 1646 A 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 1647 T 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 1648 C 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 1649 A 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 1650 A 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 1651 T 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 1652 A 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 1653 T 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 1654 T 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 1655 G 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 1656 T 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 1657 T 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 1658 G 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 1659 G 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 1660 T 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 1661 G 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 1662 A 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 1663 C 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 1664 T 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 1665 T 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 1666 T 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 1667 A 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 1668 A 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 1669 A 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 1670 C 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 1671 T 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 1672 T 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 1673 A 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 1674 A 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 1675 T 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 1676 G 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 1677 A 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 1678 A 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 1679 G 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 1680 A 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 1681 G 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 1682 A 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 1683 T 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 1684 C 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 1685 G 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 1686 C 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 1687 C 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 1688 A 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 1689 T 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 1690 T 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 1691 A 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 1692 T 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 1693 T 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 1694 T 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 1695 T 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 1696 G 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 1697 G 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 1698 C 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 1699 A 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 1700 T 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 1701 C 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 1702 T 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 1703 T 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 1704 T 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 1705 T 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 1706 T 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 1707 C 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 1708 T 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 1709 G 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 1710 C 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 1711 T 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 1712 T 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 1713 C 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 1714 C 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 1715 A 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 1716 C 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 1717 A 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 1718 A 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 1719 G 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 1720 T 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 1721 G 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 1722 C 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 1723 T 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 1724 T 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 1725 T 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 1726 T 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 1727 G 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 1728 T 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 1729 G 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 1730 G 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 1731 A 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 1732 A 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 1733 A 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 1734 C 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 1735 T 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 1736 G 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 1737 T 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 1738 G 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 1739 A 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 1740 A 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 1741 A 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 1742 G 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 1743 G 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 1744 T 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 1745 T 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 1746 T 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 1747 G 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 1748 G 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 1749 A 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 1750 T 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 1751 T 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 1752 A 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 1753 T 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 1754 A 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 1755 A 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 1756 A 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 1757 G 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 1758 C 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 1759 A 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 1760 T 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 1761 T 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 1762 C 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 1763 A 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 1764 A 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 1765 A 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 1766 C 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 1767 A 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 1768 A 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 1769 A 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 1770 T 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 1771 T 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 1772 G 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 1773 T 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 1774 T 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 1775 G 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 1776 A 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 1777 A 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 1778 T 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 1779 C 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 1780 C 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 1781 T 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 1782 G 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 1783 T 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 1784 G 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 1785 G 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 1786 T 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 1787 A 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 1788 A 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 1789 T 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 1790 T 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 1791 T 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 1792 T 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 1793 A 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 1794 A 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 1795 A 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 1796 G 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 1797 T 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 1798 T 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 1799 A 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 1800 C 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 1801 A 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 1802 A 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 1803 A 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 1804 A 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 1805 G 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 1806 G 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 1807 A 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 1808 A 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 1809 A 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 1810 A 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 1811 G 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 1812 C 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 1813 T 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 1814 A 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 1815 A 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 1816 A 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 1817 A 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 1818 A 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 1819 A 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 1820 G 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 1821 G 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 1822 T 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 1823 G 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 1824 C 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 1825 C 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 1826 T 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 1827 G 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 1828 G 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 1829 A 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 1830 A 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 1831 T 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 1832 A 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 1833 T 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 1834 T 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 1835 G 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 1836 G 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 1837 T 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 1838 G 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 1839 A 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 1840 A 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 1841 C 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 1842 A 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 1843 G 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 1844 A 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 1845 A 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 1846 A 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 1847 T 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 1848 C 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 1849 A 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 1850 A 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 1851 T 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 1852 A 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 1853 C 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 1854 T 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 1855 G 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 1856 A 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 1857 G 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 1858 T 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 1859 C 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 1860 C 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 1861 T 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 1862 C 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 1863 T 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 1864 T 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 1865 T 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 1866 A 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 1867 T 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 1868 G 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 1869 C 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 1870 A 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 1871 T 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 1872 T 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 1873 T 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 1874 G 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 1875 C 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 1876 A 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 1877 T 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 1878 C 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 1879 A 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 1880 G 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 1881 A 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 1882 G 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 1883 G 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 1884 C 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 1885 T 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 1886 G 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 1887 C 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 1888 T 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 1889 C 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 1890 G 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 1891 T 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 1892 G 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 1893 T 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 1894 T 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 1895 G 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 1896 T 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 1897 A 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 1898 C 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 1899 G 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 1900 A 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 1901 T 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 1902 C 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 1903 A 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 1904 A 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 1905 T 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 1906 T 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 1907 T 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 1908 T 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 1909 C 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 1910 T 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 1911 C 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 1912 C 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 1913 C 1 1
318 Antigua_and_Barbuda 1914 G 1 1
319 Antigua_and_Barbuda 1915 C 1 1
320 Antigua_and_Barbuda 1916 A 1 1
321 Antigua_and_Barbuda 1917 C 1 1
322 Antigua_and_Barbuda 1918 T 1 1
323 Antigua_and_Barbuda 1919 C 1 1
324 Antigua_and_Barbuda 1920 T 1 1
325 Antigua_and_Barbuda 1921 T 1 1
326 Antigua_and_Barbuda 1922 G 1 1
327 Antigua_and_Barbuda 1923 A 1 1
328 Antigua_and_Barbuda 1924 A 1 1
329 Antigua_and_Barbuda 1925 A 1 1
330 Antigua_and_Barbuda 1926 C 1 1
331 Antigua_and_Barbuda 1927 T C 1 0 Thr554Thr
332 Antigua_and_Barbuda 1928 G 1 1
333 Antigua_and_Barbuda 1929 C 1 1
334 Antigua_and_Barbuda 1930 T 1 1
335 Antigua_and_Barbuda 1931 C 1 1
336 Antigua_and_Barbuda 1932 A 1 1
337 Antigua_and_Barbuda 1933 A 1 1
338 Antigua_and_Barbuda 1934 A 1 1
339 Antigua_and_Barbuda 1935 A 1 1
340 Antigua_and_Barbuda 1936 T 1 1
341 Antigua_and_Barbuda 1937 T 1 1
342 Antigua_and_Barbuda 1938 C 1 1
343 Antigua_and_Barbuda 1939 T 1 1
344 Antigua_and_Barbuda 1940 G 1 1
345 Antigua_and_Barbuda 1941 T 1 1
346 Antigua_and_Barbuda 1942 G 1 1
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1071 Antigua_and_Barbuda 2667 C 1 1
1072 Antigua_and_Barbuda 2668 C 1 1
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