National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   1,914                                        
?                                            
A   132                                        
C   81                                        
D   60                                        
E   162                                        
F   90                                        
G   147                                        
H   27                                        
I   120                                        
K   153                                        
L   180                                        
M   30                                        
N   93                                        
P   66                                        
Q   54                                        
R   57                                        
S   108                                        
T   138                                        
V   138                                        
W   21                                        
Y   57                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Andorra 806 G 1 1
1 Andorra 807 C 1 1
2 Andorra 808 A 1 1
3 Andorra 809 T 1 1
4 Andorra 810 A 1 1
5 Andorra 811 C 1 1
6 Andorra 812 A 1 1
7 Andorra 813 C 1 1
8 Andorra 814 T 1 1
9 Andorra 815 C 1 1
10 Andorra 816 G 1 1
11 Andorra 817 C 1 1
12 Andorra 818 T 1 1
13 Andorra 819 A 1 1
14 Andorra 820 T 1 1
15 Andorra 821 G 1 1
16 Andorra 822 T 1 1
17 Andorra 823 C 1 1
18 Andorra 824 G 1 1
19 Andorra 825 A 1 1
20 Andorra 826 T 1 1
21 Andorra 827 A 1 1
22 Andorra 828 A 1 1
23 Andorra 829 C 1 1
24 Andorra 830 A 1 1
25 Andorra 831 A 1 1
26 Andorra 832 C 1 1
27 Andorra 833 T 1 1
28 Andorra 834 T 1 1
29 Andorra 835 C 1 1
30 Andorra 836 T 1 1
31 Andorra 837 G 1 1
32 Andorra 838 T 1 1
33 Andorra 839 G 1 1
34 Andorra 840 G 1 1
35 Andorra 841 C 1 1
36 Andorra 842 C 1 1
37 Andorra 843 C 1 1
38 Andorra 844 T 1 1
39 Andorra 845 G 1 1
40 Andorra 846 A 1 1
41 Andorra 847 T 1 1
42 Andorra 848 G 1 1
43 Andorra 849 G 1 1
44 Andorra 850 C 1 1
45 Andorra 851 T 1 1
46 Andorra 852 A 1 1
47 Andorra 853 C 1 1
48 Andorra 854 C 1 1
49 Andorra 855 C 1 1
50 Andorra 856 T 1 1
51 Andorra 857 C 1 1
52 Andorra 858 T 1 1
53 Andorra 859 T 1 1
54 Andorra 860 G 1 1
55 Andorra 861 A 1 1
56 Andorra 862 G 1 1
57 Andorra 863 T 1 1
58 Andorra 864 G 1 1
59 Andorra 865 C 1 1
60 Andorra 866 A 1 1
61 Andorra 867 T 1 1
62 Andorra 868 T 1 1
63 Andorra 869 A 1 1
64 Andorra 870 A 1 1
65 Andorra 871 A 1 1
66 Andorra 872 G 1 1
67 Andorra 873 A 1 1
68 Andorra 874 C 1 1
69 Andorra 875 C 1 1
70 Andorra 876 T 1 1
71 Andorra 877 T 1 1
72 Andorra 878 C 1 1
73 Andorra 879 T 1 1
74 Andorra 880 A 1 1
75 Andorra 881 G 1 1
76 Andorra 882 C 1 1
77 Andorra 883 A 1 1
78 Andorra 884 C 1 1
79 Andorra 885 G 1 1
80 Andorra 886 T 1 1
81 Andorra 887 G 1 1
82 Andorra 888 C 1 1
83 Andorra 889 T 1 1
84 Andorra 890 G 1 1
85 Andorra 891 G 1 1
86 Andorra 892 T 1 1
87 Andorra 893 A 1 1
88 Andorra 894 A 1 1
89 Andorra 895 A 1 1
90 Andorra 896 G 1 1
91 Andorra 897 C 1 1
92 Andorra 898 T 1 1
93 Andorra 899 T 1 1
94 Andorra 900 C 1 1
95 Andorra 901 A 1 1
96 Andorra 902 T 1 1
97 Andorra 903 G 1 1
98 Andorra 904 C 1 1
99 Andorra 905 A 1 1
100 Andorra 906 C 1 1
101 Andorra 907 T 1 1
102 Andorra 908 T 1 1
103 Andorra 909 T 1 1
104 Andorra 910 G 1 1
105 Andorra 911 T 1 1
106 Andorra 912 C 1 1
107 Andorra 913 C 1 1
108 Andorra 914 G 1 1
109 Andorra 915 A 1 1
110 Andorra 916 A 1 1
111 Andorra 917 C 1 1
112 Andorra 918 A 1 1
113 Andorra 919 A 1 1
114 Andorra 920 C 1 1
115 Andorra 921 T 1 1
116 Andorra 922 G 1 1
117 Andorra 923 G 1 1
118 Andorra 924 A 1 1
119 Andorra 925 C 1 1
120 Andorra 926 T 1 1
121 Andorra 927 T 1 1
122 Andorra 928 T 1 1
123 Andorra 929 A 1 1
124 Andorra 930 T 1 1
125 Andorra 931 T 1 1
126 Andorra 932 G 1 1
127 Andorra 933 A 1 1
128 Andorra 934 C 1 1
129 Andorra 935 A 1 1
130 Andorra 936 C 1 1
131 Andorra 937 T 1 1
132 Andorra 938 A 1 1
133 Andorra 939 A 1 1
134 Andorra 940 G 1 1
135 Andorra 941 A 1 1
136 Andorra 942 G 1 1
137 Andorra 943 G 1 1
138 Andorra 944 G 1 1
139 Andorra 945 G 1 1
140 Andorra 946 T 1 1
141 Andorra 947 G 1 1
142 Andorra 948 T 1 1
143 Andorra 949 A 1 1
144 Andorra 950 T 1 1
145 Andorra 951 A 1 1
146 Andorra 952 C 1 1
147 Andorra 953 T 1 1
148 Andorra 954 G 1 1
149 Andorra 955 C 1 1
150 Andorra 956 T 1 1
151 Andorra 957 G 1 1
152 Andorra 958 C 1 1
153 Andorra 959 C 1 1
154 Andorra 960 G 1 1
155 Andorra 961 T 1 1
156 Andorra 962 G 1 1
157 Andorra 963 A 1 1
158 Andorra 964 A 1 1
159 Andorra 965 C 1 1
160 Andorra 966 A 1 1
161 Andorra 967 T 1 1
162 Andorra 968 G 1 1
163 Andorra 969 A 1 1
164 Andorra 970 G 1 1
165 Andorra 971 C 1 1
166 Andorra 972 A 1 1
167 Andorra 973 T 1 1
168 Andorra 974 G 1 1
169 Andorra 975 A 1 1
170 Andorra 976 A 1 1
171 Andorra 977 A 1 1
172 Andorra 978 T 1 1
173 Andorra 979 T 1 1
174 Andorra 980 G 1 1
175 Andorra 981 C 1 1
176 Andorra 982 T 1 1
177 Andorra 983 T 1 1
178 Andorra 984 G 1 1
179 Andorra 985 G 1 1
180 Andorra 986 T 1 1
181 Andorra 987 A 1 1
182 Andorra 988 C 1 1
183 Andorra 989 A 1 1
184 Andorra 990 C 1 1
185 Andorra 991 G 1 1
186 Andorra 992 G 1 1
187 Andorra 993 A 1 1
188 Andorra 994 A 1 1
189 Andorra 995 C 1 1
190 Andorra 996 G 1 1
191 Andorra 997 T 1 1
192 Andorra 998 T 1 1
193 Andorra 999 C 1 1
194 Andorra 1000 T 1 1
195 Andorra 1001 G 1 1
196 Andorra 1002 A 1 1
197 Andorra 1003 A 1 1
198 Andorra 1004 A 1 1
199 Andorra 1005 A 1 1
200 Andorra 1006 G 1 1
201 Andorra 1007 A 1 1
202 Andorra 1008 G 1 1
203 Andorra 1009 C 1 1
204 Andorra 1010 T 1 1
205 Andorra 1011 A 1 1
206 Andorra 1012 T 1 1
207 Andorra 1013 G 1 1
208 Andorra 1014 A 1 1
209 Andorra 1015 A 1 1
210 Andorra 1016 T 1 1
211 Andorra 1017 T 1 1
212 Andorra 1018 G 1 1
213 Andorra 1019 C 1 1
214 Andorra 1020 A 1 1
215 Andorra 1021 G 1 1
216 Andorra 1022 A 1 1
217 Andorra 1023 C 1 1
218 Andorra 1024 A 1 1
219 Andorra 1025 C 1 1
220 Andorra 1026 C 1 1
221 Andorra 1027 T 1 1
222 Andorra 1028 T 1 1
223 Andorra 1029 T 1 1
224 Andorra 1030 T 1 1
225 Andorra 1031 G 1 1
226 Andorra 1032 A 1 1
227 Andorra 1033 A 1 1
228 Andorra 1034 A 1 1
229 Andorra 1035 T 1 1
230 Andorra 1036 T 1 1
231 Andorra 1037 A 1 1
232 Andorra 1038 A 1 1
233 Andorra 1039 A 1 1
234 Andorra 1040 T 1 1
235 Andorra 1041 T 1 1
236 Andorra 1042 G 1 1
237 Andorra 1043 G 1 1
238 Andorra 1044 C 1 1
239 Andorra 1045 A 1 1
240 Andorra 1046 A 1 1
241 Andorra 1047 A 1 1
242 Andorra 1048 G 1 1
243 Andorra 1049 A 1 1
244 Andorra 1050 A 1 1
245 Andorra 1051 A 1 1
246 Andorra 1052 T 1 1
247 Andorra 1053 T 1 1
248 Andorra 1054 T 1 1
249 Andorra 1055 G 1 1
250 Andorra 1056 A 1 1
251 Andorra 1057 C 1 1
252 Andorra 1058 A 1 1
253 Andorra 1059 C 1 1
254 Andorra 1060 C 1 1
255 Andorra 1061 T 1 1
256 Andorra 1062 T 1 1
257 Andorra 1063 C 1 1
258 Andorra 1064 A 1 1
259 Andorra 1065 A 1 1
260 Andorra 1066 T 1 1
261 Andorra 1067 G 1 1
262 Andorra 1068 G 1 1
263 Andorra 1069 G 1 1
264 Andorra 1070 G 1 1
265 Andorra 1071 A 1 1
266 Andorra 1072 A 1 1
267 Andorra 1073 T 1 1
268 Andorra 1074 G 1 1
269 Andorra 1075 T 1 1
270 Andorra 1076 C 1 1
271 Andorra 1077 C 1 1
272 Andorra 1078 A 1 1
273 Andorra 1079 A 1 1
274 Andorra 1080 A 1 1
275 Andorra 1081 T 1 1
276 Andorra 1082 T 1 1
277 Andorra 1083 T 1 1
278 Andorra 1084 T 1 1
279 Andorra 1085 G 1 1
280 Andorra 1086 T 1 1
281 Andorra 1087 A 1 1
282 Andorra 1088 T 1 1
283 Andorra 1089 T 1 1
284 Andorra 1090 T 1 1
285 Andorra 1091 C 1 1
286 Andorra 1092 C 1 1
287 Andorra 1093 C 1 1
288 Andorra 1094 T 1 1
289 Andorra 1095 T 1 1
290 Andorra 1096 A 1 1
291 Andorra 1097 A 1 1
292 Andorra 1098 A 1 1
293 Andorra 1099 T 1 1
294 Andorra 1100 T 1 1
295 Andorra 1101 C 1 1
296 Andorra 1102 C 1 1
297 Andorra 1103 A 1 1
298 Andorra 1104 T 1 1
299 Andorra 1105 A 1 1
300 Andorra 1106 A 1 1
301 Andorra 1107 T 1 1
302 Andorra 1108 C 1 1
303 Andorra 1109 A 1 1
304 Andorra 1110 A 1 1
305 Andorra 1111 G 1 1
306 Andorra 1112 A 1 1
307 Andorra 1113 C 1 1
308 Andorra 1114 T 1 1
309 Andorra 1115 A 1 1
310 Andorra 1116 T 1 1
311 Andorra 1117 T 1 1
312 Andorra 1118 C 1 1
313 Andorra 1119 A 1 1
314 Andorra 1120 A 1 1
315 Andorra 1121 C 1 1
316 Andorra 1122 C 1 1
317 Andorra 1123 A 1 1
318 Andorra 1124 A 1 1
319 Andorra 1125 G 1 1
320 Andorra 1126 G 1 1
321 Andorra 1127 G 1 1
322 Andorra 1128 T 1 1
323 Andorra 1129 T 1 1
324 Andorra 1130 G 1 1
325 Andorra 1131 A 1 1
326 Andorra 1132 A 1 1
327 Andorra 1133 A 1 1
328 Andorra 1134 A 1 1
329 Andorra 1135 G 1 1
330 Andorra 1136 A 1 1
331 Andorra 1137 A 1 1
332 Andorra 1138 A 1 1
333 Andorra 1139 A 1 1
334 Andorra 1140 A 1 1
335 Andorra 1141 G 1 1
336 Andorra 1142 C 1 1
337 Andorra 1143 T 1 1
338 Andorra 1144 T 1 1
339 Andorra 1145 G 1 1
340 Andorra 1146 A 1 1
341 Andorra 1147 T 1 1
342 Andorra 1148 G 1 1
343 Andorra 1149 G 1 1
344 Andorra 1150 C 1 1
345 Andorra 1151 T 1 1
346 Andorra 1152 T 1 1
347 Andorra 1153 T 1 1
348 Andorra 1154 A 1 1
349 Andorra 1155 T 1 1
350 Andorra 1156 G 1 1
351 Andorra 1157 G 1 1
352 Andorra 1158 G 1 1
353 Andorra 1159 T 1 1
354 Andorra 1160 A 1 1
355 Andorra 1161 G 1 1
356 Andorra 1162 A 1 1
357 Andorra 1163 A 1 1
358 Andorra 1164 T 1 1
359 Andorra 1165 T 1 1
360 Andorra 1166 C 1 1
361 Andorra 1167 G 1 1
362 Andorra 1168 A 1 1
363 Andorra 1169 T 1 1
364 Andorra 1170 C 1 1
365 Andorra 1171 T 1 1
366 Andorra 1172 G 1 1
367 Andorra 1173 T 1 1
368 Andorra 1174 C 1 1
369 Andorra 1175 T 1 1
370 Andorra 1176 A 1 1
371 Andorra 1177 T 1 1
372 Andorra 1178 C 1 1
373 Andorra 1179 C 1 1
374 Andorra 1180 A 1 1
375 Andorra 1181 G 1 1
376 Andorra 1182 T 1 1
377 Andorra 1183 T 1 1
378 Andorra 1184 G 1 1
379 Andorra 1185 C 1 1
380 Andorra 1186 G 1 1
381 Andorra 1187 T 1 1
382 Andorra 1188 C 1 1
383 Andorra 1189 A 1 1
384 Andorra 1190 C 1 1
385 Andorra 1191 C 1 1
386 Andorra 1192 A 1 1
387 Andorra 1193 A 1 1
388 Andorra 1194 A 1 1
389 Andorra 1195 T 1 1
390 Andorra 1196 G 1 1
391 Andorra 1197 A 1 1
392 Andorra 1198 A 1 1
393 Andorra 1199 T 1 1
394 Andorra 1200 G 1 1
395 Andorra 1201 C 1 1
396 Andorra 1202 A 1 1
397 Andorra 1203 A 1 1
398 Andorra 1204 C 1 1
399 Andorra 1205 C 1 1
400 Andorra 1206 A 1 1
401 Andorra 1207 A 1 1
402 Andorra 1208 A 1 1
403 Andorra 1209 T 1 1
404 Andorra 1210 G 1 1
405 Andorra 1211 T 1 1
406 Andorra 1212 G 1 1
407 Andorra 1213 C 1 1
408 Andorra 1214 C 1 1
409 Andorra 1215 T 1 1
410 Andorra 1216 T 1 1
411 Andorra 1217 T 1 1
412 Andorra 1218 C 1 1
413 Andorra 1219 A 1 1
414 Andorra 1220 A 1 1
415 Andorra 1221 C 1 1
416 Andorra 1222 T 1 1
417 Andorra 1223 C 1 1
418 Andorra 1224 T 1 1
419 Andorra 1225 C 1 1
420 Andorra 1226 A 1 1
421 Andorra 1227 T 1 1
422 Andorra 1228 G 1 1
423 Andorra 1229 A 1 1
424 Andorra 1230 A 1 1
425 Andorra 1231 G 1 1
426 Andorra 1232 T 1 1
427 Andorra 1233 G 1 1
428 Andorra 1234 T 1 1
429 Andorra 1235 G 1 1
430 Andorra 1236 A 1 1
431 Andorra 1237 T 1 1
432 Andorra 1238 C 1 1
433 Andorra 1239 A 1 1
434 Andorra 1240 T 1 1
435 Andorra 1241 T 1 1
436 Andorra 1242 G 1 1
437 Andorra 1243 T 1 1
438 Andorra 1244 G 1 1
439 Andorra 1245 G 1 1
440 Andorra 1246 T 1 1
441 Andorra 1247 G 1 1
442 Andorra 1248 A 1 1
443 Andorra 1249 A 1 1
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923 Andorra 1729 G 1 1
924 Andorra 1730 G 1 1
925 Andorra 1731 A 1 1
926 Andorra 1732 A 1 1
927 Andorra 1733 A 1 1
928 Andorra 1734 C 1 1
929 Andorra 1735 T 1 1
930 Andorra 1736 G 1 1
931 Andorra 1737 T 1 1
932 Andorra 1738 G 1 1
933 Andorra 1739 A 1 1
934 Andorra 1740 A 1 1
935 Andorra 1741 A 1 1
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937 Andorra 1743 G 1 1
938 Andorra 1744 T 1 1
939 Andorra 1745 T 1 1
940 Andorra 1746 T 1 1
941 Andorra 1747 G 1 1
942 Andorra 1748 G 1 1
943 Andorra 1749 A 1 1
944 Andorra 1750 T 1 1
945 Andorra 1751 T 1 1
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985 Andorra 1791 T 1 1
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1001 Andorra 1807 A 1 1
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1015 Andorra 1821 G 1 1
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1230 Andorra 2036 G 1 1
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1831 Andorra 2637 T 1 1
1832 Andorra 2638 C 1 1
1833 Andorra 2639 G 1 1
1834 Andorra 2640 A 1 1
1835 Andorra 2641 A 1 1
1836 Andorra 2642 A 1 1
1837 Andorra 2643 T 1 1
1838 Andorra 2644 C 1 1
1839 Andorra 2645 A 1 1
1840 Andorra 2646 A 1 1
1841 Andorra 2647 A 1 1
1842 Andorra 2648 G 1 1
1843 Andorra 2649 A 1 1
1844 Andorra 2650 C 1 1
1845 Andorra 2651 A 1 1
1846 Andorra 2652 C 1 1
1847 Andorra 2653 A 1 1
1848 Andorra 2654 G 1 1
1849 Andorra 2655 A 1 1
1850 Andorra 2656 A 1 1
1851 Andorra 2657 A 1 1
1852 Andorra 2658 A 1 1
1853 Andorra 2659 G 1 1
1854 Andorra 2660 T 1 1
1855 Andorra 2661 A 1 1
1856 Andorra 2662 C 1 1
1857 Andorra 2663 T 1 1
1858 Andorra 2664 G 1 1
1859 Andorra 2665 T 1 1
1860 Andorra 2666 G 1 1
1861 Andorra 2667 C 1 1
1862 Andorra 2668 C 1 1
1863 Andorra 2669 C 1 1
1864 Andorra 2670 T 1 1
1865 Andorra 2671 T 1 1
1866 Andorra 2672 G 1 1
1867 Andorra 2673 C 1 1
1868 Andorra 2674 A 1 1
1869 Andorra 2675 C 1 1
1870 Andorra 2676 C 1 1
1871 Andorra 2677 T 1 1
1872 Andorra 2678 A 1 1
1873 Andorra 2679 A 1 1
1874 Andorra 2680 T 1 1
1875 Andorra 2681 A 1 1
1876 Andorra 2682 T 1 1
1877 Andorra 2683 G 1 1
1878 Andorra 2684 A 1 1
1879 Andorra 2685 T 1 1
1880 Andorra 2686 G 1 1
1881 Andorra 2687 G 1 1
1882 Andorra 2688 T 1 1
1883 Andorra 2689 A 1 1
1884 Andorra 2690 A 1 1
1885 Andorra 2691 C 1 1
1886 Andorra 2692 A 1 1
1887 Andorra 2693 A 1 1
1888 Andorra 2694 A 1 1
1889 Andorra 2695 C 1 1
1890 Andorra 2696 A 1 1
1891 Andorra 2697 A 1 1
1892 Andorra 2698 T 1 1
1893 Andorra 2699 A 1 1
1894 Andorra 2700 C 1 1
1895 Andorra 2701 C 1 1
1896 Andorra 2702 T 1 1
1897 Andorra 2703 T 1 1
1898 Andorra 2704 C 1 1
1899 Andorra 2705 A 1 1
1900 Andorra 2706 C 1 1
1901 Andorra 2707 A 1 1
1902 Andorra 2708 C 1 1
1903 Andorra 2709 T 1 1
1904 Andorra 2710 C 1 1
1905 Andorra 2711 A 1 1
1906 Andorra 2712 A 1 1
1907 Andorra 2713 A 1 1
1908 Andorra 2714 G 1 1
1909 Andorra 2715 G 1 1
1910 Andorra 2716 C 1 1
1911 Andorra 2717 G 1 1
1912 Andorra 2718 G 1 1
1913 Andorra 2719 T 1 1