National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   416                                        
?                                            
A   38                                        
C   39                                        
D   21                                        
E   12                                        
F   15                                        
G   39                                        
H   9                                        
I   12                                        
K   24                                        
L   24                                        
M   12                                        
N   21                                        
P   24                                        
Q   18                                        
R   6                                        
S   18                                        
T   39                                        
V   27                                        
W   3                                        
Y   15                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 13026 C 5 5
1 Brunei 13027 T 5 5
2 Brunei 13028 G 5 5
3 Brunei 13029 G 5 5
4 Brunei 13030 T 5 5
5 Brunei 13031 A 5 5
6 Brunei 13032 A 5 5
7 Brunei 13033 T 5 5
8 Brunei 13034 G 5 5
9 Brunei 13035 C 5 5
10 Brunei 13036 A 5 5
11 Brunei 13037 A 5 5
12 Brunei 13038 C 5 5
13 Brunei 13039 A 5 5
14 Brunei 13040 G 5 5
15 Brunei 13041 A 5 5
16 Brunei 13042 A 5 5
17 Brunei 13043 G 5 5
18 Brunei 13044 T 5 5
19 Brunei 13045 G 5 5
20 Brunei 13046 C 5 5
21 Brunei 13047 C 5 5
22 Brunei 13048 T 5 5
23 Brunei 13049 G 5 5
24 Brunei 13050 C 5 5
25 Brunei 13051 C 5 5
26 Brunei 13052 A 5 5
27 Brunei 13053 A 5 5
28 Brunei 13054 T 5 5
29 Brunei 13055 T 5 5
30 Brunei 13056 C 5 5
31 Brunei 13057 A 5 5
32 Brunei 13058 A 5 5
33 Brunei 13059 C 5 5
34 Brunei 13060 T 5 5
35 Brunei 13061 G 5 5
36 Brunei 13062 T 5 5
37 Brunei 13063 A 5 5
38 Brunei 13064 T 5 5
39 Brunei 13065 T 5 5
40 Brunei 13066 A 5 5
41 Brunei 13067 T 5 5
42 Brunei 13068 C 5 5
43 Brunei 13069 T 5 5
44 Brunei 13070 T 5 5
45 Brunei 13071 T 5 5
46 Brunei 13072 C 5 5
47 Brunei 13073 T 5 5
48 Brunei 13074 G 5 5
49 Brunei 13075 T 5 5
50 Brunei 13076 G 5 5
51 Brunei 13077 C 5 5
52 Brunei 13078 T 5 5
53 Brunei 13079 T 5 5
54 Brunei 13080 T 5 5
55 Brunei 13081 T 5 5
56 Brunei 13082 G 5 5
57 Brunei 13083 C 5 5
58 Brunei 13084 T 5 5
59 Brunei 13085 G 5 5
60 Brunei 13086 T 5 5
61 Brunei 13087 A 5 5
62 Brunei 13088 G 5 5
63 Brunei 13089 A 5 5
64 Brunei 13090 T 5 5
65 Brunei 13091 G 5 5
66 Brunei 13092 C 5 5
67 Brunei 13093 T 5 5
68 Brunei 13094 G 5 5
69 Brunei 13095 C 5 5
70 Brunei 13096 T 5 5
71 Brunei 13097 A 5 5
72 Brunei 13098 A 5 5
73 Brunei 13099 A 5 5
74 Brunei 13100 G 5 5
75 Brunei 13101 C 5 5
76 Brunei 13102 T 5 5
77 Brunei 13103 T 5 5
78 Brunei 13104 A 5 5
79 Brunei 13105 C 5 5
80 Brunei 13106 A 5 5
81 Brunei 13107 A 5 5
82 Brunei 13108 A 5 5
83 Brunei 13109 G 5 5
84 Brunei 13110 A 5 5
85 Brunei 13111 T 5 5
86 Brunei 13112 T 5 5
87 Brunei 13113 A 5 5
88 Brunei 13114 T 5 5
89 Brunei 13115 C 5 5
90 Brunei 13116 T 5 5
91 Brunei 13117 A 5 5
92 Brunei 13118 G 5 5
93 Brunei 13119 C 5 5
94 Brunei 13120 T 5 5
95 Brunei 13121 A 5 5
96 Brunei 13122 G 5 5
97 Brunei 13123 T 5 5
98 Brunei 13124 G 5 5
99 Brunei 13125 G 5 5
100 Brunei 13126 G 5 5
101 Brunei 13127 G 5 5
102 Brunei 13128 G 5 5
103 Brunei 13129 A 5 5
104 Brunei 13130 C 5 5
105 Brunei 13131 A 5 5
106 Brunei 13132 A 5 5
107 Brunei 13133 C 5 5
108 Brunei 13134 C 5 5
109 Brunei 13135 A 5 5
110 Brunei 13136 A 5 5
111 Brunei 13137 T 5 5
112 Brunei 13138 C 5 5
113 Brunei 13139 A 5 5
114 Brunei 13140 C 5 5
115 Brunei 13141 T 5 5
116 Brunei 13142 A 5 5
117 Brunei 13143 A 5 5
118 Brunei 13144 T 5 5
119 Brunei 13145 T 5 5
120 Brunei 13146 G 5 5
121 Brunei 13147 T 5 5
122 Brunei 13148 G 5 5
123 Brunei 13149 T 5 5
124 Brunei 13150 T 5 5
125 Brunei 13151 A 5 5
126 Brunei 13152 A 5 5
127 Brunei 13153 G 5 5
128 Brunei 13154 A 5 5
129 Brunei 13155 T 5 5
130 Brunei 13156 G 5 5
131 Brunei 13157 T 5 5
132 Brunei 13158 T 5 5
133 Brunei 13159 G 5 5
134 Brunei 13160 T 5 5
135 Brunei 13161 G 5 5
136 Brunei 13162 T 5 5
137 Brunei 13163 A 5 5
138 Brunei 13164 C 5 5
139 Brunei 13165 A 5 5
140 Brunei 13166 C 5 5
141 Brunei 13167 A 5 5
142 Brunei 13168 C 5 5
143 Brunei 13169 A 5 5
144 Brunei 13170 C 5 5
145 Brunei 13171 T 5 5
146 Brunei 13172 G 5 5
147 Brunei 13173 G 5 5
148 Brunei 13174 T 5 5
149 Brunei 13175 A 5 5
150 Brunei 13176 C 5 5
151 Brunei 13177 T 5 5
152 Brunei 13178 G 5 5
153 Brunei 13179 G 5 5
154 Brunei 13180 T 5 5
155 Brunei 13181 C 5 5
156 Brunei 13182 A 5 5
157 Brunei 13183 G 5 5
158 Brunei 13184 G 5 5
159 Brunei 13185 C 5 5
160 Brunei 13186 A 5 5
161 Brunei 13187 A 5 5
162 Brunei 13188 T 5 5
163 Brunei 13189 A 5 5
164 Brunei 13190 A 5 5
165 Brunei 13191 C 5 5
166 Brunei 13192 A 5 5
167 Brunei 13193 G 5 5
168 Brunei 13194 T 5 5
169 Brunei 13195 T 5 5
170 Brunei 13196 A 5 5
171 Brunei 13197 C 5 5
172 Brunei 13198 A 5 5
173 Brunei 13199 C 5 5
174 Brunei 13200 C 5 5
175 Brunei 13201 G 5 5
176 Brunei 13202 G 5 5
177 Brunei 13203 A 5 5
178 Brunei 13204 A 5 5
179 Brunei 13205 G 5 5
180 Brunei 13206 C 5 5
181 Brunei 13207 C 5 5
182 Brunei 13208 A 5 5
183 Brunei 13209 A 5 5
184 Brunei 13210 T 5 5
185 Brunei 13211 A 5 5
186 Brunei 13212 T 5 5
187 Brunei 13213 G 5 5
188 Brunei 13214 G 5 5
189 Brunei 13215 A 5 5
190 Brunei 13216 T 5 5
191 Brunei 13217 C 5 5
192 Brunei 13218 A 5 5
193 Brunei 13219 A 5 5
194 Brunei 13220 G 5 5
195 Brunei 13221 A 5 5
196 Brunei 13222 A 5 5
197 Brunei 13223 T 5 5
198 Brunei 13224 C 5 5
199 Brunei 13225 C 5 5
200 Brunei 13226 T 5 5
201 Brunei 13227 T 5 5
202 Brunei 13228 T 5 5
203 Brunei 13229 G 5 5
204 Brunei 13230 G 5 5
205 Brunei 13231 T 5 5
206 Brunei 13232 G 5 5
207 Brunei 13233 G 5 5
208 Brunei 13234 T 5 5
209 Brunei 13235 G 5 5
210 Brunei 13236 C 5 5
211 Brunei 13237 A 5 5
212 Brunei 13238 T 5 5
213 Brunei 13239 C 5 5
214 Brunei 13240 G 5 5
215 Brunei 13241 T 5 5
216 Brunei 13242 G 5 5
217 Brunei 13243 T 5 5
218 Brunei 13244 T 5 5
219 Brunei 13245 G 5 5
220 Brunei 13246 T 5 5
221 Brunei 13247 C 5 5
222 Brunei 13248 T 5 5
223 Brunei 13249 G 5 5
224 Brunei 13250 T 5 5
225 Brunei 13251 A 5 5
226 Brunei 13252 C 5 5
227 Brunei 13253 T 5 5
228 Brunei 13254 G 5 5
229 Brunei 13255 C 5 5
230 Brunei 13256 C 5 5
231 Brunei 13257 G 5 5
232 Brunei 13258 T 5 5
233 Brunei 13259 T 5 5
234 Brunei 13260 G 5 5
235 Brunei 13261 C 5 5
236 Brunei 13262 C 5 5
237 Brunei 13263 A 5 5
238 Brunei 13264 C 5 5
239 Brunei 13265 A 5 5
240 Brunei 13266 T 5 5
241 Brunei 13267 A 5 5
242 Brunei 13268 G 5 5
243 Brunei 13269 A 5 5
244 Brunei 13270 T 5 5
245 Brunei 13271 C 5 5
246 Brunei 13272 A 5 5
247 Brunei 13273 T 5 5
248 Brunei 13274 C 5 5
249 Brunei 13275 C 5 5
250 Brunei 13276 A 5 5
251 Brunei 13277 A 5 5
252 Brunei 13278 A 5 5
253 Brunei 13279 T 5 5
254 Brunei 13280 C 5 5
255 Brunei 13281 C 5 5
256 Brunei 13282 T 5 5
257 Brunei 13283 A 5 5
258 Brunei 13284 A 5 5
259 Brunei 13285 A 5 5
260 Brunei 13286 G 5 5
261 Brunei 13287 G 5 5
262 Brunei 13288 A 5 5
263 Brunei 13289 T 5 5
264 Brunei 13290 T 5 5
265 Brunei 13291 T 5 5
266 Brunei 13292 T 5 5
267 Brunei 13293 G 5 5
268 Brunei 13294 T 5 5
269 Brunei 13295 G 5 5
270 Brunei 13296 A 5 5
271 Brunei 13297 C 5 5
272 Brunei 13298 T 5 5
273 Brunei 13299 T 5 5
274 Brunei 13300 A 5 5
275 Brunei 13301 A 5 5
276 Brunei 13302 A 5 5
277 Brunei 13303 A 5 5
278 Brunei 13304 G 5 5
279 Brunei 13305 G 5 5
280 Brunei 13306 T 5 5
281 Brunei 13307 A 5 5
282 Brunei 13308 A 5 5
283 Brunei 13309 G 5 5
284 Brunei 13310 T 5 5
285 Brunei 13311 A 5 5
286 Brunei 13312 T 5 5
287 Brunei 13313 G 5 5
288 Brunei 13314 T 5 5
289 Brunei 13315 A 5 5
290 Brunei 13316 C 5 5
291 Brunei 13317 A 5 5
292 Brunei 13318 A 5 5
293 Brunei 13319 A 5 5
294 Brunei 13320 T 5 5
295 Brunei 13321 A 5 5
296 Brunei 13322 C 5 5
297 Brunei 13323 C 5 5
298 Brunei 13324 T 5 5
299 Brunei 13325 A 5 5
300 Brunei 13326 C 5 5
301 Brunei 13327 A 5 5
302 Brunei 13328 A 5 5
303 Brunei 13329 C 5 5
304 Brunei 13330 T 5 5
305 Brunei 13331 T 5 5
306 Brunei 13332 G 5 5
307 Brunei 13333 T 5 5
308 Brunei 13334 G 5 5
309 Brunei 13335 C 5 5
310 Brunei 13336 T 5 5
311 Brunei 13337 A 5 5
312 Brunei 13338 A 5 5
313 Brunei 13339 T 5 5
314 Brunei 13340 G 5 5
315 Brunei 13341 A 5 5
316 Brunei 13342 C 5 5
317 Brunei 13343 C 5 5
318 Brunei 13344 C 5 5
319 Brunei 13345 T 5 5
320 Brunei 13346 G 5 5
321 Brunei 13347 T 5 5
322 Brunei 13348 G 5 5
323 Brunei 13349 G 5 5
324 Brunei 13350 G 5 5
325 Brunei 13351 T 5 5
326 Brunei 13352 T 5 5
327 Brunei 13353 T 5 5
328 Brunei 13354 T 5 5
329 Brunei 13355 A 5 5
330 Brunei 13356 C 5 5
331 Brunei 13357 A 5 5
332 Brunei 13358 C 5 5
333 Brunei 13359 T 5 5
334 Brunei 13360 T 5 5
335 Brunei 13361 A 5 5
336 Brunei 13362 A 5 5
337 Brunei 13363 A 5 5
338 Brunei 13364 A 5 5
339 Brunei 13365 A 5 5
340 Brunei 13366 C 5 5
341 Brunei 13367 A 5 5
342 Brunei 13368 C 5 5
343 Brunei 13369 A 5 5
344 Brunei 13370 G 5 5
345 Brunei 13371 T 5 5
346 Brunei 13372 C 5 5
347 Brunei 13373 T 5 5
348 Brunei 13374 G 5 5
349 Brunei 13375 T 5 5
350 Brunei 13376 A 5 5
351 Brunei 13377 C 5 5
352 Brunei 13378 C 5 5
353 Brunei 13379 G 5 5
354 Brunei 13380 T 5 5
355 Brunei 13381 C 5 5
356 Brunei 13382 T 5 5
357 Brunei 13383 G 5 5
358 Brunei 13384 C 5 5
359 Brunei 13385 G 5 5
360 Brunei 13386 G 5 5
361 Brunei 13387 T 5 5
362 Brunei 13388 A 5 5
363 Brunei 13389 T 5 5
364 Brunei 13390 G 5 5
365 Brunei 13391 T 5 5
366 Brunei 13392 G 5 5
367 Brunei 13393 G 5 5
368 Brunei 13394 A 5 5
369 Brunei 13395 A 5 5
370 Brunei 13396 A 5 5
371 Brunei 13397 G 5 5
372 Brunei 13398 G 5 5
373 Brunei 13399 T 5 5
374 Brunei 13400 T 5 5
375 Brunei 13401 A 5 5
376 Brunei 13402 T 5 5
377 Brunei 13403 G 5 5
378 Brunei 13404 G 5 5
379 Brunei 13405 C 5 5
380 Brunei 13406 T 5 5
381 Brunei 13407 G 5 5
382 Brunei 13408 T 5 5
383 Brunei 13409 A 5 5
384 Brunei 13410 G 5 5
385 Brunei 13411 T 5 5
386 Brunei 13412 T 5 5
387 Brunei 13413 G 5 5
388 Brunei 13414 T 5 5
389 Brunei 13415 G 5 5
390 Brunei 13416 A 5 5
391 Brunei 13417 T 5 5
392 Brunei 13418 C 5 5
393 Brunei 13419 A 5 5
394 Brunei 13420 A 5 5
395 Brunei 13421 C 5 5
396 Brunei 13422 T 5 5
397 Brunei 13423 C 5 5
398 Brunei 13424 C 5 5
399 Brunei 13425 G 5 5
400 Brunei 13426 C 5 5
401 Brunei 13427 G 5 5
402 Brunei 13428 A 5 5
403 Brunei 13429 A 5 5
404 Brunei 13430 C 5 5
405 Brunei 13431 C 5 5
406 Brunei 13432 C 5 5
407 Brunei 13433 A 5 5
408 Brunei 13434 T 5 5
409 Brunei 13435 G 5 5
410 Brunei 13436 C 5 5
411 Brunei 13437 T 5 5
412 Brunei 13438 T 5 5
413 Brunei 13439 C 5 5
414 Brunei 13440 A 5 5
415 Brunei 13441 G 5 5