National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   416                                        
?                                            
A   38                                        
C   39                                        
D   21                                        
E   12                                        
F   15                                        
G   39                                        
H   9                                        
I   12                                        
K   24                                        
L   24                                        
M   12                                        
N   21                                        
P   24                                        
Q   18                                        
R   6                                        
S   18                                        
T   39                                        
V   27                                        
W   3                                        
Y   15                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 13026 C 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 13027 T 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 13028 G 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 13029 G 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 13030 T 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 13031 A 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 13032 A 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 13033 T 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 13034 G 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 13035 C 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 13036 A 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 13037 A 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 13038 C 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 13039 A 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 13040 G 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 13041 A 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 13042 A 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 13043 G 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 13044 T 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 13045 G 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 13046 C 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 13047 C 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 13048 T 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 13049 G 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 13050 C 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 13051 C 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 13052 A 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 13053 A 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 13054 T 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 13055 T 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 13056 C 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 13057 A 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 13058 A 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 13059 C 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 13060 T 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 13061 G 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 13062 T 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 13063 A 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 13064 T 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 13065 T 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 13066 A 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 13067 T 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 13068 C 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 13069 T 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 13070 T 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 13071 T 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 13072 C 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 13073 T 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 13074 G 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 13075 T 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 13076 G 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 13077 C 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 13078 T 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 13079 T 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 13080 T 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 13081 T 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 13082 G 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 13083 C 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 13084 T 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 13085 G 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 13086 T 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 13087 A 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 13088 G 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 13089 A 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 13090 T 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 13091 G 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 13092 C 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 13093 T 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 13094 G 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 13095 C 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 13096 T 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 13097 A 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 13098 A 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 13099 A 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 13100 G 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 13101 C 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 13102 T 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 13103 T 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 13104 A 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 13105 C 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 13106 A 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 13107 A 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 13108 A 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 13109 G 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 13110 A 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 13111 T 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 13112 T 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 13113 A 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 13114 T 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 13115 C 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 13116 T 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 13117 A 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 13118 G 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 13119 C 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 13120 T 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 13121 A 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 13122 G 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 13123 T 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 13124 G 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 13125 G 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 13126 G 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 13127 G 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 13128 G 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 13129 A 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 13130 C 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 13131 A 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 13132 A 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 13133 C 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 13134 C 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 13135 A 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 13136 A 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 13137 T 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 13138 C 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 13139 A 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 13140 C 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 13141 T 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 13142 A 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 13143 A 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 13144 T 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 13145 T 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 13146 G 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 13147 T 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 13148 G 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 13149 T 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 13150 T 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 13151 A 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 13152 A 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 13153 G 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 13154 A 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 13155 T 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 13156 G 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 13157 T 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 13158 T 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 13159 G 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 13160 T 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 13161 G 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 13162 T 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 13163 A 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 13164 C 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 13165 A 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 13166 C 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 13167 A 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 13168 C 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 13169 A 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 13170 C 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 13171 T 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 13172 G 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 13173 G 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 13174 T 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 13175 A 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 13176 C 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 13177 T 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 13178 G 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 13179 G 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 13180 T 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 13181 C 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 13182 A 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 13183 G 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 13184 G 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 13185 C 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 13186 A 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 13187 A 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 13188 T 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 13189 A 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 13190 A 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 13191 C 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 13192 A 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 13193 G 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 13194 T 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 13195 T 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 13196 A 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 13197 C 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 13198 A 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 13199 C 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 13200 C 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 13201 G 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 13202 G 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 13203 A 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 13204 A 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 13205 G 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 13206 C 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 13207 C 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 13208 A 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 13209 A 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 13210 T 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 13211 A 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 13212 T 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 13213 G 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 13214 G 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 13215 A 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 13216 T 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 13217 C 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 13218 A 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 13219 A 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 13220 G 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 13221 A 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 13222 A 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 13223 T 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 13224 C 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 13225 C 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 13226 T 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 13227 T 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 13228 T 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 13229 G 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 13230 G 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 13231 T 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 13232 G 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 13233 G 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 13234 T 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 13235 G 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 13236 C 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 13237 A 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 13238 T 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 13239 C 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 13240 G 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 13241 T 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 13242 G 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 13243 T 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 13244 T 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 13245 G 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 13246 T 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 13247 C 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 13248 T 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 13249 G 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 13250 T 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 13251 A 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 13252 C 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 13253 T 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 13254 G 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 13255 C 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 13256 C 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 13257 G 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 13258 T 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 13259 T 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 13260 G 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 13261 C 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 13262 C 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 13263 A 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 13264 C 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 13265 A 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 13266 T 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 13267 A 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 13268 G 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 13269 A 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 13270 T 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 13271 C 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 13272 A 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 13273 T 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 13274 C 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 13275 C 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 13276 A 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 13277 A 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 13278 A 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 13279 T 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 13280 C 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 13281 C 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 13282 T 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 13283 A 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 13284 A 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 13285 A 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 13286 G 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 13287 G 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 13288 A 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 13289 T 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 13290 T 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 13291 T 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 13292 T 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 13293 G 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 13294 T 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 13295 G 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 13296 A 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 13297 C 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 13298 T 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 13299 T 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 13300 A 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 13301 A 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 13302 A 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 13303 A 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 13304 G 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 13305 G 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 13306 T 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 13307 A 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 13308 A 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 13309 G 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 13310 T 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 13311 A 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 13312 T 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 13313 G 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 13314 T 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 13315 A 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 13316 C 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 13317 A 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 13318 A 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 13319 A 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 13320 T 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 13321 A 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 13322 C 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 13323 C 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 13324 T 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 13325 A 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 13326 C 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 13327 A 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 13328 A 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 13329 C 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 13330 T 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 13331 T 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 13332 G 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 13333 T 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 13334 G 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 13335 C 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 13336 T 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 13337 A 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 13338 A 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 13339 T 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 13340 G 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 13341 A 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 13342 C 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 13343 C 1 1
318 Antigua_and_Barbuda 13344 C 1 1
319 Antigua_and_Barbuda 13345 T 1 1
320 Antigua_and_Barbuda 13346 G 1 1
321 Antigua_and_Barbuda 13347 T 1 1
322 Antigua_and_Barbuda 13348 G 1 1
323 Antigua_and_Barbuda 13349 G 1 1
324 Antigua_and_Barbuda 13350 G 1 1
325 Antigua_and_Barbuda 13351 T 1 1
326 Antigua_and_Barbuda 13352 T 1 1
327 Antigua_and_Barbuda 13353 T 1 1
328 Antigua_and_Barbuda 13354 T 1 1
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