National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   540                                        
?                                            
A   21                                        
C   3                                        
D   27                                        
E   54                                        
F   15                                        
G   66                                        
H   21                                        
I   9                                        
K   27                                        
L   63                   1                    
M   9                                        
N   18                                        
P   24                                        
Q   21                                        
R   30                                        
S   30                                        
T   21                                        
V   63                                   2    
W   3                                        
Y   15                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Vietnam 266 A 116 116
1 Vietnam 267 T 116 116
2 Vietnam 268 G 116 116
3 Vietnam 269 G 116 116
4 Vietnam 270 A 116 116
5 Vietnam 271 G 116 116
6 Vietnam 272 A 116 116
7 Vietnam 273 G 116 116
8 Vietnam 274 C 116 116
9 Vietnam 275 C 116 116
10 Vietnam 276 T 116 116
11 Vietnam 277 T 116 116
12 Vietnam 278 G 116 116
13 Vietnam 279 T 116 116
14 Vietnam 280 C 116 116
15 Vietnam 281 C 116 116
16 Vietnam 282 C 116 116
17 Vietnam 283 T 116 116
18 Vietnam 284 G 116 116
19 Vietnam 285 G 116 116
20 Vietnam 286 T 116 116
21 Vietnam 287 T 116 116
22 Vietnam 288 T 116 116
23 Vietnam 289 C 116 116
24 Vietnam 290 A 116 116
25 Vietnam 291 A 116 116
26 Vietnam 292 C 116 116
27 Vietnam 293 G 116 116
28 Vietnam 294 A 116 116
29 Vietnam 295 G 116 116
30 Vietnam 296 A 116 116
31 Vietnam 297 A 116 116
32 Vietnam 298 A 116 116
33 Vietnam 299 A 116 116
34 Vietnam 300 C 116 116
35 Vietnam 301 A 116 116
36 Vietnam 302 C 116 116
37 Vietnam 303 A 116 116
38 Vietnam 304 C 116 116
39 Vietnam 305 G 116 116
40 Vietnam 306 T 116 116
41 Vietnam 307 C 116 116
42 Vietnam 308 C 116 116
43 Vietnam 309 A 116 116
44 Vietnam 310 A 116 116
45 Vietnam 311 C 116 116
46 Vietnam 312 T 116 116
47 Vietnam 313 C T 116 115 Leu16Leu
48 Vietnam 314 A 116 116
49 Vietnam 315 G 116 116
50 Vietnam 316 T 116 116
51 Vietnam 317 T 116 116
52 Vietnam 318 T 116 116
53 Vietnam 319 G 116 116
54 Vietnam 320 C 116 116
55 Vietnam 321 C 116 116
56 Vietnam 322 T 116 116
57 Vietnam 323 G 116 116
58 Vietnam 324 T 116 116
59 Vietnam 325 T 116 116
60 Vietnam 326 T 116 116
61 Vietnam 327 T 116 116
62 Vietnam 328 A 116 116
63 Vietnam 329 C 116 116
64 Vietnam 330 A 116 116
65 Vietnam 331 G 116 116
66 Vietnam 332 G 116 116
67 Vietnam 333 T 116 116
68 Vietnam 334 T 116 116
69 Vietnam 335 C 116 116
70 Vietnam 336 G 116 116
71 Vietnam 337 C 116 116
72 Vietnam 338 G 116 116
73 Vietnam 339 A 116 116
74 Vietnam 340 C 116 116
75 Vietnam 341 G 116 116
76 Vietnam 342 T 116 116
77 Vietnam 343 G 116 116
78 Vietnam 344 C 116 116
79 Vietnam 345 T 116 116
80 Vietnam 346 C 116 116
81 Vietnam 347 G 116 116
82 Vietnam 348 T 116 116
83 Vietnam 349 A 116 116
84 Vietnam 350 C 116 116
85 Vietnam 351 G 116 116
86 Vietnam 352 T 116 116
87 Vietnam 353 G 116 116
88 Vietnam 354 G 116 116
89 Vietnam 355 C 116 116
90 Vietnam 356 T 116 116
91 Vietnam 357 T 116 116
92 Vietnam 358 T 116 116
93 Vietnam 359 G 116 116
94 Vietnam 360 G 116 116
95 Vietnam 361 A 116 116
96 Vietnam 362 G 116 116
97 Vietnam 363 A 116 116
98 Vietnam 364 C 116 116
99 Vietnam 365 T 116 116
100 Vietnam 366 C 116 116
101 Vietnam 367 C 116 116
102 Vietnam 368 G 116 116
103 Vietnam 369 T 116 116
104 Vietnam 370 G A 116 115 Val35Val
105 Vietnam 371 G 116 116
106 Vietnam 372 A 116 116
107 Vietnam 373 G 116 116
108 Vietnam 374 G 116 116
109 Vietnam 375 A 116 116
110 Vietnam 376 G 116 116
111 Vietnam 377 G 116 116
112 Vietnam 378 T 116 116
113 Vietnam 379 C 116 116
114 Vietnam 380 T 116 116
115 Vietnam 381 T 116 116
116 Vietnam 382 A 116 116
117 Vietnam 383 T 116 116
118 Vietnam 384 C 116 116
119 Vietnam 385 A 116 116
120 Vietnam 386 G 116 116
121 Vietnam 387 A 116 116
122 Vietnam 388 G 116 116
123 Vietnam 389 G 116 116
124 Vietnam 390 C 116 116
125 Vietnam 391 A 116 116
126 Vietnam 392 C 116 116
127 Vietnam 393 G 116 116
128 Vietnam 394 T 116 116
129 Vietnam 395 C 116 116
130 Vietnam 396 A 116 116
131 Vietnam 397 A 116 116
132 Vietnam 398 C 116 116
133 Vietnam 399 A 116 116
134 Vietnam 400 T 116 116
135 Vietnam 401 C 116 116
136 Vietnam 402 T 116 116
137 Vietnam 403 T 116 116
138 Vietnam 404 A 116 116
139 Vietnam 405 A 116 116
140 Vietnam 406 A 116 116
141 Vietnam 407 G 116 116
142 Vietnam 408 A 116 116
143 Vietnam 409 T 116 116
144 Vietnam 410 G 116 116
145 Vietnam 411 G 116 116
146 Vietnam 412 C 116 116
147 Vietnam 413 A 116 116
148 Vietnam 414 C 116 116
149 Vietnam 415 T 116 116
150 Vietnam 416 T 116 116
151 Vietnam 417 G 116 116
152 Vietnam 418 T 116 116
153 Vietnam 419 G 116 116
154 Vietnam 420 G 116 116
155 Vietnam 421 C 116 116
156 Vietnam 422 T 116 116
157 Vietnam 423 T 116 116
158 Vietnam 424 A 116 116
159 Vietnam 425 G 116 116
160 Vietnam 426 T 116 116
161 Vietnam 427 A 116 116
162 Vietnam 428 G 116 116
163 Vietnam 429 A 116 116
164 Vietnam 430 A 116 116
165 Vietnam 431 G 116 116
166 Vietnam 432 T 116 116
167 Vietnam 433 T 116 116
168 Vietnam 434 G 116 116
169 Vietnam 435 A 116 116
170 Vietnam 436 A 116 116
171 Vietnam 437 A 116 116
172 Vietnam 438 A 116 116
173 Vietnam 439 A 116 116
174 Vietnam 440 G 116 116
175 Vietnam 441 G 116 116
176 Vietnam 442 C 116 116
177 Vietnam 443 G 116 116
178 Vietnam 444 T 116 116
179 Vietnam 445 T C 116 115 Val60Val
180 Vietnam 446 T 116 116
181 Vietnam 447 T 116 116
182 Vietnam 448 G 116 116
183 Vietnam 449 C 116 116
184 Vietnam 450 C 116 116
185 Vietnam 451 T 116 116
186 Vietnam 452 C 116 116
187 Vietnam 453 A 116 116
188 Vietnam 454 A 116 116
189 Vietnam 455 C 116 116
190 Vietnam 456 T 116 116
191 Vietnam 457 T 116 116
192 Vietnam 458 G 116 116
193 Vietnam 459 A 116 116
194 Vietnam 460 A 116 116
195 Vietnam 461 C 116 116
196 Vietnam 462 A 116 116
197 Vietnam 463 G 116 116
198 Vietnam 464 C 116 116
199 Vietnam 465 C 116 116
200 Vietnam 466 C 116 116
201 Vietnam 467 T 116 116
202 Vietnam 468 A 116 116
203 Vietnam 469 T 116 116
204 Vietnam 470 G 116 116
205 Vietnam 471 T 116 116
206 Vietnam 472 G 116 116
207 Vietnam 473 T 116 116
208 Vietnam 474 T 116 116
209 Vietnam 475 C 116 116
210 Vietnam 476 A 116 116
211 Vietnam 477 T 116 116
212 Vietnam 478 C 116 116
213 Vietnam 479 A 116 116
214 Vietnam 480 A 116 116
215 Vietnam 481 A 116 116
216 Vietnam 482 C 116 116
217 Vietnam 483 G 116 116
218 Vietnam 484 T 116 116
219 Vietnam 485 T 116 116
220 Vietnam 486 C 116 116
221 Vietnam 487 G 116 116
222 Vietnam 488 G 116 116
223 Vietnam 489 A 116 116
224 Vietnam 490 T 116 116
225 Vietnam 491 G 116 116
226 Vietnam 492 C 116 116
227 Vietnam 493 T 116 116
228 Vietnam 494 C 116 116
229 Vietnam 495 G 116 116
230 Vietnam 496 A 116 116
231 Vietnam 497 A 116 116
232 Vietnam 498 C 116 116
233 Vietnam 499 T 116 116
234 Vietnam 500 G 116 116
235 Vietnam 501 C 116 116
236 Vietnam 502 A 116 116
237 Vietnam 503 C 116 116
238 Vietnam 504 C 116 116
239 Vietnam 505 T 113 113
240 Vietnam 506 C 113 113
241 Vietnam 507 A 113 113
242 Vietnam 508 T 113 113
243 Vietnam 509 G 113 113
244 Vietnam 510 G 113 113
245 Vietnam 511 T 113 113
246 Vietnam 512 C 113 113
247 Vietnam 513 A 113 113
248 Vietnam 514 T 113 113
249 Vietnam 515 G 113 113
250 Vietnam 516 T 113 113
251 Vietnam 517 T 113 113
252 Vietnam 518 A 113 113
253 Vietnam 519 T 113 113
254 Vietnam 520 G 113 113
255 Vietnam 521 G 113 113
256 Vietnam 522 T 113 113
257 Vietnam 523 T 113 113
258 Vietnam 524 G 113 113
259 Vietnam 525 A 113 113
260 Vietnam 526 G 113 113
261 Vietnam 527 C 113 113
262 Vietnam 528 T 113 113
263 Vietnam 529 G 113 113
264 Vietnam 530 G 113 113
265 Vietnam 531 T 113 113
266 Vietnam 532 A 113 113
267 Vietnam 533 G 113 113
268 Vietnam 534 C 113 113
269 Vietnam 535 A 113 113
270 Vietnam 536 G 113 113
271 Vietnam 537 A 113 113
272 Vietnam 538 A 113 113
273 Vietnam 539 C 113 113
274 Vietnam 540 T 113 113
275 Vietnam 541 C 113 113
276 Vietnam 542 G 113 113
277 Vietnam 543 A 113 113
278 Vietnam 544 A 113 113
279 Vietnam 545 G 113 113
280 Vietnam 546 G 113 113
281 Vietnam 547 C 113 113
282 Vietnam 548 A 113 113
283 Vietnam 549 T 113 113
284 Vietnam 550 T 113 113
285 Vietnam 551 C 113 113
286 Vietnam 552 A 113 113
287 Vietnam 553 G 113 113
288 Vietnam 554 T 113 113
289 Vietnam 555 A 113 113
290 Vietnam 556 C 113 113
291 Vietnam 557 G 113 113
292 Vietnam 558 G 113 113
293 Vietnam 559 T 113 113
294 Vietnam 560 C 113 113
295 Vietnam 561 G 113 113
296 Vietnam 562 T 113 113
297 Vietnam 563 A 113 113
298 Vietnam 564 G 113 113
299 Vietnam 565 T 116 116
300 Vietnam 566 G 116 116
301 Vietnam 567 G 116 116
302 Vietnam 568 T 116 116
303 Vietnam 569 G 116 116
304 Vietnam 570 A 116 116
305 Vietnam 571 G 116 116
306 Vietnam 572 A 116 116
307 Vietnam 573 C 116 116
308 Vietnam 574 A 116 116
309 Vietnam 575 C 116 116
310 Vietnam 576 T 116 116
311 Vietnam 577 T 116 116
312 Vietnam 578 G 116 116
313 Vietnam 579 G 116 116
314 Vietnam 580 T 116 116
315 Vietnam 581 G 116 116
316 Vietnam 582 T 116 116
317 Vietnam 583 C 116 116
318 Vietnam 584 C 116 116
319 Vietnam 585 T 116 116
320 Vietnam 586 T 116 116
321 Vietnam 587 G 116 116
322 Vietnam 588 T 116 116
323 Vietnam 589 C 116 116
324 Vietnam 590 C 116 116
325 Vietnam 591 C 116 116
326 Vietnam 592 T 116 116
327 Vietnam 593 C 116 116
328 Vietnam 594 A 116 116
329 Vietnam 595 T 116 116
330 Vietnam 596 G 116 116
331 Vietnam 597 T 116 116
332 Vietnam 598 G 116 116
333 Vietnam 599 G 116 116
334 Vietnam 600 G 116 116
335 Vietnam 601 C 116 116
336 Vietnam 602 G 116 116
337 Vietnam 603 A 116 116
338 Vietnam 604 A 116 116
339 Vietnam 605 A 116 116
340 Vietnam 606 T 116 116
341 Vietnam 607 A 116 116
342 Vietnam 608 C 116 116
343 Vietnam 609 C 116 116
344 Vietnam 610 A 116 116
345 Vietnam 611 G 116 116
346 Vietnam 612 T 116 116
347 Vietnam 613 G 116 116
348 Vietnam 614 G 116 116
349 Vietnam 615 C 116 116
350 Vietnam 616 T 116 116
351 Vietnam 617 T 116 116
352 Vietnam 618 A 116 116
353 Vietnam 619 C 116 116
354 Vietnam 620 C 116 116
355 Vietnam 621 G 116 116
356 Vietnam 622 C 116 116
357 Vietnam 623 A 116 116
358 Vietnam 624 A 116 116
359 Vietnam 625 G 116 116
360 Vietnam 626 G 116 116
361 Vietnam 627 T 116 116
362 Vietnam 628 T 116 116
363 Vietnam 629 C 116 116
364 Vietnam 630 T 116 116
365 Vietnam 631 T 116 116
366 Vietnam 632 C 116 116
367 Vietnam 633 T 116 116
368 Vietnam 634 T 116 116
369 Vietnam 635 C 116 116
370 Vietnam 636 G 116 116
371 Vietnam 637 T 116 116
372 Vietnam 638 A 116 116
373 Vietnam 639 A 116 116
374 Vietnam 640 G 116 116
375 Vietnam 641 A 116 116
376 Vietnam 642 A 116 116
377 Vietnam 643 C 116 116
378 Vietnam 644 G 116 116
379 Vietnam 645 G 116 116
380 Vietnam 646 T 116 116
381 Vietnam 647 A 116 116
382 Vietnam 648 A 116 116
383 Vietnam 649 T 116 116
384 Vietnam 650 A 116 116
385 Vietnam 651 A 116 116
386 Vietnam 652 A 116 116
387 Vietnam 653 G 116 116
388 Vietnam 654 G 116 116
389 Vietnam 655 A 116 116
390 Vietnam 656 G 116 116
391 Vietnam 657 C 116 116
392 Vietnam 658 T 116 116
393 Vietnam 659 G 116 116
394 Vietnam 660 G 116 116
395 Vietnam 661 T 116 116
396 Vietnam 662 G 116 116
397 Vietnam 663 G 116 116
398 Vietnam 664 C 116 116
399 Vietnam 665 C 116 116
400 Vietnam 666 A 116 116
401 Vietnam 667 T 116 116
402 Vietnam 668 A 116 116
403 Vietnam 669 G 116 116
404 Vietnam 670 T 116 116
405 Vietnam 671 T 116 116
406 Vietnam 672 A 116 116
407 Vietnam 673 C 116 116
408 Vietnam 674 G 116 116
409 Vietnam 675 G 116 116
410 Vietnam 676 C 116 116
411 Vietnam 677 G 116 116
412 Vietnam 678 C 116 116
413 Vietnam 679 C 116 116
414 Vietnam 680 G 116 116
415 Vietnam 681 A 116 116
416 Vietnam 682 T 116 116
417 Vietnam 683 C 116 116
418 Vietnam 684 T 116 116
419 Vietnam 685 A 116 116
420 Vietnam 686 A 116 116
421 Vietnam 687 A 116 116
422 Vietnam 688 G 116 116
423 Vietnam 689 T 116 116
424 Vietnam 690 C 116 116
425 Vietnam 691 A 116 116
426 Vietnam 692 T 116 116
427 Vietnam 693 T 116 116
428 Vietnam 694 T 116 116
429 Vietnam 695 G 116 116
430 Vietnam 696 A 116 116
431 Vietnam 697 C 116 116
432 Vietnam 698 T 116 116
433 Vietnam 699 T 116 116
434 Vietnam 700 A 116 116
435 Vietnam 701 G 116 116
436 Vietnam 702 G 116 116
437 Vietnam 703 C 116 116
438 Vietnam 704 G 116 116
439 Vietnam 705 A 116 116
440 Vietnam 706 C 116 116
441 Vietnam 707 G 116 116
442 Vietnam 708 A 116 116
443 Vietnam 709 G 116 116
444 Vietnam 710 C 116 116
445 Vietnam 711 T 116 116
446 Vietnam 712 T 116 116
447 Vietnam 713 G 116 116
448 Vietnam 714 G 116 116
449 Vietnam 715 C 116 116
450 Vietnam 716 A 116 116
451 Vietnam 717 C 116 116
452 Vietnam 718 T 116 116
453 Vietnam 719 G 116 116
454 Vietnam 720 A 116 116
455 Vietnam 721 T 116 116
456 Vietnam 722 C 116 116
457 Vietnam 723 C 116 116
458 Vietnam 724 T 116 116
459 Vietnam 725 T 116 116
460 Vietnam 726 A 116 116
461 Vietnam 727 T 116 116
462 Vietnam 728 G 116 116
463 Vietnam 729 A 116 116
464 Vietnam 730 A 116 116
465 Vietnam 731 G 116 116
466 Vietnam 732 A 116 116
467 Vietnam 733 T 116 116
468 Vietnam 734 T 116 116
469 Vietnam 735 T 116 116
470 Vietnam 736 T 116 116
471 Vietnam 737 C 116 116
472 Vietnam 738 A 116 116
473 Vietnam 739 A 116 116
474 Vietnam 740 G 116 116
475 Vietnam 741 A 116 116
476 Vietnam 742 A 116 116
477 Vietnam 743 A 116 116
478 Vietnam 744 A 116 116
479 Vietnam 745 C 116 116
480 Vietnam 746 T 116 116
481 Vietnam 747 G 116 116
482 Vietnam 748 G 116 116
483 Vietnam 749 A 116 116
484 Vietnam 750 A 116 116
485 Vietnam 751 C 116 116
486 Vietnam 752 A 116 116
487 Vietnam 753 C 116 116
488 Vietnam 754 T 116 116
489 Vietnam 755 A 116 116
490 Vietnam 756 A 116 116
491 Vietnam 757 A 116 116
492 Vietnam 758 C 116 116
493 Vietnam 759 A 116 116
494 Vietnam 760 T 116 116
495 Vietnam 761 A 116 116
496 Vietnam 762 G 116 116
497 Vietnam 763 C 116 116
498 Vietnam 764 A 116 116
499 Vietnam 765 G 116 116
500 Vietnam 766 T 116 116
501 Vietnam 767 G 116 116
502 Vietnam 768 G 116 116
503 Vietnam 769 T 116 116
504 Vietnam 770 G 116 116
505 Vietnam 771 T 116 116
506 Vietnam 772 T 116 116
507 Vietnam 773 A 116 116
508 Vietnam 774 C 116 116
509 Vietnam 775 C 116 116
510 Vietnam 776 C 116 116
511 Vietnam 777 G 116 116
512 Vietnam 778 T 116 116
513 Vietnam 779 G 116 116
514 Vietnam 780 A 116 116
515 Vietnam 781 A 116 116
516 Vietnam 782 C 116 116
517 Vietnam 783 T 116 116
518 Vietnam 784 C 116 116
519 Vietnam 785 A 116 116
520 Vietnam 786 T 116 116
521 Vietnam 787 G 116 116
522 Vietnam 788 C 116 116
523 Vietnam 789 G 116 116
524 Vietnam 790 T 116 116
525 Vietnam 791 G 116 116
526 Vietnam 792 A 116 116
527 Vietnam 793 G 116 116
528 Vietnam 794 C 116 116
529 Vietnam 795 T 116 116
530 Vietnam 796 T 116 116
531 Vietnam 797 A 116 116
532 Vietnam 798 A 116 116
533 Vietnam 799 C 116 116
534 Vietnam 800 G 116 116
535 Vietnam 801 G 116 116
536 Vietnam 802 A 116 116
537 Vietnam 803 G 116 116
538 Vietnam 804 G 116 116
539 Vietnam 805 G 116 116