National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.

Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   540                                        
?                                            
A   21                                        
C   3                                        
D   27                                        
E   54                 1                      
F   15                                        
G   66                                        
H   21                                       1
I   9                                        
K   27                                        
L   63                   1                    
M   9                                        
N   18                       1                
P   24                                        
Q   21                                        
R   30                             1          
S   30           1                            
T   21                                        
V   63                                   2    
W   3                                        
Y   15                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide

Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Slovenia 266 A 148 148
1 Slovenia 267 T 148 148
2 Slovenia 268 G 148 148
3 Slovenia 269 G 148 148
4 Slovenia 270 A 148 148
5 Slovenia 271 G 148 148
6 Slovenia 272 A 148 148
7 Slovenia 273 G 148 148
8 Slovenia 274 C 148 148
9 Slovenia 275 C 148 148
10 Slovenia 276 T 148 148
11 Slovenia 277 T 148 148
12 Slovenia 278 G 148 148
13 Slovenia 279 T 148 148
14 Slovenia 280 C 148 148
15 Slovenia 281 C 148 148
16 Slovenia 282 C 148 148
17 Slovenia 283 T 148 148
18 Slovenia 284 G 148 148
19 Slovenia 285 G 148 148
20 Slovenia 286 T 148 148
21 Slovenia 287 T 148 148
22 Slovenia 288 T 148 148
23 Slovenia 289 C 148 148
24 Slovenia 290 A 148 148
25 Slovenia 291 A 148 148
26 Slovenia 292 C 148 148
27 Slovenia 293 G 148 148
28 Slovenia 294 A 148 148
29 Slovenia 295 G 148 148
30 Slovenia 296 A 148 148
31 Slovenia 297 A 148 148
32 Slovenia 298 A 148 148
33 Slovenia 299 A 148 148
34 Slovenia 300 C 148 148
35 Slovenia 301 A 148 148
36 Slovenia 302 C 148 148
37 Slovenia 303 A 148 148
38 Slovenia 304 C 148 148
39 Slovenia 305 G 148 148
40 Slovenia 306 T 148 148
41 Slovenia 307 C 148 148
42 Slovenia 308 C 148 148
43 Slovenia 309 A 148 148
44 Slovenia 310 A 148 148
45 Slovenia 311 C 148 148
46 Slovenia 312 T 148 148
47 Slovenia 313 C T 148 147 Leu16Leu
48 Slovenia 314 A 148 148
49 Slovenia 315 G 148 148
50 Slovenia 316 T 148 148
51 Slovenia 317 T 148 148
52 Slovenia 318 T 148 148
53 Slovenia 319 G 148 148
54 Slovenia 320 C 148 148
55 Slovenia 321 C 148 148
56 Slovenia 322 T 148 148
57 Slovenia 323 G 148 148
58 Slovenia 324 T 148 148
59 Slovenia 325 T 148 148
60 Slovenia 326 T 148 148
61 Slovenia 327 T 148 148
62 Slovenia 328 A 148 148
63 Slovenia 329 C 148 148
64 Slovenia 330 A 148 148
65 Slovenia 331 G 148 148
66 Slovenia 332 G 148 148
67 Slovenia 333 T 148 148
68 Slovenia 334 T 148 148
69 Slovenia 335 C 148 148
70 Slovenia 336 G 148 148
71 Slovenia 337 C 148 148
72 Slovenia 338 G 148 148
73 Slovenia 339 A 148 148
74 Slovenia 340 C 148 148
75 Slovenia 341 G 148 148
76 Slovenia 342 T 148 148
77 Slovenia 343 G 148 148
78 Slovenia 344 C 148 148
79 Slovenia 345 T 148 148
80 Slovenia 346 C 148 148
81 Slovenia 347 G 148 148
82 Slovenia 348 T 148 148
83 Slovenia 349 A 148 148
84 Slovenia 350 C 148 148
85 Slovenia 351 G 148 148
86 Slovenia 352 T 148 148
87 Slovenia 353 G 148 148
88 Slovenia 354 G 148 148
89 Slovenia 355 C 148 148
90 Slovenia 356 T 148 148
91 Slovenia 357 T 148 148
92 Slovenia 358 T 148 148
93 Slovenia 359 G 148 148
94 Slovenia 360 G 148 148
95 Slovenia 361 A 148 148
96 Slovenia 362 G 148 148
97 Slovenia 363 A 148 148
98 Slovenia 364 C 148 148
99 Slovenia 365 T 148 148
100 Slovenia 366 C 148 148
101 Slovenia 367 C 148 148
102 Slovenia 368 G 148 148
103 Slovenia 369 T 148 148
104 Slovenia 370 G 148 148
105 Slovenia 371 G 148 148
106 Slovenia 372 A 148 148
107 Slovenia 373 G 148 148
108 Slovenia 374 G 148 148
109 Slovenia 375 A 148 148
110 Slovenia 376 G 148 148
111 Slovenia 377 G 148 148
112 Slovenia 378 T 148 148
113 Slovenia 379 C T 148 147 Val38Val
114 Slovenia 380 T 148 148
115 Slovenia 381 T 148 148
116 Slovenia 382 A 148 148
117 Slovenia 383 T 148 148
118 Slovenia 384 C 148 148
119 Slovenia 385 A 148 148
120 Slovenia 386 G 148 148
121 Slovenia 387 A 148 148
122 Slovenia 388 G 148 148
123 Slovenia 389 G 148 148
124 Slovenia 390 C 148 148
125 Slovenia 391 A 148 148
126 Slovenia 392 C 148 148
127 Slovenia 393 G 148 148
128 Slovenia 394 T 148 148
129 Slovenia 395 C 148 148
130 Slovenia 396 A 148 148
131 Slovenia 397 A 148 148
132 Slovenia 398 C 148 148
133 Slovenia 399 A 148 148
134 Slovenia 400 T 148 148
135 Slovenia 401 C 148 148
136 Slovenia 402 T 148 148
137 Slovenia 403 T 148 148
138 Slovenia 404 A 148 148
139 Slovenia 405 A 148 148
140 Slovenia 406 A 148 148
141 Slovenia 407 G 148 148
142 Slovenia 408 A 148 148
143 Slovenia 409 T 148 148
144 Slovenia 410 G 148 148
145 Slovenia 411 G 148 148
146 Slovenia 412 C 148 148
147 Slovenia 413 A 148 148
148 Slovenia 414 C 148 148
149 Slovenia 415 T 148 148
150 Slovenia 416 T 148 148
151 Slovenia 417 G 148 148
152 Slovenia 418 T 148 148
153 Slovenia 419 G 148 148
154 Slovenia 420 G 148 148
155 Slovenia 421 C 148 148
156 Slovenia 422 T 148 148
157 Slovenia 423 T 148 148
158 Slovenia 424 A 148 148
159 Slovenia 425 G 148 148
160 Slovenia 426 T 148 148
161 Slovenia 427 A 148 148
162 Slovenia 428 G 148 148
163 Slovenia 429 A 148 148
164 Slovenia 430 A 148 148
165 Slovenia 431 G 148 148
166 Slovenia 432 T 148 148
167 Slovenia 433 T 148 148
168 Slovenia 434 G 148 148
169 Slovenia 435 A 148 148
170 Slovenia 436 A 148 148
171 Slovenia 437 A 148 148
172 Slovenia 438 A 148 148
173 Slovenia 439 A 148 148
174 Slovenia 440 G 148 148
175 Slovenia 441 G 148 148
176 Slovenia 442 C 148 148
177 Slovenia 443 G 148 148
178 Slovenia 444 T 148 148
179 Slovenia 445 T 148 148
180 Slovenia 446 T 148 148
181 Slovenia 447 T 148 148
182 Slovenia 448 G 148 148
183 Slovenia 449 C 148 148
184 Slovenia 450 C 148 148
185 Slovenia 451 T 148 148
186 Slovenia 452 C 148 148
187 Slovenia 453 A 148 148
188 Slovenia 454 A 148 148
189 Slovenia 455 C 148 148
190 Slovenia 456 T 148 148
191 Slovenia 457 T 148 148
192 Slovenia 458 G 148 148
193 Slovenia 459 A 148 148
194 Slovenia 460 A 148 148
195 Slovenia 461 C 148 148
196 Slovenia 462 A 148 148
197 Slovenia 463 G 148 148
198 Slovenia 464 C 148 148
199 Slovenia 465 C 148 148
200 Slovenia 466 C 148 148
201 Slovenia 467 T 148 148
202 Slovenia 468 A 148 148
203 Slovenia 469 T 148 148
204 Slovenia 470 G 148 148
205 Slovenia 471 T 148 148
206 Slovenia 472 G 148 148
207 Slovenia 473 T 148 148
208 Slovenia 474 T 148 148
209 Slovenia 475 C 148 148
210 Slovenia 476 A 148 148
211 Slovenia 477 T 148 148
212 Slovenia 478 C 148 148
213 Slovenia 479 A 148 148
214 Slovenia 480 A 148 148
215 Slovenia 481 A 148 148
216 Slovenia 482 C 148 148
217 Slovenia 483 G 148 148
218 Slovenia 484 T 148 148
219 Slovenia 485 T 148 148
220 Slovenia 486 C 148 148
221 Slovenia 487 G 148 148
222 Slovenia 488 G 148 148
223 Slovenia 489 A 148 148
224 Slovenia 490 T 148 148
225 Slovenia 491 G 148 148
226 Slovenia 492 C 148 148
227 Slovenia 493 T 148 148
228 Slovenia 494 C 148 148
229 Slovenia 495 G 148 148
230 Slovenia 496 A 148 148
231 Slovenia 497 A 148 148
232 Slovenia 498 C 148 148
233 Slovenia 499 T 148 148
234 Slovenia 500 G 148 148
235 Slovenia 501 C 148 148
236 Slovenia 502 A 148 148
237 Slovenia 503 C 148 148
238 Slovenia 504 C 148 148
239 Slovenia 505 T 147 147
240 Slovenia 506 C 147 147
241 Slovenia 507 A 147 147
242 Slovenia 508 T 147 147
243 Slovenia 509 G 147 147
244 Slovenia 510 G 147 147
245 Slovenia 511 T 147 147
246 Slovenia 512 C 147 147
247 Slovenia 513 A 147 147
248 Slovenia 514 T 147 147
249 Slovenia 515 G 147 147
250 Slovenia 516 T 147 147
251 Slovenia 517 T 147 147
252 Slovenia 518 A 147 147
253 Slovenia 519 T 147 147
254 Slovenia 520 G 147 147
255 Slovenia 521 G 147 147
256 Slovenia 522 T 147 147
257 Slovenia 523 T 147 147
258 Slovenia 524 G 147 147
259 Slovenia 525 A 147 147
260 Slovenia 526 G 147 147
261 Slovenia 527 C 147 147
262 Slovenia 528 T 147 147
263 Slovenia 529 G 147 147
264 Slovenia 530 G 147 147
265 Slovenia 531 T 147 147
266 Slovenia 532 A G 147 146 Val89Val
267 Slovenia 533 G 147 147
268 Slovenia 534 C 147 147
269 Slovenia 535 A 147 147
270 Slovenia 536 G 147 147
271 Slovenia 537 A 147 147
272 Slovenia 538 A 147 147
273 Slovenia 539 C 147 147
274 Slovenia 540 T 147 147
275 Slovenia 541 C 147 147
276 Slovenia 542 G A 147 146 Glu93Lys
277 Slovenia 543 A 147 147
278 Slovenia 544 A 147 147
279 Slovenia 545 G 147 147
280 Slovenia 546 G 147 147
281 Slovenia 547 C 147 147
282 Slovenia 548 A 147 147
283 Slovenia 549 T 147 147
284 Slovenia 550 T 147 147
285 Slovenia 551 C 147 147
286 Slovenia 552 A 147 147
287 Slovenia 553 G 147 147
288 Slovenia 554 T 147 147
289 Slovenia 555 A 147 147
290 Slovenia 556 C 147 147
291 Slovenia 557 G 147 147
292 Slovenia 558 G 147 147
293 Slovenia 559 T 147 147
294 Slovenia 560 C 147 147
295 Slovenia 561 G 147 147
296 Slovenia 562 T 147 147
297 Slovenia 563 A 147 147
298 Slovenia 564 G 147 147
299 Slovenia 565 T 148 148
300 Slovenia 566 G 148 148
301 Slovenia 567 G 148 148
302 Slovenia 568 T 148 148
303 Slovenia 569 G 148 148
304 Slovenia 570 A 148 148
305 Slovenia 571 G 148 148
306 Slovenia 572 A 148 148
307 Slovenia 573 C 148 148
308 Slovenia 574 A 148 148
309 Slovenia 575 C 148 148
310 Slovenia 576 T 148 148
311 Slovenia 577 T 148 148
312 Slovenia 578 G 148 148
313 Slovenia 579 G 148 148
314 Slovenia 580 T 148 148
315 Slovenia 581 G 148 148
316 Slovenia 582 T 148 148
317 Slovenia 583 C 148 148
318 Slovenia 584 C 148 148
319 Slovenia 585 T 148 148
320 Slovenia 586 T 148 148
321 Slovenia 587 G 148 148
322 Slovenia 588 T 148 148
323 Slovenia 589 C 148 148
324 Slovenia 590 C 148 148
325 Slovenia 591 C 148 148
326 Slovenia 592 T 148 148
327 Slovenia 593 C T 148 147 His110Tyr
328 Slovenia 594 A 148 148
329 Slovenia 595 T 148 148
330 Slovenia 596 G 148 148
331 Slovenia 597 T 148 148
332 Slovenia 598 G 148 148
333 Slovenia 599 G 148 148
334 Slovenia 600 G 148 148
335 Slovenia 601 C 148 148
336 Slovenia 602 G 148 148
337 Slovenia 603 A 148 148
338 Slovenia 604 A 148 148
339 Slovenia 605 A 148 148
340 Slovenia 606 T 148 148
341 Slovenia 607 A 148 148
342 Slovenia 608 C 148 148
343 Slovenia 609 C 148 148
344 Slovenia 610 A 148 148
345 Slovenia 611 G 148 148
346 Slovenia 612 T 148 148
347 Slovenia 613 G 148 148
348 Slovenia 614 G 148 148
349 Slovenia 615 C 148 148
350 Slovenia 616 T 148 148
351 Slovenia 617 T 148 148
352 Slovenia 618 A 148 148
353 Slovenia 619 C 148 148
354 Slovenia 620 C 148 148
355 Slovenia 621 G 148 148
356 Slovenia 622 C T 148 145 Arg119Arg
357 Slovenia 623 A 148 148
358 Slovenia 624 A 148 148
359 Slovenia 625 G 148 148
360 Slovenia 626 G 148 148
361 Slovenia 627 T 148 148
362 Slovenia 628 T 148 148
363 Slovenia 629 C 148 148
364 Slovenia 630 T 148 148
365 Slovenia 631 T 148 148
366 Slovenia 632 C 148 148
367 Slovenia 633 T 148 148
368 Slovenia 634 T 148 148
369 Slovenia 635 C 148 148
370 Slovenia 636 G 148 148
371 Slovenia 637 T 148 148
372 Slovenia 638 A 148 148
373 Slovenia 639 A 148 148
374 Slovenia 640 G 148 148
375 Slovenia 641 A 148 148
376 Slovenia 642 A 148 148
377 Slovenia 643 C T 148 147 Asn126Asn
378 Slovenia 644 G 148 148
379 Slovenia 645 G 148 148
380 Slovenia 646 T 148 148
381 Slovenia 647 A 148 148
382 Slovenia 648 A 148 148
383 Slovenia 649 T 148 148
384 Slovenia 650 A 148 148
385 Slovenia 651 A 148 148
386 Slovenia 652 A 148 148
387 Slovenia 653 G 148 148
388 Slovenia 654 G 148 148
389 Slovenia 655 A 148 148
390 Slovenia 656 G 148 148
391 Slovenia 657 C 148 148
392 Slovenia 658 T 148 148
393 Slovenia 659 G 148 148
394 Slovenia 660 G 148 148
395 Slovenia 661 T 148 148
396 Slovenia 662 G 148 148
397 Slovenia 663 G 148 148
398 Slovenia 664 C 148 148
399 Slovenia 665 C 148 148
400 Slovenia 666 A 148 148
401 Slovenia 667 T 148 148
402 Slovenia 668 A 148 148
403 Slovenia 669 G 148 148
404 Slovenia 670 T 148 148
405 Slovenia 671 T 148 148
406 Slovenia 672 A 148 148
407 Slovenia 673 C 148 148
408 Slovenia 674 G 148 148
409 Slovenia 675 G 148 148
410 Slovenia 676 C 148 148
411 Slovenia 677 G 148 148
412 Slovenia 678 C 148 148
413 Slovenia 679 C 148 148
414 Slovenia 680 G 148 148
415 Slovenia 681 A 148 148
416 Slovenia 682 T 148 148
417 Slovenia 683 C 148 148
418 Slovenia 684 T 148 148
419 Slovenia 685 A 148 148
420 Slovenia 686 A 147 147
421 Slovenia 687 A 147 147
422 Slovenia 688 G 147 147
423 Slovenia 689 T 147 147
424 Slovenia 690 C 147 147
425 Slovenia 691 A 147 147
426 Slovenia 692 T 147 147
427 Slovenia 693 T 147 147
428 Slovenia 694 T 147 147
429 Slovenia 695 G 147 147
430 Slovenia 696 A 147 147
431 Slovenia 697 C 147 147
432 Slovenia 698 T 147 147
433 Slovenia 699 T 147 147
434 Slovenia 700 A 147 147
435 Slovenia 701 G 147 147
436 Slovenia 702 G 147 147
437 Slovenia 703 C 147 147
438 Slovenia 704 G 147 147
439 Slovenia 705 A 147 147
440 Slovenia 706 C 147 147
441 Slovenia 707 G 147 147
442 Slovenia 708 A 147 147
443 Slovenia 709 G 147 147
444 Slovenia 710 C 147 147
445 Slovenia 711 T 147 147
446 Slovenia 712 T 147 147
447 Slovenia 713 G 147 147
448 Slovenia 714 G 147 147
449 Slovenia 715 C 147 147
450 Slovenia 716 A 147 147
451 Slovenia 717 C 147 147
452 Slovenia 718 T 147 147
453 Slovenia 719 G 147 147
454 Slovenia 720 A 147 147
455 Slovenia 721 T 147 147
456 Slovenia 722 C 147 147
457 Slovenia 723 C 147 147
458 Slovenia 724 T 147 147
459 Slovenia 725 T 147 147
460 Slovenia 726 A 147 147
461 Slovenia 727 T 147 147
462 Slovenia 728 G 147 147
463 Slovenia 729 A 147 147
464 Slovenia 730 A 147 147
465 Slovenia 731 G 147 147
466 Slovenia 732 A 147 147
467 Slovenia 733 T 147 147
468 Slovenia 734 T 147 147
469 Slovenia 735 T 147 147
470 Slovenia 736 T 147 147
471 Slovenia 737 C 147 147
472 Slovenia 738 A 147 147
473 Slovenia 739 A 147 147
474 Slovenia 740 G 147 147
475 Slovenia 741 A 147 147
476 Slovenia 742 A 147 147
477 Slovenia 743 A 147 147
478 Slovenia 744 A 147 147
479 Slovenia 745 C 147 147
480 Slovenia 746 T 148 148
481 Slovenia 747 G 148 148
482 Slovenia 748 G 148 148
483 Slovenia 749 A 148 148
484 Slovenia 750 A 148 148
485 Slovenia 751 C 148 148
486 Slovenia 752 A 148 148
487 Slovenia 753 C 148 148
488 Slovenia 754 T 148 148
489 Slovenia 755 A 148 148
490 Slovenia 756 A 148 148
491 Slovenia 757 A 148 148
492 Slovenia 758 C 148 148
493 Slovenia 759 A 148 148
494 Slovenia 760 T 148 148
495 Slovenia 761 A G 148 147 Ser166Gly
496 Slovenia 762 G 148 148
497 Slovenia 763 C 148 148
498 Slovenia 764 A 148 148
499 Slovenia 765 G 148 148
500 Slovenia 766 T 148 148
501 Slovenia 767 G 148 148
502 Slovenia 768 G 148 148
503 Slovenia 769 T 148 148
504 Slovenia 770 G 148 148
505 Slovenia 771 T 148 148
506 Slovenia 772 T 148 148
507 Slovenia 773 A 148 148
508 Slovenia 774 C 148 148
509 Slovenia 775 C 148 148
510 Slovenia 776 C 148 148
511 Slovenia 777 G 148 148
512 Slovenia 778 T 148 148
513 Slovenia 779 G 148 148
514 Slovenia 780 A 148 148
515 Slovenia 781 A 148 148
516 Slovenia 782 C 148 148
517 Slovenia 783 T 148 148
518 Slovenia 784 C 148 148
519 Slovenia 785 A 148 148
520 Slovenia 786 T 148 148
521 Slovenia 787 G 148 148
522 Slovenia 788 C 148 148
523 Slovenia 789 G 148 148
524 Slovenia 790 T 148 148
525 Slovenia 791 G 148 148
526 Slovenia 792 A 148 148
527 Slovenia 793 G 148 148
528 Slovenia 794 C 148 148
529 Slovenia 795 T 148 148
530 Slovenia 796 T 148 148
531 Slovenia 797 A 148 148
532 Slovenia 798 A 148 148
533 Slovenia 799 C 148 148
534 Slovenia 800 G 148 148
535 Slovenia 801 G 148 148
536 Slovenia 802 A 148 148
537 Slovenia 803 G 148 148
538 Slovenia 804 G 148 148
539 Slovenia 805 G 148 148