National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   540                                        
?                                            
A   21                                        
C   3                                        
D   27                                        
E   54                                        
F   15                                        
G   66           1                            
H   21                                        
I   9                                        
K   27                                        
L   63                                        
M   9                                        
N   18                                        
P   24                                        
Q   21                                        
R   30                             1          
S   30                               1        
T   21                                        
V   63                                   2    
W   3                                        
Y   15                                       1

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Serbia 266 A 147 147
1 Serbia 267 T 147 147
2 Serbia 268 G 147 147
3 Serbia 269 G 147 147
4 Serbia 270 A 147 147
5 Serbia 271 G 147 147
6 Serbia 272 A 147 147
7 Serbia 273 G 147 147
8 Serbia 274 C 147 147
9 Serbia 275 C 147 147
10 Serbia 276 T 147 147
11 Serbia 277 T 147 147
12 Serbia 278 G 147 147
13 Serbia 279 T 147 147
14 Serbia 280 C 147 147
15 Serbia 281 C 147 147
16 Serbia 282 C 147 147
17 Serbia 283 T 147 147
18 Serbia 284 G 147 147
19 Serbia 285 G 147 147
20 Serbia 286 T 147 147
21 Serbia 287 T 147 147
22 Serbia 288 T 147 147
23 Serbia 289 C 147 147
24 Serbia 290 A 147 147
25 Serbia 291 A 147 147
26 Serbia 292 C 147 147
27 Serbia 293 G 147 147
28 Serbia 294 A 147 147
29 Serbia 295 G 147 147
30 Serbia 296 A 147 147
31 Serbia 297 A 147 147
32 Serbia 298 A 147 147
33 Serbia 299 A 147 147
34 Serbia 300 C 147 147
35 Serbia 301 A 147 147
36 Serbia 302 C 147 147
37 Serbia 303 A 147 147
38 Serbia 304 C 147 147
39 Serbia 305 G 147 147
40 Serbia 306 T 147 147
41 Serbia 307 C 147 147
42 Serbia 308 C 147 147
43 Serbia 309 A 147 147
44 Serbia 310 A 147 147
45 Serbia 311 C 147 147
46 Serbia 312 T 147 147
47 Serbia 313 C 147 147
48 Serbia 314 A 147 147
49 Serbia 315 G 147 147
50 Serbia 316 T 147 147
51 Serbia 317 T 147 147
52 Serbia 318 T 147 147
53 Serbia 319 G 147 147
54 Serbia 320 C 147 147
55 Serbia 321 C 147 147
56 Serbia 322 T 147 147
57 Serbia 323 G 147 147
58 Serbia 324 T 147 147
59 Serbia 325 T 147 147
60 Serbia 326 T 147 147
61 Serbia 327 T 147 147
62 Serbia 328 A 147 147
63 Serbia 329 C 147 147
64 Serbia 330 A 147 147
65 Serbia 331 G 147 147
66 Serbia 332 G 147 147
67 Serbia 333 T 147 147
68 Serbia 334 T 147 147
69 Serbia 335 C 147 147
70 Serbia 336 G 147 147
71 Serbia 337 C T 147 140 Arg24Arg
72 Serbia 338 G 147 147
73 Serbia 339 A 147 147
74 Serbia 340 C 147 147
75 Serbia 341 G 147 147
76 Serbia 342 T 147 147
77 Serbia 343 G 147 147
78 Serbia 344 C 147 147
79 Serbia 345 T 147 147
80 Serbia 346 C 147 147
81 Serbia 347 G 147 147
82 Serbia 348 T 147 147
83 Serbia 349 A 147 147
84 Serbia 350 C 147 147
85 Serbia 351 G 147 147
86 Serbia 352 T 147 147
87 Serbia 353 G 147 147
88 Serbia 354 G 147 147
89 Serbia 355 C 147 147
90 Serbia 356 T 147 147
91 Serbia 357 T 147 147
92 Serbia 358 T 147 147
93 Serbia 359 G 147 147
94 Serbia 360 G 147 147
95 Serbia 361 A 147 147
96 Serbia 362 G 147 147
97 Serbia 363 A 147 147
98 Serbia 364 C 147 147
99 Serbia 365 T 147 147
100 Serbia 366 C 147 147
101 Serbia 367 C 147 147
102 Serbia 368 G 147 147
103 Serbia 369 T 147 147
104 Serbia 370 G T 147 146 Val35Val
105 Serbia 371 G 147 147
106 Serbia 372 A 147 147
107 Serbia 373 G 147 147
108 Serbia 374 G 147 147
109 Serbia 375 A 147 147
110 Serbia 376 G 147 147
111 Serbia 377 G 147 147
112 Serbia 378 T 147 147
113 Serbia 379 C 147 147
114 Serbia 380 T 147 147
115 Serbia 381 T 147 147
116 Serbia 382 A 147 147
117 Serbia 383 T 147 147
118 Serbia 384 C 147 147
119 Serbia 385 A 147 147
120 Serbia 386 G 147 147
121 Serbia 387 A 147 147
122 Serbia 388 G 147 147
123 Serbia 389 G 147 147
124 Serbia 390 C 147 147
125 Serbia 391 A 147 147
126 Serbia 392 C 147 147
127 Serbia 393 G 147 147
128 Serbia 394 T 147 147
129 Serbia 395 C 147 147
130 Serbia 396 A 147 147
131 Serbia 397 A 147 147
132 Serbia 398 C 147 147
133 Serbia 399 A 147 147
134 Serbia 400 T 147 147
135 Serbia 401 C 147 147
136 Serbia 402 T 147 147
137 Serbia 403 T 147 147
138 Serbia 404 A 147 147
139 Serbia 405 A 147 147
140 Serbia 406 A 147 147
141 Serbia 407 G 147 147
142 Serbia 408 A 147 147
143 Serbia 409 T 147 147
144 Serbia 410 G 147 147
145 Serbia 411 G 147 147
146 Serbia 412 C 147 147
147 Serbia 413 A 147 147
148 Serbia 414 C 147 147
149 Serbia 415 T 147 147
150 Serbia 416 T 147 147
151 Serbia 417 G 147 147
152 Serbia 418 T 147 147
153 Serbia 419 G 147 147
154 Serbia 420 G 147 147
155 Serbia 421 C T 147 146 Gly52Gly
156 Serbia 422 T 147 147
157 Serbia 423 T 147 147
158 Serbia 424 A 147 147
159 Serbia 425 G 147 147
160 Serbia 426 T 147 147
161 Serbia 427 A 147 147
162 Serbia 428 G 147 147
163 Serbia 429 A 147 147
164 Serbia 430 A 147 147
165 Serbia 431 G 147 147
166 Serbia 432 T 147 147
167 Serbia 433 T 147 147
168 Serbia 434 G 147 147
169 Serbia 435 A 147 147
170 Serbia 436 A 147 147
171 Serbia 437 A 147 147
172 Serbia 438 A 147 147
173 Serbia 439 A 147 147
174 Serbia 440 G 147 147
175 Serbia 441 G 147 147
176 Serbia 442 C 147 147
177 Serbia 443 G 147 147
178 Serbia 444 T 147 147
179 Serbia 445 T C 147 146 Val60Val
180 Serbia 446 T 147 147
181 Serbia 447 T 147 147
182 Serbia 448 G 147 147
183 Serbia 449 C 147 147
184 Serbia 450 C 147 147
185 Serbia 451 T 147 147
186 Serbia 452 C 147 147
187 Serbia 453 A 147 147
188 Serbia 454 A 147 147
189 Serbia 455 C 147 147
190 Serbia 456 T 147 147
191 Serbia 457 T 147 147
192 Serbia 458 G 147 147
193 Serbia 459 A 147 147
194 Serbia 460 A 147 147
195 Serbia 461 C 147 147
196 Serbia 462 A 147 147
197 Serbia 463 G 147 147
198 Serbia 464 C 147 147
199 Serbia 465 C 147 147
200 Serbia 466 C 147 147
201 Serbia 467 T 147 147
202 Serbia 468 A 147 147
203 Serbia 469 T 147 147
204 Serbia 470 G 147 147
205 Serbia 471 T 147 147
206 Serbia 472 G 147 147
207 Serbia 473 T 147 147
208 Serbia 474 T 147 147
209 Serbia 475 C 147 147
210 Serbia 476 A 147 147
211 Serbia 477 T 147 147
212 Serbia 478 C 147 147
213 Serbia 479 A 147 147
214 Serbia 480 A 147 147
215 Serbia 481 A 147 147
216 Serbia 482 C 147 147
217 Serbia 483 G 147 147
218 Serbia 484 T 147 147
219 Serbia 485 T 147 147
220 Serbia 486 C 147 147
221 Serbia 487 G T 147 146 Ser74Ser
222 Serbia 488 G 147 147
223 Serbia 489 A 147 147
224 Serbia 490 T 147 147
225 Serbia 491 G 147 147
226 Serbia 492 C 147 147
227 Serbia 493 T 147 147
228 Serbia 494 C 147 147
229 Serbia 495 G 147 147
230 Serbia 496 A 147 147
231 Serbia 497 A 147 147
232 Serbia 498 C 147 147
233 Serbia 499 T 147 147
234 Serbia 500 G 147 147
235 Serbia 501 C 147 147
236 Serbia 502 A 147 147
237 Serbia 503 C 147 147
238 Serbia 504 C 147 147
239 Serbia 505 T 145 145
240 Serbia 506 C 145 145
241 Serbia 507 A 145 145
242 Serbia 508 T 145 145
243 Serbia 509 G 145 145
244 Serbia 510 G 145 145
245 Serbia 511 T 145 145
246 Serbia 512 C 145 145
247 Serbia 513 A 145 145
248 Serbia 514 T 145 145
249 Serbia 515 G 145 145
250 Serbia 516 T 145 145
251 Serbia 517 T 145 145
252 Serbia 518 A 145 145
253 Serbia 519 T 145 145
254 Serbia 520 G 145 145
255 Serbia 521 G 145 145
256 Serbia 522 T 145 145
257 Serbia 523 T 145 145
258 Serbia 524 G 145 145
259 Serbia 525 A 145 145
260 Serbia 526 G 145 145
261 Serbia 527 C 145 145
262 Serbia 528 T 145 145
263 Serbia 529 G 145 145
264 Serbia 530 G 145 145
265 Serbia 531 T 145 145
266 Serbia 532 A 145 145
267 Serbia 533 G 145 145
268 Serbia 534 C 145 145
269 Serbia 535 A 145 145
270 Serbia 536 G 145 145
271 Serbia 537 A 145 145
272 Serbia 538 A 145 145
273 Serbia 539 C 145 145
274 Serbia 540 T 145 145
275 Serbia 541 C 145 145
276 Serbia 542 G 145 145
277 Serbia 543 A 145 145
278 Serbia 544 A 145 145
279 Serbia 545 G 145 145
280 Serbia 546 G 145 145
281 Serbia 547 C 145 145
282 Serbia 548 A 145 145
283 Serbia 549 T 145 145
284 Serbia 550 T 145 145
285 Serbia 551 C 145 145
286 Serbia 552 A 145 145
287 Serbia 553 G 145 145
288 Serbia 554 T 145 145
289 Serbia 555 A 145 145
290 Serbia 556 C 145 145
291 Serbia 557 G 145 145
292 Serbia 558 G 145 145
293 Serbia 559 T 145 145
294 Serbia 560 C 145 145
295 Serbia 561 G 145 145
296 Serbia 562 T 145 145
297 Serbia 563 A 145 145
298 Serbia 564 G 145 145
299 Serbia 565 T 147 147
300 Serbia 566 G 147 147
301 Serbia 567 G 147 147
302 Serbia 568 T 147 147
303 Serbia 569 G 147 147
304 Serbia 570 A 147 147
305 Serbia 571 G 147 147
306 Serbia 572 A 147 147
307 Serbia 573 C 147 147
308 Serbia 574 A 147 147
309 Serbia 575 C 147 147
310 Serbia 576 T 147 147
311 Serbia 577 T 147 147
312 Serbia 578 G 147 147
313 Serbia 579 G 147 147
314 Serbia 580 T 147 147
315 Serbia 581 G 147 147
316 Serbia 582 T 147 147
317 Serbia 583 C 147 147
318 Serbia 584 C 147 147
319 Serbia 585 T 147 147
320 Serbia 586 T 147 147
321 Serbia 587 G 147 147
322 Serbia 588 T 147 147
323 Serbia 589 C 147 147
324 Serbia 590 C 147 147
325 Serbia 591 C 147 147
326 Serbia 592 T 147 147
327 Serbia 593 C 147 147
328 Serbia 594 A 147 147
329 Serbia 595 T 147 147
330 Serbia 596 G 147 147
331 Serbia 597 T 147 147
332 Serbia 598 G 147 147
333 Serbia 599 G 147 147
334 Serbia 600 G 147 147
335 Serbia 601 C 147 147
336 Serbia 602 G 147 147
337 Serbia 603 A 147 147
338 Serbia 604 A 147 147
339 Serbia 605 A 147 147
340 Serbia 606 T 147 147
341 Serbia 607 A 147 147
342 Serbia 608 C 147 147
343 Serbia 609 C 147 147
344 Serbia 610 A 147 147
345 Serbia 611 G 147 147
346 Serbia 612 T 147 147
347 Serbia 613 G 147 147
348 Serbia 614 G 147 147
349 Serbia 615 C 147 147
350 Serbia 616 T 147 147
351 Serbia 617 T 147 147
352 Serbia 618 A 147 147
353 Serbia 619 C 147 147
354 Serbia 620 C 147 147
355 Serbia 621 G 147 147
356 Serbia 622 C 147 147
357 Serbia 623 A 147 147
358 Serbia 624 A 147 147
359 Serbia 625 G 147 147
360 Serbia 626 G 147 147
361 Serbia 627 T 147 147
362 Serbia 628 T 147 147
363 Serbia 629 C 147 147
364 Serbia 630 T 147 147
365 Serbia 631 T 147 147
366 Serbia 632 C 147 147
367 Serbia 633 T 147 147
368 Serbia 634 T 147 147
369 Serbia 635 C 147 147
370 Serbia 636 G 147 147
371 Serbia 637 T 147 147
372 Serbia 638 A 147 147
373 Serbia 639 A 147 147
374 Serbia 640 G 147 147
375 Serbia 641 A 147 147
376 Serbia 642 A 147 147
377 Serbia 643 C 147 147
378 Serbia 644 G 147 147
379 Serbia 645 G 147 147
380 Serbia 646 T 147 147
381 Serbia 647 A 147 147
382 Serbia 648 A 147 147
383 Serbia 649 T 147 147
384 Serbia 650 A 147 147
385 Serbia 651 A 147 147
386 Serbia 652 A 147 147
387 Serbia 653 G 147 147
388 Serbia 654 G 147 147
389 Serbia 655 A 147 147
390 Serbia 656 G 147 147
391 Serbia 657 C 147 147
392 Serbia 658 T 147 147
393 Serbia 659 G 147 147
394 Serbia 660 G 147 147
395 Serbia 661 T 147 147
396 Serbia 662 G 147 147
397 Serbia 663 G 147 147
398 Serbia 664 C 147 147
399 Serbia 665 C 147 147
400 Serbia 666 A 147 147
401 Serbia 667 T 147 147
402 Serbia 668 A 147 147
403 Serbia 669 G 147 147
404 Serbia 670 T 147 147
405 Serbia 671 T 147 147
406 Serbia 672 A 147 147
407 Serbia 673 C T 147 145 Tyr136Tyr
408 Serbia 674 G 147 147
409 Serbia 675 G 147 147
410 Serbia 676 C 147 147
411 Serbia 677 G 147 147
412 Serbia 678 C 147 147
413 Serbia 679 C 147 147
414 Serbia 680 G 147 147
415 Serbia 681 A 147 147
416 Serbia 682 T 147 147
417 Serbia 683 C 147 147
418 Serbia 684 T 147 147
419 Serbia 685 A 147 147
420 Serbia 686 A 146 146
421 Serbia 687 A 146 146
422 Serbia 688 G 146 146
423 Serbia 689 T 146 146
424 Serbia 690 C 146 146
425 Serbia 691 A 146 146
426 Serbia 692 T 146 146
427 Serbia 693 T 146 146
428 Serbia 694 T 146 146
429 Serbia 695 G 146 146
430 Serbia 696 A 146 146
431 Serbia 697 C 146 146
432 Serbia 698 T 146 146
433 Serbia 699 T 146 146
434 Serbia 700 A 146 146
435 Serbia 701 G 146 146
436 Serbia 702 G 146 146
437 Serbia 703 C 146 146
438 Serbia 704 G 146 146
439 Serbia 705 A 146 146
440 Serbia 706 C 146 146
441 Serbia 707 G 146 146
442 Serbia 708 A 146 146
443 Serbia 709 G 146 146
444 Serbia 710 C 146 146
445 Serbia 711 T 146 146
446 Serbia 712 T 146 146
447 Serbia 713 G 146 146
448 Serbia 714 G 146 146
449 Serbia 715 C 146 146
450 Serbia 716 A 146 146
451 Serbia 717 C 146 146
452 Serbia 718 T 146 146
453 Serbia 719 G 146 146
454 Serbia 720 A 146 146
455 Serbia 721 T 146 146
456 Serbia 722 C 146 146
457 Serbia 723 C 146 146
458 Serbia 724 T 146 146
459 Serbia 725 T 146 146
460 Serbia 726 A 146 146
461 Serbia 727 T 146 146
462 Serbia 728 G 146 146
463 Serbia 729 A 146 146
464 Serbia 730 A 146 146
465 Serbia 731 G 146 146
466 Serbia 732 A 146 146
467 Serbia 733 T 146 146
468 Serbia 734 T 146 146
469 Serbia 735 T 146 146
470 Serbia 736 T 146 146
471 Serbia 737 C 146 146
472 Serbia 738 A 146 146
473 Serbia 739 A 146 146
474 Serbia 740 G 146 146
475 Serbia 741 A 146 146
476 Serbia 742 A 146 146
477 Serbia 743 A 146 146
478 Serbia 744 A 146 146
479 Serbia 745 C 146 146
480 Serbia 746 T 147 147
481 Serbia 747 G 147 147
482 Serbia 748 G 147 147
483 Serbia 749 A 147 147
484 Serbia 750 A 147 147
485 Serbia 751 C 147 147
486 Serbia 752 A 147 147
487 Serbia 753 C 147 147
488 Serbia 754 T 147 147
489 Serbia 755 A 147 147
490 Serbia 756 A 147 147
491 Serbia 757 A 147 147
492 Serbia 758 C 147 147
493 Serbia 759 A 147 147
494 Serbia 760 T 147 147
495 Serbia 761 A 147 147
496 Serbia 762 G 147 147
497 Serbia 763 C 147 147
498 Serbia 764 A 147 147
499 Serbia 765 G 147 147
500 Serbia 766 T 147 147
501 Serbia 767 G 147 147
502 Serbia 768 G 147 147
503 Serbia 769 T 147 147
504 Serbia 770 G 147 147
505 Serbia 771 T 147 147
506 Serbia 772 T 147 147
507 Serbia 773 A 147 147
508 Serbia 774 C 147 147
509 Serbia 775 C 147 147
510 Serbia 776 C 147 147
511 Serbia 777 G 147 147
512 Serbia 778 T 147 147
513 Serbia 779 G 147 147
514 Serbia 780 A 147 147
515 Serbia 781 A 147 147
516 Serbia 782 C 147 147
517 Serbia 783 T 147 147
518 Serbia 784 C 147 147
519 Serbia 785 A 147 147
520 Serbia 786 T 147 147
521 Serbia 787 G 147 147
522 Serbia 788 C 147 147
523 Serbia 789 G 147 147
524 Serbia 790 T 147 147
525 Serbia 791 G 147 147
526 Serbia 792 A 147 147
527 Serbia 793 G 147 147
528 Serbia 794 C 147 147
529 Serbia 795 T 147 147
530 Serbia 796 T 147 147
531 Serbia 797 A 147 147
532 Serbia 798 A 147 147
533 Serbia 799 C 147 147
534 Serbia 800 G 147 147
535 Serbia 801 G 147 147
536 Serbia 802 A 147 147
537 Serbia 803 G 147 147
538 Serbia 804 G 147 147
539 Serbia 805 G 147 147