National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   540                                        
?                                            
A   21                                        
C   3                                        
D   27                                        
E   54                                        
F   15                                        
G   66                                        
H   21                                        
I   9                                        
K   27                                        
L   63                                        
M   9                                        
N   18                                        
P   24                                        
Q   21                                        
R   30                                        
S   30                                        
T   21                                        
V   63                                        
W   3                                        
Y   15                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 266 A 5 5
1 Brunei 267 T 5 5
2 Brunei 268 G 5 5
3 Brunei 269 G 5 5
4 Brunei 270 A 5 5
5 Brunei 271 G 5 5
6 Brunei 272 A 5 5
7 Brunei 273 G 5 5
8 Brunei 274 C 5 5
9 Brunei 275 C 5 5
10 Brunei 276 T 5 5
11 Brunei 277 T 5 5
12 Brunei 278 G 5 5
13 Brunei 279 T 5 5
14 Brunei 280 C 5 5
15 Brunei 281 C 5 5
16 Brunei 282 C 5 5
17 Brunei 283 T 5 5
18 Brunei 284 G 5 5
19 Brunei 285 G 5 5
20 Brunei 286 T 5 4
21 Brunei 287 T 5 5
22 Brunei 288 T 5 5
23 Brunei 289 C 5 5
24 Brunei 290 A 5 5
25 Brunei 291 A 5 5
26 Brunei 292 C 5 5
27 Brunei 293 G 5 5
28 Brunei 294 A 5 5
29 Brunei 295 G 5 5
30 Brunei 296 A 5 5
31 Brunei 297 A 5 5
32 Brunei 298 A 5 5
33 Brunei 299 A 5 5
34 Brunei 300 C 5 5
35 Brunei 301 A 5 5
36 Brunei 302 C 5 5
37 Brunei 303 A 5 5
38 Brunei 304 C 5 5
39 Brunei 305 G 5 5
40 Brunei 306 T 5 5
41 Brunei 307 C 5 5
42 Brunei 308 C 5 5
43 Brunei 309 A 5 5
44 Brunei 310 A 5 5
45 Brunei 311 C 5 5
46 Brunei 312 T 5 5
47 Brunei 313 C 5 5
48 Brunei 314 A 5 5
49 Brunei 315 G 5 5
50 Brunei 316 T 5 5
51 Brunei 317 T 5 5
52 Brunei 318 T 5 5
53 Brunei 319 G 5 5
54 Brunei 320 C 5 5
55 Brunei 321 C 5 5
56 Brunei 322 T 5 5
57 Brunei 323 G 5 5
58 Brunei 324 T 5 5
59 Brunei 325 T 5 5
60 Brunei 326 T 5 5
61 Brunei 327 T 5 5
62 Brunei 328 A 5 5
63 Brunei 329 C 5 5
64 Brunei 330 A 5 5
65 Brunei 331 G 5 5
66 Brunei 332 G 5 5
67 Brunei 333 T 5 5
68 Brunei 334 T 5 5
69 Brunei 335 C 5 5
70 Brunei 336 G 5 5
71 Brunei 337 C 5 5
72 Brunei 338 G 5 5
73 Brunei 339 A 5 5
74 Brunei 340 C 5 5
75 Brunei 341 G 5 5
76 Brunei 342 T 5 5
77 Brunei 343 G 5 5
78 Brunei 344 C 5 5
79 Brunei 345 T 5 5
80 Brunei 346 C 5 5
81 Brunei 347 G 5 5
82 Brunei 348 T 5 5
83 Brunei 349 A 5 5
84 Brunei 350 C 5 5
85 Brunei 351 G 5 5
86 Brunei 352 T 5 5
87 Brunei 353 G 5 5
88 Brunei 354 G 5 5
89 Brunei 355 C 5 5
90 Brunei 356 T 5 5
91 Brunei 357 T 5 5
92 Brunei 358 T 5 5
93 Brunei 359 G 5 5
94 Brunei 360 G 5 5
95 Brunei 361 A 5 5
96 Brunei 362 G 5 5
97 Brunei 363 A 5 5
98 Brunei 364 C 5 5
99 Brunei 365 T 5 5
100 Brunei 366 C 5 5
101 Brunei 367 C 5 5
102 Brunei 368 G 5 5
103 Brunei 369 T 5 5
104 Brunei 370 G 5 5
105 Brunei 371 G 5 5
106 Brunei 372 A 5 5
107 Brunei 373 G 5 5
108 Brunei 374 G 5 5
109 Brunei 375 A 5 5
110 Brunei 376 G 5 5
111 Brunei 377 G 5 5
112 Brunei 378 T 5 5
113 Brunei 379 C 5 5
114 Brunei 380 T 5 5
115 Brunei 381 T 5 5
116 Brunei 382 A 5 5
117 Brunei 383 T 5 5
118 Brunei 384 C 5 5
119 Brunei 385 A 5 5
120 Brunei 386 G 5 5
121 Brunei 387 A 5 5
122 Brunei 388 G 5 5
123 Brunei 389 G 5 5
124 Brunei 390 C 5 5
125 Brunei 391 A 5 5
126 Brunei 392 C 5 5
127 Brunei 393 G 5 5
128 Brunei 394 T 5 5
129 Brunei 395 C 5 5
130 Brunei 396 A 5 5
131 Brunei 397 A 5 5
132 Brunei 398 C 5 5
133 Brunei 399 A 5 5
134 Brunei 400 T 5 5
135 Brunei 401 C 5 5
136 Brunei 402 T 5 5
137 Brunei 403 T 5 5
138 Brunei 404 A 5 5
139 Brunei 405 A 5 5
140 Brunei 406 A 5 5
141 Brunei 407 G 5 5
142 Brunei 408 A 5 5
143 Brunei 409 T 5 5
144 Brunei 410 G 5 5
145 Brunei 411 G 5 5
146 Brunei 412 C 5 5
147 Brunei 413 A 5 5
148 Brunei 414 C 5 5
149 Brunei 415 T 5 5
150 Brunei 416 T 5 5
151 Brunei 417 G 5 5
152 Brunei 418 T 5 5
153 Brunei 419 G 5 5
154 Brunei 420 G 5 5
155 Brunei 421 C 5 5
156 Brunei 422 T 5 5
157 Brunei 423 T 5 5
158 Brunei 424 A 5 5
159 Brunei 425 G 5 5
160 Brunei 426 T 5 5
161 Brunei 427 A 5 5
162 Brunei 428 G 5 5
163 Brunei 429 A 5 5
164 Brunei 430 A 5 5
165 Brunei 431 G 5 5
166 Brunei 432 T 5 5
167 Brunei 433 T 5 5
168 Brunei 434 G 5 5
169 Brunei 435 A 5 5
170 Brunei 436 A 5 5
171 Brunei 437 A 5 5
172 Brunei 438 A 5 5
173 Brunei 439 A 5 5
174 Brunei 440 G 5 5
175 Brunei 441 G 5 5
176 Brunei 442 C 5 5
177 Brunei 443 G 5 5
178 Brunei 444 T 5 5
179 Brunei 445 T 5 5
180 Brunei 446 T 5 5
181 Brunei 447 T 5 5
182 Brunei 448 G 5 5
183 Brunei 449 C 5 5
184 Brunei 450 C 5 5
185 Brunei 451 T 5 5
186 Brunei 452 C 5 5
187 Brunei 453 A 5 5
188 Brunei 454 A 5 5
189 Brunei 455 C 5 5
190 Brunei 456 T 5 5
191 Brunei 457 T 5 5
192 Brunei 458 G 5 5
193 Brunei 459 A 5 5
194 Brunei 460 A 5 5
195 Brunei 461 C 5 5
196 Brunei 462 A 5 5
197 Brunei 463 G 5 5
198 Brunei 464 C 5 5
199 Brunei 465 C 5 5
200 Brunei 466 C 5 5
201 Brunei 467 T 5 5
202 Brunei 468 A 5 5
203 Brunei 469 T 5 5
204 Brunei 470 G 5 5
205 Brunei 471 T 5 5
206 Brunei 472 G 5 5
207 Brunei 473 T 5 5
208 Brunei 474 T 5 5
209 Brunei 475 C 5 5
210 Brunei 476 A 5 5
211 Brunei 477 T 5 5
212 Brunei 478 C 5 5
213 Brunei 479 A 5 5
214 Brunei 480 A 5 5
215 Brunei 481 A 5 5
216 Brunei 482 C 5 5
217 Brunei 483 G 5 5
218 Brunei 484 T 5 5
219 Brunei 485 T 5 5
220 Brunei 486 C 5 5
221 Brunei 487 G 5 5
222 Brunei 488 G 5 5
223 Brunei 489 A 5 5
224 Brunei 490 T 5 5
225 Brunei 491 G 5 5
226 Brunei 492 C 5 5
227 Brunei 493 T 5 5
228 Brunei 494 C 5 5
229 Brunei 495 G 5 5
230 Brunei 496 A 5 5
231 Brunei 497 A 5 5
232 Brunei 498 C 5 5
233 Brunei 499 T 5 5
234 Brunei 500 G 5 5
235 Brunei 501 C 5 5
236 Brunei 502 A 5 5
237 Brunei 503 C 5 5
238 Brunei 504 C 5 5
239 Brunei 505 T 5 5
240 Brunei 506 C 5 5
241 Brunei 507 A 5 5
242 Brunei 508 T 5 5
243 Brunei 509 G 5 5
244 Brunei 510 G 5 5
245 Brunei 511 T 5 5
246 Brunei 512 C 5 5
247 Brunei 513 A 5 5
248 Brunei 514 T 5 5
249 Brunei 515 G 5 5
250 Brunei 516 T 5 5
251 Brunei 517 T 5 5
252 Brunei 518 A 5 5
253 Brunei 519 T 5 5
254 Brunei 520 G 5 5
255 Brunei 521 G 5 5
256 Brunei 522 T 5 5
257 Brunei 523 T 5 5
258 Brunei 524 G 5 5
259 Brunei 525 A 5 5
260 Brunei 526 G 5 5
261 Brunei 527 C 5 5
262 Brunei 528 T 5 5
263 Brunei 529 G 5 5
264 Brunei 530 G 5 5
265 Brunei 531 T 5 5
266 Brunei 532 A 5 5
267 Brunei 533 G 5 5
268 Brunei 534 C 5 5
269 Brunei 535 A 5 5
270 Brunei 536 G 5 5
271 Brunei 537 A 5 5
272 Brunei 538 A 5 5
273 Brunei 539 C 5 5
274 Brunei 540 T 5 5
275 Brunei 541 C 5 5
276 Brunei 542 G 5 5
277 Brunei 543 A 5 5
278 Brunei 544 A 5 5
279 Brunei 545 G 5 5
280 Brunei 546 G 5 5
281 Brunei 547 C 5 5
282 Brunei 548 A 5 5
283 Brunei 549 T 5 5
284 Brunei 550 T 5 5
285 Brunei 551 C 5 5
286 Brunei 552 A 5 5
287 Brunei 553 G 5 5
288 Brunei 554 T 5 5
289 Brunei 555 A 5 5
290 Brunei 556 C 5 5
291 Brunei 557 G 5 5
292 Brunei 558 G 5 5
293 Brunei 559 T 5 5
294 Brunei 560 C 5 5
295 Brunei 561 G 5 5
296 Brunei 562 T 5 5
297 Brunei 563 A 5 5
298 Brunei 564 G 5 5
299 Brunei 565 T 5 5
300 Brunei 566 G 5 5
301 Brunei 567 G 5 5
302 Brunei 568 T 5 5
303 Brunei 569 G 5 5
304 Brunei 570 A 5 5
305 Brunei 571 G 5 5
306 Brunei 572 A 5 5
307 Brunei 573 C 5 5
308 Brunei 574 A 5 5
309 Brunei 575 C 5 5
310 Brunei 576 T 5 5
311 Brunei 577 T 5 5
312 Brunei 578 G 5 5
313 Brunei 579 G 5 5
314 Brunei 580 T 5 5
315 Brunei 581 G 5 5
316 Brunei 582 T 5 5
317 Brunei 583 C 5 5
318 Brunei 584 C 5 5
319 Brunei 585 T 5 5
320 Brunei 586 T 5 5
321 Brunei 587 G 5 5
322 Brunei 588 T 5 5
323 Brunei 589 C 5 5
324 Brunei 590 C 5 5
325 Brunei 591 C 5 5
326 Brunei 592 T 5 5
327 Brunei 593 C 5 5
328 Brunei 594 A 5 5
329 Brunei 595 T 5 5
330 Brunei 596 G 5 5
331 Brunei 597 T 5 5
332 Brunei 598 G 5 5
333 Brunei 599 G 5 5
334 Brunei 600 G 5 5
335 Brunei 601 C 5 5
336 Brunei 602 G 5 5
337 Brunei 603 A 5 5
338 Brunei 604 A 5 5
339 Brunei 605 A 5 5
340 Brunei 606 T 5 5
341 Brunei 607 A 5 5
342 Brunei 608 C 5 5
343 Brunei 609 C 5 5
344 Brunei 610 A 5 5
345 Brunei 611 G 5 5
346 Brunei 612 T 5 5
347 Brunei 613 G 5 5
348 Brunei 614 G 5 5
349 Brunei 615 C 5 5
350 Brunei 616 T 5 5
351 Brunei 617 T 5 5
352 Brunei 618 A 5 5
353 Brunei 619 C 5 5
354 Brunei 620 C 5 5
355 Brunei 621 G 5 5
356 Brunei 622 C 5 5
357 Brunei 623 A 5 5
358 Brunei 624 A 5 5
359 Brunei 625 G 5 5
360 Brunei 626 G 5 5
361 Brunei 627 T 5 5
362 Brunei 628 T 5 5
363 Brunei 629 C 5 5
364 Brunei 630 T 5 5
365 Brunei 631 T 5 5
366 Brunei 632 C 5 5
367 Brunei 633 T 5 5
368 Brunei 634 T 5 5
369 Brunei 635 C 5 5
370 Brunei 636 G 5 5
371 Brunei 637 T 5 5
372 Brunei 638 A 5 5
373 Brunei 639 A 5 5
374 Brunei 640 G 5 5
375 Brunei 641 A 5 5
376 Brunei 642 A 5 5
377 Brunei 643 C 5 5
378 Brunei 644 G 5 5
379 Brunei 645 G 5 5
380 Brunei 646 T 5 5
381 Brunei 647 A 5 5
382 Brunei 648 A 5 5
383 Brunei 649 T 5 5
384 Brunei 650 A 5 5
385 Brunei 651 A 5 5
386 Brunei 652 A 5 5
387 Brunei 653 G 5 5
388 Brunei 654 G 5 5
389 Brunei 655 A 5 5
390 Brunei 656 G 5 5
391 Brunei 657 C 5 5
392 Brunei 658 T 5 5
393 Brunei 659 G 5 5
394 Brunei 660 G 5 5
395 Brunei 661 T 5 5
396 Brunei 662 G 5 5
397 Brunei 663 G 5 5
398 Brunei 664 C 5 5
399 Brunei 665 C 5 5
400 Brunei 666 A 5 5
401 Brunei 667 T 5 5
402 Brunei 668 A 5 5
403 Brunei 669 G 5 5
404 Brunei 670 T 5 5
405 Brunei 671 T 5 5
406 Brunei 672 A 5 5
407 Brunei 673 C 5 5
408 Brunei 674 G 5 5
409 Brunei 675 G 5 5
410 Brunei 676 C 5 5
411 Brunei 677 G 5 5
412 Brunei 678 C 5 5
413 Brunei 679 C 5 5
414 Brunei 680 G 5 5
415 Brunei 681 A 5 5
416 Brunei 682 T 5 5
417 Brunei 683 C 5 5
418 Brunei 684 T 5 5
419 Brunei 685 A 5 5
420 Brunei 686 A 5 5
421 Brunei 687 A 5 5
422 Brunei 688 G 5 5
423 Brunei 689 T 5 5
424 Brunei 690 C 5 5
425 Brunei 691 A 5 5
426 Brunei 692 T 5 5
427 Brunei 693 T 5 5
428 Brunei 694 T 5 5
429 Brunei 695 G 5 5
430 Brunei 696 A 5 5
431 Brunei 697 C 5 5
432 Brunei 698 T 5 5
433 Brunei 699 T 5 5
434 Brunei 700 A 5 5
435 Brunei 701 G 5 5
436 Brunei 702 G 5 5
437 Brunei 703 C 5 5
438 Brunei 704 G 5 5
439 Brunei 705 A 5 5
440 Brunei 706 C 5 5
441 Brunei 707 G 5 5
442 Brunei 708 A 5 5
443 Brunei 709 G 5 5
444 Brunei 710 C 5 5
445 Brunei 711 T 5 5
446 Brunei 712 T 5 5
447 Brunei 713 G 5 5
448 Brunei 714 G 5 5
449 Brunei 715 C 5 5
450 Brunei 716 A 5 5
451 Brunei 717 C 5 5
452 Brunei 718 T 5 5
453 Brunei 719 G 5 5
454 Brunei 720 A 5 5
455 Brunei 721 T 5 5
456 Brunei 722 C 5 5
457 Brunei 723 C 5 5
458 Brunei 724 T 5 5
459 Brunei 725 T 5 5
460 Brunei 726 A 5 5
461 Brunei 727 T 5 5
462 Brunei 728 G 5 5
463 Brunei 729 A 5 5
464 Brunei 730 A 5 5
465 Brunei 731 G 5 5
466 Brunei 732 A 5 5
467 Brunei 733 T 5 5
468 Brunei 734 T 5 5
469 Brunei 735 T 5 5
470 Brunei 736 T 5 5
471 Brunei 737 C 5 5
472 Brunei 738 A 5 5
473 Brunei 739 A 5 5
474 Brunei 740 G 5 5
475 Brunei 741 A 5 5
476 Brunei 742 A 5 5
477 Brunei 743 A 5 5
478 Brunei 744 A 5 5
479 Brunei 745 C 5 5
480 Brunei 746 T 5 5
481 Brunei 747 G 5 5
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483 Brunei 749 A 5 5
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488 Brunei 754 T 5 5
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500 Brunei 766 T 5 5
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539 Brunei 805 G 5 5