National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   540                                        
?                                            
A   21                                        
C   3                                        
D   27                                        
E   54                                        
F   15                                        
G   66                                        
H   21                                        
I   9                                        
K   27                                        
L   63                                        
M   9                                        
N   18                       1                
P   24                                        
Q   21                                        
R   30                                        
S   30                                        
T   21                                        
V   63                                        
W   3                                        
Y   15                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 266 A 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 267 T 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 268 G 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 269 G 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 270 A 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 271 G 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 272 A 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 273 G 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 274 C 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 275 C 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 276 T 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 277 T 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 278 G 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 279 T 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 280 C 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 281 C 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 282 C 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 283 T 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 284 G 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 285 G 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 286 T 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 287 T 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 288 T 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 289 C 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 290 A 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 291 A 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 292 C 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 293 G 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 294 A 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 295 G 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 296 A 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 297 A 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 298 A 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 299 A 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 300 C 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 301 A 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 302 C 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 303 A 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 304 C 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 305 G 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 306 T 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 307 C 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 308 C 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 309 A 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 310 A 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 311 C 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 312 T 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 313 C 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 314 A 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 315 G 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 316 T 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 317 T 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 318 T 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 319 G 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 320 C 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 321 C 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 322 T 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 323 G 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 324 T 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 325 T 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 326 T 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 327 T 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 328 A 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 329 C 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 330 A 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 331 G 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 332 G 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 333 T 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 334 T 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 335 C 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 336 G 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 337 C 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 338 G 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 339 A 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 340 C 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 341 G 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 342 T 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 343 G 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 344 C 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 345 T 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 346 C 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 347 G 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 348 T 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 349 A 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 350 C 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 351 G 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 352 T 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 353 G 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 354 G 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 355 C 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 356 T 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 357 T 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 358 T 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 359 G 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 360 G 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 361 A 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 362 G 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 363 A 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 364 C 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 365 T 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 366 C 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 367 C 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 368 G 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 369 T 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 370 G 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 371 G 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 372 A 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 373 G 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 374 G 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 375 A 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 376 G 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 377 G 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 378 T 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 379 C 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 380 T 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 381 T 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 382 A 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 383 T 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 384 C 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 385 A 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 386 G 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 387 A 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 388 G 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 389 G 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 390 C 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 391 A 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 392 C 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 393 G 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 394 T 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 395 C 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 396 A 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 397 A 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 398 C 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 399 A 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 400 T 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 401 C 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 402 T 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 403 T 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 404 A 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 405 A 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 406 A 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 407 G 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 408 A 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 409 T 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 410 G 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 411 G 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 412 C 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 413 A 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 414 C 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 415 T 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 416 T 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 417 G 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 418 T 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 419 G 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 420 G 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 421 C 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 422 T 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 423 T 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 424 A 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 425 G 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 426 T 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 427 A 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 428 G 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 429 A 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 430 A 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 431 G 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 432 T 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 433 T 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 434 G 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 435 A 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 436 A 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 437 A 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 438 A 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 439 A 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 440 G 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 441 G 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 442 C 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 443 G 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 444 T 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 445 T 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 446 T 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 447 T 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 448 G 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 449 C 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 450 C 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 451 T 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 452 C 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 453 A 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 454 A 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 455 C 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 456 T 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 457 T 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 458 G 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 459 A 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 460 A 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 461 C 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 462 A 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 463 G 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 464 C 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 465 C 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 466 C 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 467 T 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 468 A 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 469 T 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 470 G 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 471 T 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 472 G 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 473 T 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 474 T 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 475 C 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 476 A 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 477 T 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 478 C 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 479 A 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 480 A 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 481 A 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 482 C 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 483 G 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 484 T 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 485 T 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 486 C 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 487 G 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 488 G 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 489 A 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 490 T 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 491 G 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 492 C 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 493 T 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 494 C 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 495 G 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 496 A 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 497 A 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 498 C 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 499 T 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 500 G 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 501 C 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 502 A 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 503 C 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 504 C 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 505 T 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 506 C 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 507 A 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 508 T 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 509 G 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 510 G 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 511 T 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 512 C 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 513 A 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 514 T 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 515 G 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 516 T 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 517 T 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 518 A 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 519 T 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 520 G 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 521 G 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 522 T 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 523 T 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 524 G 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 525 A 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 526 G 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 527 C 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 528 T 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 529 G 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 530 G 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 531 T 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 532 A 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 533 G 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 534 C 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 535 A 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 536 G 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 537 A 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 538 A 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 539 C 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 540 T 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 541 C 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 542 G 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 543 A 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 544 A 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 545 G 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 546 G 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 547 C 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 548 A 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 549 T 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 550 T 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 551 C 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 552 A 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 553 G 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 554 T 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 555 A 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 556 C 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 557 G 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 558 G 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 559 T 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 560 C 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 561 G 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 562 T 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 563 A 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 564 G 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 565 T 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 566 G 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 567 G 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 568 T 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 569 G 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 570 A 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 571 G 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 572 A 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 573 C 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 574 A 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 575 C 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 576 T 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 577 T 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 578 G 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 579 G 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 580 T 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 581 G 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 582 T 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 583 C 1 1
318 Antigua_and_Barbuda 584 C 1 1
319 Antigua_and_Barbuda 585 T 1 1
320 Antigua_and_Barbuda 586 T 1 1
321 Antigua_and_Barbuda 587 G 1 1
322 Antigua_and_Barbuda 588 T 1 1
323 Antigua_and_Barbuda 589 C 1 1
324 Antigua_and_Barbuda 590 C 1 1
325 Antigua_and_Barbuda 591 C 1 1
326 Antigua_and_Barbuda 592 T 1 1
327 Antigua_and_Barbuda 593 C 1 1
328 Antigua_and_Barbuda 594 A 1 1
329 Antigua_and_Barbuda 595 T 1 1
330 Antigua_and_Barbuda 596 G 1 1
331 Antigua_and_Barbuda 597 T 1 1
332 Antigua_and_Barbuda 598 G 1 1
333 Antigua_and_Barbuda 599 G 1 1
334 Antigua_and_Barbuda 600 G 1 1
335 Antigua_and_Barbuda 601 C 1 1
336 Antigua_and_Barbuda 602 G 1 1
337 Antigua_and_Barbuda 603 A 1 1
338 Antigua_and_Barbuda 604 A 1 1
339 Antigua_and_Barbuda 605 A 1 1
340 Antigua_and_Barbuda 606 T 1 1
341 Antigua_and_Barbuda 607 A 1 1
342 Antigua_and_Barbuda 608 C 1 1
343 Antigua_and_Barbuda 609 C 1 1
344 Antigua_and_Barbuda 610 A 1 1
345 Antigua_and_Barbuda 611 G 1 1
346 Antigua_and_Barbuda 612 T 1 1
347 Antigua_and_Barbuda 613 G 1 1
348 Antigua_and_Barbuda 614 G 1 1
349 Antigua_and_Barbuda 615 C 1 1
350 Antigua_and_Barbuda 616 T 1 1
351 Antigua_and_Barbuda 617 T 1 1
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353 Antigua_and_Barbuda 619 C 1 1
354 Antigua_and_Barbuda 620 C 1 1
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356 Antigua_and_Barbuda 622 C 1 1
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359 Antigua_and_Barbuda 625 G 1 1
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