National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.

Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   540                                        
?                                            
A   21                                        
C   3                                        
D   27                                        
E   54                                        
F   15                                        
G   66                                        
H   21                                        
I   9                                        
K   27                                        
L   63                                        
M   9                                        
N   18                                        
P   24                                        
Q   21                                        
R   30                                        
S   30                                        
T   21                                        
V   63                                        
W   3                                        
Y   15                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide

Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Andorra 266 A 1 1
1 Andorra 267 T 1 1
2 Andorra 268 G 1 1
3 Andorra 269 G 1 1
4 Andorra 270 A 1 1
5 Andorra 271 G 1 1
6 Andorra 272 A 1 1
7 Andorra 273 G 1 1
8 Andorra 274 C 1 1
9 Andorra 275 C 1 1
10 Andorra 276 T 1 1
11 Andorra 277 T 1 1
12 Andorra 278 G 1 1
13 Andorra 279 T 1 1
14 Andorra 280 C 1 1
15 Andorra 281 C 1 1
16 Andorra 282 C 1 1
17 Andorra 283 T 1 1
18 Andorra 284 G 1 1
19 Andorra 285 G 1 1
20 Andorra 286 T 1 1
21 Andorra 287 T 1 1
22 Andorra 288 T 1 1
23 Andorra 289 C 1 1
24 Andorra 290 A 1 1
25 Andorra 291 A 1 1
26 Andorra 292 C 1 1
27 Andorra 293 G 1 1
28 Andorra 294 A 1 1
29 Andorra 295 G 1 1
30 Andorra 296 A 1 1
31 Andorra 297 A 1 1
32 Andorra 298 A 1 1
33 Andorra 299 A 1 1
34 Andorra 300 C 1 1
35 Andorra 301 A 1 1
36 Andorra 302 C 1 1
37 Andorra 303 A 1 1
38 Andorra 304 C 1 1
39 Andorra 305 G 1 1
40 Andorra 306 T 1 1
41 Andorra 307 C 1 1
42 Andorra 308 C 1 1
43 Andorra 309 A 1 1
44 Andorra 310 A 1 1
45 Andorra 311 C 1 1
46 Andorra 312 T 1 1
47 Andorra 313 C 1 1
48 Andorra 314 A 1 1
49 Andorra 315 G 1 1
50 Andorra 316 T 1 1
51 Andorra 317 T 1 1
52 Andorra 318 T 1 1
53 Andorra 319 G 1 1
54 Andorra 320 C 1 1
55 Andorra 321 C 1 1
56 Andorra 322 T 1 1
57 Andorra 323 G 1 1
58 Andorra 324 T 1 1
59 Andorra 325 T 1 1
60 Andorra 326 T 1 1
61 Andorra 327 T 1 1
62 Andorra 328 A 1 1
63 Andorra 329 C 1 1
64 Andorra 330 A 1 1
65 Andorra 331 G 1 1
66 Andorra 332 G 1 1
67 Andorra 333 T 1 1
68 Andorra 334 T 1 1
69 Andorra 335 C 1 1
70 Andorra 336 G 1 1
71 Andorra 337 C 1 1
72 Andorra 338 G 1 1
73 Andorra 339 A 1 1
74 Andorra 340 C 1 1
75 Andorra 341 G 1 1
76 Andorra 342 T 1 1
77 Andorra 343 G 1 1
78 Andorra 344 C 1 1
79 Andorra 345 T 1 1
80 Andorra 346 C 1 1
81 Andorra 347 G 1 1
82 Andorra 348 T 1 1
83 Andorra 349 A 1 1
84 Andorra 350 C 1 1
85 Andorra 351 G 1 1
86 Andorra 352 T 1 1
87 Andorra 353 G 1 1
88 Andorra 354 G 1 1
89 Andorra 355 C 1 1
90 Andorra 356 T 1 1
91 Andorra 357 T 1 1
92 Andorra 358 T 1 1
93 Andorra 359 G 1 1
94 Andorra 360 G 1 1
95 Andorra 361 A 1 1
96 Andorra 362 G 1 1
97 Andorra 363 A 1 1
98 Andorra 364 C 1 1
99 Andorra 365 T 1 1
100 Andorra 366 C 1 1
101 Andorra 367 C 1 1
102 Andorra 368 G 1 1
103 Andorra 369 T 1 1
104 Andorra 370 G 1 1
105 Andorra 371 G 1 1
106 Andorra 372 A 1 1
107 Andorra 373 G 1 1
108 Andorra 374 G 1 1
109 Andorra 375 A 1 1
110 Andorra 376 G 1 1
111 Andorra 377 G 1 1
112 Andorra 378 T 1 1
113 Andorra 379 C 1 1
114 Andorra 380 T 1 1
115 Andorra 381 T 1 1
116 Andorra 382 A 1 1
117 Andorra 383 T 1 1
118 Andorra 384 C 1 1
119 Andorra 385 A 1 1
120 Andorra 386 G 1 1
121 Andorra 387 A 1 1
122 Andorra 388 G 1 1
123 Andorra 389 G 1 1
124 Andorra 390 C 1 1
125 Andorra 391 A 1 1
126 Andorra 392 C 1 1
127 Andorra 393 G 1 1
128 Andorra 394 T 1 1
129 Andorra 395 C 1 1
130 Andorra 396 A 1 1
131 Andorra 397 A 1 1
132 Andorra 398 C 1 1
133 Andorra 399 A 1 1
134 Andorra 400 T 1 1
135 Andorra 401 C 1 1
136 Andorra 402 T 1 1
137 Andorra 403 T 1 1
138 Andorra 404 A 1 1
139 Andorra 405 A 1 1
140 Andorra 406 A 1 1
141 Andorra 407 G 1 1
142 Andorra 408 A 1 1
143 Andorra 409 T 1 1
144 Andorra 410 G 1 1
145 Andorra 411 G 1 1
146 Andorra 412 C 1 1
147 Andorra 413 A 1 1
148 Andorra 414 C 1 1
149 Andorra 415 T 1 1
150 Andorra 416 T 1 1
151 Andorra 417 G 1 1
152 Andorra 418 T 1 1
153 Andorra 419 G 1 1
154 Andorra 420 G 1 1
155 Andorra 421 C 1 1
156 Andorra 422 T 1 1
157 Andorra 423 T 1 1
158 Andorra 424 A 1 1
159 Andorra 425 G 1 1
160 Andorra 426 T 1 1
161 Andorra 427 A 1 1
162 Andorra 428 G 1 1
163 Andorra 429 A 1 1
164 Andorra 430 A 1 1
165 Andorra 431 G 1 1
166 Andorra 432 T 1 1
167 Andorra 433 T 1 1
168 Andorra 434 G 1 1
169 Andorra 435 A 1 1
170 Andorra 436 A 1 1
171 Andorra 437 A 1 1
172 Andorra 438 A 1 1
173 Andorra 439 A 1 1
174 Andorra 440 G 1 1
175 Andorra 441 G 1 1
176 Andorra 442 C 1 1
177 Andorra 443 G 1 1
178 Andorra 444 T 1 1
179 Andorra 445 T 1 1
180 Andorra 446 T 1 1
181 Andorra 447 T 1 1
182 Andorra 448 G 1 1
183 Andorra 449 C 1 1
184 Andorra 450 C 1 1
185 Andorra 451 T 1 1
186 Andorra 452 C 1 1
187 Andorra 453 A 1 1
188 Andorra 454 A 1 1
189 Andorra 455 C 1 1
190 Andorra 456 T 1 1
191 Andorra 457 T 1 1
192 Andorra 458 G 1 1
193 Andorra 459 A 1 1
194 Andorra 460 A 1 1
195 Andorra 461 C 1 1
196 Andorra 462 A 1 1
197 Andorra 463 G 1 1
198 Andorra 464 C 1 1
199 Andorra 465 C 1 1
200 Andorra 466 C 1 1
201 Andorra 467 T 1 1
202 Andorra 468 A 1 1
203 Andorra 469 T 1 1
204 Andorra 470 G 1 1
205 Andorra 471 T 1 1
206 Andorra 472 G 1 1
207 Andorra 473 T 1 1
208 Andorra 474 T 1 1
209 Andorra 475 C 1 1
210 Andorra 476 A 1 1
211 Andorra 477 T 1 1
212 Andorra 478 C 1 1
213 Andorra 479 A 1 1
214 Andorra 480 A 1 1
215 Andorra 481 A 1 1
216 Andorra 482 C 1 1
217 Andorra 483 G 1 1
218 Andorra 484 T 1 1
219 Andorra 485 T 1 1
220 Andorra 486 C 1 1
221 Andorra 487 G 1 1
222 Andorra 488 G 1 1
223 Andorra 489 A 1 1
224 Andorra 490 T 1 1
225 Andorra 491 G 1 1
226 Andorra 492 C 1 1
227 Andorra 493 T 1 1
228 Andorra 494 C 1 1
229 Andorra 495 G 1 1
230 Andorra 496 A 1 1
231 Andorra 497 A 1 1
232 Andorra 498 C 1 1
233 Andorra 499 T 1 1
234 Andorra 500 G 1 1
235 Andorra 501 C 1 1
236 Andorra 502 A 1 1
237 Andorra 503 C 1 1
238 Andorra 504 C 1 1
239 Andorra 505 T 1 1
240 Andorra 506 C 1 1
241 Andorra 507 A 1 1
242 Andorra 508 T 1 1
243 Andorra 509 G 1 1
244 Andorra 510 G 1 1
245 Andorra 511 T 1 1
246 Andorra 512 C 1 1
247 Andorra 513 A 1 1
248 Andorra 514 T 1 1
249 Andorra 515 G 1 1
250 Andorra 516 T 1 1
251 Andorra 517 T 1 1
252 Andorra 518 A 1 1
253 Andorra 519 T 1 1
254 Andorra 520 G 1 1
255 Andorra 521 G 1 1
256 Andorra 522 T 1 1
257 Andorra 523 T 1 1
258 Andorra 524 G 1 1
259 Andorra 525 A 1 1
260 Andorra 526 G 1 1
261 Andorra 527 C 1 1
262 Andorra 528 T 1 1
263 Andorra 529 G 1 1
264 Andorra 530 G 1 1
265 Andorra 531 T 1 1
266 Andorra 532 A 1 1
267 Andorra 533 G 1 1
268 Andorra 534 C 1 1
269 Andorra 535 A 1 1
270 Andorra 536 G 1 1
271 Andorra 537 A 1 1
272 Andorra 538 A 1 1
273 Andorra 539 C 1 1
274 Andorra 540 T 1 1
275 Andorra 541 C 1 1
276 Andorra 542 G 1 1
277 Andorra 543 A 1 1
278 Andorra 544 A 1 1
279 Andorra 545 G 1 1
280 Andorra 546 G 1 1
281 Andorra 547 C 1 1
282 Andorra 548 A 1 1
283 Andorra 549 T 1 1
284 Andorra 550 T 1 1
285 Andorra 551 C 1 1
286 Andorra 552 A 1 1
287 Andorra 553 G 1 1
288 Andorra 554 T 1 1
289 Andorra 555 A 1 1
290 Andorra 556 C 1 1
291 Andorra 557 G 1 1
292 Andorra 558 G 1 1
293 Andorra 559 T 1 1
294 Andorra 560 C 1 1
295 Andorra 561 G 1 1
296 Andorra 562 T 1 1
297 Andorra 563 A 1 1
298 Andorra 564 G 1 1
299 Andorra 565 T 1 1
300 Andorra 566 G 1 1
301 Andorra 567 G 1 1
302 Andorra 568 T 1 1
303 Andorra 569 G 1 1
304 Andorra 570 A 1 1
305 Andorra 571 G 1 1
306 Andorra 572 A 1 1
307 Andorra 573 C 1 1
308 Andorra 574 A 1 1
309 Andorra 575 C 1 1
310 Andorra 576 T 1 1
311 Andorra 577 T 1 1
312 Andorra 578 G 1 1
313 Andorra 579 G 1 1
314 Andorra 580 T 1 1
315 Andorra 581 G 1 1
316 Andorra 582 T 1 1
317 Andorra 583 C 1 1
318 Andorra 584 C 1 1
319 Andorra 585 T 1 1
320 Andorra 586 T 1 1
321 Andorra 587 G 1 1
322 Andorra 588 T 1 1
323 Andorra 589 C 1 1
324 Andorra 590 C 1 1
325 Andorra 591 C 1 1
326 Andorra 592 T 1 1
327 Andorra 593 C 1 1
328 Andorra 594 A 1 1
329 Andorra 595 T 1 1
330 Andorra 596 G 1 1
331 Andorra 597 T 1 1
332 Andorra 598 G 1 1
333 Andorra 599 G 1 1
334 Andorra 600 G 1 1
335 Andorra 601 C 1 1
336 Andorra 602 G 1 1
337 Andorra 603 A 1 1
338 Andorra 604 A 1 1
339 Andorra 605 A 1 1
340 Andorra 606 T 1 1
341 Andorra 607 A 1 1
342 Andorra 608 C 1 1
343 Andorra 609 C 1 1
344 Andorra 610 A 1 1
345 Andorra 611 G 1 1
346 Andorra 612 T 1 1
347 Andorra 613 G 1 1
348 Andorra 614 G 1 1
349 Andorra 615 C 1 1
350 Andorra 616 T 1 1
351 Andorra 617 T 1 1
352 Andorra 618 A 1 1
353 Andorra 619 C 1 1
354 Andorra 620 C 1 1
355 Andorra 621 G 1 1
356 Andorra 622 C 1 1
357 Andorra 623 A 1 1
358 Andorra 624 A 1 1
359 Andorra 625 G 1 1
360 Andorra 626 G 1 1
361 Andorra 627 T 1 1
362 Andorra 628 T 1 1
363 Andorra 629 C 1 1
364 Andorra 630 T 1 1
365 Andorra 631 T 1 1
366 Andorra 632 C 1 1
367 Andorra 633 T 1 1
368 Andorra 634 T 1 1
369 Andorra 635 C 1 1
370 Andorra 636 G 1 1
371 Andorra 637 T 1 1
372 Andorra 638 A 1 1
373 Andorra 639 A 1 1
374 Andorra 640 G 1 1
375 Andorra 641 A 1 1
376 Andorra 642 A 1 1
377 Andorra 643 C 1 1
378 Andorra 644 G 1 1
379 Andorra 645 G 1 1
380 Andorra 646 T 1 1
381 Andorra 647 A 1 1
382 Andorra 648 A 1 1
383 Andorra 649 T 1 1
384 Andorra 650 A 1 1
385 Andorra 651 A 1 1
386 Andorra 652 A 1 1
387 Andorra 653 G 1 1
388 Andorra 654 G 1 1
389 Andorra 655 A 1 1
390 Andorra 656 G 1 1
391 Andorra 657 C 1 1
392 Andorra 658 T 1 1
393 Andorra 659 G 1 1
394 Andorra 660 G 1 1
395 Andorra 661 T 1 1
396 Andorra 662 G 1 1
397 Andorra 663 G 1 1
398 Andorra 664 C 1 1
399 Andorra 665 C 1 1
400 Andorra 666 A 1 1
401 Andorra 667 T 1 1
402 Andorra 668 A 1 1
403 Andorra 669 G 1 1
404 Andorra 670 T 1 1
405 Andorra 671 T 1 1
406 Andorra 672 A 1 1
407 Andorra 673 C 1 1
408 Andorra 674 G 1 1
409 Andorra 675 G 1 1
410 Andorra 676 C 1 1
411 Andorra 677 G 1 1
412 Andorra 678 C 1 1
413 Andorra 679 C 1 1
414 Andorra 680 G 1 1
415 Andorra 681 A 1 1
416 Andorra 682 T 1 1
417 Andorra 683 C 1 1
418 Andorra 684 T 1 1
419 Andorra 685 A 1 1
420 Andorra 686 A 1 1
421 Andorra 687 A 1 1
422 Andorra 688 G 1 1
423 Andorra 689 T 1 1
424 Andorra 690 C 1 1
425 Andorra 691 A 1 1
426 Andorra 692 T 1 1
427 Andorra 693 T 1 1
428 Andorra 694 T 1 1
429 Andorra 695 G 1 1
430 Andorra 696 A 1 1
431 Andorra 697 C 1 1
432 Andorra 698 T 1 1
433 Andorra 699 T 1 1
434 Andorra 700 A 1 1
435 Andorra 701 G 1 1
436 Andorra 702 G 1 1
437 Andorra 703 C 1 1
438 Andorra 704 G 1 1
439 Andorra 705 A 1 1
440 Andorra 706 C 1 1
441 Andorra 707 G 1 1
442 Andorra 708 A 1 1
443 Andorra 709 G 1 1
444 Andorra 710 C 1 1
445 Andorra 711 T 1 1
446 Andorra 712 T 1 1
447 Andorra 713 G 1 1
448 Andorra 714 G 1 1
449 Andorra 715 C 1 1
450 Andorra 716 A 1 1
451 Andorra 717 C 1 1
452 Andorra 718 T 1 1
453 Andorra 719 G 1 1
454 Andorra 720 A 1 1
455 Andorra 721 T 1 1
456 Andorra 722 C 1 1
457 Andorra 723 C 1 1
458 Andorra 724 T 1 1
459 Andorra 725 T 1 1
460 Andorra 726 A 1 1
461 Andorra 727 T 1 1
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463 Andorra 729 A 1 1
464 Andorra 730 A 1 1
465 Andorra 731 G 1 1
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