National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.

Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
-   540                                        
?                                            
A   21                                        
C   3                                        
D   27                                        
E   54                                        
F   15                                        
G   66           1                            
H   21                                        
I   9                                        
K   27                                        
L   63                                        
M   9                                        
N   18                                        
P   24                                        
Q   21                                        
R   30                                        
S   30                                        
T   21                                        
V   63                                        
W   3                                        
Y   15                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide

Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Algeria 266 A 18 18
1 Algeria 267 T 18 18
2 Algeria 268 G 18 18
3 Algeria 269 G 18 18
4 Algeria 270 A 18 18
5 Algeria 271 G 18 18
6 Algeria 272 A 18 18
7 Algeria 273 G 18 18
8 Algeria 274 C 18 18
9 Algeria 275 C 18 18
10 Algeria 276 T 18 18
11 Algeria 277 T 18 18
12 Algeria 278 G 18 18
13 Algeria 279 T 18 18
14 Algeria 280 C 18 18
15 Algeria 281 C 18 18
16 Algeria 282 C 18 18
17 Algeria 283 T 18 18
18 Algeria 284 G 18 18
19 Algeria 285 G 18 18
20 Algeria 286 T 18 18
21 Algeria 287 T 18 18
22 Algeria 288 T 18 18
23 Algeria 289 C 18 18
24 Algeria 290 A 18 18
25 Algeria 291 A 18 18
26 Algeria 292 C 18 18
27 Algeria 293 G 18 18
28 Algeria 294 A 18 18
29 Algeria 295 G 18 18
30 Algeria 296 A 18 18
31 Algeria 297 A 18 18
32 Algeria 298 A 18 18
33 Algeria 299 A 18 18
34 Algeria 300 C 18 18
35 Algeria 301 A 18 18
36 Algeria 302 C 18 18
37 Algeria 303 A 18 18
38 Algeria 304 C 18 18
39 Algeria 305 G 18 18
40 Algeria 306 T 18 18
41 Algeria 307 C 18 18
42 Algeria 308 C 18 18
43 Algeria 309 A 18 18
44 Algeria 310 A 18 18
45 Algeria 311 C 18 18
46 Algeria 312 T 18 18
47 Algeria 313 C 18 18
48 Algeria 314 A 18 18
49 Algeria 315 G 18 18
50 Algeria 316 T 18 18
51 Algeria 317 T 18 18
52 Algeria 318 T 18 18
53 Algeria 319 G 18 18
54 Algeria 320 C 18 18
55 Algeria 321 C 18 18
56 Algeria 322 T 18 18
57 Algeria 323 G 18 18
58 Algeria 324 T 18 18
59 Algeria 325 T 18 18
60 Algeria 326 T 18 18
61 Algeria 327 T 18 18
62 Algeria 328 A 18 18
63 Algeria 329 C 18 18
64 Algeria 330 A 18 18
65 Algeria 331 G 18 18
66 Algeria 332 G 18 18
67 Algeria 333 T 18 18
68 Algeria 334 T 18 18
69 Algeria 335 C 18 18
70 Algeria 336 G 18 18
71 Algeria 337 C 18 18
72 Algeria 338 G 18 18
73 Algeria 339 A 18 18
74 Algeria 340 C 18 18
75 Algeria 341 G 18 18
76 Algeria 342 T 18 18
77 Algeria 343 G 18 18
78 Algeria 344 C 18 18
79 Algeria 345 T 18 18
80 Algeria 346 C 18 18
81 Algeria 347 G 18 18
82 Algeria 348 T 18 18
83 Algeria 349 A 18 18
84 Algeria 350 C 18 18
85 Algeria 351 G 18 18
86 Algeria 352 T 18 18
87 Algeria 353 G 18 18
88 Algeria 354 G 18 18
89 Algeria 355 C 18 18
90 Algeria 356 T 18 18
91 Algeria 357 T 18 18
92 Algeria 358 T 18 18
93 Algeria 359 G 18 18
94 Algeria 360 G 18 18
95 Algeria 361 A 18 18
96 Algeria 362 G 18 18
97 Algeria 363 A 18 18
98 Algeria 364 C 18 18
99 Algeria 365 T 18 18
100 Algeria 366 C 18 18
101 Algeria 367 C 18 18
102 Algeria 368 G 18 18
103 Algeria 369 T 18 18
104 Algeria 370 G 18 18
105 Algeria 371 G 18 18
106 Algeria 372 A 18 18
107 Algeria 373 G 18 18
108 Algeria 374 G 18 18
109 Algeria 375 A 18 18
110 Algeria 376 G 18 18
111 Algeria 377 G 18 18
112 Algeria 378 T 18 18
113 Algeria 379 C 18 18
114 Algeria 380 T 18 18
115 Algeria 381 T 18 18
116 Algeria 382 A 18 18
117 Algeria 383 T 18 18
118 Algeria 384 C 18 18
119 Algeria 385 A 18 18
120 Algeria 386 G 18 18
121 Algeria 387 A 18 18
122 Algeria 388 G 18 18
123 Algeria 389 G 18 18
124 Algeria 390 C 18 18
125 Algeria 391 A 18 18
126 Algeria 392 C 18 18
127 Algeria 393 G 18 18
128 Algeria 394 T 18 18
129 Algeria 395 C 18 18
130 Algeria 396 A 18 18
131 Algeria 397 A 18 18
132 Algeria 398 C 18 18
133 Algeria 399 A 18 18
134 Algeria 400 T 18 18
135 Algeria 401 C 18 18
136 Algeria 402 T 18 18
137 Algeria 403 T 18 18
138 Algeria 404 A 18 18
139 Algeria 405 A 18 18
140 Algeria 406 A 18 18
141 Algeria 407 G 18 18
142 Algeria 408 A 18 18
143 Algeria 409 T 18 18
144 Algeria 410 G 18 18
145 Algeria 411 G 18 18
146 Algeria 412 C 18 18
147 Algeria 413 A 18 18
148 Algeria 414 C 18 18
149 Algeria 415 T 18 18
150 Algeria 416 T 18 18
151 Algeria 417 G 18 18
152 Algeria 418 T 18 18
153 Algeria 419 G 18 18
154 Algeria 420 G 18 18
155 Algeria 421 C 18 18
156 Algeria 422 T 18 18
157 Algeria 423 T 18 18
158 Algeria 424 A 18 18
159 Algeria 425 G 18 18
160 Algeria 426 T 18 18
161 Algeria 427 A 18 18
162 Algeria 428 G 18 18
163 Algeria 429 A 18 18
164 Algeria 430 A 18 18
165 Algeria 431 G 18 18
166 Algeria 432 T 18 18
167 Algeria 433 T 18 18
168 Algeria 434 G 18 18
169 Algeria 435 A 18 18
170 Algeria 436 A 18 18
171 Algeria 437 A 18 18
172 Algeria 438 A 18 18
173 Algeria 439 A 18 18
174 Algeria 440 G 18 18
175 Algeria 441 G 18 18
176 Algeria 442 C 18 18
177 Algeria 443 G 18 18
178 Algeria 444 T 18 18
179 Algeria 445 T 18 18
180 Algeria 446 T 18 18
181 Algeria 447 T 18 18
182 Algeria 448 G 18 18
183 Algeria 449 C 18 18
184 Algeria 450 C 18 18
185 Algeria 451 T 18 18
186 Algeria 452 C 18 18
187 Algeria 453 A 18 18
188 Algeria 454 A 18 18
189 Algeria 455 C 18 18
190 Algeria 456 T 18 18
191 Algeria 457 T 18 18
192 Algeria 458 G 18 18
193 Algeria 459 A 18 18
194 Algeria 460 A 18 18
195 Algeria 461 C 18 18
196 Algeria 462 A 18 18
197 Algeria 463 G 18 18
198 Algeria 464 C 18 18
199 Algeria 465 C 18 18
200 Algeria 466 C 18 18
201 Algeria 467 T 18 18
202 Algeria 468 A 18 18
203 Algeria 469 T 18 18
204 Algeria 470 G 18 18
205 Algeria 471 T 18 18
206 Algeria 472 G 18 18
207 Algeria 473 T 18 18
208 Algeria 474 T 18 18
209 Algeria 475 C 18 18
210 Algeria 476 A 18 18
211 Algeria 477 T 18 18
212 Algeria 478 C 18 18
213 Algeria 479 A 18 18
214 Algeria 480 A 18 18
215 Algeria 481 A 18 18
216 Algeria 482 C 18 18
217 Algeria 483 G 18 18
218 Algeria 484 T 18 18
219 Algeria 485 T 18 18
220 Algeria 486 C 18 18
221 Algeria 487 G 18 18
222 Algeria 488 G 18 18
223 Algeria 489 A 18 18
224 Algeria 490 T 18 18
225 Algeria 491 G 18 18
226 Algeria 492 C 18 18
227 Algeria 493 T 18 18
228 Algeria 494 C 18 18
229 Algeria 495 G 18 18
230 Algeria 496 A 18 18
231 Algeria 497 A 18 18
232 Algeria 498 C 18 18
233 Algeria 499 T 18 18
234 Algeria 500 G 18 18
235 Algeria 501 C 18 18
236 Algeria 502 A 18 18
237 Algeria 503 C 18 18
238 Algeria 504 C 18 18
239 Algeria 505 T 18 18
240 Algeria 506 C 18 18
241 Algeria 507 A 18 18
242 Algeria 508 T 18 18
243 Algeria 509 G 18 18
244 Algeria 510 G 18 18
245 Algeria 511 T 18 18
246 Algeria 512 C 18 18
247 Algeria 513 A 18 18
248 Algeria 514 T 18 18
249 Algeria 515 G 18 18
250 Algeria 516 T 18 18
251 Algeria 517 T 18 18
252 Algeria 518 A 18 18
253 Algeria 519 T 18 18
254 Algeria 520 G 18 18
255 Algeria 521 G 18 18
256 Algeria 522 T 18 18
257 Algeria 523 T 18 18
258 Algeria 524 G 18 18
259 Algeria 525 A 18 18
260 Algeria 526 G 18 18
261 Algeria 527 C 18 18
262 Algeria 528 T 18 18
263 Algeria 529 G 18 18
264 Algeria 530 G 18 18
265 Algeria 531 T 18 18
266 Algeria 532 A 18 18
267 Algeria 533 G 18 18
268 Algeria 534 C 18 18
269 Algeria 535 A 18 18
270 Algeria 536 G 18 18
271 Algeria 537 A 18 18
272 Algeria 538 A 18 18
273 Algeria 539 C 18 18
274 Algeria 540 T 18 18
275 Algeria 541 C 18 18
276 Algeria 542 G 18 18
277 Algeria 543 A 18 18
278 Algeria 544 A 18 18
279 Algeria 545 G 18 18
280 Algeria 546 G 18 18
281 Algeria 547 C 18 18
282 Algeria 548 A 18 18
283 Algeria 549 T 18 18
284 Algeria 550 T 18 18
285 Algeria 551 C 18 18
286 Algeria 552 A 18 18
287 Algeria 553 G 18 18
288 Algeria 554 T 18 18
289 Algeria 555 A 18 18
290 Algeria 556 C 18 18
291 Algeria 557 G 18 18
292 Algeria 558 G 18 18
293 Algeria 559 T 18 18
294 Algeria 560 C 18 18
295 Algeria 561 G 18 18
296 Algeria 562 T 18 18
297 Algeria 563 A 18 18
298 Algeria 564 G 18 18
299 Algeria 565 T 18 18
300 Algeria 566 G 18 18
301 Algeria 567 G 18 18
302 Algeria 568 T 18 18
303 Algeria 569 G 18 18
304 Algeria 570 A 18 18
305 Algeria 571 G 18 18
306 Algeria 572 A 18 18
307 Algeria 573 C 18 18
308 Algeria 574 A 18 18
309 Algeria 575 C 18 18
310 Algeria 576 T 18 18
311 Algeria 577 T 18 18
312 Algeria 578 G 18 18
313 Algeria 579 G 18 18
314 Algeria 580 T 18 18
315 Algeria 581 G 18 18
316 Algeria 582 T 18 18
317 Algeria 583 C 18 18
318 Algeria 584 C 18 18
319 Algeria 585 T 18 18
320 Algeria 586 T 18 18
321 Algeria 587 G 18 18
322 Algeria 588 T 18 18
323 Algeria 589 C 18 18
324 Algeria 590 C 18 18
325 Algeria 591 C 18 18
326 Algeria 592 T 18 18
327 Algeria 593 C 18 18
328 Algeria 594 A 18 18
329 Algeria 595 T 18 18
330 Algeria 596 G 18 18
331 Algeria 597 T 18 18
332 Algeria 598 G 18 18
333 Algeria 599 G 18 18
334 Algeria 600 G 18 18
335 Algeria 601 C T 18 17 Gly112Gly
336 Algeria 602 G 18 18
337 Algeria 603 A 18 18
338 Algeria 604 A 18 18
339 Algeria 605 A 18 18
340 Algeria 606 T 18 18
341 Algeria 607 A 18 18
342 Algeria 608 C 18 18
343 Algeria 609 C 18 18
344 Algeria 610 A 18 18
345 Algeria 611 G 18 18
346 Algeria 612 T 18 18
347 Algeria 613 G 18 18
348 Algeria 614 G 18 18
349 Algeria 615 C 18 18
350 Algeria 616 T 18 18
351 Algeria 617 T 18 18
352 Algeria 618 A 18 18
353 Algeria 619 C 18 18
354 Algeria 620 C 18 18
355 Algeria 621 G 18 18
356 Algeria 622 C 18 18
357 Algeria 623 A 18 18
358 Algeria 624 A 18 18
359 Algeria 625 G 18 18
360 Algeria 626 G 18 18
361 Algeria 627 T 18 18
362 Algeria 628 T 18 18
363 Algeria 629 C 18 18
364 Algeria 630 T 18 18
365 Algeria 631 T 18 18
366 Algeria 632 C 18 18
367 Algeria 633 T 18 18
368 Algeria 634 T 18 18
369 Algeria 635 C 18 18
370 Algeria 636 G 18 18
371 Algeria 637 T 18 18
372 Algeria 638 A 18 18
373 Algeria 639 A 18 18
374 Algeria 640 G 18 18
375 Algeria 641 A 18 18
376 Algeria 642 A 18 18
377 Algeria 643 C 18 18
378 Algeria 644 G 18 18
379 Algeria 645 G 18 18
380 Algeria 646 T 18 18
381 Algeria 647 A 18 18
382 Algeria 648 A 18 18
383 Algeria 649 T 18 18
384 Algeria 650 A 18 18
385 Algeria 651 A 18 18
386 Algeria 652 A 18 18
387 Algeria 653 G 18 18
388 Algeria 654 G 18 18
389 Algeria 655 A 18 18
390 Algeria 656 G 18 18
391 Algeria 657 C 18 18
392 Algeria 658 T 18 18
393 Algeria 659 G 18 18
394 Algeria 660 G 18 18
395 Algeria 661 T 18 18
396 Algeria 662 G 18 18
397 Algeria 663 G 18 18
398 Algeria 664 C 18 18
399 Algeria 665 C 18 18
400 Algeria 666 A 18 18
401 Algeria 667 T 18 18
402 Algeria 668 A 18 18
403 Algeria 669 G 18 18
404 Algeria 670 T 18 18
405 Algeria 671 T 18 18
406 Algeria 672 A 18 18
407 Algeria 673 C 18 18
408 Algeria 674 G 18 18
409 Algeria 675 G 18 18
410 Algeria 676 C 18 18
411 Algeria 677 G 18 18
412 Algeria 678 C 18 18
413 Algeria 679 C 18 18
414 Algeria 680 G 18 18
415 Algeria 681 A 18 18
416 Algeria 682 T 18 18
417 Algeria 683 C 18 18
418 Algeria 684 T 18 18
419 Algeria 685 A 18 18
420 Algeria 686 A 18 18
421 Algeria 687 A 18 18
422 Algeria 688 G 18 18
423 Algeria 689 T 18 18
424 Algeria 690 C 18 18
425 Algeria 691 A 18 18
426 Algeria 692 T 18 18
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