National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     2                                        
-     669                                        
?                                              
A     57                                        
C     12                                        
D     18                                        
E     21                                        
F     33                                        
G     42                                        
H     15                                        
I     60                                        
K     21                                        
L     106                                        
M     12                                        
N     33                                        
P     15                                        
Q     12                                        
R     42                                        
S     45                                        
T     39                                        
V     36                                        
W     21                                        
Y     27                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 26523 A 5 5
1 Brunei 26524 T 5 5
2 Brunei 26525 G 5 5
3 Brunei 26526 G 5 5
4 Brunei 26527 C 5 5
5 Brunei 26528 A 5 5
6 Brunei 26529 G 5 5
7 Brunei 26530 A 5 5
8 Brunei 26531 T 5 5
9 Brunei 26532 T 5 5
10 Brunei 26533 C 5 5
11 Brunei 26534 C 5 5
12 Brunei 26535 A 5 5
13 Brunei 26536 A 5 5
14 Brunei 26537 C 5 5
15 Brunei 26538 G 5 5
16 Brunei 26539 G 5 5
17 Brunei 26540 T 5 5
18 Brunei 26541 A 5 5
19 Brunei 26542 C 5 5
20 Brunei 26543 T 5 5
21 Brunei 26544 A 5 5
22 Brunei 26545 T 5 5
23 Brunei 26546 T 5 5
24 Brunei 26547 A 5 5
25 Brunei 26548 C 5 5
26 Brunei 26549 C 5 5
27 Brunei 26550 G 5 5
28 Brunei 26551 T 5 5
29 Brunei 26552 T 5 5
30 Brunei 26553 G 5 5
31 Brunei 26554 A 5 5
32 Brunei 26555 A 5 5
33 Brunei 26556 G 5 5
34 Brunei 26557 A 5 5
35 Brunei 26558 G 5 5
36 Brunei 26559 C 5 5
37 Brunei 26560 T 5 5
38 Brunei 26561 T 5 5
39 Brunei 26562 A 5 5
40 Brunei 26563 A 5 5
41 Brunei 26564 A 5 5
42 Brunei 26565 A 5 5
43 Brunei 26566 A 5 5
44 Brunei 26567 G 5 5
45 Brunei 26568 C 5 5
46 Brunei 26569 T 5 5
47 Brunei 26570 C 5 5
48 Brunei 26571 C 5 5
49 Brunei 26572 T 5 5
50 Brunei 26573 T 5 5
51 Brunei 26574 G 5 5
52 Brunei 26575 A 5 5
53 Brunei 26576 A 5 5
54 Brunei 26577 C 5 5
55 Brunei 26578 A 5 5
56 Brunei 26579 A 5 5
57 Brunei 26580 T 5 5
58 Brunei 26581 G 5 5
59 Brunei 26582 G 5 5
60 Brunei 26583 A 5 5
61 Brunei 26584 A 5 5
62 Brunei 26585 C 5 5
63 Brunei 26586 C 5 5
64 Brunei 26587 T 5 5
65 Brunei 26588 A 5 5
66 Brunei 26589 G 5 5
67 Brunei 26590 T 5 5
68 Brunei 26591 A 5 5
69 Brunei 26592 A 5 5
70 Brunei 26593 T 5 5
71 Brunei 26594 A 5 5
72 Brunei 26595 G 5 5
73 Brunei 26596 G 5 5
74 Brunei 26597 T 5 5
75 Brunei 26598 T 5 5
76 Brunei 26599 T 5 5
77 Brunei 26600 C 5 5
78 Brunei 26601 C 5 5
79 Brunei 26602 T 5 5
80 Brunei 26603 A 5 5
81 Brunei 26604 T 5 5
82 Brunei 26605 T 5 5
83 Brunei 26606 C 5 5
84 Brunei 26607 C 5 5
85 Brunei 26608 T 5 5
86 Brunei 26609 T 5 5
87 Brunei 26610 A 5 5
88 Brunei 26611 C 5 5
89 Brunei 26612 A 5 5
90 Brunei 26613 T 5 5
91 Brunei 26614 G 5 5
92 Brunei 26615 G 5 5
93 Brunei 26616 A 5 5
94 Brunei 26617 T 5 5
95 Brunei 26618 T 5 5
96 Brunei 26619 T 5 5
97 Brunei 26620 G 5 5
98 Brunei 26621 T 5 5
99 Brunei 26622 C 5 5
100 Brunei 26623 T 5 5
101 Brunei 26624 T 5 5
102 Brunei 26625 C 5 5
103 Brunei 26626 T 5 5
104 Brunei 26627 A 5 5
105 Brunei 26628 C 5 5
106 Brunei 26629 A 5 5
107 Brunei 26630 A 5 5
108 Brunei 26631 T 5 5
109 Brunei 26632 T 5 5
110 Brunei 26633 T 5 5
111 Brunei 26634 G 5 5
112 Brunei 26635 C 5 5
113 Brunei 26636 C 5 5
114 Brunei 26637 T 5 5
115 Brunei 26638 A 5 5
116 Brunei 26639 T 5 5
117 Brunei 26640 G 5 5
118 Brunei 26641 C 5 5
119 Brunei 26642 C 5 5
120 Brunei 26643 A 5 5
121 Brunei 26644 A 5 5
122 Brunei 26645 C 5 5
123 Brunei 26646 A 5 5
124 Brunei 26647 G 5 5
125 Brunei 26648 G 5 5
126 Brunei 26649 A 5 5
127 Brunei 26650 A 5 5
128 Brunei 26651 T 5 5
129 Brunei 26652 A 5 5
130 Brunei 26653 G 5 5
131 Brunei 26654 G 5 5
132 Brunei 26655 T 5 5
133 Brunei 26656 T 5 5
134 Brunei 26657 T 5 5
135 Brunei 26658 T 5 5
136 Brunei 26659 T 5 5
137 Brunei 26660 G 5 5
138 Brunei 26661 T 5 5
139 Brunei 26662 A 5 5
140 Brunei 26663 T 5 5
141 Brunei 26664 A 5 5
142 Brunei 26665 T 5 5
143 Brunei 26666 A 5 5
144 Brunei 26667 A 5 5
145 Brunei 26668 T 5 5
146 Brunei 26669 T 5 5
147 Brunei 26670 A 5 5
148 Brunei 26671 A 5 5
149 Brunei 26672 G 5 5
150 Brunei 26673 T 5 5
151 Brunei 26674 T 5 5
152 Brunei 26675 A 5 5
153 Brunei 26676 A 5 5
154 Brunei 26677 T 5 5
155 Brunei 26678 T 5 5
156 Brunei 26679 T 5 5
157 Brunei 26680 T 5 5
158 Brunei 26681 C 5 5
159 Brunei 26682 C 5 5
160 Brunei 26683 T 5 5
161 Brunei 26684 C 5 5
162 Brunei 26685 T 5 5
163 Brunei 26686 G 5 5
164 Brunei 26687 G 5 5
165 Brunei 26688 C 5 5
166 Brunei 26689 T 5 5
167 Brunei 26690 G 5 5
168 Brunei 26691 T 5 5
169 Brunei 26692 T 5 5
170 Brunei 26693 A 5 5
171 Brunei 26694 T 5 5
172 Brunei 26695 G 5 5
173 Brunei 26696 G 5 5
174 Brunei 26697 C 5 5
175 Brunei 26698 C 5 5
176 Brunei 26699 A 5 5
177 Brunei 26700 G 5 5
178 Brunei 26701 T 5 5
179 Brunei 26702 A 5 5
180 Brunei 26703 A 5 5
181 Brunei 26704 C 5 5
182 Brunei 26705 T 5 5
183 Brunei 26706 T 5 5
184 Brunei 26707 T 5 5
185 Brunei 26708 A 5 5
186 Brunei 26709 G 5 5
187 Brunei 26710 C 5 5
188 Brunei 26711 T 5 5
189 Brunei 26712 T 5 5
190 Brunei 26713 G 5 5
191 Brunei 26714 T 5 5
192 Brunei 26715 T 5 5
193 Brunei 26716 T 5 5
194 Brunei 26717 T 5 5
195 Brunei 26718 G 5 5
196 Brunei 26719 T 5 5
197 Brunei 26720 G 5 5
198 Brunei 26721 C 5 5
199 Brunei 26722 T 5 5
200 Brunei 26723 T 5 5
201 Brunei 26724 G 5 5
202 Brunei 26725 C 5 5
203 Brunei 26726 T 5 5
204 Brunei 26727 G 5 5
205 Brunei 26728 C 5 5
206 Brunei 26729 T 5 5
207 Brunei 26730 G 5 5
208 Brunei 26731 T 5 5
209 Brunei 26732 T 5 5
210 Brunei 26733 T 5 5
211 Brunei 26734 A 5 5
212 Brunei 26735 C 5 5
213 Brunei 26736 A 5 5
214 Brunei 26737 G 5 5
215 Brunei 26738 A 5 5
216 Brunei 26739 A 5 5
217 Brunei 26740 T 5 5
218 Brunei 26741 A 5 5
219 Brunei 26742 A 5 5
220 Brunei 26743 A 5 5
221 Brunei 26744 T 5 5
222 Brunei 26745 T 5 5
223 Brunei 26746 G 5 5
224 Brunei 26747 G 5 5
225 Brunei 26748 A 5 5
226 Brunei 26749 T 5 5
227 Brunei 26750 C 5 5
228 Brunei 26751 A 5 5
229 Brunei 26752 C 5 5
230 Brunei 26753 C 5 5
231 Brunei 26754 G 5 5
232 Brunei 26755 G 5 5
233 Brunei 26756 T 5 5
234 Brunei 26757 G 5 5
235 Brunei 26758 G 5 5
236 Brunei 26759 A 5 5
237 Brunei 26760 A 5 5
238 Brunei 26761 T 5 5
239 Brunei 26762 T 5 5
240 Brunei 26763 G 5 5
241 Brunei 26764 C 5 5
242 Brunei 26765 T 5 5
243 Brunei 26766 A 5 5
244 Brunei 26767 T 5 5
245 Brunei 26768 C 5 5
246 Brunei 26769 G 5 5
247 Brunei 26770 C 5 5
248 Brunei 26771 A 5 5
249 Brunei 26772 A 5 5
250 Brunei 26773 T 5 5
251 Brunei 26774 G 5 5
252 Brunei 26775 G 5 5
253 Brunei 26776 C 5 5
254 Brunei 26777 T 5 5
255 Brunei 26778 T 5 5
256 Brunei 26779 G 5 5
257 Brunei 26780 T 5 5
258 Brunei 26781 C 5 5
259 Brunei 26782 T 5 5
260 Brunei 26783 T 5 5
261 Brunei 26784 G 5 5
262 Brunei 26785 T 5 5
263 Brunei 26786 A 5 5
264 Brunei 26787 G 5 5
265 Brunei 26788 G 5 5
266 Brunei 26789 C 5 5
267 Brunei 26790 T 5 5
268 Brunei 26791 T 5 5
269 Brunei 26792 G 5 5
270 Brunei 26793 A 5 5
271 Brunei 26794 T 5 5
272 Brunei 26795 G 5 5
273 Brunei 26796 T 5 5
274 Brunei 26797 G 5 5
275 Brunei 26798 G 5 5
276 Brunei 26799 C 5 5
277 Brunei 26800 T 5 5
278 Brunei 26801 C 5 5
279 Brunei 26802 A 5 5
280 Brunei 26803 G 5 5
281 Brunei 26804 C 5 5
282 Brunei 26805 T 5 5
283 Brunei 26806 A 5 5
284 Brunei 26807 C 5 5
285 Brunei 26808 T 5 5
286 Brunei 26809 T 5 5
287 Brunei 26810 C 5 5
288 Brunei 26811 A 5 5
289 Brunei 26812 T 5 5
290 Brunei 26813 T 5 5
291 Brunei 26814 G 5 5
292 Brunei 26815 C 5 5
293 Brunei 26816 T 5 5
294 Brunei 26817 T 5 5
295 Brunei 26818 C 5 5
296 Brunei 26819 T 5 5
297 Brunei 26820 T 5 5
298 Brunei 26821 T 5 5
299 Brunei 26822 C 5 5
300 Brunei 26823 A 5 5
301 Brunei 26824 G 5 5
302 Brunei 26825 A 5 5
303 Brunei 26826 C 5 5
304 Brunei 26827 T 5 5
305 Brunei 26828 G 5 5
306 Brunei 26829 T 5 5
307 Brunei 26830 T 5 5
308 Brunei 26831 T 5 5
309 Brunei 26832 G 5 5
310 Brunei 26833 C 5 5
311 Brunei 26834 G 5 5
312 Brunei 26835 C 5 5
313 Brunei 26836 G 5 5
314 Brunei 26837 T 5 5
315 Brunei 26838 A 5 5
316 Brunei 26839 C 5 5
317 Brunei 26840 G 5 5
318 Brunei 26841 C 5 5
319 Brunei 26842 G 5 5
320 Brunei 26843 T 5 5
321 Brunei 26844 T 5 5
322 Brunei 26845 C 5 5
323 Brunei 26846 C 5 5
324 Brunei 26847 A 5 5
325 Brunei 26848 T 5 5
326 Brunei 26849 G 5 5
327 Brunei 26850 T 5 5
328 Brunei 26851 G 5 5
329 Brunei 26852 G 5 5
330 Brunei 26853 T 5 5
331 Brunei 26854 C 5 5
332 Brunei 26855 A 5 5
333 Brunei 26856 T 5 5
334 Brunei 26857 T 5 5
335 Brunei 26858 C 5 5
336 Brunei 26859 A 5 5
337 Brunei 26860 A 5 5
338 Brunei 26861 T 5 5
339 Brunei 26862 C 5 5
340 Brunei 26863 C 5 5
341 Brunei 26864 A 5 5
342 Brunei 26865 G 5 5
343 Brunei 26866 A 5 5
344 Brunei 26867 A 5 5
345 Brunei 26868 A 5 5
346 Brunei 26869 C 5 5
347 Brunei 26870 T 5 5
348 Brunei 26871 A 5 5
349 Brunei 26872 A 5 5
350 Brunei 26873 C 5 5
351 Brunei 26874 A 5 5
352 Brunei 26875 T 5 5
353 Brunei 26876 T 5 5
354 Brunei 26877 C 5 5
355 Brunei 26878 T 5 5
356 Brunei 26879 T 5 5
357 Brunei 26880 C 5 5
358 Brunei 26881 T 5 5
359 Brunei 26882 C 5 5
360 Brunei 26883 A 5 5
361 Brunei 26884 A 5 5
362 Brunei 26885 C 5 5
363 Brunei 26886 G 5 5
364 Brunei 26887 T 5 5
365 Brunei 26888 G 5 5
366 Brunei 26889 C 5 5
367 Brunei 26890 C 5 5
368 Brunei 26891 A 5 5
369 Brunei 26892 C 5 5
370 Brunei 26893 T 5 5
371 Brunei 26894 C 5 5
372 Brunei 26895 C 5 5
373 Brunei 26896 A 5 5
374 Brunei 26897 T 5 5
375 Brunei 26898 G 5 5
376 Brunei 26899 G 5 5
377 Brunei 26900 C 5 5
378 Brunei 26901 A 5 5
379 Brunei 26902 C 5 5
380 Brunei 26903 T 5 5
381 Brunei 26904 A 5 5
382 Brunei 26905 T 5 5
383 Brunei 26906 T 5 5
384 Brunei 26907 C 5 5
385 Brunei 26908 T 5 5
386 Brunei 26909 G 5 5
387 Brunei 26910 A 5 5
388 Brunei 26911 C 5 5
389 Brunei 26912 C 5 5
390 Brunei 26913 A 5 5
391 Brunei 26914 G 5 5
392 Brunei 26915 A 5 5
393 Brunei 26916 C 5 5
394 Brunei 26917 C 5 5
395 Brunei 26918 G 5 5
396 Brunei 26919 C 5 5
397 Brunei 26920 T 5 5
398 Brunei 26921 T 5 5
399 Brunei 26922 C 5 5
400 Brunei 26923 T 5 5
401 Brunei 26924 A 5 5
402 Brunei 26925 G 5 5
403 Brunei 26926 A 5 5
404 Brunei 26927 A 5 5
405 Brunei 26928 A 5 5
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