National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     2                                        
-     669                                        
?                                              
A     57                                        
C     12                                        
D     18                                        
E     21                                        
F     33                                        
G     42                                        
H     15                                        
I     60                                        
K     21                                        
L     106                                        
M     12                                        
N     33                                        
P     15                                        
Q     12                                        
R     42                                        
S     45                                        
T     39                                        
V     36                                        
W     21                                        
Y     27                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 26523 A 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 26524 T 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 26525 G 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 26526 G 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 26527 C 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 26528 A 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 26529 G 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 26530 A 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 26531 T 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 26532 T 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 26533 C 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 26534 C 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 26535 A 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 26536 A 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 26537 C 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 26538 G 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 26539 G 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 26540 T 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 26541 A 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 26542 C 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 26543 T 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 26544 A 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 26545 T 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 26546 T 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 26547 A 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 26548 C 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 26549 C 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 26550 G 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 26551 T 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 26552 T 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 26553 G 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 26554 A 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 26555 A 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 26556 G 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 26557 A 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 26558 G 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 26559 C 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 26560 T 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 26561 T 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 26562 A 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 26563 A 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 26564 A 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 26565 A 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 26566 A 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 26567 G 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 26568 C 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 26569 T 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 26570 C 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 26571 C 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 26572 T 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 26573 T 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 26574 G 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 26575 A 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 26576 A 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 26577 C 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 26578 A 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 26579 A 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 26580 T 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 26581 G 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 26582 G 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 26583 A 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 26584 A 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 26585 C 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 26586 C 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 26587 T 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 26588 A 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 26589 G 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 26590 T 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 26591 A 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 26592 A 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 26593 T 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 26594 A 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 26595 G 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 26596 G 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 26597 T 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 26598 T 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 26599 T 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 26600 C 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 26601 C 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 26602 T 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 26603 A 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 26604 T 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 26605 T 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 26606 C 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 26607 C 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 26608 T 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 26609 T 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 26610 A 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 26611 C 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 26612 A 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 26613 T 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 26614 G 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 26615 G 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 26616 A 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 26617 T 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 26618 T 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 26619 T 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 26620 G 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 26621 T 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 26622 C 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 26623 T 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 26624 T 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 26625 C 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 26626 T 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 26627 A 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 26628 C 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 26629 A 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 26630 A 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 26631 T 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 26632 T 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 26633 T 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 26634 G 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 26635 C 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 26636 C 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 26637 T 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 26638 A 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 26639 T 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 26640 G 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 26641 C 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 26642 C 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 26643 A 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 26644 A 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 26645 C 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 26646 A 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 26647 G 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 26648 G 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 26649 A 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 26650 A 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 26651 T 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 26652 A 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 26653 G 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 26654 G 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 26655 T 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 26656 T 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 26657 T 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 26658 T 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 26659 T 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 26660 G 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 26661 T 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 26662 A 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 26663 T 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 26664 A 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 26665 T 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 26666 A 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 26667 A 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 26668 T 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 26669 T 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 26670 A 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 26671 A 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 26672 G 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 26673 T 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 26674 T 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 26675 A 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 26676 A 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 26677 T 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 26678 T 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 26679 T 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 26680 T 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 26681 C 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 26682 C 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 26683 T 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 26684 C 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 26685 T 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 26686 G 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 26687 G 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 26688 C 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 26689 T 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 26690 G 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 26691 T 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 26692 T 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 26693 A 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 26694 T 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 26695 G 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 26696 G 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 26697 C 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 26698 C 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 26699 A 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 26700 G 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 26701 T 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 26702 A 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 26703 A 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 26704 C 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 26705 T 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 26706 T 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 26707 T 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 26708 A 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 26709 G 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 26710 C 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 26711 T 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 26712 T 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 26713 G 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 26714 T 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 26715 T 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 26716 T 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 26717 T 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 26718 G 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 26719 T 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 26720 G 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 26721 C 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 26722 T 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 26723 T 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 26724 G 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 26725 C 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 26726 T 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 26727 G 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 26728 C 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 26729 T 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 26730 G 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 26731 T 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 26732 T 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 26733 T 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 26734 A 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 26735 C 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 26736 A 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 26737 G 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 26738 A 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 26739 A 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 26740 T 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 26741 A 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 26742 A 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 26743 A 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 26744 T 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 26745 T 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 26746 G 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 26747 G 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 26748 A 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 26749 T 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 26750 C 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 26751 A 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 26752 C 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 26753 C 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 26754 G 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 26755 G 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 26756 T 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 26757 G 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 26758 G 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 26759 A 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 26760 A 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 26761 T 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 26762 T 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 26763 G 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 26764 C 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 26765 T 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 26766 A 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 26767 T 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 26768 C 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 26769 G 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 26770 C 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 26771 A 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 26772 A 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 26773 T 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 26774 G 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 26775 G 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 26776 C 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 26777 T 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 26778 T 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 26779 G 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 26780 T 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 26781 C 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 26782 T 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 26783 T 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 26784 G 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 26785 T 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 26786 A 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 26787 G 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 26788 G 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 26789 C 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 26790 T 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 26791 T 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 26792 G 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 26793 A 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 26794 T 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 26795 G 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 26796 T 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 26797 G 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 26798 G 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 26799 C 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 26800 T 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 26801 C 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 26802 A 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 26803 G 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 26804 C 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 26805 T 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 26806 A 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 26807 C 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 26808 T 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 26809 T 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 26810 C 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 26811 A 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 26812 T 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 26813 T 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 26814 G 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 26815 C 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 26816 T 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 26817 T 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 26818 C 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 26819 T 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 26820 T 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 26821 T 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 26822 C 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 26823 A 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 26824 G 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 26825 A 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 26826 C 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 26827 T 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 26828 G 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 26829 T 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 26830 T 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 26831 T 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 26832 G 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 26833 C 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 26834 G 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 26835 C 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 26836 G 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 26837 T 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 26838 A 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 26839 C 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 26840 G 1 1
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