National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     102                                        
-     1,803                                        
?                                              
A     57                                        
C     57                                        
D     30                                        
E     36                                        
F     63                                        
G     21                                        
H     123                                        
I     117                                        
K     89                                        
L     345                                        
M     105                                        
N     63                                        
P     27                                        
Q     96                                        
R     55                                        
S     99                                        
T     93                                        
V     162                                        
W     15                                        
Y     48                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 16237 G 5 5
1 Brunei 16238 C 5 5
2 Brunei 16239 T 5 5
3 Brunei 16240 G 5 5
4 Brunei 16241 T 5 5
5 Brunei 16242 T 5 5
6 Brunei 16243 G 5 5
7 Brunei 16244 G 5 5
8 Brunei 16245 G 5 5
9 Brunei 16246 G 5 5
10 Brunei 16247 C 5 5
11 Brunei 16248 T 5 5
12 Brunei 16249 T 5 5
13 Brunei 16250 G 5 5
14 Brunei 16251 T 5 5
15 Brunei 16252 G 5 5
16 Brunei 16253 T 5 5
17 Brunei 16254 T 5 5
18 Brunei 16255 C 5 5
19 Brunei 16256 T 5 5
20 Brunei 16257 T 5 5
21 Brunei 16258 T 5 5
22 Brunei 16259 G 5 5
23 Brunei 16260 C 5 5
24 Brunei 16261 A 5 5
25 Brunei 16262 A 5 5
26 Brunei 16263 T 5 5
27 Brunei 16264 T 5 5
28 Brunei 16265 C 5 5
29 Brunei 16266 A 5 5
30 Brunei 16267 C 5 5
31 Brunei 16268 A 5 5
32 Brunei 16269 G 5 5
33 Brunei 16270 A 5 5
34 Brunei 16271 C 5 5
35 Brunei 16272 T 5 5
36 Brunei 16273 T 5 5
37 Brunei 16274 C 5 5
38 Brunei 16275 A 5 5
39 Brunei 16276 T 5 5
40 Brunei 16277 T 5 5
41 Brunei 16278 A 5 5
42 Brunei 16279 A 5 5
43 Brunei 16280 G 5 5
44 Brunei 16281 A 5 5
45 Brunei 16282 T 5 5
46 Brunei 16283 G 5 5
47 Brunei 16284 T 5 5
48 Brunei 16285 G 5 5
49 Brunei 16286 G 5 5
50 Brunei 16287 T 5 5
51 Brunei 16288 G 5 5
52 Brunei 16289 C 5 5
53 Brunei 16290 T 5 5
54 Brunei 16291 T 5 5
55 Brunei 16292 G 5 5
56 Brunei 16293 C 5 5
57 Brunei 16294 A 5 5
58 Brunei 16295 T 5 5
59 Brunei 16296 A 5 5
60 Brunei 16297 C 5 5
61 Brunei 16298 G 5 5
62 Brunei 16299 T 5 5
63 Brunei 16300 A 5 5
64 Brunei 16301 G 5 5
65 Brunei 16302 A 5 5
66 Brunei 16303 C 5 5
67 Brunei 16304 C 5 5
68 Brunei 16305 A 5 5
69 Brunei 16306 T 5 5
70 Brunei 16307 T 5 5
71 Brunei 16308 C 5 5
72 Brunei 16309 T 5 5
73 Brunei 16310 T 5 5
74 Brunei 16311 A 5 5
75 Brunei 16312 T 5 5
76 Brunei 16313 G 5 5
77 Brunei 16314 T 5 5
78 Brunei 16315 T 5 5
79 Brunei 16316 G 5 5
80 Brunei 16317 T 5 5
81 Brunei 16318 A 5 5
82 Brunei 16319 A 5 5
83 Brunei 16320 A 5 5
84 Brunei 16321 T 5 5
85 Brunei 16322 G 5 5
86 Brunei 16323 C 5 5
87 Brunei 16324 T 5 5
88 Brunei 16325 G 5 5
89 Brunei 16326 T 5 5
90 Brunei 16327 T 5 5
91 Brunei 16328 A 5 5
92 Brunei 16329 C 5 5
93 Brunei 16330 G 5 5
94 Brunei 16331 A 5 5
95 Brunei 16332 C 5 5
96 Brunei 16333 C 5 5
97 Brunei 16334 A 5 5
98 Brunei 16335 T 5 5
99 Brunei 16336 G 5 5
100 Brunei 16337 T 5 5
101 Brunei 16338 C 5 5
102 Brunei 16339 A 5 5
103 Brunei 16340 T 5 5
104 Brunei 16341 A 5 5
105 Brunei 16342 T 5 5
106 Brunei 16343 C 5 5
107 Brunei 16344 A 5 5
108 Brunei 16345 A 5 5
109 Brunei 16346 C 5 5
110 Brunei 16347 A 5 5
111 Brunei 16348 T 5 5
112 Brunei 16349 C 5 5
113 Brunei 16350 A 5 5
114 Brunei 16351 C 5 5
115 Brunei 16352 A 5 5
116 Brunei 16353 T 5 5
117 Brunei 16354 A 5 5
118 Brunei 16355 A 5 5
119 Brunei 16356 A 5 5
120 Brunei 16357 T 5 5
121 Brunei 16358 T 5 5
122 Brunei 16359 A 5 5
123 Brunei 16360 G 5 5
124 Brunei 16361 T 5 5
125 Brunei 16362 C 5 5
126 Brunei 16363 T 5 5
127 Brunei 16364 T 5 5
128 Brunei 16365 G 5 5
129 Brunei 16366 T 5 5
130 Brunei 16367 C 5 5
131 Brunei 16368 T 5 5
132 Brunei 16369 G 5 5
133 Brunei 16370 T 5 5
134 Brunei 16371 T 5 5
135 Brunei 16372 A 5 5
136 Brunei 16373 A 5 5
137 Brunei 16374 T 5 5
138 Brunei 16375 C 5 5
139 Brunei 16376 C 5 5
140 Brunei 16377 G 5 5
141 Brunei 16378 T 5 5
142 Brunei 16379 A 5 5
143 Brunei 16380 T 5 5
144 Brunei 16381 G 5 5
145 Brunei 16382 T 5 5
146 Brunei 16383 T 5 5
147 Brunei 16384 T 5 5
148 Brunei 16385 G 5 5
149 Brunei 16386 C 5 5
150 Brunei 16387 A 5 5
151 Brunei 16388 A 5 5
152 Brunei 16389 T 5 5
153 Brunei 16390 G 5 5
154 Brunei 16391 C 5 5
155 Brunei 16392 T 5 5
156 Brunei 16393 C 5 5
157 Brunei 16394 C 5 5
158 Brunei 16395 A 5 5
159 Brunei 16396 G 5 5
160 Brunei 16397 G 5 5
161 Brunei 16398 T 5 5
162 Brunei 16399 T 5 5
163 Brunei 16400 G 5 5
164 Brunei 16401 T 5 5
165 Brunei 16402 G 5 5
166 Brunei 16403 A 5 5
167 Brunei 16404 T 5 5
168 Brunei 16405 G 5 5
169 Brunei 16406 T 5 5
170 Brunei 16407 C 5 5
171 Brunei 16408 A 5 5
172 Brunei 16409 C 5 5
173 Brunei 16410 A 5 5
174 Brunei 16411 G 5 5
175 Brunei 16412 A 5 5
176 Brunei 16413 T 5 5
177 Brunei 16414 G 5 5
178 Brunei 16415 T 5 5
179 Brunei 16416 G 5 5
180 Brunei 16417 A 5 5
181 Brunei 16418 C 5 5
182 Brunei 16419 T 5 5
183 Brunei 16420 C 5 5
184 Brunei 16421 A 5 5
185 Brunei 16422 A 5 5
186 Brunei 16423 C 5 5
187 Brunei 16424 T 5 5
188 Brunei 16425 T 5 5
189 Brunei 16426 T 5 5
190 Brunei 16427 A 5 5
191 Brunei 16428 C 5 5
192 Brunei 16429 T 5 5
193 Brunei 16430 T 5 5
194 Brunei 16431 A 5 5
195 Brunei 16432 G 5 5
196 Brunei 16433 G 5 5
197 Brunei 16434 A 5 5
198 Brunei 16435 G 5 5
199 Brunei 16436 G 5 5
200 Brunei 16437 T 5 5
201 Brunei 16438 A 5 5
202 Brunei 16439 T 5 5
203 Brunei 16440 G 5 5
204 Brunei 16441 A 5 5
205 Brunei 16442 G 5 5
206 Brunei 16443 C 5 5
207 Brunei 16444 T 5 5
208 Brunei 16445 A 5 5
209 Brunei 16446 T 5 5
210 Brunei 16447 T 5 5
211 Brunei 16448 A 5 5
212 Brunei 16449 T 5 5
213 Brunei 16450 T 5 5
214 Brunei 16451 G 5 5
215 Brunei 16452 T 5 5
216 Brunei 16453 A 5 5
217 Brunei 16454 A 5 5
218 Brunei 16455 A 5 5
219 Brunei 16456 T 5 5
220 Brunei 16457 C 5 5
221 Brunei 16458 A 5 5
222 Brunei 16459 C 5 5
223 Brunei 16460 A 5 5
224 Brunei 16461 T 5 5
225 Brunei 16462 A 5 5
226 Brunei 16463 A 5 5
227 Brunei 16464 A 5 5
228 Brunei 16465 C 5 5
229 Brunei 16466 C 5 5
230 Brunei 16467 A 5 5
231 Brunei 16468 C 5 5
232 Brunei 16469 C 5 5
233 Brunei 16470 C 5 5
234 Brunei 16471 A 5 5
235 Brunei 16472 T 5 5
236 Brunei 16473 T 5 5
237 Brunei 16474 A 5 5
238 Brunei 16475 G 5 5
239 Brunei 16476 T 5 5
240 Brunei 16477 T 5 5
241 Brunei 16478 T 5 5
242 Brunei 16479 T 5 5
243 Brunei 16480 C 5 5
244 Brunei 16481 C 5 5
245 Brunei 16482 A 5 5
246 Brunei 16483 T 5 5
247 Brunei 16484 T 5 5
248 Brunei 16485 G 5 5
249 Brunei 16486 T 5 5
250 Brunei 16487 G 5 5
251 Brunei 16488 T 5 5
252 Brunei 16489 G 5 5
253 Brunei 16490 C 5 5
254 Brunei 16491 T 5 5
255 Brunei 16492 A 5 5
256 Brunei 16493 A 5 5
257 Brunei 16494 T 5 5
258 Brunei 16495 G 5 5
259 Brunei 16496 G 5 5
260 Brunei 16497 A 5 5
261 Brunei 16498 C 5 5
262 Brunei 16499 A 5 5
263 Brunei 16500 A 5 5
264 Brunei 16501 G 5 5
265 Brunei 16502 T 5 5
266 Brunei 16503 T 5 5
267 Brunei 16504 T 5 5
268 Brunei 16505 T 5 5
269 Brunei 16506 T 5 5
270 Brunei 16507 G 5 5
271 Brunei 16508 G 5 5
272 Brunei 16509 T 5 5
273 Brunei 16510 T 5 5
274 Brunei 16511 T 5 5
275 Brunei 16512 A 5 5
276 Brunei 16513 T 5 5
277 Brunei 16514 A 5 5
278 Brunei 16515 T 5 5
279 Brunei 16516 A 5 5
280 Brunei 16517 A 5 5
281 Brunei 16518 A 5 5
282 Brunei 16519 A 5 5
283 Brunei 16520 A 5 5
284 Brunei 16521 T 5 5
285 Brunei 16522 A 5 5
286 Brunei 16523 C 5 5
287 Brunei 16524 A 5 5
288 Brunei 16525 T 5 5
289 Brunei 16526 G 5 5
290 Brunei 16527 T 5 5
291 Brunei 16528 G 5 5
292 Brunei 16529 T 5 5
293 Brunei 16530 T 5 5
294 Brunei 16531 G 5 5
295 Brunei 16532 G 5 5
296 Brunei 16533 T 5 5
297 Brunei 16534 A 5 5
298 Brunei 16535 G 5 5
299 Brunei 16536 C 5 5
300 Brunei 16537 G 5 5
301 Brunei 16538 A 5 5
302 Brunei 16539 T 5 5
303 Brunei 16540 A 5 5
304 Brunei 16541 A 5 5
305 Brunei 16542 T 5 5
306 Brunei 16543 G 5 5
307 Brunei 16544 T 5 5
308 Brunei 16545 T 5 5
309 Brunei 16546 A 5 5
310 Brunei 16547 C 5 5
311 Brunei 16548 T 5 5
312 Brunei 16549 G 5 5
313 Brunei 16550 A 5 5
314 Brunei 16551 C 5 5
315 Brunei 16552 T 5 5
316 Brunei 16553 T 5 5
317 Brunei 16554 T 5 5
318 Brunei 16555 A 5 5
319 Brunei 16556 A 5 5
320 Brunei 16557 T 5 5
321 Brunei 16558 G 5 5
322 Brunei 16559 C 5 5
323 Brunei 16560 A 5 5
324 Brunei 16561 A 5 5
325 Brunei 16562 T 5 5
326 Brunei 16563 T 5 5
327 Brunei 16564 G 5 5
328 Brunei 16565 C 5 5
329 Brunei 16566 A 5 5
330 Brunei 16567 A 5 5
331 Brunei 16568 C 5 5
332 Brunei 16569 A 5 5
333 Brunei 16570 T 5 5
334 Brunei 16571 G 5 5
335 Brunei 16572 T 5 5
336 Brunei 16573 G 5 5
337 Brunei 16574 A 5 5
338 Brunei 16575 C 5 5
339 Brunei 16576 T 5 5
340 Brunei 16577 G 5 5
341 Brunei 16578 G 5 5
342 Brunei 16579 A 5 5
343 Brunei 16580 C 5 5
344 Brunei 16581 A 5 5
345 Brunei 16582 A 5 5
346 Brunei 16583 A 5 5
347 Brunei 16584 T 5 5
348 Brunei 16585 G 5 5
349 Brunei 16586 C 5 5
350 Brunei 16587 T 5 5
351 Brunei 16588 G 5 5
352 Brunei 16589 G 5 5
353 Brunei 16590 T 5 5
354 Brunei 16591 G 5 5
355 Brunei 16592 A 5 5
356 Brunei 16593 T 5 5
357 Brunei 16594 T 5 5
358 Brunei 16595 A 5 5
359 Brunei 16596 C 5 5
360 Brunei 16597 A 5 5
361 Brunei 16598 T 5 5
362 Brunei 16599 T 5 5
363 Brunei 16600 T 5 5
364 Brunei 16601 T 5 5
365 Brunei 16602 A 5 5
366 Brunei 16603 G 5 5
367 Brunei 16604 C 5 5
368 Brunei 16605 T 5 5
369 Brunei 16606 A 5 5
370 Brunei 16607 A 5 5
371 Brunei 16608 C 5 5
372 Brunei 16609 A 5 5
373 Brunei 16610 C 5 5
374 Brunei 16611 C 5 5
375 Brunei 16612 T 5 5
376 Brunei 16613 G 5 5
377 Brunei 16614 T 5 5
378 Brunei 16615 A 5 5
379 Brunei 16616 C 5 5
380 Brunei 16617 T 5 5
381 Brunei 16618 G 5 5
382 Brunei 16619 A 5 5
383 Brunei 16620 A 5 5
384 Brunei 16621 A 5 5
385 Brunei 16622 G 5 5
386 Brunei 16623 A 5 5
387 Brunei 16624 C 5 5
388 Brunei 16625 T 5 5
389 Brunei 16626 C 5 5
390 Brunei 16627 A 5 5
391 Brunei 16628 A 5 5
392 Brunei 16629 G 5 5
393 Brunei 16630 C 5 5
394 Brunei 16631 T 5 5
395 Brunei 16632 T 5 5
396 Brunei 16633 T 5 5
397 Brunei 16634 T 5 5
398 Brunei 16635 T 5 5
399 Brunei 16636 G 5 5
400 Brunei 16637 C 5 5
401 Brunei 16638 A 5 5
402 Brunei 16639 G 5 5
403 Brunei 16640 C 5 5
404 Brunei 16641 A 5 5
405 Brunei 16642 G 5 5
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859 Brunei 17096 G 5 5
860 Brunei 17097 T 5 5
861 Brunei 17098 A 5 5
862 Brunei 17099 A 5 5
863 Brunei 17100 G 5 5
864 Brunei 17101 A 5 5
865 Brunei 17102 G 5 5
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867 Brunei 17104 C 5 5
868 Brunei 17105 A 5 5
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875 Brunei 17112 T 5 5
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998 Brunei 17235 T 5 5
999 Brunei 17236 A 5 5
1000 Brunei 17237 T 5 5
1001 Brunei 17238 A 5 5
1002 Brunei 17239 C 5 5
1003 Brunei 17240 C 5 5
1004 Brunei 17241 T 5 5
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1006 Brunei 17243 C 5 5
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1010 Brunei 17247 T 5 5
1011 Brunei 17248 G 5 5
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1013 Brunei 17250 T 5 5
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1020 Brunei 17257 G 5 5
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1160 Brunei 17397 C 5 5
1161 Brunei 17398 A 5 5
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1170 Brunei 17407 T 5 5
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1175 Brunei 17412 T 5 5
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1260 Brunei 17497 T 5 5
1261 Brunei 17498 A 5 5
1262 Brunei 17499 T 5 5
1263 Brunei 17500 T 5 5
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1270 Brunei 17507 C 5 5
1271 Brunei 17508 A 5 5
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1274 Brunei 17511 G 5 5
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1280 Brunei 17517 A 5 5
1281 Brunei 17518 C 5 5
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1283 Brunei 17520 T 5 5
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1290 Brunei 17527 A 5 5
1291 Brunei 17528 C 5 5
1292 Brunei 17529 T 5 5
1293 Brunei 17530 A 5 5
1294 Brunei 17531 T 5 5
1295 Brunei 17532 A 5 5
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1298 Brunei 17535 T 5 5
1299 Brunei 17536 C 5 5
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1722 Brunei 17959 A 5 5
1723 Brunei 17960 T 5 5
1724 Brunei 17961 A 5 5
1725 Brunei 17962 A 5 5
1726 Brunei 17963 T 5 5
1727 Brunei 17964 G 5 5
1728 Brunei 17965 T 5 5
1729 Brunei 17966 C 5 5
1730 Brunei 17967 T 5 5
1731 Brunei 17968 G 5 5
1732 Brunei 17969 A 5 5
1733 Brunei 17970 T 5 5
1734 Brunei 17971 A 5 5
1735 Brunei 17972 G 5 5
1736 Brunei 17973 A 5 5
1737 Brunei 17974 G 5 5
1738 Brunei 17975 A 5 5
1739 Brunei 17976 C 5 5
1740 Brunei 17977 C 5 5
1741 Brunei 17978 T 5 5
1742 Brunei 17979 T 5 5
1743 Brunei 17980 T 5 5
1744 Brunei 17981 A 5 5
1745 Brunei 17982 T 5 5
1746 Brunei 17983 G 5 5
1747 Brunei 17984 A 5 5
1748 Brunei 17985 C 5 5
1749 Brunei 17986 A 5 5
1750 Brunei 17987 A 5 5
1751 Brunei 17988 G 5 5
1752 Brunei 17989 T 5 5
1753 Brunei 17990 T 5 5
1754 Brunei 17991 G 5 5
1755 Brunei 17992 C 5 5
1756 Brunei 17993 A 5 5
1757 Brunei 17994 A 5 5
1758 Brunei 17995 T 5 5
1759 Brunei 17996 T 5 5
1760 Brunei 17997 T 5 5
1761 Brunei 17998 A 5 5
1762 Brunei 17999 C 5 5
1763 Brunei 18000 A 5 5
1764 Brunei 18001 A 5 5
1765 Brunei 18002 G 5 5
1766 Brunei 18003 T 5 5
1767 Brunei 18004 C 5 5
1768 Brunei 18005 T 5 5
1769 Brunei 18006 T 5 5
1770 Brunei 18007 G 5 5
1771 Brunei 18008 A 5 5
1772 Brunei 18009 A 5 5
1773 Brunei 18010 A 5 5
1774 Brunei 18011 T 5 5
1775 Brunei 18012 T 5 5
1776 Brunei 18013 C 5 5
1777 Brunei 18014 C 5 5
1778 Brunei 18015 A 5 5
1779 Brunei 18016 C 5 5
1780 Brunei 18017 G 5 5
1781 Brunei 18018 T 5 5
1782 Brunei 18019 A 5 5
1783 Brunei 18020 G 5 5
1784 Brunei 18021 G 5 5
1785 Brunei 18022 A 5 5
1786 Brunei 18023 A 5 5
1787 Brunei 18024 T 5 5
1788 Brunei 18025 G 5 5
1789 Brunei 18026 T 5 5
1790 Brunei 18027 G 5 5
1791 Brunei 18028 G 5 5
1792 Brunei 18029 C 5 5
1793 Brunei 18030 A 5 5
1794 Brunei 18031 A 5 5
1795 Brunei 18032 C 5 5
1796 Brunei 18033 T 5 5
1797 Brunei 18034 T 5 5
1798 Brunei 18035 T 5 5
1799 Brunei 18036 A 5 5
1800 Brunei 18037 C 5 5
1801 Brunei 18038 A 5 5
1802 Brunei 18039 A 5 5