National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     102                                        
-     1,803                                        
?                                              
A     57                                        
C     57                                        
D     30                                        
E     36                                        
F     63                                        
G     21                                        
H     123                                        
I     117                                        
K     89                                        
L     345                                        
M     105                                 1      
N     63                                        
P     27                                        
Q     96                                        
R     55                                        
S     99                                        
T     93                                        
V     162                                        
W     15                                        
Y     48                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Antigua_and_Barbuda 16237 G 1 1
1 Antigua_and_Barbuda 16238 C 1 1
2 Antigua_and_Barbuda 16239 T 1 1
3 Antigua_and_Barbuda 16240 G 1 1
4 Antigua_and_Barbuda 16241 T 1 1
5 Antigua_and_Barbuda 16242 T 1 1
6 Antigua_and_Barbuda 16243 G 1 1
7 Antigua_and_Barbuda 16244 G 1 1
8 Antigua_and_Barbuda 16245 G 1 1
9 Antigua_and_Barbuda 16246 G 1 1
10 Antigua_and_Barbuda 16247 C 1 1
11 Antigua_and_Barbuda 16248 T 1 1
12 Antigua_and_Barbuda 16249 T 1 1
13 Antigua_and_Barbuda 16250 G 1 1
14 Antigua_and_Barbuda 16251 T 1 1
15 Antigua_and_Barbuda 16252 G 1 1
16 Antigua_and_Barbuda 16253 T 1 1
17 Antigua_and_Barbuda 16254 T 1 1
18 Antigua_and_Barbuda 16255 C 1 1
19 Antigua_and_Barbuda 16256 T 1 1
20 Antigua_and_Barbuda 16257 T 1 1
21 Antigua_and_Barbuda 16258 T 1 1
22 Antigua_and_Barbuda 16259 G 1 1
23 Antigua_and_Barbuda 16260 C 1 1
24 Antigua_and_Barbuda 16261 A 1 1
25 Antigua_and_Barbuda 16262 A 1 1
26 Antigua_and_Barbuda 16263 T 1 1
27 Antigua_and_Barbuda 16264 T 1 1
28 Antigua_and_Barbuda 16265 C 1 1
29 Antigua_and_Barbuda 16266 A 1 1
30 Antigua_and_Barbuda 16267 C 1 1
31 Antigua_and_Barbuda 16268 A 1 1
32 Antigua_and_Barbuda 16269 G 1 1
33 Antigua_and_Barbuda 16270 A 1 1
34 Antigua_and_Barbuda 16271 C 1 1
35 Antigua_and_Barbuda 16272 T 1 1
36 Antigua_and_Barbuda 16273 T 1 1
37 Antigua_and_Barbuda 16274 C 1 1
38 Antigua_and_Barbuda 16275 A 1 1
39 Antigua_and_Barbuda 16276 T 1 1
40 Antigua_and_Barbuda 16277 T 1 1
41 Antigua_and_Barbuda 16278 A 1 1
42 Antigua_and_Barbuda 16279 A 1 1
43 Antigua_and_Barbuda 16280 G 1 1
44 Antigua_and_Barbuda 16281 A 1 1
45 Antigua_and_Barbuda 16282 T 1 1
46 Antigua_and_Barbuda 16283 G 1 1
47 Antigua_and_Barbuda 16284 T 1 1
48 Antigua_and_Barbuda 16285 G 1 1
49 Antigua_and_Barbuda 16286 G 1 1
50 Antigua_and_Barbuda 16287 T 1 1
51 Antigua_and_Barbuda 16288 G 1 1
52 Antigua_and_Barbuda 16289 C 1 1
53 Antigua_and_Barbuda 16290 T 1 1
54 Antigua_and_Barbuda 16291 T 1 1
55 Antigua_and_Barbuda 16292 G 1 1
56 Antigua_and_Barbuda 16293 C 1 1
57 Antigua_and_Barbuda 16294 A 1 1
58 Antigua_and_Barbuda 16295 T 1 1
59 Antigua_and_Barbuda 16296 A 1 1
60 Antigua_and_Barbuda 16297 C 1 1
61 Antigua_and_Barbuda 16298 G 1 1
62 Antigua_and_Barbuda 16299 T 1 1
63 Antigua_and_Barbuda 16300 A 1 1
64 Antigua_and_Barbuda 16301 G 1 1
65 Antigua_and_Barbuda 16302 A 1 1
66 Antigua_and_Barbuda 16303 C 1 1
67 Antigua_and_Barbuda 16304 C 1 1
68 Antigua_and_Barbuda 16305 A 1 1
69 Antigua_and_Barbuda 16306 T 1 1
70 Antigua_and_Barbuda 16307 T 1 1
71 Antigua_and_Barbuda 16308 C 1 1
72 Antigua_and_Barbuda 16309 T 1 1
73 Antigua_and_Barbuda 16310 T 1 1
74 Antigua_and_Barbuda 16311 A 1 1
75 Antigua_and_Barbuda 16312 T 1 1
76 Antigua_and_Barbuda 16313 G 1 1
77 Antigua_and_Barbuda 16314 T 1 1
78 Antigua_and_Barbuda 16315 T 1 1
79 Antigua_and_Barbuda 16316 G 1 1
80 Antigua_and_Barbuda 16317 T 1 1
81 Antigua_and_Barbuda 16318 A 1 1
82 Antigua_and_Barbuda 16319 A 1 1
83 Antigua_and_Barbuda 16320 A 1 1
84 Antigua_and_Barbuda 16321 T 1 1
85 Antigua_and_Barbuda 16322 G 1 1
86 Antigua_and_Barbuda 16323 C 1 1
87 Antigua_and_Barbuda 16324 T 1 1
88 Antigua_and_Barbuda 16325 G 1 1
89 Antigua_and_Barbuda 16326 T 1 1
90 Antigua_and_Barbuda 16327 T 1 1
91 Antigua_and_Barbuda 16328 A 1 1
92 Antigua_and_Barbuda 16329 C 1 1
93 Antigua_and_Barbuda 16330 G 1 1
94 Antigua_and_Barbuda 16331 A 1 1
95 Antigua_and_Barbuda 16332 C 1 1
96 Antigua_and_Barbuda 16333 C 1 1
97 Antigua_and_Barbuda 16334 A 1 1
98 Antigua_and_Barbuda 16335 T 1 1
99 Antigua_and_Barbuda 16336 G 1 1
100 Antigua_and_Barbuda 16337 T 1 1
101 Antigua_and_Barbuda 16338 C 1 1
102 Antigua_and_Barbuda 16339 A 1 1
103 Antigua_and_Barbuda 16340 T 1 1
104 Antigua_and_Barbuda 16341 A 1 1
105 Antigua_and_Barbuda 16342 T 1 1
106 Antigua_and_Barbuda 16343 C 1 1
107 Antigua_and_Barbuda 16344 A 1 1
108 Antigua_and_Barbuda 16345 A 1 1
109 Antigua_and_Barbuda 16346 C 1 1
110 Antigua_and_Barbuda 16347 A 1 1
111 Antigua_and_Barbuda 16348 T 1 1
112 Antigua_and_Barbuda 16349 C 1 1
113 Antigua_and_Barbuda 16350 A 1 1
114 Antigua_and_Barbuda 16351 C 1 1
115 Antigua_and_Barbuda 16352 A 1 1
116 Antigua_and_Barbuda 16353 T 1 1
117 Antigua_and_Barbuda 16354 A 1 1
118 Antigua_and_Barbuda 16355 A 1 1
119 Antigua_and_Barbuda 16356 A 1 1
120 Antigua_and_Barbuda 16357 T 1 1
121 Antigua_and_Barbuda 16358 T 1 1
122 Antigua_and_Barbuda 16359 A 1 1
123 Antigua_and_Barbuda 16360 G 1 1
124 Antigua_and_Barbuda 16361 T 1 1
125 Antigua_and_Barbuda 16362 C 1 1
126 Antigua_and_Barbuda 16363 T 1 1
127 Antigua_and_Barbuda 16364 T 1 1
128 Antigua_and_Barbuda 16365 G 1 1
129 Antigua_and_Barbuda 16366 T 1 1
130 Antigua_and_Barbuda 16367 C 1 1
131 Antigua_and_Barbuda 16368 T 1 1
132 Antigua_and_Barbuda 16369 G 1 1
133 Antigua_and_Barbuda 16370 T 1 1
134 Antigua_and_Barbuda 16371 T 1 1
135 Antigua_and_Barbuda 16372 A 1 1
136 Antigua_and_Barbuda 16373 A 1 1
137 Antigua_and_Barbuda 16374 T 1 1
138 Antigua_and_Barbuda 16375 C 1 1
139 Antigua_and_Barbuda 16376 C 1 1
140 Antigua_and_Barbuda 16377 G 1 1
141 Antigua_and_Barbuda 16378 T 1 1
142 Antigua_and_Barbuda 16379 A 1 1
143 Antigua_and_Barbuda 16380 T 1 1
144 Antigua_and_Barbuda 16381 G 1 1
145 Antigua_and_Barbuda 16382 T 1 1
146 Antigua_and_Barbuda 16383 T 1 1
147 Antigua_and_Barbuda 16384 T 1 1
148 Antigua_and_Barbuda 16385 G 1 1
149 Antigua_and_Barbuda 16386 C 1 1
150 Antigua_and_Barbuda 16387 A 1 1
151 Antigua_and_Barbuda 16388 A 1 1
152 Antigua_and_Barbuda 16389 T 1 1
153 Antigua_and_Barbuda 16390 G 1 1
154 Antigua_and_Barbuda 16391 C 1 1
155 Antigua_and_Barbuda 16392 T 1 1
156 Antigua_and_Barbuda 16393 C 1 1
157 Antigua_and_Barbuda 16394 C 1 1
158 Antigua_and_Barbuda 16395 A 1 1
159 Antigua_and_Barbuda 16396 G 1 1
160 Antigua_and_Barbuda 16397 G 1 1
161 Antigua_and_Barbuda 16398 T 1 1
162 Antigua_and_Barbuda 16399 T 1 1
163 Antigua_and_Barbuda 16400 G 1 1
164 Antigua_and_Barbuda 16401 T 1 1
165 Antigua_and_Barbuda 16402 G 1 1
166 Antigua_and_Barbuda 16403 A 1 1
167 Antigua_and_Barbuda 16404 T 1 1
168 Antigua_and_Barbuda 16405 G 1 1
169 Antigua_and_Barbuda 16406 T 1 1
170 Antigua_and_Barbuda 16407 C 1 1
171 Antigua_and_Barbuda 16408 A 1 1
172 Antigua_and_Barbuda 16409 C 1 1
173 Antigua_and_Barbuda 16410 A 1 1
174 Antigua_and_Barbuda 16411 G 1 1
175 Antigua_and_Barbuda 16412 A 1 1
176 Antigua_and_Barbuda 16413 T 1 1
177 Antigua_and_Barbuda 16414 G 1 1
178 Antigua_and_Barbuda 16415 T 1 1
179 Antigua_and_Barbuda 16416 G 1 1
180 Antigua_and_Barbuda 16417 A 1 1
181 Antigua_and_Barbuda 16418 C 1 1
182 Antigua_and_Barbuda 16419 T 1 1
183 Antigua_and_Barbuda 16420 C 1 1
184 Antigua_and_Barbuda 16421 A 1 1
185 Antigua_and_Barbuda 16422 A 1 1
186 Antigua_and_Barbuda 16423 C 1 1
187 Antigua_and_Barbuda 16424 T 1 1
188 Antigua_and_Barbuda 16425 T 1 1
189 Antigua_and_Barbuda 16426 T 1 1
190 Antigua_and_Barbuda 16427 A 1 1
191 Antigua_and_Barbuda 16428 C 1 1
192 Antigua_and_Barbuda 16429 T 1 1
193 Antigua_and_Barbuda 16430 T 1 1
194 Antigua_and_Barbuda 16431 A 1 1
195 Antigua_and_Barbuda 16432 G 1 1
196 Antigua_and_Barbuda 16433 G 1 1
197 Antigua_and_Barbuda 16434 A 1 1
198 Antigua_and_Barbuda 16435 G 1 1
199 Antigua_and_Barbuda 16436 G 1 1
200 Antigua_and_Barbuda 16437 T 1 1
201 Antigua_and_Barbuda 16438 A 1 1
202 Antigua_and_Barbuda 16439 T 1 1
203 Antigua_and_Barbuda 16440 G 1 1
204 Antigua_and_Barbuda 16441 A 1 1
205 Antigua_and_Barbuda 16442 G 1 1
206 Antigua_and_Barbuda 16443 C 1 1
207 Antigua_and_Barbuda 16444 T 1 1
208 Antigua_and_Barbuda 16445 A 1 1
209 Antigua_and_Barbuda 16446 T 1 1
210 Antigua_and_Barbuda 16447 T 1 1
211 Antigua_and_Barbuda 16448 A 1 1
212 Antigua_and_Barbuda 16449 T 1 1
213 Antigua_and_Barbuda 16450 T 1 1
214 Antigua_and_Barbuda 16451 G 1 1
215 Antigua_and_Barbuda 16452 T 1 1
216 Antigua_and_Barbuda 16453 A 1 1
217 Antigua_and_Barbuda 16454 A 1 1
218 Antigua_and_Barbuda 16455 A 1 1
219 Antigua_and_Barbuda 16456 T 1 1
220 Antigua_and_Barbuda 16457 C 1 1
221 Antigua_and_Barbuda 16458 A 1 1
222 Antigua_and_Barbuda 16459 C 1 1
223 Antigua_and_Barbuda 16460 A 1 1
224 Antigua_and_Barbuda 16461 T 1 1
225 Antigua_and_Barbuda 16462 A 1 1
226 Antigua_and_Barbuda 16463 A 1 1
227 Antigua_and_Barbuda 16464 A 1 1
228 Antigua_and_Barbuda 16465 C 1 1
229 Antigua_and_Barbuda 16466 C 1 1
230 Antigua_and_Barbuda 16467 A 1 1
231 Antigua_and_Barbuda 16468 C 1 1
232 Antigua_and_Barbuda 16469 C 1 1
233 Antigua_and_Barbuda 16470 C 1 1
234 Antigua_and_Barbuda 16471 A 1 1
235 Antigua_and_Barbuda 16472 T 1 1
236 Antigua_and_Barbuda 16473 T 1 1
237 Antigua_and_Barbuda 16474 A 1 1
238 Antigua_and_Barbuda 16475 G 1 1
239 Antigua_and_Barbuda 16476 T 1 1
240 Antigua_and_Barbuda 16477 T 1 1
241 Antigua_and_Barbuda 16478 T 1 1
242 Antigua_and_Barbuda 16479 T 1 1
243 Antigua_and_Barbuda 16480 C 1 1
244 Antigua_and_Barbuda 16481 C 1 1
245 Antigua_and_Barbuda 16482 A 1 1
246 Antigua_and_Barbuda 16483 T 1 1
247 Antigua_and_Barbuda 16484 T 1 1
248 Antigua_and_Barbuda 16485 G 1 1
249 Antigua_and_Barbuda 16486 T 1 1
250 Antigua_and_Barbuda 16487 G 1 1
251 Antigua_and_Barbuda 16488 T 1 1
252 Antigua_and_Barbuda 16489 G 1 1
253 Antigua_and_Barbuda 16490 C 1 1
254 Antigua_and_Barbuda 16491 T 1 1
255 Antigua_and_Barbuda 16492 A 1 1
256 Antigua_and_Barbuda 16493 A 1 1
257 Antigua_and_Barbuda 16494 T 1 1
258 Antigua_and_Barbuda 16495 G 1 1
259 Antigua_and_Barbuda 16496 G 1 1
260 Antigua_and_Barbuda 16497 A 1 1
261 Antigua_and_Barbuda 16498 C 1 1
262 Antigua_and_Barbuda 16499 A 1 1
263 Antigua_and_Barbuda 16500 A 1 1
264 Antigua_and_Barbuda 16501 G 1 1
265 Antigua_and_Barbuda 16502 T 1 1
266 Antigua_and_Barbuda 16503 T 1 1
267 Antigua_and_Barbuda 16504 T 1 1
268 Antigua_and_Barbuda 16505 T 1 1
269 Antigua_and_Barbuda 16506 T 1 1
270 Antigua_and_Barbuda 16507 G 1 1
271 Antigua_and_Barbuda 16508 G 1 1
272 Antigua_and_Barbuda 16509 T 1 1
273 Antigua_and_Barbuda 16510 T 1 1
274 Antigua_and_Barbuda 16511 T 1 1
275 Antigua_and_Barbuda 16512 A 1 1
276 Antigua_and_Barbuda 16513 T 1 1
277 Antigua_and_Barbuda 16514 A 1 1
278 Antigua_and_Barbuda 16515 T 1 1
279 Antigua_and_Barbuda 16516 A 1 1
280 Antigua_and_Barbuda 16517 A 1 1
281 Antigua_and_Barbuda 16518 A 1 1
282 Antigua_and_Barbuda 16519 A 1 1
283 Antigua_and_Barbuda 16520 A 1 1
284 Antigua_and_Barbuda 16521 T 1 1
285 Antigua_and_Barbuda 16522 A 1 1
286 Antigua_and_Barbuda 16523 C 1 1
287 Antigua_and_Barbuda 16524 A 1 1
288 Antigua_and_Barbuda 16525 T 1 1
289 Antigua_and_Barbuda 16526 G 1 1
290 Antigua_and_Barbuda 16527 T 1 1
291 Antigua_and_Barbuda 16528 G 1 1
292 Antigua_and_Barbuda 16529 T 1 1
293 Antigua_and_Barbuda 16530 T 1 1
294 Antigua_and_Barbuda 16531 G 1 1
295 Antigua_and_Barbuda 16532 G 1 1
296 Antigua_and_Barbuda 16533 T 1 1
297 Antigua_and_Barbuda 16534 A 1 1
298 Antigua_and_Barbuda 16535 G 1 1
299 Antigua_and_Barbuda 16536 C 1 1
300 Antigua_and_Barbuda 16537 G 1 1
301 Antigua_and_Barbuda 16538 A 1 1
302 Antigua_and_Barbuda 16539 T 1 1
303 Antigua_and_Barbuda 16540 A 1 1
304 Antigua_and_Barbuda 16541 A 1 1
305 Antigua_and_Barbuda 16542 T 1 1
306 Antigua_and_Barbuda 16543 G 1 1
307 Antigua_and_Barbuda 16544 T 1 1
308 Antigua_and_Barbuda 16545 T 1 1
309 Antigua_and_Barbuda 16546 A 1 1
310 Antigua_and_Barbuda 16547 C 1 1
311 Antigua_and_Barbuda 16548 T 1 1
312 Antigua_and_Barbuda 16549 G 1 1
313 Antigua_and_Barbuda 16550 A 1 1
314 Antigua_and_Barbuda 16551 C 1 1
315 Antigua_and_Barbuda 16552 T 1 1
316 Antigua_and_Barbuda 16553 T 1 1
317 Antigua_and_Barbuda 16554 T 1 1
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672 Antigua_and_Barbuda 16909 T 1 1
673 Antigua_and_Barbuda 16910 T 1 1
674 Antigua_and_Barbuda 16911 T 1 1
675 Antigua_and_Barbuda 16912 G 1 1
676 Antigua_and_Barbuda 16913 T 1 1
677 Antigua_and_Barbuda 16914 G 1 1
678 Antigua_and_Barbuda 16915 C 1 1
679 Antigua_and_Barbuda 16916 T 1 1
680 Antigua_and_Barbuda 16917 G 1 1
681 Antigua_and_Barbuda 16918 A 1 1
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683 Antigua_and_Barbuda 16920 A 1 1
684 Antigua_and_Barbuda 16921 T 1 1
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687 Antigua_and_Barbuda 16924 C 1 1
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754 Antigua_and_Barbuda 16991 T 1 1
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1023 Antigua_and_Barbuda 17260 T 1 1
1024 Antigua_and_Barbuda 17261 G 1 1
1025 Antigua_and_Barbuda 17262 T 1 1
1026 Antigua_and_Barbuda 17263 T 1 1
1027 Antigua_and_Barbuda 17264 T 1 1
1028 Antigua_and_Barbuda 17265 T 1 1
1029 Antigua_and_Barbuda 17266 G 1 1
1030 Antigua_and_Barbuda 17267 A 1 1
1031 Antigua_and_Barbuda 17268 T 1 1
1032 Antigua_and_Barbuda 17269 A 1 1
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1364 Antigua_and_Barbuda 17601 G 1 1
1365 Antigua_and_Barbuda 17602 G 1 1
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1367 Antigua_and_Barbuda 17604 T 1 1
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1370 Antigua_and_Barbuda 17607 T 1 1
1371 Antigua_and_Barbuda 17608 G 1 1
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1702 Antigua_and_Barbuda 17939 C 1 1
1703 Antigua_and_Barbuda 17940 A 1 1
1704 Antigua_and_Barbuda 17941 A 1 1
1705 Antigua_and_Barbuda 17942 A 1 1
1706 Antigua_and_Barbuda 17943 A 1 1
1707 Antigua_and_Barbuda 17944 G 1 1
1708 Antigua_and_Barbuda 17945 T 1 1
1709 Antigua_and_Barbuda 17946 A 1 1
1710 Antigua_and_Barbuda 17947 G 1 1
1711 Antigua_and_Barbuda 17948 G 1 1
1712 Antigua_and_Barbuda 17949 C 1 1
1713 Antigua_and_Barbuda 17950 A 1 1
1714 Antigua_and_Barbuda 17951 T 1 1
1715 Antigua_and_Barbuda 17952 A 1 1
1716 Antigua_and_Barbuda 17953 C 1 1
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1718 Antigua_and_Barbuda 17955 T 1 1
1719 Antigua_and_Barbuda 17956 T 1 1
1720 Antigua_and_Barbuda 17957 G 1 1
1721 Antigua_and_Barbuda 17958 C 1 1
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1723 Antigua_and_Barbuda 17960 T 1 1
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1760 Antigua_and_Barbuda 17997 T 1 1
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1802 Antigua_and_Barbuda 18039 A 1 1