National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     99                                        
-     1,581                                        
?                                              
A     42                                        
C     33                                        
D     36                                        
E     24                                        
F     39                                        
G     39                                        
H     63                                        
I     123                     1                  
K     70                                        
L     312                   1                    
M     93                                   1    
N     57                                        
P     30                               1        
Q     42                                        
R     35                                        
S     120         1         1                    
T     105               1                        
V     147                                        
W     6                               1        
Y     66                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Sri_Lanka 18040 G 55 55
1 Sri_Lanka 18041 C 55 55
2 Sri_Lanka 18042 T 55 55
3 Sri_Lanka 18043 G 55 55
4 Sri_Lanka 18044 A 55 55
5 Sri_Lanka 18045 A 55 55
6 Sri_Lanka 18046 A 55 55
7 Sri_Lanka 18047 A 55 55
8 Sri_Lanka 18048 T 55 55
9 Sri_Lanka 18049 G 55 55
10 Sri_Lanka 18050 T 55 55
11 Sri_Lanka 18051 A 55 55
12 Sri_Lanka 18052 A 55 55
13 Sri_Lanka 18053 C 55 55
14 Sri_Lanka 18054 A 55 55
15 Sri_Lanka 18055 G 55 55
16 Sri_Lanka 18056 G 55 55
17 Sri_Lanka 18057 A 55 55
18 Sri_Lanka 18058 C 55 55
19 Sri_Lanka 18059 T 55 55
20 Sri_Lanka 18060 C 55 55
21 Sri_Lanka 18061 T 55 55
22 Sri_Lanka 18062 T 55 55
23 Sri_Lanka 18063 T 55 55
24 Sri_Lanka 18064 A 55 55
25 Sri_Lanka 18065 A 55 55
26 Sri_Lanka 18066 A 55 55
27 Sri_Lanka 18067 G 55 55
28 Sri_Lanka 18068 A 55 55
29 Sri_Lanka 18069 T 55 55
30 Sri_Lanka 18070 T 55 55
31 Sri_Lanka 18071 G 55 55
32 Sri_Lanka 18072 T 55 55
33 Sri_Lanka 18073 A 55 55
34 Sri_Lanka 18074 G 55 55
35 Sri_Lanka 18075 T 55 55
36 Sri_Lanka 18076 A 55 55
37 Sri_Lanka 18077 A 55 55
38 Sri_Lanka 18078 G 55 55
39 Sri_Lanka 18079 G 55 55
40 Sri_Lanka 18080 T 55 55
41 Sri_Lanka 18081 A 55 55
42 Sri_Lanka 18082 A 55 55
43 Sri_Lanka 18083 T 55 55
44 Sri_Lanka 18084 C 55 55
45 Sri_Lanka 18085 A 55 55
46 Sri_Lanka 18086 C 55 55
47 Sri_Lanka 18087 T 55 55
48 Sri_Lanka 18088 G 55 55
49 Sri_Lanka 18089 G 55 55
50 Sri_Lanka 18090 G 55 55
51 Sri_Lanka 18091 T 55 55
52 Sri_Lanka 18092 T 55 55
53 Sri_Lanka 18093 A 55 55
54 Sri_Lanka 18094 C 55 55
55 Sri_Lanka 18095 A 55 55
56 Sri_Lanka 18096 T 55 55
57 Sri_Lanka 18097 C 55 55
58 Sri_Lanka 18098 C 55 55
59 Sri_Lanka 18099 T 55 55
60 Sri_Lanka 18100 A 55 55
61 Sri_Lanka 18101 C 55 55
62 Sri_Lanka 18102 A 55 55
63 Sri_Lanka 18103 C 55 55
64 Sri_Lanka 18104 A 55 55
65 Sri_Lanka 18105 G 55 55
66 Sri_Lanka 18106 G 55 55
67 Sri_Lanka 18107 C 55 55
68 Sri_Lanka 18108 A 55 55
69 Sri_Lanka 18109 C 55 55
70 Sri_Lanka 18110 C 55 55
71 Sri_Lanka 18111 T 55 55
72 Sri_Lanka 18112 A 55 55
73 Sri_Lanka 18113 C 55 55
74 Sri_Lanka 18114 A 55 55
75 Sri_Lanka 18115 C 55 55
76 Sri_Lanka 18116 A 55 55
77 Sri_Lanka 18117 C 55 55
78 Sri_Lanka 18118 C 55 55
79 Sri_Lanka 18119 T 55 55
80 Sri_Lanka 18120 C 55 55
81 Sri_Lanka 18121 A 55 55
82 Sri_Lanka 18122 G 55 55
83 Sri_Lanka 18123 T 55 55
84 Sri_Lanka 18124 G 55 55
85 Sri_Lanka 18125 T 55 55
86 Sri_Lanka 18126 T 55 55
87 Sri_Lanka 18127 G 55 55
88 Sri_Lanka 18128 A 55 53
89 Sri_Lanka 18129 C 55 53
90 Sri_Lanka 18130 A 55 52
91 Sri_Lanka 18131 C 55 53
92 Sri_Lanka 18132 T 55 54
93 Sri_Lanka 18133 A 55 54
94 Sri_Lanka 18134 A 55 54
95 Sri_Lanka 18135 A 55 54
96 Sri_Lanka 18136 T 55 54
97 Sri_Lanka 18137 T 55 54
98 Sri_Lanka 18138 C 55 54
99 Sri_Lanka 18139 A 55 54
100 Sri_Lanka 18140 A 55 54
101 Sri_Lanka 18141 A 55 54
102 Sri_Lanka 18142 A 55 54
103 Sri_Lanka 18143 C 55 54
104 Sri_Lanka 18144 T 55 54
105 Sri_Lanka 18145 G 55 54
106 Sri_Lanka 18146 A 55 54
107 Sri_Lanka 18147 A 55 54
108 Sri_Lanka 18148 G 55 54
109 Sri_Lanka 18149 G 55 54
110 Sri_Lanka 18150 T 55 54
111 Sri_Lanka 18151 T 55 54
112 Sri_Lanka 18152 T 55 54
113 Sri_Lanka 18153 A 55 54
114 Sri_Lanka 18154 T 55 54
115 Sri_Lanka 18155 G 55 54
116 Sri_Lanka 18156 T 55 54
117 Sri_Lanka 18157 G 55 54
118 Sri_Lanka 18158 T 55 54
119 Sri_Lanka 18159 T 55 53
120 Sri_Lanka 18160 G 55 53
121 Sri_Lanka 18161 A 55 53
122 Sri_Lanka 18162 C 55 53
123 Sri_Lanka 18163 A 55 53
124 Sri_Lanka 18164 T 55 53
125 Sri_Lanka 18165 A 55 55
126 Sri_Lanka 18166 C 55 55
127 Sri_Lanka 18167 C 55 55
128 Sri_Lanka 18168 T 55 55
129 Sri_Lanka 18169 G 55 55
130 Sri_Lanka 18170 G 55 55
131 Sri_Lanka 18171 C 55 55
132 Sri_Lanka 18172 A 55 55
133 Sri_Lanka 18173 T 55 55
134 Sri_Lanka 18174 A 55 55
135 Sri_Lanka 18175 C 55 55
136 Sri_Lanka 18176 C 55 55
137 Sri_Lanka 18177 T 55 55
138 Sri_Lanka 18178 A 55 55
139 Sri_Lanka 18179 A 55 55
140 Sri_Lanka 18180 G 55 55
141 Sri_Lanka 18181 G 55 55
142 Sri_Lanka 18182 A 55 55
143 Sri_Lanka 18183 C 55 55
144 Sri_Lanka 18184 A 55 55
145 Sri_Lanka 18185 T 55 55
146 Sri_Lanka 18186 G 55 55
147 Sri_Lanka 18187 A 55 55
148 Sri_Lanka 18188 C 55 55
149 Sri_Lanka 18189 C 55 55
150 Sri_Lanka 18190 T 55 55
151 Sri_Lanka 18191 A 55 55
152 Sri_Lanka 18192 T 55 55
153 Sri_Lanka 18193 A 55 55
154 Sri_Lanka 18194 G 55 55
155 Sri_Lanka 18195 A 55 55
156 Sri_Lanka 18196 A 55 55
157 Sri_Lanka 18197 G 55 55
158 Sri_Lanka 18198 A 55 55
159 Sri_Lanka 18199 C 55 55
160 Sri_Lanka 18200 T 55 55
161 Sri_Lanka 18201 C 55 55
162 Sri_Lanka 18202 A 55 55
163 Sri_Lanka 18203 T 55 55
164 Sri_Lanka 18204 C 55 55
165 Sri_Lanka 18205 T 55 55
166 Sri_Lanka 18206 C 55 55
167 Sri_Lanka 18207 T 55 55
168 Sri_Lanka 18208 A 55 55
169 Sri_Lanka 18209 T 55 55
170 Sri_Lanka 18210 G 55 55
171 Sri_Lanka 18211 A 55 55
172 Sri_Lanka 18212 T 55 55
173 Sri_Lanka 18213 G 55 55
174 Sri_Lanka 18214 G 55 55
175 Sri_Lanka 18215 G 55 55
176 Sri_Lanka 18216 T 55 55
177 Sri_Lanka 18217 T 55 55
178 Sri_Lanka 18218 T 55 55
179 Sri_Lanka 18219 T 55 55
180 Sri_Lanka 18220 A 55 55
181 Sri_Lanka 18221 A 55 55
182 Sri_Lanka 18222 A 55 55
183 Sri_Lanka 18223 A 55 55
184 Sri_Lanka 18224 T 55 55
185 Sri_Lanka 18225 G 55 55
186 Sri_Lanka 18226 A 55 55
187 Sri_Lanka 18227 A 55 55
188 Sri_Lanka 18228 T 55 55
189 Sri_Lanka 18229 T 55 55
190 Sri_Lanka 18230 A 55 55
191 Sri_Lanka 18231 T 55 55
192 Sri_Lanka 18232 C 55 55
193 Sri_Lanka 18233 A 55 55
194 Sri_Lanka 18234 A 55 55
195 Sri_Lanka 18235 G 55 55
196 Sri_Lanka 18236 T 55 55
197 Sri_Lanka 18237 T 55 55
198 Sri_Lanka 18238 A 55 55
199 Sri_Lanka 18239 A 55 55
200 Sri_Lanka 18240 T 55 55
201 Sri_Lanka 18241 G 55 55
202 Sri_Lanka 18242 G 55 55
203 Sri_Lanka 18243 T 55 55
204 Sri_Lanka 18244 T 55 55
205 Sri_Lanka 18245 A 55 55
206 Sri_Lanka 18246 C 55 55
207 Sri_Lanka 18247 C 55 55
208 Sri_Lanka 18248 C 55 55
209 Sri_Lanka 18249 T 55 54
210 Sri_Lanka 18250 A 55 43
211 Sri_Lanka 18251 A 55 41
212 Sri_Lanka 18252 C 55 40
213 Sri_Lanka 18253 A 55 41
214 Sri_Lanka 18254 T 55 41
215 Sri_Lanka 18255 G 55 41
216 Sri_Lanka 18256 T 55 41
217 Sri_Lanka 18257 T 55 41
218 Sri_Lanka 18258 T 55 41
219 Sri_Lanka 18259 A 55 41
220 Sri_Lanka 18260 T 55 41
221 Sri_Lanka 18261 C 55 41
222 Sri_Lanka 18262 A 55 31
223 Sri_Lanka 18263 C 55 31
224 Sri_Lanka 18264 C 55 31
225 Sri_Lanka 18265 C 55 31
226 Sri_Lanka 18266 G 55 27
227 Sri_Lanka 18267 C 55 27
228 Sri_Lanka 18268 G 55 26
229 Sri_Lanka 18269 A 55 25
230 Sri_Lanka 18270 A 55 25
231 Sri_Lanka 18271 G 55 25
232 Sri_Lanka 18272 A 55 25
233 Sri_Lanka 18273 A 55 25
234 Sri_Lanka 18274 G 55 25
235 Sri_Lanka 18275 C 55 26
236 Sri_Lanka 18276 T 55 27
237 Sri_Lanka 18277 A 55 54
238 Sri_Lanka 18278 T 55 54
239 Sri_Lanka 18279 A 55 54
240 Sri_Lanka 18280 A 55 54
241 Sri_Lanka 18281 G 55 54
242 Sri_Lanka 18282 A 55 54
243 Sri_Lanka 18283 C 55 54
244 Sri_Lanka 18284 A 55 54
245 Sri_Lanka 18285 T 55 54
246 Sri_Lanka 18286 G 55 54
247 Sri_Lanka 18287 T 55 54
248 Sri_Lanka 18288 A 55 55
249 Sri_Lanka 18289 C 55 55
250 Sri_Lanka 18290 G 55 55
251 Sri_Lanka 18291 T 55 55
252 Sri_Lanka 18292 G 55 55
253 Sri_Lanka 18293 C 55 55
254 Sri_Lanka 18294 A 55 55
255 Sri_Lanka 18295 T 55 55
256 Sri_Lanka 18296 G 55 55
257 Sri_Lanka 18297 G 55 55
258 Sri_Lanka 18298 A 55 55
259 Sri_Lanka 18299 T 55 55
260 Sri_Lanka 18300 T 55 55
261 Sri_Lanka 18301 G 55 55
262 Sri_Lanka 18302 G 55 55
263 Sri_Lanka 18303 C 55 55
264 Sri_Lanka 18304 T 55 55
265 Sri_Lanka 18305 T 55 55
266 Sri_Lanka 18306 C 55 55
267 Sri_Lanka 18307 G 55 55
268 Sri_Lanka 18308 A 55 55
269 Sri_Lanka 18309 T 55 55
270 Sri_Lanka 18310 G 55 55
271 Sri_Lanka 18311 T 55 55
272 Sri_Lanka 18312 C 55 55
273 Sri_Lanka 18313 G 55 55
274 Sri_Lanka 18314 A 55 55
275 Sri_Lanka 18315 G 55 55
276 Sri_Lanka 18316 G 55 55
277 Sri_Lanka 18317 G 55 55
278 Sri_Lanka 18318 G 55 55
279 Sri_Lanka 18319 T 55 55
280 Sri_Lanka 18320 G 55 55
281 Sri_Lanka 18321 T 55 55
282 Sri_Lanka 18322 C 55 55
283 Sri_Lanka 18323 A 55 55
284 Sri_Lanka 18324 T 55 55
285 Sri_Lanka 18325 G 55 55
286 Sri_Lanka 18326 C 55 55
287 Sri_Lanka 18327 T 55 55
288 Sri_Lanka 18328 A 55 55
289 Sri_Lanka 18329 C 55 54
290 Sri_Lanka 18330 T 55 54
291 Sri_Lanka 18331 A 55 54
292 Sri_Lanka 18332 G 55 54
293 Sri_Lanka 18333 A 55 54
294 Sri_Lanka 18334 G 55 54
295 Sri_Lanka 18335 A 55 54
296 Sri_Lanka 18336 A 55 54
297 Sri_Lanka 18337 G 55 54
298 Sri_Lanka 18338 C 55 54
299 Sri_Lanka 18339 T 55 54
300 Sri_Lanka 18340 G 55 54
301 Sri_Lanka 18341 T 55 55
302 Sri_Lanka 18342 T 55 55
303 Sri_Lanka 18343 G 55 55
304 Sri_Lanka 18344 G 55 55
305 Sri_Lanka 18345 T 55 55
306 Sri_Lanka 18346 A 55 55
307 Sri_Lanka 18347 C 55 55
308 Sri_Lanka 18348 C 55 55
309 Sri_Lanka 18349 A 55 55
310 Sri_Lanka 18350 A 55 55
311 Sri_Lanka 18351 T 55 55
312 Sri_Lanka 18352 T 55 55
313 Sri_Lanka 18353 T 55 55
314 Sri_Lanka 18354 A 55 55
315 Sri_Lanka 18355 C 55 55
316 Sri_Lanka 18356 C 55 55
317 Sri_Lanka 18357 T 55 55
318 Sri_Lanka 18358 T 55 55
319 Sri_Lanka 18359 T 55 55
320 Sri_Lanka 18360 A 55 55
321 Sri_Lanka 18361 C 55 55
322 Sri_Lanka 18362 A 55 55
323 Sri_Lanka 18363 G 55 55
324 Sri_Lanka 18364 C 55 55
325 Sri_Lanka 18365 T 55 55
326 Sri_Lanka 18366 A 55 55
327 Sri_Lanka 18367 G 55 55
328 Sri_Lanka 18368 G 55 55
329 Sri_Lanka 18369 T 55 55
330 Sri_Lanka 18370 T 55 55
331 Sri_Lanka 18371 T 55 55
332 Sri_Lanka 18372 T 55 55
333 Sri_Lanka 18373 T 55 55
334 Sri_Lanka 18374 C 55 55
335 Sri_Lanka 18375 T 55 55
336 Sri_Lanka 18376 A 55 55
337 Sri_Lanka 18377 C 55 55
338 Sri_Lanka 18378 A 55 55
339 Sri_Lanka 18379 G 55 55
340 Sri_Lanka 18380 G 55 55
341 Sri_Lanka 18381 T 55 55
342 Sri_Lanka 18382 G 55 55
343 Sri_Lanka 18383 T 55 55
344 Sri_Lanka 18384 T 55 55
345 Sri_Lanka 18385 A 55 55
346 Sri_Lanka 18386 A 55 55
347 Sri_Lanka 18387 C 55 55
348 Sri_Lanka 18388 C 55 55
349 Sri_Lanka 18389 T 55 55
350 Sri_Lanka 18390 A 55 55
351 Sri_Lanka 18391 G 55 55
352 Sri_Lanka 18392 T 55 55
353 Sri_Lanka 18393 T 55 55
354 Sri_Lanka 18394 G 55 55
355 Sri_Lanka 18395 C 55 55
356 Sri_Lanka 18396 T 55 55
357 Sri_Lanka 18397 G 55 55
358 Sri_Lanka 18398 T 55 55
359 Sri_Lanka 18399 A 55 54
360 Sri_Lanka 18400 C 55 54
361 Sri_Lanka 18401 C 55 54
362 Sri_Lanka 18402 T 55 54
363 Sri_Lanka 18403 A 55 54
364 Sri_Lanka 18404 C 55 54
365 Sri_Lanka 18405 A 55 54
366 Sri_Lanka 18406 G 55 54
367 Sri_Lanka 18407 G 55 54
368 Sri_Lanka 18408 T 55 54
369 Sri_Lanka 18409 T 55 54
370 Sri_Lanka 18410 A 55 54
371 Sri_Lanka 18411 T 55 54
372 Sri_Lanka 18412 G 55 54
373 Sri_Lanka 18413 T 55 54
374 Sri_Lanka 18414 T 55 55
375 Sri_Lanka 18415 G 55 55
376 Sri_Lanka 18416 A 55 54
377 Sri_Lanka 18417 T 55 54
378 Sri_Lanka 18418 A 55 54
379 Sri_Lanka 18419 C 55 54
380 Sri_Lanka 18420 A 55 54
381 Sri_Lanka 18421 C 55 54
382 Sri_Lanka 18422 C 55 54
383 Sri_Lanka 18423 T 55 55
384 Sri_Lanka 18424 A 55 55
385 Sri_Lanka 18425 A 55 55
386 Sri_Lanka 18426 T 55 55
387 Sri_Lanka 18427 A 55 55
388 Sri_Lanka 18428 A 55 52
389 Sri_Lanka 18429 T 55 52
390 Sri_Lanka 18430 A 55 53
391 Sri_Lanka 18431 C 55 53
392 Sri_Lanka 18432 A 55 53
393 Sri_Lanka 18433 G 55 53
394 Sri_Lanka 18434 A 55 53
395 Sri_Lanka 18435 T 55 53
396 Sri_Lanka 18436 T 55 53
397 Sri_Lanka 18437 T 55 53
398 Sri_Lanka 18438 T 55 53
399 Sri_Lanka 18439 T 55 52
400 Sri_Lanka 18440 C T 55 53 Pro6059Ser
401 Sri_Lanka 18441 C 55 54
402 Sri_Lanka 18442 A 55 54
403 Sri_Lanka 18443 G 55 54
404 Sri_Lanka 18444 A 55 54
405 Sri_Lanka 18445 G 55 54
406 Sri_Lanka 18446 T 55 54
407 Sri_Lanka 18447 T 55 54
408 Sri_Lanka 18448 A 55 54
409 Sri_Lanka 18449 G 55 54
410 Sri_Lanka 18450 T 55 54
411 Sri_Lanka 18451 G 55 54
412 Sri_Lanka 18452 C 55 54
413 Sri_Lanka 18453 T 55 54
414 Sri_Lanka 18454 A 55 55
415 Sri_Lanka 18455 A 55 55
416 Sri_Lanka 18456 A 55 55
417 Sri_Lanka 18457 C 55 55
418 Sri_Lanka 18458 C 55 55
419 Sri_Lanka 18459 A 55 55
420 Sri_Lanka 18460 C 55 55
421 Sri_Lanka 18461 C 55 55
422 Sri_Lanka 18462 G 55 55
423 Sri_Lanka 18463 C 55 55
424 Sri_Lanka 18464 C 55 55
425 Sri_Lanka 18465 T 55 55
426 Sri_Lanka 18466 G 55 55
427 Sri_Lanka 18467 G 55 55
428 Sri_Lanka 18468 A 55 55
429 Sri_Lanka 18469 G 55 55
430 Sri_Lanka 18470 A 55 55
431 Sri_Lanka 18471 T 55 55
432 Sri_Lanka 18472 C 55 55
433 Sri_Lanka 18473 A 55 55
434 Sri_Lanka 18474 A 55 55
435 Sri_Lanka 18475 T 55 55
436 Sri_Lanka 18476 T 55 55
437 Sri_Lanka 18477 T 55 55
438 Sri_Lanka 18478 A 55 55
439 Sri_Lanka 18479 A 55 55
440 Sri_Lanka 18480 A 55 55
441 Sri_Lanka 18481 C 55 55
442 Sri_Lanka 18482 A 55 55
443 Sri_Lanka 18483 C 55 55
444 Sri_Lanka 18484 C 55 55
445 Sri_Lanka 18485 T 55 55
446 Sri_Lanka 18486 C 55 55
447 Sri_Lanka 18487 A 55 55
448 Sri_Lanka 18488 T 55 55
449 Sri_Lanka 18489 A 55 55
450 Sri_Lanka 18490 C 55 55
451 Sri_Lanka 18491 C 55 55
452 Sri_Lanka 18492 A 55 50
453 Sri_Lanka 18493 C 55 46
454 Sri_Lanka 18494 T 55 46
455 Sri_Lanka 18495 T 55 45
456 Sri_Lanka 18496 A 55 45
457 Sri_Lanka 18497 T 55 45
458 Sri_Lanka 18498 G 55 46
459 Sri_Lanka 18499 T 55 45
460 Sri_Lanka 18500 A 55 45
461 Sri_Lanka 18501 C 55 46
462 Sri_Lanka 18502 A 55 46
463 Sri_Lanka 18503 A 55 46
464 Sri_Lanka 18504 A 55 42
465 Sri_Lanka 18505 G 55 42
466 Sri_Lanka 18506 G 55 42
467 Sri_Lanka 18507 A 55 42
468 Sri_Lanka 18508 C 55 42
469 Sri_Lanka 18509 T 55 42
470 Sri_Lanka 18510 T 55 43
471 Sri_Lanka 18511 C 55 43
472 Sri_Lanka 18512 C 55 42
473 Sri_Lanka 18513 T 55 41
474 Sri_Lanka 18514 T 55 41
475 Sri_Lanka 18515 G 55 43
476 Sri_Lanka 18516 G 55 43
477 Sri_Lanka 18517 A 55 43
478 Sri_Lanka 18518 A 55 43
479 Sri_Lanka 18519 T 55 43
480 Sri_Lanka 18520 G 55 46
481 Sri_Lanka 18521 T 55 49
482 Sri_Lanka 18522 A 55 48
483 Sri_Lanka 18523 G 55 48
484 Sri_Lanka 18524 T 55 48
485 Sri_Lanka 18525 G 55 55
486 Sri_Lanka 18526 C 55 55
487 Sri_Lanka 18527 G 55 55
488 Sri_Lanka 18528 T 55 55
489 Sri_Lanka 18529 A 55 55
490 Sri_Lanka 18530 T 55 55
491 Sri_Lanka 18531 A 55 55
492 Sri_Lanka 18532 A 55 55
493 Sri_Lanka 18533 A 55 55
494 Sri_Lanka 18534 G 55 55
495 Sri_Lanka 18535 A 55 55
496 Sri_Lanka 18536 T 55 55
497 Sri_Lanka 18537 T 55 55
498 Sri_Lanka 18538 G 55 55
499 Sri_Lanka 18539 T 55 55
500 Sri_Lanka 18540 A 55 55
501 Sri_Lanka 18541 C 55 55
502 Sri_Lanka 18542 A 55 55
503 Sri_Lanka 18543 A 55 55
504 Sri_Lanka 18544 A 55 55
505 Sri_Lanka 18545 T 55 55
506 Sri_Lanka 18546 G 55 55
507 Sri_Lanka 18547 T 55 55
508 Sri_Lanka 18548 T 55 55
509 Sri_Lanka 18549 A 55 55
510 Sri_Lanka 18550 A 55 55
511 Sri_Lanka 18551 G 55 55
512 Sri_Lanka 18552 T 55 55
513 Sri_Lanka 18553 G 55 55
514 Sri_Lanka 18554 A 55 55
515 Sri_Lanka 18555 C 55 55
516 Sri_Lanka 18556 A 55 55
517 Sri_Lanka 18557 C 55 55
518 Sri_Lanka 18558 A 55 55
519 Sri_Lanka 18559 C 55 55
520 Sri_Lanka 18560 T 55 55
521 Sri_Lanka 18561 T 55 55
522 Sri_Lanka 18562 A 55 55
523 Sri_Lanka 18563 A 55 55
524 Sri_Lanka 18564 A 55 55
525 Sri_Lanka 18565 A 55 55
526 Sri_Lanka 18566 A 55 55
527 Sri_Lanka 18567 T 55 55
528 Sri_Lanka 18568 C 55 55
529 Sri_Lanka 18569 T 55 55
530 Sri_Lanka 18570 C 55 55
531 Sri_Lanka 18571 T 55 55
532 Sri_Lanka 18572 C 55 55
533 Sri_Lanka 18573 T 55 55
534 Sri_Lanka 18574 G 55 55
535 Sri_Lanka 18575 A 55 55
536 Sri_Lanka 18576 C 55 55
537 Sri_Lanka 18577 A 55 55
538 Sri_Lanka 18578 G 55 55
539 Sri_Lanka 18579 A 55 55
540 Sri_Lanka 18580 G 55 55
541 Sri_Lanka 18581 T 55 55
542 Sri_Lanka 18582 C 55 55
543 Sri_Lanka 18583 G 55 55
544 Sri_Lanka 18584 T 55 55
545 Sri_Lanka 18585 A 55 55
546 Sri_Lanka 18586 T 55 55
547 Sri_Lanka 18587 T 55 55
548 Sri_Lanka 18588 T 55 55
549 Sri_Lanka 18589 G 55 55
550 Sri_Lanka 18590 T 55 55
551 Sri_Lanka 18591 C 55 55
552 Sri_Lanka 18592 T 55 55
553 Sri_Lanka 18593 T 55 55
554 Sri_Lanka 18594 A 55 55
555 Sri_Lanka 18595 T 55 55
556 Sri_Lanka 18596 G 55 55
557 Sri_Lanka 18597 G 55 55
558 Sri_Lanka 18598 G 55 55
559 Sri_Lanka 18599 C 55 55
560 Sri_Lanka 18600 A 55 55
561 Sri_Lanka 18601 C 55 55
562 Sri_Lanka 18602 A 55 55
563 Sri_Lanka 18603 T 55 55
564 Sri_Lanka 18604 G 55 55
565 Sri_Lanka 18605 G 55 55
566 Sri_Lanka 18606 C 55 55
567 Sri_Lanka 18607 T 55 55
568 Sri_Lanka 18608 T 55 55
569 Sri_Lanka 18609 T 55 55
570 Sri_Lanka 18610 G 55 55
571 Sri_Lanka 18611 A 55 55
572 Sri_Lanka 18612 G 55 55
573 Sri_Lanka 18613 T 55 55
574 Sri_Lanka 18614 T 55 55
575 Sri_Lanka 18615 G 55 55
576 Sri_Lanka 18616 A 55 55
577 Sri_Lanka 18617 C 55 55
578 Sri_Lanka 18618 A 55 55
579 Sri_Lanka 18619 T 55 55
580 Sri_Lanka 18620 C 55 55
581 Sri_Lanka 18621 T 55 55
582 Sri_Lanka 18622 A 55 55
583 Sri_Lanka 18623 T 55 55
584 Sri_Lanka 18624 G 55 55
585 Sri_Lanka 18625 A 55 55
586 Sri_Lanka 18626 A 55 55
587 Sri_Lanka 18627 G 55 55
588 Sri_Lanka 18628 T 55 55
589 Sri_Lanka 18629 A 55 55
590 Sri_Lanka 18630 T 55 55
591 Sri_Lanka 18631 T 55 55
592 Sri_Lanka 18632 T 55 55
593 Sri_Lanka 18633 T 55 55
594 Sri_Lanka 18634 G 55 55
595 Sri_Lanka 18635 T 55 55
596 Sri_Lanka 18636 G 55 55
597 Sri_Lanka 18637 A 55 55
598 Sri_Lanka 18638 A 55 55
599 Sri_Lanka 18639 A 55 55
600 Sri_Lanka 18640 A 55 55
601 Sri_Lanka 18641 T 55 55
602 Sri_Lanka 18642 A 55 55
603 Sri_Lanka 18643 G 55 55
604 Sri_Lanka 18644 G 55 55
605 Sri_Lanka 18645 A 55 55
606 Sri_Lanka 18646 C 55 55
607 Sri_Lanka 18647 C T 55 54 Leu6128Leu
608 Sri_Lanka 18648 T 55 55
609 Sri_Lanka 18649 G 55 55
610 Sri_Lanka 18650 A 55 55
611 Sri_Lanka 18651 G 55 55
612 Sri_Lanka 18652 C 55 55
613 Sri_Lanka 18653 G 55 55
614 Sri_Lanka 18654 C 55 55
615 Sri_Lanka 18655 A 55 55
616 Sri_Lanka 18656 C 55 55
617 Sri_Lanka 18657 C 55 55
618 Sri_Lanka 18658 T 55 55
619 Sri_Lanka 18659 G 55 55
620 Sri_Lanka 18660 T 55 55
621 Sri_Lanka 18661 T 55 55
622 Sri_Lanka 18662 G 55 55
623 Sri_Lanka 18663 T 55 55
624 Sri_Lanka 18664 C 55 55
625 Sri_Lanka 18665 T 55 55
626 Sri_Lanka 18666 A 55 55
627 Sri_Lanka 18667 T 55 55
628 Sri_Lanka 18668 G 55 55
629 Sri_Lanka 18669 T 55 55
630 Sri_Lanka 18670 G 55 55
631 Sri_Lanka 18671 A 55 54
632 Sri_Lanka 18672 T 55 54
633 Sri_Lanka 18673 A 55 54
634 Sri_Lanka 18674 G 55 54
635 Sri_Lanka 18675 A 55 54
636 Sri_Lanka 18676 C 55 51
637 Sri_Lanka 18677 G 55 52
638 Sri_Lanka 18678 T 55 51
639 Sri_Lanka 18679 G 55 51
640 Sri_Lanka 18680 C 55 51
641 Sri_Lanka 18681 C 55 51
642 Sri_Lanka 18682 A 55 43
643 Sri_Lanka 18683 C 55 43
644 Sri_Lanka 18684 A 55 43
645 Sri_Lanka 18685 T 55 44
646 Sri_Lanka 18686 G 55 43
647 Sri_Lanka 18687 C 55 44
648 Sri_Lanka 18688 T 55 44
649 Sri_Lanka 18689 T 55 46
650 Sri_Lanka 18690 T 55 46
651 Sri_Lanka 18691 T 55 46
652 Sri_Lanka 18692 C 55 46
653 Sri_Lanka 18693 C 55 46
654 Sri_Lanka 18694 A 55 46
655 Sri_Lanka 18695 C 55 46
656 Sri_Lanka 18696 T 55 46
657 Sri_Lanka 18697 G 55 46
658 Sri_Lanka 18698 C 55 47
659 Sri_Lanka 18699 T 55 47
660 Sri_Lanka 18700 T 55 47
661 Sri_Lanka 18701 C 55 46
662 Sri_Lanka 18702 A 55 46
663 Sri_Lanka 18703 G 55 46
664 Sri_Lanka 18704 A 55 46
665 Sri_Lanka 18705 C 55 47
666 Sri_Lanka 18706 A 55 49
667 Sri_Lanka 18707 C 55 49
668 Sri_Lanka 18708 T 55 49
669 Sri_Lanka 18709 T 55 49
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671 Sri_Lanka 18711 T 55 49
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674 Sri_Lanka 18714 C 55 49
675 Sri_Lanka 18715 T 55 49
676 Sri_Lanka 18716 G 55 49
677 Sri_Lanka 18717 T 55 49
678 Sri_Lanka 18718 T 55 49
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1022 Sri_Lanka 19062 A 60 60
1023 Sri_Lanka 19063 C 60 60
1024 Sri_Lanka 19064 C 60 60
1025 Sri_Lanka 19065 T 60 60
1026 Sri_Lanka 19066 C 60 60
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1028 Sri_Lanka 19068 A 60 60
1029 Sri_Lanka 19069 G 60 60
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1033 Sri_Lanka 19073 A G 60 59 Met6270Val
1034 Sri_Lanka 19074 T 60 60
1035 Sri_Lanka 19075 G 60 60
1036 Sri_Lanka 19076 T 60 60
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1041 Sri_Lanka 19081 T 60 60
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1358 Sri_Lanka 19398 G 60 60
1359 Sri_Lanka 19399 T 60 60
1360 Sri_Lanka 19400 C 60 60
1361 Sri_Lanka 19401 T 60 60
1362 Sri_Lanka 19402 C 60 60
1363 Sri_Lanka 19403 A 58 50
1364 Sri_Lanka 19404 T 58 50
1365 Sri_Lanka 19405 G 58 50
1366 Sri_Lanka 19406 G 58 48
1367 Sri_Lanka 19407 A 58 48
1368 Sri_Lanka 19408 A 58 48
1369 Sri_Lanka 19409 A 58 48
1370 Sri_Lanka 19410 A 58 48
1371 Sri_Lanka 19411 C 58 48
1372 Sri_Lanka 19412 A 58 48
1373 Sri_Lanka 19413 A 58 49
1374 Sri_Lanka 19414 G 58 49
1375 Sri_Lanka 19415 T 58 50
1376 Sri_Lanka 19416 A 57 43
1377 Sri_Lanka 19417 G 56 42
1378 Sri_Lanka 19418 T 56 42
1379 Sri_Lanka 19419 G 56 40
1380 Sri_Lanka 19420 T 56 40
1381 Sri_Lanka 19421 C 56 40
1382 Sri_Lanka 19422 A 56 40
1383 Sri_Lanka 19423 G 56 40
1384 Sri_Lanka 19424 A 56 40
1385 Sri_Lanka 19425 T 56 40
1386 Sri_Lanka 19426 A 56 40
1387 Sri_Lanka 19427 T 56 40
1388 Sri_Lanka 19428 A 56 40
1389 Sri_Lanka 19429 G 56 40
1390 Sri_Lanka 19430 A 56 40
1391 Sri_Lanka 19431 T 56 40
1392 Sri_Lanka 19432 T 56 40
1393 Sri_Lanka 19433 A 56 40
1394 Sri_Lanka 19434 T 56 40
1395 Sri_Lanka 19435 G 56 40
1396 Sri_Lanka 19436 T 56 41
1397 Sri_Lanka 19437 A 56 41
1398 Sri_Lanka 19438 C 56 41
1399 Sri_Lanka 19439 C 56 41
1400 Sri_Lanka 19440 A 56 41
1401 Sri_Lanka 19441 C 56 41
1402 Sri_Lanka 19442 T 56 41
1403 Sri_Lanka 19443 A 56 42
1404 Sri_Lanka 19444 A 56 42
1405 Sri_Lanka 19445 A 56 42
1406 Sri_Lanka 19446 G 56 42
1407 Sri_Lanka 19447 T 56 42
1408 Sri_Lanka 19448 C 56 40
1409 Sri_Lanka 19449 T 56 40
1410 Sri_Lanka 19450 G 56 40
1411 Sri_Lanka 19451 C 56 29
1412 Sri_Lanka 19452 T 56 30
1413 Sri_Lanka 19453 A 56 56
1414 Sri_Lanka 19454 C 56 56
1415 Sri_Lanka 19455 G 56 56
1416 Sri_Lanka 19456 T 56 56
1417 Sri_Lanka 19457 G 56 56
1418 Sri_Lanka 19458 T 56 56
1419 Sri_Lanka 19459 A 56 56
1420 Sri_Lanka 19460 T 56 56
1421 Sri_Lanka 19461 A 56 56
1422 Sri_Lanka 19462 A 56 56
1423 Sri_Lanka 19463 C 56 56
1424 Sri_Lanka 19464 A 56 56
1425 Sri_Lanka 19465 C 56 56
1426 Sri_Lanka 19466 G 56 56
1427 Sri_Lanka 19467 T 56 56
1428 Sri_Lanka 19468 T 56 56
1429 Sri_Lanka 19469 G 56 56
1430 Sri_Lanka 19470 C 56 56
1431 Sri_Lanka 19471 A 56 56
1432 Sri_Lanka 19472 A 56 56
1433 Sri_Lanka 19473 T 56 56
1434 Sri_Lanka 19474 T G 56 55 Ile6403Met
1435 Sri_Lanka 19475 T 56 56
1436 Sri_Lanka 19476 A 56 56
1437 Sri_Lanka 19477 G 56 56
1438 Sri_Lanka 19478 G 56 56
1439 Sri_Lanka 19479 T 56 56
1440 Sri_Lanka 19480 G 56 56
1441 Sri_Lanka 19481 G 56 56
1442 Sri_Lanka 19482 T 56 56
1443 Sri_Lanka 19483 G 56 56
1444 Sri_Lanka 19484 C 56 56
1445 Sri_Lanka 19485 T 56 56
1446 Sri_Lanka 19486 G 56 56
1447 Sri_Lanka 19487 T 56 56
1448 Sri_Lanka 19488 C 56 56
1449 Sri_Lanka 19489 T 56 56
1450 Sri_Lanka 19490 G 56 56
1451 Sri_Lanka 19491 T 56 56
1452 Sri_Lanka 19492 A 56 56
1453 Sri_Lanka 19493 G 56 56
1454 Sri_Lanka 19494 A 56 56
1455 Sri_Lanka 19495 C 56 56
1456 Sri_Lanka 19496 A 56 56
1457 Sri_Lanka 19497 T 56 56
1458 Sri_Lanka 19498 C 56 56
1459 Sri_Lanka 19499 A 56 56
1460 Sri_Lanka 19500 T 56 56
1461 Sri_Lanka 19501 G 56 56
1462 Sri_Lanka 19502 C 56 56
1463 Sri_Lanka 19503 T 56 56
1464 Sri_Lanka 19504 A 56 56
1465 Sri_Lanka 19505 A 56 56
1466 Sri_Lanka 19506 T 56 56
1467 Sri_Lanka 19507 G 56 56
1468 Sri_Lanka 19508 A 56 56
1469 Sri_Lanka 19509 G 56 56
1470 Sri_Lanka 19510 T 56 56
1471 Sri_Lanka 19511 A 56 56
1472 Sri_Lanka 19512 C 56 56
1473 Sri_Lanka 19513 A 56 56
1474 Sri_Lanka 19514 G 56 56
1475 Sri_Lanka 19515 A 56 56
1476 Sri_Lanka 19516 T 56 56
1477 Sri_Lanka 19517 T 56 56
1478 Sri_Lanka 19518 G 56 56
1479 Sri_Lanka 19519 T 56 56
1480 Sri_Lanka 19520 A 56 56
1481 Sri_Lanka 19521 T 56 56
1482 Sri_Lanka 19522 C 56 56
1483 Sri_Lanka 19523 T 56 56
1484 Sri_Lanka 19524 C 56 56
1485 Sri_Lanka 19525 G 56 56
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1487 Sri_Lanka 19527 T 56 56
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1489 Sri_Lanka 19529 C 56 56
1490 Sri_Lanka 19530 T 56 56
1491 Sri_Lanka 19531 T 56 56
1492 Sri_Lanka 19532 A 56 48
1493 Sri_Lanka 19533 T 56 47
1494 Sri_Lanka 19534 A 56 47
1495 Sri_Lanka 19535 A 56 47
1496 Sri_Lanka 19536 C 56 47
1497 Sri_Lanka 19537 A 56 47
1498 Sri_Lanka 19538 T 56 47
1499 Sri_Lanka 19539 G 56 47
1500 Sri_Lanka 19540 A 56 47
1501 Sri_Lanka 19541 T 56 47
1502 Sri_Lanka 19542 G 56 47
1503 Sri_Lanka 19543 A 56 45
1504 Sri_Lanka 19544 T 56 45
1505 Sri_Lanka 19545 C T 56 44 Ser6427Phe
1506 Sri_Lanka 19546 T 56 45
1507 Sri_Lanka 19547 C 56 45
1508 Sri_Lanka 19548 A 56 45
1509 Sri_Lanka 19549 G 56 45
1510 Sri_Lanka 19550 C 56 45
1511 Sri_Lanka 19551 T 56 45
1512 Sri_Lanka 19552 G 56 45
1513 Sri_Lanka 19553 G 56 45
1514 Sri_Lanka 19554 C 56 45
1515 Sri_Lanka 19555 T 56 45
1516 Sri_Lanka 19556 T 56 45
1517 Sri_Lanka 19557 T 56 46
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1519 Sri_Lanka 19559 G 56 46
1520 Sri_Lanka 19560 C 56 46
1521 Sri_Lanka 19561 T 56 46
1522 Sri_Lanka 19562 T 56 48
1523 Sri_Lanka 19563 G 56 48
1524 Sri_Lanka 19564 T 56 48
1525 Sri_Lanka 19565 G 56 48
1526 Sri_Lanka 19566 G 56 48
1527 Sri_Lanka 19567 G 56 48
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1531 Sri_Lanka 19571 A 56 56
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1575 Sri_Lanka 19615 C 56 56
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1579 Sri_Lanka 19619 A 56 56
1580 Sri_Lanka 19620 G 56 56