National Institute Of Genetic Engineering and Biotechnology

P.I:Mohammad-Ali Malboobi
Here we provide last mutation observed in Nucleocapsid gene of COVID-19 prevalent in Iran.
We kindly wait your comment or coopration in tracking crona virus project.
Amino acid changes

How to read this table:
- Rows are reference amino acids and columns are changed amino acids. E.g. Row 'A' column 'E' indicates how many 'A' amino acids have been replaced by 'E' amino acids.
- Red background colors indicate that more changes happened (heat-map).
- Diagonals are indicated using grey background color
- WARNING: This table may include different translation codon tables (e.g. mamalian DNA and mitochondrial DNA).

  * - ? A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
*     99                                        
-     1,581                                        
?                                              
A     42                                        
C     33                                        
D     36                                        
E     24                                        
F     39                                        
G     39                                        
H     63             1                          
I     123                                        
K     70                                        
L     312                                        
M     93                                        
N     57                                        
P     30                                        
Q     42                                        
R     35                                        
S     120                                        
T     105                                        
V     147                                        
W     6                                        
Y     66                                        

Nucleotide and amino acid mutations

Here we provide list of mutation observed in Nucleocapsid at gene and protein of COVID-19.
-The position column is nucleotide position in reference genome as NC_045512.2
-The Reference column indicate reference nucleotide in NC_045512.2
-The NS column indicate number of samples that this position have been observed
-The NSR column indicate number of samples with reference nucleotide. Therefore diffrenciate related to Ns indicate number of sample with mutated nucleotide
Contoury Position Reference Alt. NSR NS AAchange
0 Brunei 18040 G 5 5
1 Brunei 18041 C 5 5
2 Brunei 18042 T 5 5
3 Brunei 18043 G 5 5
4 Brunei 18044 A 5 5
5 Brunei 18045 A 5 5
6 Brunei 18046 A 5 5
7 Brunei 18047 A 5 5
8 Brunei 18048 T 5 5
9 Brunei 18049 G 5 5
10 Brunei 18050 T 5 5
11 Brunei 18051 A 5 5
12 Brunei 18052 A 5 5
13 Brunei 18053 C 5 5
14 Brunei 18054 A 5 5
15 Brunei 18055 G 5 5
16 Brunei 18056 G 5 5
17 Brunei 18057 A 5 5
18 Brunei 18058 C 5 5
19 Brunei 18059 T 5 5
20 Brunei 18060 C 5 5
21 Brunei 18061 T 5 5
22 Brunei 18062 T 5 5
23 Brunei 18063 T 5 5
24 Brunei 18064 A 5 5
25 Brunei 18065 A 5 5
26 Brunei 18066 A 5 5
27 Brunei 18067 G 5 5
28 Brunei 18068 A 5 5
29 Brunei 18069 T 5 5
30 Brunei 18070 T 5 5
31 Brunei 18071 G 5 5
32 Brunei 18072 T 5 5
33 Brunei 18073 A 5 5
34 Brunei 18074 G 5 5
35 Brunei 18075 T 5 5
36 Brunei 18076 A 5 5
37 Brunei 18077 A 5 5
38 Brunei 18078 G 5 5
39 Brunei 18079 G 5 5
40 Brunei 18080 T 5 5
41 Brunei 18081 A 5 5
42 Brunei 18082 A 5 5
43 Brunei 18083 T 5 5
44 Brunei 18084 C 5 5
45 Brunei 18085 A 5 5
46 Brunei 18086 C 5 5
47 Brunei 18087 T 5 5
48 Brunei 18088 G 5 5
49 Brunei 18089 G 5 5
50 Brunei 18090 G 5 5
51 Brunei 18091 T 5 5
52 Brunei 18092 T 5 5
53 Brunei 18093 A 5 5
54 Brunei 18094 C 5 5
55 Brunei 18095 A 5 5
56 Brunei 18096 T 5 5
57 Brunei 18097 C 5 5
58 Brunei 18098 C 5 5
59 Brunei 18099 T 5 5
60 Brunei 18100 A 5 5
61 Brunei 18101 C 5 5
62 Brunei 18102 A 5 5
63 Brunei 18103 C 5 5
64 Brunei 18104 A 5 5
65 Brunei 18105 G 5 5
66 Brunei 18106 G 5 5
67 Brunei 18107 C 5 5
68 Brunei 18108 A 5 5
69 Brunei 18109 C 5 5
70 Brunei 18110 C 5 5
71 Brunei 18111 T 5 5
72 Brunei 18112 A 5 5
73 Brunei 18113 C 5 5
74 Brunei 18114 A 5 5
75 Brunei 18115 C T 5 4 His5950His
76 Brunei 18116 A 5 5
77 Brunei 18117 C 5 5
78 Brunei 18118 C 5 5
79 Brunei 18119 T 5 5
80 Brunei 18120 C 5 5
81 Brunei 18121 A 5 5
82 Brunei 18122 G 5 5
83 Brunei 18123 T 5 5
84 Brunei 18124 G 5 5
85 Brunei 18125 T 5 5
86 Brunei 18126 T 5 5
87 Brunei 18127 G 5 5
88 Brunei 18128 A 5 5
89 Brunei 18129 C 5 5
90 Brunei 18130 A 5 5
91 Brunei 18131 C 5 5
92 Brunei 18132 T 5 5
93 Brunei 18133 A 5 5
94 Brunei 18134 A 5 5
95 Brunei 18135 A 5 5
96 Brunei 18136 T 5 5
97 Brunei 18137 T 5 5
98 Brunei 18138 C 5 5
99 Brunei 18139 A 5 5
100 Brunei 18140 A 5 5
101 Brunei 18141 A 5 5
102 Brunei 18142 A 5 5
103 Brunei 18143 C 5 5
104 Brunei 18144 T 5 5
105 Brunei 18145 G 5 5
106 Brunei 18146 A 5 5
107 Brunei 18147 A 5 5
108 Brunei 18148 G 5 5
109 Brunei 18149 G 5 5
110 Brunei 18150 T 5 5
111 Brunei 18151 T 5 5
112 Brunei 18152 T 5 5
113 Brunei 18153 A 5 5
114 Brunei 18154 T 5 5
115 Brunei 18155 G 5 5
116 Brunei 18156 T 5 5
117 Brunei 18157 G 5 5
118 Brunei 18158 T 5 5
119 Brunei 18159 T 5 5
120 Brunei 18160 G 5 5
121 Brunei 18161 A 5 5
122 Brunei 18162 C 5 5
123 Brunei 18163 A 5 5
124 Brunei 18164 T 5 5
125 Brunei 18165 A 5 5
126 Brunei 18166 C 5 5
127 Brunei 18167 C 5 5
128 Brunei 18168 T 5 5
129 Brunei 18169 G 5 5
130 Brunei 18170 G 5 5
131 Brunei 18171 C 5 5
132 Brunei 18172 A 5 5
133 Brunei 18173 T 5 5
134 Brunei 18174 A 5 5
135 Brunei 18175 C 5 5
136 Brunei 18176 C 5 5
137 Brunei 18177 T 5 5
138 Brunei 18178 A 5 5
139 Brunei 18179 A 5 5
140 Brunei 18180 G 5 5
141 Brunei 18181 G 5 5
142 Brunei 18182 A 5 5
143 Brunei 18183 C 5 5
144 Brunei 18184 A 5 5
145 Brunei 18185 T 5 5
146 Brunei 18186 G 5 5
147 Brunei 18187 A 5 5
148 Brunei 18188 C 5 5
149 Brunei 18189 C 5 5
150 Brunei 18190 T 5 5
151 Brunei 18191 A 5 5
152 Brunei 18192 T 5 5
153 Brunei 18193 A 5 5
154 Brunei 18194 G 5 5
155 Brunei 18195 A 5 5
156 Brunei 18196 A 5 5
157 Brunei 18197 G 5 5
158 Brunei 18198 A 5 5
159 Brunei 18199 C 5 5
160 Brunei 18200 T 5 5
161 Brunei 18201 C 5 5
162 Brunei 18202 A 5 5
163 Brunei 18203 T 5 5
164 Brunei 18204 C 5 5
165 Brunei 18205 T 5 5
166 Brunei 18206 C 5 5
167 Brunei 18207 T 5 5
168 Brunei 18208 A 5 5
169 Brunei 18209 T 5 5
170 Brunei 18210 G 5 5
171 Brunei 18211 A 5 5
172 Brunei 18212 T 5 5
173 Brunei 18213 G 5 5
174 Brunei 18214 G 5 5
175 Brunei 18215 G 5 5
176 Brunei 18216 T 5 5
177 Brunei 18217 T 5 5
178 Brunei 18218 T 5 5
179 Brunei 18219 T 5 5
180 Brunei 18220 A 5 5
181 Brunei 18221 A 5 5
182 Brunei 18222 A 5 5
183 Brunei 18223 A 5 5
184 Brunei 18224 T 5 5
185 Brunei 18225 G 5 5
186 Brunei 18226 A 5 5
187 Brunei 18227 A 5 5
188 Brunei 18228 T 5 5
189 Brunei 18229 T 5 5
190 Brunei 18230 A 5 5
191 Brunei 18231 T 5 5
192 Brunei 18232 C 5 5
193 Brunei 18233 A 5 5
194 Brunei 18234 A 5 5
195 Brunei 18235 G 5 5
196 Brunei 18236 T 5 5
197 Brunei 18237 T 5 5
198 Brunei 18238 A 5 5
199 Brunei 18239 A 5 5
200 Brunei 18240 T 5 5
201 Brunei 18241 G 5 5
202 Brunei 18242 G 5 5
203 Brunei 18243 T 5 5
204 Brunei 18244 T 5 5
205 Brunei 18245 A 5 5
206 Brunei 18246 C 5 5
207 Brunei 18247 C 5 5
208 Brunei 18248 C 5 5
209 Brunei 18249 T 5 5
210 Brunei 18250 A 5 5
211 Brunei 18251 A 5 5
212 Brunei 18252 C 5 5
213 Brunei 18253 A 5 5
214 Brunei 18254 T 5 5
215 Brunei 18255 G 5 5
216 Brunei 18256 T 5 5
217 Brunei 18257 T 5 5
218 Brunei 18258 T 5 5
219 Brunei 18259 A 5 5
220 Brunei 18260 T 5 5
221 Brunei 18261 C 5 5
222 Brunei 18262 A 5 5
223 Brunei 18263 C 5 5
224 Brunei 18264 C 5 5
225 Brunei 18265 C 5 5
226 Brunei 18266 G 5 5
227 Brunei 18267 C 5 5
228 Brunei 18268 G 5 5
229 Brunei 18269 A 5 5
230 Brunei 18270 A 5 5
231 Brunei 18271 G 5 5
232 Brunei 18272 A 5 5
233 Brunei 18273 A 5 5
234 Brunei 18274 G 5 5
235 Brunei 18275 C 5 5
236 Brunei 18276 T 5 5
237 Brunei 18277 A 5 5
238 Brunei 18278 T 5 5
239 Brunei 18279 A 5 5
240 Brunei 18280 A 5 5
241 Brunei 18281 G 5 5
242 Brunei 18282 A 5 5
243 Brunei 18283 C 5 5
244 Brunei 18284 A 5 5
245 Brunei 18285 T 5 5
246 Brunei 18286 G 5 5
247 Brunei 18287 T 5 5
248 Brunei 18288 A 5 5
249 Brunei 18289 C 5 5
250 Brunei 18290 G 5 5
251 Brunei 18291 T 5 5
252 Brunei 18292 G 5 5
253 Brunei 18293 C 5 5
254 Brunei 18294 A 5 5
255 Brunei 18295 T 5 5
256 Brunei 18296 G 5 5
257 Brunei 18297 G 5 5
258 Brunei 18298 A 5 5
259 Brunei 18299 T 5 5
260 Brunei 18300 T 5 5
261 Brunei 18301 G 5 5
262 Brunei 18302 G 5 5
263 Brunei 18303 C 5 5
264 Brunei 18304 T 5 5
265 Brunei 18305 T 5 5
266 Brunei 18306 C 5 5
267 Brunei 18307 G 5 5
268 Brunei 18308 A 5 5
269 Brunei 18309 T 5 5
270 Brunei 18310 G 5 5
271 Brunei 18311 T 5 5
272 Brunei 18312 C 5 5
273 Brunei 18313 G 5 5
274 Brunei 18314 A 5 5
275 Brunei 18315 G 5 5
276 Brunei 18316 G 5 5
277 Brunei 18317 G 5 5
278 Brunei 18318 G 5 5
279 Brunei 18319 T 5 5
280 Brunei 18320 G 5 5
281 Brunei 18321 T 5 5
282 Brunei 18322 C 5 5
283 Brunei 18323 A 5 5
284 Brunei 18324 T 5 5
285 Brunei 18325 G 5 5
286 Brunei 18326 C 5 5
287 Brunei 18327 T 5 5
288 Brunei 18328 A 5 5
289 Brunei 18329 C 5 5
290 Brunei 18330 T 5 5
291 Brunei 18331 A 5 5
292 Brunei 18332 G 5 5
293 Brunei 18333 A 5 5
294 Brunei 18334 G 5 5
295 Brunei 18335 A 5 5
296 Brunei 18336 A 5 5
297 Brunei 18337 G 5 5
298 Brunei 18338 C 5 5
299 Brunei 18339 T 5 5
300 Brunei 18340 G 5 5
301 Brunei 18341 T 5 5
302 Brunei 18342 T 5 5
303 Brunei 18343 G 5 5
304 Brunei 18344 G 5 5
305 Brunei 18345 T 5 5
306 Brunei 18346 A 5 5
307 Brunei 18347 C 5 5
308 Brunei 18348 C 5 5
309 Brunei 18349 A 5 5
310 Brunei 18350 A 5 5
311 Brunei 18351 T 5 5
312 Brunei 18352 T 5 5
313 Brunei 18353 T 5 5
314 Brunei 18354 A 5 5
315 Brunei 18355 C 5 5
316 Brunei 18356 C 5 5
317 Brunei 18357 T 5 5
318 Brunei 18358 T 5 5
319 Brunei 18359 T 5 5
320 Brunei 18360 A 5 5
321 Brunei 18361 C 5 5
322 Brunei 18362 A 5 5
323 Brunei 18363 G 5 5
324 Brunei 18364 C 5 5
325 Brunei 18365 T 5 5
326 Brunei 18366 A 5 5
327 Brunei 18367 G 5 5
328 Brunei 18368 G 5 5
329 Brunei 18369 T 5 5
330 Brunei 18370 T 5 5
331 Brunei 18371 T 5 5
332 Brunei 18372 T 5 5
333 Brunei 18373 T 5 5
334 Brunei 18374 C 5 5
335 Brunei 18375 T 5 5
336 Brunei 18376 A 5 5
337 Brunei 18377 C 5 5
338 Brunei 18378 A 5 5
339 Brunei 18379 G 5 5
340 Brunei 18380 G 5 5
341 Brunei 18381 T 5 5
342 Brunei 18382 G 5 5
343 Brunei 18383 T 5 5
344 Brunei 18384 T 5 5
345 Brunei 18385 A 5 5
346 Brunei 18386 A 5 5
347 Brunei 18387 C 5 5
348 Brunei 18388 C 5 5
349 Brunei 18389 T 5 5
350 Brunei 18390 A 5 5
351 Brunei 18391 G 5 5
352 Brunei 18392 T 5 5
353 Brunei 18393 T 5 5
354 Brunei 18394 G 5 5
355 Brunei 18395 C 5 5
356 Brunei 18396 T 5 5
357 Brunei 18397 G 5 5
358 Brunei 18398 T 5 5
359 Brunei 18399 A 5 5
360 Brunei 18400 C 5 5
361 Brunei 18401 C 5 5
362 Brunei 18402 T 5 5
363 Brunei 18403 A 5 5
364 Brunei 18404 C 5 5
365 Brunei 18405 A 5 5
366 Brunei 18406 G 5 5
367 Brunei 18407 G 5 5
368 Brunei 18408 T 5 5
369 Brunei 18409 T 5 5
370 Brunei 18410 A 5 5
371 Brunei 18411 T 5 5
372 Brunei 18412 G 5 5
373 Brunei 18413 T 5 5
374 Brunei 18414 T 5 5
375 Brunei 18415 G 5 5
376 Brunei 18416 A 5 5
377 Brunei 18417 T 5 5
378 Brunei 18418 A 5 5
379 Brunei 18419 C 5 5
380 Brunei 18420 A 5 5
381 Brunei 18421 C 5 5
382 Brunei 18422 C 5 5
383 Brunei 18423 T 5 5
384 Brunei 18424 A 5 5
385 Brunei 18425 A 5 5
386 Brunei 18426 T 5 5
387 Brunei 18427 A 5 5
388 Brunei 18428 A 5 5
389 Brunei 18429 T 5 5
390 Brunei 18430 A 5 5
391 Brunei 18431 C 5 5
392 Brunei 18432 A 5 5
393 Brunei 18433 G 5 5
394 Brunei 18434 A 5 5
395 Brunei 18435 T 5 5
396 Brunei 18436 T 5 5
397 Brunei 18437 T 5 5
398 Brunei 18438 T 5 5
399 Brunei 18439 T 5 5
400 Brunei 18440 C 5 5
401 Brunei 18441 C 5 5
402 Brunei 18442 A 5 5
403 Brunei 18443 G 5 5
404 Brunei 18444 A 5 5
405 Brunei 18445 G 5 5
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859 Brunei 18899 T 5 5
860 Brunei 18900 T 5 5
861 Brunei 18901 A 5 5
862 Brunei 18902 A 5 5
863 Brunei 18903 G 5 5
864 Brunei 18904 C 5 5
865 Brunei 18905 G 5 5
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867 Brunei 18907 G 5 5
868 Brunei 18908 T 5 5
869 Brunei 18909 T 5 5
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1298 Brunei 19338 A 5 5
1299 Brunei 19339 A 5 5
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